2B7PA

Crystal structure of quinolinic acid phosphoribosyltransferase from helicobacter pylori with phthalic acid
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
273
structure length
273
Chain Sequence
MEIRTFLERALKEDLGHGDLFERVLEKDFKATAFVRAKQEGVFSGEKYALELLEMTGIECVQTIKDKERFKPKDALMEIRGDFSMLLKVERTLLNLLQHSSGIATLTSRFVEALNSHKVRLLDTRKTRPLLRIFEKYSVLNGGASNHRLGLDDALMLKDTHLRHVKDLKSFLTHARKNLPFTAKIEIECESFEEAKNAMNAGADIVMCDNLSVLETKEIAAYRDAHYPFVLLEASGNISLESINAYAKSGVDAISVGALIHQATFIDMHMKMA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Probable nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase
publication title Crystal structure of quinolinic acid phosphoribosyltransferase from Helicobacter pylori
pubmed doi rcsb
source organism Helicobacter pylori
total genus 86
structure length 273
sequence length 273
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 2.4.2.19: Nicotinate-nucleotide diphosphorylase (carboxylating).
pdb deposition date 2005-10-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01729 QRPTase_C Quinolinate phosphoribosyl transferase, C-terminal domain
A PF02749 QRPTase_N Quinolinate phosphoribosyl transferase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2b7pA02
3.90.1170.20 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Aldehyde Oxidoreductase; domain 3 Quinolinate phosphoribosyl transferase, N-terminal domain 2b7pA01
4QM1A 2QEZA 4HNTA 5K9CA 1HUVA 3KAOA 4AXKA 3S0CA 3TXVA 5BRBA 2V5BA 1EWEA 4UNLA 4D2JA 2C0AA 3QMTA 2VFGA 4Z0SA 4O4VA 3IGUA 1KM6A 1KM1A 1G4SA 1YDVA 3LCXA 3KFTA 1KBIA 2PC4A 5CPNA 1YADA 5IBXA 4WUIA 3TROA 2H8ZA 4RXGA 1SFJA 3HJZA 1J2WA 1K8XA 5CSSA 1H1ZA 1G4PA 5G4EA 3O16A 3UY8A 2GQAA 2HS6A 4TMBA 3KOFA 3M16A 1P0KA 3ZS4A 2ABBA 3DXIA 4JY8A 3L5MA 1FDJA 1VGAA 2ZRYA 1AW2A 1W5QA 4K7YA 2NUXA 1A5AA 4UIOA 1TPDA 2NUYA 2FTPA 5EPDA 3NEVA 3BLIA 1RD5A 4R33A 3NQ8A 3DFNA 4N2YA 3EX2A 2DZSA 1UJPA 4GWEA 5A8GA 4HHPA 3TAKA 3JRKA 1ME9A 4GRSA 5LNRA 3DFOA 3W85A 5D03A 3DU0A 3VE9A 2DZVA 1JULA 1R2SA 2C15A 4P61A 5ABTA 3R2GA 3W1PA 1SO5A 3BV4A 3M9YA 4O53A 4WX2A 4AEOA 3M47A 2H8XA 3T55A 3W2LA 3VI2A 3D0CA 3DKLA 5AHIA 3STFA 3GX9A 3G1SA 5HWNA 1Y0EA 1QO2A 2A85A 3GNNA 3CEPA 3LHYA 4Z1CA 3QSTA 1THFD 1TQJA 1YXYA 2WSRA 3P82A 1YTEA 3W2NA 4N9CA 4FNRA 5G5IA 4IOTA 5I3KA 1VH7A 3LCGA 1KM3A 2PCQA 3JS3A 1LP6A 2QJHA 3T78A 2R91A 2QCFA 3R13A 3DGRA 3TSMA 4GUJA 1M6JA 4Y9AA 1EP2A 1I2NA 1LCOA 3LLFA 4DF0A 2TPSA 3L65A 4OWGA 3CT7A 1DL3A 4UFHA 1DBTA 4O1CA 5BW6A 2NLIA 4NQ1A 2J9YA 5DXXA 2YW4A 4N4QA 1XDMA 3YPIA 5TQLA 2VFFA 1JR1A 1O5XA 4LY8A 4MVAA 3W75A 3O1NA 4O1BA 2WNNA 1WDWA 3GIYA 2X1RA 3SY5A 3QH2A 4OBTA 3HBLA 4LVGA 3P8JA 1W0MA 3C61A 5K4XA 3MP4A 1SZEA 2X30A 3PUOA 3L0NA 2ZFAA 2V2DA 4B5NA 4CQ9A 1E51A 3L0GA 3S1XA 4KKXA 2Q8ZA 3SJ3A 2PRLA 4BI6A 2ZZ4A 1L6WA 3EX4A 4Q32A 5L9FA 3KX6A 1XFBA 1AL7A 3T44A 4DBEA 4JYDA 1TTJA 3UD6A 3BO9A 3CHVA 3P81A 4K38A 1TCDA 3W2MA 1JCJA 1R30A 4ADTA 3EWBX 3C0JA 3KRUA 5LHEA 3W84A 1ZAIA 5GVJA 2RH9A 1PCKA 1KA9F 4JR5A 1JCNA 5D2XA 4S2CA 1OFBA 3W2KA 3I7RA 2ALDA 2E5BA 2FIQA 1YDNA 3DKJA 3IVTA 4JTSA 3F03K 4UTKA 4MYXA 4L4LA 4LVFA 5D02A 3TQVA 1Z42A 1GJPA 3G3DA 4NJIA 5D2WA 3B0VC 3CC1A 4U4MA 3S6DA 1HFBA 3LHVA 5FEWA 1GYNA 2J27A 2KZHA 3ANYA 3EXSA 1C29A 2R94A 4QISA 2YSWA 3LOTA 1H7PA 2ZZ1A 1NAL1 1LRQA 1K7XA 3NQ2A 4DF1A 1OF6A 1GTHA 2R8WA 2Y63A 4HKPA 1H7RA 3TW7A 3HMJG 5CKSA 1PL9A 3P5YA 4LOCA 3E49A 5SWUA 3UZ5A 2DZWA 1W56A 4GUGA 3TKFA 3CEUA 4K7VA 3I6RA 1QR7A 4JX6A 4LUIA 3TSDA 4NJJA 1K8ZA 2NXIA 3MI3A 1LROA 3W1RA 1WBJA 5EYWA 4PA8A 2VC6A 3A24A 3W71A 3EWUA 2C14A 3TFCA 3DI0A 4JGDA 5D30A 3HOJA 3MWAA 2WO5A 1F05A 3WK2A 4S1FA 1IIHA 4IXXA 3LDVA 5C5YA 3R5EA 4JTGA 3WJYA 3THAA 2GJNA 4Q33A 1FBAA 2ZA3A 3STGA 1EUAA 2PURA 4XBKA 3TV8A 1A53A 2Z6JA 1SU5A 2HMCA 5K9DA 1WBHA 4LUJA 3M44A 3PBUA 4JS3A 3B0UX 2EPHA 3C4UA 1XBVA 1QFEA 1H7OA 2Z6IA 1W54A 2X1UA 2QKFA 4AWTA 2A21A 1F7BA 2PRHA 1SPQA 3TUUA 5LNVA 4DO4A 2GVJA 1XBYA 3W1NA 3BG3A 5FF3A 1PVNA 2ZRXA 1I4NA 4E0CA 2CLKA 1CX9A 1FQ0A 3T4CA 2EHHA 3PULA 2ABAA 2G97A 3NQCA 3P7YA 4O28A 2ZTJA 5FF2A 1SO6A 1SZNA 1AW5A 3W1LA 2NWSA 3IIZA 3LX9A 1EPXA 4OT7A 4Z08A 5LGXA 4H6KA 2CLOA 4M19A 1OYBA 1ALDA 2H6RA 2QR6A 3FLUA 3LERA 1IGSA 3QFEA 3UXDA 3W70A 3W7GA 1NSJA 1W3NA 1WX0A 4ADUA 3FA5A 2BWGA 3NA8A 3IIXA 3EX6A 3GAYA 1HO1A 3O6CA 4KFNA 5AC6A 1KM0A 2X2GA 1H7WA 1S5VA 4QITA 4I7VA 3GXNA 2A5HA 3G8RA 1DHPA 4WQ6A 2WQPA 2WSQA 2YGYA 3C3NA 4A22A 1SZGA 4IWWA 1BTMA 4PL1A 2JK2A 3A21A 1L2UA 2V30A 3C2RA 3RFAA 3VCRA 1XBZA 3EWZA 1LBLA 3HQ1A 3DBPA 4NJHA 2GJLA 3G8EA 1UB3A 4HNNA 3DI1A 1EA0A 2Y6ZA 3WK3A 1ICSA 3L21A 4UR7A 2ZDRA 2ZYFA 3FYOA 1VRDA 1WA3A 3O05A 2DZUA 1KW1A 1VLIA 4UC5A 5KMYA 1B9BA 2E1DA 5E93A 3NL2A 3FFSA 3MBDA 4CCCA 2X1TA 5F2MA 4EWND 4N4PA 2W0UA 4MIMA 1K03A 2ZTKA 2YW3A 2P0OA 1JCYA 1QOPA 3I7QA 3VE7A 4HPJA 4WD0A 4E38A 1PE1A 1HL2A 3AO0A 3MO7A 3QF0A 1F74A 5HINA 1O4UA 3EKZA 1R2RA 3IGSA 4QJ1A 3PWAA 3V75A 2ZBTA 2RKXA 3RLVA 4RJEA 3MYOA 3N34A 4FXRA 3NXFA 2Y70A 4P2VA 3NQVA 1VQTA 4MJMA 2EKCA 2YDAA 3HPXA 3ZFHA 4JTLA 4ZMGA 1L6YA 2A2IA 3UWQA 4C1KA 1V7YA 2YFOA 2VOMA 2YFNA 1W1ZA 2LLEA 3NQMA 1YYAA 3W72A 1PIIA 2HSAA 1WAUA 2ISWA 5D09A 4IMFA 3BVJA 4KFOA 2OCZA 4RX0A 3A5VA 3L66A 3QQ1A 4UFIA 4XKYA 2V2HA 2FPTA 3IVSA 5CGQA 4RV8A 2DJLA 3GKAA 1DV7A 4PODA 3VKJA 5K2ZA 3EKLA 3S5OA 4OV4A 5KZMA 3B04A 1F2JA 2E77A 1VHCA 4M6PA 2ZA1A 3LHUA 1EX5A 1T0OA 2CZ5A 3LXAA 2V81A 3FS2A 2GUUA 4FHAA 4TO8A 1FCQA 1GT8A 3WFAA 4Z0JA 2DJXA 5FEPA 4LU0A 2ATMA 5BMWA 3CIWA 1ML1A 3USBA 1EP1A 4NX5A 1YDOA 1OX4A 1SO4A 2YX0A 4JX5A 1B4KA 2E09A 4RXFA 3DENA 2ZRVA 1WXJA 5H2ZA 2Y7GA 4HT3A 3W7EA 3NAVA 1EUNA 3LHZA 4K8HA 5EKYA 4EOUA 3MP3A 4MY8A 4ICNA 3CIXA 4JTEA 1KTCA 2DZTA 4O52A 2FLIA 3QW3A 3B8DA 3P84A 2C6QA 4LW7A 1RZMA 3QYQA 3KRZA 4GFSA 1LBFA 1OVDA 3L9CA 1YLVA 1O60A 1M5WA 5DY3A 4LWWA 3FYPA 4UCGA 3HG2A 3GB6A 1YTDA 3NZ1A 2VEPA 3HGOA 2E6FA 1VZWA 3T40A 3LCHA 3HB9A 4LRTA 3W1QA 4JTTA 2QCMA 1XCFA 4BK9A 1X1OA 2Z1BA 3T7VA 4NJKA 1OYAA 3S9YA 4PCFA 3TW6A 3FKKA 1ZFJA 4GUIA 3VNDA 1FY6A 3WK1A 1TMHA 3FEMA 3C8FA 5I3FA 5F4SA 1XC4A 2VFEA 3QZEA 4AMAA 4AWSA 1O95A 1OF8A 4NNCA 3G0SA 5F2LA 4IJBA 3ABSA 4O1AA 1XKYA 1ZENA 2GQ8A 4UTJA 3I68A 1QOQA 4JEQA 1M7PA 4PL2A 4MJZA 2A6LA 3PY2A 3NPUA 1KTNA 3G1DA 3G1HA 4LS0A 2YR1A 3KVLA 3W7JA 3CPRA 4MFEA 2A4AA 4UTIA 5FF4A 4IXHA 1QO5A 1TV5A 1PCWA 5LSMA 2H3BA 3QRHA 2Y61A 4O11A 1OHLA 2A7NA 3F1QA 3TIMA 2NV2A 3EX1A 4TIMA 3NL6A 5FEZA 3DFTA 4NNBA 3V1PA 4DELA 3N3MA 4UNKA 4IMGA 4O8RA 3BG9A 4IPJA 4O54A 7TIMA 2TSYA 5D38A 3SZ8A 4CNOA 5I3HA 5G2WA 2BXVA 1EB3A 4IMDA 4ZQMA 2H90A 3GR7A 2J9XA 1G4TA 3W7NA 4MY9A 2CZFA 3MW7A 3P8IA 3W7QA 2Y7EA 4AB4A 2TYSA 3W3OA 3UWUA 4IQLA 1B3OA 4I7UA 1GEQA 4N6FA 5F2IA 3SR7A 5KZDA 1Z48A 5G4WA 1VJIA 1VLWA 5HNRA 2V8ZA 4FX7A 1FX6A 1PV8A 3CWOX 2P1FA 4OE7A 4CNPA 1GVQA 4UR8A 1GVOA 1LTDA 2ATSA 3GYEA 2C16A 2H3DA 1OFAA 4FF7A 2DP3A 3HIJA 1YPFA 2P10A 2B0MA 1FXPA 2E6DA 3HGRA 1HG3A 4XBSA 1KLZA 1FXQA 4EF9A 1F6KA 1F6PA 1XI3A 4XZ9A 2A0NA 3INPA 4ONVA 3PS7A 4UMCA 2QAPA 3BGGA 3BW4A 1EWDA 4AHQA 3MUXA 3NQ7A 1F76A 3O6YX 4DO5A 4UTMA 1ONRA 2CLFA 4XWUA 2ZRWA 1ADOA 2FPYA 1TJRA 1KTBA 1F5ZA 4L4MA 5E0KA 1W5OA 1G67A 3W7IA 2I9EA 3S1WA 1WV2A 3LRLA 1H63A 3CWNA 3GAKA 3E12A 5U7SA 1MEHA 5A5WA 2E6YA 1S5TA 1GVSA 3TR2A 3IIPA 3QQ0A 2GOUA 3QEZA 4N6EA 1JUKA 2NX9A 1CI1A 3A5FA 4GXMA 5TBOA 2VFDA 4WXZA 4MUZA 1D9EA 4BI5A 4O19A 1OFQA 3W7DA 3BLFA 3W1MA 3SGUA 4FNTA 5DCDA 3W7HA 2QAFA 1TPVA 3GVGA 4RK8A 5AFDA 1G6CA 5D2YA 1DQXA 4N9EA 1H60A 1LYXA 4JY9A 3W7PA 3WJZA 3SFKA 4CQ8A 4TMCA 3RNDA 3N14A 3O63A 4JYFA 3EEGA 3MYPA 5AHEA 3BPWA 4MLRA 3AJXA 4N02A 1LDCA 3TJLA 2Y88A 2CLHA 1IIGA 2VEKA 4YMZA 1TYGA 1X8FA 1OFPA 4NJGA 1FWRA 1UASA 4FEZA 2QCDA 6ALDA 3W86A 4X3ZA 2VEMA 2R14A 1FUYA 2RDUA 1OG0A 3F4NA 4HN4A 1AMKA 2TRSA 4MLJA 1JJKA 2NWRA 2X16A 1PHQA 2QUVA 1UUMA 3LHTA 5D2TA 1VPXA 3M6YA 4TU1A 1O94A 1DJQA 5HR6A 4K36A 3W1TA 5D05A 3PVFA 4JTJA 5G1YA 3KVMA 2Y85A 5DY2A 3HO8A 4WXYA 2CZDA 3F4WA 4AF0A 4O14A 3O8AA 4DEFA 1TPEA 1QMLA 3GR8A 2JGQA 3W9ZA 1KFEA 5T26A 2FQIA 2C3ZA 5HMSA 3L67A 1OFRA 2CLLA 3B06A 2ZZ7A 1KFBA 1ZALA 5D32A 4FNPA 4LRSA 3LI1A 1W37A 4XKYB 3I7SA 4UTTC 3FIGA 1IXOA 5D33A 3GDKA 4WZHA 2QJGA 2QUUA 3LCWA 1IXPA 3OA3A 4QQ3A 1LRTA 3RLUA 1XL9A 3L5LA 4TR9A 5LGZA 1ZNNA 2Y7DA 4K6AA 3C56A 3FJ6A 1NVMA 2C19A 2FJKA 1O5KA 1W3IA 3RMJA 3MI6A 3FKRA 2AAMA 3LBCA 3DFPA 4AVFA 1OK6A 4FNUA 2B4GA 4DO6A 5AB3A 3IIOA 1KFCA 1U5JA 2OJPA 1OX5A 3BW3A 1SUXA 1AL8A 3SSJA 5DN1A 3IVUA 4UMBA 1VC4A 1G7UA 1SSDA 4ZQOA 1OX4B 1LM1A 3TQ0A 2WV8A 3C2FA 4UFMA 5EY5A 1HTIA 2E5DA 2ZZ3A 2OZ0A 5KTLA 1IXQA 4ORMA 3G1YA 3TC7A 3KVKA 4JXCA 1X7FA 4UTUA 1Q6QA 3LTYA 3GK0A 1SW3A 4UFJA 4YL2A 3W87A 4XTDA 3G1AA 2E6AA 1LOSA 3QW4B 4N9DA 1XUZA 3UPBA 3MHFA 1J4EA 2W6RA 1MEWA 1FWWA 1B4EA 5CZSA 4NT0A 1OK4A 3TA6A 1LBMA 3UWYA 3OG3A 3RF9A 3S5ZA 3Q58A 4JICA 1W5MA 3OEXA 4A3UA 2OMAA 3FJLA 3LB0A 5DBTA 5KZEA 3G22A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 2NX1 A;  1W8S A;  3OVP A;  4JTH A;  4MKN A;  1ZY9 A;  3Q37 A;  4AWU A;  1DOR A;  3LTS A;  4A29 A;  1Z44 A;  2RDT A;  1KV5 A;  1G7V A;  3R8R A;  4JD4 A;  1TPF A;  3CTL A;  1MZH A;  3MI2 A;  1IXN A;  2F84 A;  3BGJ A;  1MXS A;  3GXP A;  4O18 A;  3B4U A;  4Y90 A;  5CPO A;  1KFL A;  2YPI A;  3DHD A;  2CLE A;  3B0P A;  4EVZ A;  1LRN A;  4MFD A;  4LC8 A;  4UTL A;  3L5A A;  3Q2D A;  1QAP A;  3NL5 A;  4QAI A;  3LI0 A;  3C2E A;  3NQ6 A;  5AHN A;  1TIM A;  4O4W A;  2QJI A;  5E1Q A;  1D3H A;  4FO4 A;  2QCC A;  3M5V A;  1SO3 A;  3QJA A;  5FI8 A;  2ZCG A;  1I2O A;  4I9A A;  4EIV A;  1MEI A;  1X1Z A;  2OX1 A;  1QCW A;  3W6Y A;  4GUH A;  3QC3 A;  4LNY A;  1H50 A;  4H4I A;  1U83 A;  3RK8 A;  3IIV A;  3G1V A;  5F1U A;  3BW2 A;  3N2X A;  4M6Q A;  4FB7 A;  3BLE A;  1XBX A;  3LHW A;  3GND A;  3ZR4 A;  1TPW A;  1H1Y A;  4X22 A;  3W73 A;  1RQE A;  3TCE A;  2QDG A;  5C2X A;  5F2G A;  4POC A;  4LS2 A;  2YZR A;  1JVN A;  3NYZ A;  4ZVJ A;  1SQ7 A;  5LHF A;  4IGH A;  5L6U A;  1QPN A;  1YPI A;  3G18 A;  4IX0 A;  1OFD A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 1GOR A;  1V93 A;  1BTC A;  3LPF A;  1ZL1 A;  4IQE A;  4QQU A;  4FF5 A;  2PF0 A;  3T78 A;  2QDD A;  2R91 A;  2UWF A;  3TTE A;  3R13 A;  4LAM A;  3DGR A;  1C8X A;  3T2O A;  1M6J A;  5CPS A;  4Y9A A;  3VD4 A;  2P3E A;  4DF0 A;  3GXI A;  3T4W A;  3L65 A;  1S2T A;  3L7R A;  4OWG A;  2WVV A;  4LJ3 A;  4ZO6 A;  1DBT A;  4O1C A;  2BGQ A;  5BW6 A;  2NLI A;  2QYG A;  1MW2 A;  4DAI A;  1EBG A;  4GGH A;  3STP A;  5CC3 A;  1IZC A;  4MVA A;  5BRQ A;  4ZB0 A;  2UZ9 A;  3UA4 A;  1J0I A;  1NY1 A;  2J74 A;  3P8J A;  4KWU A;  4PUD A;  2X30 A;  3NVZ C;  2VCB A;  3LZ3 A;  4M29 A;  3L0G A;  5I5R A;  3SJ3 A;  2PRL A;  3APG A;  3GC5 A;  3R11 A;  3EX4 A;  1VBG A;  4S3D A;  4MKS A;  5AC5 A;  3VNJ A;  1V0L A;  1TTJ A;  3UD6 A;  3BO9 A;  3CHV A;  3P81 A;  3O9N A;  3H23 A;  3EWB X;  3C0J A;  3DC8 A;  5LHE A;  4ZFM A;  4KET A;  5GVJ A;  4YJ5 A;  1LQ0 A;  1KA9 F;  1M9H A;  1XW8 A;  2O56 A;  3TTO A;  1KGW A;  2ALD A;  2E5B A;  3V1H A;  1QNP A;  4NAE B;  1YDN A;  2F61 A;  4GI4 A;  4UTK A;  2Y0F A;  4LVF A;  2PTW A;  4WLC A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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