The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
7
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sequence length |
71
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structure length |
71
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Chain Sequence |
GSSGSSGLLARALYDNCPDCSDELAFSRGDILTILEQHVPESEGWWKCLLHGRQGLAPANRLQILSGPSSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Structural genomics, unknown function
|
| molecule keywords |
HEF-like protein
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| publication title |
Solution structure of RSGI RUH-036, an SH3 domain from human cDNA
rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
7
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| structure length |
71
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| sequence length |
71
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-05-20 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF14604 | SH3_9 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1X69 A; 1X2K A; 2LJ1 A; 3I5R A; 3NHN A; 1K1Z A; 1E7O A; 3GBQ A; 2K79 A; 3H41 A; 2BTT A; 2JMA A; 3EG2 A; 1Z9Q A; 1WA7 A; 2ED1 A; 1MV0 B; 2KRN A; 1TUD A; 1OPK A; 4OML A; 4AFS C; 1SRM A; 4AFQ C; 1K4U S; 4IIO A; 2KRO A; 4RUG A; 2EKH A; 3ZL7 C; 1G2B A; 1EFN A; 1QWE A; 3PVQ A; 1SSH A; 2RPN A; 2FO0 A; 1NM7 A; 2KXD A; 4AFU C; 3VS5 A; 1B07 A; 3VS1 A; 5ECA A; 1K76 A; 2HCK A; 3NMZ C; 2JTE A; 2KRS A; 1UEC A; 5GJW B; 3ULR B; 1FMK A; 4DEY A; 1WDX A; 2K9G A; 3NPF A; 1OV3 A; 4JJD A; 1PKT A; 1KSW A; 1NLP C; 2GQI A; 2RNA A; 4RTW A; 4OMQ A; 3SHW A; 1QLY A; 2L0A A; 2RMO A; 2D1X A; 2F2X A; 2O2O A; 4A63 B; 1SHG A; 2EYZ A; 2OI3 A; 3CQT A; 1M3B A; 2DL3 A; 4RTT A; 2YUN A; 5EC7 A; 2LCS A; 2L3S A; 2DVJ A; 1SRL A; 3EHQ A; 3TSW A; 2FG0 A; 2KYB A; 2AKK A; 1S1N A; 1NYF A; 2LMJ A; 2DL4 A; 5I11 A; 1FYN A; 3O5Z A; 1H92 A; 2PZ1 A; 2KBT A; 1JEG A; 1Y57 A; 1SEM A; 1AZG B; 1PHT A; 3VS3 A; 2EGC A; 2ABL A; 4RTY A; 2YUP A; 1JU5 C; 2LJ0 A; 2JW4 A; 3VRZ A; 1MUZ A; 3KFV A; 1GL5 A; 1Y0M A; 1G83 A; 2BZX A; 4J9H A; 2O31 A; 1UTI A; 2FRW A; 1GCQ C; 1PRM C; 2KEA A; 2ROT A; 2LQW A; 1JXO A; 4J9F A; 1T3S A; 1I07 A; 2RQU A; 3EGU A; 1PNJ A; 2D0N A; 2F2W A; 1ZUU A; 1KJW A; 1UFF A; 5IXF A; 2OAW A; 4AG1 C; 1BBZ A; 1QCF A; 1WYX A; 2MCN A; 2A36 A; 5IHI A; 1X2Q A; 2EGA A; 2EYX A; 1NYG A; 1ZX6 A; 2CT3 A; 2DRM A; 2KXC A; 2KGT A; 2K2M A; 1GCQ A; 1VYU A; 2EYY A; 3U23 A; 1GRI A; 1UJ0 A; 4RTV A; 2CT4 A; 1VA7 A; 1ZUY A; 4HCK A; 4JZ3 A; 1ABO A; 3VS4 A; 2YDL A; 1YP5 A; 3JV3 A; 1AWJ A; 1WLP B; 2AZV A; 2LX7 A; 1RLP C; 1NG2 A; 2ED0 A; 2O9S A; 4GBQ A; 2PNI A; 1AD5 A; 3RBB B; 3VS7 A; 3EHR A; 2M0Y A; 4J9B A; 1ZBJ A; 2RQR A; 2ROL A; 1ZUK A; 1M27 C; 2C0I A; 4Z88 A; 3VS0 A; 3UAT A; 5GJV B; 2JS2 A; 1JXM A; 4DEX A; 1QWF A; 2KNB B; 2YT6 A; 2HSP A; 1ZSG A; 1X6G A; 1ABQ A; 2C0O A; 1UHF A; 1M3A A; 2J6O A; 1QKW A; 2CH4 W; 1UJY A; 1X27 A; 1BU1 A; 4D8D A; 1K0X A; 1AWX A; 2QDL A; 2KE9 A; 2F2V A; 4LN2 A; 2RQV A; 2J6F A; 3I9Q A; 4CC7 A; 1RI9 A; 4J9I A; 1I0C A; 3TVT A; 4OMM A; 1IO6 A; 1YCS B; 2A08 A; 1YWO A; 1J3T A; 3H0I A; 2GTJ A; 3UF4 A; 2DL5 A; 3I5S A; 2RF0 A; 3EG3 A; 4K11 A; 4RTZ A; 1K9A A; 1RLQ C; 1BK2 A; 3RNJ A; 4CC4 B; 4ZNX A; 1LCK A; 2W0Z A; 2DA9 A; 2GNC A; 1ZLM A; 2H8H A; 1WXB A; 4X1V A; 2J7I A; 1B3Q A; 3REA B; 4J9G A; 4LUD A; 4F17 A; 2KRM A; 1SPK A; 1UDL A; 2DM1 A; 1Z9Z A; 3PE0 A; 1HSQ A; 2LJ3 A; 2CUB A; 4HVU A; 2EBP A; 4HXJ A; 2SEM A; 4J9C A; 2FEI A; 2ESW A; 4E6R A; 1AWO A; 1T0H A; 1CKB A; 1GFC A; 2V1R A; 4WCI A; 3M0Q A; 1OPL A; 4J9E A; 4FSS A; 5IHN A; 1VYT A; 3QWY A; 3VRY A; 1YWP A; 2D8H A; 2K3B A; 2JT4 A; 4RTU A; 4HVW A; 4KRT A; 3LH5 A; 1M30 A; 2X3X D; 3R6N A; 1X6B A; 2DBK A; 1UGV A; 4EIK A; 2FPD A; 1GFD A; 2BZ8 A; 1RUW A; 2GGR A; 2CH4 A; 2DMO A; 2B86 A; 2CUD A; 2DNU A; 2K7A A; 2YUO A; 2L3P A; 2CRE A; 4OMO A; 5L23 A; 4R0K A; 2LNH B; 5IH2 A; 2YSQ A; 1YNZ A; 5FW9 A; 1U3O A; 4M4Z A; 5IHK A; 2DL7 A; 5I22 A; 2KT1 A; 1VYV A; 3SEM A; 1WI7 A; 1U06 A; 2J6K A; 2XMF A; 2CSI A; 4JJC A; 1H3H A; 1JQQ A; 2HEQ A; 2DL8 A; 2ENM A; 3VS6 A; 1NLO C; 4D8K A; 2GTO A; 1PKS A; 3EG1 A; 2ECZ A; 2HBW A; 1E6G A; 2RQT A; 1E6H A; 4ESR A; 4F16 A; 5IXB A; 3M0S A; 1I1J A; 2E5K A; 3VS2 A; 4F14 A; 3REB B; 2JXB A; 2MIO A; 1AZE A; 2J06 A; 2SRC A; 3QWX X; 1OOT A; 2DE0 X; 2RN8 A; 2L2P A; 1W1F A; 2KYM A; 3A98 A; 2EYW A; 1XOV A; 3M0U A; 2JS0 A; 2V1Q A; 2A37 A; 2AK5 A; 1GCP A; 3PVL A; 2GBQ A; 3M0R A; 1UG1 A; 4IIM A; 2CSQ A; 2MOX A; 3H0F A; 2KR3 A; 2L3Q A; 1WXU A; 2OJ2 A; 2P4R A; 2LZ6 B; 4LE9 A; 2VKN A; 1OEB A; 2IIM A; 2G6F X; 1T0J A; 2EQI A; 2LP5 A; 2DX1 A; 2JMC A; 1U5S A; 1UHC A; 2O9V A; 3FJ5 A; 4GLM A; 4QT7 A; 4AFZ C; 1AEY A; 1CSK A; 2JM9 A; 2DRK A; 2DYB A; 2FRY A; 4JJB A; 1MV3 A; 1PRL C; 4Y92 A; 1QKX A; 2DBM A; 2DIL A; 1UUE A; 2JM8 A; 1PWT A; 2EPD A; 1WXT A; 2BZY A; 4Z8A A; 1V1C A; 2DLP A; 4AG2 C; 5FWC A; 1K0S A; 2X3W D; 1KFZ A; 2FPF A; 2RQW A; 3THK A; 1KIK A; 1TG0 A; 3H0H A; 2D8J A; 2EW3 A; 3UA7 A; 4CC3 A; 3UA6 A; 4RTX A; 2AZS A; 2J05 A; 3TSZ A; 1M8M A; 1NEG A; 1W6X A; 5FWB A; 1ARK A; 3C0C A; 4J9D A; 1WIE A; 2NUZ A; 3EG0 A; 1W70 A; 2EGE A; 1HD3 A; 4OMP A; 2KT8 A; 2AKL A; 1TUC A; 4LUE A; 2LQN A; 4ORZ A; 1WFW A; 4LNP A; 3M0T A; 2DF6 A; 2FPE A; 1GBQ A; 3I35 A; 1X43 A; 2I0N A; 1M3C A; 2NWM A; 2A28 A; 1UE9 A; 2CDT A; 4Z89 A; 1AOJ A; 3NGP A; 2HDA A; 1H8K A; 1WX6 A; 2DJQ A; 2W10 A; 1A0N B; 2YUQ A; 3M0P A; 2EVR A; 2VVK A; 3IQL A; 2O88 A; 1N5Z A; 2K6D A; 1GBR A; 1NEB A; 2VWF A; 1AWW A; 2M51 A; 1AVZ C; 1CKA A; 5HCK A; 1SHF A; 4CC2 A; 2C0T A; 4JPB W; 4JZ4 A; 1YN8 A; 2PTK A; 4OMN A; 1HJD A; 1BB9 A; 1T3L A; 4HVV A; 1JO8 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3G71 Q; 2QEX Q; 3S3O A; 1PSE A; 3MEU A; 1YFN A; 4XTY A; 2P4T A; 2RHY A; 3H41 A; 1RAH B; 4M75 D; 3ER0 A; 1WA7 A; 3OYM A; 5CR2 A; 4F7U F; 1VQP Q; 3L2U A; 3NTK A; 4AFS C; 3A8M B; 4E2F B; 2E5Q A; 3RMS A; 2CP5 A; 1K4U S; 1XTD A; 3FIF A; 4IIO A; 1NPP A; 2EKH A; 3ZL7 C; 1SSH A; 4C0D C; 1K8A U; 2RPN A; 1B07 A; 3VS1 A; 4QVD A; 4M78 C; 2L3R A; 3JCM e; 1K76 A; 1ZQ1 A; 2HCK A; 3NFC A; 3NMZ C; 1VQ8 A; 1N27 A; 2KRS A; 3MCA B; 5LJ3 h; 3L2Z A; 2E10 A; 1FMK A; 3CEY A; 1YJ9 T; 5LJ5 g; 4QKU A; 2RHU A; 1QVF P; 2GQI A; 1PD0 A; 1UEB A; 3E2U A; 3EFO A; 4BI8 B; 3JB9 J; 1M3B A; 3ASK A; 4RTT A; 2EFI A; 2YUN A; 5EC7 A; 3JB9 I; 4QQG A; 3CCL A; 3TSW A; 4PJO A; 9ATC B; 2R5M A; 2AKK A; 4C0D B; 4M7D E; 2CGH A; 2LMJ A; 3J7A F; 1JEG A; 4M78 B; 4F7U G; 3CC7 A; 1NBE B; 1PHT A; 1KC8 C; 2CZ7 B; 3GOX A; 4EMH A; 3MET A; 2DET A; 1VQM T; 3L2Q A; 1PC0 A; 1MUZ A; 3VRZ A; 3CCL Q; 1D3B B; 2OX7 A; 2CP7 A; 3PIO A; 2RB6 A; 4HCC A; 3OYE A; 2KEA A; 4FT4 A; 5HK3 A; 3CD6 A; 3CC7 Q; 3FC3 A; 4B9W A; 1VQK A; 1KK7 A; 1C0M A; 1SG5 A; 1F1B B; 2RQU A; 4PJO E; 2DTH A; 4FYX B; 3TRE A; 1RL2 A; 4FYY B; 4MML A; 4C8Q F; 3CPW S; 4M78 D; 3KXT A; 4OB1 B; 3PNW C; 3ME9 A; 4EMK C; 3HKS A; 1K73 C; 3J80 E; 1UFF A; 1KHI A; 5A0L A; 2H3E B; 2ZPG B; 1BBZ A; 1QCF A; 5LJ3 f; 1KD1 R; 5J26 A; 3VJP A; 1X2Q A; 4FCY A; 1D09 B; 3E1S A; 2CT3 A; 2KXC A; 2KGT A; 4M77 A; 3WVE B; 2K2M A; 4J6W A; 1VYU A; 1YI2 A; 2EYY A; 5KYY A; 1TXQ A; 4DBQ A; 3CCU T; 1UJ0 A; 3MEA A; 5KH6 A; 4LXC A; 1ABO A; 1M4Z A; 3VYG A; 2LVM A; 2VC8 A; 1UGR B; 1AWJ A; 2LTO A; 1RLP C; 1S72 A; 1NG2 A; 4M7A C; 1WNL A; 2O9S A; 4GBQ A; 2PNI A; 2PVO B; 3RBB B; 1YI2 Q; 3Q1J A; 3JRZ A; 2JUF A; 4J9B A; 1ZBJ A; 2RQR A; 1B7T A; 1Y07 A; 1NJI U; 3VS0 A; 2RI2 A; 3UAT A; 5GJV B; 2JS2 A; 1W2B P; 2K5F A; 2KNB B; 2HSP A; 4C8Q G; 5HKC A; 2C0O A; 3SB2 A; 2XDD A; 1M3A A; 3CME T; 5FRM A; 2LCC A; 4M77 E; 1Q86 U; 1N8R U; 2KDS A; 5GAN 4; 2PVD B; 4OF1 A; 2EIF A; 2E64 A; 3CCV T; 1VQM Q; 5HK0 A; 1M5Q 1; 1EZZ B; 4PLL A; 1VUB A; 2J6F A; 2MWP A; 2HQX A; 2XKO C; 4CC7 A; 4X9C A; 4OMM A; 1IO6 A; 2HD0 A; 5GAO n; 2MI6 A; 1YWO A; 1BCM A; 2GTJ A; 2YWW A; 3QSU A; 3UF4 A; 2RF0 A; 4K11 A; 3I56 T; 4J6X A; 4PJO F; 3VV0 A; 3ZFJ A; 2GFA A; 1TOV A; 1X01 A; 4L5G A; 4PFO A; 3RNJ A; 1VQL A; 1ZLM A; 2ATC B; 1O75 A; 2DO3 A; 2J7I A; 4KH0 B; 1HYO A; 4LUD A; 5GAM h; 1PM3 A; 4AT1 B; 4A53 A; 1SPK A; 1WPY A; 2DM1 A; 2DEQ A; 2KAF A; 1YBY A; 1K9M C; 4E7K A; 4HVU A; 4ZN3 A; 2SEM A; 3OYC A; 1VQL Q; 3RUX A; 2ESW A; 3M5A A; 4E6R A; 4J83 A; 2FL7 A; 1T0H A; 3QDF A; 4O6J A; 1CKB A; 4OVA A; 2JTF A; 3QWY A; 4E47 A; 1VQ9 T; 2K3B A; 2JT4 A; 3CME A; 3M9Q A; 1VQ4 T; 1KD1 C; 3OS1 A; 3H8Z A; 2HBP A; 3LH5 A; 1K8A R; 2VXF A; 4XK8 E; 3R6N A; 1BI1 A; 3CCM T; 1JJ2 S; 4C5H A; 2E3I A; 2DNU A; 2CRE A; 4OMO A; 3JCM b; 2P84 A; 3QZ5 B; 3MEV A; 3CME Q; 1U3O A; 4M4Z A; 2QTX A; 2DEU A; 3SEM A; 3N5B B; 5GAN j; 2XI9 A; 1JQQ A; 3I56 A; 2HL5 C; 2ENM A; 2YRV A; 1R0C B; 3VS6 A; 5CKE A; 3EG1 A; 3F70 A; 2RQT A; 1E6H A; 4F16 A; 1W2B A; 2L8D A; 2E5K A; 2JVV A; 5LJ3 e; 1LNX A; 1ZA2 B; 3QYH B; 1OU9 A; 2SRC A; 2MF2 A; 3QWX X; 3I56 Q; 2DE0 X; 2EYW A; 2HKQ B; 5FU7 C; 3M0U A; 3UPU A; 3OSS C; 2A37 A; 4PK4 A; 1OYX A; 1H64 1; 4FW2 A; 2L3Q A; 3GF5 A; 3CCJ A; 4LE9 A; 3CCQ T; 4IUV A; 4FT2 A; 1OEB A; 2G6F X; 2LP5 A; 1VQ4 A; 1U5S A; 2O9V A; 2XU8 A; 1K73 U; 5I2S A; 1Q81 C; 4GLM A; 4QT7 A; 1PD1 A; 4AFZ C; 5KYX A; 3PFS A; 2LC4 A; 1QVF S; 3ZEH A; 3FLG A; 1PRL C; 2COY A; 2X35 A; 4Y92 A; 1OZ3 A; 1QKX A; 2DBM A; 1M1F A; 3CCJ Q; 5FLX E; 2DIL A; 1UUE A; 1UGQ B; 4JRK A; 1VQ9 Q; 1WXT A; 1VQ4 Q; 1V1C A; 4AG2 C; 3EGX B; 2L5Q A; 2Y90 A; 1K0S A; 3MP8 A; 1ZSZ B; 3G6E A; 3JB9 G; 3LW5 E; 3VKI A; 2EW3 A; 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1DJ7 B; 5KCH A; 2D1X A; 2O2O A; 4BY6 C; 4XAX B; 5DY9 A; 3MKD A; 3CQT A; 1VQ7 Q; 1SRL A; 3QZ9 B; 1WZO A; 2KYB A; 2DXC A; 1ZBX A; 3J81 E; 3MO8 A; 1WJR A; 2DL4 A; 2RJC A; 5I11 A; 5CAI A; 3C12 A; 5IAY A; 1H92 A; 1YJN Q; 2KBT A; 2BUD A; 1Y57 A; 1SEM A; 3JCM Q; 2ABL A; 4P5N A; 1NJI C; 2DFU A; 4RTY A; 4MZM A; 2JW4 A; 3S3N A; 4BE0 A; 3P8H A; 4OB3 B; 1KC8 R; 4QVZ A; 3KFV A; 2BZX A; 4A4H A; 2O31 A; 2CP0 A; 2RI5 A; 5CCA A; 1Q86 C; 1N8R C; 1YJW A; 4ME7 A; 4LDW A; 4FU6 A; 4J9F A; 4DBH A; 1UB4 A; 5A0D A; 3BE3 A; 1MMN A; 3EGU A; 2FYK A; 2IPO B; 4PLI A; 2D0N A; 3RDV A; 1KJW A; 5IXF A; 1YJW Q; 3CXC P; 4AG1 C; 3EH2 A; 2A36 A; 3TEE A; 2QA4 T; 1K73 R; 4JS4 A; 2CKK A; 1ZX6 A; 1FX7 A; 2CP3 A; 2DRM A; 2ZPE B; 4J6Y A; 3M57 A; 1YIJ A; 1LVK A; 2P0K A; 1GCQ A; 2DVE A; 1VQP A; 2CT4 A; 3L2V A; 2QQ9 A; 3A8O B; 4HCK A; 1TUG B; 2E6Z A; 1YIJ Q; 2RJD A; 1D1B A; 5LJ5 e; 2WSF E; 1RI0 A; 3QJY A; 2COZ A; 4Z88 A; 1Y71 A; 3RKW A; 5D6Y A; 5A2Q E; 4M7D A; 2YT6 A; 1MHN A; 4WF2 A; 1QMC A; 3SWN A; 2J6O A; 4HT9 A; 4RG8 A; 4J5Y A; 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