2CLHA

Tryptophan synthase in complex with (naphthalene-2'-sulfonyl)-2-amino- 1-ethylphosphate (f19)
Total Genus 102
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
102
sequence length
267
structure length
258
Chain Sequence
MERYENLFAQLNDRREGAFVPFVTLGDPGIEQSLKIIDTLIDAGADALELGVPFSDPLADGPTIQNANLRAFAAGVTPAQCFEMLALIREKHPTIPIGLLMYANLVFNNGIDAFYARCEQVGVDSVLVADVPVEESAPFRQAALRHNIAPIFICPPNADDDLLRQVASYGRGYTYLLSRSGVTGHHLIEKLKEYHAAPALQGFGISSPEQVSAAVRAGAAGAISGSAIVKIIEKNLASPKQMLAELRSFVSAMKAASR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Tryptophan synthase alpha chain
publication title Synthesis and characterization of allosteric probes of substrate channeling in the tryptophan synthase bienzyme complex.
pubmed doi rcsb
source organism Salmonella typhimurium
total genus 102
structure length 258
sequence length 267
ec nomenclature ec 4.2.1.20: Tryptophan synthase.
pdb deposition date 2006-04-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00290 Trp_syntA Tryptophan synthase alpha chain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2clhA00
1VZWA 3QEZA 4O12A 2V5LA 4LW7A 1VC4A 3TX9A 2ZFAA 3UQNA 5DY3A 3W83A 4NJJA 1TPDA 4FX8A 5AHIA 3M5ZA 1FDJA 4LTSA 4AWUA 4DEFA 3SZ8A 4OU1A 3SR7A 1HG3A 3W1PA 3ZWTA 4QAIA 3SGZA 3B05A 4JXCA 4KFOA 1LBMA 4BI5A 3EKZA 1ADOA 2QCDB 1O4UA 3GZ3A 3HJZA 1GVFA 2E6DA 4UFKA 3LCFA 5AC8A 4JTLA 4P61A 1OFRA 3O63A 3DI1A 1O60A 1KFJA 3NQEA 1NF7A 1F76A 1SSGA 1VJIA 1KFKA 3MHUA 3UNDA 2ZRUA 5D2TA 4ADSA 2E6FA 1XDLA 3PSWA 2Z0IA 2ISWA 4K39A 1FCBA 1ONRA 3LI1A 4IX0A 3F03K 5U7SA 1JUKA 5DBTA 2DORA 3QJAA 1I45A 3TKFA 4JYDA 5EBUA 2DZXA 1K02A 3SFKA 3GXPA 3MI2A 4Z1AA 2ZQ0A 4R53A 4AHQA 1XI3A 1A5BA 1JQXA 4FNSA 5HWNA 5G4EA 3W2UA 3DBPA 5HQEA 4AB4A 2Y85A 3QMRA 1OFPA 3BG9A 3LM7A 1TPEA 1LLZA 4IXHA 1AG1O 4MYAA 3S6DA 5AHEA 4BWLC 1P5BA 4E2BA 1VH7A 4LVFA 1OX4B 1VPXA 2P1FA 4K7VA 2JGQA 1OHLA 3QW4B 1G7UA 2C18A 3F4WA 3UD6A 3TC6A 4O4VA 5C54A 3NM1A 3TXZA 4C1LA 1M7OA 1R47A 4K8EA 2FDSA 1W31A 2HS8A 3B0UX 4LT9A 5KITA 1OJXA 4JTEA 3UXDA 4ADUA 3P5ZA 1A5AA 4JD4A 1YDNA 3PULA 1H7RA 2JKEA 1G69A 2CLEA 3W7QA 3THQA 4MIMA 1LRNA 3L0GA 2VC6A 1I4NA 3NO5A 3EX3A 2FFCA 3TAOA 1F05A 2ALDA 3M43A 1KM1A 3GIYA 5EL1A 1I2QA 1C29A 2V5BA 1FCQA 5DXXA 5CPLA 4GXMA 5F1VA 4IQLA 3TQ0A 3CPRA 3DFPA 1CI1A 1PE1A 2W6RA 3IVUA 2H90A 3FEMA 1Q45A 3TSDA 4LVBA 1OFAA 2R14A 3C61A 4O11A 3ZS4A 1JCNA 1YXYA 4FNUA 5G5IA 1GTHA 4QSHA 3LTPA 4RX0A 4UXDA 2Q3OA 3P80A 2NX1A 1KM5A 1HO4A 2JBMA 3DKLA 4JTIA 1Q6RA 1LRQA 1XUUA 3MWAA 1G6CA 3PG8A 5DY2A 3CEUA 3GXNA 1GVSA 4E0CA 1YYAA 1NFBA 4Y96A 1N8FA 1OYAA 3B06A 1WA3A 4M6PA 1WX0A 4WOZA 2WV8A 1F73A 4MY8A 5K7JA 2VXNA 1I2RA 1H7OA 4ML9A 3S9YA 4Y90A 2G95A 2NUWA 2ZZ4A 4O10A 3WJXA 3W75A 3TE9A 1IF2A 3GNDA 4UC5A 1A5CA 1FQ0A 3V1PA 2WQPA 2OMAA 4JTTA 1I2PA 4A29A 2EF9A 1H7WA 4D2JA 1C8VA 1AL7A 1EEPA 1UUOA 4W9TA 2V2CA 3W86A 2B7NA 3BV4A 2CU0A 1Q6LA 3AO0A 3KOFA 1CX9A 4B5NA 2DZPA 2V2DA 3C4UA 3G0UA 3TFXA 1YADA 2FIQA 4LNYA 1JUEA 2YW3A 2V81A 4AF0B 3CT7A 3T40A 1VRDA 4AWSA 4UUIA 3B04A 2GQ8A 1R2SA 3HOJA 4O50A 1DQWA 2VFDA 5CGQA 2GVGA 2OT0A 4HPXA 1GEQA 3O1NA 3TR2A 2TRSA 4HNNA 4UR8A 2E6YA 5D2WA 1H60A 5FF0A 2OZ0A 2VELA 1EP1A 1VCFA 1TPH1 1R46A 4EIVA 4R33A 2QCEA 4IMCA 4CCCA 4UMAA 1VS1A 3MJYA 1QAPA 3O8AA 1K7EA 3W7DA 6TIMA 3W76A 6ALDA 3L5LA 5FEWA 4IJBA 2PE4A 4IGHA 2X2GA 2A4AA 1BWLA 1OFDA 3W3OA 3DFOA 1XBXA 2ZA3A 4N9EA 3T78A 3S1WA 2GPTA 2QDHA 1D9EA 1XKYA 5K9CA 1V7YA 4MLRA 1GJPA 1ZNNA 1B4KA 1PHWA 1KM6A 1R2RA 5CPNA 3C6CA 2WO5A 3BLFA 3DFSA 3TMLA 3C8FA 2ZZ6A 2CLHA 3GLCA 2RDUA 4NXSA 4FNTA 5D37A 2PC4A 5I3JA 3G1DA 4UCGA 3L5MA 1LOLA 3NL5A 4XZ9A 1KM0A 3EEGA 5CZJA 2OX1A 5FF2A 2NZLA 2GQAA 3IIOA 1VHNA 1W3IA 4AMAA 2RFGA 1TYGA 3UY8A 3R5EA 1K8XA 3NL2A 2RHGA 3ZFHA 4R7JA 3QSRA 4JX6A 4ADTA 2NWSA 4NNCA 3MI6A 3GK0A 2E5CA 3IIXA 1P4CA 3QPYA 2ZZ7A 1RQHA 1FBAA 2QR6A 4A22A 2DZWA 2CZ5A 2Y70A 1FCUA 2V82A 4M5PA 4Z0SA 3A21A 2TMDA 1TREA 5AB3A 3NM3A 2ZRZA 1RV8A 3IGSA 3LLFA 3DXIA 1OFEA 2R91A 1I2NA 1DV7A 3E96A 3KRZA 1YDOA 4NXKA 4DPQA 1T99A 3B8DA 3ELFA 1K3UA 1YTDA 4JR5A 3LCIA 4LVDA 2ZTKA 3QPZA 2Y7GA 1UB3A 4RKAA 1MO0A 3VE7A 4KWVA 3A5VA 2CLLA 1JJKA 1FCVA 1OFBA 2GJLA 2EPHA 4ZVJA 1OF8A 2J88A 4JTUA 4HSOA 2O7QA 3KXQA 3GDLA 1PIIA 1R30A 3NXFA 1FUYA 3JS3A 3GAKA 3NL6A 3SGUA 4K8HA 3UWYA 2EHHA 3P7YA 1N55A 2QCHA 3IRDA 4PEKA 3W7IA 2WSQA 2C0AA 5A8GA 4WD0A 1MSSA 2HSAA 3LRKA 4BWLA 3A23A 4UTWC 1SUXA 3JRKA 4N6EA 2QUUA 3SIZA 1IXNA 2AQWA 3ZR4A 4UMBA 2ZDRA 1NF0A 1SR9A 5D38A 2CLIA 2QF7A 5DBUA 3LHZA 4MFDA 4DO4A 5AYZA 3FYOA 3O15A 4TX9A 4UIOA 5DELA 3LXBA 2WPBA 4JX4A 1WOBA 4PL2A 4G1KA 1MXSA 3O16A 5KSWA 3FYPA 3W6YA 1PCKA 3DHFA 5K9XA 1C9DA 4Z1DA 1DOSA 4IMFA 5TIMA 4O14A 3I7RA 1SZEA 5LGXA 4HIBA 5F2LA 3LCWA 4K7YA 1YXCA 1B4EA 5BMWA 2VFGA 4NX5A 4XTIA 3KX6A 1P0KA 2E1DA 2NXHA 1F2JA 3R13A 4LV9A 3UWVA 1BEUA 4UFIA 4POCA 1H63A 1TTPA 4UNKA 1UBSA 1EPXA 4IXXA 1S3HA 1SO6A 1JCXA 3TW7A 3WJYA 5LNRA 3PBUA 2YFOA 1AW5A 4LUIA 4O8RA 1SSDA 4FB7A 4JYFA 3HPXA 3TJXA 4FNQA 1TPUA 3SJ3A 4FXSA 1DKWA 5C5YA 4WUIA 1GOXA 5BOOA 2VOMA 3NOEA 5I3HA 4JTHA 4IX2A 3N73A 5D2VA 5D09A 3L68A 3QF0A 3GYEA 2Y62A 4ZQPA 5AYYA 3BGJA 1S5VA 3GDRA 1YPIA 1OYCA 2QEZA 3BARA 3ABSA 3PY2A 5AHMA 1L6YA 2PURA 2V8ZA 3QFEA 3W71A 3QYQA 4MLJA 2V30A 2VFFA 2V0TA 1A53A 3F1QA 3STFA 1LOSA 1SZGA 3LHYA 2DP3A 3WJSA 3C3NA 1KTBA 2CFFA 3UPBA 5HR7A 2C3ZA 4LOCA 1TTJA 4N9CA 1G4TA 2Y7FA 1DVJA 1OX5A 1KM3A 1PHQA 1XBVA 1RPXA 1KFBA 2DU2A 4HKPA 1TTQA 3TU9A 1EA0A 2CLKA 1NSJA 1YDVA 4AWTA 3G1XA 1HL2A 1LDCA 1PV8A 2FTPA 3P8JA 1PS9A 1GVQA 3FA5A 3LLDA 3DFQA 4QJ1A 2NWRA 2ATMA 1ZFJA 3KFTA 1W37A 1FWWA 4HN4A 1GVOA 1XBYA 3WJZA 2UV8G 4EWND 4XKYB 2IQTA 4WX2A 4UFMA 4RR4A 1D3GA 1SFJA 3CB8A 2C1HA 3O6YX 1TRDA 3MP3A 4YL2A 2Q8LA 1K7FA 3MP4A 4RXFA 3N19B 5D04C 4I7WA 1EX5A 3KVKA 5LZLA 3UWWA 2Y7DA 3LI0A 3TDFA 5CG7A 1IXQA 5HMSA 4RLIA 3W7KA 3NEVA 3RLVA 1MEHA 4H6KA 4GC4A 1EB3A 5IBXA 3KVMA 1XCFA 2ISVA 3KVJA 4OWGA 4M19A 3NQ7A 4OQVA 3HGRA 3O06A 4S2BA 1L2UA 2Y6ZA 1FY6A 3W1XA 2BXVA 2E77A 3NPXA 5EY5A 2YZRA 1AL8A 4PL1A 3KHJA 4O54A 4RZ6A 2J24A 5A5WA 1O95A 3O05A 3LV5A 2QAPA 4PH6A 4WY0A 2A0NA 3CWNA 3MP5A 3GR8A 2PRLA 4HNVA 5HULA 1JRCA 1JRBA 3KVLA 1TJPA 1H1YA 2JK2A 1SO5A 3S5ZA 5ABTA 2JKPA 1F5ZA 4O18A 5LNSA 4CNPA 3HMJG 4NU7A 4TIMA 4AHPA 3S1VA 1MEIA 1NVMA 2C13A 3P84A 1LTDA 2ZRVA 3W7OA 4QIUA 5G4WA 2Y61A 1Z48A 2ZYFA 3DAQA 4GJ1A 3MO7A 4ZQOA 4JDBA 2WSYA 3E9AA 3QMSA 1F74A 3W1AA 2YXGA 1H5YA 2DZUA 5FEZA 1RD5A 1LP6A 4L4LA 3BW2A 1BWKA 2Y88A 2QUVA 4WOQA 4HSNA 2GUUA 4LY8A 1ZAHA 3BG5A 3EWWA 1UJPA 3PBYA 2C16A 3W7LA 1GWJA 2E5DA 1X1ZA 1KBIA 3TW6A 4GUFA 2O7SA 4PODA 1VLIA 3EXTA 4JTSA 3RFAA 3IV3A 2A7PA 2WSRA 3RU6A 3LHUA 4FXRA 2J6XA 2NLIA 2WOQA 3W7GA 1TTIA 5KZDA 5EYWA 3USBA 4P2VA 2A6LA 3LHVA 1PL9A 3L2IA 1TPFA 3LCLA 4GE8A 5FI8A 2QCGA 1KA9F 2QDGA 2Z6JA 5MHBA 2C6QA 3W2LA 4DBEA 5LNWA 4FF7A 2B7OA 1QFEA 4GNJA 1QOQA 1OVDA 3IEBA 5F2MA 1ME8A 2F7FA 2CW6A 1G7VA 5I3KA 4QQ3A 1OFQA 3FS2A 1Q6OA 3UWUA 2J9ZA 4N02A 1CW2A 3W7NA 3MW7A 3MMTA 4ZQCA 3DZ1A 1H51A 2A5HA 1OF6A 1WV2A 3MYOA 1WQ5A 3N3MA 1RVGA 3W23A 3W1TA 3WK3A 1JR1A 4AH7A 4NJIA 1TB3A 2ZRYA 4EVZA 1A50A 3NQMA 1TV8A 1J4EA 1OFOA 2H3DA 4O4WA 1WBHA 2CWNA 3N9RA 2PRMA 2ZZ3A 3L9CA 4OHQA 4UTJA 4K6AA 1QWGA 3PB0A 1I8JA 1TIMA 4LRSA 1KTNA 3W87A 3OHIA 4JDYA 4UTIA 3DHDA 8TIMA 3HBLA 1W54A 4BI7A 1RQEA 5CZ0A 5KZMA 4OV9A 3W84A 3EX6A 3LDVA 4LC8A 1TMHA 5CSRA 3EWXA 1QPQA 4RV8A 1V5XA 3PC0A 4UTMA 4XTDA 1ICSA 4M6VA 3VKJA 3CHVA 4WY0B 2FB2A 5K3VA 2H3BA 1TPWA 3CU2A 4LC6A 2Y63A 3SY5A 1ZHAA 4IMEA 1UCWA 3R89A 1DL3A 4FHAA 3B0VC 4RK8A 3EX4A 3M5YA 1LZOA 1SO4A 2GOUA 2NX3A 3BGGA 5D33A 3TAKA 1THFD 4AVFA 1DORA 3FIGA 1KM4A 4NQ1A 1T8XA 5C2XA 3C2OA 2VFHA 4ZMGA 3DGRA 3PVFA 4QISA 2NX9A 2A1YA 2QCLA 4OGZA 4GUGA 1K7XA 4K36A 2V2HA 1L6WA 2CZDA 2YDAA 4UTTC 3NQFA 1GYNA 3P60A 3W7CA 1TQXA 2RKXA 3EWYA 1Q6QA 1VCVA 4M7SA 5D30A 3UWQA 5HR6A 4UTHA 1Z41A 3THAA 3W7PA 3LX9A 3GXTA 3NA8A 1EUAA 3W2JA 5AOUA 3ATZA 3W7EA 4MOZA 3M5VA 1EWDA 4WY0F 2DJLA 1ZENA 2CLFA 3N9SA 3N14A 2DZVA 1G4PA 2Z1BA 4RJEA 4NUWA 4MPQA 5D03A 2YFNA 1LLWA 1JVNA 4JTFA 5I3IA 5LHEA 4LWWA 1OYBA 3E12A 3GX9A 3C56A 4XBSA 3BW3A 1EWEA 3DFTA 3QW3A 1X1OA 2KZHA 2I1OA 3Q37A 1GVRA 3W07A 1LOQA 2ZZ5A 3NG3A 3PG9A 1SQ7A 2ZZ2A 3G22A 1QPNA 5KZEA 2Q8ZA 2XFWA 3STGA 1FWTA 4IWWA 2AAMA 3A24A 3LBMA 4DXVA 3GDTA 4KWWA 5HWMA 3WJWA 1ALDA 5TBOA 1GZGA 2XN2A 3T44A 3GAYA 4DO6A 3UYCA 4MYXA 3L0KA 1F6KA 1DBTA 1F6PA 1XL9A 4O28A 4MZ8A 2E09A 1H50A 4DF1A 4RZ5A 4M6QA 1VLWA 3TV8A 1GG0A 1RQBA 5FF7A 2A7NA 1LBLA 3CWOX 3G1FA 3W73A 1B3OA 4GRSA 2QJIA 2XN1A 3W74A 1GTEA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3QEZ A;  3BSG A;  3H12 A;  5DY3 A;  4NJJ A;  5C71 A;  3JVA A;  4AWU A;  1HKI A;  2YL6 A;  3BIC A;  4D1I A;  4F66 A;  3WBE A;  1TR1 A;  3TN6 A;  1HG3 A;  1KNW A;  3R7M A;  4QAI A;  3MAN A;  4B90 A;  4RDW A;  5BU6 A;  1WCG A;  2GGI A;  1O4U A;  2J4G A;  3TWB A;  2HPI A;  2VD8 A;  4UFK A;  2YLA A;  5AC8 A;  3DI1 A;  3F2B A;  1F76 A;  1SSG A;  3K1D A;  5BRQ A;  1XLG A;  1RJP A;  3UND A;  2ZRU A;  2E6F A;  1XDL A;  3PSW A;  5M1T A;  1XLA A;  1RK6 A;  4K39 A;  4WKF A;  3K46 A;  2CNC A;  5U7S A;  5DBT A;  3QJA A;  5FA5 A;  4QLJ A;  1PUD A;  1I45 A;  4JYD A;  5AC5 A;  2VX5 A;  4XZW A;  3SFK A;  1RA0 A;  3ARU A;  4J3Z A;  5JBE A;  4ML4 A;  1MFV A;  4M3P A;  2GWG A;  5G4E A;  3W2U A;  2G3F A;  1Q8J A;  1AOD A;  5HQE A;  3UER A;  2PDH A;  3UET A;  1OFP A;  3BG9 A;  4L9X A;  4QG8 A;  3BSM A;  1LLZ A;  1XLL A;  3EDF A;  1KR0 A;  2BHZ A;  5AHE A;  4PFH A;  1EBH A;  4LY4 A;  3EAU A;  1OX4 B;  4K7V A;  4AG0 A;  2C18 A;  3KEH A;  3UD6 A;  3HFT A;  2QNE A;  1K8C A;  1CGU A;  1NDY A;  4DI8 A;  2R82 A;  3CGT A; 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