1CVBA

Structural and functional importance of a conserved hydrogen bond network in human carbonic anhydrase ii
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
Knots found
sequence length
255
structure length
255
Chain Sequence
WGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLVTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase(oxo-acid)
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE II
publication title Structural and functional importance of a conserved hydrogen bond network in human carbonic anhydrase II.
pubmed rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 76
structure length 255
sequence length 255
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 1993-02-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1cvbA00
2POWA 4CA2A 5SZ4A 4RUZA 3FE4A 4LP6A 5DVXA 1CNIA 4JS6A 1XQ0A 4FPTA 3W6IA 2W2JA 6CA2A 1FQRA 3MHIA 1I90A 3JXFA 5DSPA 4COQA 1CIMA 2HKKA 1HECA 1DMXA 5EKJA 4Q08A 4Z1EA 2NNSA 3OILA 1G46A 4MDLA 4QEFA 5E2KA 1UGEA 4N16A 1ZFKA 1BNQA 4ZX1A 2ILIA 1CNGA 3T5UA 1OKNA 1BN1A 3F4XA 4RN4A 5FLTA 4ZX0A 2HNCA 1UGCA 4Q6EA 1CANA 1CALA 2X7TA 1FSRA 1CRAA 4KUYA 5SZ7A 3MWOA 1YDCA 1ZE8A 3TVNX 1LUGA 1CAIA 4HEWA 3MZCA 3MNAA 5AMLA 2CBDA 3V2JA 3S97A 2QO8A 3M40A 1UGFA 4YXIA 3RLDA 3S8XA 4ETQC 3JXGA 1IF5A 1I91A 1I9NA 1YO2A 1KOQA 3S74B 2Q1BA 5SZ5A 2HFWA 3PO6A 3BL1A 4JSAA 4Q0LA 1LGDA 3EFIA 2WEGA 4Q78A 3NI5A 5JGSB 2NN7A 5EKMA 3W6HA 3P3HA 1RJ6A 1CVEA 3KKXA 3P5LA 1OKLA 3KS3A 5DOGA 4Q7PA 1H4NA 3M1WA 3OKUA 3MHLA 1HCAA 5EZTX 1TTMA 4K13A 1BNTA 1RAYA 4K1QA 1CVAA 2WEJA 4L5VA 5DSLA 3JXHC 1ZSBA 2GD8A 4WL4A 4PZHA 3D0NA 3RZ8A 1TEQX 4ZWIA 2OSMA 4KAPA 4N0XB 3LXEA 1XPZA 4HEYA 3DC9A 4JSWA 4QTLA 1AZMA 1IF9A 4PQ7A 5BRWA 1TG3A 3L14A 2ABEA 4G7AA 3RYXB 5FNLA 5HPJA 3T82A 3D93A 3K34A 5EHVA 1I9QA 1THKA 5E28A 1JCZA 2WD2A 2WD3A 2O4ZA 1FQNA 3MMFA 3U45X 5EH8A 2FMGA 1LZVA 3P58A 3KLDB 4MO8A 1AVNA 2NNVA 3HKUA 3M1JA 3KNEA 3RYJB 1RJ5A 4TWMA 4YGNA 4RUXA 4K0TA 4KNNA 4Z1JA 4ZWYA 1HEDA 4QJPA 1DMYA 4Q07A 5AMDA 4CNRA 5FL4A 2NWPA 3KOIA 4M2RA 4YGKA 1KWQA 4FRCA 1I9MA 1T9NA 4YX4A 1LG6A 5CA2A 5JG3B 4FVOA 1RZBA 3R16A 2FNKA 4R5BA 2QOAA 1UGAA 1URTA 3IBIA 1MUAA 5DSJA 2NXRA 3N0NA 1I9PA 5AMGA 1FQLA 1CA3A 4FIKA 1YDAA 3KIGA 3M67A 3B1BA 5BNLA 3MNUA 3M14A 4GL1X 3U3AX 2FOUA 1BNUA 3V3HB 2AX2A 1CAOA 1G4JA 1ZFQA 1TB0X 3KONA 4QJ0A 3SAPA 4K0SA 4RUYA 1EOUA 4QSBA 1TG9A 4JSSA 4QJOA 3S78B 3N3JA 3DCCA 3P5AA 4Q7SA 4BF1A 3HFPA 1G48A 3HKNA 1JD0A 1LG5A 3IAIA 3KWAA 4PYXA 4R5AA 4E5QA 4Z1KA 4Q9YA 5EH5A 4R59A 2F14A 4ITPA 3S75B 4E3GA 3RZ0B 3V3GB 5DSMA 5JDVB 3B4FA 1RAZA 3RG3A 5E2SA 3M5TA 5FLSA 5DSNA 3RYZA 3DA2A 1CCTA 2NNOA 1CAHA 5JEHB 2X7UA 4QSJA 1TH9A 4Q7VA 5DSKA 3HKQA 4QIZA 2CABA 4BF6A 3UYNA 1CNCA 2FOSA 2EZ7A 4L5UA 3R17B 4LU3A 2POVA 3RYVB 4QK2A 3M2XA 3DVDA 4YYTA 4KUWA 1YDBA 1TEUX 4KV0A 5EIJA 3IGPA 1CNJA 4QY3A 3V5GA 1BZMA 2ZNCA 1CNWA 1CNXA 2VVAX 1CVFA 3C7PA 2HOCA 1CAJA 1BNMA 1KWRA 1XEVA 5BYIA 3DC3A 1HEBA 4Q81A 3K7KA 3MNJA 3S71B 5A6HA 4BCWA 5EHEA 3FW3A 4Z0QA 1A42A 5FLQA 1FQMA 4RFCA 4HBAA 4FVNA 1IF8A 2H15A 3S73B 1J9WA 4XE1A 5FNMA 3M1KA 1I9OA 5E5RA 3RZ1B 1Z9YA 1OQ5A 1FR7A 3T5ZA 5SZ3A 1G54A 5JQ0A 5FLRA 1CCSA 1KOPA 4Y0JA 2CBEA 5JQTA 3ZP9A 2NWOA 4FL7A 1HUGA 4CNXA 1YO1A 2FNMA 4ZWXA 3HLJA 5FNKA 1FR4A 5FDIA 1Y7WA 5DOHA 3HS4A 5FL6A 1XEGA 3M5SA 3IBLA 3S9TA 3TVOX 4XFWA 4IDRX 3S72B 3M2YA 3U47A 4E49A 3OIMA 3K2FA 1BNWA 1BNVA 4L5WA 5G03A 1YDDA 4WUPA 3PYKA 4WW8A 1F2WA 2H4NA 5FNIA 4C3TA 1FLJA 5G0CA 4DZ9A 5JESB 3DCSA 1JV0A 3V3IB 3M98A 1ZSCA 3KOKA 12CAA 1G45A 2NWYA 4TWLA 2VVBX 7CA2A 4KP8A 4WR7A 5EKHA 3M5EA 5FDCA 3DVBA 3T85A 3DV7A 1RZDA 1G53A 1ZGEA 2FNNA 3DD0A 5G01A 1HCBA 4HT2A 5JGTB 4LHIA 4MLXA 5FLOA 3D9ZA 1DCAA 2GEHA 5FNJA 5FNHA 5E2RA 2X7SA 2WEHA 3MNIA 3RZ7A 4Q90A 2CBCA 3CA2A 4HT0A 3RZ5A 1BN4A 4Q7WA 4Q06A 1CAMA 2HL4A 2FOVA 4M2WA 2FOQA 3UYQA 4MTYA 4WW6A 3V3FA 1I8ZA 1IF4A 5LMDA 3DBUA 1FSNA 5L3OA 3RGEA 3MHOA 5CLUA 4YGFA 3DVCA 5FNGA 4XIWA 1YO0A 4Z1NA 5JEGB 1ZSAA 5CJFA 4KNMA 5BRUA 4YHAA 4YXUA 3NJ9A 4Q09A 4Q6DA 4Q99A 5E2NA 2WEOA 1H9NA 4PXXA 2NN1A 4M2UA 3MHCA 3M3XA 1ZGFA 3MYQA 4RFDA 2NNGA 3M2ZA 2CA2A 3PJJA 4IWZA 1UGGA 1MOOA 3TMJA 4FU5A 4QIYA 4X5SA 3M96A 5DSIA 3DAZA 4Q87A 4E3FA 1KEQA 2AW1A 3T84A 3FFPX 4KP5A 3F7UA 3S76A 3IEOA 1RZCA 9CA2A 2EU3A 3HKTA 4Q83A 4QSIA 4MDMA 3F7BA 3N4BA 1BN3A 4YGJA 1OKMA 1HUHA 3BL0A 3Q31A 1G0EA 1G6VA 3P3JA 4E3HA 5DRSA 3SBHA 5EH7A 2POUA 3MHMA 1G52A 2CBAA 5A25A 1CVHA 1IF6A 4ZWZA 3EFTA 1ZH9A 4KUVA 5C8IA 1Z97A 4Q8ZA 4QSAA 4HF3A 3BETA 5SZ6A 3M2NA 4ZAOA 3SAXA 3ML2A 4HEZA 2HD6A 5E5UA 1BV3A 1CAYA 1CAZA 3QYKA 5J8ZA 5SZ0A 1CNHA 1ZNCA 4CNVA 1CNYA 2NXTA 3IBNA 4CQ0A 4G0CA 2NMXA 1TBTX 3ML5A 5G0BA 1CZMA 3IBUA 1G1DA 2NXSA 4Q8YA 1CVBA 3T83A 1CNKA 3RJ7A 5E2MA 3U7CA 2NWZA 4YVYA 3DD8A 4KNJA 1G3ZA 4Q8XA 3MNHA 3P44A 5SZ1A 5EOIA 2FMZA 3GZ0A 1I9LA 1UGDA 3MNKA 5FL5A 2Q38A 1CILA 4RIUA 1BNNA 4PYYA 1TE3X 4XZ5A 4E4AA 1G0FA 4QJWA 5CACA 1RZEA 3OYSA 3OYQA 3RG4A 1BCDA 3VBDA 5JG5B 2FOYA 3V2MA 5BRVA 4MLTA 3P4VA 4KNIA 4RIVA 2QP6A 1V9IC 2FW4A 3M04A 4JSZA 1CNBA 1CRMA 1CA2A 3CZVA 5DSRA 5JEPB 5SZ2A 4MDGA 1G4OA 1Z93A 4YWPA 3MDZA 4ILXA 4Q49A 3RYYA 2IT4A 4QK1A 4WUQA 1CAKA 4XIXA 5L6KA 3S77B 4QJMA 3ZNCA 3F8EA 3N2PA 3DCWA 1BICA 4K0ZA 4DZ7A 5FLPA 3OIKA 3D8WA 8CA2A 3V3JA 5DSQA 4YXOA 1HVAA 4CNWA 4YGLA 4RH2A 2Q1QA 1HEAA 3CYUA 1AM6A 4E3DA 4QK3A 4ITOA 4HU1A 4UOVA 1CCUA 4M2VA 3P55A 3M1QA 3OY0A 1V9EA 2OSFA 1CVCA 3CAJA 2EU2A 3OKVA 1CINA 1DCBA 1UGBA 5EHWA 3D92A 1FSQA 1RZAA 1H9QA 5DSOA 4CACA 5IPZA 3NB5A 4E9OX 1CVDA 1IF7A 4QJXA 3V7XA 2CBBA 3SBIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2POW A;  4CA2 A;  5SZ4 A;  4RUZ A;  3FE4 A;  4LP6 A;  5DVX A;  1CNI A;  4JS6 A;  1XQ0 A;  4FPT A;  3W6I A;  2W2J A;  6CA2 A;  1FQR A;  3MHI A;  1I90 A;  3JXF A;  5DSP A;  4COQ A;  1CIM A;  2HKK A;  1HEC A;  1DMX A;  5EKJ A;  4Q08 A;  4Z1E A;  2NNS A;  3OIL A;  1G46 A;  4MDL A;  4QEF A;  5E2K A;  1UGE A;  4N16 A;  1ZFK A;  1BNQ A;  4ZX1 A;  2ILI A;  1CNG A;  3T5U A;  1OKN A;  1BN1 A;  3F4X A;  4RN4 A;  5FLT A;  4ZX0 A;  2HNC A;  1UGC A;  4Q6E A;  1CAN A;  1CAL A;  2X7T A;  1FSR A;  1CRA A;  4KUY A;  5SZ7 A;  3MWO A;  1YDC A;  1ZE8 A;  3TVN X;  1LUG A;  1CAI A;  4HEW A;  3MZC A;  3MNA A;  5AML A;  2CBD A;  3V2J A;  3S97 A;  2QO8 A;  3M40 A;  1UGF A;  4YXI A;  3RLD A;  3S8X A;  4ETQ C;  3JXG A;  1IF5 A;  1I91 A;  1I9N A;  1YO2 A;  1KOQ A;  3S74 B;  2Q1B A;  5SZ5 A;  2HFW A;  3PO6 A;  3BL1 A;  4JSA A;  4Q0L A;  1LGD A;  3EFI A;  2WEG A;  4Q78 A;  3NI5 A;  5JGS B;  2NN7 A;  5EKM A;  3W6H A;  3P3H A;  1RJ6 A;  1CVE A;  3KKX A;  3P5L A;  1OKL A;  3KS3 A;  5DOG A;  4Q7P A;  1H4N A;  3M1W A;  3OKU A; 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