2ABLA

Sh3-sh2 domain fragment of human bcr-abl tyrosine kinase
Total Genus 37
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
37
sequence length
163
structure length
163
Chain Sequence
MGPSENDPNLFVALYDFVASGDNTLSITKGEKLRVLGYNHNGEWCEAQTKNGQGWVPSNYITPVNSLEKHSWYHGPVSRNAAEYLLSSGINGSFLVRESESSPGQRSISLRYEGRVYHYRINTASDGKLYVSSESRFNTLAELVHHHSTVADGLITTLHYPAP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase
molecule keywords ABL TYROSINE KINASE
publication title Intramolecular interactions of the regulatory domains of the Bcr-Abl kinase reveal a novel control mechanism.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 37
structure length 163
sequence length 163
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 1996-11-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00017 SH2 SH2 domain
A PF00018 SH3_1 SH3 domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.30.40 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 Domains 2ablA01
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 2ablA02
2DX1A 1OEBA 2DBMA 2L4KA 3KFVA 2DE0X 4FBNA 2JS2A 2KXCA 4ESRA 2EYXA 1W70A 1K0SA 1X2QA 1B07A 1CKBA 2YSQA 1O44A 2OJ2A 1AYBA 4F14A 2J6OA 2B86A 2KYMA 2KROA 3ULRB 1Y57A 1GFDA 3BKBA 4F5AA 2DCRA 3CWGA 4GL9E 1I1JA 2YUQA 5IHIA 1JYUA 1O4RA 1U3OA 4H1OA 1HSQA 2ABLA 2KXDA 2AZVA 1SPSA 2FPFA 1J3TA 2KBTA 1KA6A 5FWCA 3SEMA 3MXYA 1AOJA 1YVHA 1P13A 1KA7A 2K79B 5AULA 1O45A 1RLPC 3LH5A 2O9SA 1G83A 1R1SA 2DM1A 1PKTA 3S8LA 5FW9A 4F59A 2EPDA 5IBSA 4J9HA 2LNXA 2PLEA 1KJWA 3WA4A 3CBLA 4GPLB 2JT4A 4LN2A 4J9IA 1TG0A 1VYVA 1WLPB 4A4CA 2RQUA 2EGCA 1A81A 4F5BA 2J06A 1AEYA 3VRPA 1BKLA 3MXCA 4J9GA 1H92A 4JZ4A 2CRHA 1ZX6A 3I5RA 3CXLA 4ORZA 2K79A 4AFSC 1CJ1A 1O49A 2IIMA 3UATA 4LE9A 2F2WA 2KK6A 1CWEA 3QWXX 2X3WD 2J6KA 2M51A 2RF0A 2RMOA 2ROTA 4WWQA 1CSYA 2SRCA 2L2PA 3TKZA 2EYWA 3EHRA 1I0CA 2YSXA 3BUXB 3GQIB 4FSSA 1I07A 1RLQC 1D4WA 4OHIA 2K3BA 1O4HA 1SHAA 3OB1B 5EELA 1BF5A 2DLZA 3ZNIA 2YT6A 2NWMA 1D1ZA 4JZ3A 1UG1A 2QMSA 1ZFPE 1U5SA 1NEBA 1YNZA 1YWOA 2NUZA 3PVQA 4X1VA 3RNJA 4RTWA 5L23A 1LCJA 2DLYA 5HKWA 2ECZA 4AFQC 2V1QA 5IBMA 1SHBA 2CI9A 3I9QA 1OO3A 2KR3A 3VS7A 2Y1NA 1CSKA 2LQNA 2HBWA 3U23A 2VWFA 4OMLA 5EG3B 1B3QA 2A08A 1CWDL 1X6GA 2D8HA 2DJQA 2H5KA 2RVFA 2JM8A 3CQTA 2B3OA 1X43A 2DL5A 4LNPA 2GTOA 1NRVA 2EW3A 4KRTA 3VS3A 1IO6A 1BHHB 1HJDA 3VRQA 1QWEA 2A28A 3UYOA 4Z8AA 2MC1A 1NZLA 2EQIA 4CC2A 4HVWA 2AKKA 1BK2A 1M61A 5GJVB 2O2OA 1O4NA 2DRMA 1WXBA 4LUEA 4A63B 2AOAA 1X27A 3C0CA 2C0IA 1BB9A 3CD3A 4EY0A 1JU5C 2CH4A 2HDXA 5EEQA 3HIZB 1JXOA 1ZUYA 1BFJA 4HXJA 1JYQA 2YUPA 2GE9A 3EAZA 4FL3A 1O4PA 1BHHA 2DVJA 2EGAA 1K76A 1LUMA 2LCTA 4P9VA 2C0OA 1QCFA 1QWFA 1UFFA 1PRMC 1JEGA 1FYRA 2KRNA 4M4ZA 1VYTA 4GBQA 5BO4A 3I35A 4QT7A 4RTVA 1AYCA 2FRYA 3VRYA 2EOBA 1AB2A 1WQUA 3VROA 4E93A 2ESWA 4D8DA 5EC7A 4D8KA 2GTJA 2CUBA 4NWGA 2ROLA 2MCNA 2LX7A 2M0YA 5EHPA 1ZLMA 1O41A 1U06A 2EYZA 1KFZA 3FJ5A 1G2BA 2L6KA 2LNWA 1O4CA 1GBQA 1TUCA 1UE9A 2FCIA 4JEGA 3PE0A 5CDWA 2PZ1A 1PICA 1R1QA 5I22A 2XP1A 1NEGA 1M3BA 3M0PA 1WIEA 1RPYA 1FHSA 1X0NA 2OI3A 3H0IA 3IN8A 3PJPA 2DRKA 2JM9A 2K6DA 5J3XA 2CUDA 1IJRA 4RTXA 3O5ZA 2DILA 3EG3A 4J9CA 3VS4A 1AZEA 4HVUA 2EO6A 1O46A 2RQVA 3VS1A 2MK2A 3PS5A 1QADA 4HVVA 4OMQA 2RORA 3JV3A 3EACA 1A1BA 4RTZA 1PKSA 1M3AA 5FWBA 3OB2B 2SEMA 2VVKA 2BZYA 1NG2A 3M7FA 1A1AA 2V1RA 4DGPA 2P4RA 1SHFA 2DA9A 2VIFA 3S8OA 1NYFA 2DYBA 5IHKA 1NLOC 2FPDA 2LNHB 4OHEA 2DX0A 1AVZC 2RQWA 2AUGA 4JJDA 3K2MA 1T0JA 3M0RA 1FU6A 1TZEE 2PTKA 5HKZA 3H41A 1FYNA 3REAB 2EVRA 2O9VA 4CC7A 1X6BA 1Y0MA 4CC4B 2FO0A 2CT3A 4F17A 2LQWA 2HDAA 1FU5A 1LUKA 3BUNB 5AXIA 1K1ZA 3RBBB 1UUSA 2MQIA 2DM0A 5DC0B 1KC2A 1WI7A 3VS5A 2OZOA 3TL0A 3BUWB 2K2MA 4OMPA 2EL8A 2C0TA 1NZVA 1BG1A 2PNAA 2SHPA 1PRLC 3US4A 1LKKA 2JMAA 3TSWA 3SHWA 2O31A 2QDLA 4AFUC 2HUWA 1SPRA 1WYXA 3N7YA 4AG1C 2W10A 4AFZC 1W1FA 4XZ0A 3VS2A 1O4MA 1PWTA 1O4QA 1H8KA 3VRNA 1IS0A 2CDTA 2OAWA 5I11A 1D4TA 3M0QA 1SSHA 1V1CA 5D0JA 2RNAA 3HHMB 2RPNA 2EU0A 1PHTA 1YP5A 4H34A 1AD5A 4TZIA 2JTEA 2L3PA 1MILA 2KNBB 4J9FA 1AWWA 1UHFA 2HSPA 4J9EA 4U17A 1UTIA 1O4EA 1O4AA 4F16A 4OMOA 1XA6A 1R1PA 2YDLA 3GXXA 2D1XA 1GFCA 1GRIA 2KGTA 4JGHA 1AYDA 2JXBA 2YUNA 1MV3A 2FEIA 1BMBA 1BLKA 2D0NA 5GJWB 1O4GA 1X6CA 3H0FA 2DL7A 1LUIA 2ECDA 1QKWA 1ZUKA 1O4KA 1M30A 3BUMB 4OHLA 3ZL7C 4QSYA 2HDVA 1MW4A 2HEQA 1LKLA 3VRRA 1N5ZA 2KT1A 4RTUA 1HD3A 2LP5A 1ARKA 1B47A 4RUGA 2FRWA 1OPKA 1A0NB 3N8MA 1O48A 1O43A 2DNUA 2K7AA 1HCSB 1JWOA 2L0AA 1ZSGA 1UJYA 3UA7A 2X3XD 1JU5A 1YVLA 3T04A 1HCTB 2YUOA 2IZVA 4CC3A 5I6VA 3C7IA 5IHNA 4GWFA 2GGRA 2BZ8A 4IIOA 2CT4A 1RUWA 1YCSB 2H8HA 3R6NA 5KAZA 1E6HA 4Y92A 3HCKA 2DL4A 1T3SA 2LZ6B 3VGOA 1A08A 2GBQA 4EIKA 1UGVA 1WXTA 5IXFA 4OHHA 1BLJA 2AZSA 1BHFA 2PNBA 5ECAA 3IN7A 1F2FA 2LCSA 3EHQA 3IQLA 1X69A 4R0KA 1AWOA 4DGXA 1UUEA 2L3TA 4JJBA 5HCKA 3KFJA 3EG0A 2LMJA 2DF6A 1O47A 3IMDA 2BTTA 3TSZA 2HMHA 1JO8A 1AWJA 1K9AA 3GBQA 1AOTF 1RQQC 1UURA 1H9OA 1GCPA 1S1NA 3H0HA 1JQQA 1NLPC 2AK5A 4HCKA 2CS0A 1GHUA 5DF6A 1UDLA 1Z9ZA 1VA7A 2DMOA 2E5KA 1O4BA 1RJAA 3BUOB 2Y3AB 3OVEA 1QLYA 1O4LA 5DC4A 1K4US 4K45A 2BBUA 1A07A 1UECA 1JYRA 1MV0B 5GJHA 4X6SA 4ROJA 2DL3A 4U1PA 3MAZA 1SHGA 2RQTA 1SEMA 4J9BA 2CREA 2OQ1A 2KNOA 4JJCA 2KEAA 1YWPA 4A4BA 2JMCA 2MRKA 1NYGA 3UA6A 3PSKA 1M8MA 4AG2C 1PNJA 1ABQA 1M3CA 1WXUA 4JPBW 3PLFB 1O4DA 1ZBJA 1BM2A 4K44A 2C9WA 1W6XA 4NWFA 1TUDA 2AOBA 1WFWA 2EBPA 3NPFA 2MOXA 3M0UA 2F2VA 2MIOA 1AWXA 1O4FA 2GQIA 1OO4A 3S9KA 4DEXA 2KRMA 5GJIA 3THKA 1GL5A 1YN8A 3N84A 4OMNA 1OOTA 2IUIA 5EHRA 1MUZA 2EYYA 1T3LA 2LJ3A 2MRJA 1EFNA 2J05A 1CKAA 3PFVA 4OHDA 2JW4A 4XZ1A 1SRMA 2JS0A 2EKHA 2J7IA 2CR4A 3IMJA 2PLDA 3NGPA 1F1WA 1OV3A 1UHCA 2EYVA 1RI9A 1T0HA 2CIAA 2K9GA 2PNIA 1K0XA 4JE4A 3S8NA 1SHDA 2HCKA 2IUHA 1TCEA 1O4OA 2ED1A 2KYBA 1AOUF 1WDXA 2L3QA 1AZGB 5DC9A 2RN8A 4Z88A 2CSQA 2LJ0A 1Z9QA 4E68A 1A1CA 2G6FX 1OPLA 3M0SA 1O42A 2CSIA 3PVLA 1LCKA 1QKXA 1JXMA 2FG0A 3EGUA 4LUDA 5IXBA 2K7AB 3EG1A 1KSWA 4ZNXA 2EKXA 1UJ0A 4L1BB 2BZXA 2RQRA 1ABOA 3TVTA 1BFIA 1I3ZA 1O4IA 3EG2A 4GLMA 1M27C 1H3HA 2J6FA 2D8JA 4EIHA 4K2RA 1WA7A 4WCIA 1M27A 2Y1MA 2CBLA 1Y1UA 2VKNA 4RTYA 3OP0A 1GCQC 1A09A 4J9DA 1AYAA 1GCQA 1SPKA 5HKYA 2XMFA 1GBRA 1LUNA 4IIMA 3PSJA 2AKLA 1O4JA 4K11A 2DBKA 2KT8A 5IH2A 1A1EA 3PQZA 2CH4W 1BU1A 2DLPA 2LJ1A 2O88A 1BBZA 1BKMA 4P9ZA 4OMMA 1FBZA 3REBB 3NHNA 2YU7A 3A98A 1KIKA 2JYQA 2CI8A 1VYUA 2FPEA 2F2XA 3QWYA 1CSZA 2KE9A 2RSYA 2DL8A 2I0NA 2GSBA 2A36A 2A37A 1E7OA 3VS0A 2RMXA 3UF4A 1FBVA 3NMZC 2ENMA 4E6RA 1QG1E 2ED0A 2H46E 3M0TA 4Z89A 1E6GA 1ZUUA 4FL2A 3VRZA 3OV1A 1SRLA 1Z3KA 1X2KA 1NM7A 1XOVA 3GXWA 2KRSA 3I5SA 1SKJA 1FMKA 2EGEA 2W0ZA 2L3SA 2IUGA 2ETZA 4DEYA 3VS6A 2EO3A 2GNCA 4RTTA 1WX6A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2DBMA 2DE0X 3V8JA 2EYXA 1VQ8A 1B07A 4Y28E 3J80E 2OJ2A 4F14A 2J6OA 4OB0B 1I1JA 5LJ3h 4H1OA 2KXDA 3X28B 2AZVA 3CXCS 1K9MR 3EG9B 1KA6A 3SEMA 3PMIA 3G71T 2PUOB 4F7UA 1VQ4T 1VQ5Q 1D1BA 1R1SA 3OYAA 1YHQQ 3S8LA 2K3XA 2BE9B 5IBSA 2LNXA 2PLEA 4LDXA 3UPUA 1MHNA 2RH2A 1MNDA 4E2FB 4J9IA 1TG0A 1VYVA 1WLPB 2RQUA 4LD6A 1A81A 2RI3A 4QVZA 1BKLA 1H92A 1JRIA 2CRHA 4C92E 4M7DF 3CXLA 1LOJA 5AT1B 4AFSC 4E7ZA 4II1A 3ZFJA 4EMGA 4IUPA 2LC4A 1VQNT 2CP3A 5LJ5j 3OW2A 3GIBA 2OTJT 2ROTA 1M4ZA 4C92D 1CSYA 1YJNQ 1JJ2S 2CP7A 2EYWA 1I0CA 4E7JA 4FSSA 5A2QE 2DK3A 4ZGJB 3QYGB 1TUGB 3OB1B 4CRIA 3CCVA 3P8BB 3F70A 5CKEA 3I55T 2FZCB 1NPRA 3JB9I 3CCQA 1NEBA 2DAQA 3CCEQ 1WPYA 1M1KR 3CPFA 4AFQC 2A3LA 2RHYA 1SHBA 1F1BB 5GAN2 3HRSA 2XI9A 3INZA 5EG3B 2VWFA 2F69A 1CWDL 2A08A 3E19A 2RVFA 2DJZA 3A8LB 1BCOA 2GTOA 3VS3A 2GCXA 1BHHB 3JB9D 3UYOA 4Z8AA 2EQIA 4CC2A 1RAHB 4N0AA 3SWNB 1BK2A 2DRMA 3C0CA 4QQ6A 2C0IA 4EY0A 2CZ0B 3HIZB 3QBYA 3MEUA 4N4GA 1ZUYA 5J39A 1VQ5T 1JYQA 2YUPA 2GE9A 4KH1B 2A7YA 3EAZA 1YHQT 4C8QC 2LCTA 3EH1A 3FB9A 3I56A 3D7SB 5LJ3d 3I35A 5BO4A 2M9UA 1JB0E 1AB2A 3JB9J 4FYYB 3O8VA 1M2VA 4NWGA 2ROLA 2V26A 2KSSA 1O41A 1UE9A 2FCIA 3PE0A 3OYGA 3BE3A 1I5OB 1P92A 2E12A 1NEGA 3L2VA 3M0PA 3X20B 4C92F 1RPYA 2OI3A 3H0IA 1YJNT 3IN8A 2DYIA 5J3XA 1ZA1B 1IJRA 4RTXA 3EG3A 1AZEA 3LGLA 3VS1A 2JOYA 3PS5A 3OYBA 2QEXA 2P0KA 3MP8A 3EACA 1A1BA 5CKHA 4M7DA 2F5TX 4FYWB 3CCET 2O01E 2HL3A 3M7FA 5HK0A 1A1AA 2V1RA 3M57A 5GAOm 2RJDA 4BD3A 4PJJA 5IHKA 1NLOC 2FPDA 1T0JA 3M0RA 1FU6A 1TZEE 2PTKA 3EFOB 4CC7A 4F17A 1Y0MA 2FZGB 4GY5A 2FZKB 3JB9F 1Y96A 2BKDN 1M90U 4XU3A 1KC2A 4JS4A 3KXTA 4OMPA 2C0TA 1BIBA 1K8AU 2H3JA 1PRLC 1LKKA 2JMAA 3OMGA 5GAOl 3GNFB 1VQPA 3SHWA 4MZTA 2QDLA 4AFUC 3N7YA 1Y71A 4AG1C 2YLCA 2O4XA 2EJGA 3VRNA 3LH0A 5GAN7 2Y90A 2CDTA 2OAWA 1D4TA 3VKIA 2CP0A 3X24B 2ZPGB 2EU0A 1N6AA 3RDVA 2G3RA 1AD5A 4YTLA 2KNBB 3EGDA 1KQ1A 4M7AC 5FU6C 3SFMA 1O4EA 2P4TA 4OMOA 4ELZC 2MMPA 3GXXA 2D1XA 1GFCA 1GRIA 5A0DA 3G71A 3HL8A 1X6CA 1LUIA 1VQ4A 2BE7D 3RERA 4RKUE 3SDZA 3M56A 3VRRA 1Q7YU 2LT1A 5CR2A 4RTUA 1U1TA 2M02A 4RG8A 2DNUA 2K7AA 1HCSB 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
 2DX1 A;  1OEB A;  2DBM A;  2L4K A;  3KFV A;  2DE0 X;  4FBN A;  2JS2 A;  2KXC A;  4ESR A;  2EYX A;  1W70 A;  1K0S A;  1X2Q A;  1B07 A;  1CKB A;  2YSQ A;  1O44 A;  2OJ2 A;  1AYB A;  4F14 A;  2J6O A;  2B86 A;  2KYM A;  2KRO A;  3ULR B;  1Y57 A;  1GFD A;  3BKB A;  4F5A A;  2DCR A;  3CWG A;  4GL9 E;  1I1J A;  2YUQ A;  5IHI A;  1JYU A;  1O4R A;  1U3O A;  4H1O A;  1HSQ A;  2ABL A;  2KXD A;  2AZV A;  1SPS A;  2FPF A;  1J3T A;  2KBT A;  1KA6 A;  5FWC A;  3SEM A;  3MXY A;  1AOJ A;  1YVH A;  1P13 A;  1KA7 A;  2K79 B;  5AUL A;  1O45 A;  1RLP C;  3LH5 A;  2O9S A;  1G83 A;  1R1S A;  2DM1 A;  1PKT A;  3S8L A;  5FW9 A;  4F59 A;  2EPD A;  5IBS A;  4J9H A;  2LNX A;  2PLE A;  1KJW A;  3WA4 A;  3CBL A;  4GPL B;  2JT4 A;  4LN2 A;  4J9I A;  1TG0 A;  1VYV A;  1WLP B;  4A4C A;  2RQU A;  2EGC A;  1A81 A;  4F5B A;  2J06 A;  1AEY A;  3VRP A;  1BKL A;  3MXC A;  4J9G A;  1H92 A;  4JZ4 A;  2CRH A;  1ZX6 A;  3I5R A;  3CXL A;  4ORZ A;  2K79 A;  4AFS C;  1CJ1 A;  1O49 A;  2IIM A;  3UAT A;  4LE9 A;  2F2W A;  2KK6 A;  1CWE A; 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