1LUGA

Full matrix error analysis of carbonic anhydrase
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
Knots found
sequence length
259
structure length
259
Chain Sequence
SHHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Carbonic Anhydrase II
publication title Atomic resolution studies of carbonic anhydrase II.
pubmed doi rcsb
total genus 79
structure length 259
sequence length 259
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2002-05-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1lugA00
5E2KA 4X5SA 1XEVA 5FL6A 1AZMA 3IBUA 3S72B 5E5RA 2FMGA 3DAZA 4MLTA 3M1KA 3NB5A 1V9EA 1XQ0A 3OKVA 1RZDA 3CAJA 3OKUA 2HFWA 4R59A 1FLJA 4KNJA 5AMGA 4Z1JA 2WD3A 3HFPA 4C3TA 1HCBA 2FW4A 1CCUA 2FOQA 3T84A 5JG3B 4QSBA 4M2VA 4YXOA 2Q1QA 4RUZA 5DSIA 2CA2A 5E2MA 3V3GB 2FNKA 4QJOA 2HL4A 5FNIA 1HEDA 1CA3A 1XEGA 4RFCA 1BNTA 1CAKA 1LG6A 2CABA 4XIWA 4XIXA 3M2NA 1CVHA 4LU3A 2ILIA 4K0SA 4HT0A 1RZCA 5SZ0A 3V3FA 3M40A 4L5VA 4XFWA 1BN3A 2CBBA 4G7AA 5EHEA 3RYVB 4BF6A 1BNUA 3JXGA 4ETQC 3MNJA 4Y0JA 3RLDA 1ZE8A 1DMXA 3KKXA 1Z93A 3DCWA 1BNMA 1CAJA 4JSAA 2CBCA 3U7CA 1CIMA 2NN1A 2NNOA 4M2WA 3S97A 5C8IA 1FQNA 3M96A 4Q7SA 4QJPA 4YWPA 4CNWA 4TWMA 5EH5A 1RJ5A 1CNKA 1OKMA 3P58A 1OKNA 5E2RA 4E4AA 3V7XA 3OIKA 3P44A 5G03A 3V2JA 1OQ5A 1CALA 4UOVA 1G54A 1LGDA 2WD2A 3ZNCA 1CZMA 1H4NA 4BCWA 4E3DA 5DSJA 3M14A 5CJFA 1JD0A 4JSSA 3D9ZA 4L5WA 4ZWIA 3F7BA 3K2FA 4QY3A 5AMLA 1UGAA 4R5AA 4RN4A 4Q9YA 3OY0A 3KOKA 3NJ9A 5FLRA 2X7UA 3B1BA 2FOSA 6CA2A 3K7KA 3MHCA 3DC3A 3M1JA 1LZVA 1I9OA 3IEOA 4YGJA 5HPJA 4IWZA 3P55A 2EU3A 4Q0LA 1I9NA 5FL4A 1IF5A 1AM6A 3S8XA 4WUQA 1CNCA 5DOGA 1G0FA 4L5UA 3DCSA 5FNHA 1ZFQA 2NNVA 3M5EA 2HNCA 4QSJA 5DSMA 2AX2A 4COQA 1YDCA 3N0NA 4QIYA 1CAMA 1FR4A 2VVBX 1G48A 1Z9YA 4Z0QA 3S78B 3U47A 5JG5B 3S71B 5FNKA 1CCSA 1FSQA 5JDVB 2ABEA 5JGSB 1F2WA 4WL4A 2FNNA 3TVNX 1G52A 1TH9A 1JCZA 4E49A 1RZBA 3T85A 2W2JA 4ILXA 5EZTX 1IF7A 4KUWA 5AMDA 1BICA 3MNAA 1CAYA 3RJ7A 4N16A 5E5UA 3P5AA 3PJJA 1CA2A 2NNGA 1AVNA 5E2SA 1CCTA 3V3HB 3T82A 2FOVA 5EH7A 1CNGA 5CA2A 5BRUA 4HEWA 2NNSA 4KUVA 5A6HA 4WR7A 4HT2A 5EH8A 1CVAA 1BNNA 4FL7A 4QTLA 1CNIA 5E2NA 3M2XA 3M1WA 1RAYA 3UYQA 4ZWXA 3MHLA 5DRSA 3JXHC 4MDGA 1UGCA 4XE1A 4YGLA 1DCBA 5SZ4A 3V5GA 3B4FA 4PXXA 1IF9A 4Q7PA 3P4VA 5EKMA 3DD8A 1BV3A 1TB0X 4TWLA 4RIUA 2OSMA 3GZ0A 4CNXA 3HKQA 3R16A 1TG3A 4HEZA 5DSQA 2HD6A 4ZWZA 1CVDA 1CRMA 4PYXA 3T5ZA 1BN4A 5EOIA 2HOCA 3JXFA 3M3XA 3F8EA 5L6KA 9CA2A 2FNMA 4JSZA 5L3OA 2NXRA 2POVA 1G1DA 4Q87A 1CANA 4YHAA 2X7SA 3M67A 1KOPA 4QJXA 4K0ZA 2CBDA 1I9LA 4Q6EA 3RZ1B 4CA2A 1RZAA 3MNHA 4GL1X 4FVNA 5DSKA 3SBHA 1CNJA 3R17B 1XPZA 4E5QA 3C7PA 4Q7WA 4YGKA 4KAPA 2OSFA 4YXUA 3RG4A 4CNRA 3OILA 3D93A 1CNYA 4K0TA 5FNGA 1I8ZA 2IT4A 1A42A 4R5BA 5FLSA 5CACA 4QEFA 4FU5A 4CQ0A 1CINA 2O4ZA 3HKTA 3M04A 5LMDA 5J8ZA 1YO2A 3N3JA 4CACA 2NXSA 1CAIA 1CAZA 3RZ0B 1UGBA 1HEAA 4JS6A 2FOUA 2POUA 4E3GA 4E9OX 1YDDA 2NWPA 5IPZA 4M2UA 4DZ7A 1I90A 3DVCA 4PQ7A 2FOYA 5EIJA 1G4OA 3DC9A 4KV0A 7CA2A 2EZ7A 2CBAA 3KONA 5G01A 4QK1A 1ZGEA 3M5TA 5FLOA 1BCDA 3RYYA 1CNHA 3DVBA 2NWZA 4JSWA 1ZGFA 5JEHB 1T9NA 3MWOA 3ZP9A 12CAA 2FMZA 4Q7VA 3KS3A 5JQ0A 2AW1A 3LXEA 1G3ZA 5E28A 3KLDB 1THKA 3NI5A 1ZFKA 3CZVA 2Q1BA 3N4BA 4RH2A 4Q07A 1I9PA 1ZSBA 1FSRA 4XZ5A 5BRWA 1YO0A 1UGFA 3OYSA 4RUXA 3IBLA 4HU1A 5SZ6A 1CAOA 5A25A 4BF1A 5JEGB 1CILA 4ITPA 2H15A 3U3AX 3MHOA 1CNBA 3OIMA 4N0XB 1DMYA 3P5LA 1RAZA 4QSAA 5G0BA 5JEPB 3MDZA 4K13A 4QSIA 1Y7WA 3KIGA 5FDIA 5BNLA 1BN1A 1BNQA 1YDBA 4Q78A 5FDCA 1FSNA 2NMXA 1V9IC 3U45X 3VBDA 3N2PA 1FQMA 5G0CA 2GD8A 4MO8A 4QK2A 5SZ5A 4QJ0A 1I9QA 1HVAA 1TEQX 5EHVA 3IBIA 4Z1KA 1HCAA 4Z1EA 5DSPA 3FE4A 1DCAA 4Q08A 1G0EA 4Q81A 5FLTA 3ML2A 3K34A 3MHMA 4Q8ZA 5SZ2A 5JQTA 1KEQA 3M2YA 4M2RA 4KP8A 3BL1A 3DD0A 3MHIA 2POWA 3PO6A 3Q31A 1CRAA 4MLXA 3RYXB 3S73B 3P3JA 5FNLA 1CVEA 2ZNCA 4Q83A 1EOUA 3RGEA 4ZWYA 1IF6A 1TE3X 5FL5A 3D8WA 3T5UA 3UYNA 1CVCA 1IF8A 4Q6DA 4RFDA 3M2ZA 3IAIA 3T83A 1YO1A 4FIKA 1UGEA 3P3HA 1BNVA 1CNWA 2WEGA 3MNUA 4FRCA 1OKLA 5SZ1A 1CVFA 4Z1NA 3DVDA 4LP6A 1HECA 3ML5A 3RZ5A 3TVOX 3EFIA 4MDMA 3BETA 4ZX0A 2QP6A 1FQRA 3EFTA 4WUPA 1H9QA 5FLQA 3KOIA 1YDAA 1HUHA 4DZ9A 3W6HA 4CNVA 1G6VA 1KWRA 3KNEA 4ZAOA 4WW6A 4KNNA 1G53A 3RG3A 1G46A 3SAPA 2H4NA 4QK3A 1TG9A 3FW3A 2F14A 4Q06A 3F7UA 4KUYA 3SBIA 1KWQA 5JGTB 4PZHA 1FR7A 2WEOA 1URTA 2WEHA 5DSLA 4K1QA 3MNKA 5DSOA 3QYKA 5EHWA 3RYZA 3W6IA 2QOAA 2NWOA 1UGGA 4QJMA 1ZSCA 4HEYA 3TMJA 4YGNA 1I91A 4QJWA 5DSNA 4KP5A 1HEBA 3BL0A 1BZMA 1ZNCA 3CA2A 3MYQA 3M1QA 3S9TA 1TTMA 3D92A 4Q49A 2GEHA 5EKJA 4YVYA 2X7TA 5SZ3A 4FPTA 3S75B 1TBTX 2NXTA 5CLUA 3HKUA 4YYTA 2NN7A 3S74B 3D0NA 4KNMA 1ZH9A 1FQLA 3S77B 4RUYA 3V2MA 3V3IB 3FFPX 3HLJA 5FNMA 2HKKA 4WW8A 3RZ7A 1TEUX 3M5SA 3MMFA 1KOQA 3DA2A 5DSRA 1CAHA 5FLPA 3L14A 4QIZA 1RJ6A 4YXIA 4Q99A 5BYIA 1Z97A 2NWYA 3CYUA 3DV7A 2CBEA 8CA2A 3KWAA 5DOHA 3RZ8A 3MNIA 4MDLA 2VVAX 2Q38A 4Q8XA 4FVOA 3OYQA 3V3JA 4Q09A 4E3HA 1RZEA 1HUGA 4MTYA 4PYYA 1J9WA 4HBAA 3S76A 1LG5A 1JV0A 3HS4A 1BNWA 4HF3A 4E3FA 5JESB 3IBNA 1H9NA 1I9MA 3SAXA 4Q90A 3IGPA 1LUGA 1MOOA 2QO8A 3F4XA 3HKNA 5SZ7A 3M98A 4RIVA 1MUAA 4KNIA 3RYJB 3DCCA 4IDRX 4G0CA 1IF4A 3MZCA 1CNXA 1ZSAA 4YGFA 5FNJA 5EKHA 5BRVA 4Q8YA 4ZX1A 2EU2A 2WEJA 5DVXA 4LHIA 1G4JA 4ITOA 1G45A 1UGDA 4YX4A 3DBUA 3PYKA 1CVBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 5E2K A;  4X5S A;  1XEV A;  5FL6 A;  1AZM A;  3IBU A;  3S72 B;  5E5R A;  2FMG A;  3DAZ A;  4MLT A;  3M1K A;  3NB5 A;  1V9E A;  1XQ0 A;  3OKV A;  1RZD A;  3CAJ A;  3OKU A;  2HFW A;  4R59 A;  1FLJ A;  4KNJ A;  5AMG A;  4Z1J A;  2WD3 A;  3HFP A;  4C3T A;  1HCB A;  2FW4 A;  1CCU A;  2FOQ A;  3T84 A;  5JG3 B;  4QSB A;  4M2V A;  4YXO A;  2Q1Q A;  4RUZ A;  5DSI A;  2CA2 A;  5E2M A;  3V3G B;  2FNK A;  4QJO A;  2HL4 A;  5FNI A;  1HED A;  1CA3 A;  1XEG A;  4RFC A;  1BNT A;  1CAK A;  1LG6 A;  2CAB A;  4XIW A;  4XIX A;  3M2N A;  1CVH A;  4LU3 A;  2ILI A;  4K0S A;  4HT0 A;  1RZC A;  5SZ0 A;  3V3F A;  3M40 A;  4L5V A;  4XFW A;  1BN3 A;  2CBB A;  4G7A A;  5EHE A;  3RYV B;  4BF6 A;  1BNU A;  3JXG A;  4ETQ C;  3MNJ A;  4Y0J A;  3RLD A;  1ZE8 A;  1DMX A;  3KKX A;  1Z93 A;  3DCW A;  1BNM A;  1CAJ A;  4JSA A;  2CBC A;  3U7C A;  1CIM A;  2NN1 A;  2NNO A;  4M2W A;  3S97 A;  5C8I A;  1FQN A;  3M96 A;  4Q7S A;  4QJP A;  4YWP A;  4CNW A;  4TWM A;  5EH5 A;  1RJ5 A;  1CNK A;  1OKM A;  3P58 A;  1OKN A;  5E2R A;  4E4A A; 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