1UGDA

Human carbonic anhydrase ii[hcaii] (e.c.4.2.1.1) mutant with ala 65 replaced by ser (a65s)
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHSFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase (oxo-acid)
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE II
publication title X-ray crystallographic studies of alanine-65 variants of carbonic anhydrase II reveal the structural basis of compromised proton transfer in catalysis.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 79
structure length 258
sequence length 258
other databases KnotProt 2.0: K +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 1996-07-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1ugdA00
3M5TA 4ITPA 1G4JA 3V2JA 3MZCA 4CA2A 1KEQA 1YDAA 1DCBA 1FSRA 4CNRA 4CQ0A 6CA2A 3T5ZA 1IF6A 5FLTA 3FFPX 3IGPA 2QO8A 3F4XA 5EHVA 1CNWA 4PZHA 4DZ9A 4QSAA 1CVBA 5DSLA 3M5EA 2POWA 4MO8A 3TMJA 3ML5A 1I9NA 4E5QA 4FL7A 3UYQA 1RZBA 3TVNX 5FL6A 4YGLA 3D93A 5EZTX 5BYIA 1TEUX 2CBCA 1YDDA 3M2NA 4ZAOA 5CACA 4YGFA 4E9OX 4YYTA 3KLDB 3N3JA 3JXHC 3T85A 4HEYA 1BNNA 2Q38A 1CNHA 1CZMA 3MHIA 4MDGA 4Q6DA 4WW6A 3MNAA 2OSMA 3Q31A 3IBIA 1JCZA 1HVAA 4KUYA 1YO2A 2H15A 4JSZA 2POVA 3DCCA 1JD0A 3PJJA 1TB0X 4QY3A 3NI5A 3M96A 4KUVA 4Q8XA 1IF5A 5C8IA 3S8XA 3T5UA 4Z0QA 1HCAA 3D8WA 4IDRX 4IWZA 3RYZA 2VVBX 3KS3A 1IF8A 3T82A 5E5RA 4E3FA 3P3JA 1I9QA 3SBHA 2GEHA 1BZMA 1OKLA 2EZ7A 1G48A 1I90A 3RYJB 1UGBA 3S76A 1BN4A 2CBBA 5AMGA 3RYYA 5FDIA 4YXOA 5FLPA 3NJ9A 4RUXA 2AW1A 4JSAA 3CZVA 4HT0A 3S77B 5A25A 4G7AA 5EH5A 3DV7A 5DSMA 2HNCA 1YO0A 1CALA 5AMLA 4Z1NA 3P5LA 1RAYA 4YGKA 4ZWYA 3MHLA 3MNKA 3K7KA 4XFWA 1YDBA 2F14A 5EOIA 3M14A 2NNGA 2FMZA 3DAZA 3MNUA 2NXRA 4Z1JA 3M1WA 1CVHA 3EFTA 1FSQA 3VBDA 4WL4A 3ML2A 5SZ6A 2FOYA 1I9LA 1CNKA 4RUZA 4KNNA 1LGDA 3OIKA 5EH8A 5EH7A 5FNIA 5A6HA 2FOUA 4JSSA 5DSKA 5SZ1A 3OYQA 4K13A 1DMYA 1DMXA 5L3OA 2FNKA 3OIMA 1I9MA 1YDCA 1I91A 3KOIA 3N2PA 1LZVA 3C7PA 4HEWA 4XZ5A 3V5GA 4FRCA 1FQMA 3V3JA 1XPZA 3HLJA 1AM6A 4Q08A 1MUAA 4DZ7A 1RZEA 3DD0A 3ZP9A 4Q8YA 1G53A 2ZNCA 5FNJA 1CVFA 1CVDA 2X7SA 3OILA 3HKQA 3D9ZA 4Q83A 1CANA 5SZ2A 5BRUA 2CABA 3P55A 1ZSAA 2H4NA 3KOKA 5SZ3A 1LUGA 4L5WA 4QIZA 2Q1QA 3P44A 4E3HA 5FL5A 1T9NA 3SBIA 4BF1A 2NNVA 2IT4A 3JXFA 1RZAA 2NWYA 4G0CA 1CNBA 3OYSA 5JQ0A 4PYXA 1TG3A 3MNJA 4RUYA 4LU3A 5JDVB 4L5UA 4QSJA 2NN7A 4MLXA 1FR7A 1BV3A 1ZGEA 3S73B 3P5AA 4Z1KA 3F8EA 1UGEA 2X7UA 1I9OA 3KNEA 4KUWA 4QEFA 2QOAA 1YO1A 9CA2A 2FOQA 3V3HB 5DVXA 1BCDA 3DBUA 4YX4A 1AZMA 3BL1A 5SZ4A 1CA2A 3DC9A 2GD8A 4Q0LA 1CILA 3M5SA 3ZNCA 3S78B 1CA3A 4R5AA 2FMGA 1Z9YA 5E28A 5L6KA 1ZSCA 4BF6A 3MHMA 1CIMA 1HEAA 3F7UA 2NN1A 3RG3A 5G0BA 4Q8ZA 1CNIA 5FNGA 4HBAA 1CVAA 4Q49A 4XE1A 3DA2A 1RZCA 1TBTX 3T83A 3S97A 4QIYA 3S9TA 3DCWA 2FNMA 3K34A 5JQTA 4M2WA 4N0XB 2NWZA 4PXXA 4Q7PA 3JXGA 1IF7A 4QTLA 3B4FA 1OKMA 1G6VA 5EIJA 2FOVA 3N0NA 4ITOA 3U7CA 5FNHA 5DSPA 5E2RA 5CA2A 1G1DA 3R16A 3HKTA 4COQA 3M98A 4YGNA 4KNJA 4QK2A 4FPTA 4Q7WA 5EHWA 2WEJA 1CAZA 1URTA 4HT2A 1HUHA 5SZ7A 4Q09A 3BL0A 5HPJA 1ZFKA 4Z1EA 2CBDA 4RFDA 5JGSB 3KWAA 5FDCA 3RZ0B 3HKNA 1BNWA 1ZGFA 3OKUA 5JG3B 3DC3A 2NXTA 1BNMA 1Y7WA 3RZ1B 1FQRA 1ZNCA 5DSNA 3M2XA 3M40A 1V9IC 1UGGA 4QK1A 5FNMA 4XIWA 5CJFA 3CA2A 1CVEA 4LP6A 2NXSA 3DVBA 5E5UA 4Q06A 1KWQA 2HFWA 3QYKA 4YVYA 4QJXA 4RIVA 3M2YA 1CAOA 4CNXA 4QK3A 5EHEA 2EU3A 3M1QA 1I9PA 1TG9A 4L5VA 1BNTA 1CAJA 3EFIA 4Q78A 4MTYA 5DSJA 5G0CA 1H4NA 2WEOA 5DSRA 4K0TA 1BNVA 1KOQA 1CCUA 3HS4A 4YHAA 5DSIA 2FW4A 5EKHA 2CBEA 1AVNA 2WD2A 1KWRA 1RZDA 4YGJA 1J9WA 4QJWA 3T84A 4FVOA 4ZX1A 4ZWIA 4RIUA 1OQ5A 3P3HA 4ZWZA 3V7XA 5JGTB 4XIXA 3HFPA 3IEOA 3S74B 1DCAA 4HEZA 3UYNA 5BNLA 1KOPA 3PYKA 5EKJA 3U45X 4KP5A 1BICA 3V3FA 4CNVA 1CNGA 2NNOA 4Q7SA 3BETA 3S71B 1THKA 1UGFA 2WEHA 4WR7A 1FQLA 4KV0A 1ZSBA 3S75B 2X7TA 1CAIA 3RZ7A 4PQ7A 4QSIA 8CA2A 3DVCA 3MNHA 5DSOA 3MNIA 2O4ZA 4YXUA 5DSQA 1EOUA 2OSFA 2HD6A 3KIGA 3IBLA 3LXEA 4M2UA 3DD8A 3RG4A 1G0FA 2ILIA 5JG5B 3K2FA 3IBNA 1CAMA 3MHOA 4K1QA 3W6HA 1OKNA 4GL1X 2NMXA 1XEGA 4Y0JA 3M3XA 3DCSA 2FNNA 3M67A 4QJPA 3CAJA 3S72B 2QP6A 1G54A 4FIKA 4X5SA 1FQNA 5E2SA 4MDMA 3GZ0A 5SZ0A 2NWOA 4QJOA 1CCSA 1H9NA 3IAIA 2AX2A 3RGEA 4KNMA 3OKVA 1ZE8A 2CA2A 5E2NA 1F2WA 5JEHB 1Z97A 2EU2A 3U3AX 1UGAA 1CVCA 4R5BA 4QSBA 3V3IB 2VVAX 4ZWXA 1CAKA 1G4OA 4PYYA 3U47A 1TEQX 3RLDA 3RZ8A 3CYUA 3IBUA 1Z93A 1UGDA 1TH9A 4QJMA 4E3GA 3M04A 3RYVB 1ZFQA 3N4BA 4HU1A 2CBAA 4M2VA 2HKKA 4CACA 7CA2A 4Q81A 1BNUA 1IF4A 2FOSA 4RN4A 4TWMA 5LMDA 3SAPA 5JEPB 1I8ZA 2WD3A 1HEBA 4MDLA 4Q99A 3D92A 1HCBA 3V2MA 5FL4A 1FSNA 1CRMA 1H9QA 4C3TA 1HEDA 1CNCA 5E2KA 5DOHA 4WUPA 4KNIA 4Q90A 4Q07A 4E4AA 4E49A 5BRWA 5DOGA 1RAZA 3MHCA 5FLOA 4Q7VA 1CNXA 5EKMA 4YXIA 1G46A 3R17B 5E2MA 3KONA 5J8ZA 1V9EA 3D0NA 4HF3A 1FLJA 1G52A 5CLUA 5FLRA 4K0ZA 3RYXB 1A42A 5FNLA 1CRAA 1MOOA 3P58A 5G01A 2W2JA 1RJ5A 3MDZA 4WW8A 5FNKA 3RZ5A 1HUGA 1G45A 4MLTA 4BCWA 4JSWA 1ZH9A 4ETQC 12CAA 1TTMA 3F7BA 4K0SA 4WUQA 4RFCA 4KAPA 4JS6A 1FR4A 1LG6A 1JV0A 2POUA 1BN1A 3V3GB 4CNWA 4TWLA 2NNSA 4YWPA 1XEVA 4ILXA 2NWPA 5BRVA 4UOVA 4Q87A 3M1JA 1LG5A 2Q1BA 3M1KA 3DVDA 5JESB 1CAHA 4FU5A 4E3DA 1TE3X 4R59A 5JEGB 3OY0A 5G03A 3W6IA 4FVNA 1IF9A 4KP8A 1BNQA 3FE4A 5DRSA 3HKUA 2HL4A 5SZ5A 4QJ0A 4LHIA 2HOCA 3MMFA 3SAXA 1CNYA 5FLQA 2ABEA 3NB5A 4N16A 1UGCA 4Q6EA 1RJ6A 3FW3A 3KKXA 5AMDA 2WEGA 3PO6A 3TVOX 1CNJA 5FLSA 4RH2A 1XQ0A 3B1BA 5IPZA 1G3ZA 4M2RA 1G0EA 3L14A 1CAYA 4Q9YA 4ZX0A 3RJ7A 1CINA 3MWOA 1HECA 3M2ZA 1CCTA 3P4VA 1BN3A 3MYQA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3M5T A;  4ITP A;  1G4J A;  3V2J A;  3MZC A;  4CA2 A;  1KEQ A;  1YDA A;  1DCB A;  1FSR A;  4CNR A;  4CQ0 A;  6CA2 A;  3T5Z A;  1IF6 A;  5FLT A;  3FFP X;  3IGP A;  2QO8 A;  3F4X A;  5EHV A;  1CNW A;  4PZH A;  4DZ9 A;  4QSA A;  1CVB A;  5DSL A;  3M5E A;  2POW A;  4MO8 A;  3TMJ A;  3ML5 A;  1I9N A;  4E5Q A;  4FL7 A;  3UYQ A;  1RZB A;  3TVN X;  5FL6 A;  4YGL A;  3D93 A;  5EZT X;  5BYI A;  1TEU X;  2CBC A;  1YDD A;  3M2N A;  4ZAO A;  5CAC A;  4YGF A;  4E9O X;  4YYT A;  3KLD B;  3N3J A;  3JXH C;  3T85 A;  4HEY A;  1BNN A;  2Q38 A;  1CNH A;  1CZM A;  3MHI A;  4MDG A;  4Q6D A;  4WW6 A;  3MNA A;  2OSM A;  3Q31 A;  3IBI A;  1JCZ A;  1HVA A;  4KUY A;  1YO2 A;  2H15 A;  4JSZ A;  2POV A;  3DCC A;  1JD0 A;  3PJJ A;  1TB0 X;  4QY3 A;  3NI5 A;  3M96 A;  4KUV A;  4Q8X A;  1IF5 A;  5C8I A;  3S8X A;  3T5U A;  4Z0Q A;  1HCA A;  3D8W A;  4IDR X;  4IWZ A;  3RYZ A;  2VVB X;  3KS3 A;  1IF8 A;  3T82 A;  5E5R A;  4E3F A;  3P3J A;  1I9Q A;  3SBH A;  2GEH A;  1BZM A;  1OKL A;  2EZ7 A;  1G48 A;  1I90 A;  3RYJ B;  1UGB A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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