2CZ5 | Genus

Total Genus 75

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	75
sequence length	208
structure length	208
Chain Sequence	MIVLALDVYEGERAIKIAKSVKDYISMIKVNWPLILGSGVDIIRRLKEETGVEIIADLKLADIPNTNRLIARKVFGAGADYVIVHTFVGRDSVMAVKELGEIIMVVEMSHPGALEFINPLTDRFIEVANEIEPFGVIAPGTRPERIGYIRDRLKEGIKILAPGIGAQGGKAKDAVKAGADYIIVGRAIYNAPNPREAAKAIYDEIRGV

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Lyase
molecule keywords	Orotidine 5'-phosphate decarboxylase
publication title	Crystal structure of orotidine 5'-phosphate decarboxylase from Pyrococcus horikoshii OT3 rcsb
source organism	Pyrococcus horikoshii
total genus	75
structure length	208
sequence length	208
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 4.1.1.23: Orotidine-5'-phosphate decarboxylase.
pdb deposition date	2005-07-11

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00215	OMPdecase	Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	2cz5A00

5K3VA 2E5CA 3TA6A 4AHOA 2X1TA 1QPOA 3N14A 2ZRZA 2QCNA 1OK6A 3W7KA 2OCZA 2FQIA 5HQEA 4DPQA 3BARA 1GZGA 2O7QA 4Z1CA 3UYCA 4O13A 5HWMA 2OZ0A 1W54A 2CLIA 3NG3A 3R8RA 2BXVA 1VLIA 3G0XA 4PODA 3GB6A 3MHFA 5CZTA 1VCGA 2FB3A 1PHQA 3P74A 1YDVA 2QR6A 1H7PA 2VC6A 2ZQ0A 3DFSA 4HNUA 5K9CA 3W2JA 1TRIA 5LHFA 2JKPA 4BI5A 2AAMA 2VEIA 5C55A 2ZRYA 3IIPA 1HUVA 1SSDA 3W7DA 3CLMA 1H7XA 4JS3A 4O1BA 1S3HA 2V30A 3PBUA 3FFSA 1ZAHA 3LRKA 2NXHA 3W7MA 4LVGA 2C3ZA 2QAFA 4Z0SA 2CZEA 4NZJA 4UTJA 5CKSA 3LI0A 4LOCA 4MKNA 3Q94A 3YPIA 3W84A 1XM3A 3CC1A 5DCEA 2J27A 1FUYA 1LOLA 3LM7A 5G4WA 3LOTA 4H3DA 4K38A 1LROA 2TSYA 3VI2A 1UUMA 2WOQA 2ISSA 3S42A 2FLIA 4JTEA 1F76A 3WK2A 2ZRUA 4N9CA 3DHDA 3OG3A 3TROA 4AVFA 1ZENA 5CG7A 1GG1A 3LRMA 4JYFA 1VC4A 4K7YA 3G1VA 1N55A 1WXJA 2QCFA 1TQXA 1KFKA 2QJIA 4JX5A 1MEHA 4TIMA 1TSIA 1W31A 4RZ5A 3RF9A 5K7JA 3DGRA 2EF9A 3USBA 2RHGA 3NM1A 4O1AA 4CNPA 5D2VA 3TJXA 4FO4A 1UCWA 4PC8A 3B03A 5AC6A 3KVLA 3MJYA 2QCLA 4OWGA 1SW3A 4MIMA 3TXVA 2Z6JA 3TAOA 1Y0EA 4TX9A 4FB7A 2VFGA 3N73A 1OK4A 2QUVA 1JCXA 2C15A 4QAIA 1WOAA 4O54A 1FDYA 3GR8A 2YCEA 1H62A 3TV8A 1FQ0A 3A5VA 2E6FA 3OVRA 2CZFA 1S5VA 2JBMA 2GVLA 3KOFA 1HL2A 3W1MA 4HNTA 2BX7A 4K37A 4O11A 4UTMA 3S5NA 2TRSA 1RD5A 3QZEA 2DZXA 3GVGA 3LTPA 4NJIA 2QAPA 3DENA 4UTWA 1M7PA 4MY9A 2F7FA 3M43A 4QNEA 1XBYA 1W5QA 5DXXA 1YLVA 2ZZ2A 2CLMA 4EF9A 1OYCA 3DFOA 2CW6A 3QPZA 4OT7A 5FI8A 1GOXA 1WV2A 2JGYA 3FYOA 1F5ZA 5CPNA 4DO5A 3LXBA 2XN0A 3R5EA 3SZ8A 2Y62A 2Q8ZA 3EKZA 5AC8A 1A5AA 4S2CA 4P2VA 3LV5A 3LGEA 2ZFAA 1YTKA 1TPH1 5C54A 2XN2A 3W7RA 2A7RA 1KLZA 1B9BA 1U5JA 5LSMA 5TQLA 3ZFHA 3UY7A 3PR2A 3W70A 2QCCA 4RZ6A 4N9EA 2WNZA 4NJKA 1OF6A 3RK8A 1IXPA 4UIOA 1A5SA 1EX5A 1RR2A 3T4CA 1VJIA 2VEMA 3PB0A 3NPUA 2CZDA 3IEBA 3UD6A 1FCBA 2JKAA 3Q2DA 3O16A 4GUFA 2NUWA 2FJKA 4WXYA 5C2XA 2PCQA 3VKJA 1S5TA 4X3ZA 3H55A 2YSWA 1N8FA 1OABA 5LNWA 1HFBA 1DOSA 4BI6A 3EX3A 4UUIA 4MZYA 4LS0A 4XUGA 4AF0B 3W7NA 5LNUA 1ZHAA 3AO0A 1R47A 1UJPA 3W83A 3MP5A 1QAPA 3N3MA 3MI2A 2EAWA 4CCDA 3FKKA 3G1SA 4Z0JA 1D3GA 3M0ZA 3PVFA 3UZJA 3RNDA 4WOQA 2ZA2A 3DFPA 4I7WA 4ML9A 3NL6A 4NJHA 1J2WA 2JK2A 3EXSA 1F2JA 2WNNA 4QITA 4R33A 2DJLA 1LRTA 2QCEA 4Z1DA 3L0KA 3O63A 4FNPA 4LWWA 4XBKA 2H8ZA 3W72A 5D2TA 2CLHA 1EA0A 3W86A 4LRSA 3TUUA 4W9TA 1P0NA 4RLIA 3O6YX 1XKYA 2TPSA 4GFSA 3M5YA 1GG0A 3HGRA 1KFLA 1S5WA 5AHIA 5LKYA 4XTDA 4DO6A 1JUKA 3G1AA 4MUZA 1YXYA 3C2RA 5LZLA 3QW4B 1ZY9A 4EWND 2AQWA 2WSYA 3QJAA 1KV5A 2OJPA 2QDGA 4AB4A 3B05A 5F4WA 2RDTA 2WPBA 3W87A 1ALDA 3OEXA 2NX3A 3GDKA 4Y8FA 1W5PA 3HQ1A 3GXPA 1CX9A 3TW6A 3KFTA 4JR5A 5HNRA 4O16A 1L6WA 1X6UA 1XXXA 1H7NA 2BLEA 1ME7A 2GJLA 3O06A 4UXDA 1R46A 5HULA 3G3MA 4OV9A 5LHEA 3QMTA 3HG4A 4MLRA 4UMCA 1SUXA 3G0UA 4NT0A 3QC3A 5KTLA 1LZOA 3VFLA 1KFEA 3QFEA 4ZQMA 3GK0A 2KZHA 4OGZA 3UWWA 3WJWA 3A24A 3FJLA 3G8EA 3UWZA 1JCYA 3LHWA 4UTHA 4WXZA 4XKYB 3JS3A 1C29A 1K02A 3LBCA 3WJXA 1HO1A 4FEZA 3B8DA 3O1NA 5EMUA 1EEPA 3U8GA 2PE4A 4NU7A 4B5NA 1ZFJA 2NLIA 4MY1A 1X8FA 1LLWA 4UFHA 2A5HA 4P61A 5AHMA 4Q33A 4GXMA 1FXPA 2PRMA 3NQ8A 1MEIA 3DFNA 3INPA 2ZRXA 5T26A 4UNKA 2R8WA 1OX5A 2W79A 4PA8A 1VR6A 5H2ZA 1WBJA 3H54A 3TH6A 4NUWA 4PEKA 3FKRA 2NUYA 4ORMA 3UZ5A 1G69A 1CI1A 4O8RA 1L6YA 2B4GA 1RQBA 2X30A 3T40A 1QOQA 1K03A 4DO4A 2F84A 2ALDA 2V0TA 1XBZA 3E02A 5CZJA 4ZQCA 5U4NA 5F2MA 3RMJA 4J9JA 7TIMA 5E0KA 3HOJA 3MBDA 1FWSA 4LT9A 3VE9A 1JVNA 2BSLA 1H1ZA 4JGDA 3P80A 1JQXA 3TK7A 3JRKA 3OA3A 2E5DA 1IF2A 1X1ZA 1GWJA 3BK0A 1K8YA 2QCGA 3LHTA 3LHYA 4WJEA 4LVAA 1H1YA 4FX8A 3WJZA 2WSQA 5D38A 3EWXA 4H6KA 4RK8A 1HTIA 4NJGA 1WA3A 3GR7A 4DF1A 3L65A 4UTTA 5F4SA 1SO6A 3STFA 2ZZ5A 3PS7A 5GVJA 2QCDB 3PAJA 4C1KA 1W3IA 5EPDA 3M5ZA 2Z2UA 4LS1A 4PL1A 4JY8A 2ABAA 2A6LA 4N4PA 4NX5A 3HPXA 4JTFA 3O05A 3CHVA 4UTIA 2Q8LA 3BLIA 3MP3A 1NF7A 3GNDA 3SW6A 1WAUA 4O28A 4PH6A 1G67A 5KZMA 4ZZ9A 4JNMA 3MO7A 3CPRA 2X2GA 1JQVA 3T55A 3WK1A 3E12A 4NQ1A 3EX2A 3IGSA 3QYQA 1TV7A 2LLEA 3WK0A 4FNQA 3S0CA 2BWGA 2Q3RA 5AHEA 3QPYA 1YADA 2V8ZA 3GZ3A 2OMAA 5D2WA 4L4MA 3R2GA 2GJNA 3N9SA 4MZ1A 1TV8A 1C9DA 3G1XA 4IJBA 2Z0IA 2VFEA 3LCGA 3MUXA 3CWOX 1X7FA 3A23A 1EWEA 4O10A 1X1OA 4ZMGA 3L5LA 3HBLA 4FNSA 4WX2A 3WJSA 4C1LA 4RV8A 3B4UA 1H5YA 3W7HA 4G1KA 2VEKA 1SW0A 5HUOA 2Y6ZA 1ADOA 1OX6A 4YL2A 3A22A 4LRTA 5LNRA 2BZNA 1G4SA 4O1CA 3CQ0A 3W1XA 3B0PA 3BPWA 4O15A 4O0ZA 4JD4A 3O6DA 1NVMA 5CPMA 5E93A 2W0UA 3HG5A 1OFAA 3NM3A 4LVFA 6TIMA 3NDOA 3RFAA 3DKJA 4X22A 3P81A 3L9CA 1JUBA 1BEUA 3KRUA 5I3KA 4BFAA 3PBYA 1JR1A 5D2YA 1H7OA 4FX7A 3IGXA 2VFFA 1SU5A 1B4EA 5A8GA 3T78A 1SPQA 3C8FA 5EL1A 2QEZA 3ABQA 3W7JA 3CTLA 4NNAA 5E1QA 4K8HA 3SGUA 1VYSX 4JTHA 3I68A 2GOUA 1BTMA 4IGHA 3W1AA 1SZNA 3NNTA 4E38A 3PG8A 4NJJA 2P0OA 4NVTA 4AWTA 1XUZA 2BTMA 1VQTA 3E49A 4CCEA 3ATYA 3LLDA 3T44A 5BMWA 1YTEA 2DJXA 4Y96A 3DFTA 4IMDA 3U6WA 3C0JA 1L9WA 1EP2A 1RZMA 5HINA 3Q58A 3FA5A 2WV8A 1JRBA 1EB3A 2ABBA 4K8EA 5HMSA 4RR4A 4XQ6A 3SR7A 1I8JA 2DZUA 3SY5A 3W2NA 1EUAA 3W9ZA 4KFOA 2YR1A 2NWSA 3DU0A 3LBMA 4FIRA 3TDFA 2VOMA 4JTKA 4NZFA 3L5MA 3L68A 4AH7A 5FESA 3I7QA 2VFDA 3PY2A 4UTTC 2A0NA 3OBKA 4K6AA 1JCNA 3PM6A 3ANYA 3NQVA 2NUXA 3TQ0A 2VENA 1VGAA 3C2OA 3L0NA 5KZEA 4GUGA 3D0CA 4O19A 4DF0A 3KVMA 5D30A 1YDNA 2B7QA 3OHIA 4WY0B 4E0CA 2DP3A 4JIQA 5FF4A 4OBTA 4ADSA 1XFBA 2WQPA 1EUNA 1JCJA 1FCQA 2GQ9A 2WKJA 3IGUA 2DORA 4NX0A 1LLZA 1KM0A 1PIIA 3DBPA 3M5XA 4RXFA 1KM3A 3GXTA 2J88A 3O8AA 3FYPA 1SQ7A 4AXKA 3PWAA 1K3UA 4O0KA 5K9XA 4UR7A 1FWRA 2RKXA 4Y9AA 4OE7A 2YDAA 5L9FA 3W88A 1MXSA 4MYAA 1A50A 3N2XA 1JCLA 4FNRA 2PC4A 1HO4A 5D2XA 5H91A 1ZJIA 4ICNA 5AOUA 4FIQA 2V2HA 1Q6OA 1BKSA 4O4VA 4N2YA 4EOUA 3E9AA 1LOQA 1BWKA 4JY9A 1QPQA 2ZTKA 1OHLA 3N9RA 3UPBA 1TPEA 2V5BA 4JEQA 4LVBA 4CQAA 5D02A 2PRHA 3NVTA 1R2TA 4KKXA 2Y70A 1XUUA 4QIUA 4A22A 4JN6A 1UUOA 4MFDA 5DBUA 1KM2A 1TO3A 3I6RA 1TPDA 1YXCA 4L4LA 2P10A 4JTLA 3P82A 1PCKA 2YXGA 1A5CA 1WOBA 5FF0A 3BGJA 4MFEA 3RLVA 1OFEA 3WJYA 2NZLA 3NQAA 3S1WA 1ZAJA 2AGKA 3HPZA 4Y6GA 1GQNA 1GPWA 4OU1A 2ZBTA 1W0MA 2G95A 3C61A 1QOPA 1N7KA 4BF9A 1TPWA 1R2SA 2CFFA 4LS2A 2ISWA 1SSGA 3DH7A 3LRLA 3THQA 1TQJA 3G24A 1KBJA 1W3NA 2B7OA 2C19A 2FPYA 1DV7A 4LY8A 2GQ8A 4H4IA 3BO9A 3O07A 3KXQA 3W1QA 4XBSA 1FX6A 3GDLA 3UPWA 4DPPA 1I2NA 2FIQA 1O60A 1I2RA 2ZRWA 3S1VA 1GVFA 1GTHA 3TQKA 3NQ2A 1VYPX 2EKCA 3TX9A 4IXHA 3PG9A 1M5WA 4ADUA 4YXGA 1LORA 1RVGA 1OF8A 1PV8A 3EX6A 4MLJA 1TIMA 2ZZ6A 3EX1A 3KRSA 4HPXA 4WY0A 4PTNA 1WDWA 3VNDA 1Z48A 5D37A 2ZZ7A 2CLEA 3MWAA 3BG5A 5AHLA 3ABSA 1KM5A 3KHJA 1IIGA 3NOEA 4GC4A 3EEGA 2A2IA 3SFKA 4D2JA 4A2SA 2FPTA 4JICA 2GQAA 1VZWA 2G97A 1G4TA 3G1YA 3I7SA 4O4WA 5F1UA 4WUIA 2V5LA 3AJXA 5F2IA 3NA8A 4AHPA 3WK3A 1XC4A 3NQCA 5D32A 4A29A 1YPFA 2ZRVA 4M19A 3ZWSA 3NXFA 4JYEA 4GE8A 4FHAA 1WQ5A 2PRLA 4XZ9A 2QJGA 3R89A 4I7UA 3NQGA 1T96A 4UTKA 1LDCA 1ICQA 5EBUA 2C16A 1U83A 2C0AA 2ZZ1A 2Q3OA 1TRDA 1TPVA 2H3BA 5G2WA 4EIVA 1QPRA 4OQVA 2I1OA 3KVJA 1AL8A 3NYZA 4TMBA 4WZHA 1QO5A 4QJ1A 1SZEA 3BW3A 3IVSA 3BGGA 1JUEA 4POCA 1OFDA 4Z08A 4Q32A 1W8SA 1MSSA 3BVJA 2E6DA 3HMJG 2Z6IA 2C13A 1ME8A 3P61A 3V75A 2V82A 1O5KA 4PFMA 2QF7A 1VRDA 1MO0A 4HT3A 5KZDA 5TIMA 5D03A 1XL9A 3W7PA 3TIMA 2A7NA 3TSMA 5AB3A 4O12A 4UFIA 4K7VA 4LUIA 4MPQA 1TMHA 4JTTA 4HSNA 3BLEA 2X16A 3I65A 5DCDA 1OFQA 3W85A 2ISVA 1FY6A 1T0OA 3HF3A 1SZGA 3LV6A 4R34A 3B0VC 4LVDA 1AG1O 3DFQA 2NX9A 3BW4A 2RH9A 2RDWA 1DVJA 1DBTA 3M16A 3NPXA 1AW2A 3ZR4A 3G3DA 3S5OA 3LHUA 3NR0A 5HWJA 1TTIA 3UNDA 1TTJA 2GVGA 3W1LA 4LW7A 4O53A 1F6PA 3T7VA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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2CZ5A

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