2AA4A

Crystal structure of escherichia coli putative n-acetylmannosamine kinase, new york structural genomics consortium
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
289
structure length
289
Chain Sequence
MTTLAIDIGGTKLAAALIGADGQIRDRRELPTPASQTPEALRDALSALVSPLQAHAQRVAIASTGIIRDGSLLALNPHNLGGLLHFPLVKTLEQLTNLPTIAINDAQAAAWAEFQALDGDITDMVFITVSTGVGGGVVSGCKLLTGPGGLAGHIGHTLADPHGPVCGCGRTGCVEAIASGRGIAAAAQGELAGADAKTIFTRAGQGDEQAQQLIHRSARTLARLIADIKATTDCQCVVVGGSVGLAEGYLALVETYLAQEPAAFHVDLLAAHYRHDAGLLGAALLAQGE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Putative N-acetylmannosamine kinase
publication title Crystal Structure of Escherichia Coli Putative N-Acetylmannosamine Kinase
rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 85
structure length 289
sequence length 289
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.60: N-acylmannosamine kinase.
pdb deposition date 2005-07-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00480 ROK ROK family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2aa4A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2aa4A01
3HI0A 3DJCA 4CZLA 2GWKA 5AQVA 1T44A 3VOVA 1J6ZA 2P9UA 3CJBA 2QM1A 1Y64A 4RCHA 4FWKA 4YDUC 3EZWA 5I9EB 1XC3A 2P9SB 1S22A 3A5NC 4H0TB 3KHYA 4A62A 3O08A 3EKSA 2Q1NA 4BRGA 5B8HA 3C0BA 2IVOA 3H1VX 2PAVA 3R8EA 2A40A 1HJOA 2F9WA 2HF4A 4PKIA 1HKGA 2FF6A 4BC5A 3BEXA 3L6QA 2V7YA 4FWSA 4H0XB 1V4SA 5AZIA 1QQOA 3I33A 5AQWA 2E2QA 3U9ZA 3CIPA 2FSJA 3VEXA 5CE3A 2FSNA 3DXMA 4XH4A 1ZBSA 2YJFA 3VESA 1S3XA 4FOEA 2FLOA 1ESVA 3C7NA 4MLHA 5AQGA 1CZAN 4GY2B 1QHAA 3JS6A 4BQZA 5AQOA 5BRDA 3VEOA 4H0PA 5FPDA 1BOTO 1TUUA 3WQTA 5BRHA 5AQMA 1NGHA 2P9UB 3WT0A 1GLDG 1U2VA 1Q18A 3VEZA 4K42A 3WXLA 3CJCA 1YXQA 4ISEA 3TPQA 2VWBA 3GBTA 4BR7A 4XEIA 2A41A 2FSKA 2HOEA 4BR4A 1HUXA 3GE1A 4EHTA 4BC3A 2GWJA 3D7EO 5AZIB 4DCHA 3DWLA 4JD2A 3ULEA 1IG8A 1ATRA 3LDQA 4GNIA 5AQLA 2QWPA 4BVPA 4CZMA 1P8ZA 5TKYA 4CZGA 4H0VB 4FO0A 4B1XB 3DXMB 2WUSA 5BN9A 1X9JA 4JAXA 2CH5A 5AQQA 4CZJA 3C7NB 3BUZB 3L0QA 1H1VA 3IUCA 3ZETA 2E88A 3R6MA 4IO8A 3FZMA 5AQRA 3ZEUA 4BR5A 5EXWA 4MLEA 1Z6RA 3SMSA 3ZX3A 3O8MA 3ATVA 4A61A 4FWMA 1DKGD 1YAGA 1XQSC 1E4FT 4BR2A 3CJ7A 3H1QA 5ADXH 3A8YA 1SZ2A 3FGUA 3UKRA 1ATSA 5AQJA 2Q36A 4WQ5A 4B1VA 3IDHA 4CI6A 3O80A 4FPBA 3SK3A 2IVNA 3A5LC 3A0IX 5BR9A 1IJJA 4QS9A 2A3ZA 1MDUB 3FR0A 4JD2B 2FXUA 4EHUA 3BF1A 3ULEB 4BRCA 3EN9A 2ITMA 1HPMA 4BREA 2A42A 5LJWA 3VF2A 3MN9A 4BRHA 1ZXOA 3VEYA 1RFQA 4JHDA 2F9TA 4RTFD 2VYPA 4MO5A 3U4LA 3ZETB 4WQ4A 4H5NA 3M1FA 2QWQA 1U6ZA 3LL3A 3IMXA 4LC9B 4BRDA 4EIAA 2YHYA 4AM6A 3H45C 1ATNA 3AY9A 5AQZA 3TU5A 3VF6A 2V51B 1LOTB 3LM2A 2V7ZA 2UYTA 3QBWA 3VETA 2CH6A 3FZFA 4K43A 3CETA 5AQIA 3HBTA 3O1WA 1MWKA 3M6GA 1BWFO 3P4IA 5EX5A 1RGIA 3UKRB 4CZKA 1GLAG 4IXCA 4BGBA 5E84A 3EL2A 3MMVA 4HWIA 3L4IA 2P9NA 1G99A 1QQMA 2YHXA 5AQUA 3QBXA 3R9PA 4FWLA 1TYQB 2ASMA 2FF3B 4CBWA 4K25A 3WEEB 3VENA 1BA1A 3J8AA 2A5XA 2GEMA 4JHDB 3WQUA 4BROA 3HTVA 1JCFA 4WQ4C 5BRFA 4DB3A 4FWPA 3UKUA 3I8BA 2ASPA 2A6AA 5ELZA 4FOIA 3CERA 1D4XA 2Q2RA 2VCPA 3KVGA 4JNEA 4CZEA 4BVOA 5BN8A 2D0PA 2CGKA 4B1UB 2V52B 4H0OA 3H46O 3U8XA 1YVNA 5AFUH 5BPLA 3VF4A 3WXKA 2EWSA 4H5WA 2NLXA 3W0LA 1ZC6A 2GTDA 4FWNA 4CD3A 2ASOA 4EFHA 5BPMA 4AM7A 4E1JA 4M7XA 1EQYA 2IIRA 4FSVA 2YHWA 1NGCA 3LDOA 3GL1A 3EKUA 3SMPA 3UKUB 3CJ1A 3IFRA 3HZ6A 1NLVA 4A2BA 1NM1A 1BG3A 3CQYA 4BRLA 2P9IA 2D0OA 3M3ZA 2J4RA 4B9QA 1GLCG 1YUWA 1K8KA 5EY4A 2BTFA 4DHYA 2Q0UA 3EO3A 5LY3A 4BQLA 4JN4A 2CGLA 3QMLA 2DPNA 4F9OA 4PKHA 1U2VB 4BG8A 5KPRA 3O5BA 3SLCA 4EAHD 4BR9A 3UB5A 4BRKA 5KQ8A 4M63C 1KAZA 3MDQA 2QWNA 2QWMA 3CQXA 1GLJO 4CBUA 2NZTA 5BPNA 1X3NA 2D4WA 2QWRA 3DAWA 3KZBA 5JICA 1NWKA 5JLFA 4YDUA 2P9PA 1JCEA 2P9SA 3ENHA 3MK6A 4IZ9A 5ADXA 5KPTA 2ZGZA 1HLUA 1NGAA 4O5FA 1NGGA 3B8AX 3VGKA 1BO5O 4B1ZA 1WOQA 2P9IB 3ZEUB 5LJVA 2H3GX 5BREA 1K8KB 2W40A 4IWVA 3BF3A 4Y0WA 1LCUA 3H3OB 3QFPA 3WXJA 2E20A 2E2NA 2YI1A 1OKJA 4Z94A 4A2AA 2D1KA 2HF3A 2HMPA 3FE1A 1R59O 3DXKA 3FLCO 3H6EA 4M7YA 5AQHA 3VERA 3WUHA 4ISFA 4WQ5C 3LDNA 3G25A 2W41A 4WYBA 2KHOA 3FFKB 1SQKA 2IVPA 1RDWX 1HKBA 4H5RA 2BUPA 5FPNA 4NB4A 5AQFA 4L3QA 4QS8A 4FL9A 3VGLA 2I7PA 2P9PB 4IJNA 4J8FA 4BRAA 2QWOA 3AAPA 4CZFA 4PKGA 3AARA 2Q0RA 1NGJA 1NGDA 2ZF5O 4I6MA 2Q31A 4BRMA 3BP8A 2QW9A 1MWMA 1KXPA 1HKCA 2AA4A 3QFUA 1WUAA 3LDLA 1T6CA 1GLEG 2GELA 3UE5A 2GUPA 3LM9A 3LDPA 5AQNA 3S41A 1GLLO 3O6WA 2YJEA 5FPEA 3ZX2A 3AAQA 3DXKB 4H5TA 2P9KA 4HTLA 3CI5A 5F0XA 1BU6O 2CGJA 3ENOA 3GG4A 2E8AA 5AR0A 5F2RA 2P9NB 4K41A 2PBDA 3FZKA 4BRQA 1KAXA 2E1YA 5JLHA 1DEJA 3ATUA 3RSEA 2YCHA 4XH1A 1C0FA 1GLBG 3OHRA 2QWLA 3O1BA 1NGEA 1C0GA 4B1WB 4KBOA 5AFUA 1E4GT 3VEVA 2Q97A 4BGAA 3QDKA 4ISGA 3HM8A 5AZJA 3ZX0A 4QS7A 2OANA 3F9MA 1KAYA 1GLFO 4I6MB 4CZHA 5KQDA 4NO7A 4DQ8A 2ZGYA 4BRPA 4CD1A 4FWQA 1QQNA 5EOYA 4MO4A 4H5VA 5JMVA 1MA9B 3U9DA 1QZ5A 3WXIA 3VEWA 1HX1A 2P9KB 3D2EA 1NGIA 3W3DA 3D2FA 2I7NA 3VPZA 2AP1A 4H0YB 4RWTA 4XH5A 5FPMA 1BUPA 2P9LA 3HSCA 4BRIA 5AQTA 1TUYA 4FWRA 3RSEB 4BC4A 3JXUA 4FWOA 3FZHA 4BRFA 3MN7A 3QB0A 1XUPO 5AQKA 2NRHA 1Z05A 4BRNA 3H3NO 1BA0A 3CJ9A 4H03B 5AQYA 1NBWA 5E26A 5AZJB 3FZLA 4B1YB 2E2PA 3QICA 1NMDA 4CZIA 5F1XA 3MN5A 3VGMA 5AQPA 5KPZA 1SAZA 1X3MA 3ID8A 3O4WA 3A5MC 4IJAA 1NGBA 4BC2A 1TYQA 2QXLA 4O8KA 4C23A 3SJHA 5AQSA 3GDQA 4BR0A 3MN6A 1T6DA 1DGKN 3WEEA 3MCPA 3A5OC 1NGFA 4BG9A 3CJAA 5AQXA 1JCGA 1BDGA 1QZ6A 2E2OA 3D2EB 4FPAA 5EVZA 4CBXA 3D2FB 2ZWHA 4PL7A 4CJ7A 3GOIA 3CHWA 4PL8A 1V4TA 2E1ZA 2P9LB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1VSEA 4LD0A 5AQVA 3VOVA 1T44A 1Y64A 4RCHA 4ILHA 2P9SB 3A5NC 4FJNA 3CFPA 4GKJK 4H0TB 3EKSA 4DFKA 4CGFA 4BRGA 5B8HA 4EZ6A 3VQBA 2A40A 1HJOA 4CE9A 3VN5A 3BEXA 4H0XB 2E2QA 1IH7A 1KSPA 1S5JA 4E7LA 5CE3A 4E3SA 1ZBSA 5CY4A 4DTXA 3SJJA 2O8DB 2FLOA 1ESVA 4MLHA 4GY2B 3JS6A 1RTHA 5M1FA 2GUIA 3VEOA 3CM5A 2LSNA 1IKVA 3LZJA 1LAVA 3VQAA 1RT3A 3VMFB 5AQMA 3T1HK 1I94K 2RE2A 3TWHA 3AVBA 5M1NA 3OYLA 1GLDG 4FJLA 3BGRA 2ZJPL 4M3UA 4K42A 3CJCA 4ISEA 3E01A 4FLUA 2VWBA 4CEZA 4YORA 3GE1A 1HYVA 4EHTA 3I8DA 4CGIA 4JKGA 3OY9A 1X9SA 4FJIA 1YVUA 2ITGA 3A2FA 3OYDA 4JD2A 2OA8A 1RT5A 4U67L 4DTOA 1BIZA 4MDBA 4JAXA 5AQQA 4CZJA 5FRMA 4CGJA 4KTZA 2PZSA 1WSGA 1KLNA 4MLEA 5HROA 2QK9A 4YOYA 2KQ2A 4JS4A 3ATVA 4FWMA 4RW4A 3E66A 4OO1J 1XMOK 3VA0A 1XQSC 1E4FT 3CC2N 3CJ7A 5ADXH 3FGUA 3UKRA 1JL2A 4F2RA 1RNHA 3SUQA 4DSLA 3ZT3A 4NCBA 2DY4A 4CI6A 3ASMA 4AHTA 1I3AA 4JKGB 3RRGA 3A0IX 2PYLA 2A3ZA 3NGYA 4BWMA 3TR8A 4JD2B 4EHUA 4BRCA 3EN9A 2Z1HA 1RDBA 2A42A 2G8FA 4CHYA 4RTFD 2IS3A 3AVIA 4LY7A 1L3VA 5CYMA 4H4MA 3M1FA 4CJ5A 3MCAB 4CF0A 5AQZA 4JKBA 2V51B 5KRSA 2V7ZA 2UYTA 3RMAA 3VQ4A 4YNQA 4JRPA 2WOMA 1J5EK 5AQIA 3HYFA 3P83D 4JI5K 5IT9O 1CZBA 5GAHP 3M6GA 1BWFO 5EX5A 1RGIA 3UKRB 4IXCA 4DR1K 4JI3K 4KKOA 4HWIA 3O3HA 4DV2K 3L4IA 2P9NA 3OYGA 1ASVA 1QQMA 2YHXA 1Q9XA 5AQUA 3QBXA 3DM2A 3NVMA 3EYZA 3ITHA 1TYQB 3AA5X 3O9QA 2ASMA 2FF3B 1NK5A 1XI1A 3AVNA 4CBWA 3WEEB 3VENA 4BDYA 4LF9K 4KHYA 3J8AA 1NK4A 4JS5A 4WQ4C 5BRFA 4JK8A 4DB3A 1BI4A 5ELZA 1VRUA 4JRQA 1EX4A 3M8QA 3TTFA 1NK9A 4JI1K 1QSLA 4OGCA 4FVMA 2V52B 4H0OA 5I3UA 2KLAA 4DTNA 5HRPA 1WN7A 5CYQA 3DMJA 3OJSA 3VF4A 3AVHA 3NHGA 1CLQA 4N56A 3CFRA 2F8SA 2BGGA 4CHNA 4O0IA 4AHRA 3CCRN 2ASOA 4LF4K 3K9KA 1WSIA 3O4NA 4EFHA 5BPMA 2HHUA 4M7XA 2VWJA 4Q5VA 2IIRA 4FSVA 4OGEA 4E7HA 1BI4B 4HUGA 4A2BA 1NM1A 3CQYA 3DLRA 3LPTA 2D0OA 3G71N 1YUWA 5EY4A 4DHYA 3EO3A 3RR8A 4K8XA 4LFCK 3QMLA 4F9OA 3KWIA 4KREA 3KLHA 4IBNA 1U2VB 3KJVA 3SLCA 3CF5L 4EAHD 3LP0A 4M63C 2HHXA 4PWDA 4CBUA 5BPNA 4FJ5A 3NDKA 4N5SA 2D4WA 4E7KA 4LF7K 3TSPA 1K8AO 1LWCA 4PHTX 4WE1A 5JLFA 4IEIA 3ENHA 4B9SA 3SI6A 4OPHA 4C1NI 1CXUA 3DRRA 5ADXA 5DM7L 1YIJN 4FJHA 3B8AX 1KC8O 4Z4GA 3LALA 1KRPA 4AHSA 4M3TA 4DSKA 3WXJA 4M3WA 2E2NA 1MU2A 4Z94A 2YNIA 2D1KA 4A2AA 3KLFA 2HF3A 3MXJA 1HNWK 4M7YA 5AQHA 3VERA 3SAGA 4BWJA 3TANA 4ISFA 5AJ3K 4WFBL 3O9UA 3FFKB 1U4BA 1RDUA 2P5GA 2ZE2A 4H5RA 1VK0A 2BUPA 1M1KO 4NB4A 1J9AA 5AQFA 4CJSA 4B9NA 2I7PA 5EU7A 3DLBA 4W5OA 3K58A 1VSKA 4BRAA 2QWOA 3AAPA 5DK5A 4X62K 3PX4A 1IBMK 1B92A 1FK9A 2Q0RA 4CHQA 3SZ2A 4E1NA 4I6MA 3F2KA 1DLOA 3AVCA 1MWMA 2NUBA 3HJFA 1KXPA 3NBPA 3QFUA 1QS4A 4KB0A 1T6CA 3V9XA 4WFNL 4DS5A 3TAQA 3RRHA 4E7JA 1JLBA 2IAJA 2YKNA 3TAFA 3T7ZA 2EHGA 3AA3A 5FPEA 3ZX2A 5J2MA 4H5TA 3ALYA 4FM0A 1Z26A 3V9ZA 3CI5A 1L5UA 4DKWA 3OS2A 3ENOA 1NJXA 5AR0A 2VQEK 4K41A 2E1YA 3F73A 1C0FA 4R5PA 3DLHA 3O1BA 1E4GT 3AVLA 4ELUA 4LSNA 5CR4A 4W5NA 5FDLA 5LMUK 5IWAK 3S3MA 3TI0A 5AZJA 1GLFO 4I6MB 4B3MK 5KQDA 2KTQA 1T3VA 3O4QA 1VSLA 1D8YA 4BRPA 4CD1A 2WFBA 4FWQA 4BE0A 1QQNA 3BY5A 3AV9A 5EOYA 4MO4A 3C95A 4H5VA 4R79A 4PUOA 1KVAA 1U04A 3L2RA 3OBWA 3WXIA 3OTOK 3WNEA 4FLWA 3AVGA 3DLEA 1IBLK 3NGZA 1X9WA 2P9LA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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