The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
18
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sequence length |
66
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structure length |
66
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Chain Sequence |
MGLKWTDSREIGEALYDAYPDLDPKTVRFTDMHQWICDLEDFDDDPQASNEKILEAILLVWLDEAE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Iron binding protein
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| molecule keywords |
PROTEIN ISCX
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| publication title |
YfhJ, a molecular adaptor in iron-sulfur cluster formation or a frataxin-like protein?
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Escherichia coli
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| total genus |
18
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| structure length |
66
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| sequence length |
66
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-08-22 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF04384 | Fe-S_assembly | Iron-sulphur cluster assembly |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Arc Repressor Mutant, subunit A | IscX-like |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1UJ8 A; 2BZT A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2I10 A; 2P81 A; 3L00 A; 5BQT A; 1OFC X; 4RAY A; 4M6Y A; 1V55 H; 1R4M B; 2BY2 A; 4HX8 A; 1ON2 A; 5H20 A; 3KZZ A; 4R8H A; 5FLM J; 1IC8 A; 1IXS B; 2LP0 A; 3V8J A; 1O57 A; 3PO3 J; 2EV0 A; 5AON A; 1R00 A; 4Z2Y A; 3TED A; 2Z2S B; 1YJN I; 1A36 A; 4AU7 A; 1ZKG A; 3BZ6 A; 4PJM A; 2PFB A; 4AM3 A; 2Q2E A; 2JPB A; 3GTP J; 5LBQ A; 2VQL A; 2KFD A; 2O61 A; 1YX3 A; 4HQE A; 2K9S A; 2FA5 A; 1UG0 A; 2HWV A; 5JVT A; 1BC7 C; 3FBN B; 1ZAO A; 2ME6 A; 1XDS A; 2HYF A; 3HRU A; 4KFC A; 3HSE A; 2EIM H; 1ETO A; 2D1H A; 1K61 A; 2GXG A; 3DV8 A; 1UHS A; 3OIO A; 4E7H A; 5J1R A; 1HSJ A; 5E8I A; 1Y39 A; 3F3X A; 1O4X A; 1I1S A; 3DBR B; 4E6K G; 3LMM A; 1YLF A; 2HTS A; 4AID A; 4OIQ F; 4KN7 X; 2ZJP F; 3DEE A; 3K2Z A; 3QPL A; 2FBH A; 2KKO A; 3CC2 I; 1S5L C; 1IUF A; 2XAQ A; 4A3B J; 4JX6 A; 3E0J B; 1OKR A; 2XAS A; 3ERE D; 2VIX A; 4BL0 B; 3HHG A; 1R7J A; 3E6B A; 2JA8 J; 2A68 F; 3PL8 A; 2BV6 A; 1ENH A; 1HQC A; 2P5K A; 2O7O A; 3OL4 A; 3GLX A; 3OYE A; 3WE2 A; 2R7T A; 3CP2 A; 3FM5 A; 3L09 A; 5EYR A; 2F5D A; 4M9X A; 1PUF B; 3X2Q H; 1JKR C; 3BR2 A; 2AHQ A; 3Q9S A; 4D0P A; 3IH3 A; 4ETS A; 5H6Q A; 5JI6 A; 4C3I J; 3OS1 A; 1ON1 A; 4AVZ A; 1IJW C; 4G7H F; 3DCF A; 4ZTF A; 4XLF A; 1H8A C; 2HYJ A; 4L0Z B; 1KGS A; 4KYW A; 1CQT A; 1SAX A; 4F93 B; 1B9N A; 4M6V A; 3S1N J; 2KRH A; 1W5S A; 4XQF A; 2V6C A; 3I55 I; 1W1W E; 4N9I A; 3I56 I; 2STW A; 2KZG A; 3SDB A; 3DKY A; 2VOD A; 3QAH A; 2BY3 A; 1VFC A; 3BCA A; 3OYI A; 1BOB A; 4RAZ A; 5JLX A; 2L7M P; 2CQ7 A; 5LRR A; 4ESF A; 2HVS A; 2E5N A; 2V9V A; 4UXN A; 4A3L J; 2QF7 A; 4HNV A; 3QYB A; 4A5M A; 1ERD A; 1FSH A; 1JTX A; 2WAQ N; 3G73 A; 1VQ5 I; 2E2I J; 1SAN A; 3K4N A; 2RKH A; 3TGN A; 1IUY A; 3DPU A; 2HDW A; 2QQ8 A; 4KIG A; 3WTV C; 4LGW A; 1TTY A; 4ENN A; 3IH4 A; 3VYU B; 1BIA A; 2K9Q A; 5IP7 J; 1FBU A; 1WH5 A; 2IRF G; 3IKV A; 4MFE A; 2M45 A; 3KZI C; 2K85 A; 2LTP A; 4IQJ A; 1U6G A; 4Y15 A; 2MC4 A; 2Y75 A; 3SZP A; 2PMZ N; 2IXS A; 1K4T A; 3PUF A; 4OAZ A; 5LGU A; 1MNM C; 2MH9 A; 2OV7 A; 3CO7 C; 1LDD A; 4F7Z A; 1MBE A; 3N05 A; 4XOR A; 1MSE C; 2CUZ A; 1ZG5 A; 3O8H A; 1HW1 A; 3LSP A; 1HW2 A; 1YQA A; 3OMY A; 1S7A A; 2XUB A; 2GA1 A; 1GT0 C; 5DCM A; 3SEZ A; 1MMS A; 4M9S A; 4CGZ A; 4BKX A; 3WU2 C; 5C4J J; 2Y0M A; 4I99 C; 3LAJ A; 4PFO A; 2R7W A; 1WVR A; 3KIO A; 2XAU A; 5J4V A; 3BWG A; 1A6Q A; 5FGM A; 3ZMZ A; 3K4B A; 1QVU A; 1Z7L A; 2E36 A; 2CWE A; 2CO5 A; 4HX4 A; 3WTS C; 3OS0 A; 3JRH A; 3M8F A; 1AKH A; 3FXL A; 1Y8Q B; 1R1U A; 3ECO A; 3I4M J; 2EJR A; 1XGS A; 2ISZ A; 1FYM A; 2E7W A; 4NUB A; 1RC9 A; 3MAJ A; 4ZYA A; 1WJD A; 3FXU A; 3LQQ A; 3ZGK A; 4PJN A; 5E18 F; 1W4M A; 3DFG A; 2OPT A; 3ML6 A; 4U87 A; 3IP4 B; 3LA2 A; 4B47 A; 5K5Q A; 2FQ4 A; 3WG7 H; 2KQR A; 2L54 A; 3PO2 J; 3BT9 A; 3MVP A; 1LUJ B; 3CUO A; 3DXJ F; 3TQN A; 4BQN A; 3KP4 A; 4RA2 A; 3WGH A; 1R49 A; 5DCF A; 4XLA A; 2CG4 A; 1SD6 A; 4BJT A; 2KMU A; 1IRG A; 1P92 A; 3ONQ A; 2MC3 A; 3E7L A; 2LRD A; 1OCR H; 1NHA A; 2WAQ A; 3CJQ B; 3BTI A; 4HDU A; 2XHK A; 1L0O C; 4ZZD A; 2CYY A; 2HU9 A; 4BQO A; 4A69 C; 2ID3 A; 1I3A A; 4C2U A; 2ZXI A; 1Z21 A; 4GO1 A; 4LK1 F; 1X58 A; 3S3O A; 4O3M A; 5K5R A; 2HZT A; 3C18 A; 2DOE A; 2M0C A; 3DWL E; 3GCM A; 3HOU J; 5D5W B; 3VFZ A; 3ABT A; 5FKN A; 1U0J A; 2V1U A; 4AD9 A; 1QU3 A; 4ASN A; 3FM3 A; 1FBS A; 3ZN1 A; 1X19 A; 4LD5 A; 2HPI A; 3ZQC A; 2A6T A; 2JVH A; 1EKE A; 1XN7 A; 4IKF A; 2EFN A; 4M74 A; 2R7S A; 4A0X A; 2XRO A; 1HCR A; 1R36 A; 3RKQ A; 5EG0 B; 3SXY A; 2EPF A; 2DA3 A; 4IHW A; 2W24 A; 1XTA A; 1FX7 A; 5E20 A; 2HS5 A; 1TWH J; 3L9F A; 1PUE E; 4V2F A; 4IHT A; 2PI0 A; 3OYL A; 1QHG A; 4N9H A; 2MH2 A; 3HBL A; 1VZ0 A; 5J1Y A; 5KNL A; 4XLC A; 3JTH A; 2CQQ A; 5FKO A; 2CUF A; 5EGO B; 4B43 A; 3HTS B; 3OS2 A; 2I5U A; 3KLN A; 4ZYE A; 2WAF A; 1BI1 A; 2CGP A; 1AA7 A; 2B7E A; 3DPT A; 4FET A; 1T56 A; 3WU0 A; 1SD7 A; 4HBL A; 4A0Z A; 2IS4 A; 2DT5 A; 3O8G A; 3EDP A; 1QZY A; 1LVK A; 1WJC A; 2Y69 H; 4IPA A; 2E60 A; 2X0L A; 3OYC A; 3PNT A; 3GO5 A; 4P9U A; 3OSF A; 4MIM A; 4F52 A; 3FMS A; 4M3E A; 3S1Q J; 4HNU A; 2L02 A; 3PFI A; 2XGC A; 4XLE A; 1RPW A; 1ZGA A; 1JXS A; 3HOY J; 4PDK A; 1A5J A; 4UB8 C; 1IN7 A; 2VKD A; 1WCM J; 2HXO A; 1A31 A; 3LSI A; 3CCV I; 4DQ2 A; 4XIC A; 2WA0 A; 1MBH A; 5IY5 H; 3UKG A; 2DJI A; 4ENM A; 1QPI A; 2HGC A; 2DN0 A; 4KT5 C; 1QNT A; 2E7X A; 3C2H A; 5HLI A; 4B3X A; 3OYB A; 1FY7 A; 1Z0X A; 1K6O A; 5KVR A; 2EB7 A; 4BHB A; 3S15 J; 3CCM I; 3KYL A; 3LL7 A; 3LSJ A; 1ZRE A; 1O7L A; 5JHU A; 3TW7 A; 1B59 A; 1ETK A; 1IDY A; 1Z91 A; 3FHN A; 5IP6 A; 5FFZ A; 3FXQ A; 2VB6 A; 4D7M A; 1WFX A; 4O5V A; 4HLY A; 4A3K J; 2E1O A; 3ZQF A; 1N25 A; 2DAO A; 2ZME C; 3BOQ A; 4J01 A; 1X3Z B; 3PM1 A; 1MD0 A; 1ZRD A; 1IRF A; 2JWT A; 2D2W A; 4KIC A; 3KCC A; 4FIS A; 4FQG A; 5FLV A; 2M1B A; 1R23 A; 3ZMS A; 3F6O A; 4Q48 A; 3WTY C; 2K4B A; 2RC4 A; 3K70 D; 3P9I A; 4H0E A; 2D1V A; 1C0W A; 4HRI A; 1TBX A; 3HOW J; 2COB A; 3ZQG A; 1P7J A; 2HOA A; 3IWF A; 2CMP A; 3I5U A; 2OBP A; 4RBO A; 3BR5 A; 2BW3 B; 4M3G A; 2Y9Y A; 2L3D A; 5FRN A; 4I7H A; 4PK4 A; 4C30 A; 2IVM A; 3PSF A; 4BUP A; 2CQX A; 1MMN A; 5K7H A; 4IOC F; 5L3G A; 4R1H A; 3CCS I; 4ZH4 F; 3S2D J; 1B1B A; 1GV5 A; 3HJE A; 1WQ2 A; 4DYC A; 1JKO C; 3OYH A; 1TQP A; 2EZK A; 2JZY A; 3M7G A; 3QPT A; 4KN4 X; 2M4G A; 1LJ9 A; 1CGP A; 2VUM J; 3BTJ A; 3FK6 A; 4I0B A; 2K27 A; 3G71 I; 1HDD C; 4HF2 A; 1V4R A; 4XOP A; 4OIN F; 1IV6 A; 2BVM A; 1UST A; 1MW7 A; 1JHF A; 3GLL A; 4BJ6 C; 4U7D A; 3H3V K; 1W7P D; 2XF7 A; 2JA6 J; 4YG2 F; 1FOW A; 9ANT A; 1P9Q C; 1MND A; 2X6Y A; 4NC7 A; 2CJJ A; 2WB1 N; 4CCM A; 3CES A; 2MYS A; 2K7L A; 1Z67 A; 3CCR I; 1FOY A; 1POG A; 2QM3 A; 5EZG A; 2EIJ H; 1BOA A; 1YJW I; 4CDG A; 3MZY A; 2BW3 A; 1XS9 A; 3HG9 A; 4U0V A; 3E5U A; 2QUF A; 4CZC A; 2LK2 A; 2IW5 A; 1Y6I A; 4E7Z A; 2FD5 A; 2W00 A; 3BG3 A; 4AYB N; 3JRD A; 2EA2 A; 3C7J A; 3IV5 A; 3BG9 A; 3K1M A; 5F04 A; 1P2F A; 1XMA A; 5F0F A; 1K6Y A; 2QWW A; 2R3S A; 4D7N A; 4XKC A; 3F8N A; 5E17 F; 2LDU A; 1E17 A; 4IHS A; 4P55 A; 2K4J A; 2K9L A; 5DTD A; 4HSR A; 2PN6 A; 1D1C A; 1R1T A; 2UXX A; 5JR3 A; 2FEZ A; 2LRE A; 2IGM A; 2DK8 A; 4GGG A; 4HG2 A; 3DKX A; 1VQK I; 4P1W A; 3WHC A; 2PEX A; 3LSM A; 3ZPL A; 1R9T J; 1JE8 A; 4G94 A; 1P6R A; 2JA2 A; 3GFL A; 3GYH X; 2B9S A; 1XCV A; 5CVI A; 2A6H F; 1R5H A; 5HS9 A; 3P9K A; 3WHB A; 2GM4 A; 1FTZ A; 3IC7 A; 1YW7 A; 4EJV A; 3MKY B; 3F8B A; 1BA5 A; 2VJ5 A; 2W48 A; 2EK5 A; 3FXR A; 2FNA A; 2VXD A; 4KA4 A; 3M3Y J; 4EQQ A; 4LIT A; 3LNQ A; 1SEU A; 1RR7 A; 2VBZ A; 2XPU A; 3ZR8 X; 2KIS A; 1RR8 C; 3DP7 A; 2E2H J; 1KQ8 A; 1OR7 C; 3FHZ A; 2RNJ A; 5ILU A; 2ZSH B; 3PQJ A; 2DT7 B; 1MH3 A; 4UB6 C; 3HKZ A; 2IAI A; 4G12 A; 1ITY A; 4BE0 A; 2M8E A; 3EUH A; 4JX5 A; 1MBF A; 1W7P B; 1RI7 A; 4NC8 A; 5JFR A; 5GPC A; 3PNV A; 3DQV C; 1OYY A; 3V4G A; 1J0R A; 2XAH A; 1NK3 P; 2AO9 A; 5HOD A; 5IT9 Z; 4A6D A; 1R5I D; 2H8W A; 5JHF A; 1YW9 A; 3TKY A; 1SMY F; 3ASN H; 3MFK A; 2LNB A; 1VQN I; 1X1C A; 3W2V A; 2E2J J; 1KU9 A; 4D5C A; 3QOE A; 1QBJ A; 1I6H J; 4UUS A; 5CVJ A; 1OMI A; 2H6B A; 4L5J A; 2QSG X; 2E5Z A; 5HVQ C; 1XX5 A; 2CSO A; 2BY0 A; 5AIQ A; 1NK2 P; 3IHU A; 2WB1 A; 2IGO A; 3I4N J; 1ZK8 A; 4EV0 A; 4EGZ A; 4V2G A; 3IRR A; 1GDT A; 1Z3Y A; 2ELH A; 3CDL A; 3HC7 A; 2GIZ A; 1TQM A; 4MLO A; 3RPU A; 2YX4 A; 2HZD A; 2M87 A; 5IPA A; 3G3Z A; 5DDG A; 2J5O A; 5B5E C; 1Z6R A; 1J5Y A; 2F4O B; 4AYB A; 4NBQ A; 2HQ5 A; 2LY9 A; 2W25 A; 2DOF A; 2ME0 A; 4UNO A; 2BGC A; 3CUQ B; 3JRA A; 3BG7 A; 4IOA F; 4CXF A; 3E6D A; 3ZXS A; 1ETV A; 1RET A; 4Y33 A; 4PSX A; 5HLH A; 1QGP A; 3I71 A; 4FE7 A; 5TGT A; 3IRQ A; 1U8B A; 2D45 A; 1DU6 A; 2OAZ A; 2QEX I; 2K02 A; 1G59 A; 3S1M J; 2VJ4 A; 2P8T A; 3GTO J; 4DZP A; 2B63 J; 2W84 A; 4ZYH A; 1KYZ A; 4UV9 A; 3Q0V A; 3V8K A; 3CDH A; 3RI4 A; 3LFU A; 1HA8 A; 3RKY A; 1S7E A; 2R92 J; 2Z16 A; 4EJT A; 5IT9 K; 3F8F A; 2C6Y A; 1GLN A; 5E1Z B; 3KEY A; 4XRS G; 4C2T A; 2Z99 A; 2GBY A; 5L3C A; 3H5A A; 5E1W A; 3BTL A; 2Z5U A; 4II2 A; 3RYP A; 2EZI A; 3LST A; 1FTT A; 1D0X A; 1ZTR A; 2RQQ A; 1HBX G; 2O9L A; 2ZO4 A; 1HKT A; 1IZ1 A; 1RES A; 2RGV A; 2L9V A; 2JUG A; 4AUX A; 1JT6 A; 3LOC A; 5CPR B; 3O2P E; 4HV6 A; 3K69 A; 2ZB9 A; 1MKM A; 2M34 A; 2Y9Z A; 5EZH A; 1WKM A; 2FBK A; 4IRI A; 4G7O F; 2LFB A; 4FT8 A; 5IOZ A; 1RUO A; 2DPD A; 3QYE A; 2LR8 A; 3ZQL A; 2F2E A; 2HOE A; 1TL8 A; 1WJA A; 4I76 A; 4W97 A; 3M9A A; 3FDY A; 4ABZ A; 3OY9 A; 3KX2 A; 3VYT B; 4E7K A; 3I64 A; 3I59 B; 4IJA A; 2R7U A; 3HEF A; 2RAE A; 3BQZ A; 3W6J B; 1XB4 A; 2WAE A; 4GYG A; 4CO8 A; 4M9Z A; 4LFU A; 2EWN A; 1IW7 F; 3NWS A; 3E3V A; 5IP9 J; 2E71 A; 3BPX A; 3F72 A; 1P4X A; 3V7C A; 3PSI A; 2HDD A; 2DA4 A; 3M1E A; 2Q8K A; 1DU0 A; 2PJR A; 2M7B A; 2CV1 A; 4XL9 A; 4M72 A; 1WI9 A; 4YIR X; 3FKJ A; 3NEU A; 2V1D A; 2LH9 A; 2FBI A; 2QEN A; 4X0G A; 2MD0 A; 1XSD A; 2E19 A; 5J40 A; 2WTE A; 3TW6 A; 1IN4 A; 2DXI A; 2M4K A; 4PGG A; 1B72 B; 2AQF A; 1I27 A; 3RKX A; 3A0B C; 4NNJ A; 5KAF C; 2VC0 A; 4XNF A; 1EJ9 A; 2EV5 A; 4E7L A; 2ACJ A; 2CS3 A; 1SD5 A; 2F48 A; 5CQE A; 3W3C A; 2YUS A; 1QZE A; 4KUM A; 4AVP A; 2MLK A; 2L4A A; 3D5S C; 4HV5 A; 3CUQ C; 2VPR A; 2M7A A; 1S29 A; 2X1C A; 1IG7 A; 1WWX A; 3HUG B; 3J7Z I; 1VQ6 I; 4BQA A; 5LRS A; 1UJ8 A; 5F27 A; 2DDA A; 2OTJ I; 4XM3 A; 1FOK A; 1BI2 A; 4S05 A; 4MNU A; 4IHV A; 1VTN C; 2HVR A; 4WCG A; 1FOX A; 2ZC2 A; 3QP6 A; 3K4C A; 1EH7 A; 1U2W A; 2CW7 A; 2CU7 A; 2EQR A; 3K4J A; 5E3O A; 4Y7N J; 3QU6 A; 4XOT A; 5HLG A; 4J19 A; 3IAM 2; 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