1CNIA

X-ray crystallographic studies of engineered hydrogen bond networks in a protein-zinc binding site
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIAFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase (oxo-acid)
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE II
publication title X-Ray Crystallographic Studies of Engineered Hydrogen Bond Networks in a Protein-Zinc Binding Site
pubmed rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 77
structure length 257
sequence length 257
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 1995-04-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1cniA00
3DC9A 9CA2A 2OSMA 5DSRA 3D92A 1CZMA 4IDRX 4FVNA 4WUQA 5AMDA 2X7TA 4Q0LA 1CA3A 2NWOA 1THKA 1TEQX 1FSNA 3RZ1B 3OKUA 3T83A 1I9NA 2HL4A 2Q38A 5BRWA 4CNRA 5JEPB 3W6IA 4Q7WA 2FOVA 4WL4A 2CABA 3M2NA 2WEOA 2H4NA 3SBHA 1I9QA 3P5LA 4E3DA 1YDAA 2HOCA 4MLTA 3MNKA 3NI5A 4MTYA 1LG6A 3IGPA 4E3GA 5SZ3A 4QSJA 2ABEA 2NXTA 4ZWIA 4RUYA 4CA2A 3ZP9A 5EHEA 5FLTA 4LHIA 2NWZA 2AX2A 5E2RA 3MNIA 4FPTA 4RH2A 4YYTA 4KUYA 3M1JA 6CA2A 1CNBA 3F7UA 3HFPA 3K7KA 1UGAA 4QIZA 3RGEA 2NNGA 1RAYA 4L5UA 4ILXA 5DSPA 4E49A 1XEGA 2FOUA 1XEVA 1G0EA 1CCSA 1JD0A 4RUZA 1RZCA 4XZ5A 4Q8XA 3N0NA 3F7BA 2NNVA 1T9NA 1CAIA 1ZH9A 5BYIA 3JXFA 5EKHA 1CAKA 1I9MA 5JGSB 1CILA 3S73B 1G48A 4KNNA 4M2RA 3DD8A 1H4NA 5CJFA 3MDZA 3N3JA 3ML2A 5DVXA 1BNQA 5SZ5A 3BL0A 1UGDA 1Z93A 1FSRA 1DCAA 5G03A 3RZ8A 2FOSA 5JEGB 5DOHA 1HCBA 5EZTX 5SZ7A 4YXIA 3C7PA 3MNAA 1YDCA 4WUPA 5CLUA 4Q09A 1CAMA 3OYQA 3MHIA 3M1QA 3U3AX 3DVCA 3M5EA 3M5TA 1CALA 5DSIA 2WEJA 3OIKA 5IPZA 1TH9A 3HKTA 4ZX0A 4KNIA 1CVEA 4COQA 3MNUA 5AMLA 1ZSCA 5E28A 4Q49A 1BN1A 3MHLA 3SAXA 1TE3X 4WW8A 3RYZA 4QK3A 1FQMA 1IF6A 4R5AA 1YO2A 1MOOA 3RZ7A 4KUVA 2WEHA 4QJ0A 1BNWA 2NWYA 2NXRA 1RZBA 1CA2A 3DV7A 1EOUA 1YO0A 2X7SA 3KS3A 3M67A 4HU1A 5C8IA 5E5RA 1CVBA 3NJ9A 4Q8YA 5EKMA 3N4BA 3T82A 5FLPA 2CBAA 2F14A 4Q7PA 1HUHA 4XIXA 2CA2A 3IBLA 1CINA 4QJPA 3P55A 1HEBA 4Q08A 1RZEA 1LUGA 4IWZA 3V3JA 3S8XA 3JXGA 5FL6A 1BICA 5E2SA 1Y7WA 3MMFA 1TG3A 2WD2A 4BF6A 4R59A 4YXOA 1BZMA 3M1WA 5E5UA 1TG9A 4RFCA 3S71B 1TBTX 3D9ZA 4E4AA 4HT0A 1G4OA 5E2NA 5LMDA 4Q99A 5G0BA 3L14A 1YDBA 1BN4A 2WEGA 4GL1X 5E2MA 5DSQA 4DZ7A 4Z1NA 1CNKA 3P4VA 3OIMA 4CNWA 2NWPA 1CVDA 3M96A 4HT2A 4X5SA 1RZDA 1CAHA 3M5SA 3P44A 3PO6A 2FOQA 3M2ZA 3SBIA 2HFWA 1KWQA 3KONA 5EKJA 2NN7A 3RYJB 1AVNA 4MO8A 4E9OX 4G7AA 5FL5A 3CA2A 4CNVA 4Q06A 1HEAA 4DZ9A 1KOPA 1I9PA 4Q8ZA 5G0CA 5SZ0A 3D0NA 4K0TA 1CVAA 3M3XA 4QSAA 4RFDA 3FW3A 2QO8A 4CACA 1BNNA 3DC3A 5EOIA 4KP8A 5FDCA 4ZWYA 12CAA 1I9LA 5FNLA 3HS4A 4YWPA 5HPJA 3TMJA 5DOGA 1CCTA 3HKQA 5FLSA 2FNKA 1OKNA 2HNCA 4XFWA 5FLQA 3HKUA 5JESB 5L6KA 4Q6EA 3DVBA 3M98A 3KIGA 3RYVB 3V5GA 4QEFA 3M40A 2NN1A 3KKXA 1RJ5A 1RJ6A 4PZHA 4RUXA 1AZMA 2VVAX 1G54A 1FR4A 3HLJA 5FNMA 3PJJA 1ZNCA 3T5ZA 3M04A 1IF4A 3B4FA 1G4JA 3D8WA 4BCWA 1CIMA 4K13A 4MLXA 2EU3A 4RN4A 1OKLA 1V9EA 3W6HA 4RIUA 5SZ6A 4R5BA 3FFPX 2ZNCA 1I91A 2CBEA 1G6VA 1I9OA 3R17B 5JGTB 4LU3A 1YDDA 4QK1A 5EIJA 4YGNA 3P5AA 3OKVA 3S72B 1ZGEA 1UGFA 2Q1QA 1FLJA 1CAJA 1F2WA 4KNMA 1IF8A 2NNOA 1UGBA 2FOYA 5L3OA 4QIYA 3VBDA 1CVFA 1G53A 1CRMA 3MHMA 2QP6A 4YX4A 1CAOA 1UGCA 1G0FA 1HUGA 4MDLA 4PYXA 5SZ1A 4YGKA 2CBBA 5AMGA 4L5WA 4YHAA 3U7CA 3FE4A 1CNIA 3RJ7A 8CA2A 3N2PA 4HBAA 5DSMA 1I90A 3S75B 3F8EA 4FU5A 5FLRA 1FSQA 1KEQA 4ITOA 1H9NA 5FNIA 2ILIA 1JCZA 4KUWA 4Q07A 4RIVA 5FNGA 1G3ZA 3KWAA 5DSNA 4FRCA 1DMXA 2X7UA 2FW4A 3MZCA 4Q9YA 1J9WA 3NB5A 1ZE8A 1ZFKA 1TTMA 1CNYA 3MYQA 4HEZA 3Q31A 4KV0A 1BCDA 3RZ0B 1BN3A 1ZGFA 3RG3A 4CQ0A 1BNUA 5A25A 4Z1KA 3DAZA 2GEHA 4ZX1A 3S74B 1HVAA 4K0ZA 3CYUA 3PYKA 2NMXA 2O4ZA 2HD6A 1FQRA 3S76A 1HECA 5EH8A 4QSIA 3UYQA 2AW1A 3RZ5A 2NNSA 5FNHA 4ETQC 1RAZA 5FNKA 3S9TA 3T84A 3DA2A 1CVCA 3MNJA 2W2JA 5SZ2A 3EFIA 5DSOA 3JXHC 1RZAA 5FL4A 1LZVA 4FIKA 3U47A 2EU2A 2CBCA 2QOAA 5CACA 3UYNA 1MUAA 4KNJA 4MDGA 4QY3A 4YGFA 3M2XA 3V3IB 5EH7A 4Q87A 2POWA 1ZFQA 4Z1JA 3S77B 1FR7A 1IF5A 1XQ0A 2WD3A 2POVA 3HKNA 3RYXB 5EH5A 5DSLA 3DBUA 4UOVA 1CNHA 3EFTA 4HEWA 5FLOA 1H9QA 4ZAOA 1KOQA 3V3GB 4PXXA 1Z9YA 3CAJA 4Y0JA 1UGGA 1I8ZA 1HEDA 2FNNA 4XE1A 2IT4A 3SAPA 1CCUA 1CNGA 1UGEA 3BETA 3QYKA 4Z1EA 3F4XA 2GD8A 2CBDA 1G1DA 2FMGA 4FL7A 4QSBA 4QTLA 1CAYA 4M2VA 4PYYA 1CANA 4M2UA 5FDIA 5A6HA 1BV3A 1BNTA 1HCAA 5DRSA 5G01A 3P58A 1URTA 4PQ7A 5CA2A 4Q6DA 4QJXA 3TVOX 3LXEA 4JSSA 7CA2A 3OY0A 3R16A 1ZSAA 4Q81A 5BRUA 3IEOA 4TWMA 1Z97A 1CNCA 5SZ4A 1V9IC 3S97A 4QK2A 5JEHB 5FNJA 3RLDA 1TEUX 4YGJA 3MHCA 2POUA 1IF7A 4ITPA 4ZWXA 4YGLA 5BNLA 4HF3A 1LG5A 4JSWA 1XPZA 4YVYA 3D93A 3IBNA 1AM6A 1JV0A 1CNJA 3CZVA 1G45A 3DCWA 2FNMA 3V7XA 5BRVA 3MHOA 3RYYA 1KWRA 3T85A 4K1QA 4L5VA 5JQ0A 3P3HA 4MDMA 3K34A 4Q78A 1DMYA 4KAPA 3ZNCA 4N16A 5EHWA 1A42A 4Q7VA 3IBIA 5E2KA 1OKMA 1YO1A 1ZSBA 5JQTA 4E3FA 3P3JA 4JSZA 3V3HB 1TB0X 4BF1A 5DSJA 1CNXA 3MWOA 3KNEA 2EZ7A 5EHVA 4Q7SA 4E5QA 4M2WA 4WW6A 4HEYA 4FVOA 5DSKA 3V2MA 3B1BA 3ML5A 1CNWA 2OSFA 3MNHA 3K2FA 3U45X 3M2YA 3S78B 3DVDA 4Q90A 2HKKA 1FQNA 4KP5A 1FQLA 3IAIA 4C3TA 4E3HA 4QJWA 4QJMA 3DCSA 3V2JA 3GZ0A 4QJOA 5JG3B 3TVNX 4JS6A 4ZWZA 3BL1A 1CRAA 3DCCA 4LP6A 3M1KA 4TWLA 5J8ZA 1G52A 1G46A 3V3FA 3DD0A 2FMZA 2NXSA 1DCBA 2VVBX 3OYSA 1BNMA 2H15A 1LGDA 4WR7A 4K0SA 3KOKA 2Q1BA 1CVHA 1IF9A 4G0CA 3OILA 1OQ5A 3M14A 3IBUA 3KLDB 3T5UA 4CNXA 4Q83A 1BNVA 1CAZA 4JSAA 3RG4A 4XIWA 4N0XB 4YXUA 4Z0QA 3KOIA 5JDVB 5JG5B
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3DC9 A;  9CA2 A;  2OSM A;  5DSR A;  3D92 A;  1CZM A;  4IDR X;  4FVN A;  4WUQ A;  5AMD A;  2X7T A;  4Q0L A;  1CA3 A;  2NWO A;  1THK A;  1TEQ X;  1FSN A;  3RZ1 B;  3OKU A;  3T83 A;  1I9N A;  2HL4 A;  2Q38 A;  5BRW A;  4CNR A;  5JEP B;  3W6I A;  4Q7W A;  2FOV A;  4WL4 A;  2CAB A;  3M2N A;  2WEO A;  2H4N A;  3SBH A;  1I9Q A;  3P5L A;  4E3D A;  1YDA A;  2HOC A;  4MLT A;  3MNK A;  3NI5 A;  4MTY A;  1LG6 A;  3IGP A;  4E3G A;  5SZ3 A;  4QSJ A;  2ABE A;  2NXT A;  4ZWI A;  4RUY A;  4CA2 A;  3ZP9 A;  5EHE A;  5FLT A;  4LHI A;  2NWZ A;  2AX2 A;  5E2R A;  3MNI A;  4FPT A;  4RH2 A;  4YYT A;  4KUY A;  3M1J A;  6CA2 A;  1CNB A;  3F7U A;  3HFP A;  3K7K A;  1UGA A;  4QIZ A;  3RGE A;  2NNG A;  1RAY A;  4L5U A;  4ILX A;  5DSP A;  4E49 A;  1XEG A;  2FOU A;  1XEV A;  1G0E A;  1CCS A;  1JD0 A;  4RUZ A;  1RZC A;  4XZ5 A;  4Q8X A;  3N0N A;  3F7B A;  2NNV A;  1T9N A;  1CAI A;  1ZH9 A;  5BYI A;  3JXF A;  5EKH A;  1CAK A;  1I9M A;  5JGS B;  1CIL A;  3S73 B;  1G48 A;  4KNN A;  4M2R A;  3DD8 A;  1H4N A;  5CJF A;  3MDZ A; 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