2BLE | Genus

Total Genus 111

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	111
sequence length	343
structure length	337
Chain Sequence	MPRIDADLKLDFKDVLLRPKRSSLKSRAEVDLERTFTFRNSKQTYSGIPIIVANMDTVGTFEMAAVMSQHSMFTAIHKHYSLDDWKLFATNHPECLQNVAVSSGSGQNDLEKMTSILEAVPQVKFICLDVANGYSEHFVEFVKLVRAKFPEHTIMAGNVVTGEMVEELILSGADIIKVGVGPGSVCTTRTKTGVGYPQLSAVIECADSAHGLKGHIISDGGCTCPGDVAKAFGAGADFVMLGGMFSGHTECAGEVIRKLKLFYGMSSDTAMNKHGVAEYRASEGKTVEVPYKGDVENTILDILGGLRSTCTYVGAAKLKELSRRATFIRVTQQHNTV

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Oxidoreductase
molecule keywords	GMP REDUCTASE I
publication title	Structure of Human Guanosine Monophosphate Reductase Gmpr1 in Complex with Gmp rcsb
source organism	Homo sapiens
total genus	111
structure length	337
sequence length	343
ec nomenclature	ec 1.7.1.7: GMP reductase.
pdb deposition date	2005-03-03

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00478	IMPDH	IMP dehydrogenase / GMP reductase domain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	2bleA00

3W2LA 2FIQA 3WK3A 2Z0IA 2VENA 3UWZA 2FTPA 1YDVA 4UMCA 1SO5A 3LCGA 4YL2A 1SR9A 3O63A 4RLIA 5AHEA 3LRLA 3TA6A 3RLVA 1QOQA 2ABBA 1WYIA 1W5OA 4Z08A 1ZJIA 5D37A 3L65A 3LRKA 3PG8A 4O12A 3NO5A 2WKJA 2WQPA 1VS1A 2CLHA 1JCNA 1A53A 3Q2DA 4RK8A 1S3HA 3TFCA 1VYRA 2W79A 3T55A 3G1VA 4Q4KA 3NXFA 1E51A 5D30A 1S5TA 4FB7A 1OFRA 2OJPA 1WQ5A 5TIMA 4ZMGA 4JGDA 3P8IA 2OMAA 1OJXA 5HULA 4UFLA 5AHMA 3UWWA 2CLOA 4XTDA 3A5FA 5K7JA 3G1YA 3BK0A 2V30A 3UWVA 4O0ZA 1QPRA 1ZHAA 2C3ZA 4UMAA 1SQ7A 4ADTA 2ATMA 3G24A 1K7EA 3EX2A 4M7TA 4LT9A 4GUJA 4ORMA 1CI1A 1SSGA 2G95A 4X2RA 3YPIA 1Y0EA 1DOSA 4AAJA 1WAUA 1YTDA 2J88A 3M44A 5H91A 1XBYA 2YFNA 4NUWA 1U5JA 1UASA 4FX6M 4O14A 1SFJA 3W71A 3MI6A 4PTNA 4LNYA 5LNSA 1SSDA 2YYTA 4GFSA 4UR7A 4E2DA 3FA5A 1LRNA 2G97A 3HG5A 3IVTA 3EWYA 3PBUA 4JYEA 1H62A 4Q32A 1N55A 2CZFA 5FF0A 4ZQCA 3PF3A 1HUVA 2YX0A 4LW7A 5E0KA 4ADUA 2V82A 4MKNA 1MO0A 3GDLA 1PVNA 2RKXA 1KM1A 3P74A 4ZVJA 3NQ2A 2FPVA 3SJ3A 2PRLA 1YDNA 3EWWA 1TTJA 3BG5A 4FEZA 4L4MA 3HGOA 2TSYA 1AW1A 2A0NA 2CLLA 3LXAA 1XBXA 1QMLA 3MW7A 1LLWA 4HN4A 2CW6A 1ZY9A 5BOOA 5FESA 4QM1A 1L6SA 2XN0A 1GVFA 3P5YA 1SU5A 3STGA 4IWWA 3RU6A 3SIZA 3NGJA 3DFOA 3W1TA 4K7YA 3MYOA 2YCEA 3EKZA 3GAYA 2IQTA 3MJYA 4O4VA 3WJSA 1MSSA 2DU2A 3DFSA 3CHVA 4WY0F 2TPSA 1ZALA 2X2GA 3GVGA 5LNRA 3FJ6A 3M9YA 5I3IA 2DP3A 1YXYA 3L5LA 4O1DA 3WJWA 1VYPX 1I45A 4UTUA 1F05A 4C1LA 3PB0A 3EXSA 4WJEA 2ISVA 3F4NA 5CZJA 3QMTA 4EWND 3IGUA 2QF7A 3N2MA 4NJJA 4A21A 2YZRA 4N9CA 1XKYA 4O11A 4OV9A 1JCYA 4J9JA 4XBKA 1OFOA 3UWQA 4LV9A 1OYAA 5LNWA 5DXYA 3LCXA 4M7SA 1EP1A 2Q8ZA 2FQIA 2QUVA 2A5HA 1BTMA 2G96A 3VFLA 1TTQA 1ZAHA 5HNRA 4LC8A 3EB2A 3B04A 4CQAA 3GX9A 3LDVA 2B7OA 4O28A 3QYQA 2NZLA 1KA9F 1QPQA 1TQXA 2ZYFA 3W1NA 5TQLA 3MHGA 3PBWA 3GNNA 1QO5A 2VEIA 5EKYA 2EKCA 3N34A 4XZ9A 2RFGA 1UBSA 1L6WA 1RZMA 3NL3A 1T8XA 5I3KA 3GR8A 3PSVA 5LGXA 1VHNA 4GBUA 4POCA 4DPQA 3B03A 4UIOA 4A2SA 4WX2A 3MP4A 4PODA 3FOKA 4JTUA 4PL1A 4DF0A 3T78A 2Y63A 1RR2A 4JX4A 4HSNA 1FWSA 4UTTA 3UPBA 1GZGA 1KTBA 4MY9A 3W70A 1KLYA 3W1AA 5K4ZA 1GPWA 2YR1A 3LLDA 4JYDA 2VOMA 1LTDA 3JR2A 3PBYA 1NSJA 4QIUA 1L2UA 4R7JA 4UC5A 3IV3A 1RQHA 5EMUA 1EUAA 4DF2A 5HJLA 2E6DA 3SY5A 3TU9A 3LHVA 3WK1A 3EX3A 1W0MA 3FS2A 2FB3A 3CLMA 3LHYA 3DI1A 3MYPA 1N7KA 4FNRA 3M5VA 2DZTA 3GDMA 4A29A 1AMKA 2QCGA 3K30A 4NX0A 4UTTC 1QFEA 4NZJA 1TPC1 1SUXA 4FNQA 3E9AA 3E0IA 4HIBA 3NOEA 3NAVA 3C8FA 1HO1A 3KVMA 4YCPA 2QCHA 3C2VA 3TQKA 1V5XA 1Q6QA 4M6PA 1OFDA 1CW2A 5DN1A 4PCFA 1TRDA 2X1UA 3B0PA 3KVJA 3PUDA 4QJ1A 4CCCA 3MHUA 3QFEA 2R8WA 4AHQA 4IX0A 4UXDA 4RXGA 3CB8A 1QWGA 3BLFA 1OABA 3IIXA 5LNUA 1JQVA 1GG1A 5AHIA 3GKFA 3M41A 4Y90A 3PWAA 2HSAA 2FPTA 4TIMA 1GYNA 1YDOA 5BNKA 2YSWA 1Q6LA 2VFGA 2ZRVA 3NQDA 4LY8A 4NJKA 3WJXA 1I2OA 3A21A 3WK0A 4HNTA 4OGZA 1XUUA 1BWLA 3PVFA 1KM3A 2ZDRA 1VHCA 2TYSA 4JTJA 1AG1O 1W8SA 3LCFA 3LHUA 4O18A 2NWSA 1FQ0A 4ZL1A 2KZHA 3MUXA 4Z1BA 1XBVA 5KZMA 5IM51 3RMJA 3P61A 3C3NA 3STEA 5AC8A 4K7VA 1A5AA 3B4UA 3O6CA 3BLEA 4O15A 4ORIA 1ME8A 1TRIA 2A7RA 3W7EA 3MO7A 3IGXA 1DBTA 2ZZ3A 5D2VA 3GKAA 3DXIA 1AL8A 1M7OA 4JTTA 3TSDA 5HMSA 4DF1A 3PULA 3V75A 4O1BA 4PL2A 1UB3A 4FIRA 4DQWA 4AB4A 1RPXA 1SZFA 4DO4A 3NQEA 2B4GA 2HS6A 1HL2A 1KV5A 3OHIA 2QEZA 4O53A 3W7MA 3WFAA 1C8VA 1ZFJA 1KFKA 2H3BA 3P80A 4CQ8A 3VI2A 3OEXA 4QISA 2ZRZA 5J5DA 1EPXA 2JBMA 2X1SA 2J9YA 4MVAA 2ZZ5A 1T96A 3T4CA 4CCDA 1ZENA 3IIZA 4BF9A 3LTSA 3P5ZA 2Y7GA 3TC7A 2OCZA 3LCIA 5FI8A 4AF0A 5FEZA 5K3VA 3M1ZA 1VLWA 3L5AA 2E5BA 4M5PA 1I4NA 1DVJA 2H8ZA 2VFFA 4FX8A 5LNVA 1XM3A 2QAPA 1L6YA 1LP6A 5CSRA 4XKYA 1ZCOA 2QKFA 1XDMA 5AYYA 4JICA 2QCDB 4EVZA 2YW4A 4U4MA 4IGHA 4Z0JA 1OFPA 3MP3A 1W3NA 3M7WA 5L6UA 2EGZA 3TQ0A 1BKSA 3LLFA 2NX9A 2C13A 4QQ3A 5F2LA 3QPZA 2RDWA 2NLIA 3GXNA 2E6YA 4UFHA 1EX5A 1FCVA 1H63A 2H6RA 2I9EA 4NJIA 4HPXA 4OT7A 5CSSA 3HPZA 4YMZA 3LCLA 3M47A 1ADOA 3U6WA 1YPFA 3UZ5A 1W56A 5A5WA 3S42A 2HMCA 4G1KA 1XXXA 1VH7A 4MYAA 2WPBA 3CEPA 3S0CA 1SZEA 3HGRA 3L68A 1JUEA 1YYAA 1VYSX 2JKPA 4IQLA 2J6XA 2C0AA 2C1HA 2A7PA 2YGYA 3OG3A 4QITA 2Y70A 1X1OA 1LRQA 2QUTA 5D04C 2AAMA 5GVJA 5DELA 1O5KA 3S6DA 1RV8A 2GPTA 1NF0A 5KTLA 2OT0A 3A23A 4E0CA 3IRDA 3G8RA 4C1KA 1IF2A 4K37A 3PB2A 2ZQ0A 3DBPA 3UYCA 3L66A 5ABTA 4KFPA 4UFKA 2C6QA 4MZYA 4YLWA 3P62A 5CG7A 3W7LA 3TK7A 2A6LA 3UXDA 2ZRXA 2CLIA 3H54A 1TMHA 2ZBTA 3NQMA 1DJNA 2PE4A 2DZVA 5CPMA 3VE9A 3KOFA 1OX4A 3EWZA 3NQFA 3W7DA 1PS9A 2QDHA 3G1SA 5DLCA 1RVGA 3PUEA 1YADA 4JTGA 1TPUA 3EX4A 3S1VA 2JKEA 4UCGA 4LRTA 4NNBA 1BWKA 3NQ7A 1VC4A 4WXZA 1W5MA 4MJZA 2DJLA 3W86A 4UFMA 5G4WA 2QCMA 3EX6A 2NXGA 1QPOA 1VPXA 3IIVA 2CFFA 3GAKA 1A50A 3E96A 1Z42A 4UR8A 2QCLA 4M6QA 2V5LA 1IIGA 1SZNA 1FCUA 1K7XA 3W83A 2GQ8A 1JUKA 2ZZ1A 3KVLA 4JS3A 3CEUA 1K3UA 1L9WA 3B06A 1QR7A 4EF8A 3U2OA 4CQ9A 5F4WA 1GVSA 2A1YA 2B7PA 2E1DA 4WXYA 5F4XA 4K36A 3KAOA 1X6UA 2QJIA 1DKWA 4A2RA 5F2MA 1O4UA 4HNUA 1IXNA 1PHQA 3B05A 4IMFA 1M6JA 2CZDA 5C5YA 5FF3A 4ICNA 3TJXA 2WNNA 1YTEA 1J4EA 2F84A 3G3MA 4N9EA 1MEHA 1IXQA 1YLVA 2CLKA 4CLMA 5CGQA 4NU7A 2WNZA 1GOXA 3R2GA 2X1TA 4LOCA 4IPIA 1F76A 1UUMA 3LTYA 2V5BA 1JR1A 2VFHA 2VKZG 4DEFA 1I2QA 4ZQRA 4KFOA 3W73A 3QF0A 5CKSA 2VEPA 3TDFA 1ALDA 1LORA 2Q3OA 4LVGA 1H7XA 1GTEA 3LXBA 3C56A 3E12A 4LUIA 2Y88A 3GLCA 3W7JA 1H50A 4FNUA 3TNOA 1MEIA 5EBUA 3C4UA 3BV4A 3W07A 4ZQOA 4O0KA 5G1TA 1O94A 3NL6A 2P10A 4ZQNA 4IUOA 4O52A 4NJGA 2B7NA 3TQVA 2V2HA 3A9IA 3C6CA 3W3OA 2C14A 3BARA 4UNLA 1PL9A 3F4WA 5K9DA 4RCXA 1FCBA 2BZNA 2Y89A 3UWUA 2V8ZA 3MBFA 2VFDA 1JCMP 3ZR4A 4AHOA 3IGSA 1TSIA 3L2IA 3TJLA 1OF6A 1Q3NA 3CIXA 2DJXA 1H7OA 2Y6ZA 2QCNA 4OV4A 2ZRWA 3NM1A 4EOUA 4RV8A 1RD5A 4Y96A 4AHPA 5G2WA 5HQEA 3S9YA 2NXHA 4OU1A 1SW3A 2DZUA 5MHBA 3A24A 4RX0A 5FF4A 1QOPA 2FB2A 3TW6A 3Q94A 1GT8A 2B0MA 3HF3A 1PV8A 4YXGA 4GUHA 2Y7EA 1ME9A 3DKLA 4PFMA 2I1OA 2CWNA 5SWUA 2X16A 1K8ZA 4UTKA 3O8AA 5F2IA 6TIMA 3KX6A 1IXOA 3I68A 1I2NA 5K2ZA 1B3OA 4LS2A 3EXRA 1O95A 2JGYA 4IMCA 5D05A 1OG0A 3S5NA 3TIMA 3C2RA 4RKAA 5KINA 2ZZ2A 4W9TA 1D3GA 4X22A 3O6YX 4MUZA 3W1PA 3O06A 1I8JA 1VJIA 3DHFA 4FO4A 1G67A 5D2YA 3M16A 3TROA 4IXHA 1J2WA 5DBUA 3VKJA 1LYXA 1YPIA 1G4TA 2ZRUA 4K38A 4MJMA 3PS7A 3R89A 1KFJA 3TV8A 3SGUA 4FNSA 5FEWA 5D09A 4MFEA 5LHEA 4LVFA 5LHFA 5D03A 3QZEA 1DORA 5D2WA 1P1XA 1FBAA 1LLZA 1VR6A 2WSQA 3USBA 2ZRYA 3NPWA 3G22A 5J5RA 3DZ1A 3G18A 2H3DA 1QNVA 4XTIA 1GEQA 3W2KA 4D2JA 3SSJA 5KZDA 3CM4A 3LM7A 3L0NA 2RDUA 1R2RA 3TMLA 4LTSA 7TIMA 1F73A 2G5WA 4S1FA 2WV8A 3G1DA 1XCFA 3S1XA 4RXFA 4DO6A 4IMDA 4O54A 3S5YA 1ZNNA 3HQ1A 3A5VA 1NAL1 1A5CA 4HHPA 1RQEA 1W37A 1OYCA 4Y6GA 6ALDA 5CZ0A 3T40A 5EY5A 3S5ZA 4AWSA 3DFQA 3NPVA 1F7BA 3IIOA 4I7VA 5D2XA 1W1ZA 1KTCA 3GK0A 1HTIA 3UQNA 3C0JA 3CIWA 3W85A 2FFCA 3LCHA 4PH6A 1ZAIA 2QJGA 1G4PA 1P5BA 3QC3A 1VRDA 2YW3A 3TC6A 4JDYA 3W76A 5D02A 3VNDA 5HINA 3OA3A 1TPWA 3FIGA 1LOLA 3LX9A 1W3TA 3FKRA 2A4AA 1LRTA 4N2YA 1FDYA 3ATYA 3HG4A 2E77A 1LBFA 4L4LA 3ANYA 3BPWA 1C9DA 1LCOA 4M6VA 3DENA 4PA8A 1H7NA 1KFCA 2Z6JA 3UY8A 3PR2A 3I7RA 3DFTA 2Q3RA 1EEPA 4S2BA 2BTMA 3A22A 3W75A 2A85A 2C15A 4KFNA 5I3JA 2ZTJA 1LBMA 4AXKA 2DZPA 2GJLA 4HT3A 5LSMA 1J5TA 1LBLA 1GTHA 1GVOA 3CQ0A 1TQJA 1JVNA 3RF9A 5F2GA 1K8XA 5HUPA 1FWWA 3NPXA 1TCDA 3GYEA 3HOJA 3W7KA 1QPNA 5F1VA 1TPB1 1LOQA 3UD6A 1SW7A 4UMBA 1JCXA 1JJKA 1KV8A 1ME7A 3G0XA 1EA0A 4FXSA 4DBDA 3LGEA 5FEPA 1OX5A 1NF7A 3ABRA 2NUWA 5AN7A 4AEOA 1UCWA 4N6EA 1F5ZA 2B7QA 2ZZ4A 3HG3A 5HWJA 1RQBA 3UPWA 3TCEA 1AL7A 3NZ1A 3AJXA 3QSTA 3L0GA 3D0CA 2Q8LA 1GQNA 3KRSA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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2BLEA

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