1XEVA

Crystal structure of human carbonic anhydrase ii in a new crystal form
Total Genus 72
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
72
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Carbonic anhydrase II
publication title Crystal structure of human carbonic anhydrase II in a new crystal form
rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Lyase
total genus 72
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B, C, D
other databases KnotProt 2.0: K +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2004-09-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1xevA00
2GEHA 3D9ZA 5FLPA 5FNJA 4FVNA 1IF6A 3KS3A 4Q8ZA 3S9TA 4MDMA 1CNKA 5G01A 1RZEA 2ABEA 5IPZA 2WD3A 1UGAA 3S73B 3DBUA 1LZVA 1T9NA 5JQ0A 3D8WA 1KWRA 2NNGA 1CALA 3N4BA 4QJMA 4RFCA 5FLTA 5E2MA 2NWYA 3F8EA 1UGGA 5JEPB 4XIXA 3V7XA 3OYSA 4CNVA 1HEDA 4L5WA 3RZ8A 4HF3A 3BL0A 4PXXA 4Q08A 1KWQA 3DCSA 5FLSA 3S8XA 2NWZA 4XIWA 1TG3A 5JDVB 4HU1A 3DVDA 1CAZA 1LGDA 4FL7A 1G45A 4Q8XA 4ITOA 3IBUA 5EHWA 3GZ0A 4MLTA 3M96A 3MYQA 2IT4A 4Q07A 5JG5B 3D92A 1AZMA 4K0TA 5DSKA 3MMFA 4Y0JA 5EZTX 3SBHA 1BNQA 2CBAA 3T82A 5JEGB 1G3ZA 3V3IB 5FLQA 1CANA 3OIKA 4HEYA 4UOVA 5SZ0A 2FOQA 4HBAA 4YWPA 5FDCA 3S75B 1OKLA 3LXEA 3DV7A 3N3JA 4ETQC 5SZ3A 1ZFKA 1CNXA 3S76A 5A6HA 4YVYA 1RAYA 4QSBA 2FOSA 3M1KA 3RYXB 3IBLA 4KUWA 1BN3A 1G53A 1HUHA 1YDDA 4KNJA 2FOYA 3S77B 4Q99A 1FSQA 2FMZA 4KUYA 1CVFA 1CNHA 5EKHA 3R17B 3OYQA 4K1QA 2VVAX 1I91A 3KLDB 5DSRA 5EH7A 4E4AA 4QK2A 4JS6A 4QIZA 3EFIA 4K13A 1KEQA 2O4ZA 4Q7SA 4FPTA 4Q06A 2VVBX 3KWAA 4FRCA 3P44A 5EKMA 4KNMA 4ZAOA 3P58A 2HOCA 1YO0A 3T5UA 1G0FA 3EFTA 2NXSA 5CLUA 3W6IA 3KONA 1A42A 3IAIA 3D93A 5G03A 3M2YA 4TWLA 4QJOA 5FNKA 1V9EA 1TB0X 1OQ5A 4KNNA 1YDAA 3HFPA 3NI5A 1CIMA 1CNCA 1CVEA 1XEGA 1HECA 1HCAA 1H9QA 1CINA 4L5UA 3RGEA 2F14A 4Q8YA 4M2RA 5JEHB 5CJFA 3M2NA 4E5QA 1F2WA 5BRUA 2ILIA 4MO8A 5JG3B 1G4OA 3V3GB 2EU3A 3DAZA 2H15A 4CNRA 5DSIA 3MHIA 3M98A 5DOGA 5DSPA 5FL5A 2ZNCA 4WR7A 4GL1X 5HPJA 1TEUX 1BNMA 4C3TA 5JQTA 2POVA 4LU3A 3MNIA 2Q1QA 3DVBA 2Q1BA 1CAMA 4Q90A 3V2MA 3KOIA 4E3HA 2H4NA 4YGNA 1RZBA 5DSQA 4JSAA 4MDLA 5E2KA 4CNWA 1ZSCA 1JCZA 3M5TA 1TH9A 4PQ7A 4PYYA 1OKNA 1ZE8A 4ZWIA 5DSLA 4R5BA 4YGFA 3TVOX 2FNNA 3HKUA 4M2WA 4XFWA 3T85A 3C7PA 2X7UA 4JSWA 4K0ZA 4WL4A 1FQRA 4IDRX 1BNNA 4G0CA 5A25A 4ZX0A 3PJJA 3IBNA 3B4FA 4YGKA 2WEOA 1CNIA 4TWMA 1BN4A 5JESB 1HUGA 3M3XA 3V3JA 4RUYA 1CRMA 4WW8A 5EHVA 12CAA 4QJWA 1G6VA 5SZ7A 4QK3A 1CVDA 3MHOA 1KOQA 2HFWA 3SBIA 5FL6A 5EHEA 5AMGA 3HLJA 4YXIA 2Q38A 3M1JA 3M5EA 3VBDA 1XEVA 3HKQA 1CAOA 3N0NA 3V3HB 2NXRA 3DCWA 4Q9YA 4KP8A 2AX2A 3PYKA 4Z1JA 2CBCA 3P5LA 4KP5A 3ZP9A 3OY0A 1IF5A 1FR7A 5DSOA 2QP6A 4MTYA 2HL4A 5FNGA 4CQ0A 5SZ2A 3UYNA 1BCDA 1CCUA 3CZVA 1YO2A 4QJPA 2NNVA 1FQMA 5BNLA 3S71B 2NXTA 1CZMA 5BRVA 4DZ7A 4N16A 1THKA 4Q09A 3V5GA 4FVOA 4E3DA 2FW4A 4XZ5A 1TG9A 1YO1A 3F7UA 3MZCA 4YXUA 4Q81A 3NJ9A 2CBEA 4G7AA 3M40A 1XQ0A 5EKJA 8CA2A 1DMXA 3U3AX 5G0CA 1H4NA 3CYUA 5L6KA 3CA2A 1YDBA 2POWA 3DA2A 1CAKA 4ZWZA 1DMYA 4YGJA 1Z9YA 3M14A 1HVAA 1Y7WA 3SAPA 4R59A 4HEZA 2X7TA 4HT2A 4Q49A 3M1QA 1ZFQA 5DOHA 3T84A 3M2XA 5BYIA 2OSFA 4LHIA 4QJXA 4Z1EA 1I9OA 4FIKA 5DVXA 5E2RA 2EU2A 3RYVB 1RZAA 1AM6A 3DC9A 1CRAA 2OSMA 3KNEA 1I90A 5FNHA 3HKNA 3MNKA 4E3FA 3NB5A 4BF6A 4Q87A 3P4VA 3F7BA 4M2VA 3QYKA 3MNJA 1I9PA 3K34A 4RUZA 3ML5A 5FLRA 3IGPA 3ML2A 1BZMA 4QSIA 1I9NA 2W2JA 4E3GA 3JXHC 3PO6A 3DD8A 4JSZA 4Q78A 1CAIA 1TBTX 1G0EA 4QSAA 3IBIA 5CACA 4MDGA 3T5ZA 1KOPA 2HKKA 6CA2A 1CA3A 4Q0LA 3HS4A 4YGLA 1CNJA 3DC3A 4Z0QA 1LUGA 2WD2A 4IWZA 2NWPA 1BV3A 3MHLA 4DZ9A 3RYJB 4YYTA 2CBBA 3ZNCA 4YX4A 1G48A 5AMLA 1V9IC 2POUA 4E9OX 3HKTA 3OKUA 3OILA 5SZ4A 1YDCA 5E2NA 3N2PA 5FNMA 4Z1NA 5J8ZA 5DRSA 1CNWA 5CA2A 3V2JA 3MDZA 4Q7PA 1TEQX 2X7SA 5SZ5A 1UGBA 3M1WA 1LG6A 2WEGA 4QY3A 1DCAA 1XPZA 4WUQA 4FU5A 3RG3A 1BNWA 5E5RA 4RH2A 5FL4A 3RYYA 4RN4A 1LG5A 2FMGA 2QO8A 1EOUA 1FR4A 1G4JA 3P55A 4L5VA 1HEAA 5AMDA 5EH5A 1G1DA 5JGSB 3FFPX 2NN7A 1ZSAA 5L3OA 1IF7A 3P3JA 1J9WA 3P5AA 2NNOA 4X5SA 5DSNA 5FLOA 4BF1A 5FNLA 3DCCA 5EH8A 1UGFA 3M67A 7CA2A 4Q83A 3IEOA 3TMJA 3W6HA 1CNBA 4HEWA 1I9QA 2CA2A 1G52A 4R5AA 3SAXA 2CABA 4YXOA 4ZX1A 1FSRA 4Q7VA 4WW6A 3MNUA 2AW1A 4Q6DA 4KAPA 4RFDA 1FSNA 3KKXA 1BICA 2HNCA 3S78B 1MOOA 1CNYA 2FOUA 1CVCA 3L14A 5E5UA 3RJ7A 3MNAA 4KV0A 2NMXA 1OKMA 2WEJA 4WUPA 1AVNA 1FLJA 1ZH9A 4QEFA 4CACA 3RYZA 4JSSA 3MWOA 1ZNCA 1URTA 3MNHA 1ZGFA 2GD8A 2NNSA 3P3HA 3KIGA 1ZGEA 1H9NA 3JXFA 4ILXA 3JXGA 5EIJA 4RUXA 4MLXA 1UGDA 3FE4A 1CAHA 2QOAA 3Q31A 3S97A 1FQNA 4KUVA 3T83A 1JV0A 1CCSA 1CCTA 5FNIA 4Z1KA 1I9MA 1IF9A 1CVAA 1CAYA 3V3FA 1UGCA 1I9LA 1RZDA 1UGEA 4COQA 1RJ5A 2CBDA 4YHAA 1TE3X 1Z97A 4CNXA 5SZ6A 1BNTA 5SZ1A 3M5SA 2NN1A 2FNMA 1CNGA 1FQLA 3FW3A 3BETA 3K2FA 9CA2A 3F4XA 2NWOA 3DVCA 3RG4A 3S72B 3UYQA 1BN1A 3MHMA 4BCWA 3RZ5A 4LP6A 4XE1A 4QSJA 1IF8A 4ITPA 1HCBA 5LMDA 3D0NA 3RLDA 1IF4A 3M2ZA 1CILA 3RZ0B 4Q7WA 1CVBA 3BL1A 1BNVA 1TTMA 3KOKA 1CAJA 2EZ7A 2FOVA 4PZHA 3U45X 1DCBA 3OKVA 5G0BA 1G54A 3RZ1B 4HT0A 1MUAA 4QK1A 3K7KA 1ZSBA 2HD6A 4E49A 3M04A 3MHCA 5DSJA 1Z93A 1RJ6A 4RIUA 3U7CA 1RAZA 4Q6EA 5FDIA 1I8ZA 4CA2A 2WEHA 5JGTB 3TVNX 3R16A 1CA2A 3DD0A 4ZWYA 4N0XB 3OIMA 3U47A 1JD0A 4QJ0A 3CAJA 3B1BA 5BRWA 4K0SA 4M2UA 4KNIA 3RZ7A 2FNKA 4PYXA 4QTLA 5DSMA 4RIVA 1G46A 1RZCA 3S74B 5C8IA 4ZWXA 1BNUA 5EOIA 4QIYA 5E28A 1HEBA 1CVHA 5E2SA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2GEH A;  3D9Z A;  5FLP A;  5FNJ A;  4FVN A;  1IF6 A;  3KS3 A;  4Q8Z A;  3S9T A;  4MDM A;  1CNK A;  5G01 A;  1RZE A;  2ABE A;  5IPZ A;  2WD3 A;  1UGA A;  3S73 B;  3DBU A;  1LZV A;  1T9N A;  5JQ0 A;  3D8W A;  1KWR A;  2NNG A;  1CAL A;  3N4B A;  4QJM A;  4RFC A;  5FLT A;  5E2M A;  2NWY A;  3F8E A;  1UGG A;  5JEP B;  4XIX A;  3V7X A;  3OYS A;  4CNV A;  1HED A;  4L5W A;  3RZ8 A;  4HF3 A;  3BL0 A;  4PXX A;  4Q08 A;  1KWQ A;  3DCS A;  5FLS A;  3S8X A;  2NWZ A;  4XIW A;  1TG3 A;  5JDV B;  4HU1 A;  3DVD A;  1CAZ A;  1LGD A;  4FL7 A;  1G45 A;  4Q8X A;  4ITO A;  3IBU A;  5EHW A;  3GZ0 A;  4MLT A;  3M96 A;  3MYQ A;  2IT4 A;  4Q07 A;  5JG5 B;  3D92 A;  1AZM A;  4K0T A;  5DSK A;  3MMF A;  4Y0J A;  5EZT X;  3SBH A;  1BNQ A;  2CBA A;  3T82 A;  5JEG B;  1G3Z A;  3V3I B;  5FLQ A;  1CAN A;  3OIK A;  4HEY A;  4UOV A;  5SZ0 A;  2FOQ A;  4HBA A;  4YWP A;  5FDC A;  3S75 B;  1OKL A;  3LXE A;  3DV7 A;  3N3J A;  4ETQ C;  5SZ3 A;  1ZFK A;  1CNX A;  3S76 A;  5A6H A;  4YVY A;  1RAY A;  4QSB A;  2FOS A;  3M1K A;  3RYX B; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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