2C4GA

Structure of cdk2-cyclin a with pha-533514
Total Genus 89
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
89
sequence length
301
structure length
301
Chain Sequence
PLVDMENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIRLDTETEGVPSTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFGVPVRTYTHEVVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase
molecule keywords CELL DIVISION PROTEIN KINASE 2
publication title 3-Amino-1,4,5,6-Tetrahydropyrrolo[3,4-C]Pyrazoles: A New Class of Cdk2 Inhibitors.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 89
structure length 301
sequence length 301
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2005-10-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2c4gA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2c4gA01
4JRVA 5CWZA 1XH7A 4MD9E 1O6KA 3BEGA 2BZHB 3SRVB 3BYSA 2J0IA 1YHSA 4D5KA 2HWOA 3UDBA 3C1XA 3ORZA 3PUPA 4ANQA 4AT3A 3KU2A 3F88A 2QQ7A 5IMEA 5EK7A 3ZO4A 4PF4A 3Q6WA 3A7FA 3E7VA 2WIHA 3U55A 2A27A 3AGMA 3FAAA 2CGVA 1V0OA 4USFA 3PPKA 4QMXA 2HZ4A 5E9EA 4XG9A 2C1BA 2XIXA 3FXWA 5LVLA 4FEXA 4A06A 4HW7A 2VWUA 5KMNA 4AFJA 4ZLYA 2AC5A 1YWNA 3NUXA 4LFIA 5FTOA 4IXPA 2REIA 4FX3A 3HRBA 4ZLZA 5C1QB 3WILA 2ZM1A 2JEDA 3DXPA 2IW8A 1ZYCA 3FMHA 2UZBA 2ZDTA 5FDXA 1KE8A 4XV3A 4JG7A 4JJRA 4F6UA 4R7HA 2VN9A 4GSBA 3RK5A 3HZTA 3QD2B 4Z7HA 4FKPA 4D9TA 2PMIA 4N6YA 3WI6A 4UB7A 3VW6A 2XIRA 4KIKB 2BZIB 4EEVA 3LMIA 5ANOA 3DFAA 5JSMA 2LAVA 4DN5A 2HZIA 4ANOA 2YWVA 3DBQA 1E9HA 2XBAA 3FQEA 2C6TA 4AF3A 4ZTLA 3ZONA 5CLPA 3G6HA 5DT3A 2ESMA 1K9AA 3OEZA 4ZJJA 5TF9A 4M66A 2XVDA 2BRBA 1R1WA 1YQJA 4DGGA 3FSFA 2W0JA 4YPDA 2X4FA 1OZ1A 3MVHA 3R7IA 5ETAA 4MQ2A 5LMAA 2X9EA 3FYKX 3GCSA 3D2KA 1H4LA 4KKGA 4EHZA 5AM6A 3PLSA 4G9CA 3R7VA 4XYFA 4APCA 3ENHA 5LOHA 3HKOA 4PUZA 4TWNA 1GIJA 2OW3A 4DAWA 2X39A 3RAWA 2XK8A 4M69B 4OW8A 2GPHA 4NWMA 2YZLA 2OJJA 2P2IA 3BCEA 1VEBA 1CMKE 1FGKA 3R2YA 4PDPA 4QYHA 2WMVA 3ZZEA 2WQNA 4QMMA 5BUEA 4NKSA 1XJDA 2J90A 2ZV9A 2H34A 4O82A 3LE6A 3I60A 3DXNA 3UG2A 3ZLSA 4E4MA 3BI6A 1H27A 2XNNA 3BLHA 3I0OA 1A9UA 2KTYA 3CR0A 4K8AA 3IPHA 5M55A 2UW5A 2PUPA 4ZTHA 2NP8A 1JKLA 1LEWA 2HZNA 2V22A 3FHRA 2Z7SA 3KRRA 4KSPA 3OXZA 1YXUA 2HY0A 1QL6A 2JIUA 3LFFA 3QUEA 3TZ9A 1R0PA 5E4HA 3IECA 4DF3A 2Z8CA 1BUHA 1U46A 1FVTA 3C0IA 3LXPA 4TL0A 1AD5A 2XM9A 2BILB 4F9YA 2VX0A 4JDKA 2DWBA 2CGWA 3KEXA 4AE6A 3FKOA 3HDMA 1Q5KA 5E8ZA 1Q61A 4R3CA 5HHWA 3UGCA 3WF5A 3R7YA 3LQ5A 4E7WA 1XBCA 5JN2A 2ETKA 4FK6A 2C0OA 2WMUA 1APME 2YDKA 3MDYA 2C69A 3MTLA 3W18A 4X2FA 1NVRA 3K3IA 4X7QA 4EH4A 4OAVB 4ZMEA 4MXZA 2VNYA 3A8XA 2BRMA 3FLWA 4H3BA 4HYSA 4WUNA 5J7HA 4O0VA 2UV2A 2WTDA 2GFCA 3AGLA 3L9NA 3S00A 3QTUA 5AIKA 1TVOA 2B9FA 2P4IA 4UMRA 4AE9A 4MVFA 4U8ZA 5LMBA 4GKIA 1A48A 4FNWA 3QCXA 4FNYA 3RPSA 1CM8A 2YERA 2G2IA 2VNWA 3R8PA 1Q8YA 1JSUA 5EYMA 4EOSA 1KSWA 5T6KA 2ZV7A 4H3PA 3U87A 2PHKA 1ZY4A 3CBLA 3CPBA 4QD6A 5I9WA 3CQUA 4X3FA 2BDFA 3O50A 2WQOA 3E62A 5AX3A 1V0BA 2Y9QA 2CKPA 2RF9A 2W17A 3UO4A 5IA4A 2B52A 3PZHA 3G9LX 2W7XA 4Z55A 2OJFE 5K3YA 4YO4A 2PE1A 3AD5A 4MTAA 2R3LA 2R3MA 4YHTA 4H36A 3MH3A 1URWA 2WPAA 3VC4A 5IU2A 1PXJA 3R8ZA 4FT3A 3PPZA 4O38A 4Q5EA 4QPSA 4RJ7A 4FNXA 3LCTA 2WMQA 3R9OA 1MUOA 1Q24A 3DKCA 5A4QA 5AV1A 2EVAA 2X0GA 2UVXA 4BI2A 5JEBA 4WNKA 4EH5A 5KO1A 5CNNA 5FXQA 5AUWA 2Q0BA 3CP9A 4IAFA 3F5UA 1WFCA 2FSMX 4ERWA 3ZYAA 4AGUA 3HX4A 1OKWA 1DI9A 3PXFA 2WB8A 3EFJA 3I6WA 3CJGA 3AC8A 4ALVA 4L44A 5ANKA 3GU5A 4YSJA 2ITQA 2RGPA 3D7ZA 4UMQA 4EWHA 4XP0A 4ZOGA 4YR8A 5CANA 4YZNA 1SVHA 2WTKC 4G6LA 4IC8A 2XA4A 5L2SA 1VR2A 3L8SA 4YC3A 4DFXE 4WSYA 2JDRA 2ZVAA 1GOLA 2IVSA 2VWXA 4BN1A 3DB8A 3DBEA 5HCXA 3ROCA 2WELA 3E7OA 5JKGA 3TDWA 3GBZA 3D94A 3NMUF 2ZV8A 2FYSA 2RFSA 4FUXA 5K4IA 2WOUA 3T9IA 1W8CA 4F9WA 3LIJA 3BRBA 2QHNA 2Z2WA 2LGCA 3C7QA 4UV0A 3OVVA 3KRLA 3WIKA 3AMAA 5IEYA 5IQGA 3K3JA 3PFQA 3QCSA 2WO6A 3QF9A 3ZDIA 3R9HA 5L2WA 3Q60A 4Y5HA 3UIMA 2UZDA 5FEQA 1YOMA 2BFXA 4XG4A 5AMNA 3S0OA 2UW0A 3FLSA 4L67A 4R6VA 5CVGA 5H8BA 3DS6A 4JIAA 3RCJA 4EH2A 3QKLA 4UXLA 3OOMA 4B9DA 3MWUA 2IO6A 3LKMA 2C68A 4FT0A 4YZBA 3VUMA 5AFVA 4DINA 4BR3A 3DZOA 4DH8A 5EI8A 5HVJA 3ZHPC 1PMUA 1F3MC 2E9OA 2JAVA 5J95A 4NUSA 2C0IA 2WTKB 2YM6A 2PVHA 2PZ5A 4UWCA 3ZOSA 3BHTA 1H8FA 4FSUA 5BYLA 1O6YA 5E1EA 4OTHA 2I6LA 5I9YA 4YTCA 3QD0A 2QLQA 4QYEA 2Q83A 1VYZA 3ZRLA 4UYAA 5FP5A 4EBVA 4H1JA 3V6RA 5A4CA 4TYHB 3QTIA 4FTNA 3EMGA 1OBDA 3JVSA 3LFBA 4IB1A 4M84A 4AW1A 4FEVA 4RSSA 3NS9A 4IVBA 4FVPA 5EI6A 1YXSA 4F0IA 3JUHA 3BGQA 4F9CA 5CAUA 1KUTA 4KKHA 4XV2A 3C0GA 4MBIA 2C30A 2C5NA 1SVEA 3DZQA 5M4IA 2Z60A 2JIIA 3IOPA 2R3IA 2YM3A 5CU2A 4BCQA 5C26A 3PXYA 4BIEA 3VBVA 4I20A 4EOPA 5D1JA 4FF8A 2CKQA 5CU6A 3G9NA 3O17A 3OY3A 4N6ZA 4EUUA 5AEPA 3HECA 3TKUA 3DV3A 5TOZA 2C3IB 2P33A 2XK7A 1QMZA 2IW6A 3ORMA 4FIHA 3PVGA 4C37A 4RGJA 2J6MA 2NPQA 3AC1A 4IZAA 3R8LA 3SAYA 1W98A 1Q41A 3KRWA 4YMJA 5DH3A 3DY7A 5J79A 1MRYA 2J5EA 2ITWA 2J9MA 3PWYA 4W4YA 4NIFB 4KSQA 4EQUA 4CLIA 4O0YA 1I44A 2WMRA 3DJ6A 1OIUA 2Y4PA 3FQHA 5CY3A 5JMSA 3EJ1A 1NW1A 3BEAA 3SOCA 1UU9A 5GINE 1ZYJA 1VZOA 4GRBA 3MFRA 3QTQA 3NVKI 4C0TA 3DBCA 2ZM4A 4IVDA 4FL3A 5J7BA 5DGZA 2PK9A 3NGAA 3UE4A 3WZUA 2E9VA 2VWWA 2Y0AA 5HTCA 3BLQA 1WVYA 2BTRA 1FBNA 3CD8A 4GT4A 5C27A 2EXMA 3VO3A 2W1DA 5CTPA 4W8DA 3MA6A 3EFLA 4IFCA 4CKRA 3VJOA 3IDCA 2EXCX 4UMUA 3UNKA 2V5QA 1H07A 2BCJA 4QMZA 5HG8A 3VUKA 4D2WA 1I09A 2GNLA 3F3TA 2QI8A 2IWIA 2G2FA 2XNMA 5AUYA 4EJNA 1WBOA 2OF2A 5ETIA 5KNJA 5BQ0A 5H8EA 2YJRA 2ETMA 3ZM4A 3Q9YA 5LMKC 2R3QA 2W9ZB 1A06A 3VQHA 3BLRA 5EG3A 3ITZA 5JT2A 5ITAA 4AACA 1PRYA 4C2WA 2B9JA 3FV8A 3ORNA 3H4JA 3W55A 4F6SA 5CF4A 5J1WA 5FXRA 3HGKA 1E1VA 1ZMWA 4YUQA 3AXWA 4L3JA 4WO5A 2IZRA 2H96A 3AG9A 1PMNA 4W9WA 3ZO1A 3KK8A 4G1WA 4ZTQA 5AV3A 4QMNA 3LLAA 4H3QA 1GIHA 4B8LA 3EN7A 2GS7A 3PG3A 4Z3VA 2OGVA 3VNTA 4ITIA 2AUHA 3B8RA 4FL1A 4XHKB 3R9NA 4FSWA 2CPKE 4FA2A 1F0QA 1XH5A 3RINA 3GQLA 2BAQA 4ZZOA 4ASDA 5CQUA 3HVCA 3BYUA 2PYWA 1UWJA 1OPJA 3DFCB 4Z16A 1UWHA 3SGCA 1YI6A 3WYXA 4U9AA 4ZJVA 3D14A 2R3JA 4CTBA 4HVHA 1UV5A 4D4YA 5A6NA 1P4OA 1QPDA 2A1AB 4HNIA 4FTOA 4L46A 3Q4CA 1G8SA 5D10A 3UYTA 4FSQA 3CSVA 4ZSJA 4N0SA 2RFEA 3EIDA 4W8EA 5BVFA 3KULB 4PL3A 1WZYA 4D58A 1F5QA 2GS6A 3L8XA 1PMVA 4I0SA 4RZVA 4CCBA 3DJ5A 5HKMA 3KCFA 3AC5A 3SQQA 3THBA 4FEUA 4XG3A 5H2UA 3C4CA 1URCA 5DVRA 3LXNA 4AFEA 2PUIA 3V5LA 4BGGA 4C02A 5HNBA 5D41A 2VWYA 2NRYA 2YIXA 3CKXA 4RJ4A 1QPJA 5C9CA 1V1KA 1NY3A 1Z9XA 2HENA 2YCSA 2PY3A 3R1SA 4XP2A 5HESA 4R3PA 4TPTA 4AZWA 2X7OA 5KMKA 5DMZA 2WIPA 3E92A 5IQDA 5E8UA 3PJCA 4FV2A 3UOKA 4D2RA 1ZYSA 4YC8A 3KGAA 4BCIA 4ZEGA 2GQRA 4H39A 5CEPA 2UZUE 2R3KA 1GZOA 4GYGA 4IX3A 1KV1A 3O96A 4A9TA 4QMWA 3BBWA 2QOQA 5AR7A 3FJQE 3R0TA 4EOLA 1P2AA 3FC1X 3QQJA 4DEEA 5M09A 2QU6A 5DE2A 5IA5A 3VBWA 3DTWA 5B2MA 2RG5A 4GT5A 4E73A 4CYJA 4CSVA 2P2HA 5F9EA 1WBVA 4QT1A 3PVUA 3PA5A 4W4XA 1OECA 3TUDA 2PUNA 4F7NA 4BTKA 3UTOA 3PPJA 2O0UA 3TXOA 5FBNC 3UNJA 3V3VA 3R04A 3R28A 4MF1A 4O6EA 2YN8A 2XEYA 3PYYA 5EOLA 1PXPA 3FL5A 3NUSA 3VS3A 3CXWA 4BBEA 5BYYA 5AUZA 3CTJA 5J9ZA 1YXVA 4RC3A 2WMTA 3A62A 5EQPA 2J5FA 2P0CA 3FDNA 2VTSA 1LEZA 3EZVA 3H9OA 3NYOA 4QO9A 4RWKA 4QP3A 4R1YA 4DEIA 3VS2A 1JPAA 2VTRA 5CX9A 4A4OA 4E4LA 1PMEA 4YLKA 3PXZA 4BCOA 3RI1A 2X8EA 4PPAA 3FLQA 2DYLA 4PV0A 4QYYA 4X2KA 3WZDA 1BMKA 4D55A 1KWPA 3NPCA 3QHWA 3LM0A 3CQWA 4D0XA 3GENA 2WQEA 4N57A 3P7CA 4BCGA 4MXYA 2QC6A 3HUCA 5CXHA 2EXEA 3JVRA 3GXLA 4ZY6A 3NRMA 1JKTA 4FL2A 4NTSA 2UW7A 4QMPA 5IUIA 4ZMFA 3CEKA 3TIYA 2WMWA 2BIKB 2QOKA 3CQEA 4QQJA 5ACBC 1JWHA 1UKIA 2A4LA 5BYZA 4TRLA 4EKLA 3ZXZA 1NXKA 4E6AA 4MNEB 3QRIA 4M3QA 2W96B 3M11A 4OBOA 4Q5HA 2W06A 2QG7A 4CFNA 3PP0A 4OBQA 5BVOA 2VWVA 2ZM3A 1OGUA 4O0RA 4J97A 2QR8A 5KX8A 2BHEA 5AUTA 2FGIA 3GNIB 4EJ7A 3ZEWA 3SD0A 4C61A 5A54A 2ACXA 5J9LA 5L8LA 4P4CA 2XNGA 4DG0E 4XOZA 3KMMA 3FMMA 4I4FA 1R78A 4QNYA 5M4FA 4AAAA 2OXXA 2OBJA 4DTKA 5CALA 3KXXA 3LFEA 3ZBXA 4OTRA 1UVRA 3DU8A 3KCKA 3QFVA 3F3UA 4L3LA 4MHAA 2CNQA 3NLBA 3E8CA 3R63A 4W4VA 3S2PA 4C3RA 4CVAA 2ITNA 5HVKA 2I0EA 3FY0A 1OMWA 4EOKA 2XH5A 4E3CA 3PXRA 3MY1A 4IWQA 2X8IA 3KB7A 2J0KA 3WZKA 5CSHA 4KBAA 2QONA 3MSSA 2BROA 3E8DA 4E6CA 4F70A 3L8PA 3UQFA 1PYEA 4F99A 2JIVA 4PX6A 2XEZA 4Y85A 2ZDUA 4ITHA 3ATTA 1JSVA 4GG7A 4E4XA 3PLAE 1ZZLA 4D28A 1OUYA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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