2B7QA

Crystal structure of quinolinic acid phosphoribosyltransferase from helicobacter pylori with nicotinate mononucleotide
Total Genus 66
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
66
sequence length
273
structure length
273
Chain Sequence
MEIRTFLERALKEDLGHGDLFERVLEKDFKATAFVRAKQEGVFSGEKYALELLEMTGIECVQTIKDKERFKPKDALMEIRGDFSMLLKVERTLLNLLQHSSGIATLTSRFVEALNSHKVRLLDTRKTRPLLRIFEKYSVLNGGASNHRLGLDDALMLKDTHLRHVKDLKSFLTHARKNLPFTAKIEIECESFEEAKNAMNAGADIVMCDNLSVLETKEIAAYRDAHYPFVLLEASGNISLESINAYAKSGVDAISVGALIHQATFIDMHMKMA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Probable nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase
publication title Crystal structure of quinolinic acid phosphoribosyltransferase from Helicobacter pylori
pubmed doi rcsb
source organism Helicobacter pylori
total genus 66
structure length 273
sequence length 273
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 2.4.2.19: Nicotinate-nucleotide diphosphorylase (carboxylating).
pdb deposition date 2005-10-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01729 QRPTase_C Quinolinate phosphoribosyl transferase, C-terminal domain
A PF02749 QRPTase_N Quinolinate phosphoribosyl transferase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2b7qA02
3.90.1170.20 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Aldehyde Oxidoreductase; domain 3 Quinolinate phosphoribosyl transferase, N-terminal domain 2b7qA01
1WOAA 2KZHA 5AHNA 5IBXA 5AC6A 1I4NA 1LOSA 4U4MA 3S1VA 4N2YA 1G7VA 4FX7A 1HTIA 4IQLA 1IXPA 2OMAA 3E9AA 1ZCOA 3PAJA 1QNVA 4TIMA 1PV8A 3BG9A 4U28A 1VR6A 2DORA 3LLDA 1SSGA 4KFPA 4ZQOA 5HUOA 3S8HA 4FO4A 4EWND 1FBAA 3WJXA 4Y9AA 3SY5A 4A21A 2FB2A 1SFJA 1KFJA 5HJLA 5HR6A 2NUYA 1VCGA 4A2SA 1LDCA 1O5XA 3U6WA 5LSMA 4IX0A 1ME9A 3F03K 1N55A 5G4WA 3M5YA 1EX5A 5F4SA 3LCLA 3TNOA 2YYUA 3WK2A 4WOZA 3G22A 3NGJA 3L2IA 3UWUA 1ME7A 5C54A 4O52A 2E1DA 1U83A 4TMCA 3GVGA 4EF9A 2PRHA 2WOQA 2CZEA 2NV2A 5ABTA 1NFBA 2VKZG 3YPIA 3W7GA 2ISSA 2AAMA 3LTPA 3TCEA 1Z44A 1DQXA 1P0KA 3F4WA 4Y8FA 5BOOA 1SO3A 4O50A 2WKJA 3N9SA 3VI2A 3PUEA 2X2GA 4O15A 3M5ZA 4CQAA 1OFQA 2A7NA 4JTLA 1LBMA 2ZZ6A 1GEQA 3LXCA 4HNUA 3TQVA 4CQ9A 3KOFA 3RU6A 3TMQA 4JN6A 4WZHA 4K7YA 3NL2A 5FF7A 3HGOA 3PF3A 4OQVA 5EYWA 1THFD 5AYXA 4POCA 1K8YA 1LOQA 1TV8A 2GJLA 1UB3A 1NEYA 3BO9A 4L4LA 1R2TA 2EPHA 3TKFA 4QAIA 1J2WA 3CIWA 5I3IA 2NX9A 3L0KA 3TQKA 4JTIA 2QUVA 2RDTA 4H6KA 1F2JA 3HG3A 1KFEA 2W0UA 3B05A 3NZRA 5F2MA 5FF3A 2CLKA 1OJXA 4A22A 2QCFA 2JKAA 4GJ1A 3HG2A 2YXGA 5AB3A 2JKPA 1G67A 2GJNA 1TSIA 3N73A 3EWWA 2OJPA 1F73A 2G95A 2PRMA 3R2GA 3NO5A 1NSJA 1KTBA 4LNYA 1OFEA 4S1FA 5AOUA 5K9DA 4RXGA 1GTHA 4O28A 5D2TA 3WJYA 1HG3A 1ZJIA 3TQ0A 3N2XA 2V2DA 3C2FA 2Y70A 3STGA 1FX6A 3LCGA 2NUWA 3MP5A 4N02A 3BG3A 2ZQ0A 3LRKA 1ZAHA 1KFKA 3NNTA 5TQLA 1CX9A 1SW3A 3EWXA 3HPSA 3DFOA 1VJIA 3PVFA 1B57A 3W1AA 3PBWA 1GZGA 1WV2A 1L6YA 5BW6A 4QJ1A 3NEVA 3C3NA 5LGZA 1TO3A 4MVAA 3SI9A 5LHFA 1H62A 1GYNA 1ICQA 3MUXA 2YR1A 4UR8A 4E2BA 3MI6A 4LS0A 1ICPA 1UJPA 3SGZA 5DELA 2B7NA 2NV1A 1SFLA 4M7TA 2H90A 2BLEA 1OFPA 1H51A 5K9CA 5AHFA 3QPZA 3OHIA 4YCOA 1WDWA 4Z1BA 1SZNA 1MO0A 3NQ7A 1HUVA 3NQ8A 4MLJA 1SUXA 1YXCA 4O13A 3INPA 5LKYA 3KVLA 1LORA 3W7CA 2VFDA 3TH6A 2V82A 4JDBA 2JKEA 3W1NA 5LHEA 5HULA 4OGZA 1UBSA 4QISA 2GQAA 1LRTA 4DBEA 3W7MA 2ISWA 4AWSA 4UFLA 1QR7A 1VH7A 4Z1AA 2CLMA 3LGEA 3FKRA 3EKZA 4HPXA 2Y61A 3G1HA 3G1FA 3MWAA 3BW4A 5K7JA 3QC3A 2GVGA 4LT9A 3TMLA 5KZMA 2VFFA 1GVQA 1SU5A 2QJIA 2OX1A 3W7JA 2YW3A 1W56A 1P1XA 3E02A 2ZCGA 1KBIA 4K7VA 4PC8A 3NXFA 1J4EA 3Q94A 1XFBA 4X9SA 4ZMGA 2Z1BA 1O5KA 5G4EA 3IRDA 4FEZA 3FKKA 2P0OA 1VYPX 4DF2A 3LCWA 5G2WA 3A23A 3PWAA 1UUOA 4BWLA 3QJAA 3ZWTA 4JNMA 1I2RA 4O17A 1EEPA 1OFDA 1KM1A 4YL2A 2YSWA 3GKAA 2YFNA 1LROA 2E6FA 1JVNA 4AAJA 1OFOA 4UXDA 4DF1A 3W7RA 4LC8A 4WXZA 3TDFA 6TIMA 4DPPA 2NWSA 3BGGA 3LX9A 2E5CA 4O57A 3NQFA 4WY0B 4N9EA 3KRUA 3EXRA 2H3BA 2EF9A 1ALDA 1NF0A 2QCHA 2QCEA 3NL6A 3DH7A 2H3DA 4C1LA 4IMEA 3P5YA 5FF2A 3LRLA 3CIXA 4Y6GA 1EP2A 3KVMA 4BI5A 3Q2DA 4JTFA 3HG5A 3KRZA 4H3DA 3IVSA 1TPUA 2QCMA 3GIYA 1K8XA 4A2RA 3EEGA 3M5XA 3CWOX 3QM3A 1LBLA 4AVFA 3EB2A 3R12A 2ZZ1A 4UMCA 3UYCA 1YTDA 4DBDA 1FDZA 2FQIA 4NX5A 1QDSA 1WYIA 3UZJA 2Z2UA 1W1ZA 2BWGA 3M5VA 4LVGA 3W1TA 2CZFA 1EPXA 3N3MA 4IPJA 3WJSA 1VS1A 4FNSA 1KTCA 1AG1O 1VGAA 2BZNA 2R8WA 3BW2A 3G1VA 4XKYA 3SR7A 2OT0A 4HPJA 3QW3A 3MBDA 1DVJA 4LVDA 2WQPA 3OVPA 3W2MA 5D2XA 1DKWA 4XWUA 3UPBA 3TV8A 2GQ8A 3NZ1A 2G5WA 1BEUA 5AFDA 1EIXA 5SWUA 1AMKA 3EKLA 1BTMA 1NVMA 5I3HA 1Q6RA 4Z1DA 3NAVA 1G4SA 4ML9A 2QEZA 4C1KA 3TSBA 1GWJA 4KWVA 4I7UA 4TO8A 3W7QA 2A85A 2F7FA 1IIGA 1S3HA 3MW7A 1WQ5A 5FEXA 2NXHA 1R30A 3W1RA 3HG4A 3R8RA 1B4EA 3PC0A 1H7NA 3BW3A 1TPDA 1ADOA 4MKNA 4PEKA 4RZ6A 1W5MA 1LP6A 1G6CA 4LW7A 1VYSX 3DFNA 1H7OA 2QCLA 3KAOA 3LCFA 1OX6A 3C2VA 1S5TA 2RDUA 4FIQA 3C56A 4ZVJA 3MO7A 5CSSA 3W6YA 2PRLA 3GXPA 4LV4A 4PFMA 3UNDA 3ANYA 2A7PA 1H7WA 1FWRA 1QOQA 1KFLA 1D3HA 3FFSA 2J24A 3FS2A 4UTLA 2E6DA 5EY5A 4JX5A 1XBZA 4WXYA 2A1YA 1BKSA 3NQCA 3W7OA 2NZLA 1W5NA 5A5WA 1OG0A 5CGQA 3GK0A 4JIQA 2GVLA 4JTKA 4MFEA 1MZHA 1X1OA 1JCXA 3G1XA 2NWRA 5AN7A 3NYZA 3LHYA 3DXIA 1YDOA 5CPMA 3OA3A 3L21A 1GG1A 1HL2A 1IXQA 3CTLA 1F6PA 4JDYA 1QAPA 5FEPA 4BWLC 2AGKA 4IMFA 4UTJA 4ZL1A 1QFEA 1GTEA 4AHPA 5K4ZA 3TSMA 2QCDA 3NQ6A 1QCWA 5D03A 4P2VA 2ZRUA 2FJKA 1OFBA 1YLVA 2ZZ2A 3SSJA 2NX3A 5EBUA 3N19B 4OBTA 1YPFA 2C6QA 3UPWA 1A5CA 1PIIA 5HUPA 1OX5A 1CI1A 4YLWA 2DZTA 3HBLA 1R47A 2A2IA 2W79A 4GC4A 2DZWA 5LGXA 1BWKA 4UNKA 5E0KA 3BLFA 4IJBA 4GWEA 3TW7A 1TV7A 5DLCA 3LCXA 1P5BA 4KFOA 4UFMA 4BR1A 4XUGA 4MY9A 4JR5A 1YTEA 2GQ9A 2J27A 1PE1A 1XL9A 3THQA 2CWNA 1W5QA 4ALDA 3QMRA 4N6EA 3IVTA 1TQJA 1M6JA 1Z41A 4GUGA 1R2RA 1XC4A 1FCVA 3IEBA 3HGSA 3EX1A 1QMLA 1X6UA 3I7QA 3A9IA 4OV9A 4XQ6A 2A7RA 5FEZA 3HPXA 1F6KA 2ZZ7A 1ML1A 2Y63A 2TSYA 3BARA 3W2JA 4CNNA 3CC1A 1W0MA 2BTMA 3W7HA 1LM1A 5BMWA 5AC8A 1GYLA 4OU1A 5D37A 2V9DA 1NF7A 3DHFA 4KKXA 1YTKA 4LU0A 1I2NA 3CB8A 1W8SA 4R7JA 3BLIA 3Q37A 1K03A 2FPYA 3W73A 4ZQPA 5AHIA 3O8AA 2C3ZA 1SO5A 5LNUA 5D32A 4O1DA 3BGJA 3H53A 3C6CA 1W5OA 1FXQA 3WK3A 1EWDA 1X1ZA 4UTWA 3I68A 4NNAA 3W74A 1N7KA 1D3GA 3PSVA 3ZS4A 4Y90A 2JGQA 1KV5A 3WFAA 3W2UA 3G24A 2X1SA 3CLMA 2UV8G 3NPWA 1H60A 2WNZA 5I3GA 2V0TA 4B5NA 4LY8A 1FCUA 1YYAA 2CLOA 3TR2A 3I7RA 1T8XA 4UMAA 1OK4A 4OHQA 1F7BA 4QM1A 3L9CA 2WV8A 4RKAA 2NXGA 1PCKA 3R5EA 1AW1A 3LRMA 2CW6A 3PM6A 3FIGA 3HJZA 3SIZA 4JXCA 3C2RA 1YADA 1XXXA 5HWNA 2E77A 3OEXA 3AJXA 2WO5A 1RPXA 3A5VA 1PHWA 2Q8ZA 3GXTA 1QPOA 3GDMA 1JQXA 4TX9A 5F2IA 4O16A 3RFAA 4WX2A 1TQXA 2Y7EA 1OVDA 3EX4A 1VHCA 4O0KA 2C16A 4M6VA 2QDGA 1WBHA 1TMHA 4LVBA 1KM4A 3LBMA 2ZFAA 3T55A 3QF0A 5TIMA 2A21A 1IF2A 4KWWA 4N4PA 3DI1A 3EX6A 3NQVA 3B8DA 1IGSA 4CCEA 4CCDA 2BXVA 3C2EA 3FEMA 1FWTA 1IIHA 2A5HA 2ZTKA 2ZRXA 3BV4A 3DKJA 1OFRA 1ONRA 1TPFA 3IIOA 3O05A 1O60A 4PL2A 4MYAA 1DL3A 3NG3A 3P62A 2Y62A 1VQTA 3W7NA 3O16A 2C13A 3R13A 2R94A 1TRIA 4ZQCA 1IXOA 5E93A 1SPQA 3G18A 3P5ZA 5L6UA 1UUMA 2CLHA 1HO1A 2V81A 3UY8A 4I9AA 1K7FA 2W6RA 4RK8A 1SW0A 5K4XA 2NXIA 4J9JA 4UTIA 3ZWSA 3NPVA 3OIXA 7TIMA 1Z42A 3TXVA 4NZJA 4UFKA 1B4KA 2QAFA 1KM3A 3NM3A 3QQ0A 3LI1A 3SFKA 1SZFA 2WSRA 3TFCA 3M44A 1B9BA 1WAUA 3JRKA 3NQMA 3EWYA 3LXAA 3TC6A 3KX6A 1JCLA 4ONVA 3S5YA 1LLZA 2FB3A 1VPXA 2JK2A 4MJMA 4LVAA 1PVNA 3L65A 1VCFA 2H8XA 2QUTA 3TFXA 4O54A 2GUUA 3SW6A 2CZDA 3IGUA 4O53A 3VE9A 4JGDA 4NU7A 4NVTA 2FPVA 3CHVA 3E0IA 1DV7A 4A3UA 3HGJA 4Q4KA 3LI0A 4JTHA 4LVFA 3MI3A 4JTEA 3MBFA 3O6CA 4UTHA 3C61A 1O94A 1B3OA 3W23A 3W2KA 3LDVA 1FCBA 3NPUA 3OVQA 3HMJG 3UWWA 2HTMA 3PSWA 1JQVA 2F84A 4GUIA 1TYGA 2ATSA 1W31A 5AC7A 1XUZA 3TXZA 2ZYFA 3MHGA 3PBVA 5I3KA 3B0VC 5CPLA 5EL1A 4WY0F 4E2DA 2EAWA 1TIMA 1F76A 4O12A 3G1YA 5DCDA 1VLIA 2IQTA 4UTWC 1JCYA 1TPVA 6ALDA 4JX4A 4MIMA 4IMGA 3WK0A 1OABA 2FDSA 1O95A 1VCVA 4AF0B 3RK8A 3CWNA 3BPWA 3TU9A 3L68A 2ATMA 4NZFA 4LOCA 1K7EA 2H6RA 4GUHA 1GPWA 4JIPA 2V30A 3QPYA 2Z0IA 3W71A 4GFSA 4WQ6A 3GXNA 4XTIA 3TX9A 1TCDA 3Q58A 4H4IA 3TAKA 3ABRA 3PBUA 4YXGA 3RNDA 3H54A 2I14A 1WX0A 2XN2A 3USBA 3LCHA 4BFAA 2CZ5A 1OF6A 1TPEA 3W1XA 4ADTA 2P1FA 4ORMA 3QH2A 4P61A 3CU2A 1GVOA 3NA8A 1ICSA 1W3TA 1K8ZA 1WOBA 4AF0A 1RV8A 3L5LA 4FXRA 4N9CA 3UWQA 1HFBA 3ABOA 4O1AA 3PULA 4DF0A 3M41A 3HO8A 1VC4A 4RJEA 2ABAA 2HS6A 1TPWA 1Q3NA 3O07A 2E5DA 3TJLA 1TPH1 1VZWA 3FOKA 3G3MA 4CNPA 5EPDA 3QMSA 2ZTJA 5I3JA 1M7OA 4O4WA 3NR0A 1W3NA 4MUZA 1G4EA 4UTTA 4HT3A 1XI3A 4MYXA 1XUUA 3R89A 1RQHA 3W87A 4CCCA 3MP3A 1N8FA 3P84A 4LS1A 1PL9A 3GKFA 2Y7DA 4UTMA 2TYSA 4XKYB 1TRDA 3LHVA 3STCA 1SQ7A 3W22A 3VE7A 3LCIA 3S0CA 4ADUA 3W1PA 3GZ3A 3G1AA 3C0JA 4HN4A 3UY7A 2J9YA 4UC5A 2I9EA 2VFGA 3RMJA 1Q6LA 1GQNA 2J9ZA 1EP3A 1LTDA 3S5ZA 1XCFA 3W9ZA 5DBUA 1A5AA 1LLWA 4CLMA 3QYQA 5GVJA 2HSAA 3T7VA 2XN0A 5F1UA 4K39A 3FJ6A 3B0PA 4W9TA 5D33A 3QRHA 3P67A 4IUOA 2ZRWA 5HR7A 3FJLA 4EF8A 2A6NA 4GRSA 3H55A 3LERA 1YXYA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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