2CLOA

Tryptophan synthase (external aldimine state) in complex with (naphthalene-2'-sulfonyl)-2-amino-1-ethylphosphate (f19)
Total Genus 102
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
102
sequence length
266
structure length
257
Chain Sequence
ERYENLFAQLNDRREGAFVPFVTLGDPGIEQSLKIIDTLIDAGADALELGVPFSDPLADGPTIQNANLRAFAAGVTPAQCFEMLALIREKHPTIPIGLLMYANLVFNNGIDAFYARCEQVGVDSVLVADVPVEESAPFRQAALRHNIAPIFICPPNADDDLLRQVASYGRGYTYLLSRSGVTGHHLIEKLKEYHAAPALQGFGISSPEQVSAAVRAGAAGAISGSAIVKIIEKNLASPKQMLAELRSFVSAMKAASR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords TRYPTOPHAN SYNTHASE ALPHA CHAIN
publication title Allosteric Regulation of Substrate Channeling in Tryptophan Synthase: Modulation of the L-Serine Reaction in Stage I of the Beta-Reaction by Alpha-Site Ligands.
pubmed doi rcsb
source organism Salmonella typhimurium
total genus 102
structure length 257
sequence length 266
ec nomenclature ec 4.2.1.20: Tryptophan synthase.
pdb deposition date 2006-04-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00290 Trp_syntA Tryptophan synthase alpha chain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2cloA00
4EF9A 5KSWA 4O18A 3HMJG 3WJWA 1W5PA 1EP2A 1S5VA 3NQCA 1J5TA 4O53A 2NUWA 4ZVJA 3M0ZA 4PEKA 5CZSA 2Y89A 3EWUA 3L21A 1DJQA 4CNOA 3FIGA 4A29A 3LV5A 3B03A 3KRZA 3QQ1A 5EYWA 4ML9A 1YXYA 4NQ1A 1WAUA 1RZMA 3LTPA 3HG5A 3A23A 3W1XA 5K3VA 1TPC1 2V82A 4AWTA 1QNVA 1TYGA 4CQAA 3T55A 1KW1A 3GK0A 4ONVA 3W1AA 2WKJA 2WO5A 5KZMA 4EWND 2DP3A 4QM1A 3G1FA 3OEXA 1IXOA 1FWNA 1K02A 2E09A 3DXIA 1HO4A 2ZFAA 4IJBA 1S5WA 3UNDA 3STEA 3L5AA 4E38A 4LC8A 5D09A 4JTEA 4JTGA 1VCVA 4TU1A 3W87A 3NPUA 4BI7A 4POCA 3C2FA 1OFPA 4U28A 2YZRA 5F4SA 3RMJA 4WQ6A 2A4AA 3G8EA 2ZYFA 3OG3A 4PC8A 4E0CA 1O4UA 5F2IA 4N9EA 3USBA 2WNNA 2ATMA 1B4EA 4CNNA 1VHCA 1FXPA 3ZWSA 3LV6A 3O1NA 4G1KA 3LI1A 3HGRA 3VFLA 5HJLA 1XM3A 2ZRYA 1SUXA 2VEIA 3DHFA 3LXCA 1A5AA 1GJPA 1FCQA 3M5VA 3PB0A 3HG2A 1IIGA 2PC4A 4NT0A 4RXFA 1RD5A 4OT7A 5BOOA 3G1SA 3G0XA 2ZRWA 4YMZA 1ZY9A 4MZ8A 3W7IA 4CCDA 3M44A 1KFKA 4K8HA 1H62A 3STGA 1MO0A 2OZ0A 3RNDA 3NZRA 4NZJA 3Q37A 1M7PA 1SFLA 2YXGA 4NJKA 3VE7A 3QM3A 2EAWA 3BV4A 3L0NA 4MUZA 2DJLA 3V1PA 4ZQCA 5G2WA 4R34A 3EKLA 3TKFA 4WY0A 1TQJA 3W6YA 2ZRXA 1H7PA 3W86A 3H53A 2VC6A 3M9YA 3NZ1A 3EWXA 3KVKA 1TTIA 3LXBA 2VXNA 3W84A 2DU2A 3CHVA 2CLMA 3EX1A 4UFIA 4UNLA 3WK2A 5LNUA 4M5PA 4O54A 3YPIA 2Q3OA 5HWMA 4M6VA 2F7FA 4Q33A 2V8ZA 3CIWA 2FLIA 2Y7EA 3FFSA 4XKYA 1S3HA 4RXGA 1SPQA 2EGZA 2EHHA 3HGJA 1NFBA 3Q2DA 1W8SA 4JTLA 1I8JA 1FWWA 1PV8A 2DZTA 4JTJA 4R53A 3C2VA 4IXHA 4GBUA 5I3HA 1D9EA 3W76A 1GVFA 5T26A 3KVMA 1PE1A 2QCEA 4UTUA 2WNZA 1UCWA 3PWAA 3O05A 4CCEA 3EWYA 2QJIA 4JTSA 5AHFA 2RFGA 3G1VA 3LTSA 2NX9A 3GKAA 3TSBA 4EIVA 3BVJA 3LDVA 3DFTA 4K37A 5DXXA 2FPVA 2RH9A 3OIXA 4H6KA 2QAPA 3QMTA 5BNKA 3THAA 4IPIA 2GVLA 3O06A 5CZTA 5FF7A 2Z2UA 1HUVA 2PRLA 1TTJA 1OF6A 3UWQA 1KFBA 3W7HA 1B9BA 3GDTA 3MWAA 3W9ZA 3LLFA 4Y9AA 3O07A 1VLWA 1HG3A 2B0MA 1AG1O 3B4UA 4DF1A 3H54A 1XKYA 3LCIA 3FJLA 3LHUA 2PE4A 3BW4A 3FKKA 1BWLA 1PIIA 3LGEA 5I3GA 2GQ9A 2A85A 3RF9A 1TPH1 1QMLA 1QPQA 4MZ1A 4MY8A 3SSJA 3GKFA 4JN6A 1TTQA 5FEZA 3GDKA 2A0NA 1G69A 1VR6A 3B04A 3O16A 1JQVA 3TDFA 2X1RA 1VS1A 4QSHA 2B7OA 1L2UA 2NWSA 3H55A 3DFPA 3W2KA 2ZQ0A 4DBDA 4LTSA 3NQ2A 1KFJA 3PBWA 3IV3A 4UMBA 4DPQA 3NDOA 2ZA3A 5SWUA 3W7KA 1EA0A 2XN0A 4JTKA 3LRKA 2H3DA 1JCJA 4XBSA 4JGDA 3OBKA 3C61A 4S2BA 2VFDA 2YW3A 1ZENA 4PTNA 3GXNA 2W6RA 3SGUA 3MMTA 3G18A 3LERA 1JRCA 3NQ8A 3OA3A 2RDUA 3TQ0A 5HR6A 4MYXA 4LS1A 1ZAHA 3FS2A 2E77A 2XFWA 2GQ8A 5I3KA 2A21A 4CQ9A 2Y7FA 4PH6A 5D2WA 2Y7DA 1BTMA 3QSTA 1EIXA 2YFOA 5KZEA 1XUUA 4RZ4A 5G5IA 3LXAA 3S5ZA 2W0UA 4DXVA 2PURA 1PVNA 3GDMA 1A5CA 4MVAA 1F2JA 3S6DA 3CWNA 1GT8A 1QPRA 4NZFA 2VFFA 2ZCGA 4IMGA 1JUKA 1A53A 5K9DA 1KM2A 1F7BA 3GNDA 1GTHA 2CZFA 3MJYA 5F2MA 2ISSA 3NOEA 3KRUA 5KZDA 1OFAA 4ZQMA 5KTLA 1N7KA 1O5XA 2HSAA 1VC4A 3C56A 3ABSA 2H6RA 3UYCA 1H7XA 2QJHA 1WOAA 3ANYA 3Q94A 4UTTC 3PAJA 3TW6A 4ALDA 4MFDA 3W7CA 1R46A 3TFCA 3P8JA 5ABTA 1YADA 4Z1BA 5AYZA 4HNUA 2HS6A 2YFNA 4X9SA 3CEUA 4DO4A 2VKZG 1VRDA 1A5SA 3R12A 2JKAA 4I7UA 3TROA 3GB6A 3FJ6A 4JX6A 3UWWA 3NVTA 3PF3A 3V75A 1G7UA 4GJ1A 2WNQA 1QOPA 2NV1A 2Q8LA 5A5WA 3IIPA 2NXIA 4IWWA 1G4SA 4FNTA 3JR2A 4O50A 4JX5A 1W0MA 4LC6A 1W3NA 1DQWA 1F73A 4UC5A 4TO8A 1FWRA 5GVJA 1U83A 3NL2A 2NX1A 4WY0B 3M43A 2R94A 1GG1A 2YX0A 4Y8FA 3KFTA 1I2RA 3AO0A 4MPQA 3C4UA 4LS0A 4OU1A 1JUBA 3NEVA 3PVFA 2EPHA 1YTDA 3BO9A 1L6YA 1OF8A 1G6CA 4NJGA 1LM1A 2OJPA 4XBKA 5AHNA 1O5KA 3P60A 1FDJA 3C2OA 3UWVA 3BGJA 4N6EA 4P61A 2TYSA 3LHYA 3HPZA 4UTMA 1R2RA 4UNKA 5A8GA 4PFMA 2DJXA 1T0OA 1K3UA 3N2MA 4ORIA 4CNPA 3W7JA 3EWBX 3NM3A 1ZJIA 3NAVA 2EKCA 4Y96A 2CLOA 4RKAA 4WZHA 1WBHA 5CG7A 3SR7A 4FX7A 2OX1A 1MZHA 1SZNA 1RQBA 1TIMA 4GNJA 3BW3A 4O1CA 2YDAA 1SSDA 2ZZ1A 4O17A 4A3UA 3QEZA 3TIMA 3C3NA 4ZQPA 4MYAA 2ZA1A 5FEPA 4UUIA 5D33A 3L2IA 1LOSA 1AMKA 3W3OA 2RHGA 3ZWTA 1LBFA 4FNRA 4QNWA 3C2EA 3G22A 3JS3A 5AHIA 1IXQA 1LORA 3TE9A 2V2HA 4W9TA 3GR7A 4BR1A 1KFEA 2I9EA 3NQFA 1A50A 3TU9A 1KTNA 3W1UA 1UB3A 1KV8A 3MYOA 4NX5A 4O1AA 2BLEA 2CLKA 4GE8A 1W37A 3TXZA 5CPNA 2NUXA 1Z48A 1LCOA 1OFOA 5CGQA 3GYEA 1VZWA 2VFIA 3T44A 1TTPA 3EWZA 1A5BA 1Q3NA 5HUOA 2BXVA 1D3GA 1XBYA 4HT3A 5AC7A 3ABRA 5IBXA 4AWSA 4KFOA 1N55A 4FEZA 5D30A 3W88A 5K9CA 4IPJA 2NUYA 1UJPA 2C16A 2TSYA 1JRBA 4IXXA 4UCGA 4LV4A 2Y7GA 1JCLA 5AYXA 1M6JA 1XI3A 3OHIA 1LBMA 1I2QA 2CW6A 2A7RA 3NR0A 1FQ0A 2VFEA 1G7VA 1F5ZA 4PCFA 3U6WA 1OYBA 3W7LA 5D05A 3DHDA 4MLJA 5HULA 4YLWA 1Q6RA 5HNRA 4LVBA 4UTWC 2ZDRA 1L9WA 3PB2A 4N02A 1J4EA 1EP1A 4ZL1A 2CLIA 2C18A 1SZEA 3SY5A 2A6NA 1NEYA 4OQVA 4FNUA 1LRNA 4DEFA 4AH7A 3SZ8A 2I14A 1W5OA 1RQEA 2Z6IA 2C6QA 2Y85A 4LT9A 1C8VA 1H1YA 1WV2A 4TIMA 4XUGA 4L4LA 4Q32A 1ME7A 1TPVA 2G95A 3GDRA 5D03A 4UMCA 5LKYA 2QCDA 1X1OA 3C0JA 1SO4A 1OFDA 4YXGA 4M6QA 1U5JA 4YWIA 1XBVA 1L6WA 1OG0A 4GUHA 5LHEA 2WSYA 1FY6A 3MHUA 5I3FA 1B3OA 1W1ZA 4FX8A 2Y61A 2QR6A 2R8WA 1TQXA 4MY9A 3P80A 3N9SA 1V5XA 3LOTA 4OGZA 1OX5A 2E6AA 3LBCA 4LVDA 4MJMA 4FHAA 1OX6A 3S5YA 3EEGA 2FIQA 4J9JA 3NYZA 1YXDA 2FPYA 3ELFA 3MP5A 3PULA 3MHFA 1H1ZA 1H63A 5CPOA 1AL7A 3QPZA 3EX2A 3GDLA 1X7FA 4HNTA 4UFLA 4GUIA 2C3ZA 2WSQA 4WD0A 3IVTA 3PM6A 5LNRA 3I7RA 3W2MA 1PHQA 4QIUA 5D37A 4MKNA 5D32A 4MLRA 1LROA 1S5TA 4CLMA 3E02A 5LHFA 1W5NA 5EKYA 1TPUA 2V30A 3UPWA 5FF2A 2QCFA 2NV2A 3TSDA 1W3TA 1Q6QA 1F76A 5L9FA 3CTLA 3GLCA 3LM7A 3A22A 3P8IA 3GR8A 3THQA 4OBTA 4HIBA 4N4PA 3PUDA 3RK8A 3PC0A 3LHTA 3UZ5A 4KWWA 1THFD 2DZVA 1KLZA 3TMLA 1XBXA 1FXQA 5AC8A 3R2GA 3IIXA 2YCEA 3M41A 1TSIA 1TREA 1VYRA 3G3DA 5KINA 1GVQA 2E1DA 1GVRA 4S1FA 1EWEA 1H7RA 3WK3A 5LNVA 2LLEA 1KV5A 3NQMA 3NPWA 3SW6A 1K7XA 1GZGA 2GQAA 1VH7A 1EB3A 1JCNA 2DZXA 4JY8A 4MIMA 1NF0A 1FUYA 4O16A 5KITA 1PCWA 2OT1A 3BGGA 3TA6A 3NO5A 4ADTA 3HOJA 1B4KA 2VFGA 1VPXA 2X1UA 1NAL1 2E6FA 1BWKA 5HQEA 5G4WA 2DORA 1Y0EA 2NX3A 3NQ7A 3BG9A 4JX4A 4Y6GA 4LV9A 5DY3A 2E5BA 1JR1A 4ICNA 2J9ZA 3I7QA 5D2TA 1HO1A 3DH7A 4KFPA 1DVJA 3W70A 1JCMP 1QDSA 2NXGA 4WOZA 4UTHA 1EX5A 2C19A 1R30A 1QO5A 2WSRA 3W23A 3L9CA 2A2IA 2FFCA 2VEPA 3MW7A 2Y70A 1SO5A 4HSNA 3QC3A 3IIOA 1FX6A 3F1QA 3TH6A 3TV8A 4O14A 4DELA 3LHZA 1W3IA 4ZQRA 2NZLA 5C2XA 3M47A 3IVSA 4R33A 3MP4A 4H3DA 4Q4KA 1TPDA 5HINA 1L6SA 1Q45A 3O8AA 5L6UA 1HTIA 1R47A 4GUFA 3QH2A 4HNNA 5CPMA 3VI2A 2VELA 4EF8A 1GOXA 1VQTA 3LBMA 5G2IA 2VFHA 2QEZA 1WYIA 4WOQA 3W1QA 1RQHA 3L68A 2JGYA 3G1HA 3LCGA 2DZUA 3L5LA 4A22A 3MUXA 3PG9A 2QJGA 2GJLA 4LVGA 8TIMA 1P0NA 1H5YA 2X16A 3ZS4A 1SW3A 3P62A 5D02A 4QAIA 4UFHA 3LRLA 2J6XA 3TK7A 4JTIA 3HBLA 4NNAA 1XBZA 2QCDB 1LDCA 3CU2A 3QMSA 3TC6A 1SW7A 3RLUA 2QCMA 1FWSA 4GUGA 3F4WA 4DBEA 4OWGA 3PBVA 1LOLA 3GAYA 3W85A 1QPOA 3GZ3A 3W7OA 1D3HA 5LGXA 3UY8A 3E9AA 4OV4A 3MO7A 2JK2A 2ABAA 3S9YA 3M5ZA 4S2CA 5H91A 3R89A 2QCHA 3CEPA 2AQWA 5EA9A 3SIZA 4XTDA 3W7QA 4UR7A 4C1KA 1OJXA 3UWZA 3FLUA 2AGKA 4BFAA 4IUOA 4XZ9A 3B0PA 1KM5A 3NL3A 4O28A 2RDWA 1QCWA 4K39A 4XTIA 2FB3A 3P7YA 3S8HA 3S42A 3MHGA 3N3MA 1PHWA 4RR4A 3TAKA 2H90A 3R13A 3W7PA 4M7TA 4N9DA 1SZGA 2J24A 3RFAA 3B8DA 1XXXA 2UV8G 3CB8A 1M5WA 1ME8A 4B5NA 4IMDA 3EXTA 3SI9A 3HGSA 3CT7A 2VENA 3W7NA 3S1XA 2JKPA 3TX9A 3S0CA 3N19B 1R2TA 2YYTA 1CW2A 1TV7A 1LRTA 4JD4A 5LZLA 5J5DA 3F4NA 1WDWA 1LRQA 3DBPA 1KFLA 3DI0A 4FF7A 4AB4A 4AAJA 1SQ7A 5F1UA 4BWLC 2X2GA 1J2WA 2GOUA 4WUIA 4IOTA 5K2ZA 1XL9A 2X30A 1KM3A 1ICPA 1ZALA 5CSSA 3NA8A 4O4WA 3QYQA 1FWTA 2QUTA 3TCEA 4ZZ9A 1C9DA 1F05A 3BG5A 1Z44A 3ABQA 1JULA 4O19A 4EOUA 1GVOA 1WXJA 3G1YA 3GIYA 3O6YX 3PSWA 4JEQA 5EPDA 1KA9F 3LCXA 4CQ8A 1OFEA 3IGXA 2V5LA 1DOSA 3NPXA 5AHEA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4EF9 A;  2QUL A;  3HMJ G;  1V0L A;  2X05 A;  1DTN A;  3GW0 A;  4GY7 A;  1W5P A;  1HJV A;  3WJW A;  1VBR A;  1EP2 A;  4PEK A;  2HBX A;  3EWU A;  3FIG A;  3KRZ A;  1CXI A;  4MWA C;  4ML9 A;  3EGJ A;  3V7P A;  1WAU A;  1EJU C;  4IP4 A;  3LTP A;  1VFS A;  1J9Y A;  2QUN A;  3IJ9 A;  1TPC 1;  4DX3 A;  5KZM A;  2PAJ A;  4AUB A;  4CNS A;  1FWN A;  4W7U A;  1HO4 A;  1V6U A;  5AYI A;  3STE A;  4E38 A;  4LC8 A;  1W3K A;  3S46 A;  2FZ8 A;  1YRR A;  3W87 A;  3NPU A;  4EPD C;  3SUU A;  5C0Q A;  1HP4 A;  4U28 A;  4NAS A;  4Q7I A;  4BZY A;  3RMJ A;  1ZQ5 A;  3OG3 A;  4E0C A;  1O4U A;  4QRO A;  3USB A;  2PDW A;  3M07 A;  4WIW A;  4LPC A;  4J3S A;  4FF5 A;  4BY3 A;  3ZT7 A;  2XVG A;  4G1K A;  3HGR A;  3VFL A;  3SM0 A;  3HPF A;  2ZRY A;  5HMD A;  2VEI A;  1A5A A;  3CB3 A;  4JHM A;  2PC4 A;  4JOM A;  3VCC A;  3WLS A;  2ZRW A;  3WN6 A;  1R3W A;  4K8H A;  2F2H A;  3RND A;  2RJG A;  3E0L A;  5CG0 A;  1QUM A;  3APY A;  4L6H A;  1E9L A;  1HN1 A;  3L0N A;  1HJW A;  3V1P A;  1BG9 A;  1Q2S A;  4R34 A;  1J6O A;  3CUJ A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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