2BNJA

The xylanase ta from thermoascus aurantiacus utilizes arabinose decorations of xylan as significant substrate specificity determinants.
Total Genus 124
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
124
sequence length
302
structure length
302
Chain Sequence
EAAQSVDQLIKARGKVYFGVATDQNRLTTGKNAAIIQANFGQVTPENSMKWDATEPSQGNFNFAGADYLVNWAQQNGKLIRGHTLVWHSQLPSWVSSITDKNTLTNVMKNHITTLMTRYKGKIRAWDVVNEAFNEDGSLRQTVFLNVIGEDYIPIAFQTARAADPNAKLYINDYNLDSASYPKTQAIVNRVKKWRAAGVPIDGIGSQTHLSAGQGAGVLQALPLLASAGTPEVAITELDVAGASPTDYVNVVNACLNVSSCVGITVWGVADPDSWRASTTPLLFDGNFNPKPAYNAIVQNLQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords ENDO-1,4-BETA-XYLANASE
publication title A Family 10 Thermoascus Aurantiacus Xylanase Utilizes Arabinose Decorations of Xylan as Significant Substrate Specificity Determinants.
pubmed doi rcsb
total genus 124
structure length 302
sequence length 302
ec nomenclature ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date 2005-03-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00331 Glyco_hydro_10 Glycosyl hydrolase family 10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2bnjA00
3J7HA 1R8LA 1G1YA 3A3HA 1GOWA 4EE9A 3RPMA 3WBAA 3F5KA 1JAEA 2WVUA 2YLLA 5ABGA 2J8GA 3AIRA 2CESA 3ALGA 1E56A 4AISA 1NWTA 3UR8A 1J10A 2YL9A 3ARWA 4HZ6A 2J62A 3RILA 1MXGA 2ZUTA 4GXPA 2AMGA 5IHRA 1V3KA 2D0FA 3CUGA 4P8WA 1CTNA 1U30A 4UOJA 2DSWA 2OSWA 2XFRA 1GOOA 4D6JA 3ZO9A 4CU6A 3PZQA 2XVPA 3ARSA 3WENA 3MMUA 1NH6A 3VIPA 5CPTA 4F79A 1BPLB 1UUQA 3AMGA 2EPNA 4HOZA 4FF5A 2HVMA 1J0ZA 3VNZA 2BHZA 2WSKA 4ZENA 4NF7A 2Y8KA 2XIIA 4IISA 1WE5A 1L0PA 1ISXA 1VFUA 5I79A 1TR1A 1QNRA 4M81A 4B9YA 1UQYA 2WNWA 1B3VA 2DT1A 5D8WA 3GZAA 4GI8A 3WQ6A 4W93A 2Y5EA 3N17A 1H0IA 4DUWA 2GJXA 4NRRA 5BROA 5C8BB 1C7SA 4PMYA 3KL3A 1KR1A 1R7OA 3CMGA 4UTFA 1E0VA 4UCFA 2FGLA 3NUKA 2E3ZA 1JFXA 1HJVA 4M56A 3ZJ6A 3PZGA 3KL5A 4UQ9A 5DT7A 1PJ9A 4PUEA 3VIOA 4MAVA 2WKLA 1QW9A 1JXKA 3GNOA 3GBDA 4LXFA 4B3LA 4MB3A 3WUBA 3THCA 2GUYA 4W7VA 1UZ1A 4JL1A 1UR1A 2CBJA 4HU8A 2WHKA 5A8NA 1GNXA 2WMKA 2XVNA 3SUTA 1V02A 1KXQA 4DUXA 3AYRA 1BYCA 2PWFA 4Q22A 1G94A 3VM7A 1UD2A 3SCQA 4OBRA 2W67A 1G9HA 5IFTA 4EAMA 4JCLA 3W38A 2ZWYA 3PZVA 4D6GA 3QOKA 4OKDA 4CVUA 2DH3A 2E8ZA 2WMFA 2ZUUA 1GONA 2J7HA 2DIEA 3O6AA 4DM2A 4XUYA 4Y7EA 4GZIA 1J11A 1HJQA 3T0AA 1NQ6A 2BVYA 4TXEA 4GI6A 2VL4A 2WMHA 5JBEA 5FL0A 1KCLA 3ZOAA 1DWHM 1SFSA 2YA1A 4ZE4A 1XH1A 2VCBA 2ZOXA 3VGHA 1VBUA 3AMKA 3L4TA 4YN5A 3WMBA 3WEOA 3WFLA 2ZX5A 4H7VA 3EDFA 1QNSA 3QGVA 1CGYA 4V28A 4B9ZA 2DH2A 3WDIA 3WMCA 1UG6A 4FMVA 1OINA 4HOXA 3T2PA 3ARVA 1UR0A 2WVSA 4BQ2A 1JZ6A 2YL6A 1HKKA 4JKKA 4A3YA 1XH0A 1E1FA 3NJ3A 3AFBA 2YBTA 3MS8A 2X0HA 3BMVA 1HP4A 2FHFA 1V0MA 4PTVA 1ZJBA 1V3MA 3CGTA 3WNPA 3WELA 1XYZA 4J3XA 1PIGA 1E6NA 1QHZA 4PCTA 1BVZA 4AZGA 3OZPA 1OIMA 4XZBA 1W1PA 2O9TA 4OOZA 3PHAA 5C71A 2WMGA 3B9DA 7CGTA 2Y8VA 2FHCA 4U2ZA 1QHPA 4ZEPA 4HA1A 3W53A 1WCGA 2VVNA 1D7FA 1GQIA 2CKSA 2QPSA 5DO8A 4AY1A 2F8QA 1BHGA 1UQZA 2XJ7A 3AHTA 5LA0A 4MJ4A 3AHXA 3AICA 1BG4A 3RCNA 2D24A 4ATLA 5FCZA 2CEQA 1KGUA 4TTGA 4GQRA 2WK2A 1ZU8A 5JIWA 3WUEA 1XRVA 4F9JA 1E72M 5CSYA 1E4IA 1C90A 4WJXA 4IPNB 1HJUA 4KRTA 4UFLA 4XX6A 3CBWA 1VEOA 3GXMA 2EQDA 1JD7A 3ZJKA 1W2VA 1L8NA 2ZUNA 1WB0A 4PMNA 5GQBA 1WPCA 2WKGA 3UESA 2PI6A 2JF7A 3LPFA 4MDOA 1K9DA 2V3FA 5A8MA 1VRXA 4ACYA 4EANA 4J7RA 2VT0A 3BLKA 1WP6A 2EEXA 3WF0A 3IAPA 1CGUA 4W5ZA 1EGZA 4UFJA 1K9FA 3CHCA 2J79A 1SR0A 4B3KA 3ZR6A 1UR9A 1E5NA 4D6EA 1J12A 2IXVA 2GVYA 1ZL1A 2XWDA 3L2MA 3CMJA 4D1IA 2VZSA 2CETA 1V3JA 1WO2A 1E6QM 3RIKA 3WQWA 3UR7A 2PWEA 3VINA 1JZ7A 2ZUMA 1S46A 4PRWA 3G6LA 1HP5A 1NP2A 4M8UA 4H8VA 5DF0A 5I3DA 2V38A 3EYPA 3SCNA 1FP9A 2ZX8A 2VX6A 2XPKA 1VIWA 3A4XA 3AI0A 4GO8A 4HA4A 1PPIA 1MYRA 3VDCA 1LQ0A 1B3XA 4AEFA 5EMYA 5CLTA 4E4PA 1QI3A 2BVTA 4PSPA 5HDRA 3N1AA 3M07A 1C7TA 1W9BM 3HU7A 3PZTA 3CZGA 3QHMA 5GNXA 4ATDA 3BAWA 1DTUA 5ABEA 2WMIA 1EDTA 3W28A 3AROA 1E6XM 4P7OA 4Z2IA 2JEPA 3NSXA 3F5LA 3MANA 1VJZA 2YJQA 2UY4A 3N04A 1ISYA 3IAQA 4TUFA 5FD0A 4LGXA 1EO5A 3VDAA 1E55A 5A6BA 4W8BA 1JZ3A 4QAWA 5EFFA 1CNVA 5A69A 1KXHA 4PEEA 1RP8A 1M04A 2HISA 1EA9C 3CTTA 5KEZA 1NM9A 3SCOA 2YDSA 1K9EA 2WM0A 3WUFA 3CUIA 4HMEA 3QR3A 2J7EA 1CGTA 3D5HA 1BF2A 1PBGA 3PBGA 1MFVA 3MO4A 4JKMA 1BG9A 1VBRA 1CZ1A 1JI1A 2CPUA 3SCPA 1GHRA 3VIGA 1LLOA 3FAWA 5A3HA 5BWFA 3U7BA 1PZ3A 3VDHA 3EDJA 4CGTA 4GKLA 3B8SA 4H41A 2BXYA 3VD3A 2VZTA 2NSXA 3FN9A 3LPGA 3WNOA 5FKYA 4H04A 1DWGM 3T2OA 4AWEA 1C91A 2WYSA 3PTMA 2VJXA 2VNCA 1UOKA 3LPPA 2UY2A 3TONA 3PZIA 1OWQA 4W5UA 5I5RA 2BNJA 2PB1A 1MW2A 3BXWA 5HXMA 2ZICA 4L4OA 3WQ8A 3GH7A 5CG0A 2CBUA 1NWUA 4JKLA 1H0GA 3L4ZA 5I77A 3WQ5A 3AXXA 1MQPA 2FGZA 5CSUA 1EDGA 4KMQA 2WCGA 3CUHA 3PZMA 4C7GA 1H4PA 3VMNA 5KZ6A 1F4HA 1UWTA 1CECA 2ZE0A 2JE8A 1GJUA 4N42A 4UQAA 3BLPX 4F9DA 4TVUA 1JZ2A 3SCSA 4YHGA 2OWCA 4HZ8A 2VO5A 4DM1A 4D6DA 2E4TA 1XD0A 3ZT6A 1FH9A 1E70M 2F2HA 3DYMA 3K4AA 4MPKA 1UWSA 2E9MA 1W3KA 1QI2A 3CZLA 1KBBA 1H5VA 1TUXA 5EBAA 3W37A 3GXFA 1F4AA 3GBEA 1Y7VA 4BA0A 1DWAM 1QVBA 1W1VA 4CN6A 4IM4A 4M24A 5HPOA 3BCDA 3VDBA 2ZUWA 2ZXQA 2EPKX 1HT6A 5A6JA 1HL9A 1MW0A 3VU2A 1EQCA 3AIUA 1TCMA 1CGWA 3BAXA 3VVGA 2VX5A 2Y2WA 4NRSA 4HP5A 4UQCA 4W85A 3ARTA 1CENA 1HKMA 2DT2A 4HTYA 3SUSA 5JIPA 3MV11 2Z1KA 1XSKA 4U5IA 4PTXA 1XGZA 4PMDA 1UA3A 3WNKA 1E15A 1H49A 5M03A 1ZBWA 3NYDA 1DWFM 1Q4NX 3GNPA 1JDDA 5FL1A 2D1ZA 1NWSA 1H41A 1KQYA 4HMCA 3SCRA 3PZ9A 1GORA 3AOFA 2J4GA 1OGSA 1UD6A 3VIFA 1LWHA 1QOXA 2YLAA 3WD2A 2D20A 1VFOA 1NP0A 1ITCA 1GPFA 3WNMA 2DSZA 5I2UA 1E4LA 1G01A 5HOSA 1MW3A 3FNDA 1W1TA 5BXPA 2FDMA 3VILA 1JYNA 3CZJA 4GIAA 2WBGA 3GM8A 2D3NA 4K68A 4X0VA 3WBEA 3VGEA 1E1EA 3ARQA 4TTUA 1M01A 1QNOA 3TOPA 4GZEA 1V6VA 4LX4A 3HN3A 4WSKA 2WVTA 1MXDA 4U31A 1IV8A 1QHOA 3PTQA 2CKRA 4PMUA 1P6WA 1UWQA 1D2KA 1EIBA 1Q6CA 2XFFA 3IK2A 2WPGA 2ZX6A 2VQTA 3FHQA 1J0JA 3MKKA 2CNCA 5E09A 2VZOA 4JFSA 4CD5A 2DT3A 4HMDA 1A47A 5DEZA 4AZIA 2J74A 3OLEA 5A6SA 3DYOA 3AQUA 1W9VA 3ZSSA 2XVKA 4L4PA 4B15A 3EMCA 3AYSA 1MWOA 4M82A 3OLIA 3ALFA 2XUCA 4AIUA 4GI9A 1IZJA 1E40A 2XYLA 1X6NA 2J47A 1HF6A 4P7QA 4AD0A 4DWSB 2VI0A 1OT2A 2W91A 2V3DA 4AZ7A 4ACZB 4AMCA 3FHAA 2DT0A 4UOQA 1W3LA 4NSBA 5BXRA 1EOKA 5JUVA 1JAKA 2YDQA 3EDDA 4QCEA 1Q6EA 3BCFA 2CBVA 1TZ7A 3IJ9A 4CU8A 1E43A 3AHVA 1C93A 2YIHA 3AS2A 1JZ8A 1MVYA 3A4WA 2EJ1A 2J25A 2WCAA 4PMRA 2Z1SA 4ZE5A 2W4XA 1CXFA 4R5EA 2D0GA 1JF5A 2CHNA 1JG9A 4MB1A 2PBOA 1LF1A 5IFPA 2G3MA 2BHUA 1J0YA 2AOSA 4YHEA 2YA0A 1PX8A 3PN8A 1WAWA 3W0KA 1W3JA 4W88A 4GINA 1QNPA 1UWRA 3SURA 1NARA 2WC3A 2AAAA 2OYMA 3VIKA 1BVNP 2E0PA 3WF3A 1UR4A 1YQ2A 3W4RA 3L4UA 3POCA 1WDRA 3S2CA 1E5JA 2J75A 1Z32X 2DSVA 1C3FA 2G3JA 3O2LA 1HJXA 2O92A 3A6OA 3CLWA 4P8UA 1MQQA 2WC7A 5ABFB 1HNYA 3SUVA 2GDUA 4C7DA 4H2CA 2OYLA 3K8MA 1VF8A 1UZ4A 9CGTA 4GQQA 3SCUA 3SCWA 3VD5A 2BVDA 3N9KA 1UD4A 3DHUA 5A1AA 1J0KA 4U3CA 1LL6A 3OB8A 3VMOA 3ARRA 3VUPA 2GDVA 3WN6A 3AS3A 4J3UA 1ISZA 4AD2A 1TG7A 2VTFA 1B9ZA 1M7XA 1XYFA 4N0RA 3WD4A 2VR4A 4W7WA 4U2YA 1J9YA 4XB3A 3OGRA 5FOOA 4AIOA 1XHGA 5HBFA 4CCDA 5TD4A 4W89A 1UKPA 1NOUA 4JCMA 1NOWA 3I3EA 1WKYA 3VNYA 3N11A 3WDPP 1Q6FA 4RE3A 5A8QA 1HKIA 3WDRA 1KXTA 1B2YA 8A3HA 5CLWA 3W26A 3AMLA 3W6LA 1FP8A 5BRQA 3G6MA 1KQZA 2PWGA 2PWDA 4LYRA 1OCQA 1M03A 3AIQA 2GJRA 3W82A 1WZAA 3ZJ8A 5F7UA 4UFIA 2CYGA 3VPLA 1JNDA 2ZX9A 1JI2A 2VX4A 5CGMA 3NIYA 1WZMA 1W1YA 3U5UA 3RJYA 2X09A 4W8LA 1CLXA 2V5DA 4UR9A 5I23A 5E9AA 1JDCA 3WY1A 4P7LA 1Q6GA 1VB9A 2C7FA 2UY5A 2NT1A 4WLCA 1UD3A 1QBBA 2WC4A 3UERA 2E40A 2QF8A 1X6LA 1CXEA 5HPCA 3DYPA 4WIWA 3WH8A 1OD0A 4S3KA 1V6UA 4BS0A 2WB5A 4NI3A 3KE0A 1JF6A 1I1XA 2VR5A 4HU0A 3MSDA 3AIEA 3NDZA 4XZWA 4HA3A 4W86A 1GZJA 1H11A 3K4DA 2WVVB 5AY7A 4AZ5A 2E8YA 2XWEA 2A3CA 4H8HA 3OIHA 4PCSA 2DQXA 4MTVA 4OIFA 3CHDA 5A2AA 1R87A 3N15A 3MUY1 1W9UA 2CXGA 5DT5A 3OG2A 4UQEA 1BAGA 1HVQA 1V6YA 2UWFA 3WNLA 5C70A 2D23A 3AIBA 4R27A 3WNNA 4MNKA 4XV0A 2BFGA 3ZJ7A 1FA2A 3WQ4A 3VKKA 4V27A 1TA3B 2ZXDA 2JF6A 1CXHA 5E70A 1ODUA 2VMFA 7TAAA 4D6HA 4QLKA 4X0NA 3L4VA 3W24A 4UFKA 1U33A 2BS9A 6A3HA 1W9XA 3AIWA 1E3ZA 1VEMA 3ARYA 1OB0A 1ESWA 4AZCB 3NSNA 2WHJA 2OWWA 1M53A 5AC5A 4PN2A 1EHAA 1J0IA 3AS0A 5GPRA 1UWIA 4QFUA 1PIFA 1JDAA 2BY3A 1RD6A 1H3GA 1PX3A 3GDBA 2YL8A 1HX0A 2EBNA 2E9LA 4MDPA 3UETA 2V5CA 3CUJA 1G5AA 2WZIA 4PMVA 3WMSA 3K1DA 2TAAA 1H1NA 1I75A 3MUAA 1DWIM 5GNZA 3KEHA 2DGAA 2EPMX 3U7VA 4JZ5A 2QV4A 1B3ZA 1UHVA 2XG9A 3QOMA 3ECQA 3LMYA 3AHYA 2A3EA 4C7FA 3UG4A 3MUZ1 4J3TA 2OSYA 3TTQA 2WHLA 5DFAA 4QLLA 3A47A 1TVPA 1V0NA 2X0YA 2NW0A 2YOCA 3ARXA 3TTYA 4W8AA 3T2QA 2YDRA 4EKJA 5E0CA 2W5FA 2BV9A 1U2YA 4FLOA 5JBDA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3J7H A;  1R8L A;  1G1Y A;  3A3H A;  1GOW A;  4EE9 A;  3RPM A;  3WBA A;  3F5K A;  1JAE A;  2WVU A;  2YLL A;  5ABG A;  2J8G A;  3AIR A;  2CES A;  3ALG A;  1E56 A;  4AIS A;  1NWT A;  3UR8 A;  1J10 A;  2YL9 A;  3ARW A;  4HZ6 A;  2J62 A;  3RIL A;  1MXG A;  2ZUT A;  4GXP A;  2AMG A;  5IHR A;  1V3K A;  2D0F A;  3CUG A;  4P8W A;  1CTN A;  1U30 A;  4UOJ A;  2DSW A;  2OSW A;  2XFR A;  1GOO A;  4D6J A;  3ZO9 A;  4CU6 A;  3PZQ A;  2XVP A;  3ARS A;  3WEN A;  3MMU A;  1NH6 A;  3VIP A;  5CPT A;  4F79 A;  1BPL B;  1UUQ A;  3AMG A;  2EPN A;  4HOZ A;  4FF5 A;  2HVM A;  1J0Z A;  3VNZ A;  2BHZ A;  2WSK A;  4ZEN A;  4NF7 A;  2Y8K A;  2XII A;  4IIS A;  1WE5 A;  1L0P A;  1ISX A;  1VFU A;  5I79 A;  1TR1 A;  1QNR A;  4M81 A;  4B9Y A;  1UQY A;  2WNW A;  1B3V A;  2DT1 A;  5D8W A;  3GZA A;  4GI8 A;  3WQ6 A;  4W93 A;  2Y5E A;  3N17 A;  1H0I A;  4DUW A;  2GJX A;  4NRR A;  5BRO A;  5C8B B;  1C7S A;  4PMY A;  3KL3 A;  1KR1 A;  1R7O A;  3CMG A;  4UTF A;  1E0V A;  4UCF A;  2FGL A;  3NUK A;  2E3Z A;  1JFX A;  1HJV A;  4M56 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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