1KOQA

Neisseria gonorrhoeae carbonic anhydrase
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
Knots found
sequence length
222
structure length
222
Chain Sequence
THWGYTGHDSPESWGNLSEEFRLCSTGKNQSPVNITETVSGKLPAIKVNYKPSMVDVENNGHTIQVNYPEGGNTLTVNGRTYTLKQFHFHVPSENQIKGRTFPMEAHFVHLDENKQPLVLAVLYEAGKTNGRLSSIWNVMPMTAGKVKLNQPFDASTLLPKRLKYYRFAGSLTTPPCTEGVSWLVLKTYDHIDQAQAEKFTRAVGSENNRPVQPLNARVVIE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE
publication title Crystal structure of carbonic anhydrase from Neisseria gonorrhoeae and its complex with the inhibitor acetazolamide.
pubmed doi rcsb
source organism Neisseria gonorrhoeae
total genus 58
structure length 222
sequence length 222
chains with identical sequence B
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 1998-03-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1koqA00
3P3HA 4QJ0A 3OYSA 3V3GB 5E5RA 2NXSA 1HVAA 4Q7PA 1CAJA 1FR7A 3M1JA 1CNIA 5EOIA 4RN4A 2NWZA 1BICA 3K2FA 4ZWYA 5BRVA 4XZ5A 1KWQA 3KOIA 3ZNCA 1CNWA 4E4AA 5DOHA 2X7TA 4Q6EA 3SAPA 5CJFA 1CAIA 3MNJA 3B4FA 1CANA 3KLDB 3N2PA 4M2RA 3P58A 1TE3X 1CNHA 1TEQX 4FU5A 2GD8A 4K0ZA 1HEBA 4YYTA 3RZ1B 1UGBA 3RZ0B 5EKJA 1ZFKA 2CBCA 4K13A 4M2UA 1ZGFA 4YXOA 1UGCA 4HEYA 2FOYA 1BNMA 2WEGA 5DSMA 4N0XB 4ZWZA 4KP5A 3OIKA 5CA2A 7CA2A 1LGDA 5E2KA 1CALA 1HUHA 2NNVA 4MLXA 4WW8A 1AZMA 1XEGA 3HS4A 2AW1A 1HCBA 3RYJB 1ZFQA 4TWMA 1V9EA 4ZX0A 4YGFA 4R5AA 5JGTB 1RZAA 1HEAA 5EIJA 1FLJA 3P55A 1BNVA 5EH7A 4Q6DA 1CRMA 1G4OA 4Q9YA 9CA2A 3M2XA 4Q90A 1G46A 1OKLA 5G03A 1ZSBA 4YWPA 1HEDA 4RIVA 1TB0X 4QJMA 1ZGEA 5L6KA 4ZX1A 5JESB 3P3JA 2FNKA 5SZ3A 3K34A 3SBIA 4E49A 4MDMA 4DZ7A 3P5LA 3CZVA 1RZDA 4ETQC 3UYQA 2WEOA 3NI5A 3CAJA 4BCWA 3MYQA 1J9WA 4RUZA 3RGEA 5FLQA 2FOUA 5E28A 1DCAA 3ML5A 1T9NA 1CZMA 3DA2A 5DSNA 3KNEA 2WEHA 3T5ZA 1CVCA 3RYYA 1BNWA 8CA2A 1UGAA 5FL4A 4CNVA 5FNGA 4L5UA 4RFCA 1FSNA 1CRAA 3T82A 3V3JA 1H9QA 1BN4A 1ZH9A 4Q07A 3M96A 1CILA 3DVBA 3B1BA 4IDRX 3F7BA 2NMXA 4KAPA 4QJPA 1I9OA 3N0NA 1XEVA 4G7AA 1YDAA 3PO6A 3FFPX 1H4NA 1CNXA 5EZTX 1ZNCA 1AM6A 3RYVB 5DOGA 2F14A 1TG9A 3DVCA 3KOKA 3M1WA 3RG3A 4CNXA 3MMFA 3P5AA 1IF8A 3ZP9A 3M5EA 3R17B 3IBNA 3QYKA 3TVOX 1DMYA 3KIGA 3MHLA 1YO2A 3CA2A 1KOQA 4KNIA 2CA2A 4M2VA 1RAZA 4WR7A 6CA2A 1G52A 3F4XA 4Q09A 3RLDA 3T5UA 4Q7VA 3DC3A 5EH5A 3EFIA 3KONA 3N3JA 5EHWA 3BETA 3F8EA 2NWYA 1CAKA 2H4NA 1RJ6A 3HKNA 2EU2A 1KOPA 2FW4A 5SZ6A 1RAYA 4DZ9A 5FNHA 4QJXA 1Y7WA 1OQ5A 1I9QA 1RZCA 2ZNCA 3T84A 5HPJA 4Q06A 4BF1A 3V3HB 4RFDA 5SZ4A 5AMDA 2Q38A 4R5BA 4X5SA 2POWA 3N4BA 5G01A 3DV7A 2OSMA 1OKMA 4FVOA 4JSAA 4YHAA 2ABEA 5CACA 3S74B 1HCAA 5JQ0A 4KNNA 4LP6A 3P4VA 5JG5B 3S75B 3HLJA 3MZCA 3MNAA 4L5WA 1UGDA 1JV0A 2NNSA 3IBUA 3M98A 4KUYA 4KNJA 2WD3A 5EHEA 4CA2A 1FSRA 1I9MA 3M2NA 3NB5A 4M2WA 4YGJA 5DSLA 1BNQA 1MOOA 2NNOA 3NJ9A 4FVNA 1CNYA 3MDZA 1FQMA 4XIXA 1YDDA 4MTYA 4K0TA 3V5GA 3IBLA 1BNUA 1BNNA 4KV0A 5A6HA 1G4JA 5G0BA 4LU3A 1TEUX 3MHIA 3JXHC 4QY3A 2IT4A 4ITPA 4XIWA 3MWOA 4Q78A 3T83A 4KUWA 3RZ8A 1OKNA 1I91A 3BL0A 3S72B 1DMXA 3TMJA 5JEGB 3HKUA 5FLOA 3BL1A 5DVXA 1CAYA 5SZ7A 2FNNA 1UGEA 2HD6A 4HT0A 2O4ZA 3R16A 5FDIA 1Z97A 1I9NA 5CLUA 3M1QA 1YO1A 4HBAA 1HUGA 3DD8A 2CBBA 2POUA 4JSZA 4FIKA 3OKUA 3V3IB 1RZBA 4FL7A 2WD2A 4LHIA 4CACA 4QIYA 3MHMA 4ZWXA 1G0EA 4E9OX 3DAZA 3ML2A 3F7UA 1UGGA 4Q7WA 5EHVA 1RZEA 4QJWA 1THKA 1LG6A 1G54A 2NNGA 4JSWA 5E2RA 4KNMA 3MNKA 1TBTX 3M1KA 3DCWA 2EZ7A 3UYNA 3VBDA 1CVAA 2HOCA 4MDLA 4YGNA 4K1QA 2AX2A 2HFWA 1G45A 1CAMA 3HFPA 3IBIA 1HECA 2NWPA 3M40A 4MDGA 1F2WA 4N16A 4QIZA 1FSQA 3U7CA 2QOAA 3D8WA 4PYXA 3OKVA 4Z1EA 5FNMA 1MUAA 1FQLA 1CCSA 3S9TA 2FNMA 1G1DA 1CNKA 3OIMA 4QSIA 1KWRA 3GZ0A 1UGFA 1BNTA 2CBDA 1FQNA 2Q1BA 2ILIA 4ILXA 4TWLA 1CAOA 3EFTA 4Q49A 1I90A 3OYQA 5FDCA 1TG3A 2NXTA 3TVNX 4CQ0A 4CNWA 5J8ZA 5E5UA 1JCZA 1CVEA 5JG3B 3DC9A 3LXEA 4Q8ZA 5EH8A 4MLTA 3M3XA 1ZE8A 3MNHA 5SZ1A 1BN1A 4C3TA 1IF7A 3DD0A 3MHCA 4R59A 3RZ5A 5FNLA 1CA3A 3M04A 3FE4A 2X7SA 5FLTA 4E3HA 4E5QA 5JQTA 3U3AX 5G0CA 3KKXA 5SZ0A 1IF9A 5FNKA 1EOUA 5DSQA 3W6IA 3S76A 1CNBA 1ZSAA 1BN3A 3RZ7A 4Q87A 3HKQA 2Q1QA 2VVBX 4E3DA 5BNLA 2FOSA 4IWZA 4QJOA 2EU3A 5BRUA 5DRSA 3SBHA 1A42A 1DCBA 5JEPB 5JGSB 1BV3A 2CABA 4HEWA 3M14A 1KEQA 4UOVA 4XFWA 3JXGA 2NN7A 1IF5A 3S97A 2NXRA 4RUYA 4PXXA 5AMGA 4ZWIA 3M5TA 5BRWA 3S71B 3K7KA 4Q8YA 5JDVB 1AVNA 4Q83A 4Z1KA 4Q7SA 4HT2A 4QTLA 4QK3A 5IPZA 3PYKA 4QK2A 4ITOA 4COQA 2NN1A 4FPTA 5LMDA 2NWOA 4JS6A 1FQRA 4MO8A 5FNIA 1LUGA 5JEHB 3L14A 2FOQA 4Q08A 1CVHA 1Z9YA 4BF6A 4GL1X 4RH2A 1CA2A 4WW6A 1YDBA 1TTMA 3T85A 3U47A 1Z93A 4FRCA 4ZAOA 4Z1JA 2X7UA 4WUQA 1CINA 3KS3A 2HKKA 4HU1A 3V2JA 3RYXB 3FW3A 3S8XA 3HKTA 5FLPA 5FL6A 2FMZA 3C7PA 3D93A 3JXFA 5L3OA 5DSJA 3U45X 4Z1NA 5SZ2A 4Q8XA 4CNRA 2WEJA 4QK1A 2FMGA 1I8ZA 5EKMA 4Y0JA 1BCDA 1IF4A 3M2YA 1JD0A 1BZMA 1LZVA 1CAZA 4Q99A 3P44A 4E3FA 3DCSA 3IEOA 4WUPA 1CCUA 2HNCA 5FLRA 3DVDA 3D92A 5FNJA 4YX4A 1H9NA 4HEZA 2CBAA 5DSRA 5E2MA 1G53A 1I9PA 4YGLA 1CVBA 3KWAA 4QSJA 3PJJA 1CAHA 4Q81A 4L5VA 2HL4A 5FL5A 3D9ZA 4KUVA 4G0CA 3DBUA 2VVAX 4PYYA 5DSIA 1G6VA 4RUXA 3SAXA 3V2MA 1V9IC 2H15A 4KP8A 1CCTA 1LG5A 4WL4A 4PZHA 5E2SA 3IGPA 3MNUA 1G3ZA 5AMLA 5EKHA 1XQ0A 4YXUA 4E3GA 1CVDA 4QSAA 2QP6A 12CAA 3S77B 4QEFA 1CVFA 3DCCA 3W6HA 3M67A 3RYZA 4YVYA 3OILA 1G0FA 1YO0A 3M5SA 3RG4A 4Q0LA 1CNCA 3RJ7A 3MHOA 3D0NA 5DSKA 4HF3A 3CYUA 5C8IA 3V7XA 3OY0A 3S73B 1CNJA 5BYIA 1XPZA 1FR4A 1TH9A 2CBEA 2QO8A 2OSFA 4JSSA 4YXIA 3IAIA 5E2NA 1I9LA 3M2ZA 5SZ5A 4RIUA 1YDCA 1ZSCA 1G48A 1URTA 2GEHA 2POVA 4QSBA 2FOVA 4Z0QA 4K0SA 5A25A 5FLSA 3S78B 1RJ5A 3MNIA 1CIMA 1CNGA 4PQ7A 4YGKA 3Q31A 2W2JA 5DSPA 5DSOA 3V3FA 1IF6A 4XE1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3P3H A;  4QJ0 A;  3OYS A;  3V3G B;  5E5R A;  2NXS A;  1HVA A;  4Q7P A;  1CAJ A;  1FR7 A;  3M1J A;  1CNI A;  5EOI A;  4RN4 A;  2NWZ A;  1BIC A;  3K2F A;  4ZWY A;  5BRV A;  4XZ5 A;  1KWQ A;  3KOI A;  3ZNC A;  1CNW A;  4E4A A;  5DOH A;  2X7T A;  4Q6E A;  3SAP A;  5CJF A;  1CAI A;  3MNJ A;  3B4F A;  1CAN A;  3KLD B;  3N2P A;  4M2R A;  3P58 A;  1TE3 X;  1CNH A;  1TEQ X;  4FU5 A;  2GD8 A;  4K0Z A;  1HEB A;  4YYT A;  3RZ1 B;  1UGB A;  3RZ0 B;  5EKJ A;  1ZFK A;  2CBC A;  4K13 A;  4M2U A;  1ZGF A;  4YXO A;  1UGC A;  4HEY A;  2FOY A;  1BNM A;  2WEG A;  5DSM A;  4N0X B;  4ZWZ A;  4KP5 A;  3OIK A;  5CA2 A;  7CA2 A;  1LGD A;  5E2K A;  1CAL A;  1HUH A;  2NNV A;  4MLX A;  4WW8 A;  1AZM A;  1XEG A;  3HS4 A;  2AW1 A;  1HCB A;  3RYJ B;  1ZFQ A;  4TWM A;  1V9E A;  4ZX0 A;  4YGF A;  4R5A A;  5JGT B;  1RZA A;  1HEA A;  5EIJ A;  1FLJ A;  3P55 A;  1BNV A;  5EH7 A;  4Q6D A;  1CRM A;  1G4O A;  4Q9Y A;  9CA2 A;  3M2X A;  4Q90 A;  1G46 A;  1OKL A;  5G03 A;  1ZSB A;  4YWP A;  1HED A;  4RIV A;  1TB0 X;  4QJM A;  1ZGE A; 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