The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
5
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sequence length |
78
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structure length |
78
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Chain Sequence |
GSSGSSGKVWKPGDECFALYWEDNKFYRAEVEALHSSGMTAVVKFTDYGNYEEVLLSNIKPVQTEAWVRDPNSGPSSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Structural genomics, unknown function
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| molecule keywords |
Tudor domain-containing protein 3
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| publication title |
Solution structure of the Tudor domain of Tudor domain containing protein 3 from mouse
rcsb |
| source organism |
Mus musculus
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| total genus |
5
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| structure length |
78
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| sequence length |
78
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-12-13 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 type barrels. |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3LH0 A; 2RJC A; 5IN1 A; 3NTI A; 3PFS A; 3UWN A; 2RJE A; 3MP6 A; 2EQU A; 4IUR A; 4C5G A; 3OYA A; 2BKD N; 1RI0 A; 2X4Y A; 3LLR A; 4L59 A; 3OYE A; 3OYI A; 3S3N A; 4NS5 A; 2HQE A; 2RI2 A; 2R5M A; 3OYL A; 4BE1 A; 3DB4 A; 4PLI A; 2LTO A; 3OQ5 A; 2XK0 A; 3P8D A; 4CRI A; 1XNI A; 3FEO A; 2G3R A; 1WJQ A; 2RHU A; 2BUD A; 1MHN A; 2JZ2 A; 3QKJ A; 1G5V A; 3MP1 A; 3OB9 A; 3PMT A; 5CIU A; 2M16 A; 2NLU A; 4C5H A; 3Q1J A; 1H3Z A; 2CKK A; 3MET A; 2R5A A; 3MP8 A; 3S6W A; 3SD4 A; 4GY5 A; 2QQS A; 3P8H A; 2D9T A; 4E7L A; 3PMI A; 3LGF A; 1OZ3 A; 4FU6 A; 2F5K A; 4EDU A; 3OYG A; 3LGL A; 2RHX A; 3DB3 A; 4IUQ A; 4A4E A; 4C5I A; 5C0M A; 4BAC A; 2VYT A; 3C4S A; 2B8A A; 2GFA A; 2O4X B; 2BIV A; 1WGS A; 4IUT A; 4X34 A; 4BE0 A; 2MWO A; 2PQW A; 2M0O A; 2QQR A; 2DAQ A; 2HQX A; 3FLG A; 3OYF A; 3L2R A; 3S3M A; 2R57 A; 2LCC A; 1OYX A; 3L2U A; 3M9Q A; 3ZEH A; 2XDP A; 5KCH A; 4QQD A; 4C5E A; 1OZ2 A; 2P0K A; 5KE2 A; 3F70 A; 2DIQ A; 3S3O A; 4LD6 A; 3L42 A; 3O8V A; 4QW2 A; 3OYM A; 2RJD A; 1WJR A; 3FC3 A; 4UC4 A; 4A4F A; 2YRV A; 2EQJ A; 3OYJ A; 4N4G A; 2WAC A; 2RHI A; 4A4G A; 3OA6 A; 3MEU A; 2RI3 A; 5FRN A; 4RG2 A; 2LVM A; 3CEY A; 4BDZ A; 4B9W A; 2R58 A; 5KE3 A; 2DIG A; 3PNW C; 2EQM A; 3MEW A; 3OYH A; 2MWP A; 2EKO A; 3L2V A; 4QVZ A; 2E5Q A; 2L89 A; 2L3R A; 3KUF A; 5J26 A; 5KCO A; 5IAY A; 3MEV A; 3GOX A; 2K3X A; 2LDM A; 4PLL A; 5D6W A; 4BDY A; 3OYK A; 3ASK A; 2RHZ A; 2L8D A; 4OVA A; 5D6X A; 3UT1 A; 3OS0 A; 1N27 A; 4IKF A; 3OS2 A; 1KHC A; 3EAE A; 3FDR A; 2GF7 A; 3DLM A; 4Q5W A; 3BDL A; 3NTK A; 4E7K A; 3E9G A; 2K3Y A; 4FL6 A; 3OYB A; 5FRO A; 3ME9 A; 4BE2 A; 2X35 A; 2X4X A; 3H6Z A; 3H8Z A; 3MO8 A; 4IUV A; 4B9X A; 3QJ6 A; 3OYN A; 4N4I A; 2LRQ A; 3OY9 A; 4PL6 A; 3OYD A; 2RI5 A; 3QBY A; 1OI1 A; 4Z02 A; 3L2Q A; 3L2W A; 3E9F A; 2E6N A; 2X4W A; 3LYI A; 4HCZ A; 5FRM A; 3MEA A; 1SSF A; 2JTF A; 3QII A; 2RHY A; 4BD3 A; 4ZTF A; 4IUP A; 3OYC A; 4II1 A; 4N4H A; 4A4H A; 5KH6 A; 4E7J A; 2RJF A; 4IUU A; 2M1H A; 4E7I A; 2GFU A; 2RO0 A; 2O4X A; 4QQG A; 3NTH A; 2FHD A; 5M9O A; 5J39 A; 4ZTJ A; 3LX7 A; 3OMC A; 5D6Y A; 5C6S A; 2EQK A; 3OS1 A; 4QQ6 A; 2EFI A; 3OMG A; 4E7H A; 2IG0 A; 1WJS A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1X2K A; 1M2V B; 1WXU A; 2L3S A; 3QYG B; 2KSS A; 5CCA A; 1AT1 B; 2KXD A; 1YCY A; 4A54 A; 4KH0 B; 1T3L A; 3QKJ A; 2ZPH B; 1G5V A; 2IPO B; 1H3Z A; 2BTT A; 2ZAE A; 3RIR A; 3HHT B; 2EWN A; 1V76 A; 1M4Z A; 5LJ5 h; 1LVK A; 2LQK A; 2F5K A; 1AWX A; 3CD6 Q; 2FL7 A; 3JCM e; 4IUT A; 1O75 A; 4ELZ C; 2O9V A; 1YP5 A; 5GJV B; 4Y28 E; 1Q7Y R; 4E7S A; 1D1C A; 1EIF A; 4RTT A; 1U06 A; 2OX7 A; 4M78 D; 3FC3 A; 2WAC A; 1T0H A; 5L23 A; 3O5Z A; 1YHQ Q; 1N9R A; 3IQL A; 2DO3 A; 3VV0 A; 3RR6 A; 1Y96 B; 2RMO A; 5GAN 6; 1NJI R; 1S72 Q; 3CCM T; 4NL3 A; 3CQT A; 4OVA A; 3OS0 A; 1N27 A; 4RTX A; 4XU2 A; 1EZZ B; 1SRM A; 2QDL A; 2RNA A; 3CCR T; 3M53 A; 2E4H A; 4PNO A; 2AT1 B; 1M5Q 1; 3OYD A; 2F2V A; 3L2Q A; 2KK4 A; 1UGP B; 2KI7 A; 4C8Q B; 4II1 A; 5CK9 A; 5LJ3 h; 2NUP A; 1TTH B; 4F7U B; 4M75 A; 5M9O A; 5J39 A; 1Q82 R; 4C8Q F; 1PNJ A; 2EYW A; 5IHN A; 4M77 C; 4F7U F; 4C8Q G; 1YI2 Q; 2QA4 A; 2EYQ A; 3MP6 A; 4XTZ A; 2EQU A; 3VRY A; 3OYA A; 2OJ2 A; 4C92 G; 3VU3 C; 1UFF A; 2A08 A; 3FEO A; 2BUD A; 2RHU A; 4RCB A; 2FPE A; 5CIU A; 1YJW A; 2P0P A; 3CXC S; 1YJ9 T; 2LX9 A; 1QKX A; 3CPF A; 2KVQ G; 3C94 A; 3LGF A; 1PD0 A; 1T3S A; 5C0M A; 3VUZ A; 3PVQ A; 2P0Q A; 1KHI A; 3CCL Q; 3GIB A; 2O88 A; 3CC4 Q; 4FT4 A; 1JJ2 S; 5AT1 B; 2EYX A; 5GAN e; 4DBQ A; 1D1A A; 2C0O A; 2RI3 A; 1Z9Z A; 3CEY A; 1I07 A; 2R58 A; 2KY9 A; 2LQW A; 2DTH A; 2ECZ A; 2RQV A; 4XU1 A; 3I9Q A; 2KXC A; 2GCX A; 3M0P A; 4E6R A; 1X6B A; 2BZX A; 2YRC A; 3SEM A; 5KCO A; 2Y90 A; 3I55 Q; 2DMO A; 1WYX A; 1KC8 R; 3JCM f; 1K4U S; 2LJ1 A; 3VS4 A; 4M7D E; 5FW9 A; 2XKO C; 4FT2 A; 2L3P A; 2VV5 A; 4HXJ A; 1Q81 C; 2LRQ A; 4PL6 A; 4EMK B; 3PTA A; 3QBY A; 4Z02 A; 4J9F A; 3CD6 T; 5FRM A; 2JS0 A; 3J80 E; 2WSC E; 2YSQ A; 5FU6 B; 4TVR A; 3TQ7 P; 4IUU A; 3UA6 A; 3V8L A; 3JCM J; 3M57 A; 5GAM g; 4BI3 A; 4LDU A; 4M78 C; 2ZGW A; 1TUD A; 4R56 A; 1JRI A; 4RUG A; 2CUD A; 3CCL A; 1YHQ T; 1RI0 A; 1MV0 B; 3LLR A; 3CC4 A; 3BE3 A; 4Y91 A; 4EMK C; 1WIE A; 2XK0 A; 1YIT Q; 2LC4 A; 1VIF A; 5CKB A; 3H0H A; 1HSQ A; 3BW1 A; 1S72 T; 3KFV A; 2P84 A; 3SB2 A; 1QVF A; 4ELY C; 2XDD A; 4LDY A; 1M30 A; 3EGX B; 1AWO A; 3I55 A; 3A8O B; 2VYT A; 2B8A A; 2OTL A; 1PC0 A; 1C0M A; 2MWO A; 1FMK A; 1H64 1; 1R0C B; 2G6F X; 2LCC A; 3ULR B; 2HD0 A; 4PJO B; 4LD6 A; 3GNG A; 4LE9 A; 1K9M C; 1WJR A; 2DZ9 A; 2YRV A; 2JNG A; 2LQN A; 2RK1 A; 1A0N B; 4PJO F; 1E6G A; 3OS5 A; 3CC2 Q; 1Y07 A; 1YI2 T; 2EKO A; 3L2V A; 4PJO G; 1VQN T; 1HJD A; 4FIB A; 4GBQ A; 1M3C A; 1U8R A; 4IIM A; 3A8H B; 2E10 A; 5I2S A; 3CCS Q; 2YUQ A; 2D1X A; 2GNC A; 2E3H A; 4FW1 A; 1GXI E; 2QQ9 A; 3JB9 I; 1OX9 A; 4N4I A; 4J7F A; 2FO0 A; 5GAN f; 1YIT A; 3L2W A; 3HFO A; 5KH6 A; 1O9S A; 3EFO B; 3HP9 A; 1QCO A; 1AHJ B; 1MUZ A; 5GAN 4; 4F7U E; 2ATC B; 2DL5 A; 1U1S A; 4DEY A; 3UDC A; 4F17 A; 3UWN A; 1WFW A; 4RG8 A; 4M75 B; 4CI0 C; 5IXF A; 1Q7Y U; 3FJP A; 1K9M R; 5FLX E; 3TSZ A; 1YWO A; 1YBY A; 3LWI A; 3VJP A; 3HSB A; 3RKW A; 3I55 T; 1LOJ A; 4E7Z A; 4J7I A; 1FYN A; 4OB1 B; 1WZO A; 1UDL A; 5I2M A; 3CC2 A; 1M1K C; 3SD4 A; 4RCC A; 3C12 A; 1KD1 C; 3R6N A; 4F16 A; 4FYY B; 2KQW A; 2AKL A; 1IGQ A; 1NJI U; 2M51 A; 4EMG A; 3VYH B; 2RD1 A; 1UTI A; 2J6F A; 2CZ1 B; 2DRK A; 2M0O A; 4M75 C; 1KQ2 A; 1QVF P; 3BFM A; 1TU0 B; 2J05 A; 5DLO A; 4UC4 A; 4M7A D; 3CCV Q; 1B07 A; 3VS3 A; 1NLO C; 5FRN A; 1M9S A; 2KT8 A; 4BUG A; 3QYH B; 3CC7 T; 1QQJ A; 3A8L B; 4HVW A; 2RQT A; 4QVZ A; 1KG1 A; 1Q82 U; 3M0S A; 3ASK A; 4J8O A; 2HBW A; 1AWJ A; 2RHZ A; 1VQ5 A; 3JCM X; 1D0X A; 3RMQ A; 2XIC A; 4PK4 A; 3J81 E; 5DM7 R; 1ZSZ B; 2X35 A; 2EGC A; 2RI5 A; 1ARK A; 3G4S Q; 2JW4 A; 1KD1 R; 3BY7 A; 1ZQ1 A; 3JB9 J; 3FRN A; 5A0G A; 2KRS A; 1I0C A; 3LX7 A; 4MDW A; 1D09 B; 1MND A; 2P4T A; 4AFS C; 4E2F B; 1UEB A; 3SHW A; 2ZPF B; 4FYV B; 2VWF A; 9ATC B; 3EG0 A; 1SPK A; 2ED1 A; 2E6Z A; 4JRQ A; 5LJ5 e; 3CC2 T; 1WXB A; 1U3O A; 1ABO A; 2LTO A; 1AOJ A; 3FJ5 A; 2E70 A; 1WHM A; 4QKU A; 5LJ5 g; 2NUT A; 1JB0 E; 2PZ1 A; 1RAH B; 1BI2 A; 4KT0 E; 1NPP A; 4HCC A; 3CCQ T; 3Q1J A; 3SFM A; 2DRM A; 4AFU C; 3CCS T; 3P8H A; 4E7L A; 3PMI A; 1JEG A; 1K73 C; 4C92 A; 1TUC A; 4OMQ A; 2A36 A; 1UJ0 A; 3I56 T; 1KC8 U; 2PQW A; 2EJF A; 4RTW A; 3QWY A; 2J06 A; 3L2U A; 2DYI A; 2KDS A; 5DY9 A; 1NG2 A; 5GAM j; 2EJ9 A; 3CCJ Q; 1GBQ A; 1BI1 A; 2JUF A; 2JT4 A; 4CC4 B; 4QW2 A; 4A4F A; 4KGZ B; 4XQ3 A; 1YWP A; 1RI9 A; 3EG9 B; 5DLQ E; 2KRN A; 3G4S A; 2KE9 A; 2HNI A; 1H92 A; 4BY6 C; 2QAZ A; 1ZBX A; 4C0D B; 1SRL A; 2I2L A; 2L3R A; 2M02 A; 2VKN A; 3KUF A; 2JXB A; 4OB0 B; 3JCM c; 2PNI A; 3SDZ A; 3JAM E; 1R8O B; 2COY A; 3CCE Q; 1G3Y A; 1N9S A; 1HXD A; 2KT1 A; 4M7A G; 2EGA A; 2L8D A; 2M9U A; 2QGG A; 5LJ3 e; 4XK8 E; 2RQW A; 1SKU B; 4M4Z A; 2K3Y A; 3EG3 A; 2K79 A; 4RTU A; 5LJ3 g; 1SEM A; 1QCF A; 2CGH A; 3A8M B; 2CZ7 B; 4LUE A; 4R55 A; 2HQH A; 2JMC A; 2SEM A; 1SSF A; 2YLB A; 4PJM A; 4KGV B; 2V8K A; 2CP5 A; 4E7J A; 4B6M A; 1VQ9 Q; 1G2B A; 4MDX A; 3NHN A; 4OGC A; 3QWX X; 1K8A R; 1RLQ C; 2DPP B; 4M7D B; 3OMC A; 1X43 A; 1JO8 A; 2ROT A; 4E7H A; 2X51 A; 5GAN 7; 3CCV T; 2ED0 A; 2PUO B; 4M7D F; 1MMA A; 3C95 A; 3OYE A; 4M75 E; 2HQE A; 4C8Q D; 4M7D G; 2PVD B; 4PLI A; 4CRI A; 2FZG B; 5CVI A; 2QEX Q; 3G6E Q; 1WJQ A; 1VQK A; 4R0K A; 2XMF A; 2RQR A; 4JRP A; 5IH2 A; 3HRT A; 4L5G A; 1M90 C; 3MET A; 1QVF S; 2V1Q A; 2MIO A; 1WPY A; 1ZUY A; 1I5O B; 2HDA A; 2YDL A; 4OMM A; 1OZ3 A; 4FU6 A; 2X4J A; 4C5I A; 2YWW A; 3REB B; 2ESW A; 4C0Z A; 2VB6 A; 3SWN B; 3UPU A; 3CCE A; 4JJB A; 4LDV A; 3MJX A; 2A3L A; 2GTO A; 1ZSG A; 1EX4 A; 1OPK A; 3HFN A; 3EG2 A; 5HKC A; 4QQD A; 5LJ5 f; 3DLL A; 2DIQ A; 2JS2 A; 2JOY A; 2DXU A; 3O8V A; 1QP2 A; 3EFS A; 2RHI A; 1UHC A; 4FYW B; 2DL7 A; 4X9C A; 1MMG A; 4FW2 A; 4D6W A; 2FG0 A; 2H3J A; 2XU8 A; 3OYH A; 4XTW A; 1VQ9 A; 2A7Y A; 2QA4 Q; 1WI7 A; 1G3T A; 3JCM g; 1RAE B; 2CRE A; 1VQ4 A; 3SWN C; 2BE9 B; 3E1S A; 1VYT A; 3VYG A; 2DD4 A; 3G71 A; 1BIB A; 4MMK A; 4DOW A; 2QYZ A; 1K9M U; 2VXE A; 1YJW Q; 4HKE A; 3CMA T; 2QEX A; 3G6E A; 1M90 R; 2E65 A; 4JLI A; 2DD5 A; 2GBQ A; 1B7T A; 4RTZ A; 3A5Z B; 4AT1 B; 4M77 B; 1VQM Q; 1Q86 C; 3JB9 F; 2CSQ A; 2HZY A; 3CCJ T; 3D7S B; 2RQU A; 3J7A F; 1BYM A; 2DNU A; 4QQ6 A; 4J6X A; 4PFO A; 2A28 A; 4M77 F; 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2QA4 T; 5CQY A; 1UB4 A; 2OAU A; 3RNJ A; 3TSW A; 1QKW A; 4KUD K; 2YUN A; 4OMF B; 2COW A; 2D6F A; 3WVE B; 3S6W A; 5GAM d; 3QZ5 B; 1ZA2 B; 3EGD B; 8AT1 B; 3CME Q; 4NL2 A; 5KYU A; 4IUQ A; 3THK A; 3GF5 A; 5I22 A; 1YJW T; 4X34 A; 6AT1 B; 2COZ A; 1YNZ A; 4JRI A; 1ZUK A; 3QDR B; 3CBO A; 4OML A; 1BKB A; 1D3B A; 3ZEH A; 3FB9 A; 2DZC A; 5KCH A; 1RAC B; 5CKD A; 3CBP A; 3S3O A; 3N5B B; 4JS5 A; 1VQM T; 2QG9 B; 1QVG P; 1N6A A; 1Y7X A; 3HRU A; 3H41 A; 3VKI A; 1QW1 A; 3LW5 E; 3M4Y A; 2E5Q A; 3NFC A; 2OI3 A; 1N8R C; 1K8A U; 8ATC B; 3WVD B; 1HD3 A; 3P8B B; 3OYK A; 3OSS C; 1YIJ T; 1Q81 R; 1GFD A; 2HL5 C; 2LCS A; 1VQO Q; 3URG A; 4FL6 A; 2L5Q A; 1QLY A; 2MI6 A; 1YJN A; 1PCX A; 3A8G B; 2QXF A; 2LNV A; 4FYX B; 2DXT A; 1RUW A; 4Z8A A; 3LYI A; 3NGP A; 4M7A A; 4JPB W; 3M0U A; 4K11 A; 4A4H A; 2J6K A; 2EPD A; 2K6D A; 2XG8 D; 4QQG A; 4M77 E; 3CME A; 2DEU A; 1RAF B; 2IG0 A; 3G7Z A; 3EH2 A; 1LNX A; 1IB8 A; 4IUR A; 2KGT A; 4XAX B; 4QVD A; 2JMA A; 4NS5 A; 2HAX A; 2MF2 A; 2R5M A; 3EHR A; 4ZGE B; 1QMC A; 4L6V 5; 3CCL T; 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