2ABBA

Structure of petn reductase y186f in complex with cyanide
Total Genus 134
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
134
sequence length
361
structure length
361
Chain Sequence
KLFTPLKVGAVTAPNRVFMAPLTRLRSIEPGDIPTPLMGEYYRQRASAGLIISEATQISAQAKGYAGAPGLHSPEQIAAWKKITAGVHAEDGRIAVQLWHTGRISHSSIQPGGQAPVSASALNANTRTSLRDENGNAIRVDTTTPRALELDEIPGIVNDFRQAVANAREAGFDLVELHSAHGFLLHQFLSPSSNQRTDQYGGSVENRARLVLEVVDAVCNEWSADRIGIRVSPIGTFQNVDNGPNEEADALYLIEELAKRGIAYLHMSETDLAGGKPYSEAFRQKVRERFHGVIIGAGAYTAEKAEDLIGKGLIDAVAFGRDYIANPDLVARLQKKAELNPQRPESFYGGGAEGYTDYPSL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords pentaerythritol tetranitrate reductase
publication title Proton transfer in the oxidative half-reaction of pentaerythritol tetranitrate reductase
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacter cloacae
total genus 134
structure length 361
sequence length 361
ec nomenclature ec 1.7.99.-:
pdb deposition date 2005-07-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00724 Oxidored_FMN NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2abbA00
2H90A 3BK0A 1XKYA 1H61A 5D04C 1QFEA 3M9YA 3N73A 3IIPA 4BR1A 1ZAIA 5L9FA 4ICNA 1T0OA 1IIHA 1R2TA 2FTPA 1IGSA 4N4QA 4UTHA 4OE7A 1JQXA 1ZNNA 2QF7A 4IMDA 4RX0A 5EL1A 3DFNA 3N19B 1Q6LA 3W84A 3EKZA 5I3GA 1VCFA 2V2CA 5C5YA 1K8YA 4O4WA 2ATSA 4FX6M 1PV8A 3HQ1A 5CZTA 4IQLA 2FPYA 3OVRA 3R13A 3USBA 4ZQRA 1WDWA 3FKRA 5DXYA 1TPVA 4UNLA 4UXDA 3UNDA 4JTSA 4DXVA 1TQJA 4LUIA 3RFAA 2WPBA 1S5WA 4JICA 3UXDA 5HULA 1AW5A 1DQXA 1SW0A 1TIMA 4NX5A 1YTKA 3QSRA 3TJXA 3S5OA 4LT9A 4WY0A 1I2PA 5BNKA 2CW6A 5K4XA 4HT3A 1KM4A 1VR6A 2ISWA 5DN1A 4NNAA 3MMTA 5G1TA 1RD5A 2C13A 2H8XA 4HNVA 3PSVA 3A21A 1WQ5A 4JD4A 1FWRA 1G4TA 2X1RA 3TMQA 4Z1CA 1JVNA 2OMAA 2NXIA 1A5SA 4K7VA 1ICPA 5GVJA 4JYEA 2VOMA 3ABSA 4B5NA 3NL2A 1ALDA 3NVTA 3P5ZA 1FXPA 3UWUA 1RQHA 2BSLA 3GK0A 2J27A 2FPTA 4PA8A 3TNOA 2WSQA 2HTMA 3GX9A 5D2VA 5DXXA 1H7PA 2CZ5A 3O06A 2E6FA 2QKFA 2JKAA 2VEKA 4DPPA 3S5YA 4HNNA 1TSIA 1HL2A 1MEWA 4AWSA 3NAVA 3O63A 3NQEA 3M5XA 5K9XA 5AN7A 3W86A 4DO5A 4MFEA 1F2JA 2ZFAA 1AL7A 3NOEA 4LVDA 1AL8A 1H50A 1W3IA 1ZENA 2A5HA 4O1BA 5KMYA 2QCEA 3TXZA 1RQEA 2O7SA 3L5MA 3PR2A 1ICQA 2Q8LA 3KX6A 2CLFA 4A22A 3NGJA 4LRTA 4Z0JA 2TSYA 1CW2A 4BWLC 1TPEA 2QCGA 1F74A 3TU9A 3UY8A 1F5ZA 3TFXA 2GPTA 1LOLA 1UCWA 3S42A 3P80A 2YW3A 3SR7A 5G2WA 2Z0IA 2H6RA 3EX4A 3OVQA 4Z1BA 3LV6A 4UUIA 4ZQOA 1JCXA 1H7RA 2JGQA 4IXXA 4O50A 1SFJA 1LBMA 3TCEA 1KFEA 1X1OA 4J9JA 3HIJA 3NYZA 2ZCGA 1J2WA 2FPVA 3LGEA 1B4EA 3B0VC 1DKWA 3U6WA 3W7KA 1JUEA 1R2RA 2Q3RA 1N7KA 2GVLA 2PE4A 2YYUA 4YL2A 1H5YA 4EWND 4AXKA 3PUOA 3GDKA 2AQWA 4IX2A 4O13A 2ZYFA 3WK1A 1P5BA 3LOTA 2GQ8A 4KWVA 3LRLA 4DF2A 1EPXA 1F6KA 1OFDA 2GVGA 3WFAA 3TH6A 3ZWTA 3NZRA 1WBJA 1PIIA 3C52A 4AVFA 3NQ8A 1QWGA 1AMKA 4WQ6A 4O14A 5F4WA 4XKYA 2I14A 4PFMA 2C3ZA 2KZHA 3W1UA 2XN2A 1DVJA 1YDNA 3C61A 1F7BA 3DGRA 4HIBA 3A22A 2YX0A 1FX6A 3LCLA 3TDFA 5CSRA 3F1QA 3S1XA 5EA9A 3DKLA 1JCNA 4U28A 4DBEA 3BLIA 3WJZA 5K9DA 4O52A 2PURA 3W7DA 1HFBA 3QYQA 1N8FA 1XC4A 2VEMA 4RLIA 4FIRA 2A1YA 1QMLA 3CWNA 4KFPA 3UWZA 1FXQA 3N3MA 4GUHA 3W2UA 3NQ7A 4HPXA 2E09A 2CZFA 4CNPA 2EGZA 2JBMA 3LDVA 1KFCA 3BW3A 5AYXA 1GTEA 5H91A 4MJMA 2F7FA 3PBWA 3CU2A 5HUPA 5BOOA 4KWWA 1A5AA 3N14A 4UTLA 5AHFA 3QW3A 1XFBA 1Q6OA 2GQ9A 4X22A 2A7RA 3NR0A 1JUBA 5I3HA 3STGA 3FYOA 3G1SA 3KRSA 1PHWA 3HG4A 4O18A 2FB2A 2Q8ZA 3PG8A 4GUGA 3G8EA 1OFAA 1JRCA 3H55A 1E51A 3I6RA 1I8JA 5L6UA 2PRHA 4A21A 3RU6A 2DORA 5HWMA 3DAQA 1GPWA 3E9AA 5HNRA 1OVDA 5F1VA 4GUFA 2E5CA 3L2IA 3UY7A 4MUZA 1GWJA 3EXSA 4MFDA 4M6VA 3S5ZA 3EWYA 2VEIA 3UWWA 3Q94A 5LKYA 3TXVA 3P74A 2VKZG 1H7NA 3MJYA 4DO4A 3UQNA 1ML1A 2PRLA 3G8RA 3A23A 1YYAA 1EEPA 1VQTA 4GXMA 3PBUA 2H3BA 3HGSA 3KHJA 4CCEA 2WSYA 4OQVA 3T40A 3IVUA 3GXPA 1B4KA 4NZJA 3TQVA 1MO0A 3Q58A 2OT0A 3P67A 4UCGA 2HMCA 3TJLA 3KXQA 3LXBA 3LRMA 4RJEA 3BO9A 5CPOA 5BMWA 3QFEA 2C14A 1OFEA 1JUKA 3TIMA 1RQBA 1F76A 3QH2A 4UFIA 1XBZA 2VENA 5IBXA 3OVPA 3NL3A 1LRNA 2DZUA 3BPWA 5D03A 2RH9A 4DBDA 1VYPX 2Y7GA 2A4AA 3MI3A 4DPQA 1TPUA 1ZAJA 2P1FA 5FI8A 4RXGA 1LRQA 3HB9A 4S1FA 3A5FA 4JDYA 3W74A 1XM3A 1MSSA 3MYOA 3CHVA 4JR5A 1L2UA 5DY2A 2DZSA 2GUUA 3JRKA 3KOFA 4Y6GA 3LTSA 1AG1O 1LZOA 3T7VA 5K9CA 1OHLA 4OV9A 5F2GA 3G1VA 1DL3A 1OFQA 1KM0A 2ZZ2A 2VFDA 3S5NA 2Y7FA 1YDVA 2B4GA 3NQAA 4RK8A 2HSAA 3PSWA 1G4EA 3DI0A 3T55A 3LHVA 1LTDA 3DFPA 5LZLA 4FO4A 4RR4A 3ZS4A 1W3TA 1RR2A 1OYBA 2O7QA 4LVGA 5DELA 4YCOA 3TAKA 3C6CA 2YYTA 3BVJA 5KTLA 4FNPA 1NSJA 4JS3A 1D3HA 3PB0A 3LI0A 4LS2A 5AYYA 1IXOA 5AC7A 1TPDA 3TFCA 1SZFA 4OHQA 1T8XA 3W7IA 3QM3A 3EXRA 1TV8A 1HO1A 4IMFA 3ANYA 2J88A 1FWSA 3FFSA 1OX6A 3PAJA 3G18A 3GDTA 5D38A 2J9XA 3HG5A 3OEXA 4NT0A 1YPFA 4JYFA 4MZ1A 2YW4A 2GQAA 1VGAA 2B7QA 3S6DA 1W0MA 1VHCA 1LBFA 4A29A 3QQ0A 4FIQA 3QMTA 4O16A 3TV8A 4ZQMA 4NJJA 3GDLA 4PH6A 3CIWA 5LNWA 1OJXA 1YPIA 4C1KA 3VE7A 3GKAA 3P62A 4TMBA 3TAOA 1O60A 2RKXA 2ZZ4A 1PL9A 3UWVA 4DELA 3ATZA 3PUDA 1SO3A 4UTWA 1FCQA 2ATMA 3UZJA 1SPQA 3FJLA 3ZWSA 3LHTA 4GC4A 3NPUA 4ONVA 5D37A 5ABTA 2ZA1A 3P5YA 5E1QA 4DEFA 3QJAA 4G1KA 4NZFA 4E2DA 3VCRA 5FF2A 4L4LA 4EF9A 2HS6A 3GYEA 3O05A 2ZRZA 1S5VA 3H53A 4PEKA 3R12A 1SO4A 5C6MA 4UMCA 3WJXA 1LBLA 1OF6A 4FF7A 3G22A 2V2DA 2QUUA 2QEZA 4OU1A 5F2IA 3W1NA 1LRTA 4KFNA 1PCWA 1V7YA 1VLIA 4BFAA 5KSWA 2X2GA 3S1VA 1SW3A 2EPHA 1OG0A 4M5PA 1W56A 3CTLA 4RZ4A 1UB3A 3IIVA 4WOZA 4EOUA 3RLUA 3M5YA 1VPXA 1P0KA 5K3VA 4LS1A 3W7MA 2C6QA 4IX0A 3TW7A 4UTTC 2ZZ7A 2NXGA 3DBPA 3VI2A 2E6DA 2V5BA 3STFA 4UR7A 1OABA 1H7OA 4CQ8A 3MHUA 3NQ6A 1W8SA 1FUYA 4TO8A 3W7QA 5D33A 3TK7A 4FEZA 3C56A 2WO5A 4BI5A 3M44A 3QQ1A 3CB8A 3GDRA 1EUNA 1KM6A 5BW6A 3EWWA 1O94A 2V5LA 1KTNA 2ZZ3A 1C29A 3CPRA 4LOCA 1JQVA 4TIMA 5FF0A 3PB2A 3R5EA 1BEUA 2NLIA 1HG3A 2BLEA 3E12A 1P0NA 1LLZA 1G69A 3B0PA 2B7OA 2ZZ5A 2ZZ6A 4XKYB 2QDHA 4XZ9A 4OWGA 1FQ0A 3TSMA 3W7RA 4QM1A 3UD6A 5HR6A 4FNSA 1KFBA 3CT7A 1WV2A 2CLOA 5C55A 1KBJA 3MHFA 1G4SA 4WXZA 2YZRA 3P7YA 2P0OA 5LNVA 1LOSA 3DU0A 1ADOA 1U83A 3W1LA 3L5AA 2C0AA 4Z1DA 4LW7A 2CZEA 3LXCA 1OYCA 2BXVA 3IEBA 4YMZA 5FF4A 5D2YA 2QJHA 1KA9F 4HPJA 2ZA3A 4TX9A 3PULA 1SSGA 2PRMA 1I45A 1A5CA 1WOAA 3BLEA 3N9RA 3W7CA 4EIVA 5FF7A 1PCKA 3G3DA 1Q45A 3WK0A 3KRZA 3IIOA 4IWWA 2WKJA 3G1YA 3L0NA 4LV9A 3C2OA 2Y6ZA 2YCEA 4PTNA 3L68A 4LS0A 3PUEA 1ME9A 4AEOA 4N6EA 2X30A 5CPMA 3BLFA 1KM3A 1KFJA 3QMRA 1DJNA 1GYLA 4R34A 1KV5A 4MY8A 2G97A 5K2ZA 1T96A 1R2SA 3FA5A 3TMLA 4A2SA 4N9EA 2QDGA 5F2MA 3LCXA 1F73A 2YSWA 1EP2A 3B03A 5FF3A 5D32A 3I7QA 5LHEA 3HG3A 2VXNA 3G0SA 4I7WA 1OFOA 2E68A 3BG9A 3O8AA 3EWXA 1NAL1 4HHPA 4U4MA 1I2NA 2X1SA 1O4UA 3NG3A 1XL9A 3Q2DA 4P2VA 3TX9A 4AB4A 1K8ZA 4MPQA 5EMUA 2RHGA 2A6NA 1W5OA 4M7TA 1DJQA 1Z42A 3NZ1A 1TREA 2Y62A 4HSNA 5IBXC 3TQ0A 2R14A 4KFOA 1FWWA 1TRDA 1SQ7A 4LTSA 1OYAA 4S2CA 4YWIA 4LC8A 2ZRXA 4O10A 2ZRWA 2VELA 1PE1A 2D73A 4E2BA 5D09A 1GYNA 4LC6A 3FLUA 4UFLA 3DFQA 4NNBA 3S1UA 4DF0A 2DU2A 2NV2A 1W31A 1FDJA 3SFKA 1SZGA 2ZBTA 3NQVA 1XDMA 4O11A 1M6JA 2G5WA 1OFPA 3FS2A 4JNMA 1ZALA 2Z6JA 3LB0A 3LHWA 1XUZA 1GT8A 4KKXA 2CLHA 3W85A 1MZHA 3NQMA 3G1HA 4UTUA 2X16A 3C2FA 1MEHA 1QCWA 3E0IA 2YGYA 1DOSA 1EWDA 1SSDA 4RCXA 3NM3A 5D2TA 3W2NA 3N2MA 1KM5A 3N9SA 3G3MA 4GBUA 4JYDA 3OA3A 4GUIA 4O15A 3K30A 3CEPA 4WUIA 3GIYA 1ICSA 4O54A 1X1ZA 4Y8FA 4Z08A 1SR9A 1TQXA 3MI2A 3W23A 1VRDA 4H4IA 4ZVJA 4BI7A 1PHQA 4ADSA 3LCFA 5FESA 3GR7A 1D3GA 3B06A 3DFSA 4WY0F 4GRSA 3G1AA 1L6SA 3OHIA 4E0CA 4IMEA 1FDZA 4FX8A 4S2BA 4AHOA 3EX2A 3LCGA 1GVRA 1M7OA 3IGXA 2QCNA 3W7HA 2FLIA 1GZGA 4H6KA 3CLMA 3GAKA 4FNRA 3GLCA 4Q33A 3BG5A 1QR7A 2WNNA 1TTPA 1GVOA 4IXHA 4JIQA 3TE9A 4DF1A 4EF8A 2YDAA 5CPLA 3QSTA 4BI6A 1QPQA 3M47A 3E02A 3NQ2A 1TV5A 1O5KA 1S3HA 5F4XA 5K7JA 3VFLA 1KFLA 1XCFA 1JR1A 2Z2UA 4ML9A 3W7NA 4N02A 4AH7A 2VFEA 3PC0A 4N2YA 3W7EA 3O16A 1L6YA 1KM1A 3HGRA 1JCYA 2J24A 3LLFA 1G7UA 1C8VA 4CNOA 3OG3A 2TRSA 2W6RA 3W1TA 3PVFA 1H1ZA 4RXFA 1QDSA 4UTWC 2WSRA 1DHPA 1TPFA 1JULA 3UZ5A 3B8DA 4MYAA 1FCBA 4JTIA 3DH7A 4AF0B 2E5BA 5LNSA 5DCBA 1HO4A 4ZMGA 2FJKA 1UBSA 5LNRA 3GR8A 4FNTA 2ZTJA 1I2QA 3W75A 4CQ9A 4XBSA 3GKFA 1U5JA 1W1ZA 2CFFA 1GQNA 3WK2A 3O07A 1ZJIA 4MZ8A 3B0UX 1FBAA 2AAMA 3LTYA 2TPSA 2ZRUA 5D30A 3BW2A 3KVKA 3RMJA 2JKPA 3M43A 1TTJA 4GWEA 3M16A 2DZWA 4AHPA 4RZ5A 2QAPA 4PODA 1TCDA 1GJPA 4UFMA 2C1HA 3RLVA 1NVMA 3UPWA 5CKSA 5AHMA 3CWOX 5AOUA 1P1XA 2PCQA 1YTEA 3NDOA 4CCCA 3W22A 4TMCA 3L67A 4O4VA 3HPXA 4RKAA 4FHAA 1H60A 3ATYA 4R53A 3NQFA 4JN6A 1JJKA 1QO2A 3D0CA 2LLEA 3U8GA 1TYGA 1ZFJA 2ABBA 2QCHA 1BKSA 5KZEA 2EHHA 3DFTA 3P84A 4K38A 4X2RA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2H90 A;  1I75 A;  2WHK A;  2QPX A;  1RPK A;  1W1B 1;  3CO4 A;  1ZAI A;  5L9F A;  2XZ7 A;  5I77 A;  2OGY A;  3MU7 A;  1T0O A;  2PTD A;  4BZY A;  2X8R A;  4UTH A;  2PD5 A;  2JAL A;  2PGR A;  2BGN E;  1ZGD A;  4M1B A;  4OE7 A;  1ZNN A;  4IMD A;  1KWK A;  2ZX9 A;  5EL1 A;  3EKZ A;  3RN6 A;  1VCF A;  2OFJ A;  4FX6 M;  1EJR C;  3WZ0 E;  5CZT A;  4IQL A;  7CGT A;  3VII A;  2FPY A;  4LF2 A;  1KKO A;  3UND A;  2PP1 A;  4JTS A;  3H2N A;  1TQJ A;  4LUI A;  2OYL A;  2F61 A;  3SCO A;  1LL7 A;  3UXD A;  3LPO A;  5J04 A;  1SW0 A;  2R1P A;  4RL3 A;  3RJY A;  1P6B A;  4MAD A;  3S5O A;  1K77 A;  1I2P A;  2CW6 A;  2HXU A;  4HT3 A;  1REQ B;  3I3E A;  1LQ0 A;  1KM4 A;  5DN1 A;  4NNA A;  4RPP A;  1RD5 A;  4HNV A;  3PSV A;  1XLL A;  4TOQ A;  1WQ5 A;  4ZXL A;  2X1R A;  4IP4 A;  4R88 A;  4Z1C A;  1RCQ A;  2OMA A;  1A5S A;  2YL8 A;  4UB9 A;  3BMW A;  2ZX8 A;  2Z1V A;  1ALD A;  1FXP A;  4HA0 A;  1DID A;  1RQH A;  2AMX A;  1H4P A;  4ZGY A;  1VRX A;  3RCM A;  3TLQ A;  4PA8 A;  2PDP A;  5D2V A;  5DQP A;  2CZ5 A;  3H2F A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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