2AW1A

Carbonic anhydrase inhibitors: valdecoxib binds to a different active site region of the human isoform ii as compared to the structurally related cyclooxygenase ii "selective" inhibitor celecoxib
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Carbonic anhydrase II
publication title Carbonic anhydrase inhibitors: Valdecoxib binds to a different active site region of the human isoform II as compared to the structurally related cyclooxygenase II
pubmed doi rcsb
total genus 75
structure length 257
sequence length 257
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2005-08-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 2aw1A00
4WW8A 3OYSA 3PJJA 4FIKA 4KNNA 2X7UA 1G0FA 5FNKA 1UGDA 5DVXA 1H9NA 3KIGA 3L14A 4FVOA 3T84A 4BF6A 4Q07A 1TBTX 3M2NA 5FNGA 3F4XA 1BN1A 2NNSA 2NNVA 1G3ZA 1MUAA 3NB5A 3P4VA 4E3HA 5SZ4A 3T83A 2OSMA 3QYKA 5FLOA 3K34A 5JDVB 5DRSA 5DSPA 1BNWA 3S72B 2H4NA 3BETA 4QSAA 3HFPA 4QSBA 4YWPA 3S71B 4E4AA 3F7UA 5AMLA 3S97A 1CA3A 4RUZA 5FNLA 5FLTA 4QK1A 5G0CA 5BRVA 3S74B 3CYUA 1F2WA 4C3TA 2GEHA 2NN1A 4HT2A 4G7AA 3HKTA 4PQ7A 4Q06A 4YGFA 1UGAA 5G0BA 3DCSA 1IF9A 4Z1KA 3JXGA 5E5UA 2CBBA 3IBLA 4FL7A 1RJ6A 1ZH9A 1BNNA 3S75B 4Q8ZA 3FE4A 5JG3B 1CILA 3HLJA 3N0NA 1CNYA 4ILXA 3M2XA 4MLXA 4E9OX 4YXOA 1BZMA 1CANA 1HEBA 3DC3A 1UGGA 4E3DA 4KNIA 2NWPA 4RUXA 3HKQA 5EKMA 1BV3A 1RZBA 1RZDA 1CNBA 5JESB 4QJXA 12CAA 4YGLA 4E5QA 3Q31A 5BNLA 1RAYA 4QSJA 1EOUA 4RN4A 1ZGFA 5E2RA 1TEQX 4N0XB 5EKJA 5DSMA 1FLJA 1KOPA 1I9MA 3MNJA 3V3IB 5FDIA 4Q81A 3M14A 4YXIA 3N3JA 1G46A 3SBHA 3KOIA 2CABA 1UGCA 4L5WA 1BNVA 3V3JA 1CNCA 1IF6A 3M67A 5SZ5A 3R17B 4K1QA 1DMXA 5DOGA 1YDDA 4LHIA 4YVYA 5EHVA 1ZSCA 4Q99A 3V3FA 5HPJA 4Q0LA 2IT4A 5EHWA 1ZNCA 3TVNX 2HFWA 2FNMA 5E28A 4L5VA 3CZVA 4HT0A 1TG3A 3MWOA 4Z1JA 4CACA 3S76A 2GD8A 2NWZA 4HBAA 4R59A 4ETQC 1DMYA 3UYQA 4Q7PA 3JXFA 1FQLA 3HKUA 4M2UA 3V3HB 1OQ5A 3KONA 3CAJA 4XE1A 3KKXA 2POWA 1DCBA 4CNVA 3RYZA 1CAIA 3ZP9A 4R5AA 4N16A 3P58A 4KUWA 3MYQA 5FNIA 3U3AX 2FOSA 3EFTA 5DSIA 1I9NA 1G45A 2WEGA 2ZNCA 3MNIA 3F7BA 1I90A 4HEWA 4QTLA 1LG6A 4QJPA 5SZ0A 1LUGA 4K13A 5JQ0A 1CVCA 2FNKA 3ML2A 1LGDA 3DAZA 5FNJA 9CA2A 2NN7A 2ILIA 3B4FA 3CA2A 3K7KA 1G1DA 2AX2A 2W2JA 3BL1A 3SBIA 3D0NA 2FOYA 4YGJA 4ZAOA 3DCCA 3KS3A 4KV0A 3M5SA 5E2MA 2WEOA 4PZHA 1FQRA 3D92A 4QJOA 3RYVB 5FNMA 4QJ0A 5CACA 3M96A 1KOQA 1RJ5A 3MHCA 1RZCA 1UGBA 3MHOA 3DCWA 1ZE8A 1IF7A 1TH9A 1CZMA 5SZ2A 2Q38A 4M2VA 4HF3A 2WEJA 4WR7A 1HEDA 4Q90A 3EFIA 5JEPB 1ZSAA 3V2JA 4DZ9A 4Q49A 1CVFA 2EU2A 3P5AA 4IDRX 4RIVA 3W6HA 4RFDA 4JSWA 3ML5A 3M98A 5L6KA 2WEHA 3MMFA 1TB0X 3S78B 4COQA 1OKLA 2CBDA 3NJ9A 1CNWA 5DSOA 3DVDA 3M2YA 4YX4A 3SAPA 4YXUA 3MNUA 1CNKA 3M1QA 3VBDA 2FMZA 1XQ0A 4LU3A 5SZ6A 5L3OA 3S73B 4BCWA 4Q6EA 5AMGA 4R5BA 3V7XA 3V5GA 1RZAA 4ZWYA 2HNCA 3RYYA 1T9NA 3DBUA 4K0ZA 1G48A 1JD0A 1THKA 3PO6A 1FQNA 4KUYA 1CNHA 5BRUA 2NWOA 3DD0A 4KP8A 1URTA 4QIZA 2Q1QA 2POVA 4WW6A 1JV0A 1I9LA 2FOVA 3P3HA 5SZ7A 1UGFA 4WUPA 2O4ZA 4QY3A 5DSRA 1RAZA 1HUHA 1LG5A 1YO2A 4QSIA 1TE3X 5JEHB 3T85A 1CAMA 4CNWA 3MZCA 1KEQA 2FMGA 3DVBA 5BYIA 3MNHA 4Z0QA 7CA2A 1AZMA 3RYXB 1Z9YA 2X7SA 4XFWA 4MLTA 2CA2A 3GZ0A 4IWZA 3U7CA 1TEUX 3OIKA 3ZNCA 1V9EA 4FU5A 3NI5A 1FQMA 1Z97A 4YGNA 1CAZA 2QP6A 1MOOA 4WUQA 3C7PA 1CNJA 3M1WA 3KOKA 3RGEA 4HEYA 1YDAA 3D9ZA 4JSAA 4ZWZA 3S8XA 5E5RA 1YDCA 2HKKA 1CALA 4Q08A 3RZ0B 5DSLA 5FL4A 3S77B 1LZVA 3S9TA 5LMDA 4ZX0A 5AMDA 1FSQA 1XEGA 4QK2A 4HEZA 4Q9YA 4WL4A 4E49A 5C8IA 4XIWA 8CA2A 2HOCA 1CNGA 1BNQA 1CVDA 1G4OA 3U47A 5JGTB 3MHMA 1CVEA 1DCAA 3P3JA 1ZGEA 3IAIA 2NNGA 4RH2A 1XEVA 3M5TA 1I8ZA 1AM6A 3RJ7A 5BRWA 1BCDA 1BNTA 5G03A 4JSZA 1UGEA 1G52A 3PYKA 5FL6A 3M2ZA 1BN4A 4X5SA 3P44A 2HL4A 2NMXA 1G6VA 1CA2A 3D8WA 1H4NA 3OYQA 5J8ZA 4FVNA 4QIYA 1G0EA 4UOVA 4PYXA 1JCZA 3DA2A 1CRAA 2FOQA 4QK3A 4Q7WA 5EZTX 3DC9A 4QJWA 2Q1BA 3W6IA 2X7TA 1BN3A 1CAJA 3SAXA 1HECA 5SZ1A 3UYNA 1YO0A 3RYJB 4Q7SA 4Q83A 4M2WA 5CJFA 3OKUA 2NXSA 3P55A 1Z93A 1BNUA 3FFPX 5JQTA 2OSFA 3M1JA 3RG3A 2F14A 3M04A 1HEAA 1ZSBA 2VVAX 2QO8A 3HS4A 5A6HA 5EH8A 3RG4A 1G53A 2EZ7A 4JS6A 1Y7WA 5FLRA 4ITOA 5CA2A 5DSJA 3MNAA 4QEFA 3M1KA 3BL0A 3IBNA 5JGSB 3IGPA 3JXHC 4RFCA 3R16A 3K2FA 1BNMA 1FR4A 4MDGA 4ZWIA 4ZX1A 3V2MA 4CQ0A 2FOUA 5JEGB 5E2KA 3RZ8A 1CVHA 4FRCA 4LP6A 1CCUA 3OKVA 1XPZA 5FL5A 3TVOX 4KNJA 2AW1A 4Y0JA 5IPZA 4YHAA 2HD6A 5FLPA 4Q78A 4CA2A 1HCBA 1CVAA 3IEOA 4L5UA 1FSNA 5DOHA 4XIXA 4KAPA 5EKHA 1CNXA 1FR7A 1G4JA 3RZ1B 5JG5B 3RZ5A 5DSQA 1HVAA 3OY0A 5SZ3A 3TMJA 2WD3A 3FW3A 1I9OA 2CBAA 3M3XA 4YYTA 4K0TA 4E3GA 2CBEA 2EU3A 5FLSA 4KUVA 4Q7VA 1OKMA 3MHLA 3T5ZA 3DV7A 3KNEA 3N2PA 1V9IC 5EH7A 3V3GB 4BF1A 1J9WA 3KWAA 1CAOA 4TWLA 3OIMA 1HUGA 3F8EA 1CAHA 1CAYA 4KP5A 4MO8A 4PXXA 4MDMA 4DZ7A 3HKNA 5A25A 5E2SA 1YDBA 1H9QA 1CCTA 1IF5A 1BICA 1I91A 4Q87A 2FNNA 3IBIA 1AVNA 4M2RA 4YGKA 1YO1A 4Q8YA 4Q09A 1CIMA 4QJMA 2H15A 5CLUA 1ZFQA 3RZ7A 4G0CA 1TG9A 4Z1EA 4TWMA 1CRMA 5EIJA 4MTYA 2ABEA 2NNOA 1KWQA 4PYYA 4Q6DA 4RIUA 2NXTA 4ITPA 4MDLA 3MHIA 3LXEA 3KLDB 1TTMA 6CA2A 1HCAA 4ZWXA 3DD8A 3T82A 1G54A 3DVCA 1CNIA 2FW4A 3U45X 5G01A 2NXRA 3MNKA 3N4BA 3OILA 1CINA 4K0SA 2NWYA 1CCSA 1CAKA 4JSSA 1IF4A 5FLQA 2WD2A 5EH5A 3P5LA 1IF8A 4CNRA 4HU1A 2VVBX 1A42A 1I9QA 5EHEA 5FNHA 1CVBA 4CNXA 4GL1X 4XZ5A 2CBCA 3RLDA 4E3FA 4Q8XA 4Z1NA 1OKNA 5DSNA 3M40A 5DSKA 4RUYA 1FSRA 1ZFKA 4FPTA 1I9PA 2QOAA 3IBUA 2POUA 5FDCA 5E2NA 3T5UA 3D93A 3MDZA 4KNMA 3M5EA 1KWRA 3B1BA 5EOIA 1RZEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4WW8 A;  3OYS A;  3PJJ A;  4FIK A;  4KNN A;  2X7U A;  1G0F A;  5FNK A;  1UGD A;  5DVX A;  1H9N A;  3KIG A;  3L14 A;  4FVO A;  3T84 A;  4BF6 A;  4Q07 A;  1TBT X;  3M2N A;  5FNG A;  3F4X A;  1BN1 A;  2NNS A;  2NNV A;  1G3Z A;  1MUA A;  3NB5 A;  3P4V A;  4E3H A;  5SZ4 A;  3T83 A;  2OSM A;  3QYK A;  5FLO A;  3K34 A;  5JDV B;  5DRS A;  5DSP A;  1BNW A;  3S72 B;  2H4N A;  3BET A;  4QSA A;  3HFP A;  4QSB A;  4YWP A;  3S71 B;  4E4A A;  3F7U A;  5AML A;  3S97 A;  1CA3 A;  4RUZ A;  5FNL A;  5FLT A;  4QK1 A;  5G0C A;  5BRV A;  3S74 B;  3CYU A;  1F2W A;  4C3T A;  2GEH A;  2NN1 A;  4HT2 A;  4G7A A;  3HKT A;  4PQ7 A;  4Q06 A;  4YGF A;  1UGA A;  5G0B A;  3DCS A;  1IF9 A;  4Z1K A;  3JXG A;  5E5U A;  2CBB A;  3IBL A;  4FL7 A;  1RJ6 A;  1ZH9 A;  1BNN A;  3S75 B;  4Q8Z A;  3FE4 A;  5JG3 B;  1CIL A;  3HLJ A;  3N0N A;  1CNY A;  4ILX A;  3M2X A;  4MLX A;  4E9O X;  4YXO A;  1BZM A;  1CAN A;  1HEB A;  3DC3 A;  1UGG A;  4E3D A;  4KNI A;  2NWP A;  4RUX A;  3HKQ A;  5EKM A;  1BV3 A;  1RZB A;  1RZD A;  1CNB A;  5JES B; 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