The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
7
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sequence length |
77
|
structure length |
77
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Chain Sequence |
GSSGSSGQYFVALFDYQARTAEDLSFRAGDKLQVLDTSHEGWWLARHLEKKGTGLGQQLQGYIPSNYVAEDSGPSSG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Transferase
|
| molecule keywords |
fyn-related kinase
|
| publication title |
Solution structure of the SH3 domain of Fyn-related kinase
rcsb |
| source organism |
Mus musculus
|
| total genus |
7
|
| structure length |
77
|
| sequence length |
77
|
| ec nomenclature |
ec
2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase. |
| pdb deposition date | 2005-12-06 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4AG2 C; 3KFV A; 1UHC A; 1SRM A; 1RLQ C; 2LZ6 B; 1B3Q A; 3VRY A; 4LUD A; 4ESR A; 3I5S A; 2PZ1 A; 2BZ8 A; 2D1X A; 4J9I A; 4LN2 A; 1JXM A; 1QWE A; 3RNJ A; 2NUZ A; 1AVZ C; 1I0C A; 2JM9 A; 1H92 A; 1WI7 A; 1JO8 A; 2CUD A; 3UAT A; 2RF0 A; 4RTY A; 4AFZ C; 5IHK A; 2JW4 A; 4IIO A; 4JZ3 A; 3O5Z A; 1SRL A; 2PTK A; 2QDL A; 2GTJ A; 1H3H A; 1MV3 A; 1SHG A; 2ENM A; 1UUE A; 2EGA A; 2W0Z A; 1QKW A; 1AOJ A; 1B07 A; 2DRK A; 3IQL A; 2X3W D; 2DF6 A; 1UE9 A; 1CKA A; 1W70 A; 1GCQ C; 2FPD A; 1M8M A; 1PRM C; 1WIE A; 4WCI A; 2V1R A; 1AZG B; 2YUQ A; 2YDL A; 4OML A; 3NPF A; 2RPN A; 4JZ4 A; 2GBQ A; 1U5S A; 2DYB A; 2DBM A; 2EGC A; 1TUC A; 2GNC A; 3A98 A; 3TVT A; 5I22 A; 1QWF A; 2G6F X; 1YWP A; 4CC2 A; 2CRE A; 2L0A A; 4LNP A; 2AKL A; 4X1V A; 1E6H A; 2K2M A; 1VYV A; 1T0J A; 2DVJ A; 1WXT A; 1WFW A; 1X6B A; 4J9E A; 1OPK A; 1G2B A; 1ABO A; 2AZV A; 1HD3 A; 5IHI A; 1G83 A; 1WX6 A; 2H8H A; 3FJ5 A; 1AEY A; 1NLP C; 2HEQ A; 1WYX A; 1RLP C; 4JPB W; 1GFC A; 2M51 A; 1PRL C; 3VS4 A; 3EG3 A; 3PVL A; 2DL7 A; 2YUO A; 4OMM A; 1CKB A; 1PKS A; 1K0X A; 2KRN A; 2FPE A; 1GCQ A; 3VS3 A; 2P4R A; 4OMP A; 1NYF A; 2C0I A; 2ECZ A; 2EVR A; 2FO0 A; 1JXO A; 2A37 A; 1OOT A; 2JMC A; 2BTT A; 2DM1 A; 2O88 A; 2K9G A; 4OMN A; 1M3A A; 1KSW A; 2VWF A; 2K6D A; 1K0S A; 2X3X D; 1YCS B; 1M3C A; 1WXU A; 2M0Y A; 2KEA A; 2YUP A; 3REA B; 2B86 A; 2KXD A; 2DIL A; 2KGT A; 1IO6 A; 4GBQ A; 2LX7 A; 2KYB A; 1NEB A; 2KYM A; 3REB B; 2LJ0 A; 3EGU A; 2J7I A; 2ROL A; 2DE0 X; 1ABQ A; 2KT1 A; 1GL5 A; 5FW9 A; 2KR3 A; 1QLY A; 1UTI A; 1K1Z A; 2CH4 W; 2FRW A; 2J6F A; 1VYU A; 3H0H A; 2KBT A; 4F16 A; 2LP5 A; 4CC7 A; 1UG1 A; 2D8J A; 4HVV A; 4D8K A; 5FWC A; 1LCK A; 4HXJ A; 4AFQ C; 1KJW A; 1M30 A; 1X69 A; 1Y0M A; 5GJW B; 4RTU A; 2DX1 A; 4ORZ A; 1HSQ A; 2JTE A; 3PVQ A; 2CDT A; 2EYY A; 1YN8 A; 2EBP A; 2KXC A; 3M0P A; 2DBK A; 2HDA A; 2DJQ A; 4RTX A; 4QT7 A; 2DL5 A; 4F14 A; 2A36 A; 2NWM A; 2BZY A; 1AWX A; 2L3Q A; 3VS5 A; 1EFN A; 1UDL A; 1ZSG A; 5ECA A; 2HBW A; 2KT8 A; 1OV3 A; 1NEG A; 1E6G A; 3UA6 A; 2A08 A; 2HCK A; 1GCP A; 4HCK A; 1JU5 C; 1TG0 A; 1X6G A; 2RQW A; 1RUW A; 1FYN A; 1W6X A; 1PKT A; 2L2P A; 1YNZ A; 2AKK A; 2FPF A; 2CH4 A; 2LNH B; 1A0N B; 2GQI A; 2DL3 A; 2O9S A; 4M4Z A; 2OI3 A; 2EKH A; 1WLP B; 4LE9 A; 2PNI A; 5EC7 A; 2ED0 A; 1VYT A; 1HJD A; 2DL4 A; 2IIM A; 2EPD A; 1PHT A; 3SHW A; 2JXB A; 2D8H A; 1GFD A; 4JJB A; 2JS0 A; 4JJD A; 3TSZ A; 3EG1 A; 4F17 A; 2W10 A; 1AWO A; 1TUD A; 2LMJ A; 5IXB A; 1UJ0 A; 3M0R A; 2FEI A; 3H41 A; 4DEX A; 1SEM A; 1UJY A; 3VS7 A; 3UF4 A; 1V1C A; 1MV0 B; 2F2W A; 1N5Z A; 2AZS A; 2L3S A; 2MCN A; 4OMQ A; 2LQN A; 1U3O A; 4R0K A; 2CT4 A; 2GGR A; 4J9C A; 4RTV A; 5IXF A; 1PNJ A; 2VVK A; 2LJ3 A; 3M0U A; 3QWX X; 1K9A A; 4K11 A; 4JJC A; 2YT6 A; 3VS0 A; 3EHR A; 1PWT A; 3VS1 A; 4E6R A; 5GJV B; 1Z9Z A; 2EYX A; 1WA7 A; 1T0H A; 2HSP A; 1JEG A; 4CC3 A; 3LH5 A; 5L23 A; 1W1F A; 4Y92 A; 1AWJ A; 1AD5 A; 2ED1 A; 2KNB B; 3TSW A; 1KFZ A; 2LQW A; 2DMO A; 4RUG A; 4J9B A; 1NYG A; 3NMZ C; 5IH2 A; 2JT4 A; 2JM8 A; 2AK5 A; 1Z9Q A; 2DLP A; 3H0F A; 3GBQ A; 2LCS A; 2KRM A; 1VA7 A; 1YP5 A; 1WXB A; 3M0S A; 2F2V A; 2CT3 A; 3UA7 A; 2SRC A; 1X27 A; 4FSS A; 2D0N A; 2DNU A; 2O9V A; 3QWY A; 5IHN A; 3ULR B; 2GTO A; 1Y57 A; 2JMA A; 3SEM A; 1BB9 A; 1BK2 A; 1GBR A; 4IIM A; 2CSI A; 5HCK A; 3I9Q A; 4AFU C; 2BZX A; 1RI9 A; 1GRI A; 3R6N A; 1E7O A; 1ZUY A; 1U06 A; 2RNA A; 2MOX A; 3C0C A; 1MUZ A; 2O2O A; 1GBQ A; 4RTT A; 2C0T A; 1X2K A; 2CUB A; 1AWW A; 2RQT A; 3NGP A; 1X43 A; 2F2X A; 3H0I A; 2FRY A; 1T3S A; 2ABL A; 3I35 A; 3EG2 A; 2EW3 A; 2RMO A; 2JS2 A; 4J9G A; 4Z8A A; 4CC4 B; 1I1J A; 1NLO C; 3U23 A; 4AG1 C; 1OEB A; 1NM7 A; 1J3T A; 1K4U S; 2J6O A; 1AZE A; 2VKN A; 3JV3 A; 3CQT A; 1ZUK A; 2ESW A; 2C0O A; 3THK A; 4ZNX A; 2FG0 A; 2K79 A; 1UEC A; 1H8K A; 1ZBJ A; 4KRT A; 2RQU A; 2L3P A; 3ZL7 C; 1ZUU A; 1T3L A; 2K7A A; 2KE9 A; 5I11 A; 2O31 A; 1QKX A; 1ARK A; 2KRO A; 1CSK A; 4AFS C; 1BU1 A; 2ROT A; 1NG2 A; 4LUE A; 2A28 A; 2MIO A; 2OJ2 A; 4J9D A; 1K76 A; 4RTZ A; 3M0Q A; 3VS6 A; 1M3B A; 1S1N A; 2EQI A; 2OAW A; 2V1Q A; 2XMF A; 4HVW A; 5FWB A; 4HVU A; 1ZX6 A; 1M27 C; 4RTW A; 1UFF A; 2RQR A; 1QCF A; 2RQV A; 1SHF A; 1ZLM A; 4J9F A; 4Z88 A; 2DA9 A; 4A63 B; 2DL8 A; 3VS2 A; 2EYZ A; 1SSH A; 3EHQ A; 3NHN A; 2EGE A; 3EG0 A; 3PE0 A; 1YWO A; 4EIK A; 2KRS A; 1SPK A; 1XOV A; 2LJ1 A; 3VRZ A; 4J9H A; 2K3B A; 2EYW A; 2SEM A; 4Z89 A; 2CSQ A; 1WDX A; 4D8D A; 1I07 A; 4OMO A; 1UGV A; 1BBZ A; 3I5R A; 2I0N A; 2RN8 A; 2J06 A; 1FMK A; 4DEY A; 2E5K A; 2YSQ A; 1UHF A; 3M0T A; 4GLM A; 2YUN A; 1KIK A; 2J6K A; 3RBB B; 1JQQ A; 2DRM A; 2J05 A; 1X2Q A; 1OPL A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2DET A; 4AG2 C; 3EGD A; 1VQ7 A; 2CZ0 B; 2LCC A; 4M75 E; 4KGZ B; 3OY9 A; 2XKO C; 4M7D G; 1IZ6 A; 2DER A; 4E7K A; 3I5S A; 2BZ8 A; 2E6Z A; 2MAM A; 2D1X A; 3PNW C; 1TH7 A; 5HY6 A; 1YJ9 T; 3QYG B; 1UGR B; 3RER A; 4EMK A; 2QYZ A; 2XD0 A; 3UAT A; 3JCM e; 2KI7 A; 1VIE A; 4XAX B; 1WZO A; 2K3X A; 5HKC A; 4L59 A; 4JZ3 A; 2WSF E; 1K8A U; 2PTK A; 4OGE A; 4A4H A; 1MV3 A; 1SHG A; 4JS4 A; 2ENM A; 3EH2 A; 2D6F A; 4PJJ A; 3VYH B; 4C92 B; 1JJ2 S; 3URG A; 5CKE A; 2NUP A; 1W2B P; 2X3W D; 1VQ7 T; 2DF6 A; 1UE9 A; 1PM3 A; 1GCQ C; 1VQO T; 2ZPB B; 1PRM C; 4EMK B; 3V7R A; 4C92 E; 3TCJ A; 3CCM Q; 2YUQ A; 2YDL A; 3I55 Q; 3L2Z A; 3NPF A; 2VXE A; 5CKH A; 2DKG A; 2L8D A; 3FIF A; 3TVT A; 3C95 A; 1KQ2 A; 4ZGJ B; 1Q7Y U; 2G6F X; 3EG9 B; 5KYU A; 4CC2 A; 2L0A A; 3A8G B; 2AKL A; 3JCM W; 4X1V A; 4F7U B; 4HCZ A; 2DVJ A; 1U1S A; 1VQM A; 2PQW A; 4MDW A; 3RKX A; 3HRU A; 2AIR B; 3ZEH A; 1OPK A; 3PGG A; 1ABO A; 1G3T A; 2NUP B; 3MEA A; 6AT1 B; 3CXC S; 4F7U E; 3CCR Q; 4ZN3 A; 3M9Q A; 4ZGD B; 2H8H A; 4BI3 A; 2HEQ A; 1RLP C; 2EKO A; 1GFC A; 2P4T A; 2FZG B; 3VS4 A; 1WNL A; 3G71 A; 3OYE A; 3CME A; 1PKS A; 5KYU B; 1K0X A; 4PJO G; 5J26 A; 2FPE A; 1GCQ A; 3VS3 A; 4JRI A; 2P4R A; 2PUO B; 5KE3 A; 1OU9 A; 4QQ6 A; 3G4S Q; 2VGM A; 2HQH A; 2OTL Q; 4KGX B; 4D6W A; 3TU4 K; 5FU6 C; 1DJ7 B; 5GMK i; 1RAI B; 2V8K A; 2DXU A; 2DD4 A; 1WXU A; 2KEA A; 2RM4 A; 1M5Q 1; 2YUP A; 3M5A A; 2KXD A; 1N6A A; 1M2V B; 1K9M U; 2KMT A; 1NEB A; 1WQ7 A; 2LNV A; 2ROL A; 2DE0 X; 1ABQ A; 2HAX A; 5FW9 A; 3M54 A; 1QLY A; 1UB4 A; 2FRW A; 2J6F A; 3H0H A; 3G71 T; 2JZ2 A; 4FW1 A; 4CC7 A; 5GMK e; 3CME T; 5FWC A; 1W2B S; 2LDM A; 1C6V X; 1QP3 A; 1KC8 C; 3CC7 Q; 1M30 A; 1G3W A; 1Y0M A; 4FSX A; 4RTU A; 1HSQ A; 3JCM c; 2EYY A; 1YN8 A; 5J39 A; 3QUI A; 2KXC A; 1VQP T; 2RJC A; 2DJQ A; 1IGU A; 2ZPG B; 2E3H A; 2A36 A; 1WJR A; 3GNF B; 4BE0 A; 2QEX Q; 3HKS A; 2DZ9 A; 3JCM g; 4ATO A; 4M7D F; 4J6X A; 4R56 A; 1NEG A; 3OB9 A; 3LGL A; 4EDU A; 1E6G A; 3M55 A; 4FYX B; 3P8D A; 1JU5 C; 1X6G A; 3FJP A; 4PFZ A; 4E7S A; 1FYN A; 1ZSZ C; 4J7F A; 1YNZ A; 2FPF A; 2NUT A; 1U8R A; 2CYZ B; 4KT0 E; 3G1J A; 2HQE A; 1G3Y A; 4RG2 A; 3RIR A; 1WLP B; 1VYT A; 2MWP A; 4B9W A; 1GFD A; 2Y90 A; 3TSZ A; 5FU6 B; 3V8J A; 4F17 A; 4XTW A; 3JAM E; 3CCJ A; 2FZC B; 5CK9 A; 2FEI A; 4C8Q D; 2NUT B; 1IHV A; 2HKQ B; 1M8V A; 2M1H A; 2F2W A; 1N5Z A; 3CPW P; 5A0G A; 1V76 A; 3CCV A; 2GGR A; 4J9C A; 2DK3 A; 3SDZ A; 1N8R U; 3V7S A; 1KQS A; 4K11 A; 1ZSZ A; 2HL5 C; 4JJC A; 3EHR A; 4MZT A; 4L5G A; 3BFM A; 3QZ5 B; 5GJV B; 3VU3 C; 1KD1 C; 1Z9Z A; 3PMI A; 3OYB A; 1QVF P; 3CD6 A; 5CO7 A; 3JCM h; 3CC2 Q; 2QQ9 A; 1VQ9 A; 3P8B B; 1KFZ A; 3NMZ C; 5IH2 A; 2JT4 A; 4PJO F; 3RDV A; 1HYO A; 1AT1 B; 1D0Y A; 3GBQ A; 3GP8 A; 2KRM A; 4C0G A; 3I56 Q; 1VA7 A; 1MMA A; 5GAN 5; 2IPO B; 3UA7 A; 2OTJ A; 1TXQ A; 4BAC A; 3E9F A; 1R77 A; 3QWY A; 1IHW A; 4QVC A; 3CCL Q; 5KCH A; 4EMG A; 2V8I A; 1BB9 A; 1GBR A; 3BE3 A; 1YJN Q; 2CSI A; 3CCE A; 2BE9 B; 2BZX A; 1YIJ T; 1BIA A; 1RI9 A; 1BCM A; 1EX4 A; 3C0C A; 1WJQ A; 1VQ4 Q; 2HQX A; 2C0T A; 4C8Q B; 1WHG A; 1X2K A; 5GAN 6; 4JLG A; 3CCU Q; 3NGP A; 4Z02 A; 2F2X A; 2FRY A; 4C5E A; 2GFA A; 2E65 A; 5AT1 B; 2EW3 A; 2RMO A; 4J9G A; 3OA6 A; 3BY7 A; 4C8Q E; 1OEB A; 1NM7 A; 3V7C A; 5IAY A; 3QSU A; 3SWN B; 1AZE A; 3CPW S; 1D1C A; 3CQT A; 1ZUK A; 1IXD A; 2FHD A; 2Y4X A; 1SSF A; 3CMA A; 3MET A; 3VYG A; 3LH0 A; 3OMG A; 1ZUU A; 1T3L A; 2OX7 A; 5GAN d; 4FCY A; 3A8H B; 4HKE A; 1CSK A; 2XHC A; 2L89 A; 4BUG A; 2ROT A; 1XJW B; 5M9O A; 2E41 A; 4J9D A; 2VYT A; 3VS6 A; 4R55 A; 4OB1 B; 1YJW A; 2EQI A; 1N9S A; 7AT1 B; 2CP5 A; 5CQX A; 2DD5 A; 2RQV A; 5GMK h; 2K4Y A; 2RI3 A; 4Z88 A; 4M7A G; 3VS2 A; 3O8V A; 2QDY B; 3KUF A; 4ELY C; 3CMA T; 3MHX A; 1M1G A; 3EG0 A; 3JSC A; 3QBY A; 1YWO A; 4EIK A; 1BI0 A; 2ATC B; 3HRS A; 1SPK A; 4NOY A; 1G8X A; 1XOV A; 4FIB A; 1YCY A; 5HK3 A; 4J9H A; 2FZK B; 2CSQ A; 2JOY A; 5A0D A; 3JCM b; 4D8D A; 2IG0 A; 4OMO A; 1UGV A; 1BBZ A; 3I5R A; 2RN8 A; 1Y71 A; 2P0K A; 1I4K 1; 4PJN A; 2MK5 A; 2VUB A; 3M0T A; 1Q81 R; 4GLM A; 3RBB B; 5FU7 C; 5CAI A; 1VUB A; 1JQQ A; 1VQN Q; 1NYF A; 4MML A; 1X2Q A; 1VQ6 Q; 4M78 D; 1YJW T; 1SRM A; 1TSF A; 1JRI A; 4M77 D; 1B3Q A; 3VRY A; 2EQJ A; 4M77 C; 2PZ1 A; 3V8L A; 2HNI A; 3OS5 A; 4OB0 B; 4LN2 A; 1JXM A; 4DBR A; 3RNJ A; 2NUZ A; 3QII A; 1AVZ C; 1I0C A; 4JJN K; 2JM9 A; 3X25 B; 1WGS A; 3CC4 A; 3NTK A; 3QKJ A; 1QVP A; 1NJI C; 1D0X A; 2EQU A; 4M75 D; 3S6W A; 4FT4 A; 4IIO A; 4JUV A; 4A4G A; 4LD6 A; 1SRL A; 2QDL A; 3CCS Q; 1H3H A; 5GAN 8; 3JB9 D; 3S3M A; 2EGA A; 2EJG A; 2ZAE A; 2LX9 A; 4P5N A; 4FW2 A; 4KH0 B; 1BI3 A; 3UPU A; 1YI2 Q; 3OW2 S; 1B7T A; 2L3R A; 1Y96 A; 2FPD A; 4IUV A; 1K73 U; 4ZTF A; 1LJO A; 4DA4 A; 2V1R A; 1LNX A; 2IVW A; 4IUQ A; 1OI1 A; 1PC0 A; 2CZ6 B; 3ME9 A; 5GAO m; 3J81 E; 4JZ4 A; 1U5S A; 2DBM A; 2EGC A; 4M77 A; 5I22 A; 2X4X A; 1QWF A; 8AT1 B; 3GOX A; 3CC4 T; 2YWW A; 1Q82 R; 2QXF A; 1E6H A; 2K2M A; 1VYV A; 1LVK A; 1T0J A; 1YIT A; 1WXT A; 4PJO D; 1WFW A; 2AHJ B; 4J9E A; 3GNG A; 2QG9 B; 3OYJ A; 5FU7 B; 1Y96 B; 1QCN A; 2O01 E; 4PJO C; 2CS7 A; 2AZV A; 3EGX A; 1HD3 A; 5IHI A; 1G83 A; 3FJ5 A; 2DPP B; 4MZP A; 1AEY A; 2YXY A; 1WYX A; 4M78 B; 2H3E B; 4M77 B; 2DL7 A; 4OGC A; 1VQK A; 1CKB A; 2KRN A; 1FMW A; 1RAD B; 1KG1 A; 4M78 E; 2CP2 A; 1YJ9 Q; 4OMP A; 5GMK m; 3QJ6 A; 4M77 E; 2C0I A; 2FO0 A; 3L1A A; 3DB3 A; 2BTT A; 1MND A; 3WVE B; 1MNE A; 3ZFJ A; 4A53 A; 2O88 A; 1QP2 A; 4O5V A; 4IUR A; 5KYX A; 1WJS A; 2DTO A; 2X3X D; 4DBF A; 1YIT T; 1IO6 A; 3QHS A; 3JRZ A; 2KYB A; 4NS5 A; 3CXC A; 2LJ0 A; 2J7I A; 1BI1 A; 1Q95 G; 4M7A F; 2DJZ A; 2KT1 A; 2QA4 A; 3JB9 H; 4PJO A; 3MKD A; 3A8O B; 3OYI A; 5FRO A; 4MZM A; 2K3Y A; 1VQO Q; 1K8A R; 2KBT A; 2RJF A; 3H8Z A; 1UG1 A; 2D8J A; 3OYA A; 1VQK T; 4D8K A; 4ZN1 A; 2RHU A; 4UC4 A; 4HXJ A; 4AFQ C; 1KJW A; 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