The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
8
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sequence length |
59
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structure length |
59
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Chain Sequence |
MEAIAKHDFSATADDELSFRKTQILKILNMEDDSNWYRAELDGKEGLIPSNYIEMKNHD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Signaling protein
|
| molecule keywords |
Protein E(sev)2B
|
| publication title |
Structural Comparison of the Unstable drkN SH3 Domain and a Stable Mutant
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Drosophila melanogaster
|
| total genus |
8
|
| structure length |
59
|
| sequence length |
59
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-06-23 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2EGA A; 1MUZ A; 2CSI A; 2BZY A; 3IQL A; 1M3A A; 4DEY A; 2YUO A; 3KFV A; 1GCQ C; 1H3H A; 2KRS A; 2JS2 A; 4HXJ A; 2HEQ A; 4HVV A; 3I9Q A; 2LQN A; 2YSQ A; 5IHI A; 4J9C A; 4LN2 A; 1A0N B; 2L2P A; 2LCS A; 1X6G A; 4J9H A; 5IH2 A; 2K9G A; 2ENM A; 1K0S A; 2F2X A; 2AK5 A; 4LE9 A; 1YWO A; 2J7I A; 2HDA A; 2QDL A; 2I0N A; 3M0Q A; 2EKH A; 1PWT A; 2A08 A; 2C0T A; 5GJW B; 1E6G A; 2M51 A; 2F2V A; 1BBZ A; 1UJ0 A; 1T0J A; 4J9I A; 1UEC A; 2ED1 A; 2DVJ A; 2FPD A; 1I1J A; 1UUE A; 2LNH B; 2L0A A; 3CQT A; 1PRM C; 3M0T A; 3M0U A; 2HCK A; 1G2B A; 5I11 A; 1ZLM A; 2V1R A; 3EG0 A; 2DL8 A; 3I5S A; 2K7A A; 4JJD A; 1AWX A; 2JXB A; 2CH4 A; 1GBR A; 3C0C A; 2KGT A; 1UDL A; 4HCK A; 3VS0 A; 2A28 A; 4M4Z A; 2P4R A; 4F17 A; 1B07 A; 3NPF A; 1RLQ C; 3M0R A; 5FW9 A; 1ARK A; 2G6F X; 3TVT A; 4ZNX A; 1JO8 A; 1AEY A; 3A98 A; 3I35 A; 1GBQ A; 3EG3 A; 3UAT A; 3U23 A; 3H0H A; 3LH5 A; 1JQQ A; 1OEB A; 1WXT A; 2JW4 A; 2KRO A; 1LCK A; 4HVW A; 2C0O A; 2DL5 A; 2EYX A; 2EYW A; 4D8D A; 1AWO A; 4AFQ C; 2X3W D; 4F16 A; 2SRC A; 1NM7 A; 2RF0 A; 2PNI A; 4WCI A; 2YUQ A; 1GCP A; 1M3C A; 1JXM A; 3EHQ A; 3NGP A; 2O9V A; 3O5Z A; 2DM1 A; 1FYN A; 1RI9 A; 1BK2 A; 2YUP A; 4R0K A; 1UE9 A; 2L3S A; 2ED0 A; 1E7O A; 2FG0 A; 3PE0 A; 1EFN A; 2DL3 A; 1WI7 A; 1CKB A; 2RN8 A; 4EIK A; 1WDX A; 1ABO A; 3PVL A; 3JV3 A; 2GBQ A; 2K6D A; 2MCN A; 2RMO A; 1PHT A; 2CT3 A; 1YN8 A; 3REA B; 1T0H A; 4OML A; 2KXC A; 1I07 A; 2JM9 A; 1JXO A; 2W0Z A; 2KT1 A; 2BTT A; 4ORZ A; 1K4U S; 5IHN A; 2DRM A; 1M3B A; 3TSZ A; 1VYT A; 3EG2 A; 1WIE A; 3RNJ A; 1BB9 A; 2DBK A; 3UA6 A; 5FWC A; 3TSW A; 1OPL A; 3UF4 A; 2MIO A; 2DE0 X; 1U3O A; 2EW3 A; 1YWP A; 2FPF A; 4Z8A A; 4GLM A; 4AG2 C; 3REB B; 2CSQ A; 3THK A; 4HVU A; 1SHG A; 2M0Y A; 1QWF A; 2O9S A; 2LMJ A; 1PKT A; 1NLP C; 1M30 A; 2H8H A; 1ZUK A; 2K79 A; 1PRL C; 1IO6 A; 1QCF A; 1E6H A; 1UG1 A; 2B86 A; 4OMO A; 1AWJ A; 1X2Q A; 5I22 A; 2DL4 A; 3ZL7 C; 2K3B A; 4CC3 A; 4RTY A; 1B3Q A; 4JZ3 A; 1FMK A; 2BZX A; 1WYX A; 2V1Q A; 1AWW A; 2KNB B; 2CDT A; 2DF6 A; 1HD3 A; 3SEM A; 4IIM A; 1GL5 A; 2AZS A; 1G83 A; 2KEA A; 2FRY A; 1GFD A; 2FPE A; 2LP5 A; 2MOX A; 2EBP A; 2X3X D; 4AFZ C; 2D8H A; 4JJC A; 3NHN A; 1X43 A; 1S1N A; 2KYB A; 1BU1 A; 2XMF A; 1ZSG A; 2RNA A; 3QWY A; 3I5R A; 2DLP A; 1Y0M A; 2DL7 A; 1RLP C; 5EC7 A; 1K9A A; 1SSH A; 2JS0 A; 1HSQ A; 3VRY A; 2GTO A; 2DYB A; 1VYV A; 1I0C A; 2OAW A; 2ROL A; 3EG1 A; 1T3L A; 2LJ3 A; 1W1F A; 1H8K A; 2GNC A; 1UFF A; 4RTU A; 4GBQ A; 1W6X A; 1WX6 A; 2RPN A; 3SHW A; 3RBB B; 2CRE A; 3VS5 A; 4OMN A; 2PZ1 A; 2YDL A; 2OJ2 A; 2L3Q A; 1U5S A; 3VS1 A; 4Z89 A; 2EQI A; 5ECA A; 3VS6 A; 2D8J A; 1NYG A; 1Y57 A; 1NEB A; 1GFC A; 2EPD A; 2VKN A; 4CC2 A; 3PVQ A; 2O88 A; 4AFS C; 4A63 B; 1UTI A; 4J9G A; 2NWM A; 3H0F A; 1X2K A; 1NYF A; 1X6B A; 5HCK A; 2CT4 A; 4LUD A; 4J9F A; 2KYM A; 2KRN A; 2DJQ A; 4JPB W; 1CKA A; 1SPK A; 4F14 A; 4KRT A; 1OOT A; 1WXU A; 3NMZ C; 5IXB A; 4IIO A; 1KJW A; 4X1V A; 4Z88 A; 1K0X A; 1AZE A; 1JEG A; 2LJ0 A; 2FRW A; 4CC4 B; 1PNJ A; 4OMQ A; 4J9B A; 2DBM A; 2JMA A; 1SEM A; 1Z9Z A; 1WA7 A; 2J6F A; 2RQT A; 4JZ4 A; 1UHC A; 1SRM A; 1TUD A; 1U06 A; 3H41 A; 1HJD A; 2EYZ A; 4J9E A; 1X69 A; 1QKW A; 5IHK A; 3UA7 A; 2J6K A; 4RTT A; 2O2O A; 2YT6 A; 2EYY A; 5IXF A; 1KIK A; 2PTK A; 1QLY A; 1AD5 A; 2AKL A; 2J6O A; 4QT7 A; 3R6N A; 3VRZ A; 2CH4 W; 2KT8 A; 2EGC A; 4E6R A; 2IIM A; 2BZ8 A; 2GGR A; 3H0I A; 1ZUU A; 2ROT A; 2CUD A; 1PKS A; 1ZUY A; 2GTJ A; 4JJB A; 1GRI A; 2DIL A; 1WFW A; 1MV3 A; 3FJ5 A; 3VS2 A; 2LZ6 B; 4AG1 C; 2D0N A; 1SHF A; 1J3T A; 1W70 A; 1AVZ C; 2KXD A; 1UGV A; 4D8K A; 1K1Z A; 2F2W A; 2FO0 A; 1TG0 A; 1M8M A; 2OI3 A; 4RTX A; 4DEX A; 2ECZ A; 1NEG A; 1YP5 A; 1GCQ A; 2D1X A; 4RUG A; 4OMP A; 2C0I A; 2LX7 A; 2YUN A; 2JMC A; 4LUE A; 2NUZ A; 2HSP A; 2LJ1 A; 2L3P A; 2DMO A; 3M0P A; 2JTE A; 2KBT A; 1XOV A; 1KFZ A; 1NG2 A; 4AFU C; 4OMM A; 2A37 A; 1OPK A; 1AZG B; 1M27 C; 2DRK A; 2AKK A; 4RTV A; 1UHF A; 2DNU A; 1T3S A; 1N5Z A; 1X27 A; 2HBW A; 1WLP B; 1VYU A; 2EVR A; 5GJV B; 3VS7 A; 1RUW A; 2LQW A; 4ESR A; 2VWF A; 3M0S A; 2KE9 A; 2SEM A; 2GQI A; 1SRL A; 2J05 A; 2RQV A; 3GBQ A; 3EHR A; 3EGU A; 4Y92 A; 1AOJ A; 1H92 A; 4J9D A; 3QWX X; 1JU5 C; 1QWE A; 1V1C A; 2O31 A; 1CSK A; 2KR3 A; 2K2M A; 1UJY A; 3VS4 A; 1VA7 A; 4LNP A; 3ULR B; 2EGE A; 2J06 A; 3VS3 A; 1ABQ A; 2RQU A; 2JT4 A; 2A36 A; 2RQR A; 2FEI A; 5L23 A; 1QKX A; 1NLO C; 2JM8 A; 1ZX6 A; 5FWB A; 2CUB A; 1YCS B; 2ESW A; 2ABL A; 2KRM A; 4RTZ A; 1Z9Q A; 2W10 A; 1WXB A; 4K11 A; 4CC7 A; 1MV0 B; 1TUC A; 1ZBJ A; 1KSW A; 2DA9 A; 1OV3 A; 4FSS A; 2E5K A; 2DX1 A; 2RQW A; 2AZV A; 4RTW A; 1K76 A; 1YNZ A; 2VVK A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3RER A; 2XHC A; 1N8R U; 1M1K C; 3HL8 A; 2BZY A; 2P0K A; 3IQL A; 4DEY A; 2JJ9 A; 2OTJ T; 1GCQ C; 2NUT A; 4ZGE B; 2KRS A; 4EDU A; 4R56 A; 4HXJ A; 1ZHI A; 1JJ2 S; 4HVV A; 3VV0 A; 1VQO Q; 3I9Q A; 2LQN A; 5IHI A; 1NE8 A; 4RMO A; 4LN2 A; 1RAF B; 4J7F A; 5LJ3 d; 2A3L A; 1X6G A; 2DER A; 3QHS A; 1K0S A; 4LDW A; 2HNI A; 2AK5 A; 3QKJ A; 2J7I A; 3M0Q A; 4XK8 E; 4F7U A; 1WJR A; 4NL3 A; 2ZPF B; 5LJ3 e; 2M51 A; 2F2V A; 3L1A A; 3TRE A; 1Q82 R; 1AHJ B; 1T0J A; 5GAN 5; 1D1C A; 2DVJ A; 3PMI A; 2LNH B; 4J6W A; 2L0A A; 3G4S A; 3OYF A; 3M0T A; 1G2B A; 5I11 A; 2XID A; 4MDW A; 3EG0 A; 3CC4 Q; 4JJD A; 1VQM Q; 1AWX A; 2JXB A; 1RAE B; 2CH4 A; 3CC7 A; 5GAN j; 3C0C A; 3RIR A; 3PGG A; 2A28 A; 1RAA B; 5D7U A; 4FU6 A; 1B07 A; 1K9M R; 1M9S A; 1G3W A; 5GAM j; 3M4G A; 4BB7 A; 5GAN 6; 5GAN h; 3U23 A; 2XKO C; 3QJY A; 1LCK A; 2EYW A; 4A4G A; 3ZFJ A; 4D8D A; 5C6S A; 1AWO A; 4FYW B; 2NUP B; 2X3W D; 3CCU A; 3OA6 A; 1NM7 A; 5GAM h; 1YJN Q; 1YHQ Q; 4C8Q A; 2RF0 A; 4WCI A; 3EHQ A; 2O9V A; 1P92 A; 4L6V 5; 4O6J A; 3CMA T; 1TOV A; 4M75 D; 1K73 U; 1PC0 A; 4M78 D; 1Q82 U; 4AT1 B; 1Q86 C; 4KBM B; 3C94 A; 3VUB A; 1UGR B; 4M7A A; 1YIJ Q; 1MNE A; 2DL3 A; 1S72 Q; 4BI8 B; 5GAO r; 3CCL Q; 1IRE B; 5CR2 A; 1VQ4 T; 1WDX A; 3QII A; 2R5M A; 1NBE B; 5CCA A; 2GBQ A; 2VUB A; 1G3S A; 2KVQ G; 3P8H A; 2D6F A; 1T0H A; 2VGN A; 5IAY A; 4OML A; 1I07 A; 3CCS A; 2W0Z A; 1QP3 A; 3OW2 A; 1BIA A; 1K4U S; 3OYB A; 1M3B A; 1VYT A; 1WGS A; 3CCV T; 2HZY A; 1LPL A; 1QMC A; 3EH2 A; 2KDS A; 4II1 A; 4DBF A; 4M75 F; 4M78 F; 4DOW A; 2DE0 X; 2LQ8 A; 1BCM A; 3JCM P; 1K8A R; 1QWF A; 2X9H A; 2L89 A; 2O9S A; 1D09 B; 1ZUK A; 1G3T A; 3L2U A; 2FYK A; 4J8O A; 2E3H A; 1GXI E; 3QBY A; 1E6H A; 3DB4 A; 4RTY A; 2PVD B; 3LGL A; 3MEU A; 3HFO A; 1M1G A; 1WYX A; 1SF9 A; 1VOM A; 4C0Z A; 2KNB B; 3FRN A; 5FU7 B; 1SSF A; 3OYL A; 2LTO A; 5KYW A; 2OAU A; 4KT0 E; 2ZPE B; 2DTI A; 1JRI A; 4JJN K; 3G6E Q; 3QG1 A; 2FPE A; 2X3X D; 3JB9 I; 4PJO E; 5C0M A; 4JRK A; 3G71 A; 1C6V X; 3INZ A; 1S1N A; 3A8L B; 4QKU A; 5FU6 B; 4KH1 B; 2E3I A; 3M55 A; 1MMG A; 3EFR A; 2RM4 A; 1EIF A; 3I5R A; 2QQ9 A; 4M75 B; 4OB1 B; 3GOX A; 3M58 A; 2CP5 A; 1K9A A; 3VUZ A; 1M2O A; 4JS4 A; 2P84 A; 3VRY A; 2PUO B; 1KQS A; 2CYZ B; 1K8A U; 2KAF A; 1X01 A; 4FT2 A; 1KC8 C; 1WQW A; 1YJ9 T; 4RTU A; 5FRM A; 4GBQ A; 4PK4 A; 1BI3 A; 1WX6 A; 3SHW A; 3RBB B; 4N4H A; 2YDL A; 5A2Q E; 1D3B A; 3L42 A; 4JUV A; 5HY6 A; 4Z89 A; 5ECA A; 3CD6 Q; 4C92 D; 1YCY A; 2C06 A; 1MHN A; 1Y57 A; 1W2B P; 3CXC A; 5GAN g; 1GFC A; 3PVQ A; 2DZ9 A; 4A63 B; 4J9G A; 2NWM A; 5FRO A; 3SWN C; 4XQ3 A; 4LUD A; 2DJQ A; 4M77 D; 4NOY A; 1OZ3 A; 1ZSZ B; 1WXU A; 2FZK B; 5GAM g; 2MAM A; 3LYI A; 5GAM f; 3QUI A; 2X4Y A; 3EGD A; 3TU4 K; 2HQX A; 4F7U G; 3CMA Q; 1AZE A; 2P4T A; 3N5B B; 4OB3 B; 1HXD A; 3PT9 A; 1PNJ A; 4OMQ A; 3R6O A; 4LXC A; 5GAN 2; 2DIG A; 3WXM B; 1WA7 A; 4M7D A; 2RQT A; 1UHC A; 1SRM A; 2CP6 A; 4C5E A; 1TUD A; 5KYX B; 1VQ4 Q; 4C92 F; 1VQK T; 2EKO A; 2EYZ A; 4J9E A; 2YWW A; 3FDR A; 3JCM b; 1RAG B; 4L59 A; 1TS9 A; 1UGQ B; 5GAN 7; 2YT6 A; 4WTO B; 1QLY A; 2VB6 A; 2NYS A; 1LOJ A; 2AKL A; 4D6W A; 1V76 A; 2M02 A; 4M77 F; 3VRZ A; 2CH4 W; 2E10 A; 3OYM A; 2LCC A; 2Y90 A; 2EGC A; 3JCM h; 2IIM A; 2QK0 A; 3A8G B; 3CCV Q; 2F1L A; 2QAZ A; 4ANJ A; 1YJW A; 3PIO A; 1W2B A; 2GTJ A; 3CCM T; 3CCJ A; 4E47 A; 3DKM A; 1Y7X A; 2RHY A; 5LJ5 j; 2COW A; 2D0N A; 2DO3 A; 3PFS A; 3ZEH A; 4JLG A; 2LT4 A; 1QVG P; 4BY6 C; 2X4X A; 2V26 A; 1VQL A; 4HT8 A; 1UGV A; 4C8Q G; 3NTI A; 3QDF A; 2DTO A; 1VQP A; 1I5O B; 3OYH A; 1M8M A; 3MO8 A; 4RTX A; 1YP5 A; 2D1X A; 1H3Z A; 3FLG A; 5LJ5 h; 3EGX B; 3MP1 A; 4IUT A; 4ME7 A; 1VQ9 A; 4M7A G; 2JTE A; 2KBT A; 4AFU C; 2A37 A; 3CCQ A; 2DRK A; 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3DLM A; 5AT1 B; 4GLK A; 4PJO D; 3E9F A; 2V1R A; 4FYY B; 3CPW P; 1VQ8 A; 4XU2 A; 1UDL A; 5DLQ E; 1VQN A; 4M4Z A; 4KGX B; 3L2Z A; 1Y96 B; 2KK4 A; 3NPF A; 2OTL T; 1RLQ C; 3JCM g; 3I55 A; 2MI6 A; 1N8R R; 3M0R A; 4TVR A; 3JCM f; 3X28 B; 1WNL A; 4MZP A; 1N27 A; 3OSS C; 1AEY A; 3CCM Q; 4J5Y A; 4Y91 A; 5IN1 A; 4P5N A; 3LH5 A; 3JB9 G; 2HD0 A; 2NUP A; 1KQ2 A; 2C0O A; 3J80 E; 2DL5 A; 1C1A A; 2O4X A; 2BE9 B; 3QO3 A; 4PJM A; 3S3O A; 4PJO F; 2PNI A; 1M3C A; 1LNX A; 2P0P A; 2VXF A; 1SKU B; 1NPP A; 1BI1 A; 2EWN A; 2RI5 A; 5LJ5 f; 2ED0 A; 1B34 B; 2HKN A; 1PG5 B; 3PE0 A; 4C92 E; 2F5T X; 1QVG S; 2R58 A; 2RA2 A; 2RN8 A; 4QVC A; 4BDY A; 1ABO A; 2EQJ A; 4IUR A; 2K6D A; 2DET A; 3V7S A; 5KYY B; 3M9Q A; 2E6N A; 2KT1 A; 4YTL A; 5GMK e; 2BTT A; 4ORZ A; 1Q86 U; 5FRN A; 3C95 A; 3EG2 A; 4FSX A; 2DBK A; 3MEW A; 3UA6 A; 1YBY A; 1Q7Y C; 1LJO A; 2E41 A; 4E7Z A; 4HT9 A; 2DXB A; 3RUX A; 1QW1 A; 3OB9 A; 2PU9 B; 1U3O A; 5A0G A; 5KH6 A; 1YWP A; 2LC4 A; 4J7I A; 3PIP A; 4AG2 C; 1RAI B; 4GLM A; 1RAB B; 3HPW A; 4FT4 A; 3G6E T; 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