1TG9A

Effect of shuttle location and ph environment on h+ transfer in human carbonic anhydrase ii
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNHGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Carbonic anhydrase II
publication title Structural and Kinetic Characterization of Active-Site Histidine as a Proton Shuttle in Catalysis by Human Carbonic Anhydrase II
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 75
structure length 258
sequence length 258
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2004-05-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1tg9A00
1FR4A 3JXGA 3NI5A 4KUYA 4QSIA 3DVBA 4E3FA 1FSRA 5DSRA 5EH8A 1YO1A 2X7TA 4BF1A 1CANA 4K0ZA 4WW8A 3RJ7A 2ILIA 1ZE8A 3RZ1B 3KIGA 1CNIA 2NWYA 1XPZA 4CNRA 1ZFQA 5EKJA 2OSMA 1JD0A 4Q07A 4MLXA 2NNOA 5CJFA 5G0BA 3IAIA 3TMJA 3M2XA 3P5LA 4QTLA 1CAIA 3CYUA 4K0TA 1G4OA 4XZ5A 5BRWA 1CCTA 3T5UA 1YDDA 4R5BA 1BNNA 1CVEA 1IF6A 1ZGFA 3M04A 3BL1A 2Q38A 2WEGA 4QJOA 4RUYA 5AMLA 3DC3A 3HLJA 1LG5A 1JV0A 3NB5A 3OIMA 1YDCA 1FSQA 1Z97A 4HEWA 1FQNA 3KOIA 4FVOA 1RZDA 4K13A 1CNJA 1UGCA 3MHCA 5SZ5A 3MDZA 4Z1NA 2ABEA 1CAMA 4ZAOA 1XQ0A 7CA2A 5FLQA 5IPZA 3OILA 3MYQA 2NXSA 4ITPA 4RN4A 5EHVA 3F7UA 4M2WA 3N4BA 1LZVA 4RUXA 1KOQA 1G0EA 3MNKA 3M2YA 1BNWA 4YGFA 3MHLA 2EU2A 4M2RA 2CABA 5E5RA 2CBEA 3JXFA 1Z9YA 1ZFKA 2VVBX 3D9ZA 3HS4A 4Z0QA 4KNJA 5AMGA 3V3FA 1I9QA 4KNIA 4MDMA 3MNAA 3M5EA 3ML5A 3V3HB 3S77B 3HKTA 4GL1X 1HEAA 3S76A 1RZEA 3V3IB 3OYQA 4CQ0A 1KEQA 3S8XA 1CCSA 1THKA 4MDGA 4WUPA 4E49A 3N3JA 1IF5A 2FOSA 5DSIA 3P4VA 4LP6A 4RH2A 1I8ZA 4K0SA 2NWPA 5EHEA 4XIXA 3IBLA 1OKNA 3RG4A 4Q7SA 2WD2A 3C7PA 2FOYA 1ZSCA 2NNGA 3EFIA 4Q87A 2NXRA 4E5QA 3RYVB 2NNVA 5C8IA 5BNLA 4ZWIA 4QJ0A 3S78B 4CA2A 2X7UA 3Q31A 4YGLA 4G7AA 1EOUA 4KP8A 2FNNA 3TVNX 1V9IC 3PYKA 3BETA 3R17B 4KAPA 3SAXA 5FNIA 3MWOA 5EH5A 1CAKA 5DSQA 5DSPA 2FMGA 1IF8A 1CCUA 4JSWA 3MMFA 5A6HA 1FQLA 4QK1A 4MO8A 4HT0A 3U47A 2FNKA 4Q09A 1Y7WA 2VVAX 4E3GA 2HOCA 1BN3A 5G01A 1LUGA 2FNMA 3RLDA 1ZH9A 4ZWZA 5JEPB 1CAHA 4Q81A 2FOVA 3T83A 4C3TA 3V7XA 1I9NA 5DOHA 1CNGA 3DAZA 3DBUA 2QO8A 1TTMA 3K7KA 4LHIA 4ITOA 5CACA 8CA2A 3DD0A 2EU3A 4M2UA 1CIMA 2O4ZA 3IBIA 4KUVA 5E2NA 1AZMA 4JS6A 2X7SA 5G0CA 3ZP9A 3DD8A 5E2KA 2EZ7A 1FR7A 5DVXA 4Q7PA 1BN1A 2NNSA 3T85A 4FVNA 4WUQA 3RG3A 5BRVA 12CAA 4WR7A 5EH7A 1TE3X 1UGBA 3MHOA 3NJ9A 4XIWA 5JG5B 4TWMA 3DCCA 5LMDA 3RZ8A 3KONA 1H9NA 4L5WA 4Q9YA 1CVFA 4Q8XA 4CNXA 3DCSA 2IT4A 4RIVA 2HL4A 1CNXA 4QJMA 3S9TA 4CACA 3S72B 3P5AA 3TVOX 4YXOA 3FE4A 1G3ZA 3PO6A 4E3DA 4Q0LA 4PZHA 1CVBA 1HUHA 4BCWA 3K34A 3M2NA 6CA2A 4ETQC 3FFPX 1CILA 5JEHB 4COQA 4QSAA 1HEBA 4HEZA 4PYYA 3K2FA 3D93A 5FLPA 3P3JA 3RYZA 5J8ZA 1JCZA 3F8EA 3T82A 1LGDA 5BYIA 1KWQA 4Q99A 3B1BA 3RYYA 5FLOA 3M2ZA 5SZ0A 1HECA 4L5UA 4ZWYA 4K1QA 4DZ7A 1F2WA 1G1DA 3S97A 3IBNA 5E2SA 2AW1A 4Q6DA 3RYXB 1BNMA 5EKHA 5EIJA 3IBUA 1UGAA 5EOIA 4HT2A 2CA2A 3N2PA 3DCWA 1UGDA 3OKVA 4YXIA 3VBDA 2NN1A 2CBBA 5SZ2A 3DC9A 1CZMA 3IEOA 4JSAA 4WL4A 1G53A 1UGGA 3V3GB 1CNCA 1TEUX 1G46A 3ML2A 5EHWA 9CA2A 1H4NA 4CNVA 1AM6A 1OQ5A 1CALA 2ZNCA 3HKQA 5FLSA 1BNQA 3FW3A 3MNIA 3S74B 2WEJA 3KS3A 5JEGB 4TWLA 5JESB 1CVHA 3DV7A 5G03A 4Q06A 1TH9A 1CNHA 2NMXA 4DZ9A 2NWZA 3M3XA 1TEQX 1XEGA 4M2VA 4QSJA 1FQMA 1I9OA 1RJ6A 4R59A 5E5UA 1I90A 1RZBA 1CNKA 5CA2A 4MDLA 3P44A 3V5GA 5EZTX 2WEOA 1HEDA 3CAJA 1CRMA 2FW4A 4PQ7A 3KLDB 3M5SA 4QSBA 2FMZA 3KKXA 4Q08A 4KNMA 2W2JA 5DOGA 4KUWA 1FSNA 1I9MA 4R5AA 1IF4A 1G4JA 1CNBA 4FRCA 3M98A 2NN7A 1TG9A 3GZ0A 4HEYA 1G0FA 1CVDA 1G48A 3V2MA 1ZSBA 2Q1BA 1CA2A 2FOQA 4IDRX 3UYNA 3MZCA 3S71B 5FL4A 4JSZA 3RZ5A 3SAPA 3M1QA 5DSLA 5FL6A 3KOKA 3T5ZA 3U3AX 4RFCA 5FLRA 1G45A 4KP5A 1TG3A 5CLUA 4YVYA 1TB0X 1CAYA 3MHMA 1URTA 3SBIA 5DSJA 2HKKA 4Q90A 3HKUA 4Q83A 5FNJA 3V2JA 3SBHA 1UGFA 4PXXA 5FL5A 2GD8A 5DSOA 2NXTA 1HUGA 1HCAA 3L14A 4X5SA 1DCAA 4RUZA 4QIZA 3W6IA 3HFPA 1BN4A 3M1KA 5EKMA 1G52A 5FLTA 1G54A 1UGEA 3P3HA 4L5VA 5JGTB 5DSNA 4QY3A 3OY0A 3T84A 1XEVA 4QIYA 4ZX0A 3CA2A 4Q8ZA 3IGPA 1CNWA 1YDAA 3M14A 4Q6EA 5E2MA 3KWAA 4ILXA 4PYXA 4Q8YA 2NWOA 1BNTA 1V9EA 2FOUA 4Z1KA 4KV0A 5SZ1A 1DCBA 1YDBA 4HF3A 5SZ4A 1CAZA 4E3HA 2CBAA 1I91A 3RGEA 3EFTA 4UOVA 2QP6A 1DMXA 4FU5A 3PJJA 1HCBA 5BRUA 1YO0A 3P58A 3RZ0B 3W6HA 2H15A 1RZCA 5DSKA 4XFWA 3RZ7A 1OKMA 5SZ3A 4Y0JA 3F7BA 5A25A 1ZGEA 1I9PA 4ZWXA 5FDIA 5FNKA 5FNMA 1CAJA 4FL7A 3M5TA 4YXUA 1CVAA 2CBDA 4HBAA 3D0NA 2GEHA 4E9OX 3F4XA 4Q7WA 3S73B 2F14A 3BL0A 4Q78A 1KWRA 1BNUA 3OYSA 4Q49A 5FNGA 5SZ7A 4JSSA 4LU3A 4YWPA 4MTYA 4YX4A 1CA3A 4QK3A 5FNLA 1LG6A 3S75B 3RYJB 5SZ6A 3V3JA 5HPJA 3U7CA 1BV3A 2QOAA 5JQ0A 2OSFA 2AX2A 3B4FA 4YGNA 4YGKA 1BNVA 1BICA 4FIKA 4HU1A 1ZNCA 1CNYA 1FQRA 3DA2A 3LXEA 1MUAA 1OKLA 1T9NA 3KNEA 3M67A 4E4AA 2WEHA 3JXHC 3M1JA 3U45X 4QEFA 1IF7A 1BZMA 1G6VA 1DMYA 1YO2A 4G0CA 3OKUA 1CAOA 3R16A 4XE1A 1IF9A 2Q1QA 4N0XB 4RIUA 1CVCA 4N16A 2POVA 3CZVA 1HVAA 3UYQA 1A42A 4YHAA 5JQTA 1ZSAA 2WD3A 3P55A 5JDVB 2CBCA 1H9QA 1I9LA 3M40A 4ZX1A 3MNHA 4BF6A 1J9WA 4YGJA 1CINA 5L6KA 1TBTX 1RAYA 3D8WA 1BCDA 2HNCA 2POWA 3D92A 5E28A 4MLTA 1KOPA 1MOOA 3MHIA 1CRAA 1RZAA 3HKNA 3M96A 3DVCA 4WW6A 3MNUA 4CNWA 1AVNA 2HD6A 4IWZA 2H4NA 4Z1JA 5AMDA 1Z93A 3MNJA 4FPTA 4QJPA 4YYTA 3QYKA 3M1WA 4QK2A 4Q7VA 4RFDA 5FDCA 5FNHA 5JG3B 5JGSB 4Z1EA 3DVDA 1RJ5A 3OIKA 5DRSA 5E2RA 2HFWA 4QJXA 3ZNCA 2POUA 1FLJA 1RAZA 4KNNA 4QJWA 3N0NA 5DSMA 5L3OA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1FR4 A;  3JXG A;  3NI5 A;  4KUY A;  4QSI A;  3DVB A;  4E3F A;  1FSR A;  5DSR A;  5EH8 A;  1YO1 A;  2X7T A;  4BF1 A;  1CAN A;  4K0Z A;  4WW8 A;  3RJ7 A;  2ILI A;  1ZE8 A;  3RZ1 B;  3KIG A;  1CNI A;  2NWY A;  1XPZ A;  4CNR A;  1ZFQ A;  5EKJ A;  2OSM A;  1JD0 A;  4Q07 A;  4MLX A;  2NNO A;  5CJF A;  5G0B A;  3IAI A;  3TMJ A;  3M2X A;  3P5L A;  4QTL A;  1CAI A;  3CYU A;  4K0T A;  1G4O A;  4XZ5 A;  5BRW A;  1CCT A;  3T5U A;  1YDD A;  4R5B A;  1BNN A;  1CVE A;  1IF6 A;  1ZGF A;  3M04 A;  3BL1 A;  2Q38 A;  2WEG A;  4QJO A;  4RUY A;  5AML A;  3DC3 A;  3HLJ A;  1LG5 A;  1JV0 A;  3NB5 A;  3OIM A;  1YDC A;  1FSQ A;  1Z97 A;  4HEW A;  1FQN A;  3KOI A;  4FVO A;  1RZD A;  4K13 A;  1CNJ A;  1UGC A;  3MHC A;  5SZ5 A;  3MDZ A;  4Z1N A;  2ABE A;  1CAM A;  4ZAO A;  1XQ0 A;  7CA2 A;  5FLQ A;  5IPZ A;  3OIL A;  3MYQ A;  2NXS A;  4ITP A;  4RN4 A;  5EHV A;  3F7U A;  4M2W A;  3N4B A;  1LZV A;  4RUX A;  1KOQ A;  1G0E A;  3MNK A;  3M2Y A;  1BNW A;  4YGF A;  3MHL A;  2EU2 A;  4M2R A;  2CAB A;  5E5R A;  2CBE A;  3JXF A; 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