2B7NA

Crystal structure of quinolinic acid phosphoribosyltransferase from helicobacter pylori
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
273
structure length
273
Chain Sequence
MEIRTFLERALKEDLGHGDLFERVLEKDFKATAFVRAKQEGVFSGEKYALELLEMTGIECVQTIKDKERFKPKDALMEIRGDFSMLLKVERTLLNLLQHSSGIATLTSRFVEALNSHKVRLLDTRKTRPLLRIFEKYSVLNGGASNHRLGLDDALMLKDTHLRHVKDLKSFLTHARKNLPFTAKIEIECESFEEAKNAMNAGADIVMCDNLSVLETKEIAAYRDAHYPFVLLEASGNISLESINAYAKSGVDAISVGALIHQATFIDMHMKMA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Probable nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase
publication title Crystal structure of quinolinic acid phosphoribosyltransferase from Helicobacter pylori
pubmed doi rcsb
source organism Helicobacter pylori
total genus 88
structure length 273
sequence length 273
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 2.4.2.19: Nicotinate-nucleotide diphosphorylase (carboxylating).
pdb deposition date 2005-10-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01729 QRPTase_C Quinolinate phosphoribosyl transferase, C-terminal domain
A PF02749 QRPTase_N Quinolinate phosphoribosyl transferase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2b7nA02
3.90.1170.20 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Aldehyde Oxidoreductase; domain 3 Quinolinate phosphoribosyl transferase, N-terminal domain 2b7nA01
2E1DA 1VH7A 2DP3A 4N9BA 2WO5A 5CZ0A 3MO7A 1VZWA 1TO3A 2ZA1A 3NQ6A 3RNDA 4X22A 1XDMA 5LGZA 3SI9A 3HIJA 4N6EA 2YGYA 1W8SA 4YLWA 3FEMA 3R89A 1I45A 1JUBA 1S3HA 2BX7A 1QOQA 2CU0A 1MEIA 2QDHA 5AYXA 1B4EA 3B4UA 1VHNA 2QJHA 5U7SA 3W7PA 2Y63A 1FDYA 3WK2A 2CLOA 4M6QA 4KFPA 1SO6A 3FJLA 1UJPA 1FBAA 1OJXA 1ICSA 2WJZA 4O53A 1QPOA 4Y6GA 1RV8A 1SW3A 4LRTA 4NZFA 3P80A 4UTWC 1P1XA 3FOKA 4N9CA 5G2IA 2Z6IA 1TJRA 1JRBA 5BRBA 1M5WA 4JY9A 2DU2A 3OEXA 1JCYA 4FNRA 4QISA 3KVKA 4AHQA 5E0KA 2ZZ2A 5EMUA 5EYWA 2E5CA 1PHWA 4BWLA 1MSSA 1OX4A 3R2GA 3O6CA 3W75A 3K30A 1KLZA 3A5FA 3G8RA 3A21A 4FIQA 4N9DA 4M5PA 4R33A 3PSWA 1FDJA 2YFOA 3NM1A 3QF0A 2FJKA 2C19A 4ZQMA 3W1QA 3N9RA 1PCWA 4ZQPA 3QPZA 5HULA 2VEIA 3KHJA 3G3DA 2C6QA 4BWLC 5EA9A 1NFBA 1MO0A 3B05A 1QDSA 2YX0A 3QJAA 1QFEA 2Y7FA 3ZS4A 4CQAA 3L0GA 3G8EA 3WJSA 3LTPA 3GAYA 3QMTA 1R2TA 5G2WA 3BG3A 3DI0A 1JR1A 4P61A 1R47A 3Q37A 4I7UA 3NL6A 1W3NA 2ZTJA 4O52A 4UIOA 1WBHA 3SW6A 1ZFJA 3GDKA 3QW4B 1T0OA 4JX4A 5DLCA 4RXFA 4B5NA 1ZAIA 2VFEA 4JYDA 3GKAA 1SU5A 4A22A 4MYAA 3KVJA 3IIPA 1TTJA 4DQWA 3GXNA 1HUVA 2RKXA 4JYEA 3TC6A 1GJPA 2OJPA 4XWUA 1KW1A 1UUOA 2GQ9A 3S6DA 2DZWA 2G96A 4FHAA 2NX3A 3P62A 4HT3A 3PBVA 4NJKA 3RMJA 2YR1A 4PL2A 4N2YA 1KM1A 1WX0A 1KM6A 3TV8A 4K8HA 3A23A 1I2QA 4WOQA 3KRZA 4UTTA 3IEBA 2ZZ3A 3EX1A 1DJQA 3B06A 5CPNA 5DBTA 1O4UA 2QCEA 1QPNA 4ICNA 4TR9A 4QITA 2FTPA 1F5ZA 4O15A 1LBMA 4QNEA 5L9FA 3LI0A 3BPWA 3QMRA 4JR5A 1P0NA 3MBDA 4FNTA 1FDZA 5D32A 4JX5A 5CKSA 3S5ZA 3W1XA 2AGKA 3I68A 5GVJA 3DI1A 3L21A 3PF3A 3KXQA 3W2JA 3WK0A 3HGRA 1W3IA 3ABRA 2A7PA 3F03K 1GG1A 4IJBA 1K3UA 3W7CA 4DBDA 1L6WA 2OCZA 4MY9A 5FI8A 4AMAA 5CSSA 5TIMA 3PAJA 3CLMA 1YDVA 3W23A 1LZOA 3BG9A 3GVGA 4O50A 5CZSA 1SSGA 3UXAA 5AC6A 1WV2A 4UTHA 1VLWA 5F1VA 3LOTA 4AEOA 1PE1A 2W0UA 3W72A 2Y7DA 4K39A 1XBYA 4LV9A 2CLMA 4O19A 2FDSA 3L5LA 4UMBA 4Z1BA 2DZPA 4FF7A 4P2VA 4UTJA 5HR7A 1H7XA 1LRQA 2ZRXA 1S5TA 2ZZ7A 3UD6A 1RZMA 3WJWA 3QW3A 4AWUA 2VEPA 4X2RA 4IMFA 2V82A 3R12A 5D2TA 1M7PA 4O16A 3QSTA 1VYPX 3H55A 4AWTA 1F76A 3CHVA 1O5XA 2V81A 3IGUA 1WOBA 3LB0A 3W7MA 4ZQOA 2JGYA 2ZTKA 3HB9A 3O6DA 4ADTA 2ALDA 1KV5A 1EA0A 3GXPA 1LOQA 1N8FA 2AQWA 1ONRA 1A5SA 1UUMA 3JRKA 3NQAA 5G5IA 1ZCOA 3NQDA 1LLWA 2A6LA 1A53A 3PUOA 2CZEA 3WK3A 2B7QA 3TCEA 4BI7A 1FY6A 4S2CA 5AB3A 4KWVA 3UZJA 4G1KA 1H63A 4S1FA 5DCDA 2WSRA 2R91A 3DFNA 4BI5A 1C9DA 2TYSA 3TMQA 4NVTA 4PC8A 5K7JA 1PL9A 1RVGA 3NL5A 2V5BA 1CX9A 3TJLA 4AHPA 4FNUA 1GVOA 4OGZA 4K7YA 4HNVA 3OG3A 2X30A 5KMYA 4WX2A 1T96A 3H53A 2CLEA 3NXFA 4O4WA 3PM6A 5LSMA 2E09A 2CZFA 3CIXA 1I2NA 4AF0B 1WXJA 2QCDB 3W86A 4M19A 3FYOA 4MYXA 3PR2A 2VENA 1XBVA 1OFRA 1RQHA 3LCGA 2ZRVA 1F6KA 5AFDA 1XL9A 5K9CA 1VJIA 2FB3A 5LZLA 2QAFA 1IXPA 3G1XA 3W73A 4O1BA 4WZHA 4FNPA 2H8ZA 4CCCA 5L6UA 2B4GA 4XBSA 1SR9A 5DBUA 3DAQA 4D2JA 4EOUA 2I14A 1ZAJA 1LM1A 5J5DA 1VCVA 4JXCA 4WXYA 4CNOA 4RCXA 4HPXA 1W5PA 2PRLA 4JEQA 3T55A 2Y70A 3N2XA 4QAIA 4WD0A 3GKFA 1XXXA 2NWSA 2QDGA 4LS0A 1LYXA 3IGXA 2WQPA 5KINA 5ABTA 3L5MA 2RDWA 3OIXA 2QCCA 3MJYA 5K4ZA 5CSRA 1OG0A 4NJHA 3NDOA 3U6WA 5BMXA 4N6FA 3PBUA 3EXSA 4IGHA 3NQ7A 2ZZ5A 3B04A 3SFKA 4FB7A 1TV8A 4LS1A 5G4EA 3SECA 1HO1A 4HIBA 4O13A 3P5ZA 4IX0A 3TMLA 1TTIA 2WOQA 2J9XA 3ZWSA 4AF0A 1OHLA 2QCDA 5HUPA 3UYCA 3THQA 1FWNA 3QPYA 3I7SA 3EKLA 2E5BA 1GWJA 4E38A 4JIQA 3NQGA 3TH6A 3W2LA 4RZ4A 1H7OA 3PG8A 3LM7A 3W7KA 4HNNA 1OF6A 3M41A 4NJJA 3BO9A 1K7XA 4IQLA 4IXXA 1FWSA 2OX1A 4JTKA 2O7SA 1WQ5A 2P1FA 5CGQA 1H62A 4Q32A 4MLRA 1SO5A 3GB6A 2I9EA 1F2JA 2Q3RA 3W88A 2VFHA 3PB2A 4WXZA 1OFQA 5U4NA 2BWGA 3P82A 3CT7A 4NNAA 1YXDA 1L6SA 4UFMA 3UZ5A 2WV8A 3DFSA 4E0CA 3ZFHA 3HPZA 4JTSA 3UWZA 4BI6A 1FCVA 4O17A 1GT8A 2VKZG 1G7UA 1GTEA 3MHFA 3T40A 3MBFA 1H7WA 4FX7A 1L9WA 3IVSA 3W84A 3NQVA 2NV2A 3QH2A 5AHEA 2VFFA 1EWEA 4JTLA 3W7NA 1BKSA 3QSRA 1QR7A 1WYIA 5EPDA 1NF7A 5D2WA 1CW2A 5FF3A 1KFBA 1A50A 1QWGA 1ZALA 3W9ZA 1U83A 3LI1A 3BK0A 4GRSA 3KAOA 1XUUA 5HMSA 4FX6M 3PC0A 4AXKA 4DELA 5AHLA 3V75A 3HGSA 3C2FA 1VQTA 3PSVA 1EP1A 2TSYA 3Q58A 1TB3A 4AWSA 1H1YA 2C3ZA 1FWRA 2A2IA 2PRHA 4O18A 1YDNA 3DFTA 3O6YX 3IRDA 1JRCA 3IIVA 3PG9A 4MZ1A 3L68A 3LX9A 4ONVA 2Z1BA 1WDWA 2WSYA 5F2MA 4BK9A 2UV8G 1VR6A 4DBEA 3QC3A 4XTDA 3PY2A 3NG3A 5HNRA 1TPVA 2BXVA 4GUJA 4MJMA 1OF8A 1TPH1 1VCFA 3L0KA 4Z08A 2X1TA 4UTUA 4JTFA 3NPXA 1I4NA 1EIXA 1EEPA 4I7WA 1YTEA 4K7VA 4UC5A 3C2OA 1C29A 1KFEA 2ZRWA 1EUNA 1TPC1 2QCLA 3WJYA 4EIVA 3WFAA 1OX6A 1AK5A 1W31A 3MI2A 5EY5A 4LT9A 2V2DA 3DBPA 4UTIA 5CZTA 3G0SA 3W1UA 3S1XA 4LW7A 1SFLA 3O63A 4E2BA 5BNKA 3P8JA 4MUZA 2E68A 1HG3A 3ABOA 5AHMA 5LKYA 3N14A 1MEWA 1YPIA 1OYAA 3T78A 4O54A 3PVFA 1FQ0A 5KITA 4GUIA 3E49A 1FXPA 4GC4A 3W7GA 1FUYA 1DL3A 4OE7A 4MFDA 5D04C 1YLVA 3W85A 1VYSX 1J4EA 1EPXA 2HS8A 4Y96A 1KFLA 3TDFA 4TMBA 1XDLA 2X1SA 4OV9A 2F84A 1FWTA 4A29A 2TPSA 2GUUA 2ISVA 3DKLA 4HKPA 1G4SA 1TREA 3BLIA 2GVGA 1AL7A 5D02A 2ZQ0A 3S5YA 3MI3A 2YXGA 2V8ZA 4CCDA 1TV7A 1DV7A 4PCFA 1TPB1 5KSWA 5D03A 3FFSA 3ZWTA 2Q8LA 1F6PA 4K37A 1DHPA 3GK0A 3OVPA 1VS1A 3ABSA 4X3ZA 5MHBA 1B57A 1SSDA 4NU7A 3PB0A 5EBUA 3VE7A 2A1YA 5J5RA 5LNVA 4HN4A 1OFEA 2DJXA 3CWNA 3LRKA 5C6MA 3L65A 1O95A 3SIZA 1AG1O 2XN2A 2ZCGA 1ZJIA 5D2VA 3C6CA 5HINA 3HG4A 1W1ZA 3BW2A 4FX8A 1RR2A 4M6VA 3S0CA 3LCFA 3W1NA 4IOTA 2E6FA 2QR6A 4WUIA 3DENA 3E02A 1P0KA 3FYPA 5C5YA 3QMSA 1LOLA 1GOXA 2Y62A 2JKEA 3M16A 1OK4A 1O60A 1TQJA 2Y6ZA 3GDRA 4IX2A 5D38A 1U5JA 3UPBA 3M6YA 3TU9A 3SZ8A 2CZ5A 2YPIA 3Q2DA 4RR4A 1QO5A 1VYRA 3LBMA 4ZQCA 5HWJA 1JUKA 1N55A 2V5LA 3B8DA 3W6YA 4MIMA 1JUEA 3GXTA 3VI2A 1TMHA 3MYOA 2VEKA 4JY8A 1HFBA 5CPMA 3LV6A 2ZRYA 1XCFA 4LVGA 3GR8A 3TAOA 3G1YA 3HF3A 1I8JA 2A5HA 4TIMA 5FEXA 2Y7GA 3GR7A 2DJLA 2NX1A 3GDLA 4O14A 2VC6A 3RFAA 4W9TA 2YSWA 4HNUA 4EWND 3TSDA 3AJXA 1QNVA 1Q6LA 3TC7A 4L4MA 4LVAA 4UXDA 1DQWA 5DCEA 3RF9A 4CQ8A 1SUXA 1WOAA 4YCOA 2C15A 2EAWA 1Z48A 2RHGA 2FFCA 4OQVA 5HWMA 1SW7A 3UWUA 4JN6A 4JD4A 3HQ1A 1A5CA 3EXRA 1KTCA 2A6NA 3C8FA 3C3NA 3C52A 1XKYA 3G1VA 5KZMA 1H61A 4LV4A 3RLVA 3UWYA 2A85A 4NZJA 5F4XA 2NUYA 3UPWA 1P4CA 1L6YA 1TPEA 4JDBA 1YADA 4ORMA 1G69A 1UB3A 5I3KA 2E6AA 5AYYA 1W5QA 1G7VA 2JKAA 3STFA 3GDMA 5HJLA 2PC4A 3LRLA 4ZQRA 1NAL1 1FWWA 2QUTA 4UTTC 4DO6A 4CNPA 2I1OA 2VFDA 1GZGA 1LORA 1W5NA 4UTLA 3RU6A 1OFAA 3Q94A 5F2IA 1BTMA 1RQEA 1NVMA 3TE9A 2JKPA 5D2YA 3GZ3A 5CPLA 4UCGA 3NPVA 1H7PA 2ZA3A 2NX9A 4RJEA 4RZ6A 1G4EA 3NO5A 4ZL1A 1GVRA 3CC1A 3LHVA 2ZFAA 5DY3A 4JGDA 3LERA 2PCQA 3G22A 1Q6QA 4FNQA 2GVJA 3QFEA 2OMAA 1GG0A 3FKRA 1ME9A 2QCHA 2H90A 4LNYA 3CM4A 5BMWA 1LP6A 3FKKA 4IUOA 3EWZA 3M9YA 1F7BA 4JS3A 2NWRA 3N34A 4TX9A 3IVUA 3FIGA 1GVSA 5A5WA 2HMCA 3I65A 1IF2A 4QIUA 1JULA 4UUIA 1SZNA 2EGZA 4Y8FA 1V7YA 5HR6A 1ADOA 2WNQA 2X1RA 1H7RA 1OFOA 1S5WA 2Y61A 3KX6A 5EL1A 4J9JA 3W1PA 1BEUA 3SSJA 4C1KA 1KM5A 1TRDA 3I7QA 1DBTA 4K6AA 4ORIA 3NVTA 1H5YA 5D30A 2Z0IA 3NA8A 3LRMA 5I3JA 4IPIA 3M47A 5LNUA 5FF7A 3TA6A 3W7DA 2ZDRA 1QPRA 3QYQA 3W7HA 1SO3A 3FLUA 1VCGA 4XBKA 4ZZ9A 2O7QA 4TU1A 2YYUA 4MPQA 2Z6JA 3CWOX 2PURA 3KOFA 1G4PA 3EWUA 4K36A 3HGOA 3C61A 1K03A 2EHHA 2FB2A 3TR2A 3KVMA 2G95A 5D09A 3W1TA 1OK6A 3W2UA 2A7RA 6ALDA 1QOPA 3B03A 3E96A 3P5YA 1KTBA 2NXGA 2E6YA 3W76A 3G0UA 1X7FA 1SZEA 3GDTA 3PWAA 2A7NA 2NV1A 1JCXA 1JJKA 3L5AA 4ZQNA 1YTKA 5G4WA 3HG5A 1TIMA 3M7WA 2FLIA 4TMCA 1S5VA 4H6KA 4DF2A 1TV5A 3GNNA 3T4CA 3W7IA 2BLEA 1IIGA 1PV8A 1YXYA 4NXKA 1BWLA 3EX4A 4FEZA 2ABBA 4N9EA 4LTSA 3BGGA 3W7RA 4OT7A 3A9IA 4R7JA 4O10A 3DHDA 3GLCA 2GJNA 1KM4A 3W7EA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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