The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
6
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sequence length |
68
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structure length |
68
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Chain Sequence |
GSSGSSGPRAKALCNYRGKNPGDLKFNKGDVILLRRQLDENWYQGEINGVSGIFPASSVEVISGPSSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Structural genomics, unknown function
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| molecule keywords |
SH3 domain containing ring finger 2
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| publication title |
The solution structure of the first SH3 domain of mouse SH3 domain containing ring finger 2
rcsb |
| source organism |
Mus musculus
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| total genus |
6
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| structure length |
68
|
| sequence length |
68
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| ec nomenclature |
ec
2.3.2.27: RING-type E3 ubiquitin transferase. |
| pdb deposition date | 2006-04-05 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF07653 | SH3_2 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2CSQ A; 1SRM A; 1Y57 A; 1JXO A; 2LNH B; 4JJD A; 2RQU A; 1PKS A; 2ESW A; 2EGE A; 3CQT A; 2X3W D; 1LCK A; 2ABL A; 4J9C A; 1JEG A; 2YT6 A; 2CT4 A; 3A98 A; 2A28 A; 2D0N A; 2DL7 A; 1M3C A; 4JJC A; 3KFV A; 2LZ6 B; 5FWB A; 2BZY A; 2HEQ A; 2KE9 A; 3EHQ A; 2DBK A; 2EYZ A; 2GBQ A; 2NWM A; 4OMO A; 3TSZ A; 4Z89 A; 2HCK A; 3M0R A; 2EQI A; 2FPD A; 2YUQ A; 1PNJ A; 4AG1 C; 4J9I A; 2JTE A; 1K0X A; 3C0C A; 4HVU A; 1X69 A; 5IHK A; 2RQT A; 4IIM A; 4CC4 B; 1NLP C; 2V1R A; 1AWX A; 2NUZ A; 1ZSG A; 2A08 A; 4OMQ A; 1AWO A; 1QWE A; 3UA7 A; 4HVW A; 1AWW A; 1SRL A; 1WXU A; 4ESR A; 1M3A A; 2GGR A; 2JS2 A; 2K9G A; 1ABO A; 4OMP A; 5GJW B; 2EKH A; 1GBR A; 1N5Z A; 3U23 A; 5IH2 A; 2MOX A; 3NHN A; 3TSW A; 1YP5 A; 1NYF A; 2FPE A; 2ROT A; 4LN2 A; 2AZS A; 3VS7 A; 3QWX X; 2CUD A; 2GTO A; 2O31 A; 1PRL C; 2AZV A; 2CUB A; 1I0C A; 1MV0 B; 2F2W A; 2L2P A; 3M0U A; 2L3P A; 1OOT A; 2FRY A; 1UGV A; 1I07 A; 3RBB B; 2DNU A; 2DE0 X; 2FEI A; 2EYX A; 2GTJ A; 2M0Y A; 2LJ0 A; 1X43 A; 1SHG A; 3EGU A; 4A63 B; 1K0S A; 1K1Z A; 3EHR A; 1EFN A; 1UJ0 A; 1UJY A; 3VS1 A; 1SSH A; 1E6G A; 2EPD A; 1U3O A; 1NLO C; 2D8J A; 5L23 A; 3RNJ A; 2KNB B; 1AZG B; 1HD3 A; 2W10 A; 1JXM A; 4J9F A; 4JZ3 A; 4OML A; 1ZUU A; 1RUW A; 2DX1 A; 4KRT A; 2IIM A; 4JJB A; 1ARK A; 2E5K A; 2QDL A; 2D1X A; 2A37 A; 2CRE A; 1OEB A; 1YNZ A; 1GCP A; 1X27 A; 1H92 A; 2BTT A; 1GBQ A; 1WX6 A; 2I0N A; 3REA B; 2HBW A; 2ENM A; 1HSQ A; 4Z8A A; 3LH5 A; 2L3Q A; 1YWP A; 2C0T A; 4DEX A; 2RMO A; 5I11 A; 1PWT A; 2EGC A; 2DYB A; 1GRI A; 2YUO A; 4GLM A; 1BU1 A; 1YN8 A; 4E6R A; 2DMO A; 1ABQ A; 4J9B A; 1JU5 C; 1UG1 A; 1YCS B; 1U5S A; 4RTV A; 2HDA A; 2VWF A; 1UHC A; 1RI9 A; 2EVR A; 1T0J A; 2DL4 A; 3VS5 A; 2FRW A; 2AKK A; 2LJ1 A; 3VRZ A; 4CC2 A; 2K7A A; 3UA6 A; 2LJ3 A; 4K11 A; 2XMF A; 3NGP A; 1W6X A; 2C0O A; 5I22 A; 4FSS A; 1A0N B; 1BB9 A; 1AZE A; 2AKL A; 2KRO A; 1QLY A; 2D8H A; 3VRY A; 2DRK A; 2F2V A; 2KXD A; 3REB B; 2JW4 A; 3M0T A; 1V1C A; 3VS4 A; 1KSW A; 2H8H A; 2EBP A; 4JPB W; 2J06 A; 1UTI A; 2P4R A; 4JZ4 A; 1K9A A; 4OMM A; 4D8K A; 2OI3 A; 1Z9Q A; 1FMK A; 1AVZ C; 1XOV A; 1SPK A; 3IQL A; 3R6N A; 5HCK A; 1GCQ A; 1MV3 A; 2DBM A; 1K76 A; 2RQW A; 2JMC A; 2DJQ A; 5EC7 A; 5IXF A; 1M30 A; 2F2X A; 4RTU A; 1HJD A; 1M8M A; 1QKX A; 1IO6 A; 2DF6 A; 2JS0 A; 3JV3 A; 2KRS A; 2LMJ A; 2K79 A; 2J05 A; 3VS3 A; 2YUN A; 2M51 A; 2KRM A; 1SEM A; 4ZNX A; 2JT4 A; 1KIK A; 2O88 A; 1AOJ A; 1X6B A; 1AWJ A; 1KJW A; 4RTY A; 4AFU C; 1I1J A; 2ROL A; 1WXB A; 1WA7 A; 1UDL A; 2FO0 A; 1OV3 A; 2L0A A; 3ZL7 C; 5FW9 A; 1K4U S; 3SEM A; 4J9H A; 2HSP A; 1W70 A; 2J6K A; 2RQV A; 5ECA A; 1VYV A; 2MIO A; 4AFZ C; 3TVT A; 1JQQ A; 1UEC A; 1TG0 A; 2DA9 A; 1H8K A; 3NPF A; 2ED1 A; 4LE9 A; 2FG0 A; 1QCF A; 4D8D A; 3M0S A; 1UHF A; 1UE9 A; 1YWO A; 1U06 A; 2KT1 A; 4Z88 A; 4M4Z A; 2EYW A; 3ULR B; 3M0Q A; 4LUD A; 4DEY A; 1E7O A; 1J3T A; 2K3B A; 2CSI A; 1AD5 A; 2DVJ A; 2RF0 A; 1ZUY A; 2AK5 A; 1Z9Z A; 1NEB A; 5IHI A; 1RLP C; 1WI7 A; 3VS6 A; 2EW3 A; 2KR3 A; 4RTT A; 1GL5 A; 4EIK A; 2EGA A; 1WDX A; 4CC3 A; 1PHT A; 2DLP A; 2JM9 A; 1PRM C; 1SHF A; 2LQW A; 2W0Z A; 5IHN A; 4GBQ A; 3UAT A; 1B3Q A; 1BK2 A; 2GQI A; 2RQR A; 2VKN A; 4F17 A; 1W1F A; 3QWY A; 2KRN A; 1GCQ C; 5IXB A; 3I5S A; 2KYB A; 2JXB A; 2PTK A; 1ZX6 A; 1AEY A; 1G83 A; 1WXT A; 1CSK A; 1RLQ C; 2BZ8 A; 2PZ1 A; 1ZBJ A; 4AG2 C; 1MUZ A; 1UFF A; 1ZUK A; 2J7I A; 2GNC A; 2G6F X; 2CH4 A; 2LQN A; 4AFS C; 2B86 A; 2VVK A; 1TUD A; 3VS2 A; 3SHW A; 2O9V A; 1WYX A; 3NMZ C; 2LX7 A; 2DIL A; 1G2B A; 3H0I A; 5FWC A; 4J9E A; 4LUE A; 2KGT A; 2J6F A; 1VYU A; 2YDL A; 4CC7 A; 2PNI A; 1X6G A; 2BZX A; 4RTX A; 1NEG A; 1NG2 A; 4J9D A; 1E6H A; 2KT8 A; 3UF4 A; 1Y0M A; 2SRC A; 3EG0 A; 3FJ5 A; 1CKA A; 1FYN A; 2DL3 A; 2ED0 A; 1H3H A; 2LCS A; 2DL8 A; 2SEM A; 2YUP A; 3PVL A; 4RTW A; 2O2O A; 2MCN A; 4Y92 A; 2JM8 A; 2KYM A; 4F16 A; 2KEA A; 1M3B A; 2RN8 A; 1WFW A; 1JO8 A; 2KBT A; 2CH4 W; 3EG1 A; 4LNP A; 1ZLM A; 1X2K A; 2JMA A; 4WCI A; 2C0I A; 2K6D A; 1WIE A; 4RTZ A; 2A36 A; 2K2M A; 2J6O A; 4J9G A; 2OAW A; 2L3S A; 4HCK A; 1CKB A; 4X1V A; 1GFD A; 1T3L A; 4ORZ A; 1S1N A; 2DRM A; 2EYY A; 3O5Z A; 1OPL A; 3EG2 A; 1OPK A; 5GJV B; 1T0H A; 4QT7 A; 2CT3 A; 1UUE A; 2ECZ A; 2DL5 A; 2FPF A; 4AFQ C; 3I9Q A; 4HVV A; 1QKW A; 2X3X D; 1VYT A; 4RUG A; 2YSQ A; 3H41 A; 1KFZ A; 4IIO A; 2RNA A; 3I5R A; 3PE0 A; 1QWF A; 2LP5 A; 2RPN A; 1VA7 A; 1NYG A; 4HXJ A; 1M27 C; 3GBQ A; 2DM1 A; 3VS0 A; 3H0H A; 2CDT A; 1PKT A; 2OJ2 A; 2V1Q A; 3I35 A; 1GFC A; 3H0F A; 1NM7 A; 1BBZ A; 3PVQ A; 4F14 A; 2KXC A; 1B07 A; 1TUC A; 1WLP B; 3EG3 A; 3M0P A; 1T3S A; 4OMN A; 3THK A; 2O9S A; 4R0K A; 1X2Q A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3SWN C; 2RA2 A; 1V76 A; 1NPR A; 1SRM A; 1Y57 A; 3X24 B; 2DET A; 2RM4 A; 2ESW A; 2VXF A; 4JRQ A; 4XTX A; 5CK9 A; 4R55 A; 5EG2 A; 3CCE Q; 2AT1 B; 3A8M B; 4FYW B; 2A28 A; 2RI2 A; 3JB9 J; 1KQS S; 2D0N A; 2OTJ T; 3V8J A; 2MWP A; 4IUR A; 1TU0 B; 3KFV A; 2LZ6 B; 2BZY A; 4XU0 A; 2OTL T; 2EYZ A; 1ZSZ B; 2GBQ A; 2X4J A; 2FPD A; 2Y4Y A; 5DLQ E; 3FLG A; 3QO3 A; 3LWH A; 2CP2 A; 3G4S T; 2RI5 A; 1BI3 A; 1X69 A; 4BE0 A; 3X28 B; 1NJI U; 3URG A; 5IHK A; 2RQT A; 1TWB A; 3FEO A; 4IUT A; 1VQ4 A; 2P0K A; 3AT1 B; 4M75 C; 2A08 A; 3OW2 A; 3HRS A; 3UA7 A; 1SRL A; 5M9O A; 1QCN A; 1M3A A; 3MP1 A; 2K9G A; 2DXB A; 5GAN 4; 1XJW B; 2F5T X; 4NS5 A; 2MOX A; 1YJW A; 2A3L A; 1YCY A; 3GNG A; 1YP5 A; 2FPE A; 4M77 F; 5CCA A; 2ATC B; 4NL3 A; 1VQL Q; 4A4K A; 3VS7 A; 3QWX X; 1G3S A; 1NPP A; 2HQE A; 1OQK A; 3QKJ A; 2O31 A; 3EH1 A; 4C8Q B; 1YI2 T; 1I0C A; 4C5E A; 3QSU A; 3M0U A; 4KUD K; 3S3N A; 1ZBX A; 4M7A B; 2DE0 X; 2M0Y A; 4KGV B; 5GAM d; 1OI1 A; 3V7C A; 6AT1 B; 5FLX E; 2BE9 B; 4A63 B; 1K1Z A; 3EHR A; 1UJ0 A; 1E6G A; 1Q86 C; 4C0D C; 3M4G A; 5L23 A; 3HKS A; 2XDP A; 2WAC A; 2W10 A; 1YIT T; 5A0D A; 3CD6 T; 5D6X A; 2RO0 A; 4OML A; 5KYY A; 5L8R E; 1RUW A; 2QTV A; 5FRN A; 4BE2 A; 4JJB A; 2E5K A; 4E7K A; 3EG9 A; 1KHI A; 3CC2 A; 1ZQ1 A; 3SD4 A; 1GBQ A; 2CZ0 B; 3CPW A; 3REA B; 1FX7 A; 4F7U A; 4JS4 A; 4A53 A; 2RHU A; 2DJZ A; 2C0T A; 3CCQ T; 3QXE B; 4HCZ A; 3LWI A; 1YN8 A; 4JDS A; 1PD1 A; 1WHK A; 1Q81 U; 1ABQ A; 2GCX A; 3LLR A; 1UG1 A; 1VQO T; 1LVK A; 3JB9 G; 3X20 B; 2XD0 A; 2LVM A; 1UHC A; 4E7H A; 2RB6 A; 1I5O B; 2EVR A; 3CCM T; 4ZTF A; 4C92 A; 2FRW A; 2AKK A; 2GQV A; 4M7D F; 2DEQ A; 2OTJ Q; 3MEA A; 4CC2 A; 1ZHI A; 2QI2 A; 2C0O A; 2OTL Q; 1WQW A; 1AZE A; 4TVR A; 3G71 T; 3VYH B; 3RIR A; 3G4S Q; 2KXD A; 4KT0 E; 2EQJ A; 3CCL A; 4ZTJ A; 4YTL A; 2H8H A; 1RL2 A; 4PJO B; 1XQH A; 1U8R A; 2P4R A; 2CZ7 B; 3J81 E; 5KYU A; 3SB2 A; 1FMK A; 3GIB A; 3IQL A; 3JSC A; 1M90 R; 3RES A; 1AHJ B; 2RQW A; 1IHW A; 2JJ9 A; 1TTH B; 4EMK C; 5DY9 A; 3JV3 A; 3L2V A; 5IT9 E; 1IRE B; 2LMJ A; 2K79 A; 1K73 C; 1JJ2 A; 4BAC A; 1YI2 Q; 3QBY A; 2M51 A; 1SEM A; 2JT4 A; 1AOJ A; 1X6B A; 4BD3 A; 1AWJ A; 1M5Q 1; 1D0Z A; 4RTY A; 5I21 A; 4AFU C; 2COY A; 1I1J A; 1OZ3 A; 1WA7 A; 5CKE A; 1UDL A; 3QPH A; 3PFS A; 2QYZ A; 1OV3 A; 2L0A A; 4N0A C; 2QEX T; 1ZSZ C; 3CCJ A; 4M78 D; 5ECA A; 2O4X A; 3RUX A; 4MMK A; 3CCU A; 1YIT Q; 2DA9 A; 4LE9 A; 3CD6 Q; 1BIA A; 1UHF A; 1UE9 A; 1WHL A; 1YWO A; 1U06 A; 5GMK h; 4M4Z A; 1Q81 R; 3ULR B; 3QYH B; 2CP5 A; 4M77 A; 2Y4X A; 5DLO A; 4LUD A; 1E7O A; 1J3T A; 3L2W A; 2DVJ A; 4B9X A; 1YIJ Q; 3CCQ Q; 2QK0 A; 2EW3 A; 4QW2 A; 2FVU A; 4EIK A; 1VOM A; 1U1T A; 2DLP A; 1YJ9 A; 2JM9 A; 5GAN d; 1VQO Q; 1G3Y A; 5KYN A; 2W0Z A; 2M1H A; 5IHN A; 3UAT A; 3QWY A; 4E47 A; 3CCM Q; 4C8Q C; 2PTK A; 4RMO A; 1Y96 A; 2PVO B; 1AEY A; 2V8J A; 5GAN 5; 3MP6 A; 2VGN A; 4FM4 B; 3L42 A; 1MUZ A; 3V8L A; 5KYW B; 4OB3 B; 2GNC A; 1R77 A; 3EAE A; 1K9M C; 4ZN1 A; 3CXC S; 3I55 A; 3G71 Q; 1M2O A; 5FWC A; 2XID A; 3JB9 H; 1YBY A; 1VYU A; 2ZCF B; 4CC7 A; 4DBF A; 2PNI A; 3LX7 A; 5GAN e; 1D1C A; 5GMK m; 3MKD A; 1NEG A; 4J9D A; 3JB9 F; 2KT8 A; 3VKI A; 1Y0M A; 3JCM g; 1B7T A; 3SWN A; 2XDD A; 2ED0 A; 3EGX B; 2LCS A; 4D6W A; 4NL2 A; 1VQ5 A; 3PVL A; 3P8H A; 8AT1 B; 3CCV T; 2V26 A; 2COW A; 1OZ2 A; 1Q82 C; 2DTO A; 1M3B A; 3QDF A; 3M5A A; 2CS7 A; 2P84 A; 1VQ6 T; 3EG1 A; 4LNP A; 1I81 A; 1IXD A; 1S72 T; 2A36 A; 4DA4 A; 3MEW A; 2P0Q A; 3PMI A; 4ATO A; 4M7D B; 1UB4 A; 4HCK A; 3CC7 T; 4MML A; 1T3L A; 2DRM A; 2EYY A; 2WSF E; 2YHT A; 2E12 A; 4DOW A; 1BKB A; 1VQM T; 4FW2 A; 4PJJ A; 4Y91 A; 1QVP A; 1K8A R; 2QEX Q; 4M75 A; 3LGF A; 1TOV A; 1G5V A; 2YSQ A; 3H41 A; 2L5Q A; 4IIO A; 4PJM A; 3OS5 A; 1QVG A; 2RNA A; 4X9D A; 1WHH A; 3FRN A; 4N4G A; 4JS5 A; 4FYV B; 3BY7 A; 3CMA T; 4RKU E; 2RPN A; 1NYG A; 4OGC A; 1KHC A; 3M4Y A; 1TSF A; 4M7A D; 5IN1 A; 2K4Y A; 2KVQ G; 3GBQ A; 1Q7Y C; 3OQ5 A; 3MEV A; 3VUB A; 5GAN j; 4MDW A; 2XKO C; 1UGP B; 2V1Q A; 4OVA A; 1MND A; 3H0F A; 1BBZ A; 1VQ7 T; 2KXC A; 3EG3 A; 2VYT A; 2NLU A; 3OYH A; 2K5F A; 4R0K A; 1VQK T; 3MCA B; 3N5B B; 3DLM A; 1JXO A; 2LNH B; 1IGQ A; 3CPF A; 4XTZ A; 2RQU A; 4C8Q F; 2GFU A; 3PGG A; 1LCK A; 1PG5 B; 2ABL A; 2X35 A; 2QAZ A; 1RAG B; 4KBM B; 4VUB A; 3QUI A; 3VU3 C; 2YT6 A; 4F04 B; 4PKC C; 1WHJ A; 2DL7 A; 3J80 E; 2LCC A; 5FWB A; 2HEQ A; 4C0D B; 2YXY A; 3FJP A; 2K5I A; 3OYC A; 1N8R C; 2NWM A; 3TSZ A; 4EPC A; 4Z89 A; 2KK4 A; 1PNJ A; 2JTE A; 3C0C A; 4HVU A; 2EJG A; 1VQ8 T; 1D0X A; 1D09 B; 4CRI A; 1NLP C; 1W2B P; 1AWX A; 1KQ2 A; 2DPP B; 4OMQ A; 1AWO A; 1QWE A; 2DFU A; 4HVW A; 2YRV A; 3CCV Q; 1YJN T; 3H8Z A; 3EFS A; 3LGL A; 3M59 A; 4C92 D; 2GGR A; 2JS2 A; 4PFO A; 2QGF B; 2FYK A; 1C1A A; 5GJW B; 1GBR A; 3HRT A; 3HFO A; 1VQ6 Q; 3NFC A; 1G8X A; 2QAS A; 1W2B S; 2ROT A; 2EQU A; 4PJO D; 4J6Y A; 1ACM B; 2AZS A; 4KUL A; 2CZ6 B; 3L2R A; 2L8D A; 1KD1 C; 3I56 A; 1N6A A; 1NZ9 A; 3CC7 Q; 2DTH A; 4II1 A; 2DXT A; 1MV0 B; 4E7J A; 4PFZ A; 5FU6 B; 5I2M A; 3OYM A; 2L3P A; 1OOT A; 1HXD A; 3JRZ A; 2HL3 A; 1VQM Q; 1BI0 A; 2DNU A; 2FEI A; 3E9F A; 2GTJ A; 1MMN A; 1SKU B; 4XTY A; 1M1K C; 1SHG A; 3EGU A; 1K0S A; 1UJY A; 1SSH A; 3UWN A; 1KK7 A; 3RNJ A; 3OMC A; 4FT2 A; 3HPW A; 3EFR A; 4QQG A; 4QVC A; 3CMA Q; 1FMW A; 3M58 A; 5GAN f; 3OSV A; 5GMK l; 4FW1 A; 4ZGJ B; 4LDX A; 2KSS A; 4EMK A; 3E19 A; 4KRT A; 1EZZ B; 2ZAE A; 2I2L A; 2QDL A; 4XU2 A; 5GAO p; 2A37 A; 2FHD A; 1YNZ A; 1VQ9 T; 1P92 A; 3LW5 E; 2MAM A; 1KQS A; 3CME T; 2QQB A; 2HBW A; 5CIU A; 1VQ7 Q; 4BE1 A; 4Z8A A; 1M2V B; 2L3Q A; 4PNO A; 1O9S A; 5I11 A; 1TS9 A; 4GLM A; 5J39 A; 1B34 B; 1VQK Q; 4E6R A; 2DMO A; 1QP2 A; 4J9B A; 1JU5 C; 3JCM P; 1YCS B; 2OAU A; 2E70 A; 1ZSZ A; 4M7D C; 3CC4 T; 9ATC B; 2CZ1 B; 3OYI A; 3S6W A; 4X9C A; 2FZG B; 5A2Q E; 2DL4 A; 4BY6 B; 3VS5 A; 1MMA A; 2HZY A; 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