1DCBA

Structure of an engineered metal binding site in human carbonic anhydrase ii reveals the architecture of a regulatory cysteine switch
Total Genus 73
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
73
Knots found
sequence length
255
structure length
255
Chain Sequence
WGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLCTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase(oxo-acid)
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE II
publication title Structure of an engineered His3Cys zinc binding site in human carbonic anhydrase II.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 73
structure length 255
sequence length 255
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 1993-03-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1dcbA00
1I90A 1OQ5A 3FW3A 3DCSA 2GD8A 3DVDA 3IBIA 5DSMA 3MNKA 3NB5A 3IGPA 4FRCA 2NXTA 4HF3A 1LG5A 5AMLA 3U3AX 2QOAA 5EH7A 1HCAA 3DC3A 5EHEA 2ZNCA 3MNAA 4DZ7A 1YDBA 2FNMA 1I9PA 4HU1A 3P44A 2WD2A 5E5RA 8CA2A 3IBUA 3T85A 1H4NA 4HBAA 3T84A 3P5LA 4CNXA 1FQNA 3M2XA 3V3HB 3S9TA 4HEWA 4Q6DA 3ML2A 4RUXA 3RYZA 3SAPA 4YGKA 4QJ0A 4FPTA 4YXOA 4DZ9A 2FOVA 3B4FA 4K0TA 1RJ6A 3N2PA 1UGBA 1CRMA 5SZ1A 3VBDA 2CBAA 4PXXA 3V3GB 4QIZA 5EH5A 3EFIA 4K0ZA 4Q7PA 3MNUA 5E2KA 2NXSA 2NMXA 4ZWXA 1FSRA 4Q49A 1HEDA 1KWRA 3KOIA 4MDGA 1ZNCA 1G4JA 5DSNA 4HEZA 5DSJA 1HCBA 5DSPA 5FNHA 4YXUA 2NNSA 3EFTA 5FNKA 6CA2A 4L5WA 1ZH9A 3RGEA 4N16A 5DOGA 5JEGB 4MO8A 4JSAA 3OY0A 5FLQA 5EKMA 5BRUA 4QIYA 4IWZA 2CBBA 3P3JA 4Q6EA 1CNXA 2O4ZA 4MLTA 1IF9A 4HT0A 5JESB 1G46A 3R17B 4RUYA 3DAZA 2WEGA 3RG4A 5G0CA 1CIMA 4Q06A 4G7AA 2HNCA 2ILIA 3M5SA 7CA2A 4QJPA 4RN4A 1UGGA 1BICA 1J9WA 3BL1A 3D0NA 2WD3A 3U45X 1CINA 5E2MA 1KOPA 3TVNX 1IF4A 5SZ6A 3D92A 2CBCA 1FQLA 1CVAA 3MYQA 1TH9A 4Z1NA 1LGDA 2WEOA 3P5AA 1I91A 1FLJA 4QEFA 1XEVA 4COQA 3S72B 2NNGA 4M2WA 4FL7A 1BV3A 4CNRA 1HECA 3R16A 4C3TA 3S74B 4ZX0A 5L6KA 4CQ0A 4E4AA 5G03A 1UGAA 3K7KA 4WW8A 4Z1KA 1IF8A 3KLDB 3HFPA 3OKUA 3M04A 4E3HA 5DSOA 1FR4A 1TB0X 3DVBA 4YWPA 3B1BA 3RZ8A 3N4BA 5BNLA 1CNJA 4ZX1A 5FDCA 4RH2A 4MDLA 1YDAA 1ZGFA 3C7PA 3TMJA 1AM6A 1Z9YA 5FLOA 1UGCA 3JXFA 5FNIA 2NWYA 4YGNA 4YVYA 4Q8ZA 5SZ4A 4ZWIA 1UGDA 4K0SA 5AMDA 3M5EA 4ITOA 5HPJA 1BZMA 1BN3A 2Q1QA 3DD0A 3M1JA 3TVOX 2GEHA 5AMGA 1CVCA 3NJ9A 3M2ZA 2IT4A 3S73B 5DSQA 1CAMA 4WW6A 5JG3B 3N0NA 1RZBA 4BCWA 1TEUX 1BNQA 1CVBA 4Z0QA 4Z1JA 4LP6A 4KNJA 4E5QA 1HVAA 3D93A 1HUGA 4PYYA 5JDVB 3N3JA 5FLSA 1ZE8A 1XQ0A 5EOIA 4TWLA 3L14A 1FR7A 3V5GA 3K2FA 3KS3A 2NWPA 4E3DA 2X7TA 2CABA 3S97A 2EZ7A 3M14A 3KKXA 4RIUA 1CCUA 1CA3A 2NN7A 1I9LA 4Q83A 4QK1A 1CNIA 4Q8YA 1BN4A 4YGJA 3V2MA 1TEQX 1CCSA 1G45A 3SBIA 4ZWYA 4LHIA 3IAIA 2F14A 1I9MA 3S75B 4QJMA 4WUQA 1CAKA 3ZP9A 2HFWA 3DCWA 1F2WA 3DV7A 1CAJA 1KWQA 1CAZA 1CVDA 3QYKA 3T83A 3DBUA 4ETQC 4X5SA 2VVAX 1LZVA 4KNIA 5DSKA 4QK2A 4YHAA 4M2UA 4KUVA 3HLJA 3GZ0A 3KOKA 4XZ5A 3KIGA 3U47A 4QJWA 3RYVB 4FU5A 3HKTA 1T9NA 1LUGA 5EZTX 1JCZA 3M1WA 4Q07A 2FNKA 1YO0A 4KV0A 4HEYA 1ZGEA 5EHWA 5EIJA 1CALA 1V9IC 3OIKA 4QY3A 5JGSB 3PO6A 5SZ7A 2NWOA 3S71B 2Q38A 3V3JA 1G0EA 2FMZA 1CAYA 5J8ZA 2NXRA 4KUWA 4IDRX 1HUHA 3D8WA 3LXEA 1YDCA 2FW4A 3M98A 5L3OA 5CLUA 3M3XA 1CAHA 5E28A 3S8XA 1OKLA 5FNMA 3MHLA 5FLRA 2HL4A 1ZSBA 1CNHA 3RZ5A 2POWA 3OYQA 3MWOA 4CACA 3CZVA 2CA2A 4RUZA 5SZ5A 1BN1A 4YGLA 4Q08A 4XE1A 3T5UA 3DVCA 1A42A 4JS6A 3M2NA 2HOCA 2NNOA 5JEPB 1THKA 1FQRA 1CANA 1OKMA 4HT2A 1KOQA 2AX2A 4WL4A 5SZ3A 1G48A 3P4VA 3T5ZA 2FMGA 4MLXA 2EU3A 1JD0A 3KNEA 3ML5A 5DVXA 4YYTA 1CZMA 2H15A 1IF5A 3RYXB 1URTA 1G4OA 1I9NA 1ZFQA 3OYSA 4M2VA 4QK3A 5FLPA 3K34A 2OSFA 1LG6A 5FLTA 1G54A 2VVBX 1FSQA 3M1KA 3M67A 2POVA 4M2RA 5EKJA 4TWMA 5FNLA 3SBHA 5JG5B 1ZFKA 4XFWA 4Y0JA 5E2SA 2X7SA 2X7UA 5BYIA 5JGTB 2FOYA 1OKNA 5CACA 1BNWA 1RZCA 4PYXA 1FQMA 3NI5A 1EOUA 3MHOA 4Q7SA 3OKVA 5CA2A 5FL5A 4Q7WA 1HEBA 2NWZA 5BRVA 3RZ7A 1CNWA 1HEAA 1KEQA 4Q81A 5DSRA 3MHMA 3V7XA 4QSBA 3DCCA 4QJXA 5LMDA 1CNYA 3SAXA 3P55A 4RFDA 1G1DA 5DOHA 1BNTA 4CA2A 5EH8A 3FFPX 1RJ5A 2POUA 4ILXA 1BNUA 3KWAA 3OILA 1RZEA 4QTLA 5FL4A 1G3ZA 1G0FA 3MHIA 4N0XB 3RYYA 3BETA 4XIXA 5EHVA 3CYUA 1CA2A 2QO8A 4KNNA 3MDZA 3HKUA 1I9OA 3W6IA 3DD8A 2CBEA 1CNGA 4WUPA 3IBNA 1TBTX 4GL1X 4MDMA 1Y7WA 4QSIA 1DCAA 4BF1A 5G01A 1H9QA 1BNVA 4KUYA 3W6HA 4ZAOA 4JSSA 1H9NA 5FNJA 4CNVA 1CCTA 3RZ0B 5SZ2A 1CVFA 3PJJA 2AW1A 3PYKA 1UGFA 2OSMA 5FDIA 4QSJA 1CAIA 1BNNA 2HD6A 2NNVA 3M1QA 3Q31A 4K1QA 4PZHA 3U7CA 5BRWA 3CA2A 4KAPA 4Q7VA 5IPZA 2WEHA 1CNBA 4WR7A 2Q1BA 2H4NA 1BNMA 2ABEA 4ITPA 4R5AA 4BF6A 3UYNA 4E9OX 1DMYA 4QSAA 1BCDA 3RYJB 4FVOA 1IF7A 2FOSA 4Q99A 5E2NA 5E5UA 3MNHA 4Q9YA 9CA2A 4XIWA 3RJ7A 3F4XA 1Z93A 3MMFA 1RZAA 3OIMA 4FVNA 5SZ0A 3IBLA 1XEGA 3S76A 1AZMA 5DRSA 3MZCA 5EKHA 3RLDA 2FOQA 3IEOA 4FIKA 1FSNA 3F7UA 3M5TA 4G0CA 3M40A 1ZSAA 3MNIA 4E3FA 3UYQA 4YX4A 4R5BA 4UOVA 3KONA 5JQTA 1IF6A 3HKQA 4LU3A 3MNJA 4QJOA 3P58A 4K13A 1JV0A 1CNKA 3M2YA 3DA2A 4RIVA 2W2JA 3MHCA 3JXGA 5C8IA 1CNCA 4Q87A 4YXIA 12CAA 1TG9A 4L5VA 1XPZA 1V9EA 4JSWA 1RAYA 3HS4A 4MTYA 1G52A 2EU2A 1ZSCA 3M96A 3V2JA 5E2RA 3FE4A 5FNGA 1UGEA 3ZNCA 4L5UA 5G0BA 1G53A 1CILA 1YO2A 5A6HA 1DCBA 2NN1A 4Z1EA 3V3FA 4R59A 3T82A 1G6VA 3CAJA 3DC9A 5FL6A 4PQ7A 2QP6A 3F7BA 2FNNA 4KP8A 1TG3A 3JXHC 1I9QA 3RZ1B 5CJFA 3P3HA 1MUAA 4Q78A 1TE3X 4CNWA 2CBDA 5DSIA 1MOOA 3BL0A 4Q90A 3S77B 1YO1A 5JEHB 2HKKA 3RG3A 4Q09A 4YGFA 4ZWZA 4JSZA 2FOUA 4Q0LA 5A25A 4KP5A 1CVEA 1CRAA 3HKNA 3D9ZA 4RFCA 1YDDA 4Q8XA 4E3GA 1CAOA 1RAZA 2WEJA 3S78B 1TTMA 5JQ0A 1CVHA 1DMXA 4E49A 5DSLA 4KNMA 3V3IB 1AVNA 1RZDA 1I8ZA 1Z97A 3F8EA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1CIL A;  1YO2 A;  5A6H A;  1DCB A;  2NN1 A;  4Z1E A;  3V3F A;  4R59 A;  3T82 A;  1G6V A;  3CAJ A;  3DC9 A;  5FL6 A;  4PQ7 A;  2QP6 A;  3F7B A;  2FNN A;  4KP8 A;  1TG3 A;  3JXH C;  1I9Q A;  3RZ1 B;  5CJF A;  3P3H A;  1MUA A;  4Q78 A;  1TE3 X;  4CNW A;  2CBD A;  5DSI A;  1MOO A;  3BL0 A;  4Q90 A;  3S77 B;  1YO1 A;  5JEH B;  2HKK A;  3RG3 A;  4Q09 A;  4YGF A;  4ZWZ A;  4JSZ A;  2FOU A;  4Q0L A;  5A25 A;  4KP5 A;  1CVE A;  1CRA A;  3HKN A;  3D9Z A;  4RFC A;  1YDD A;  4Q8X A;  4E3G A;  1CAO A;  1RAZ A;  2WEJ A;  3S78 B;  1TTM A;  5JQ0 A;  1CVH A;  1DMX A;  4E49 A;  5DSL A;  4KNM A;  3V3I B;  1AVN A;  1RZD A;  1I8Z A;  1Z97 A;  3F8E A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 1I90 A;  1OQ5 A;  3FW3 A;  3DCS A;  2GD8 A;  3DVD A;  3IBI A;  5DSM A;  3MNK A;  3NB5 A;  3IGP A;  4FRC A;  2NXT A;  4HF3 A;  1LG5 A;  5AML A;  3U3A X;  2QOA A;  5EH7 A;  1HCA A;  3DC3 A;  5EHE A;  2ZNC A;  3MNA A;  4DZ7 A;  1YDB A;  2FNM A;  1I9P A;  4HU1 A;  3P44 A;  2WD2 A;  5E5R A;  8CA2 A;  3IBU A;  3T85 A;  1H4N A;  4HBA A;  3T84 A;  3P5L A;  4CNX A;  1FQN A;  3M2X A;  3V3H B;  3S9T A;  4HEW A;  4Q6D A;  3ML2 A;  4RUX A;  3RYZ A;  3SAP A;  4YGK A;  4QJ0 A;  4FPT A;  4YXO A;  4DZ9 A;  2FOV A;  3B4F A;  4K0T A;  1RJ6 A;  3N2P A;  1UGB A;  1CRM A;  5SZ1 A;  3VBD A;  2CBA A;  4PXX A;  3V3G B;  4QIZ A;  5EH5 A;  3EFI A;  4K0Z A;  4Q7P A;  3MNU A;  5E2K A;  2NXS A;  2NMX A;  4ZWX A;  1FSR A;  4Q49 A;  1HED A;  1KWR A;  3KOI A;  4MDG A;  1ZNC A;  1G4J A;  5DSN A;  4HEZ A;  5DSJ A;  1HCB A;  5DSP A;  5FNH A;  4YXU A;  2NNS A;  3EFT A;  5FNK A;  6CA2 A;  4L5W A;  1ZH9 A;  3RGE A;  4N16 A;  5DOG A;  5JEG B;  4MO8 A;  4JSA A;  3OY0 A;  5FLQ A;  5EKM A;  5BRU A;  4QIY A;  4IWZ A;  2CBB A;  3P3J A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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