1HCBA

Enzyme-substrate interactions: structure of human carbonic anhydrase i complexed with bicarbonate
Total Genus 74
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
74
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
PDWGYDDKNGPEQWSKLYPIANGNNQSPVDIKTSETKHDTSLKPISVSYNPATAKEIINVGHSFHVNFEDNDNRSVLKGGPFSDSYRLFQFHFHWGSTNEHGSEHTVDGVKYSAELHVAHWNSAKYSSLAEAASKADGLAVIGVLMKVGEANPKLQKVLDALQAIKTKGKRAPFTNFDPSTLLPSSLDFWTYPGSLTHPPLYESVTWIICKESISVSSEQLAQFRSLLSNVEGDNAVPMQHNNRPTQPLKGRTVRASF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase(oxo-acid)
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE I
publication title Enzyme-substrate interactions. Structure of human carbonic anhydrase I complexed with bicarbonate.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 74
structure length 258
sequence length 258
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 1994-01-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1hcbA00
1CAIA 5FLSA 3M5SA 3KWAA 1AM6A 4YXOA 1CAMA 1I90A 3T83A 4KNIA 1F2WA 3MNHA 4HBAA 5AMLA 1HCBA 4YGKA 2FW4A 2X7UA 3MNAA 3CA2A 4HEYA 4FL7A 1BN3A 1AZMA 1TH9A 2FOVA 5SZ0A 4QIZA 4ZWIA 1CINA 2CBAA 4PZHA 3S97A 4Q7PA 5DSOA 4YGJA 12CAA 1Y7WA 2FNNA 4E4AA 2POVA 3HFPA 3RG4A 4PXXA 5E2NA 1UGFA 3RZ5A 1T9NA 2Q1QA 1CNBA 4LP6A 4Q7VA 1CANA 2GEHA 4Q87A 3ZNCA 3P55A 5DSPA 4RFDA 4E5QA 3D93A 3PYKA 4HT2A 4ITPA 4Q83A 3M1WA 1BCDA 1TB0X 4RIUA 3ZP9A 3TVOX 2F14A 3M3XA 4Q7SA 3RYJB 3DC3A 5FLPA 2VVBX 1XEGA 3M14A 9CA2A 1FQMA 3N3JA 3DCSA 3KOIA 1BNWA 5EH7A 1RJ6A 3U3AX 5EHVA 4Q8YA 5EZTX 3TMJA 5FL5A 3U7CA 4MDGA 5EOIA 3TVNX 2CBCA 2CBBA 3OY0A 2CBEA 3P3JA 4CNXA 3S72B 4MDMA 4QK2A 3RZ1B 5SZ1A 4K0TA 2HNCA 3F7UA 5SZ2A 1FQNA 3OYSA 4RIVA 5DOHA 4M2WA 5DSRA 1BN4A 1CNHA 3P4VA 3RZ8A 4RUYA 3VBDA 5E2KA 4Q49A 3D92A 3KLDB 1TEQX 1MOOA 5FNIA 2FOUA 1BNUA 3EFTA 3RLDA 1Z93A 2FNMA 4HT0A 2EU3A 3OKUA 3IBNA 3LXEA 3MNJA 4QSIA 1I8ZA 1IF8A 4BCWA 3SAPA 1FSNA 1JV0A 3RYYA 4Q81A 3IEOA 5FNHA 1CNGA 5FNGA 3KNEA 3DV7A 4RH2A 1CAYA 4QSJA 3EFIA 4E3GA 4E3FA 2ZNCA 4N16A 3RZ7A 2WEOA 1HCAA 2QP6A 3KIGA 1CVDA 2NWPA 3M98A 4JSAA 5EH8A 1EOUA 1TG3A 3D9ZA 3JXHC 4N0XB 3U47A 4ZX1A 3S8XA 3NJ9A 4CACA 2NWOA 2HOCA 2EU2A 3SAXA 5SZ5A 1G54A 3KS3A 5DSNA 4HEWA 3D0NA 1A42A 3M96A 3MYQA 1CVHA 3K7KA 1RZEA 3V2MA 4KNJA 3S76A 3MWOA 1HEBA 1LG6A 5E2SA 4QJMA 3W6HA 2EZ7A 3N2PA 5CA2A 4FRCA 1OQ5A 5BRVA 5C8IA 5SZ6A 2CA2A 5FLOA 3IBLA 3M40A 1G46A 1G52A 4KV0A 1Z9YA 3IBUA 1KOQA 4KUYA 4DZ7A 3RYZA 1Z97A 1LG5A 1BNTA 3FE4A 4QJXA 1I9LA 1OKNA 5JESB 5A6HA 1IF7A 6CA2A 3MNUA 1JD0A 1ZSAA 3RJ7A 3M1KA 4UOVA 2WEJA 3RYXB 1I9OA 3MZCA 4DZ9A 2FOSA 4ZX0A 4QIYA 4QJWA 5FNJA 5CJFA 4M2UA 5DSLA 4JSSA 4PQ7A 4ZWXA 1ZGEA 1CA3A 1FQLA 4Z1EA 4WR7A 4Z0QA 3HLJA 1TE3X 1CAJA 4E49A 5DVXA 5JDVB 3DD8A 3MHMA 1H9QA 5DOGA 3UYNA 1TEUX 1FQRA 1CALA 1CNCA 2QO8A 1I9MA 3P5LA 4IDRX 3ML5A 4L5UA 1TBTX 3DC9A 1BN1A 1DMXA 3P5AA 4Q8ZA 3S71B 5BYIA 4RUXA 1CA2A 1XQ0A 1CILA 2FNKA 3F8EA 4QK1A 4QSAA 1HUGA 2OSFA 3KONA 2WEGA 3GZ0A 5E28A 3N4BA 5AMDA 2HKKA 3T82A 3Q31A 5AMGA 4LHIA 5CACA 3DVBA 2H4NA 3DCCA 1CAOA 4Q0LA 1YDBA 5FL4A 1BICA 3K2FA 2NWYA 4YVYA 3MMFA 3NI5A 1CVCA 5SZ3A 3V3JA 4FVOA 3M1JA 4CQ0A 2X7TA 3T5ZA 1TTMA 3M2XA 5FLQA 4QEFA 4M2VA 3DD0A 1XEVA 4KP8A 2AX2A 2OSMA 4RUZA 1DCAA 1CCSA 1CVEA 2W2JA 4TWMA 3T5UA 3M2ZA 5JG5B 4Q99A 5DSQA 1OKLA 3MDZA 3RGEA 1G53A 1I9NA 3SBIA 3HS4A 2FOYA 3F4XA 4Q9YA 4ILXA 3RG3A 4CA2A 3D8WA 2WD3A 3DVCA 1CAHA 1IF4A 4ZAOA 1H9NA 3ML2A 3HKUA 1UGAA 3BL0A 4MLXA 5DSMA 1ZFQA 5EKMA 1CVBA 5EIJA 3U45X 1FLJA 4K1QA 3V3HB 3JXGA 3DVDA 1CCTA 1HECA 1YDDA 5CLUA 4QK3A 8CA2A 4QJOA 3B1BA 4XFWA 4R59A 4XE1A 5IPZA 3MHIA 1FR4A 3FW3A 5JEPB 4HU1A 3R16A 1CVAA 1V9IC 1G4OA 1RZCA 4FVNA 5J8ZA 1BNVA 2POWA 5BRWA 1TG9A 3BETA 4KNNA 1KWQA 1CRAA 4X5SA 1G45A 3M67A 4FPTA 4COQA 1RAZA 4YXUA 5EH5A 5EHEA 3S74B 1YO0A 1HVAA 1IF5A 2AW1A 3PO6A 1AVNA 1CRMA 2NNVA 5A25A 5LMDA 3UYQA 5E2RA 3V5GA 1IF9A 2NXSA 2NN1A 2VVAX 4ITOA 3T85A 4L5WA 3B4FA 5FNKA 4GL1X 4WL4A 5G0BA 5JEGB 1CNYA 1ZGFA 4QJPA 1I9QA 4ZWYA 4Q90A 5EHWA 5HPJA 5FDCA 1YDAA 4Q78A 4Q6EA 5G01A 4WUPA 5JEHB 3M2NA 5DRSA 4E3DA 3V2JA 5FLTA 5DSJA 1CAZA 2X7SA 5FNLA 2CBDA 2HD6A 1LUGA 3P44A 4WW6A 5SZ7A 7CA2A 3IGPA 5L3OA 5FLRA 4Q6DA 5G03A 3HKTA 5FNMA 3RYVB 4LU3A 1CVFA 1HEDA 1YDCA 4QTLA 3OILA 3OIMA 3M5EA 4YGLA 4JS6A 3S73B 4KUVA 1ZSBA 3HKNA 1JCZA 4Q07A 3DAZA 1LGDA 4JSWA 4Y0JA 3HKQA 4Q8XA 4YHAA 4BF6A 4KNMA 4E3HA 1BNMA 3RZ0B 3P3HA 3F7BA 4KUWA 4E9OX 1BZMA 4QJ0A 4MTYA 3MNIA 4XIWA 1HUHA 2NMXA 3MNKA 4RFCA 1BNNA 3M04A 1RZDA 5BNLA 3V3FA 4CNVA 1V9EA 2NXTA 1URTA 1UGDA 1CNKA 1G0EA 4YXIA 1G3ZA 1ZH9A 4K13A 1FSRA 3M5TA 1XPZA 1G6VA 4PYXA 4JSZA 5EKJA 5L6KA 2HFWA 1RAYA 1CNXA 3BL1A 2NXRA 3MHCA 3S9TA 1CNWA 3QYKA 1BNQA 3N0NA 3L14A 1ZFKA 1G1DA 2GD8A 3C7PA 5E5UA 3FFPX 3V7XA 2FMZA 4HEZA 5JQ0A 4K0ZA 1FR7A 3T84A 4K0SA 1DMYA 1G0FA 5DSIA 5JGSB 1H4NA 3CAJA 4Z1JA 1CNIA 2NWZA 2IT4A 1LZVA 1KWRA 3P58A 5EKHA 4Z1KA 1J9WA 4PYYA 5E2MA 1YO2A 4XZ5A 3MHLA 4FIKA 1UGGA 4M2RA 4Q09A 3V3IB 4WUQA 4RN4A 5JQTA 2WD2A 3OYQA 3KKXA 3IAIA 1G48A 2FOQA 2NN7A 4KAPA 4CNWA 4G7AA 1KEQA 1CCUA 2Q38A 3M1QA 3W6IA 4G0CA 1OKMA 4QSBA 3CZVA 1ZNCA 2O4ZA 4FU5A 5JG3B 1RZAA 4KP5A 4C3TA 1DCBA 1UGEA 5E5RA 3DA2A 4Q06A 3DCWA 4YYTA 2NNGA 3S78B 4Z1NA 1FSQA 3R17B 4MDLA 1YO1A 1I91A 2H15A 4YWPA 2HL4A 1ZE8A 4ZWZA 2NNOA 3M2YA 4Q7WA 1IF6A 1G4JA 3S75B 3OIKA 1CZMA 5JGTB 2WEHA 5BRUA 1CNJA 5FL6A 3MHOA 4CNRA 3DBUA 5G0CA 2FMGA 1I9PA 4YX4A 5DSKA 4IWZA 3CYUA 4YGNA 1UGBA 2CABA 2POUA 1MUAA 4QY3A 4TWLA 4WW8A 2QOAA 4L5VA 4R5BA 3JXFA 3K34A 3S77B 1RZBA 1HEAA 2ABEA 1KOPA 4ETQC 3IBIA 4Q08A 4HF3A 4BF1A 3V3GB 2ILIA 4R5AA 4MO8A 1CAKA 2Q1BA 3NB5A 1ZSCA 3PJJA 5FDIA 1UGCA 1THKA 5SZ4A 1CIMA 4YGFA 2NNSA 3KOKA 4MLTA 3SBHA 1BV3A 3OKVA 1RJ5A 4XIXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1CAI A;  5FLS A;  3M5S A;  3KWA A;  1AM6 A;  4YXO A;  1CAM A;  1I90 A;  3T83 A;  4KNI A;  1F2W A;  3MNH A;  4HBA A;  5AML A;  1HCB A;  4YGK A;  2FW4 A;  2X7U A;  3MNA A;  3CA2 A;  4HEY A;  4FL7 A;  1BN3 A;  1AZM A;  1TH9 A;  2FOV A;  5SZ0 A;  4QIZ A;  4ZWI A;  1CIN A;  2CBA A;  4PZH A;  3S97 A;  4Q7P A;  5DSO A;  4YGJ A;  12CA A;  1Y7W A;  2FNN A;  4E4A A;  2POV A;  3HFP A;  3RG4 A;  4PXX A;  5E2N A;  1UGF A;  3RZ5 A;  1T9N A;  2Q1Q A;  1CNB A;  4LP6 A;  4Q7V A;  1CAN A;  2GEH A;  4Q87 A;  3ZNC A;  3P55 A;  5DSP A;  4RFD A;  4E5Q A;  3D93 A;  3PYK A;  4HT2 A;  4ITP A;  4Q83 A;  3M1W A;  1BCD A;  1TB0 X;  4RIU A;  3ZP9 A;  3TVO X;  2F14 A;  3M3X A;  4Q7S A;  3RYJ B;  3DC3 A;  5FLP A;  2VVB X;  1XEG A;  3M14 A;  9CA2 A;  1FQM A;  3N3J A;  3DCS A;  3KOI A;  1BNW A;  5EH7 A;  1RJ6 A;  3U3A X;  5EHV A;  4Q8Y A;  5EZT X;  3TMJ A;  5FL5 A;  3U7C A;  4MDG A;  5EOI A;  3TVN X;  2CBC A;  2CBB A;  3OY0 A;  2CBE A;  3P3J A;  4CNX A;  3S72 B;  4MDM A;  4QK2 A;  3RZ1 B;  5SZ1 A;  4K0T A;  2HNC A;  3F7U A; 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