1Y7WA

Crystal structure of a halotolerant carbonic anhydrase from dunaliella salina
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
Knots found
sequence length
274
structure length
274
Chain Sequence
NPNDGYDYMQHGFDWPGLQEGGTTKYPACSGSNQSPIDINTNQLMEPSSRSGTSAVSLNGLNVDGAQADGITLTNAKVDLEQGMKVTFDQPAANLPTIEIGGTTKSFVPIQFHFHHFLSEHTINGIHYPLELHIVMQEQDPADVATAQLAVIGIMYKYSENGDAFLNSLQTQIEGKIGDGTASYGDTGVSIDNINVKTQLLPSSLKYAGYDGSLTTPGCDERVKWHVFTTPREVTREQMKLFVDVTMGAHAGADVVNNRMIQDLGDREVYKYNY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Halotolerant alpha-type carbonic anhydrase (dCA II)
publication title Three-dimensional structure of a halotolerant algal carbonic anhydrase predicts halotolerance of a mammalian homolog.
pubmed doi rcsb
source organism Dunaliella salina
total genus 78
structure length 274
sequence length 274
chains with identical sequence B
other databases KnotProt 2.0: K +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2004-12-10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1y7wA01
3MNAA 3T85A 1CNHA 5DOGA 2F14A 1BV3A 4YXUA 4Q8XA 1BN4A 2FOSA 4HEYA 4HEWA 3SBHA 4M2UA 3DCSA 4FIKA 5FNMA 3MHCA 5G03A 2CBCA 4K0SA 1CRAA 2X7SA 1RZAA 4Q09A 1CNWA 1ZSCA 1G45A 4TWMA 3M04A 3DBUA 4JSWA 3JXFA 5SZ7A 3OILA 3MNIA 3MHLA 1LGDA 4E3GA 4ZAOA 3U47A 1IF4A 1A42A 3DC9A 4E3FA 1CA2A 1MOOA 2EU3A 3EFTA 4ILXA 4YYTA 1I9NA 1CAHA 1G3ZA 3FE4A 3P5LA 4MLXA 3D92A 5J8ZA 1H9QA 1KEQA 2POUA 1Z97A 3KOKA 4KP5A 1KWRA 1TG9A 3R17B 3T83A 4DZ9A 4RIUA 7CA2A 5E2SA 6CA2A 2O4ZA 4QJ0A 5CLUA 5IPZA 2FOUA 3V2MA 2CBEA 5FL5A 1H9NA 3V3FA 3HKQA 3S8XA 4CNXA 1BNNA 1TEQX 3U7CA 3KOIA 2CABA 3JXHC 3P3HA 3P55A 5SZ1A 1HCAA 3M5TA 4Z1NA 4IDRX 4QJMA 3FFPX 5AMDA 3P5AA 4Q81A 2Q1BA 1IF5A 3P44A 4X5SA 3MWOA 5FLSA 4QTLA 1G6VA 3RYVB 2QOAA 1JCZA 3S78B 5BNLA 3NJ9A 1BCDA 3RYJB 1I9QA 1IF6A 1T9NA 4ITOA 3TVNX 1FLJA 3MMFA 5EIJA 1I9OA 9CA2A 3T5UA 5FLOA 1BNMA 1YDAA 4PYYA 3UYQA 3HLJA 3MNHA 1CVEA 1F2WA 2EU2A 1RZDA 1XPZA 4M2VA 5FDIA 1CA3A 1CNCA 2NN7A 5DSOA 3RJ7A 1CNGA 1XEGA 5EHVA 3RYZA 2VVBX 4LU3A 1TG3A 2NNOA 3PJJA 1XQ0A 1CNJA 5DSJA 1BZMA 4Q06A 5G01A 5EKJA 1RZCA 3DC3A 2NN1A 1YO2A 4Q9YA 3S73B 4CNVA 3R16A 1ZFQA 4LHIA 3ML2A 1MUAA 3IBUA 1ZGFA 1YDBA 2FNMA 1I90A 2Q38A 4JS6A 4L5UA 2AX2A 4RH2A 3MZCA 3F8EA 1JD0A 3M2YA 4MDLA 1TTMA 3P3JA 4HBAA 5EH8A 3W6IA 4Q08A 5EZTX 3DAZA 3U3AX 3HS4A 3KLDB 3LXEA 3D9ZA 5E2NA 4E3HA 4CQ0A 4YGNA 2ILIA 3B1BA 3CA2A 3P58A 1CRMA 4ITPA 2ZNCA 2NWYA 5EHWA 4WL4A 4G0CA 4QIZA 3DVCA 4FU5A 1CAOA 4JSZA 4XIXA 1HECA 5HPJA 1ZNCA 3QYKA 4WW6A 5DVXA 1IF8A 5FLPA 1BN1A 3BL1A 1KOPA 5EKMA 5JEGB 3OYSA 3V3IB 3F7UA 1BNQA 1AM6A 1IF9A 1V9IC 4YGKA 5FNIA 3U45X 4KNNA 1CVDA 4Q90A 4FRCA 4QK2A 4YVYA 1G1DA 2VVAX 5A6HA 1BNWA 1CILA 2AW1A 1CNBA 1KWQA 4TWLA 2HFWA 1I9PA 1HEAA 5DSPA 2FOVA 4KV0A 4QSIA 5E5RA 2OSMA 4Q7SA 1YO0A 5JQ0A 2ABEA 2NWOA 2X7TA 1CZMA 8CA2A 3FW3A 3M40A 5LMDA 1EOUA 5SZ0A 3M14A 2CA2A 5AMGA 2FNNA 1CCUA 3M96A 4RUXA 2GD8A 5DSRA 3M1QA 1UGGA 4K1QA 2HD6A 2POVA 4KUWA 2WEHA 3D8WA 3V3JA 4ZWIA 3V7XA 2H15A 3V3HB 2FW4A 4FVOA 3N3JA 1Z9YA 3OY0A 3M1JA 3M1WA 3M5SA 1DCAA 1DMXA 5CACA 4Q7VA 3S9TA 1I8ZA 3D93A 1CANA 3RGEA 4KAPA 3CAJA 3NB5A 1BNVA 4PZHA 5DRSA 2QP6A 3RG3A 3UYNA 1CAMA 2QO8A 5JQTA 5E2MA 1CAYA 1RAYA 1UGAA 4XE1A 4Q78A 2FNKA 4ZX1A 1G48A 1ZE8A 3P4VA 1IF7A 1CAZA 1HEBA 3L14A 3RYYA 1G52A 3KNEA 5DSMA 4XZ5A 3RLDA 5FNKA 1FR7A 3KKXA 4QK1A 2FOQA 4YX4A 3RYXB 4DZ7A 5FL4A 4Z0QA 2WEOA 4FVNA 1TH9A 4HF3A 4XIWA 1FQMA 4Y0JA 5G0CA 4CNRA 4QY3A 3DVDA 3RZ1B 4ZX0A 5BRVA 3DCWA 1J9WA 3V3GB 3M5EA 4MTYA 1XEVA 2W2JA 4ZWZA 1CVFA 3M67A 4M2WA 1TBTX 1AZMA 3EFIA 2FMZA 2NWZA 3KS3A 4QEFA 3OIKA 3T82A 3C7PA 5CA2A 4JSAA 3TMJA 3IBIA 4RN4A 5JEHB 1FSQA 4RIVA 3M2XA 5G0BA 2Q1QA 4Z1EA 3ZNCA 3DD8A 5JG5B 3N2PA 5JGTB 3KWAA 4RFDA 3JXGA 1OKNA 5FNHA 5DSIA 3IBNA 1DCBA 1FQLA 4L5VA 4KP8A 5BYIA 1CNXA 1HVAA 1OKLA 2NNVA 2NMXA 3D0NA 4MDMA 4R5AA 5BRUA 4IWZA 4YXIA 3MHOA 4HT2A 2OSFA 3MNKA 2WEGA 3K2FA 3GZ0A 4CACA 2HNCA 5SZ6A 3MNUA 3Q31A 4HT0A 5EOIA 5L3OA 3V5GA 5JG3B 1YDDA 4WW8A 5AMLA 3OKUA 4E4AA 1DMYA 1UGBA 4Q07A 4Q8YA 3T84A 3V2JA 4HEZA 5DSQA 1HCBA 1YO1A 3OKVA 3S72B 1RAZA 1Z93A 1AVNA 3M98A 4N0XB 1CINA 4RUYA 4E3DA 3M2NA 4QSAA 1H4NA 1CNKA 2CBAA 4KNJA 1CVAA 4RFCA 1CNIA 1G53A 1UGCA 4K0ZA 1TEUX 3S71B 4FPTA 4UOVA 4ETQC 1CVHA 3RZ5A 4WR7A 4QIYA 4BF1A 3HKUA 5FL6A 3SBIA 5EH7A 1CIMA 4MDGA 4WUPA 5A25A 4Q7PA 3S74B 1HEDA 5E2RA 2NNSA 1FQNA 3DCCA 3IEOA 4KNMA 5E28A 4K13A 3IGPA 4MLTA 3DA2A 1G0FA 5JDVB 4Q7WA 1CALA 1CVCA 3F7BA 4MO8A 4WUQA 2CBDA 3MDZA 1JV0A 3ML5A 4QSBA 5FNLA 4RUZA 4QK3A 3PYKA 4Q49A 4G7AA 4LP6A 1CAKA 3DD0A 5FLTA 3K34A 5BRWA 4Q87A 1G0EA 5SZ2A 4Q6EA 3MNJA 4KNIA 1G4OA 4L5WA 3MHMA 4GL1X 1ZGEA 4JSSA 4YWPA 1BICA 1FQRA 1UGEA 5EH5A 4R59A 4COQA 1RZBA 5SZ5A 1ZFKA 5E5UA 1G4JA 3RZ0B 3CZVA 5EKHA 5L6KA 1CCSA 2IT4A 3SAXA 3K7KA 1KOQA 1G54A 1BNTA 1Y7WA 5EHEA 12CAA 3S75B 1G46A 4R5BA 2WEJA 4E9OX 2NXRA 4YGLA 1TE3X 2HOCA 3NI5A 4N16A 5E2KA 3PO6A 1CVBA 3F4XA 1OKMA 3M3XA 1UGDA 4PQ7A 3VBDA 2X7UA 3MHIA 5DSKA 1ZH9A 3OIMA 3S97A 1LG6A 4ZWYA 4YGFA 3TVOX 2NXSA 3S76A 4C3TA 4ZWXA 1URTA 2WD3A 4PYXA 4CNWA 4FL7A 1RZEA 1BN3A 3KIGA 5FLQA 3ZP9A 1CCTA 2WD2A 5SZ3A 3T5ZA 4E49A 5FNGA 1ZSBA 1V9EA 4QJXA 2FMGA 1RJ5A 3M2ZA 4CA2A 3BL0A 1LZVA 1BNUA 4Q99A 4QJWA 1YDCA 4BCWA 3CYUA 3HFPA 1OQ5A 1RJ6A 2EZ7A 1CAIA 1HUGA 1I9LA 3MYQA 1FSNA 5CJFA 1I9MA 3SAPA 2POWA 4M2RA 3HKTA 2FOYA 1FSRA 1FR4A 5FNJA 3RG4A 2NWPA 5DOHA 3RZ8A 1CNYA 5DSLA 4E5QA 1TB0X 3S77B 3IBLA 3DVBA 2GEHA 3HKNA 3KONA 1LG5A 5FLRA 5JEPB 2HKKA 4KUVA 4QSJA 1CAJA 5DSNA 3BETA 4QJPA 4BF6A 4HU1A 2NXTA 3N4BA 3B4FA 4YHAA 4YXOA 1ZSAA 3N0NA 4KUYA 2H4NA 2NNGA 1HUHA 1I91A 4Q0LA 5FDCA 5JESB 4Q8ZA 3OYQA 4PXXA 4K0TA 4QJOA 4YGJA 4Q6DA 2HL4A 3DV7A 2CBBA 5C8IA 1LUGA 5JGSB 5SZ4A 4Z1KA 4Q83A 1THKA 4XFWA 3M1KA 3W6HA 4Z1JA 1UGFA 3RZ7A 3IAIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3MNA A;  3T85 A;  1CNH A;  5DOG A;  2F14 A;  1BV3 A;  4YXU A;  4Q8X A;  1BN4 A;  2FOS A;  4HEY A;  4HEW A;  3SBH A;  4M2U A;  3DCS A;  4FIK A;  5FNM A;  3MHC A;  5G03 A;  2CBC A;  4K0S A;  1CRA A;  2X7S A;  1RZA A;  4Q09 A;  1CNW A;  1ZSC A;  1G45 A;  4TWM A;  3M04 A;  3DBU A;  4JSW A;  3JXF A;  5SZ7 A;  3OIL A;  3MNI A;  3MHL A;  1LGD A;  4E3G A;  4ZAO A;  3U47 A;  1IF4 A;  1A42 A;  3DC9 A;  4E3F A;  1CA2 A;  1MOO A;  2EU3 A;  3EFT A;  4ILX A;  4YYT A;  1I9N A;  1CAH A;  1G3Z A;  3FE4 A;  3P5L A;  4MLX A;  3D92 A;  5J8Z A;  1H9Q A;  1KEQ A;  2POU A;  1Z97 A;  3KOK A;  4KP5 A;  1KWR A;  1TG9 A;  3R17 B;  3T83 A;  4DZ9 A;  4RIU A;  7CA2 A;  5E2S A;  6CA2 A;  2O4Z A;  4QJ0 A;  5CLU A;  5IPZ A;  2FOU A;  3V2M A;  2CBE A;  5FL5 A;  1H9N A;  3V3F A;  3HKQ A;  3S8X A;  4CNX A;  1BNN A;  1TEQ X;  3U7C A;  3KOI A;  2CAB A;  3JXH C;  3P3H A;  3P55 A;  5SZ1 A;  1HCA A;  3M5T A;  4Z1N A;  4IDR X;  4QJM A;  3FFP X;  5AMD A;  3P5A A;  4Q81 A;  2Q1B A;  1IF5 A;  3P44 A;  4X5S A;  3MWO A;  5FLS A;  4QTL A; 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