2AX2A

Production and x-ray crystallographic analysis of fully deuterated human carbonic anhydrase ii
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Carbonic anhydrase II
publication title Production and X-ray crystallographic analysis of fully deuterated human carbonic anhydrase II.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 77
structure length 258
sequence length 258
other databases KnotProt 2.0: K +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2005-09-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 2ax2A00
3IEOA 3S72B 1FR4A 4X5SA 3HLJA 1CAZA 1G0EA 1FQLA 3OKVA 5JGSB 3PYKA 2FW4A 1FSQA 2FOVA 2NXSA 5DSOA 3U45X 4DZ9A 5E5UA 4E9OX 3RYVB 1TB0X 3M14A 4RUYA 5FL5A 2ABEA 4MO8A 2OSFA 5DSNA 3MDZA 3IBIA 1CNGA 3N0NA 5E2MA 3ZNCA 4HU1A 4JSWA 4QEFA 3MNHA 4YXUA 3DAZA 1ZSAA 2X7SA 4Z0QA 3KKXA 3V2JA 3OILA 4XFWA 4Q49A 4KUVA 5DRSA 1FSRA 2Q38A 4ETQC 1G53A 4LP6A 3R16A 4YWPA 5FL4A 4QIZA 4QSIA 4YGNA 1A42A 1G4OA 4Y0JA 4CNRA 5LMDA 1JCZA 3S9TA 3S76A 3ML2A 5DVXA 4CQ0A 3MHMA 3W6IA 4QJOA 2CBEA 5EH8A 3V2MA 1LGDA 3CYUA 5DSQA 3M1JA 3U3AX 1DCBA 3KNEA 5FDCA 3VBDA 4ITOA 4COQA 1TEQX 1CRAA 4Q7PA 5EOIA 1CNIA 4K0ZA 5EHWA 3RYZA 4Q99A 3W6HA 3L14A 1BNQA 1CAOA 4RN4A 1LUGA 1HUGA 2FMGA 4IDRX 5E2RA 1JV0A 5FLTA 5DOHA 1CINA 5JEPB 3DCWA 3S97A 4ZWZA 5DSJA 1YO1A 1XQ0A 3EFTA 1CCUA 3M1KA 4ZWXA 4Z1JA 1CVFA 2H15A 3DVDA 5FNMA 1CNYA 3RZ0B 1H9QA 5SZ4A 1IF7A 4K13A 3RG3A 3RYYA 3DD0A 4Z1KA 1HUHA 3P5LA 4PQ7A 4KP5A 3S74B 3KOIA 4G0CA 5JEHB 5G0BA 1CCSA 1URTA 2NWYA 3D92A 3MNKA 3SAPA 2NNOA 1G0FA 1YDBA 5FLOA 3IGPA 3TMJA 4QJXA 1DMYA 1I9PA 4N0XB 2FNKA 2VVBX 2NXRA 3MNIA 1UGDA 3KS3A 4QK1A 5JESB 1J9WA 1CNHA 3OYSA 8CA2A 4QJ0A 4GL1X 3P55A 3T5ZA 4WW8A 5EIJA 1CAMA 3RYXB 3M3XA 4Q07A 1I9QA 1AM6A 1KEQA 1CVBA 4K0TA 4K1QA 3TVOX 1BCDA 3MYQA 3ML5A 3SAXA 2POVA 4KUYA 2IT4A 3M1WA 3MNAA 1UGEA 4RIUA 1TEUX 3PO6A 4QIYA 4JS6A 3F8EA 3F7BA 1MUAA 4CACA 1TH9A 1CANA 3D93A 4YGKA 2EU3A 3CZVA 4QJPA 2FOYA 3MNUA 5SZ1A 1ZGEA 4Q08A 3CAJA 4E5QA 3DVCA 1YDDA 5FL6A 5JDVB 2X7TA 3PJJA 2CBBA 4HEYA 3OIMA 4Z1NA 4ITPA 3M2ZA 4E3HA 1LG5A 2GD8A 1UGCA 1G48A 4Q7WA 1HCBA 3HKUA 4UOVA 1CAYA 1OKMA 1RZDA 5CJFA 3SBHA 1TG9A 3ZP9A 3OY0A 2FNNA 4E49A 5JQTA 4RFCA 3MHLA 3T85A 4MDLA 2WEOA 4Q78A 1XEGA 5EHVA 3DCCA 4KAPA 4Q6DA 1FLJA 1CALA 4BF6A 3P4VA 1Z9YA 3U7CA 3M2XA 1YDCA 1CIMA 1KWQA 3NI5A 4TWMA 3MWOA 1CVHA 4M2RA 2HD6A 5BRWA 1RAYA 3RYJB 1V9EA 4ZWIA 1CAKA 3S73B 5JEGB 3V3FA 4R59A 1KOPA 3V5GA 1HVAA 5FNKA 2WEGA 3KIGA 5DSMA 5DSKA 5A25A 3IBUA 5EH7A 1I9NA 4RH2A 4PYXA 1HCAA 4XIWA 2CABA 3FW3A 4MDMA 1BNNA 1AZMA 4FIKA 3RZ5A 2HFWA 3LXEA 5DSRA 1DCAA 1BNUA 3F7UA 3FE4A 5EHEA 3IAIA 2FOSA 3RGEA 4FL7A 4PXXA 2QO8A 1I90A 4YX4A 1JD0A 4PZHA 3RLDA 2NNSA 2WEHA 3P3HA 3N2PA 5AMDA 3N4BA 4MTYA 1Z97A 2CBAA 5E2SA 4M2VA 2QOAA 3JXGA 3MHIA 4Q8ZA 1YO2A 3S78B 1CAHA 4Z1EA 5E2NA 2EU2A 3SBIA 1OKLA 5EKJA 5EZTX 2FNMA 4KNMA 2NXTA 4E4AA 1ZE8A 4RFDA 4MLXA 5EH5A 1RZBA 4WR7A 3BL1A 4QSAA 1BNTA 1CA2A 3T82A 4YGFA 3MHOA 2NWZA 5DOGA 4RUXA 2OSMA 1OQ5A 1CAJA 3V3HB 2WEJA 3P44A 3C7PA 3B4FA 1I91A 1G45A 1YO0A 3M1QA 1T9NA 1CRMA 3UYQA 3TVNX 4Q83A 2HL4A 4IWZA 1UGFA 1THKA 2O4ZA 4LU3A 3M5SA 4YYTA 3M67A 4RIVA 3K7KA 3JXHC 4CNVA 3RZ8A 3V3IB 4JSSA 4QJWA 1LZVA 2NMXA 4HBAA 4WL4A 5A6HA 5JGTB 2ILIA 4QK2A 1HEDA 5SZ0A 4QSJA 1IF6A 5HPJA 3M5EA 3KWAA 4WW6A 2HKKA 3P5AA 4QTLA 5JG5B 5CACA 3S8XA 2NN1A 1FR7A 2POUA 1FQMA 4HT2A 4CNWA 2QP6A 1UGGA 1I8ZA 4MLTA 5FNIA 3JXFA 1TE3X 4N16A 1RJ6A 4RUZA 5E28A 5E5RA 5FNJA 5FLSA 2W2JA 5L3OA 3DC3A 3M2NA 3DD8A 1TBTX 2NWOA 3UYNA 1F2WA 4ZWYA 3K34A 1IF4A 1XPZA 3HKQA 3GZ0A 5EKHA 5DSPA 1CA3A 4L5VA 2H4NA 4QSBA 3S77B 3DCSA 5SZ2A 3OKUA 1BZMA 1G3ZA 1KOQA 3HKNA 3HS4A 1ZSBA 1UGBA 2AX2A 1BNMA 1FQNA 3EFIA 5BYIA 6CA2A 4FRCA 1ZSCA 4XZ5A 5DSIA 2HOCA 1HEAA 1I9OA 4KP8A 5EKMA 4YGLA 1UGAA 4YGJA 1CNCA 4KNJA 1RAZA 1CNJA 3F4XA 1H4NA 4C3TA 3DVBA 1ZH9A 4KV0A 5FNHA 1G4JA 4Q90A 1G6VA 5AMLA 3FFPX 5SZ5A 2NN7A 4G7AA 4R5AA 3Q31A 1TTMA 1CVEA 4FPTA 4CNXA 4XE1A 3V3GB 4Q7VA 1RZCA 5SZ3A 3B1BA 3MMFA 1H9NA 1KWRA 4Q06A 5BRVA 3BETA 1CZMA 3M98A 3N3JA 3P58A 3QYKA 4Q7SA 4YXIA 2NNVA 5JQ0A 3HKTA 5FDIA 5FNLA 5G0CA 5FLPA 3DV7A 1IF8A 3NB5A 2GEHA 4KNNA 1G54A 4DZ7A 5SZ6A 4PYYA 3M04A 1G1DA 3D8WA 3K2FA 5DSLA 1XEVA 4Q8YA 5JG3B 3DC9A 1Y7WA 3MNJA 2FOUA 5CA2A 1CCTA 3NJ9A 2FMZA 4YHAA 4QK3A 5FLQA 1IF5A 3DA2A 5FNGA 2WD3A 4Q8XA 1OKNA 1CNXA 2CBCA 4ILXA 4Q81A 1TG3A 1CNWA 1ZFQA 3S75B 1G52A 2NNGA 4HEWA 4Q6EA 4TWLA 5AMGA 1RZAA 2NWPA 3KOKA 4HF3A 1BV3A 3S71B 4Q09A 4E3FA 4QY3A 1BNWA 1BN4A 5J8ZA 3V7XA 4E3DA 9CA2A 1FQRA 4HEZA 2ZNCA 3KLDB 4M2WA 2CA2A 2POWA 5G01A 3P3JA 4WUPA 3T84A 3CA2A 1IF9A 5FLRA 2X7UA 4E3GA 5G03A 3D0NA 4QJMA 1BNVA 1CVCA 5L6KA 1V9IC 1RZEA 4R5BA 1ZFKA 4CA2A 5BNLA 4HT0A 5BRUA 2VVAX 3HFPA 2EZ7A 4K0SA 3M5TA 4XIXA 1LG6A 3D9ZA 1CILA 1BN3A 3IBLA 5CLUA 5C8IA 4FVOA 4LHIA 3U47A 2Q1QA 4ZAOA 2Q1BA 1I9LA 1ZGFA 4L5WA 5SZ7A 4ZX0A 1HEBA 2AW1A 4ZX1A 4JSAA 4Q87A 4YVYA 3DBUA 4BCWA 3M2YA 4FU5A 1G46A 1AVNA 1CNBA 12CAA 4KUWA 1FSNA 1CNKA 1I9MA 7CA2A 3IBNA 1CAIA 2WD2A 3T5UA 1DMXA 4FVNA 5IPZA 4L5UA 1EOUA 2F14A 4MDGA 4Q0LA 1MOOA 1YDAA 3OIKA 3R17B 3RZ7A 3MHCA 3RG4A 4M2UA 4YXOA 3BL0A 1RJ5A 1CVDA 4BF1A 3RJ7A 4JSZA 3V3JA 4KNIA 4WUQA 1CVAA 1Z93A 4Q9YA 1BICA 3MZCA 1ZNCA 3T83A 3M96A 3M40A 5E2KA 2FOQA 1HECA 2HNCA 3KONA 1BN1A 3OYQA 3RZ1B 2CBDA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3IEO A;  3S72 B;  1FR4 A;  4X5S A;  3HLJ A;  1CAZ A;  1G0E A;  1FQL A;  3OKV A;  5JGS B;  3PYK A;  2FW4 A;  1FSQ A;  2FOV A;  2NXS A;  5DSO A;  3U45 X;  4DZ9 A;  5E5U A;  4E9O X;  3RYV B;  1TB0 X;  3M14 A;  4RUY A;  5FL5 A;  2ABE A;  4MO8 A;  2OSF A;  5DSN A;  3MDZ A;  3IBI A;  1CNG A;  3N0N A;  5E2M A;  3ZNC A;  4HU1 A;  4JSW A;  4QEF A;  3MNH A;  4YXU A;  3DAZ A;  1ZSA A;  2X7S A;  4Z0Q A;  3KKX A;  3V2J A;  3OIL A;  4XFW A;  4Q49 A;  4KUV A;  5DRS A;  1FSR A;  2Q38 A;  4ETQ C;  1G53 A;  4LP6 A;  3R16 A;  4YWP A;  5FL4 A;  4QIZ A;  4QSI A;  4YGN A;  1A42 A;  1G4O A;  4Y0J A;  4CNR A;  5LMD A;  1JCZ A;  3S9T A;  3S76 A;  3ML2 A;  5DVX A;  4CQ0 A;  3MHM A;  3W6I A;  4QJO A;  2CBE A;  5EH8 A;  3V2M A;  1LGD A;  3CYU A;  5DSQ A;  3M1J A;  3U3A X;  1DCB A;  3KNE A;  5FDC A;  3VBD A;  4ITO A;  4COQ A;  1TEQ X;  1CRA A;  4Q7P A;  5EOI A;  1CNI A;  4K0Z A;  5EHW A;  3RYZ A;  4Q99 A;  3W6H A;  3L14 A;  1BNQ A;  1CAO A;  4RN4 A;  1LUG A;  1HUG A;  2FMG A;  4IDR X;  5E2R A;  1JV0 A;  5FLT A;  5DOH A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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