The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
5
|
sequence length |
49
|
structure length |
49
|
Chain Sequence |
GSSGSSGSCQYQDLLSNCDSLKNTAGCEHELLKEKCKATCLCESGPSSG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Structural genomics, unknown function
|
| molecule keywords |
Cysteine-rich secretory protein-2
|
| publication title |
Solution structure of RSGI RUH-032, a cystein-rich domain of CRISP-2 from human cDNA
rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
5
|
| structure length |
49
|
| sequence length |
49
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-05-19 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Arc Repressor Mutant, subunit A | Crisp domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2CQ7 A; 2GIZ A; 2EPF A; 1XTA A; 1WVR A; 2DDB A; 3MZ8 A; 2A05 A; 2DDA A; 1RC9 A; 1XX5 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1HW2 A; 2E60 A; 1JTX A; 2LMD A; 3LWF A; 4NC8 A; 4A6E A; 2JPB A; 5J6X A; 5L3C A; 3K69 A; 2VN2 A; 3EUH C; 3RTR A; 1BW5 A; 2XGE A; 4DGW B; 1WFX A; 2ZJR F; 3EQL F; 1U3E M; 1RR8 C; 4N9I A; 1Z05 A; 1DUX C; 1HKQ A; 4XLA A; 2QQ9 A; 2IBD A; 2LY1 A; 2QBY B; 2ZSH B; 4RGX A; 1XN7 A; 3MEX A; 4IHS A; 1A6I A; 4PJM A; 1BM9 A; 1X1A A; 2CFO A; 2EIK H; 5DUK A; 5IP6 A; 2EFW A; 2I5U A; 5DV5 A; 1W4M A; 2FD5 A; 4A3J J; 2DTR A; 4BBR J; 3Q0U A; 1Y0U A; 4G6Q A; 3G1M A; 4RB3 C; 1Z3X A; 3LSP A; 2R92 J; 2ZME B; 5FLX K; 2KT0 A; 3CF2 A; 4EMS A; 4XKV A; 1O3Q A; 3HDD A; 2D5V A; 3P9K A; 1I3A A; 1C0W A; 2F6C A; 1IUY A; 4I0A A; 3GUD A; 3PSF A; 4PZJ A; 5E17 F; 2BXY A; 4NUB A; 2EFO A; 4UUV A; 1X3U A; 2QLZ A; 3S8P A; 1K4T A; 1R7J A; 1XSV A; 4B47 A; 1W0U A; 2HYG D; 3I71 A; 5F1R A; 1D5Y A; 3OYJ A; 1REP C; 4ANJ A; 1TQP A; 1DP3 A; 2PG4 A; 2WBM A; 3JSP A; 4YEJ A; 3JRF A; 2VJI A; 3OWT A; 2NS7 A; 1WH5 A; 4U7B A; 2YU3 A; 2HDC A; 2P81 A; 1J09 A; 2KLO A; 4WXD A; 4NNJ A; 4BH9 A; 3OOP A; 1VND A; 5K5Q A; 3HRS A; 4CCO A; 3L2U A; 3WTT C; 3HL2 A; 4QPO A; 2LVS A; 5CYV A; 2DOD A; 4OIR F; 3JRE A; 2RC4 A; 3H36 A; 4IHT A; 4DYQ A; 2D45 A; 2XAQ A; 4NDL A; 3VFZ A; 4C30 A; 1VQ4 I; 1VQ9 I; 1G2H A; 1M1E B; 3BR5 A; 2CS3 A; 3U2R A; 3FIW A; 3ZQF A; 3CCS I; 1W7P B; 4ZTF A; 2PJR A; 3LSK A; 2DN0 A; 3WGI A; 4ITV A; 4PUS A; 5F6F A; 1EF4 A; 2DMN A; 5IOY A; 1B59 A; 1BJA A; 2DJN A; 2VI6 A; 2XRL A; 3H9G A; 1B72 A; 1HDD C; 1DGW Y; 3R0A A; 2PBI A; 5FLM J; 2QEX I; 1YS7 A; 3L2W A; 5AIQ A; 1VTN C; 1K78 B; 3ZMD A; 2IS2 A; 1OCZ H; 2JA5 J; 4Z6Y A; 2F48 A; 2F5F A; 4H0E A; 1WHU A; 1JUM A; 3ABK H; 4D7N A; 2NVY J; 4MIM A; 3NAU A; 5H2F C; 1IV6 A; 2WAE A; 3QAH A; 5CPR B; 3ELK A; 2OBP A; 3GEZ A; 5B1A H; 4E7K A; 4S04 A; 1U0J A; 3DXJ F; 4I01 A; 4B3X A; 4L9T A; 4BDY A; 2RNG A; 5H20 A; 4E7I A; 5L3E A; 3CJN A; 2KP6 A; 2CV2 A; 3GX4 X; 2PQ8 A; 2HTJ A; 4J19 A; 3KX2 A; 1IO2 A; 2A6E F; 1X3Z B; 4A3F J; 3OYL A; 1PYV A; 3HOU J; 3PIP F; 5F64 A; 5KHD A; 1MBG A; 3L1P A; 2NVX J; 4XQF A; 2FX0 A; 1W36 D; 2MLG A; 1UMQ A; 4EJU A; 2FBH A; 3F6V A; 3S1Q J; 4UXN A; 2M45 A; 3J7A Y; 1X19 A; 3KP6 A; 2IGN A; 3W2A A; 3ZQC A; 1P92 A; 4BYY A; 3OYD A; 4YII A; 2Z3Y A; 3QU3 A; 3O6B B; 4IHY A; 4I02 A; 2STT A; 1YX5 A; 3WE2 A; 2Z5U A; 4F52 A; 4BNC A; 4ESF A; 1KZH A; 4AIJ A; 2VC1 A; 3HTS B; 3HOY J; 1Z6T A; 3MZY A; 2XAJ A; 1LJ9 A; 2VQH A; 5DEQ A; 1ZRE A; 2AXL A; 4DQ2 A; 2GXG A; 5DCF A; 3A1Y A; 1ZTR A; 1BN5 A; 5D5U B; 4IHV A; 1D1C A; 3GF2 A; 2R7U A; 1MD0 A; 3K4L A; 1MNE A; 1R5G A; 3BG5 A; 2ZSI B; 3WTX C; 4E7L A; 1ZRD A; 4XLH A; 3FZV A; 4M9X A; 1AU7 A; 2VON A; 3WU1 B; 3D0S A; 5HOO A; 3J80 K; 2H6B A; 5IPA A; 3FWE A; 1FP1 D; 4I99 C; 3VOD A; 1O3R A; 3S16 J; 1UJ8 A; 3G71 I; 1VQK I; 2UWM A; 1SFO J; 3UKG A; 4XRM A; 4V2F A; 4F93 B; 3MZ8 A; 4HF1 A; 2FNP A; 4AWX B; 2HQ5 A; 4UUT A; 2XDV A; 5BOX A; 1T6S A; 2L01 A; 3K4C A; 2IW5 A; 4FX4 A; 3MD2 A; 5JLW A; 1K61 A; 3F22 A; 3SQN A; 3IKT A; 3HJE A; 3DLL F; 5E1X A; 2CRG A; 3LQR A; 4EM1 A; 2XAF A; 1B9N A; 4GYI A; 5F08 A; 2K4B A; 5M3F J; 1RRJ A; 1KYW A; 3Q5F A; 2WAD A; 1ENH A; 1HLV A; 4EGY A; 1S72 I; 3PNV A; 2Y75 A; 2C6Y A; 2YS9 A; 1B8I A; 2COM A; 4XL9 A; 3COA C; 4G7H F; 3CJT B; 1I39 A; 2Z99 A; 3FK6 A; 1R23 A; 2L02 A; 1QA6 A; 1QQI A; 2E1M C; 2EWN A; 4HLY A; 3K9T A; 1Z3Y A; 3OSF A; 2Y9Y A; 3WGG A; 2V9V A; 2QSG X; 1XSD A; 2DCE A; 4KN7 X; 2DW4 A; 2HQR A; 3R0J A; 5HNF A; 1Z77 A; 1LNW A; 1WPK A; 1D0Y A; 5F0F A; 2VL8 A; 4HA8 A; 1IG7 A; 2NVQ J; 1R1T A; 1H0M A; 2DA7 A; 2FSW A; 3M07 A; 1XTA A; 3LOC A; 3O8G A; 4IRI A; 1ETY A; 2MD0 A; 4UUS B; 3LA7 A; 3V8L A; 4ENN A; 2N8G A; 3O8H A; 3W6K B; 4PGG A; 4HYE A; 2ZB9 A; 4OIQ F; 1UHW A; 5FO5 A; 2CV1 A; 2IGO A; 3HKZ N; 4JOM A; 4AUX A; 4PDK A; 5M5W J; 1W5C C; 1K6O A; 1FBS A; 4XSZ F; 2EIN H; 2HKX A; 1ZAO A; 2LKS A; 1DGR M; 4EM0 B; 3SZG A; 1UFM A; 4BJ5 C; 3GFJ A; 4D9J A; 3ZMZ A; 1RIO H; 1I3Q J; 4HBL A; 4GXO A; 2XAU A; 4S0H B; 2MW8 A; 4ETS A; 2IEK A; 1MGT A; 2JRT A; 3H3Z A; 4ZH4 F; 4M3F A; 4L5I A; 3ZCO A; 2RQP A; 3OYG A; 1K4S A; 4RGS A; 3FXL A; 1SFU A; 1RNL A; 4Q48 A; 4FAS D; 1HA8 A; 2JZY A; 2PFB A; 5FD6 A; 1OCR H; 3S32 A; 2LY2 A; 5EG0 B; 5JLX A; 3HRM A; 4CCJ A; 3S1R J; 3DBL B; 3WOD F; 1CQT A; 2QKM B; 4AM3 A; 4PFO A; 3KZZ A; 4L0Z B; 3M1C A; 1YLF A; 3BJA A; 1AKH B; 1W7P D; 2EFQ A; 2AQF A; 3I9V 2; 3RQI A; 2NOG A; 4HZF A; 1LKX A; 1G3W A; 1ACI A; 2QKL B; 2OV7 A; 4HX4 A; 2Z2S B; 3C2B A; 1FTZ A; 2LLK A; 4KDP A; 1IV8 A; 4E70 A; 4KFC A; 1QRY A; 1MBF A; 5IP7 J; 1LDK B; 2QSF X; 1FYK A; 4Q5S F; 1RKW A; 1P7I A; 1V3F A; 2FQ4 A; 3ESW B; 3LST A; 4OAZ A; 3S3N A; 2VQC A; 2WC2 A; 4V19 K; 1TWA J; 5KVR A; 3R4K A; 4P9U A; 4Y52 J; 2ZNZ A; 4IRG A; 2X1D A; 4H4K C; 2QUF A; 4KA4 A; 1FBU A; 1YO5 C; 2XAG A; 1D1B A; 1ULY A; 1EA3 A; 1U5T A; 2EH3 A; 2G9W A; 3OS2 A; 2BHY A; 5LFA A; 1PP8 F; 1VQM I; 1BOB A; 2HS5 A; 2MC3 A; 5FFX A; 5B1B H; 4I6Z A; 3F0C A; 3ZMU A; 2VLA A; 5KAI C; 1Z9C A; 3S14 J; 3GWZ A; 4V2G A; 2P4W A; 2PMZ N; 4IX7 A; 1J75 A; 4MQ9 F; 4U7D A; 4AD9 A; 5IOZ A; 4L5J A; 4U0V A; 3KZI C; 3ZN0 A; 1FJL A; 1JJ6 C; 1STZ A; 1T33 A; 3ECH A; 1FSE A; 2HR3 A; 2VQL A; 2QCO A; 5K1Y A; 2DU9 A; 2Q1Z B; 3RSN A; 2IA2 A; 3LSJ A; 3MFK A; 4KIT B; 1J7K A; 2CH0 A; 1CGP A; 1D0X A; 1D8J A; 5EF6 A; 3G1L A; 3HZJ A; 3EYI A; 4JX5 A; 4AIK A; 1KU2 A; 3QYE A; 1R22 A; 3MKL A; 4E4H A; 2R7Z J; 1OQY A; 3FHN A; 2L9N A; 2ZO4 A; 1D0Z A; 2CG4 A; 3CP8 A; 1CF7 A; 1MH3 A; 1TW3 A; 4IOC F; 2QQA A; 5FRM A; 2XF6 A; 1U9N A; 2CW0 F; 4DBR A; 1ZR2 A; 1GLN A; 1YE9 A; 3CC2 I; 2CW8 A; 3BJO A; 3BG6 A; 1QBJ A; 1HKT A; 4W1U A; 1Z21 A; 2P8T A; 5EEA A; 2BVM A; 5JVT A; 1MBE A; 2R7Q A; 1T2K A; 2OC6 A; 3RYR A; 4EGZ A; 2F5D A; 3HC7 A; 2R7S A; 4XKB A; 2A6H F; 3QPS A; 1LEB A; 3S17 J; 4KIG A; 2LRE A; 3DQV C; 1P7J A; 1LFU P; 2ZJQ F; 1WJA A; 2W00 A; 2DMP A; 3E6D A; 3GZN B; 2VUM J; 1T38 A; 3VSK A; 4PCQ A; 2ID6 A; 3R6S A; 2OZU A; 4DZP A; 4CCN A; 5FRN A; 1N75 A; 2PJP A; 3DU5 A; 5CVI A; 3AL0 C; 1B6A A; 3ABM H; 1VZ0 A; 2RRE A; 1O7L A; 2ZXI A; 2ZC2 A; 4LD5 A; 2KIU A; 5EGO A; 3SFI A; 1V4R A; 5J8F A; 1POG A; 3I55 I; 2DPD A; 2FOW A; 1NH3 A; 2A3S A; 3IV5 A; 4AYB N; 2EFP A; 2DDA A; 5FD5 A; 2YR2 A; 3HBL A; 4BE1 A; 5H6R A; 4LG0 B; 2X1E A; 1Y6I A; 2X9D A; 3E5Q A; 3FX3 A; 4BE0 A; 2M9H A; 2E2H J; 2P7V B; 3REO A; 5J4Y A; 3E6M A; 4M6Y A; 1QVU A; 4FX0 A; 3WE3 A; 1QZY A; 3Q9S A; 2XC7 A; 2QWW A; 3FXK A; 2LH9 A; 1VQP I; 2ISY A; 3D5L A; 2CO5 A; 3Q3S A; 2HVQ A; 4YIR X; 1I1S A; 2P6S A; 3OIP A; 2YU9 J; 5F0C A; 1R1U A; 2DFE A; 3CO7 C; 3AG1 H; 1LDJ A; 2Y0M A; 3OL3 A; 2HOA A; 1OR7 C; 4QLC U; 3C7J A; 5LEJ A; 5EZG A; 3TO7 A; 2Y9Z A; 4JBA A; 4B48 A; 1J59 A; 3BRO A; 4IVN A; 2KMU A; 3I5U A; 4MQV A; 2LBF B; 1ONV A; 2DT5 A; 1ETW A; 4BUP A; 2QA4 I; 3S2H J; 5EYR A; 2XRO A; 1VQN I; 2EZK A; 1I1G A; 4D1Q A; 2BBY A; 4OIP F; 4CYC B; 2FUG 2; 2XVC A; 3DV8 A; 1JGS A; 3E1S A; 3HGG A; 2OU2 A; 3K4B A; 3OR2 C; 3NQO A; 3CDH A; 9ANT A; 2VKH A; 4HDU A; 3H5A A; 3RYP A; 3E5X A; 3CMA I; 4FHT A; 4HW0 A; 4MGR A; 4F3Q A; 4F92 B; 2JUG A; 2CV0 A; 1V5E A; 2HQA A; 4B09 A; 3H5R A; 2HEO A; 3L09 A; 2OCE A; 4NQW B; 1VQ8 I; 1XDU A; 2MLK A; 4XSX F; 2QSH X; 5GAD J; 2HXI A; 3Q9V A; 4M74 A; 4RAY A; 2OQR A; 1KU3 A; 1MW7 A; 3KP7 A; 3FKI J; 4CCK A; 3H3U A; 4NC7 A; 2KIM A; 4ZC3 A; 1KGS A; 4XMY A; 4YG2 F; 5L3F A; 2E5Z A; 2QQ8 A; 4XON A; 1WSU A; 4A3C J; 2PLY A; 3CJR B; 1ZGJ A; 2VAS A; 1RES A; 3S3M A; 3ZN1 A; 2K4J A; 2W57 A; 3HUG B; 4A3G J; 4G7O F; 3HYI A; 3QYF A; 2KJC A; 5ICC A; 1JKQ C; 3H92 A; 3KPH A; 1BIB A; 2BHZ A; 3C3W A; 4LLG F; 2NVT J; 3J7Y J; 1WJF A; 2EA4 A; 3BDD A; 4XNF A; 3GW2 A; 3WTW C; 5FRO A; 2CW7 A; 1ZQ3 P; 5JFR A; 1QZE A; 2JRM A; 4KMU X; 2PMZ A; 1XGO A; 3OYE A; 3GO5 A; 2P7C B; 1ZG1 A; 4ESB A; 1XMK A; 3KIO A; 1F9N A; 3CCR I; 3PUF A; 3A0B C; 1GV5 A; 1U5T C; 1LVA A; 4KIF A; 4JX4 A; 4P96 A; 4BEH A; 4DW6 A; 5HNH A; 3HM5 A; 1LFB A; 4YFN F; 5FB2 A; 3HB9 A; 5BMZ A; 3DEW A; 1WQ2 A; 2EZL A; 2ZXH A; 2W7N A; 1BA5 A; 1JKO C; 1SMT A; 3LA3 A; 3CDI A; 2DXI A; 4S05 A; 1SMY F; 3WG7 H; 1O4X A; 3QOE A; 3WTY C; 2L9S A; 2M4K A; 3BTI A; 2WAF A; 3DLA A; 4KIS A; 3I58 A; 4L9N A; 3NWT A; 2GQQ A; 2P5L C; 2Y48 A; 3DTE A; 3MN2 A; 3DKX A; 4U0Y A; 2EV6 A; 1F4K A; 4MLO A; 3QOP A; 2D2W A; 2KZV A; 3OIQ A; 3TO9 A; 3I64 A; 3M8E A; 1ZEL A; 1BW6 A; 1SD4 A; 2H8W A; 3F8F A; 4CYD A; 3CC4 I; 2VOD A; 4F91 B; 3KEO A; 1I5Z A; 4ZYA A; 3PIO F; 2VIX A; 1MDM B; 4RM3 A; 5BPD A; 5DD8 A; 2V6C A; 3M7G A; 4PK4 A; 4XIC A; 3O2P E; 4AIH A; 3PL8 A; 2QGU A; 1H88 C; 5TGT A; 3PQK A; 3RPQ A; 1BOA A; 3PO3 J; 4F7Z A; 1OCO H; 3CO6 C; 4ESJ A; 2LNB A; 1GUU A; 4B44 A; 3JAM Z; 3A4C A; 2O0Y A; 2BW3 A; 4II2 A; 5ILS A; 2WY8 Q; 2KDO A; 3IL2 A; 2OTL I; 2CFX A; 2DA3 A; 1SD6 A; 1XDS A; 1YX3 A; 2RVC A; 1J5Y A; 2ZFW A; 2ELJ A; 3RDI A; 2V9P A; 4HV6 A; 3OYC A; 1RPW A; 1S6L A; 1DPR A; 5GP9 A; 2ESN A; 4AYB A; 4E7Z A; 1Z6R A; 2VBW A; 2VKE A; 4BQN A; 4HNT A; 2IP2 A; 3R61 A; 4DZJ A; 5E3M A; 2COB A; 2MH2 A; 3VDX A; 3JRC A; 4HQE A; 4NB5 A; 1TWC J; 2GLO A; 3J7A O; 2STW A; 1R6R A; 2V6E A; 3CJQ B; 2VE9 A; 2BXZ A; 3QPT A; 5LHG A; 1KQ9 A; 2HFH A; 2GM4 A; 2OCC H; 3VWB A; 4BHB A; 2A5Y B; 1GHC A; 2KL4 A; 3U1D A; 2M8G X; 1MND A; 1HST A; 3P9C A; 1XGN A; 2E36 A; 3E5U A; 1JHH A; 3LQQ A; 4IRH A; 4YFK F; 1XPX A; 4IO9 F; 5K5O A; 2AHQ A; 2DI3 A; 4EJV A; 4A0Y A; 2GA2 A; 3EUK L; 1VQO I; 2HNH A; 2CQ7 A; 3BR6 A; 3RIR A; 1IRX A; 4UV8 A; 5HDN A; 5DCM A; 4HX7 A; 4PJJ A; 1Z67 A; 2MD5 A; 2BY3 A; 1AHD P; 2E2J J; 1XCV A; 2PMU A; 2EFN A; 3HSE A; 4E7H A; 1FSH A; 4P5O A; 2Y2Z A; 3HOV J; 3CCQ I; 2HQN A; 3BTJ A; 1EJ9 A; 4M3E A; 1KQ8 A; 3BZC A; 4HLX A; 2K02 A; 2QQB A; 1IXS B; 5FKN A; 3TOA A; 2DDB A; 5L3B A; 1JE8 A; 2E71 A; 4Q47 A; 4U0W A; 4LG0 A; 3ZMT A; 2TDX A; 3BZ6 A; 4RBO A; 3C1D A; 1LEA A; 2CUJ A; 2L4M A; 5E3O A; 2MC4 A; 2OJE D; 4FIS A; 2EA2 A; 3P7N A; 3AG2 H; 1IDZ A; 3N4M A; 4IHW A; 2O6G E; 3OYF A; 2BYV E; 5EEG A; 4A5M A; 4IQJ A; 2L5Q A; 4C2T A; 4XLE A; 4XRS A; 3HOX J; 2O3F A; 2GIV A; 2EIM H; 1MSE C; 3BCB A; 1LE8 A; 3FBI B; 3OYH A; 1IDY A; 4NHJ A; 1ETK A; 2GWR A; 3J81 Z; 5M5X J; 3ZP5 A; 1TT5 B; 3OYM A; 2DA6 A; 4B4C A; 2KHM A; 2ESH A; 1EH6 A; 2CYY A; 1T0F C; 1T8I A; 2LBF A; 3M9A A; 3K6G A; 5HOD A; 5C44 J; 3TGN A; 4C9Y A; 1UEL B; 2E19 A; 1O57 A; 4EJT A; 1X1B A; 1R49 A; 1BR1 A; 1YIT I; 4K2E A; 2ECC A; 4HST A; 2MSY A; 3BG9 A; 3H1C A; 4P9F A; 1P4A A; 4XLC A; 4CYC A; 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