1YO2A

Proton transfer from his200 in human carbonic anhydrase ii
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGAAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTHPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Carbonic anhydrase II
publication title Proton transfer in a Thr200His mutant of human carbonic anhydrase II
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 76
structure length 258
sequence length 258
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2005-01-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1yo2A00
1BN1A 4YX4A 3MHCA 5LMDA 4Q83A 3M1KA 3P4VA 4HU1A 3NI5A 1FR7A 4PYYA 3K7KA 7CA2A 5G0CA 3RZ8A 1RAYA 3M5SA 4KUWA 4WUQA 1RZDA 1H9QA 4XFWA 5JEPB 4E3FA 6CA2A 4G7AA 1ZGEA 1HUHA 4YWPA 1CAOA 4QK1A 1G53A 4ITOA 1OQ5A 1OKMA 5L6KA 1XPZA 1TH9A 4BCWA 1T9NA 2AX2A 1CNJA 3S8XA 3K2FA 3T83A 4YXUA 3HKUA 1ZSBA 2FNNA 5FLTA 1UGDA 4CNWA 1ZNCA 1IF9A 1H4NA 2Q38A 5DSNA 5E5UA 3SAPA 4WR7A 1UGAA 2FW4A 4BF6A 5DSLA 1CAMA 2POUA 3DCWA 1CCTA 4KNMA 1TB0X 4TWLA 3KIGA 4M2WA 3DAZA 1LZVA 1CRMA 3RZ0B 1YDDA 4HEYA 4K0SA 3SAXA 2NXTA 4RIUA 2HOCA 1CAHA 2X7SA 4QK3A 3RG3A 2NNSA 3V3IB 1ZSAA 2OSMA 3FFPX 4Q7WA 1OKNA 1IF7A 5FNGA 4K1QA 3K34A 2HFWA 1CAKA 1TE3X 3M98A 3P55A 3ML5A 4KNJA 4MDLA 4YGLA 5SZ5A 1YO1A 1AM6A 4M2VA 1I90A 5FNJA 3DD0A 1RZCA 3IAIA 1Z9YA 3ZP9A 3MHOA 3RYJB 3HLJA 2QOAA 3U3AX 5JEGB 2GD8A 5SZ4A 5G01A 4WW6A 4Q09A 1CNKA 2FOSA 5E2SA 4XIWA 1MUAA 5E2MA 1FSNA 3B4FA 3MDZA 1HEBA 4JSWA 4YVYA 3BL0A 5JDVB 1DMYA 3KONA 3T5UA 2FNMA 4FU5A 1A42A 3DBUA 3HKNA 5L3OA 3EFTA 4Z1KA 3M96A 2H4NA 1BNQA 1CNWA 4QJPA 1FSRA 3T5ZA 3BL1A 4Q8ZA 3IEOA 4FVOA 3M40A 1G4OA 2ABEA 5FNLA 4YXIA 4K13A 4FIKA 3RYXB 2QO8A 2NN7A 5FDIA 9CA2A 1I9OA 3RZ1B 2NMXA 5EKMA 1G4JA 4MDGA 1I9PA 1THKA 4JSAA 4ITPA 3W6HA 2NN1A 4Z1EA 3S9TA 3RGEA 1DMXA 3JXFA 1BICA 4JSSA 5FLSA 5E2NA 4YGKA 3S78B 1FSQA 2AW1A 3MWOA 4PYXA 1HVAA 1CAZA 3V5GA 1LG5A 1LG6A 1XEGA 5G03A 4ZX0A 1EOUA 2CBAA 4Q87A 5FLOA 3IBIA 3N3JA 5JG5B 4KNNA 3R17B 2CBCA 4JS6A 12CAA 3M5TA 2F14A 3V2MA 4HEZA 1CNYA 2WEOA 2HL4A 3M2XA 3OIKA 2FOVA 3M1JA 4DZ9A 4COQA 1IF6A 1ZE8A 4Q6EA 4UOVA 4G0CA 4HF3A 5FLRA 4Z1NA 1CIMA 1CNCA 4QJ0A 4Y0JA 1CA2A 3KOKA 3RYVB 5A25A 4QSAA 8CA2A 4CQ0A 4Q8YA 3M67A 1CALA 4Q7VA 4KNIA 1KWQA 5JEHB 3PJJA 4KV0A 4Q8XA 5G0BA 4ZWZA 1CAIA 1IF8A 5EOIA 3UYNA 5BRVA 3V3HB 4LP6A 1BN3A 1TG9A 5FNHA 3MHLA 5EIJA 5EH5A 5BNLA 4LHIA 4QEFA 4QSJA 1J9WA 4CNXA 3S73B 1G6VA 2CBBA 5EHWA 4Q07A 1RJ5A 1CVFA 2POWA 3MYQA 1KOQA 4RUYA 4RUXA 1CZMA 1CRAA 3IBUA 4ZAOA 1H9NA 3MHMA 4ZWXA 1BNMA 4YGNA 3S77B 3BETA 5EZTX 2WEJA 1RZEA 5EHVA 1KOPA 1V9IC 1G3ZA 3MNJA 3HKQA 2NWZA 3V3GB 4RFCA 4QJWA 4FRCA 5E2RA 2QP6A 3MMFA 2ZNCA 1YDCA 1DCAA 4C3TA 1FQMA 1JV0A 2H15A 5C8IA 3MNKA 1BCDA 4DZ7A 1G0FA 1CVHA 5JG3B 4PZHA 5FNKA 4E49A 4M2RA 1G52A 1CNIA 1FQRA 3RJ7A 1UGEA 3MZCA 3HKTA 2NWPA 1CCUA 5SZ7A 1TEUX 3S72B 5JQ0A 4KP5A 4HBAA 4RUZA 3CYUA 3P58A 3P5LA 4Q99A 1FQLA 4QY3A 3CZVA 3ML2A 1I91A 1YDAA 3FW3A 4ZX1A 3ZNCA 5FNMA 4XZ5A 2X7UA 5EHEA 4E3GA 5EH8A 1YO0A 2POVA 2NXRA 1IF4A 1Z97A 3M1QA 1CINA 2HNCA 2CBEA 3MNAA 4XE1A 1DCBA 5JESB 4Q90A 1YDBA 4QJXA 4R5AA 4X5SA 4YYTA 2WEGA 3RZ5A 3OILA 3Q31A 4L5UA 1CVAA 5DRSA 1CNHA 1BV3A 2EZ7A 4XIXA 5E28A 3P44A 5FLPA 5AMDA 5A6HA 5SZ2A 1BNUA 3FE4A 3RLDA 3M2ZA 4YHAA 3CA2A 1HCBA 3IBNA 1CNBA 1CVBA 3S97A 3KOIA 3P3HA 4Q0LA 4QJMA 3UYQA 4K0ZA 5DSJA 3M5EA 5FL5A 5CLUA 3D92A 2X7TA 5DSIA 1HEAA 1CNGA 1IF5A 1JD0A 3KWAA 3D0NA 1FR4A 5J8ZA 3U7CA 3DV7A 4GL1X 1G48A 2VVBX 3OYQA 3KNEA 3HS4A 3W6IA 4MDMA 3RG4A 1ZFKA 4WUPA 3JXGA 1G45A 5DSPA 2OSFA 3OKVA 3IBLA 3P5AA 2NWOA 4Q78A 1LUGA 1AZMA 1XEVA 2Q1QA 3NB5A 2NNGA 4KUVA 4Z1JA 3VBDA 5DSRA 1I8ZA 2O4ZA 5JQTA 1I9MA 3S71B 1F2WA 5CACA 4Q08A 2NNVA 1BN4A 5CJFA 2CABA 5BYIA 3DVDA 3GZ0A 1UGCA 5DOGA 3S76A 1BNWA 3RYYA 4Z0QA 5DSQA 1KWRA 2ILIA 5DVXA 4FVNA 5AMLA 4QIZA 4LU3A 4M2UA 1G46A 3MNHA 4E3DA 3B1BA 4PXXA 1BNNA 3N4BA 3NJ9A 4R5BA 4TWMA 4QTLA 3D8WA 1TG3A 3DCCA 1RZBA 2WD2A 3T85A 1RZAA 1Z93A 5CA2A 3F4XA 4Q49A 3LXEA 3V3JA 5FLQA 4ILXA 3TVOX 1CNXA 1TEQX 5AMGA 1CANA 3DVBA 3SBIA 2Q1BA 2CA2A 3F7UA 3RZ7A 3S74B 3T82A 1G1DA 4QSIA 5DSMA 4Q9YA 4RIVA 1CVEA 4E3HA 3TVNX 5IPZA 5JGSB 3S75B 1ZH9A 1FLJA 3T84A 4L5VA 1CVDA 3KKXA 3R16A 5EKJA 5DSKA 4Q81A 3OY0A 1G0EA 3N2PA 1HUGA 1CILA 2IT4A 5JGTB 2GEHA 3DCSA 3V2JA 2FOUA 4FL7A 4RH2A 4YXOA 2HD6A 2WEHA 5SZ1A 1KEQA 4MLTA 1I9LA 4N0XB 2EU3A 4MO8A 5EKHA 1JCZA 3PO6A 3DA2A 4YGJA 1UGGA 3OKUA 3DC3A 4N16A 5E5RA 4ETQC 3M04A 5SZ3A 1XQ0A 1TBTX 1RJ6A 4QK2A 1FQNA 4HEWA 4Q06A 2NXSA 4L5WA 3QYKA 1Y7WA 1BZMA 3M2NA 4CA2A 1LGDA 1TTMA 2FOQA 3P3JA 4HT0A 2WD3A 4QIYA 3SBHA 5BRUA 1RAZA 3JXHC 4E9OX 4Q6DA 3MHIA 3F7BA 3D93A 4IWZA 5FL6A 3MNUA 4YGFA 4KUYA 4CACA 4Q7PA 2CBDA 5DOHA 4QSBA 5SZ0A 4FPTA 3IGPA 1HCAA 2FNKA 4JSZA 1G54A 4HT2A 4K0TA 3KS3A 4MLXA 3M1WA 3OYSA 3D9ZA 4CNVA 4ZWIA 3TMJA 2VVAX 3L14A 1UGFA 2FMGA 5EH7A 4R59A 1BNVA 4WL4A 3V7XA 3OIMA 3RYZA 4PQ7A 1I9QA 5FL4A 2NWYA 1HEDA 3EFIA 4IDRX 4RFDA 1CVCA 1V9EA 2EU2A 1CAJA 3F8EA 1HECA 1OKLA 5FNIA 3KLDB 5E2KA 4RN4A 3M2YA 3PYKA 2HKKA 3MNIA 3DC9A 4CNRA 4QJOA 1CAYA 3M3XA 2W2JA 4ZWYA 1YO2A 4MTYA 1URTA 2FOYA 5FDCA 3U47A 5HPJA 4KAPA 4E5QA 3U45X 1CA3A 4Q7SA 1AVNA 1UGBA 1ZSCA 5BRWA 1BNTA 1MOOA 5DSOA 2NNOA 3DVCA 1ZGFA 4WW8A 1CCSA 4BF1A 3HFPA 3CAJA 5SZ6A 4E4AA 2FMZA 4KP8A 3N0NA 3V3FA 3M14A 3DD8A 1I9NA 3C7PA 1ZFQA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1BN1 A;  4YX4 A;  3MHC A;  5LMD A;  4Q83 A;  3M1K A;  3P4V A;  4HU1 A;  3NI5 A;  1FR7 A;  4PYY A;  3K7K A;  7CA2 A;  5G0C A;  3RZ8 A;  1RAY A;  3M5S A;  4KUW A;  4WUQ A;  1RZD A;  1H9Q A;  4XFW A;  5JEP B;  4E3F A;  6CA2 A;  4G7A A;  1ZGE A;  1HUH A;  4YWP A;  1CAO A;  4QK1 A;  1G53 A;  4ITO A;  1OQ5 A;  1OKM A;  5L6K A;  1XPZ A;  1TH9 A;  4BCW A;  1T9N A;  2AX2 A;  1CNJ A;  3S8X A;  3K2F A;  3T83 A;  4YXU A;  3HKU A;  1ZSB A;  2FNN A;  5FLT A;  1UGD A;  4CNW A;  1ZNC A;  1IF9 A;  1H4N A;  2Q38 A;  5DSN A;  5E5U A;  3SAP A;  4WR7 A;  1UGA A;  2FW4 A;  4BF6 A;  5DSL A;  1CAM A;  2POU A;  3DCW A;  1CCT A;  4KNM A;  1TB0 X;  4TWL A;  3KIG A;  4M2W A;  3DAZ A;  1LZV A;  1CRM A;  3RZ0 B;  1YDD A;  4HEY A;  4K0S A;  3SAX A;  2NXT A;  4RIU A;  2HOC A;  1CAH A;  2X7S A;  4QK3 A;  3RG3 A;  2NNS A;  3V3I B;  1ZSA A;  2OSM A;  3FFP X;  4Q7W A;  1OKN A;  1IF7 A;  5FNG A;  4K1Q A;  3K34 A;  2HFW A;  1CAK A;  1TE3 X;  3M98 A;  3P55 A;  3ML5 A;  4KNJ A;  4MDL A;  4YGL A;  5SZ5 A;  1YO1 A;  1AM6 A;  4M2V A; 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