2A41A

Ternary complex of the wh2 domain of wip with actin-dnase i
Total Genus 125
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
125
sequence length
372
structure length
371
Chain Sequence
ETTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Structural protein
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title Actin-bound structures of Wiskott-Aldrich syndrome protein (WASP)-homology domain 2 and the implications for filament assembly
pubmed doi rcsb
total genus 125
structure length 371
sequence length 372
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-06-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 2a41A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2a41A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2a41A03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2a41A04
2PAVA 2BUPA 4FPAA 4MO5A 3QBWA 3ATVA 3LDOA 2YHWA 3IDHA 2ASPA 2YJFA 5BRDA 3LDPA 5BREA 1YAGA 4O8KA 4PL8A 4WQ5C 3JXUA 2W41A 4BRQA 4CZMA 2YCHA 5KQDA 2DPNA 3C7NA 2NLXA 5E84A 3FZMA 2VCPA 1C0FA 3MCPA 4CI6A 2QWQA 4CZHA 1NLVA 3S41A 4E1JA 1U6ZA 4IWVA 3WXLA 2CH6A 2QW9A 4H0TB 2E20A 2Q1NA 4FO0A 2V52B 4B9QA 1H1VA 4NO7A 5I9EB 1DEJA 3CJAA 2GELA 1QQNA 4CZJA 3H6EA 3CJ9A 4M7XA 2HOEA 4FSVA 4JAXA 1NM1A 3FZLA 2VWBA 3LDLA 3AAPA 2D1KA 5ADXA 3M6GA 3EO3A 1TUUA 3C0BA 5JLHA 1IJJA 2GUPA 1OKJA 1NGIA 4CZEA 3GBTA 3ATUA 3M1FA 4H0OA 3D2FA 1ATNA 2Q0UA 2FF3B 2QWOA 5AQUA 1CZAN 3FE1A 1T6DA 2HF3A 1HKGA 3L4IA 4K25A 3LM9A 1NGEA 2E1ZA 2HF4A 5EOYA 5FPMA 4A61A 5EX5A 2GWKA 3KHYA 5BR9A 5BPNA 1NWKA 3VF6A 4B1WB 3BP8A 1XUPO 1NGCA 3MMVA 4BQLA 1ZBSA 3QBXA 3SMPA 2P9UB 2Q31A 4BR4A 4B1YB 3BUZB 2CGLA 3DJCA 1TYQB 3IFRA 5AQLA 3VEZA 2E1YA 1MWMA 2V7YA 3WQTA 4IZ9A 5AQXA 3KVGA 4RCHA 1QZ5A 1LOTB 3UKUA 3HZ6A 1XC3A 4H0XB 3ZETB 1DGKN 2P9LA 1JCEA 4FOIA 3G25A 2PBDA 3A5MC 2FSJA 3O8MA 4L3QA 5AFUH 2QWLA 1GLAG 2F9TA 4H0YB 4BVOA 3H45C 3UKRA 4EFHA 2A40A 1NMDA 3H1QA 1S22A 4BRFA 3CI5A 3VEXA 4QS7A 1Q18A 4DHYA 3D7EO 3O5BA 4I6MB 1GLCG 3RSEA 4BRGA 1J6ZA 3LL3A 4WQ4C 1NGJA 2NRHA 4H0VB 2NZTA 1KAZA 4AM6A 2QWNA 3QB0A 5F1XA 5KPRA 1TUYA 4PKHA 4PKIA 2P9IB 3CHWA 4BC5A 1MA9B 5AQHA 1S3XA 1HX1A 3CETA 1X9JA 4WYBA 2P9SB 1YVNA 5AQNA 4BGBA 2IVPA 4A2AA 4EHTA 5EVZA 4RWTA 4YDUA 2F9WA 5F2RA 1QHAA 3HM8A 3WQUA 3QFPA 4JD2B 4BR2A 2Q97A 3VETA 1ATRA 3CQXA 3LDQA 1HJOA 1JCGA 3B8AX 3P4IA 5AQFA 1Z05A 1LCUA 4BG8A 2VYPA 5AQQA 5BN9A 3SLCA 4RTFD 3GE1A 1V4TA 4CBXA 4BRCA 4FWLA 3SJHA 4BRDA 3FR0A 1NGAA 3MN7A 2P9PB 5FPNA 3TU5A 4ISGA 3DXMA 3DXKA 2D0PA 2IVNA 3L0QA 3BF1A 5BRHA 3VPZA 1HLUA 4NB4A 4B1UB 5BN8A 1U2VA 2FLOA 3FZHA 4H5WA 1DKGD 1HKCA 4GNIA 2YHYA 3AARA 4HTLA 5B8HA 2A42A 4CBUA 4K42A 4BR5A 1GLFO 2P9LB 1EQYA 3A5LC 3EKSA 3O1BA 1QZ6A 4O5FA 3MK6A 3IMXA 5AQKA 3U9DA 3D2EA 3M3ZA 4WQ5A 3BF3A 3HTVA 4BREA 1GLDG 4CZGA 3UKRB 1C0GA 4C23A 3AAQA 4BROA 4BRKA 4BRIA 4JHDB 1KAXA 1P8ZA 3H3OB 4B1XB 3FZFA 1YUWA 4KBOA 4A62A 5JLFA 1HKBA 1QQOA 3MN9A 5BPMA 5AR0A 1NGDA 5KPZA 1SQKA 1GLBG 4FWPA 5LJWA 2QWMA 3UB5A 3WEEA 1BWFO 2IIRA 3VERA 4CJ7A 2CGKA 4BC2A 3ZX2A 4J8FA 5AFUA 1T6CA 2FXUA 5AQVA 2W40A 1D4XA 2A5XA 4CBWA 3ENOA 4BRNA 3CJ7A 4EIAA 3O6WA 2V51B 3ZX3A 5EXWA 2AP1A 3C7NB 2ZF5O 4XH5A 1E4FT 3TPQA 3QMLA 2ASOA 2BTFA 5AZJA 4FWMA 3IUCA 4BRLA 3VGLA 2E2PA 4CZIA 3EZWA 3HBTA 2E2OA 5LY3A 3ZX0A 2ZWHA 3O08A 4M63C 4Y0WA 4BGAA 4M7YA 4H5VA 2D4WA 1ZC6A 4FWKA 3J8AA 2E2QA 4BRAA 3A5NC 1KAYA 3GL1A 3DXMB 3DXKB 1QQMA 1MWKA 2E8AA 2YJEA 3SMSA 1BO5O 4BRMA 4PL7A 5FPEA 4H5RA 3GG4A 3VEYA 1E4GT 2EWSA 1KXPA 4XH4A 3A8YA 2UYTA 4XH1A 5AQPA 4Z94A 4FWSA 1U2VB 4H0PA 2P9UA 3CJ1A 5KPTA 4IXCA 1G99A 5AZIA 3R8EA 4H5TA 3EN9A 4A2BA 4BR7A 1X3NA 3D2FB 3DWLA 2GTDA 5AQJA 5AQRA 3MN6A 1V4SA 2IVOA 3O80A 3ENHA 4CD1A 2Q0RA 5AQZA 4F9OA 2QWPA 3ZETA 4QS8A 2P9NA 3WUHA 1T44A 3I33A 3FLCO 3VEOA 4BC4A 3I8BA 4MLHA 3ZEUA 1GLLO 1SZ2A 1K8KA 3EKUA 3BEXA 4WQ4A 2FSNA 3FGUA 3VEWA 5KQ8A 4CZKA 3VGMA 3VENA 3VGKA 3WEEB 2KHOA 4I6MA 4JN4A 3LM2A 5FPDA 3CJBA 4FOEA 5TKYA 3UKUB 4DCHA 1R59O 3FZKA 1SAZA 1ATSA 3H1VX 4CZLA 3HSCA 1HUXA 4QS9A 3JS6A 3ULEA 2A6AA 5AQIA 1BA1A 1NGGA 4FL9A 5AQGA 4BR9A 3WXIA 2P9KA 2ZGYA 3QFUA 4IO8A 3VEVA 2P9IA 2CH5A 4BRHA 2H3GX 3OHRA 4H5NA 3VESA 2P9SA 4FWRA 3EL2A 4EHUA 3GDQA 5AZJB 3WXJA 5ADXH 2AA4A 3VF2A 1WOQA 3RSEB 1JCFA 5BRFA 4JD2A 1BG3A 4B1VA 2GWJA 4FWQA 3R6MA 3WXKA 4BG9A 4ISFA 5BPLA 4HWIA 4IJNA 3U4LA 3F9MA 4MLEA 3VOVA 4GY2B 3WT0A 4H03B 5E26A 5AQSA 1GLJO 5LJVA 4BRPA 5EY4A 5CE3A 4DB3A 2YHXA 3W3DA 2D0OA 2P9PA 4AM7A 3CERA 2ZGZA 1Y64A 4EAHD 3GOIA 4FWNA 3L6QA 5AZIB 2I7PA 5AQTA 2WUSA 4JNEA 1NGBA 5F0XA 3CJCA 3U9ZA 5AQYA 1XQSC 2FF6A 3H46O 1RDWX 3MN5A 5AQMA 3AY9A 1NGFA 2QWRA 4FPBA 2QXLA 3H3NO 3U8XA 1IG8A 4PKGA 2GEMA 3CIPA 3KZBA 3QDKA 4K43A 5ELZA 3VF4A 1BUPA 2QM1A 4YDUC 2E2NA 2P9NB 4BVPA 4B1ZA 3O4WA 3ZEUB 1RGIA 2Q2RA 2Q36A 3W0LA 1K8KB 2ASMA 3R9PA 1X3MA 3CQYA 4K41A 4LC9B 1NBWA 1ZXOA 2YI1A 4DQ8A 1NGHA 2HMPA 3UE5A 3SK3A 4JHDA 4XEIA 4BR0A 2OANA 3HI0A 1ESVA 2V7ZA 2J4RA 3FFKB 3O1WA 4BC3A 5JMVA 1GLEG 2I7NA 3ID8A 1BDGA 1YXQA 4FWOA 4CD3A 1MDUB 5AQWA 4IJAA 1Z6RA 2E88A 1TYQA 1RFQA 2A41A 3LDNA 1BOTO 2ITMA 4BQZA 3ULEB 1WUAA 4MO4A 4CZFA 4ISEA 3A0IX 1HPMA 3D2EB 2A3ZA 1BA0A 5AQOA 2P9KB 5JICA 3DAWA 3QICA 3A5OC 1BU6O 3MDQA 2CGJA 2FSKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3C6AA 2JWLA 4AHUA 1C1CA 3IDHA 3T7ZA 1SKSA 4M3XA 3LDPA 1N33K 4WQ5C 4CZMA 4DU3A 2DPNA 4DQSA 1NKEA 3V1QA 1LWFA 1U04A 3VA3A 2VCPA 1JLQA 1VAZA 4XJXA 2QWQA 3O9RA 3THWA 2O8BB 1RTIA 2Q1NA 4FO0A 3V6DA 3QIPA 4NO7A 1I94K 1DEJA 4PQUA 4ZTFA 1HR0K 2KFZA 4C8OA 4M7XA 2HOEA 4DS4A 2Y1IA 4JAXA 4E19A 2G8FA 4FJIA 2ZJQL 4QCLA 4EZ6A 3O4NA 3SV3A 3FFIA 3WNGA 3C0BA 3J7YP 3M8QA 1TVRA 5HOOA 5J2NA 1RTDA 5T7BA 1HYZA 2GUPA 3EE8A 1NGIA 4CZEA 1VSIA 4O8UA 1CZBA 1C0TA 3M1FA 4N41A 3E1YA 1QVFM 2PY5A 1A5VA 5AQUA 4FJNA 1T6DA 4IFVA 2HF3A 1SUQA 4LFBK 3LM9A 5JENA 2E1ZA 4FVUA 3CCEN 3THXB 2HHXA 2HNYA 3P31A 3AO5A 4CGIA 2GWKA 2NUBA 4F4KA 1NG9A 3QEIA 1NGCA 4ELTA 2A1RA 1ZBSA 3QBXA 3SMPA 1RBUA 3T3FA 2Q31A 3DJCA 3V1RA 4CFDA 1TYQB 5AQLA 4KTZA 2E6MA 1Q8IA 3KVGA 2ATQA 1QZ5A 2YV0X 1LOTB 2VWJA 3UKUA 4CJRA 2YNGA 4H0XB 1KRPA 4CHYA 4FZXC 5HP1A 2P9LA 4I9QA 1JCEA 4FOIA 3L3UA 4BE7B 2NRRA 4AHTA 1GLAG 3OYAA 3F5TA 4H0YB 4RW7A 2X6NA 4FLTA 3RRGA 4CJUA 1WSEA 4CGFA 4EFHA 1T8EA 1EKEA 3T69A 1S22A 3CI5A 4QS7A 4CEBA 3CC7N 3D7EO 3QEPA 3SNNA 1Q9YA 3ZT3A 1EP4A 5K14A 4E0DA 1J6ZA 4FJMA 4LF7K 3IRXA 1RBSA 1NK9A 4AM6A 3TTDA 3T1YK 3NMUA 5BR8K 3V9UA 1XMQK 3ALYA 3TSQA 1TUYA 3K57A 3CHWA 1B9DA 1WSHA 3LANA 5CYMA 1HX1A 3CETA 1BGXT 3OY9A 1YVNA 4B9VA 4A2AA 4KB1A 4DTMA 1WSGA 5F2RA 1QHAA 3WQUA 2Q97A 3VETA 4WCEL 4Q0BA 5GAGP 1JCGA 4RG8A 1UAXA 2VYPA 3SLCA 3O3GA 4LSNA 4RTFD 4CGGA 1V4TA 2F7TA 2HMIA 4NCGA 4JI2K 3SJHA 2XY7A 3ZT1A 2IVNA 1IG9A 2QTDA 3TABA 1HJRA 3LP1A 3DLGA 1RTJA 1EWRA 3KLIA 1DKGD 3MXJA 1YIJN 3NF8A 1UOCA 1RBTA 4ELVA 4F3TA 3EKSA 3O1BA 4O5FA 3OTOK 1F21A 4QOZB 3D6RA 3NH2A 3U9DA 3PIOL 3M3ZA 3BF3A 3NGIA 4FXDA 1NKBA 1KLMA 1C0GA 3JAMO 3AAQA 1G15A 5DM6L 4FJJA 3AVMA 1JJ2M 4JHDB 3HP9A 2HSTA 1P8ZA 3H08A 3LALA 1YHQN 4A62A 1DTQA 3DLKA 1ASWA 1L3SA 1NGDA 4CJKA 5KPZA 4FWPA 2B6AA 4CVNE 4IKFA 3OYKA 4CJ7A 2NNWA 3KWIA 1NU0A 3RMDA 3ZX2A 1NJZA 4YOWA 5M1OA 4HCCA 3VQCA 3HT3A 5M1NA 1TV6A 3L2RA 3HVRA 4DFMA 4E1NA 4IEEA 3HSTB 2GX9A 1LAVA 3O6WA 2V51B 3ZX3A 5FLXO 5HRRA 2BGGA 3AA3A 3HO1A 4LH4A 3ZSQA 1ILYA 3TPQA 1VSDA 5AZJA 4DS5A 1KLNA 3IUCA 3OYFA 5JVGL 2E2PA 4CZIA 4WFBL 3IAYA 5LY3A 3KKRA 3ZX0A 3THWB 3O08A 3AVHA 4LY7A 3TSPA 3TAPA 4M7YA 3PSFA 3KK1A 3DM2A 3PX0A 3A5NC 2O8CB 1MWKA 1YI2N 4CERA 5KGWA 2UYTA 2HVIA 1RT6A 5M1FA 2OA8A 3CJ1A 1NK4A 3KD1E 4BE1A 5LMNK 5AZIA 3K5NA 4H5TA 2YNFA 2ZD1A 3EN9A 3ZSVA 4A2BA 1X3NA 2IS3A 3SCXA 4OKEA 5AQJA 4JKFA 2IC3A 3DLBA 3BDPA 3O4QA 2O8FA 2QWPA 3RMCA 3KK7A 4JI3K 4KHYA 1NJWA 4NCAA 1BQNA 3FLCO 2UUCK 2Q3SA 4V19S 2RHKA 3AVKA 1ASUA 4ID5A 3CQ8A 1RBRA 3J81O 1SZ2A 1K8KA 3EKUA 1BCOA 1HQEA 1TAQA 2QKBA 1JLAA 4FLZA 3O9SA 4CZKA 3VGMA 4DV7K 1RT5A 2KHOA 4I6MA 5FPDA 1YITN 3THYA 2HW3A 3UKUB 3ZSXA 2NRXA 4X66K 3LP2A 3H1VX 3OYHA 3NVKA 1HUXA 3JS6A 3ULEA 2A6AA 5AQIA 1HPZA 3WXIA 4C1NK 4JV5K 1VSKA 2ZQBA 3NF6A 2OZMA 2P9IA 2CH5A 4BRHA 3NGZA 2H3GX 3TR8A 3VQ8A 2OYQA 3VESA 2P9SA 2X6SA 3L4QA 1OH5A 2VG7A 2VG6A 3GDQA 3K5MA 4CK3A 2W6LA 4Z4EA 2AA4A 1S72N 3ZCMA 1DLOA 5CHIA 4TSXA 2XY5A 1BG3A 4DTPA 4B3RK 4B1VA 2KKZA 2D0AA 1BIZA 4BG9A 4CJEA 4ISFA 5BPLA 1UA1A 3U4LA 3HPHA 1O1WA 3VQQA 3F9MA 2YNHA 3VOVA 1MU2A 3R3LA 4GY2B 5E26A 2BE2A 2O8BA 4BRPA 3PLAA 2YHXA 3C6HA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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