1TTMA

Human carbonic anhydrase ii complexed with 667-coumate
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Carbonic anhydrase II
publication title Crystal structure of human carbonic anhydrase II at 1.95 A resolution in complex with 667-coumate, a novel anti-cancer agent
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 77
structure length 258
sequence length 258
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2004-06-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1ttmA00
1G52A 1I91A 1TTMA 3RG4A 1CILA 3F4XA 4QK2A 2AW1A 4YXIA 3CAJA 3S8XA 1I9MA 4K0ZA 3P5AA 1IF5A 4YVYA 2HNCA 4L5VA 1UGFA 3U3AX 4YGFA 1BNUA 2Q1QA 3S71B 1CVEA 4XIXA 1CAIA 3M1WA 3S73B 4CNXA 1Z97A 3MNHA 3JXHC 4PYXA 5E2RA 4Q7WA 5DSLA 5FLPA 5SZ0A 5JEPB 4PXXA 2AX2A 2WEHA 1G4OA 4MO8A 4YYTA 1CAHA 4HT2A 3P4VA 4Q7SA 5A25A 3OKUA 3V3IB 1UGGA 3DC9A 3HKTA 2QO8A 4CNRA 1BCDA 3DCWA 2ZNCA 3RZ8A 3FFPX 1G6VA 4Q6DA 1CAZA 4HBAA 3D8WA 3HLJA 1OKNA 1BICA 3U47A 2X7TA 3DCSA 5E2SA 4Z0QA 1HEDA 4KAPA 1LG6A 3U7CA 1BNMA 4KUWA 1CNGA 4YGKA 1FSRA 1ZH9A 1I9PA 4K0SA 12CAA 3R16A 3UYQA 4FRCA 5G0CA 3S76A 3RYXB 4QSBA 2FMZA 3KIGA 4Q78A 4CACA 4L5UA 4LU3A 4DZ7A 4L5WA 1A42A 3T84A 3DD0A 4WUQA 3T82A 4E49A 5G0BA 3U45X 3FW3A 3RZ7A 3C7PA 1CCTA 1FLJA 1CNKA 4Q08A 2WEOA 3M1KA 1RZBA 1ZNCA 3M1JA 4Q06A 3T83A 1AM6A 1HEAA 3KWAA 4Q90A 4KUYA 3P58A 3B1BA 5SZ3A 4FVNA 2CBCA 3VBDA 3M14A 3TMJA 4RH2A 1TBTX 1CVBA 2FNMA 6CA2A 2POUA 1HUHA 2W2JA 3IBUA 4QK1A 2CBDA 1CVCA 4Q09A 1RJ5A 2IT4A 5E2NA 3RLDA 4DZ9A 3KKXA 5DRSA 5SZ6A 3D0NA 1BZMA 1G48A 1XPZA 4Q6EA 4BCWA 3M3XA 3T5UA 4JSZA 3RZ1B 3NB5A 5CJFA 1DCAA 3S77B 3OY0A 3IEOA 1KWQA 3NI5A 4Q8YA 4MDMA 4YWPA 3B4FA 3PYKA 1BNQA 5EH7A 4HF3A 3T5ZA 2NWYA 1CZMA 3K34A 3N3JA 1TG9A 5FNLA 4YGLA 3F8EA 1CA3A 4Q9YA 5DSOA 1CVFA 1RZAA 5FLSA 1ZE8A 3V3HB 5BRUA 3S9TA 3DD8A 4QY3A 1RAYA 5FL6A 2VVBX 1G0FA 3V3GB 2CBAA 4YXUA 1YO2A 5FLRA 4ZWIA 2Q38A 4YHAA 2NNSA 3T85A 2EU3A 3RYVB 1CANA 5CACA 4Q07A 1ZGFA 3KNEA 2GEHA 3SAXA 3M5TA 1DMXA 4Q83A 4IWZA 9CA2A 4LHIA 1ZGEA 3W6HA 4QTLA 1CNWA 1HECA 5G01A 5FNGA 5BNLA 5SZ4A 3LXEA 4ITOA 3PJJA 4N0XB 1CVAA 3R17B 4TWMA 5JGTB 3M2YA 4XIWA 4COQA 2EZ7A 3HKNA 4R5BA 5FLOA 5JGSB 2X7SA 4KP5A 1HEBA 3OILA 5G03A 1CA2A 1I9QA 5FLTA 4RUZA 1G3ZA 1URTA 1HUGA 3JXGA 2FOUA 3ML5A 3MNIA 4ZWYA 4PQ7A 3P44A 1G46A 3OKVA 4Q7VA 4ZWZA 3S72B 4RFCA 3D92A 2FW4A 3M2ZA 1CNIA 3Q31A 4YGNA 1OQ5A 2POVA 3DVDA 2CABA 1ZFKA 3N4BA 1IF4A 4XFWA 4ETQC 4E3FA 3MHLA 1CCUA 3DBUA 2HKKA 2WD2A 4G0CA 3RYJB 3SBHA 1JV0A 3RYYA 2GD8A 1V9EA 3MHOA 4QSIA 5EHWA 1YDCA 3D93A 2HL4A 4K0TA 1F2WA 4WUPA 5JG3B 3MNUA 3M5SA 3SAPA 4LP6A 3OYQA 5C8IA 3MDZA 5CA2A 4Q49A 3M04A 1KWRA 4Y0JA 3HS4A 1IF9A 1J9WA 4ZX0A 4ZX1A 1DMYA 1AZMA 4Q8XA 1MOOA 3CA2A 2NWZA 3HFPA 1UGCA 5EH5A 5JEHB 1RZCA 2QP6A 3OYSA 2WEJA 4R59A 3IBIA 4E4AA 1JD0A 1CNYA 4ILXA 5BRWA 1TEQX 8CA2A 2NWPA 1I9OA 5JQTA 4XZ5A 4M2WA 4WL4A 1THKA 1Z93A 1CNCA 2FOSA 4FL7A 5AMGA 3S78B 1Z9YA 5FDIA 1AVNA 1BNNA 1XQ0A 5EKJA 5FLQA 5FL5A 1LZVA 1CAMA 3KOIA 3MNAA 4BF1A 1RJ6A 3PO6A 4ITPA 4E3DA 1HCBA 4IDRX 4MDGA 3ZNCA 3RGEA 5SZ2A 1IF7A 2NWOA 3MNJA 4MDLA 5EIJA 3ZP9A 2POWA 2FNKA 1BN1A 3S97A 1BN3A 4QJXA 1TH9A 1KOPA 3BETA 4MLXA 3FE4A 3P3JA 1BV3A 3V3JA 1CVDA 4RFDA 3OIMA 1RZDA 4KNMA 3RJ7A 1G54A 3K2FA 3DA2A 2CBEA 5DSNA 5EHVA 3M96A 3KLDB 5FNJA 4JSSA 3BL1A 1CVHA 5FNKA 1V9IC 5JQ0A 1T9NA 4M2RA 1XEVA 3RZ5A 3CYUA 1EOUA 3CZVA 5JG5B 1BN4A 1YO0A 3TVNX 1CCSA 4JSWA 1LGDA 1CAOA 4Q87A 4E5QA 5L6KA 4YXOA 4QIZA 2OSFA 1LG5A 4CA2A 1H9QA 2QOAA 1TE3X 1UGBA 4QEFA 4E9OX 4M2UA 4CNWA 5J8ZA 4HEWA 5DSRA 1I90A 3IAIA 4N16A 4XE1A 2X7UA 4HU1A 5HPJA 1I9LA 4MLTA 3F7BA 5L3OA 5EZTX 3N0NA 4R5AA 5FNMA 5SZ1A 5DSJA 1G1DA 2FMGA 3V2MA 5JEGB 4RIUA 3MHCA 4FIKA 4TWLA 1HCAA 2FNNA 1CNHA 1ZSAA 1YO1A 4KNIA 5FNHA 1G0EA 1CIMA 4K13A 4UOVA 3RG3A 1ZSCA 4FVOA 4GL1X 1H4NA 1MUAA 5E2MA 3DAZA 5FNIA 1KEQA 3V2JA 1YDAA 4M2VA 4WW8A 4CQ0A 4E3GA 5EOIA 5DOHA 5FDCA 5DSPA 4RUYA 3P3HA 4KV0A 5DSKA 1LUGA 2NN1A 1UGDA 2VVAX 2NXTA 1CALA 3M67A 3IBNA 1CNXA 3SBIA 1ZFQA 2ABEA 3BL0A 4HEYA 1JCZA 4YGJA 3TVOX 5DSQA 7CA2A 3DVCA 5A6HA 1DCBA 3EFIA 4RN4A 1XEGA 2F14A 1FSNA 4Q8ZA 2FOQA 4WW6A 2OSMA 4QK3A 4G7AA 4K1QA 2NXRA 1YDBA 1IF6A 3L14A 3MZCA 2NXSA 3M5EA 5BRVA 3V7XA 1RAZA 3M1QA 3KONA 3MMFA 5DSIA 1G4JA 5AMDA 3S74B 4RUXA 1OKLA 4WR7A 3GZ0A 4Q7PA 3V5GA 5EH8A 4ZWXA 1H9NA 3HKUA 4JS6A 4KP8A 3QYKA 1FR7A 2Q1BA 4BF6A 5SZ7A 3JXFA 3IGPA 1UGEA 2NN7A 5BYIA 1YDDA 2HOCA 5LMDA 4Z1EA 2NMXA 1BNWA 1CAKA 4PZHA 5DSMA 5E28A 2EU2A 2NNGA 4Q0LA 2FOVA 4KNJA 4KNNA 1FSQA 1TG3A 1IF8A 3EFTA 2H4NA 3P5LA 1ZSBA 4HEZA 5E5UA 3UYNA 4QIYA 5AMLA 3OIKA 4X5SA 3F7UA 4Z1JA 3HKQA 1RZEA 1FR4A 2WEGA 3M98A 5E2KA 2CBBA 4C3TA 2NNVA 3MHMA 3W6IA 2FOYA 4FPTA 3D9ZA 1CAJA 3KS3A 1FQNA 3MHIA 1TB0X 2H15A 4HT0A 5E5RA 3NJ9A 1G53A 1TEUX 5FL4A 2HFWA 3N2PA 3DVBA 2HD6A 5SZ5A 4JSAA 4QSAA 3S75B 4Z1KA 4QJMA 2O4ZA 5JDVB 3DC3A 4Z1NA 3MWOA 5DVXA 3M2NA 4FU5A 4RIVA 1CRAA 2WD3A 1CAYA 3KOKA 3MYQA 1CNJA 1G45A 3M40A 3MNKA 3P55A 1Y7WA 5EKMA 3ML2A 4ZAOA 3K7KA 4QJPA 5CLUA 4YX4A 4E3HA 4Q81A 5JESB 4Q99A 1FQRA 2CA2A 1BNVA 1OKMA 4CNVA 3RYZA 3V3FA 1HVAA 4QSJA 2NNOA 3IBLA 3M2XA 3RZ0B 3DV7A 1KOQA 3DCCA 4QJOA 1CINA 4KUVA 1I9NA 1CRMA 4PYYA 1I8ZA 1UGAA 5DOGA 4QJWA 4MTYA 5EHEA 5EKHA 5IPZA 2ILIA 1CNBA 1FQMA 4QJ0A 1BNTA 1FQLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1G52 A;  1I91 A;  1TTM A;  3RG4 A;  1CIL A;  3F4X A;  4QK2 A;  2AW1 A;  4YXI A;  3CAJ A;  3S8X A;  1I9M A;  4K0Z A;  3P5A A;  1IF5 A;  4YVY A;  2HNC A;  4L5V A;  1UGF A;  3U3A X;  4YGF A;  1BNU A;  2Q1Q A;  3S71 B;  1CVE A;  4XIX A;  1CAI A;  3M1W A;  3S73 B;  4CNX A;  1Z97 A;  3MNH A;  3JXH C;  4PYX A;  5E2R A;  4Q7W A;  5DSL A;  5FLP A;  5SZ0 A;  5JEP B;  4PXX A;  2AX2 A;  2WEH A;  1G4O A;  4MO8 A;  4YYT A;  1CAH A;  4HT2 A;  3P4V A;  4Q7S A;  5A25 A;  3OKU A;  3V3I B;  1UGG A;  3DC9 A;  3HKT A;  2QO8 A;  4CNR A;  1BCD A;  3DCW A;  2ZNC A;  3RZ8 A;  3FFP X;  1G6V A;  4Q6D A;  1CAZ A;  4HBA A;  3D8W A;  3HLJ A;  1OKN A;  1BIC A;  3U47 A;  2X7T A;  3DCS A;  5E2S A;  4Z0Q A;  1HED A;  4KAP A;  1LG6 A;  3U7C A;  1BNM A;  4KUW A;  1CNG A;  4YGK A;  1FSR A;  1ZH9 A;  1I9P A;  4K0S A;  12CA A;  3R16 A;  3UYQ A;  4FRC A;  5G0C A;  3S76 A;  3RYX B;  4QSB A;  2FMZ A;  3KIG A;  4Q78 A;  4CAC A;  4L5U A;  4LU3 A;  4DZ7 A;  4L5W A;  1A42 A;  3T84 A;  3DD0 A;  4WUQ A;  3T82 A;  4E49 A;  5G0B A;  3U45 X; 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