1V9IC

Crystal structure analysis of the site specific mutant (q253c) of bovine carbonic anhydrase ii
Total Genus 69
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
69
Knots found
sequence length
261
structure length
261
Chain Sequence
RCSHHWGYGKHNGPEHWHKDFPIANGERQSPVDIDTKAVVQDPALKPLALVYGEATSRRMVNNGHSFNVEYDDSQDKAVLKDGPLTGTYRLVQFHFHWGSSDDQGSEHTVDRKKYAAELHLVHWNTKYGDFGTAAQQPDGLAVVGVFLKVGDANPALQKVLDALDSIKTKGKSTDFPNFDPGSLLPNVLDYWTYPGSLTTPPLLESVTWIVLKEPISVSSQQMLKFRTLNFNAEGEPELLMLANWRPAQPLKNRCVRGFPK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Carbonic anhydrase II
publication title Crystal Structure Analysis of the site specific mutant (Q253C) of bovine carbonic anhydrase II
rcsb
source organism Bos taurus
total genus 69
structure length 261
sequence length 261
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2004-01-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
C PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1v9iC00
5JQTA 5JG3B 1FSRA 4BF1A 1I8ZA 3M2NA 3IBUA 2POUA 1XQ0A 1FQNA 5FLQA 3DVBA 1HCBA 1ZSCA 1ZSBA 3T83A 1JD0A 1THKA 9CA2A 3V7XA 4Q78A 1H4NA 4XZ5A 3RG3A 1I9LA 3V5GA 3HFPA 4KNMA 1HECA 3CAJA 2NWPA 3KLDB 2H15A 3JXGA 4KAPA 1DMYA 4E49A 3MHOA 3V3HB 5EKJA 3KOIA 4M2VA 3M1JA 1CILA 1IF8A 5FLSA 4ETQC 5L3OA 5FNIA 1IF5A 3MNUA 1CAHA 2WEJA 5FNMA 4Z1JA 1IF4A 5SZ1A 5SZ4A 3MYQA 4M2UA 5SZ2A 1TH9A 3DD0A 4QK1A 1MOOA 5JEPB 3OIMA 3DCCA 3HKTA 1G48A 5E5RA 2WEHA 1OQ5A 4RIUA 1CNBA 3TVNX 3RZ7A 3V3JA 3M2YA 5G0BA 2VVAX 1LG5A 2NXTA 3IEOA 2Q38A 1CALA 2CBBA 3RYVB 4JSWA 1IF7A 1DCBA 4Q81A 3F7UA 1I9PA 2FNMA 5EHVA 3V2MA 4DZ7A 5DSPA 4Q6DA 5AMLA 2ZNCA 1CAYA 5DSLA 4FVOA 2ILIA 1HUHA 2X7TA 4YGFA 4KP8A 3RJ7A 3K2FA 1CNKA 1KEQA 3KS3A 4DZ9A 3MHCA 4RN4A 3W6IA 3M67A 5EIJA 2NN7A 3F4XA 4YGKA 5FNGA 3DAZA 3T84A 5DSJA 1UGDA 4Q8ZA 4TWMA 1V9EA 4ZX0A 4M2WA 5FNLA 4ZWYA 2AX2A 4WW6A 5SZ3A 4X5SA 4ILXA 1DMXA 2WD2A 1RZBA 4MDMA 3BETA 1G54A 5E2NA 3V3IB 3IBIA 3NI5A 5EHEA 2FMGA 1FQRA 5EOIA 3RYZA 4MLTA 3S8XA 5SZ0A 3KKXA 1OKNA 3K7KA 4M2RA 3P3JA 1CAZA 1UGEA 1CVAA 2FOYA 2OSMA 1CAMA 3MNJA 4RUYA 5DSQA 1RAZA 3UYQA 5DSOA 1ZNCA 4YVYA 3SAXA 4JSAA 3M96A 5LMDA 4HEYA 5JEHB 3SAPA 2HFWA 1TB0X 1CNGA 3D8WA 4KNJA 4KV0A 4Q90A 2POVA 3SBHA 1ZFKA 2NMXA 4XIXA 5G0CA 4XE1A 4WUPA 4Q49A 3DVCA 1YO1A 3M5SA 4UOVA 1BV3A 3S74B 2HNCA 2NN1A 2F14A 3MHMA 1BNWA 2O4ZA 3N0NA 3OYQA 3DBUA 4RH2A 1T9NA 4C3TA 3U3AX 3OY0A 4G0CA 4LHIA 1HCAA 5E5UA 5EHWA 3IAIA 3P4VA 1G1DA 2HOCA 3S97A 5JGTB 1CVHA 1ZSAA 3HKQA 2W2JA 4PYYA 4ZWIA 1I9MA 3MNAA 2CBCA 1ZFQA 1H9NA 2IT4A 3V2JA 5HPJA 1G45A 1RZCA 3V3FA 1CCTA 3U7CA 2NXSA 5E28A 1CZMA 1KWRA 3DCWA 3D0NA 1XEGA 5DOHA 3M5EA 4QY3A 5BRWA 5JQ0A 3BL1A 3D9ZA 3S76A 1BNNA 8CA2A 1BN3A 3C7PA 1Y7WA 1CIMA 3RLDA 4QK2A 3DVDA 1CINA 5EKMA 1I91A 3N4BA 4RFDA 3S9TA 3D93A 4YYTA 4QIZA 4E3GA 3DC9A 4ITOA 4Y0JA 3W6HA 3MWOA 5AMGA 4YXOA 3MMFA 4WL4A 4YGJA 2WEGA 2HKKA 4HT0A 3B1BA 3EFTA 3RZ0B 3MNIA 2GEHA 2EU2A 3KNEA 4CNWA 3S75B 1AM6A 12CAA 5G01A 4Q08A 4FIKA 4WR7A 3KWAA 1CAJA 4RIVA 4E9OX 4K0SA 1LUGA 1BCDA 1XEVA 3S73B 1CNHA 3R16A 5CLUA 5CA2A 3UYNA 4LP6A 1IF6A 4CACA 3IGPA 3CZVA 1XPZA 4CNRA 5SZ7A 5FLOA 4WUQA 1TE3X 1Z9YA 4PQ7A 1G46A 4HBAA 2X7UA 1LGDA 3PO6A 4QEFA 4IDRX 4YHAA 3U45X 3LXEA 5EKHA 1MUAA 1RJ6A 3M98A 1CVDA 4BCWA 4ZX1A 1YO0A 4WW8A 5CACA 3HKUA 2FOSA 3CYUA 4CA2A 3PYKA 1CAKA 3FE4A 3KOKA 1FQLA 2EU3A 5FNJA 4HF3A 5FDIA 2QP6A 4Q7WA 2CA2A 2Q1QA 4MLXA 3RGEA 5C8IA 4K13A 4MTYA 2FW4A 1FR7A 5EH8A 3T5UA 2H4NA 4CNXA 3RYYA 3QYKA 7CA2A 5G03A 4R59A 5DSIA 3P5LA 2NWOA 3EFIA 1TEUX 2NNOA 1URTA 4XFWA 1HEBA 2QOAA 1FR4A 4RFCA 1CNCA 1OKMA 2ABEA 1RJ5A 5CJFA 4HEZA 1I9QA 1CCSA 1ZGEA 1Z93A 5FDCA 4Q06A 4CNVA 4PXXA 1CNYA 1FSNA 1BNUA 1IF9A 2GD8A 4COQA 2NWZA 1G0FA 4ZAOA 2FOQA 1EOUA 4LU3A 3IBLA 2NNVA 2POWA 5J8ZA 3S71B 3ML2A 3MNHA 4XIWA 4FL7A 2NNGA 1RZAA 1Z97A 3OKUA 4K0ZA 3P58A 3KIGA 3M1KA 4YGLA 3F8EA 3L14A 4QJPA 1KWQA 2NXRA 2WD3A 5FLTA 5A25A 1G53A 3DA2A 3U47A 4QSBA 5EH5A 4E4AA 5FLRA 6CA2A 4ZWZA 1ZGFA 1CAIA 1AZMA 4G7AA 1UGBA 2NWYA 1TTMA 1J9WA 4Q07A 4QTLA 2HL4A 1A42A 3OYSA 3P55A 4HT2A 4RUXA 4JSSA 1BICA 4PYXA 4JS6A 5SZ5A 4FU5A 1BNMA 4K0TA 1CRMA 5E2SA 4Z1EA 4QJXA 5AMDA 5E2KA 1FLJA 4MO8A 5JGSB 4MDGA 1CNXA 1TG3A 1I9NA 5A6HA 1BNVA 1BZMA 4QSAA 4PZHA 1AVNA 3DD8A 3M1QA 4QJWA 1HUGA 1CA3A 1G3ZA 4Q6EA 4L5VA 4QJMA 2CBDA 3TMJA 3HKNA 3MHLA 3M2ZA 1HEDA 3SBIA 5E2MA 5EZTX 5E2RA 2FMZA 4QSIA 1RZEA 5FLPA 4L5WA 4Q8YA 1H9QA 3T85A 1ZH9A 4KUVA 2CABA 5JESB 4KUYA 1CA2A 3M2XA 4QJ0A 1UGFA 3VBDA 4Z1NA 5DSRA 5SZ6A 3M40A 5JDVB 1CRAA 3P5AA 4Q99A 5DSMA 3DV7A 1G4OA 3FW3A 3V3GB 4KNIA 3ZNCA 1CCUA 3P3HA 4Q7VA 4Q87A 3ML5A 4IWZA 3FFPX 1LG6A 3Q31A 2VVBX 3M14A 3RZ1B 3RZ8A 1G4JA 2FNNA 1CVCA 3M1WA 4L5UA 1BN1A 2CBAA 3S77B 1CAOA 4RUZA 3IBNA 3N3JA 1HVAA 3MNKA 1UGGA 4KNNA 1CVFA 3MDZA 2OSFA 1F2WA 1FQMA 1YDAA 5JEGB 4ITPA 4Z1KA 4QJOA 2FNKA 1BNTA 3MZCA 5BNLA 3DC3A 3HS4A 4TWLA 4R5BA 1LZVA 4FPTA 4Q83A 4YXUA 1UGCA 3MHIA 4KUWA 3KONA 5FL6A 1CVEA 4K1QA 5FL5A 1G0EA 3T82A 1JCZA 2NNSA 3NJ9A 3RYJB 1TBTX 3ZP9A 5BYIA 4YXIA 3B4FA 4YWPA 4Q7SA 1G6VA 1OKLA 1CNIA 5FL4A 3P44A 1CNWA 4ZWXA 5DSNA 4MDLA 1BNQA 3S78B 4Q0LA 3TVOX 4E3HA 3JXFA 3BL0A 5FNKA 5DRSA 4Q09A 1KOQA 3K34A 3HLJA 1YO2A 1JV0A 1BN4A 2FOVA 3JXHC 3GZ0A 4QK3A 4FVNA 3N2PA 5BRUA 3CA2A 5FNHA 3F7BA 4HU1A 2QO8A 4N16A 1I90A 4Q8XA 2FOUA 3OKVA 4Q9YA 1YDCA 1TEQX 1UGAA 3OIKA 5DOGA 4QSJA 1KOPA 5DVXA 3D92A 1ZE8A 4Z0QA 4N0XB 1YDDA 1I9OA 4HEWA 4YGNA 3DCSA 1HEAA 4Q7PA 4QIYA 1CVBA 1RAYA 1YDBA 3R17B 4GL1X 1CNJA 4E3FA 2X7SA 1DCAA 5DSKA 3NB5A 3S72B 1TG9A 1CANA 3T5ZA 5EH7A 5IPZA 2WEOA 3OILA 4YX4A 3M04A 2HD6A 5JG5B 4BF6A 2AW1A 2CBEA 2EZ7A 3M5TA 3RG4A 4JSZA 1G52A 3RYXB 2Q1BA 1FSQA 3PJJA 3RZ5A 4KP5A 4E3DA 4R5AA 5L6KA 1V9IC 3M3XA 4FRCA 4CQ0A 4E5QA 1RZDA 5BRVA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 5JQT A;  5JG3 B;  1FSR A;  4BF1 A;  1I8Z A;  3M2N A;  3IBU A;  2POU A;  1XQ0 A;  1FQN A;  5FLQ A;  3DVB A;  1HCB A;  1ZSC A;  1ZSB A;  3T83 A;  1JD0 A;  1THK A;  9CA2 A;  3V7X A;  4Q78 A;  1H4N A;  4XZ5 A;  3RG3 A;  1I9L A;  3V5G A;  3HFP A;  4KNM A;  1HEC A;  3CAJ A;  2NWP A;  3KLD B;  2H15 A;  3JXG A;  4KAP A;  1DMY A;  4E49 A;  3MHO A;  3V3H B;  5EKJ A;  3KOI A;  4M2V A;  3M1J A;  1CIL A;  1IF8 A;  5FLS A;  4ETQ C;  5L3O A;  5FNI A;  1IF5 A;  3MNU A;  1CAH A;  2WEJ A;  5FNM A;  4Z1J A;  1IF4 A;  5SZ1 A;  5SZ4 A;  3MYQ A;  4M2U A;  5SZ2 A;  1TH9 A;  3DD0 A;  4QK1 A;  1MOO A;  5JEP B;  3OIM A;  3DCC A;  3HKT A;  1G48 A;  5E5R A;  2WEH A;  1OQ5 A;  4RIU A;  1CNB A;  3TVN X;  3RZ7 A;  3V3J A;  3M2Y A;  5G0B A;  2VVA X;  1LG5 A;  2NXT A;  3IEO A;  2Q38 A;  1CAL A;  2CBB A;  3RYV B;  4JSW A;  1IF7 A;  1DCB A;  4Q81 A;  3F7U A;  1I9P A;  2FNM A;  5EHV A;  3V2M A;  4DZ7 A;  5DSP A;  4Q6D A;  5AML A;  2ZNC A;  1CAY A;  5DSL A;  4FVO A;  2ILI A;  1HUH A;  2X7T A;  4YGF A;  4KP8 A;  3RJ7 A;  3K2F A; 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