2CITA

Structure of the covalent intermediate of a family 26 lichenase
Total Genus 113
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
113
sequence length
274
structure length
274
Chain Sequence
LKIGAWVGTQPSESAIKSFQELQGRKLDIVHQFINWSTDFSWVRPYADAVYNNGSILMITWEPWEYNTVDIKNGKADAYITRMAQDMKAYGKEIWLRPLHAANGDWYPWAIGYSSRVNTNETYIAAFRHIVDIFRANGATNVKWVFNVNCDNVGNGTSYLGHYPGDNYVDYTSIDGYNWGTTQSWGSQWQSFDQVFSRAYQALASINKPIIIAEFASAEIGGNKARWITEAYNSIRTSYNKVIAAVWFHENKETDWRINSSPEALAAYREAIGA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords ENDOGLUCANASE H
publication title Substrate Distortion by a Lichenase Highlights the Different Conformational Itineraries Harnessed by Related Glycoside Hydrolases.
pubmed doi rcsb
source organism Clostridium thermocellum
total genus 113
structure length 274
sequence length 274
ec nomenclature ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date 2006-03-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02156 Glyco_hydro_26 Glycosyl hydrolase family 26
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2citA00
3KEHA 3VNZA 4BQ4A 3FY1A 1CXKA 2ZXDA 3NSMA 1UR1A 3PTQA 1GONA 1E73M 1G9HA 3K8LA 1KWGA 4OIFA 5A94A 2IXVA 2WMIB 3AYSA 3W28A 2GSJA 3VNYA 2W5FA 1PIFA 1JXKA 1RP8A 1LG2A 2XTKA 2VNCA 3PHAA 5HOSA 2NW0A 3CZKA 1IZKA 1PIGA 1UA7A 4PRWA 1UWTA 1EXPA 4J3SA 3VTRA 1R87A 4HMCA 5I0DA 4X9YA 2XJ7A 3T2PA 1G1YA 1TFVA 1W9VA 2ZXBA 4CU6A 4LX4A 4JHOA 3B9DA 3G6LA 5FCZA 1RH9A 2VX4A 1GJUA 3UEQA 4HPGA 2WANA 2OSXA 5CLWA 4H8UA 3ZMRA 4QLLA 3WNNA 4HOXA 3L2LA 2WKGA 3AJ7A 1KGXA 2DH2A 4PMDA 2VO5A 4PMYA 1MW1A 3BCDA 1WO2A 4W5UA 4TVCA 3AMDA 1QOXA 4BF7A 3QHNA 3UETA 1US2A 3UCQA 3VX1A 2J78A 3VO0A 1Q6FA 2W91A 1UKOA 4RL3A 4WKAA 4UQDA 2YOCA 3WEZA 3GH4A 3FXYA 2GJRA 2PF0A 1HJWA 2WHKA 4HA3A 4Z2JA 3N12A 3CUJA 2FHBA 1OT1A 1DWFM 2VRKA 3SEPA 1NM9A 1UH4A 1VAHA 4NF7A 5ABEA 2WCGA 5HNNA 5CPSA 7CGTA 4HP5A 4P7RA 4AY1A 1WPCA 1GHSA 3MMDA 5D8WA 1GOOA 2J8FA 3TTOA 1E6NA 3VOCA 1CXEA 1QI2A 1EDQA 2W61A 2AAAA 3GXIA 2Y8KA 2DT2A 2DEPA 5I23A 2BXYA 2J7HA 4MB3A 1ZB5A 2DSUA 1C3FA 2O9TA 1W3HA 1CEOA 2ZX7A 4AD1A 3N18A 3WQWA 1UKQA 3PZVA 1BVNP 4R5EA 2DIJA 2GJPA 5FOOA 1IZJA 2BVTA 3ZM8A 4A3HA 3O6AA 3AQUA 1HNYA 3UR8A 1ZBVA 3EBVA 3KE0A 4XZWA 1UZ4A 3AIVA 4PUDA 1B1YA 2VX7A 1QBAA 2G3JA 2W66A 4AW7A 2XIBA 1JDCA 3K4DA 4MDPA 8CGTA 2Y4SA 4JFVA 2XVKA 2JIWA 4W7WA 3SUTA 4AZIA 4MB1A 2UWFA 3SCSA 2ZUNA 4GZEA 1JZ4A 3L4ZA 3AS1A 3AS0A 1OCQA 4B16A 2VT0A 2BY3A 4JKMA 4AIEA 3SUWA 4PTWA 3WMCA 1H5VA 1J12A 1CLXA 1JI1A 3CZEA 1G01A 2D3LA 3IJ8A 4GZIA 4NSBA 3AHYA 1KB3A 1X6NA 4E4PA 3RDKA 2VI0A 4Z2HA 2XFYA 1HN1A 3WDPP 3WF0A 1GORA 4PEEA 5DMYA 2QPUA 4NI3A 2PBGA 5BRQA 1CGXA 3B9EA 3I3DA 4M8UA 4MB5A 1VB9A 3ARSA 2E8ZA 1W9UA 2NT0A 3QOKA 3KL0A 5HPOA 1XC6A 3JUGA 4HZ8A 1V0LA 1M01A 1ESWA 4EE9A 5C8BB 1V0NA 4U2ZA 1SFSA 3UG3A 1QVBA 4WLCA 1VJZA 4TOQA 1AMYA 4W88A 4UFKA 3ZSSA 1UUQA 1JNDA 3A47A 3VIPA 1KWKA 1FFQA 4Z2GA 5CPQA 3VKKA 1CPUA 2VX5A 3GYCA 3RCNA 4W84A 1BG4A 3EDDA 2ZX6A 3AIUA 4AWEA 4M81A 3TA9A 4UQBA 1HJUA 3PZIA 1E6QM 2J7FA 4E8CA 4A3YA 1CENA 3WL0A 2ZICA 4J7RA 1NH6A 4AIUA 2YJQA 2WK2A 4D6EA 3RM9A 5A8PA 1V3IA 4ACYA 2ZE0A 1ODUA 3FNDA 4JZ5A 4H8HA 1E1FA 1FOBA 5M3WA 4D6FA 1XH1A 1CTNA 1V6WA 4OOUA 2MANA 3LPPA 1D2KA 2BHUA 2XHYA 2ZX8A 3WDRA 3WQ8A 4DWSB 1MWOA 2ZUTA 4H7VA 3CH9A 4CCEA 4BCEA 1C7TA 1JF5A 2BXZA 1GJWA 4GINA 4L4PA 4B9ZA 1KBBA 4DWSA 3O9NA 3M6DA 5CPTA 2JIEA 1LF1A 3AIBA 4B15A 7TAAA 1B3VA 2VVNA 4HOZA 3F4VA 4XB3A 3UG5A 4AMCA 1Q4NX 2WZEA 3F5JA 4UZSA 2EO7A 1B3WA 2CCRA 3CHFA 5FIPA 1TR1A 1MQPA 1EOMA 1DEDA 2WHJA 1E6XM 3T0AA 3AI0A 5JUVA 1W2PA 3K1DA 5JBFA 2QHAA 3A4AA 5BROA 1TVPA 3HMCA 2VZSA 4QP0A 2BFGA 4OOZA 1CXIA 4HZ6A 5F7UA 3OLGA 4LYRA 4M24A 4AEEA 1C92A 1BQCA 5D9MA 5E6ZA 2WCAA 1W9BM 4TX6A 2TAAA 5JIWA 1EQCA 1WNOA 3N1AA 1CXFA 4H41A 3NIYA 4DWSD 4JCLA 4J3XA 1H1NA 3FHAA 1UD2A 3WEOA 1UWSA 1E4NA 1B3ZA 4LXFA 2VCAA 3VIJA 1TG7A 1VEMA 1C8YA 1W3LA 3ECQA 4BS0A 4CU8A 4GI9A 4JCMA 1W1TA 4J3TA 2EBNA 3MV01 3O2LA 5A3HA 4AXNA 2WMJA 4H04A 1LWJA 1H49A 1HF6A 3RJYA 3WBAA 1UQZA 3L4UA 1JGIA 1E6RA 4HMDA 1WZMA 1PX8A 2D20A 1E0VA 1E9LA 1EA9C 3QOMA 1I1WA 3BSGA 3PZQA 3UERA 1XH2A 2E4TA 1DWGM 1OGGA 3BAJA 2CERA 3WF4A 1BSIA 3L2MA 1GPFA 2VQTA 4TTGA 3M07A 2X05A 5A2AA 1CYGA 2D1ZA 3VDBA 3N15A 1R86A 3NYDA 1UWQA 1BF2A 3CBWA 2J74A 4FMVA 4ZEPA 1V0MA 5IFPA 3TP4A 2XWEA 3N17A 1XGZA 1CGYA 1UA3A 1KXTA 2DPEA 3FAXA 3IK2A 3U5UA 5I77A 1TZ7A 2X0HA 3MUZ1 4J27A 3ZQ9A 4EKJA 2QMJA 4QLJA 3W53A 2CPUA 1XH0A 2AOSA 2Y24A 4B9YA 1E71M 1JXJA 5DT5A 3EDKA 4ML4A 4U3CA 3PTKA 3SCPA 4P8VA 4TTUA 4DUWA 1DTUA 5BWFA 3PZOA 4UQ9A 1H0GA 1KXHA 2JFEX 2DSVA 5KEZA 4D6CA 1EHNA 4BQ3A 4IPLA 1RPKA 2PC8A 3THCA 3W38A 1HX0A 2YLAA 3MKKA 4GIAA 1VFMA 2XSBA 3CZLA 1W2VA 4P8XA 3WBEA 3VINA 1V02E 3VIFA 2CYGA 1E6SM 4J3VA 1MW2A 4PMZA 3VGBA 2O9PA 5TD4A 4HZ7A 4PN2A 2BY0A 5IFTA 4MB4A 3GNPA 1CGVA 4IUGA 1NOWA 3BLKA 1XRVA 1QI0A 5A6MA 2ZX5A 1FP9A 1IT0A 2J7EA 3WNOA 1XYZA 4U5KA 5BRPA 1UYQA 1Q6GA 4F8XA 4MJ4A 1X1NA 4C7FA 4UOQA 2C0HA 1E43A 3PZ9A 1BFNA 2WMGA 1X6LA 1KBKA 3U5YA 3WNMA 1PEZA 4GPNA 4WF7A 3OIHA 3NDZA 1WZLA 2VCCA 2YA1A 4AZBA 1QNQA 1HJVA 2DT0A 2G3IA 3CO4A 1UKTA 3IJ7A 4OBSA 4AYSA 3WENA 2X0YA 2WSPA 3WNKA 2VVSA 1PX3A 3OZOA 1BG9A 4GI8A 4FLQA 1GOMA 1V08A 1JAEA 4HOWA 1OIMA 2YA0A 5D8ZA 3OGSA 1JZ8A 3WDHA 1OIFA 1ZU8A 4M82A 1DP0A 4Q7NA 5A6KA 4AISA 1GCYA 3EDEA 1ISXA 2CNCA 1BPLB 2VR5A 2VZUA 3AZTA 3L4VA 3MANA 5EFFA 3WQ5A 2OWXA 2D23A 3AROA 4V28A 2WMIA 5A6JA 3N04A 5D9OA 1GVYA 1FHLA 5E0FA 1W1YA 3F5KA 4UFJA 2XVNA 3WY1A 4KWUA 2V5DA 5EMYA 2WVSA 3ZR5A 1MQRA 1UWUA 4GI6A 3WSUA 5A6AA 4YHEA 3RIKA 3ZJ7A 4Z2LA 3GXMA 2CITA 4MNKA 4HU8A 4S3JA 3CUFA 2E9BA 1JAKA 3U7VA 4IM4A 5IHSA 3UESA 4DUXA 1JZ5A 2XYLA 1RP9A 1ISVA 5CXPA 4C7DA 5D4YA 2BHYA 1HL8A 1VENA 3FHQA 6TAAA 3AMKA 3KL5A 3SCTA 1WDPA 4DM2A 3L4WA 2IUZA 4D6DA 5M5DA 5E6YA 2QPSA 3VD9A 1P6WA 4BQ5A 1CNVA 4W89A 1YQ2A 2OLHA 2YL9A 3M46A 4L4OA 3VDCA 1ZL1A 3DC0A 1GOWA 5D9PA 1UQYA 3CHEA 1EH9A 2UY4A 1H11A 4XV0A 1M7XA 3VX0A 2VCBA 2GDVA 1SR0A 4IISA 3FAWA 3VMNA 4NZCA 1BHGA 1HP5A 2WBGA 3QR3A 1QNOA 4WJXA 2ZWZA 4UFMA 1LG1A 5AYBA 1KGWA 4PSPA 1E56A 1G5AA 4GO8A 4ZXLA 3W27A 3WH7A 5I2UA 1DHKA 2PWDA 1XSIA 2J47A 5A8OA 2VR4A 2YL8A 1V3KA 1OGSA 3CMGA 4TXEA 3FW6A 4P7LA 3AXIA 1V3HA 1N82A 4U5IA 3DYMA 1E70M 5A95A 3DYOA 3D5HA 4D6IA 3CUGA 2G4FA 2XVGA 1BGGA 3AMCA 4MAZA 2WC3A 1MYRA 1UR0A 4MJ2A 3ZO9A 2VQUA 1L0PA 3AS3A 4B3LA 5BCAA 2X2YA 2JF7A 2E3ZA 5I3DA 1UR2A 3BC9A 1H3GA 3A4WA 1CDGA 3AFBA 3ARVA 4U33A 2WM0A 3K46A 3WFZA 4K68A 4TX8A 4Y7EA 2GVYA 1VEOA 1NWSA 5CJ5A 1CGUA 5M03A 2XUCA 2J8GA 1KR1A 2DDXA 4FLOA 4RE3A 3WD4A 1BYAA 1Q6EA 2OYMA 4HU0A 1E15A 2XG9A 1E4MM 4PBGA 2VZVA 1FFRA 3WL1A 5D9NA 4CVWA 1WP6A 3GH7A 2VTFA 4W86A 3N9KA 5I6SA 1GZJA 2D22A 2XM1A 3K8KA 5EBAA 2Q8XA 4TVDA 1HIZA 4AD5A 1E6PA 3ALFA 1OD8A 1B31A 1E0XA 3AIWA 5GNXA 1ZBCA 2WHLA 4A4AA 1E4IA 2ZUSA 2XGBA 2E8YA 3DYPA 3ZT7A 1C8XA 4HTYA 3SUUA 3VIMA 1UD4A 3ARRA 3BAXA 1PZ3A 1SYTA 2V3FA 1UWRA 5BXSA 4PMUA 1CIUA 1TA3B 1VFOA 3ZJ6A 3AISA 2PI6A 3AOFA 4DWSC 2XGIA 5IXEA 1BLIA 4J3WA 3UG4A 1NWTA 1TA3A 2F8QA 3WQ6A 1QBBA 1LL6A 1V6VA 2UY3A 4KH2A 1TCMA 3LPGA 5C71A 2XSAA 3WMBA 2E9MA 5CG0A 2EJ1A 3VGHA 3CHDA 2WVVB 2BNJA 4PUEA 4HMEA 5BXTA 3VMPA 4P7OA 3QHOA 1D7FA 2YIHA 2WVVA 1OGBA 5I5RA 2W92A 2CBJA 2ZIDA 3QHMA 3VU2A 3KL3A 2YDQA 5CGTA 4AZGA 1MXDA 4QLKA 1JYNA 3NUKA 3OGVA 1I75A 4PMVA 1M53A 2GDUA 1FA2A 1GQKA 3OBAA 4AD3A 3CIVA 4CD4A 2FHFA 1UKSA 1H4PA 3WH5A 3RO8A 4EANA 1YHTA 2WVTA 1UWIA 5FD0A 2J62A 2WVUA 1J0KA 1W32A 3MUAA 4D72A 4S3KA 3RMEA 4PCSA 3DHUA 3GBDA 1KGUA 4PTXA 4W85A 1MFUA 2X09A 5IHRA 1NOFA 1PBGA 3OZPA 3GXFA 1MXGA 1UH2A 2PWFA 5BYWA 3W24A 3EMZA 2VJXA 2UY2A 4H2CA 1UZ1A 3ZIZA 3M7SA 5C70A 3GBEA 3POCA 3VMOA 3ARTA 1HKJA 1NARA 1JDDA 1V3JA 1W9XA 1S46A 2WCSA 2YBUA 4J28A 2EPMX 2RGLA 4V2XA 4MNLA 1DWAM 9CGTA 2J25A 4Q22A 1JZ3A 1I1XA 1BGAA 5DT7A 1B9ZA 1R7OA 1GQJA 2W62A 1FH7A 5A8NA 4Z2KA 2YLLA 1EQPA 3ZT5A 1JNEA 3GZAA 1JZ2A 1H41A 8A3HA 4FF5A 1J10A 3S2CA 4BQ2A 4PCTA 5I78A 3VVGA 2CXGA 4R27A 4D1IA 1OBAA 1UD5A 2V3DA 1QI5A 2J75A 3S6TA 4QCEA 3MUIA 3T2OA 1UHVA 2D0GA 3IJ9A 2GUYA 3SCOA 5I24A 1QNPA 3EDFA 5M17A 4XX6A 3VIKA 4URIA 1K6AA 1W9PA 4NRRA 1R85A 4AEFA 3I3EA 3SCQA 1C8QA 5FL1A 4FLSA 4F66A 1EHAA 5GNYA 4OUEA 1GHRA 3G6MA 2A3BA 1HKKA 4W7VA 3BMWA 3W6LA 4YN5A 1D3CA 2D24A 3NDYA 1H2JA 1A3HA 2IXUA 4MTVA 4JKKA 1TUXA 1HL9A 3TTQA 1M03A 2J77A 2OWWA 1WDSA 1VBRA 3ARPA 4ATWA 3WDJA 2BY2A 1KR0A 3WFLA 5JBDA 2VX6A 2CHOA 4H8VA 3BAYA 1C7SA 4UFIA 2PWEA 1B0IA 2WW5A 2EPLX 3MO4A 1EO5A 2BS9A 3ARYA 4OZOA 4CGTA 1CGTA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3KEH A;  3VNZ A;  4BQ4 A;  3FY1 A;  1CXK A;  2ZXD A;  3NSM A;  1UR1 A;  3PTQ A;  1GON A;  1E73 M;  1G9H A;  3K8L A;  1KWG A;  4OIF A;  5A94 A;  2IXV A;  2WMI B;  3AYS A;  3W28 A;  2GSJ A;  3VNY A;  2W5F A;  1PIF A;  1JXK A;  1RP8 A;  1LG2 A;  2XTK A;  2VNC A;  3PHA A;  5HOS A;  2NW0 A;  3CZK A;  1IZK A;  1PIG A;  1UA7 A;  4PRW A;  1UWT A;  1EXP A;  4J3S A;  3VTR A;  1R87 A;  4HMC A;  5I0D A;  4X9Y A;  2XJ7 A;  3T2P A;  1G1Y A;  1TFV A;  1W9V A;  2ZXB A;  4CU6 A;  4LX4 A;  4JHO A;  3B9D A;  3G6L A;  5FCZ A;  1RH9 A;  2VX4 A;  1GJU A;  3UEQ A;  4HPG A;  2WAN A;  2OSX A;  5CLW A;  4H8U A;  3ZMR A;  4QLL A;  3WNN A;  4HOX A;  3L2L A;  2WKG A;  3AJ7 A;  1KGX A;  2DH2 A;  4PMD A;  2VO5 A;  4PMY A;  1MW1 A;  3BCD A;  1WO2 A;  4W5U A;  4TVC A;  3AMD A;  1QOX A;  4BF7 A;  3QHN A;  3UET A;  1US2 A;  3UCQ A;  3VX1 A;  2J78 A;  3VO0 A;  1Q6F A;  2W91 A;  1UKO A;  4RL3 A;  4WKA A;  4UQD A;  2YOC A;  3WEZ A;  3GH4 A;  3FXY A;  2GJR A;  2PF0 A;  1HJW A;  2WHK A;  4HA3 A;  4Z2J A;  3N12 A;  3CUJ A;  2FHB A; 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