1KEQA

Crystal structure of f65a/y131c carbonic anhydrase v, covalently modified with 4-chloromethylimidazole
Total Genus 73
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
73
Knots found
sequence length
238
structure length
238
Chain Sequence
GTRQSPINIQWKDSVYDPQLAPLRVSYDAASCRYLWNTGYAFQVEFDDSCEDSGISGGPLGNHYRLKQFHFHWGATDEWGSEHAVDGHTYPAELHLVHWNSTKYENCKKASVGENGLAVIGVFLKLGAHHQALQKLVDVLPEVRHKDTQVAMGPFDPSCLMPACRDYWTYPGSLTTPPLAESVTWIVQKTPVEVSPSQLSMFRTLLFSGRGEEEDVMVNNYRPLQPLRDRKLRSSFRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords F65A/Y131C-MI Carbonic Anhydrase V
publication title Crystal structure of F65A/Y131C-methylimidazole carbonic anhydrase V reveals architectural features of an engineered proton shuttle.
pubmed doi rcsb
source organism Mus musculus
total genus 73
structure length 238
sequence length 238
chains with identical sequence B
other databases KnotProt 2.0: K
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2001-11-16
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1keqA00
2EU3A 1UGCA 4Q8XA 4QSIA 4QK1A 1TH9A 3M14A 1CNWA 1J9WA 5FL4A 4HEYA 4Q7PA 5E2RA 3PO6A 3RG4A 3V7XA 12CAA 4Z1KA 3M2YA 3S8XA 3R16A 1FQLA 3T5UA 1HVAA 1UGEA 2W2JA 4Q87A 1G6VA 4PYXA 4QJOA 4MLXA 3S74B 1G46A 4RFDA 3V3IB 3U3AX 4KV0A 1ZE8A 4XE1A 3U47A 1BNMA 1UGBA 1TBTX 4PXXA 1ZH9A 1CVEA 4C3TA 1Z93A 1CVCA 3DCWA 2Q1QA 3S78B 1IF7A 3M40A 4PYYA 4RUYA 4TWMA 3D92A 1YO0A 5FLSA 5DOHA 4YYTA 1MOOA 3IGPA 1ZFKA 5EHWA 1BZMA 2EZ7A 4Q9YA 5IPZA 1LZVA 4N16A 1BN1A 3HS4A 5EIJA 3M96A 5FL6A 3RZ1B 2NN7A 3MNJA 2WD3A 4QJ0A 4YGJA 4QK2A 5BRUA 2GD8A 3RGEA 1CINA 3IBIA 5DSOA 1OQ5A 5BYIA 2HD6A 3MNIA 2NNOA 4BF6A 1KOPA 5E5UA 3OKUA 1MUAA 3M67A 4RH2A 1KWRA 3MNHA 3K34A 4E3FA 4HT0A 3T83A 1CAZA 4KNJA 3N4BA 4WW6A 3HFPA 1IF6A 3OIMA 4QK3A 4M2WA 4HBAA 4ILXA 1CAMA 1G54A 1H4NA 2ABEA 1CA3A 4RN4A 2QO8A 2POVA 3VBDA 1FQNA 1HEAA 1G0EA 3U45X 3MNAA 2HL4A 3MHIA 3P44A 1YDDA 3V3HB 4YXOA 1YDBA 4MTYA 4PQ7A 1I8ZA 4KUWA 4XFWA 1BN4A 3OY0A 5DVXA 3T5ZA 1ZFQA 4K0SA 5FLTA 3M1JA 1EOUA 2HOCA 1CNCA 3SBHA 1BN3A 3R17B 5BRVA 3LXEA 1IF5A 2QOAA 5G0BA 1I9MA 3FFPX 1TEUX 4FPTA 4ZWIA 5SZ1A 3EFTA 3NI5A 3JXFA 4COQA 2GEHA 4ZWYA 3OIKA 3M1KA 2CBDA 3Q31A 4Q7SA 3T82A 3RZ7A 1CCUA 3M2NA 2F14A 1XQ0A 4XZ5A 1FLJA 1YDAA 4G0CA 3KKXA 4MDMA 1DMXA 1JD0A 3HKQA 5DSPA 1F2WA 1FSNA 3ML2A 3V3GB 4FL7A 4HEWA 3W6HA 3JXHC 1CAOA 4ZAOA 4XIWA 5JG5B 4XIXA 4DZ9A 3V3FA 1ZGEA 1FSRA 2X7TA 4G7AA 4KP5A 3V2JA 3MHMA 4JSSA 4JS6A 5DOGA 1ZNCA 1UGAA 2CBCA 3QYKA 2NN1A 5FL5A 3UYQA 4E5QA 2NMXA 1G1DA 1I9OA 3MDZA 1TG3A 4JSAA 3S76A 2NWZA 3D0NA 5BNLA 1IF9A 5JEGB 1BNUA 4UOVA 2NXTA 3N0NA 3V2MA 4Q81A 5SZ0A 2Q38A 4Q99A 4KAPA 4ETQC 3N3JA 5EHEA 2EU2A 2AW1A 3DC3A 5FLRA 1THKA 4E3HA 2CBAA 3M1WA 5EKHA 4YGNA 7CA2A 1LG5A 1HCAA 1JV0A 3HKTA 1DMYA 2NNVA 4FU5A 1OKNA 1Z9YA 3F4XA 1YO2A 3RYXB 1CRAA 4QY3A 3HKUA 4MDGA 3UYNA 1CNXA 5FLQA 1CNGA 4TWLA 4MDLA 4QEFA 5SZ6A 4RUZA 4WR7A 5EH8A 5A25A 3D8WA 3RYZA 3S75B 1G52A 3GZ0A 1CAKA 2POUA 1AZMA 5DSNA 1T9NA 3ZNCA 3FE4A 3TVNX 3DC9A 3B4FA 4Q8YA 4Q6DA 5DSKA 1BCDA 3DVBA 4YHAA 1BNQA 4QJPA 4CQ0A 3P5AA 2FNNA 2FOYA 5JDVB 1G4JA 4JSWA 3RZ8A 4M2RA 4QIZA 1IF8A 2NWPA 1CALA 6CA2A 1BNNA 4KNNA 2CBEA 3D93A 5DSRA 5FNIA 3PJJA 3DCSA 1HUGA 1LUGA 3BETA 4QTLA 1OKLA 3K2FA 4Q7VA 1XEGA 1H9NA 3CAJA 1CVAA 2FOSA 1V9EA 3M2ZA 5CACA 3RLDA 3IAIA 5FNHA 3RG3A 1CNKA 3M04A 1HEDA 3JXGA 2VVBX 4LU3A 1KWQA 4Q06A 5JQ0A 3FW3A 2FOQA 3V3JA 3DVCA 4ITOA 3T85A 3NB5A 4R5BA 5EZTX 2NNGA 1BNWA 4HF3A 2QP6A 5DSQA 5DSIA 1CNJA 1I90A 1ZSAA 5SZ3A 2FMGA 5JEHB 2X7SA 3EFIA 1JCZA 1XPZA 3P3HA 4KNMA 9CA2A 5L6KA 5AMDA 3CA2A 3MZCA 4QJMA 4QJWA 2NNSA 3DV7A 1YO1A 5JEPB 1CAHA 2ILIA 5DSMA 4ZWXA 5E2KA 3KOKA 3F7UA 5G01A 5G03A 3DA2A 4Q83A 3W6IA 4Q90A 3RJ7A 4R59A 2AX2A 3ML5A 1CAIA 1TE3X 5EH5A 2X7UA 3DVDA 3DBUA 5CJFA 3PYKA 4Z0QA 1CVDA 2Q1BA 4YXUA 4YXIA 3DD0A 1RAZA 1CRMA 5FNMA 3MHCA 4YX4A 1I9LA 1I91A 2O4ZA 4QJXA 4CNVA 5BRWA 4L5UA 3IBUA 1HCBA 1HECA 4QIYA 4E3GA 3MYQA 2HKKA 4Z1NA 5JGSB 5SZ5A 1RJ5A 2HNCA 4CACA 3DCCA 4CA2A 1CILA 1Y7WA 3DAZA 1CVHA 2WEJA 3M1QA 1I9PA 1RZDA 1RZBA 2CABA 3CYUA 5E2MA 1FQMA 3M98A 3MMFA 1LGDA 1I9NA 4Q78A 3C7PA 3KNEA 4RFCA 4KUVA 3S71B 3M5SA 3P3JA 2POWA 1UGFA 4LP6A 3P55A 1KOQA 4E49A 3D9ZA 3BL0A 4KP8A 4FRCA 4K1QA 4RIVA 3M3XA 4Q6EA 4IDRX 3S72B 4L5WA 1RAYA 3B1BA 3IBNA 5LMDA 2NWOA 1BNVA 5DSJA 4R5AA 1TEQX 1G45A 3TMJA 5FNKA 3S97A 4GL1X 4K0ZA 4M2VA 3KS3A 2FMZA 2CA2A 1CNBA 5JESB 3RZ0B 4L5VA 4Q49A 1ZSCA 1CNHA 5FDCA 5DRSA 5JQTA 2OSMA 3S73B 2FOVA 4FVOA 4CNRA 1IF4A 3NJ9A 4M2UA 3S77B 1FSQA 4MLTA 4DZ7A 4CNWA 3KOIA 4YGFA 4BF1A 4ZWZA 1G3ZA 1AM6A 1H9QA 3RYYA 1YDCA 4RUXA 1LG6A 3RZ5A 2NXSA 3KONA 3ZP9A 5EH7A 5J8ZA 1CAYA 1RJ6A 1A42A 3HKNA 1CZMA 1UGGA 5AMLA 3IEOA 3MHLA 3OILA 2CBBA 1CIMA 3M2XA 4E3DA 3OYSA 1AVNA 1BNTA 2H15A 4HEZA 1CCSA 1G4OA 3F8EA 4CNXA 5E28A 1FQRA 4YWPA 3S9TA 2OSFA 4FVNA 5EOIA 1CVBA 4KNIA 1CNYA 2FW4A 1FR7A 5EKMA 5E2NA 3SBIA 2FOUA 4Q08A 1TG9A 3MHOA 4K0TA 3M5TA 5CLUA 5SZ4A 1HUHA 5EHVA 4E4AA 1OKMA 1BICA 4YGKA 3T84A 1G48A 4Y0JA 4HU1A 5AMGA 5FNLA 4WW8A 3OYQA 4K13A 1RZAA 2WEOA 3KIGA 4BCWA 5C8IA 2HFWA 5FLPA 4WUPA 1TB0X 5EKJA 1RZEA 5FLOA 4QSAA 1DCAA 3K7KA 3KLDB 3BL1A 2FNKA 5G0CA 5FNJA 5A6HA 4Q0LA 3RYVB 5E2SA 3V5GA 1FR4A 3M5EA 1G0FA 3IBLA 1URTA 3OKVA 4FIKA 1CANA 4IWZA 1CNIA 4QSBA 4YGLA 4Z1EA 1XEVA 3N2PA 1HEBA 3DD8A 1ZGFA 4QSJA 8CA2A 3P5LA 1RZCA 3MWOA 1V9IC 4ITPA 2NXRA 3CZVA 2WEGA 4WL4A 2ZNCA 4X5SA 5E5RA 1CAJA 4JSZA 4Q07A 3SAPA 3U7CA 2FNMA 3KWAA 4KUYA 4Q09A 1CCTA 5CA2A 1KEQA 1CVFA 5HPJA 5SZ7A 1I9QA 4WUQA 1ZSBA 3HLJA 3RYJB 4HT2A 4Q7WA 5L3OA 3TVOX 3MNKA 1BV3A 1UGDA 4Q8ZA 5JG3B 4ZX0A 2WEHA 4Z1JA 1CA2A 4LHIA 5SZ2A 5FDIA 3F7BA 4ZX1A 3SAXA 4N0XB 2NWYA 5FNGA 3MNUA 1Z97A 1G53A 4YVYA 4PZHA 2IT4A 3P4VA 3L14A 2H4NA 2VVAX 4MO8A 2WD2A 1TTMA 5JGTB 4RIUA 1DCBA 5DSLA 3P58A 4E9OX
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2EU3 A;  1UGC A;  4Q8X A;  4QSI A;  4QK1 A;  1TH9 A;  3M14 A;  1CNW A;  1J9W A;  5FL4 A;  4HEY A;  4Q7P A;  5E2R A;  3PO6 A;  3RG4 A;  3V7X A;  12CA A;  4Z1K A;  3M2Y A;  3S8X A;  3R16 A;  1FQL A;  3T5U A;  1HVA A;  1UGE A;  2W2J A;  4Q87 A;  1G6V A;  4PYX A;  4QJO A;  4MLX A;  3S74 B;  1G46 A;  4RFD A;  3V3I B;  3U3A X;  4KV0 A;  1ZE8 A;  4XE1 A;  3U47 A;  1BNM A;  1UGB A;  1TBT X;  4PXX A;  1ZH9 A;  1CVE A;  4C3T A;  1Z93 A;  1CVC A;  3DCW A;  2Q1Q A;  3S78 B;  1IF7 A;  3M40 A;  4PYY A;  4RUY A;  4TWM A;  3D92 A;  1YO0 A;  5FLS A;  5DOH A;  4YYT A;  1MOO A;  3IGP A;  1ZFK A;  5EHW A;  1BZM A;  2EZ7 A;  4Q9Y A;  5IPZ A;  1LZV A;  4N16 A;  1BN1 A;  3HS4 A;  5EIJ A;  3M96 A;  5FL6 A;  3RZ1 B;  2NN7 A;  3MNJ A;  2WD3 A;  4QJ0 A;  4YGJ A;  4QK2 A;  5BRU A;  2GD8 A;  3RGE A;  1CIN A;  3IBI A;  5DSO A;  1OQ5 A;  5BYI A;  2HD6 A;  3MNI A;  2NNO A;  4BF6 A;  1KOP A;  5E5U A;  3OKU A;  1MUA A;  3M67 A;  4RH2 A;  1KWR A;  3MNH A;  3K34 A;  4E3F A;  4HT0 A;  3T83 A;  1CAZ A;  4KNJ A;  3N4B A;  4WW6 A; 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