2DKHA

Crystal structure of 3-hydroxybenzoate hydroxylase from comamonas testosteroni, in complex with the substrate
Total Genus 195
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
195
sequence length
639
structure length
614
Chain Sequence
MQFHLNGFRPGNPLIAPASPLAPAHTEAVPSQVDVLIVGCGPAGLTLAAQLAAFPDIRTCIVEQKEGPMELGQADGIACRTMEMFEAFEFADSILKEACWINDVTFWKPDPGQPGRIARHGRVQDTEDGLSEFPHVILNQARVHDHYLERMRNSPSRLEPHYARRVLDVKVDHGAADYPVTVTLERCDAAHAGQIETVQARYVVGCDGARSNVRRAIGRQLVGDSANQAWGVMDVLAVTDFPDVRYKVAIQSEQGNVLIIPREGGHLVRFYVEMDNITVEQLIATAQRVLHPYKLEVKNVPWWSVYEIGQRICAKYDDVVDAVATPDSPLPRVFIAGDACHTHSPKAGQGMNFSMQDSFNLGWKLAAVLRKQCAPELLHTYSSERQVVAQQLIDFDREWAKDPKEFQKYFEQHGRFTAGVGTHYAPSLLTGQAKHQALASGFTVGMRFHSAPVVRVCDAKPVQLGHCGKADGRWRLYAFAAQNDLAQPESGLLALCRFLEGDAASPLRRFTPAGQDIDSIFDLRAVFPQAYTEVALETLPALLLPPKGQLGMIDYEKVFSPDLKNAGQDIFELRGIDRQQGALVVVRPDQYVAQVLPLGDHAALSAYFESFMRA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords 3-hydroxybenzoate hydroxylase
publication title Crystal structure of 3-hydroxybenzoate hydroxylase from Comamonas testosteroni has a large tunnel for substrate and oxygen access to the active site
pubmed doi rcsb
total genus 195
structure length 614
sequence length 639
ec nomenclature ec 1.14.13.23: 3-hydroxybenzoate 4-monooxygenase.
pdb deposition date 2006-04-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
A PF07976 Phe_hydrox_dim Phenol hydroxylase, C-terminal dimerisation domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.9.50 Alpha Beta 2-Layer Sandwich D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 2dkhA02
3.40.30.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2dkhA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 2dkhA01
3ISHA 3L1RA 1X31B 3RHAA 3QVPA 1GESA 2C75A 4BV6A 3SM8A 1XPQA 4A6NA 4N9XA 4OPDA 1VG9A 3V3NA 1RYIA 2YLXA 4H50A 1YQ3A 1IUXA 1F8RA 1H83A 3B3RA 1XANA 3V76A 4B69A 5EB5A 3EPTA 5CQFA 3WE0A 1PS9A 2JB2A 5HXIA 2Y6RA 3AE3A 4BJZA 1DNCA 4EQXA 1PXBA 3H4KA 3DGHA 2ZZ0A 3AD8B 1E1LA 1E6EA 1TDOA 2OALA 3QFBA 4EMJA 1OJCA 4J33A 3AEAA 4U8IA 1L9DA 3GMBA 3DH9A 2V61A 3BI2A 3BNUA 3I3LA 4CCQA 3NYEA 3DGZA 2YLSA 2VVLG 4H2RA 1ZOYA 1PBCA 2YLTA 2EQ8A 3KLJA 3LXDA 1E1NA 2XCGA 2BABA 4USQA 1CF3A 1FEAA 1ZP0A 3C4NA 3BHKA 4H4SA 1NAAA 1BKWA 2B7RA 4H2PA 2XFQA 3FG2P 3CTYA 1OJAA 1CC6A 5GRTA 3NYCA 4NTDA 1BWCA 2XLSA 4EIQA 4ICYA 2UZZA 3AEDA 4H2QA 1KFYA 4OCGA 5CKUA 4YT0A 2XLRA 1H84A 3AEFA 1CJCA 3DMEA 3II4A 2VOUA 3P1WA 2JAEA 4K7ZA 1B4VA 1M6IA 5J7XA 3VRAA 1TRBA 3M13A 2GRTA 4FK1C 4DSHA 1NG4A 2WPCA 4H2NA 2BK5A 2IVDA 3ALJA 3ITJA 3AE2A 2WHDA 4GDEA 1ZDLA 1EL5A 4XWRA 3GMCA 4Y4MA 3AEGA 3URHA 3UKPA 1GRTA 4JY2A 3BNMA 3G5QA 2YG7A 4TLZA 2BA9A 2XVFA 4YSZA 2YR4A 2XFNA 1GTHA 2BXSA 1NEKA 2ACZA 4P9SA 4J2WA 2VRMA 4Y4NA 1PXCA 4D04A 1GRAA 1L9EA 1O95A 1F8SA 2NPXA 1O94A 1IUUA 2X50A 1DOCA 2R0PA 1HYUA 3K30A 4B68A 1QJDA 2V5ZA 3LOVA 1ELIA 4A65A 4BURA 2IVEA 4TLXA 1MXTA 4OPGA 5FS9A 3CNPA 2YQUA 3DJJA 5JCNA 3G5RA 3I6DA 2TPRA 1GV4A 4Z43A 1VDCA 2X8HA 4I58A 5TR3A 2YVJA 4HB9A 3NN0X 3NNEA 3ZDNA 1IUTA 3DK9A 1BZLA 4IVOB 3NK2X 1DOBA 1K0LA 3UP4A 1CHUA 4DNAA 4GR1A 3D1CA 2H88A 4NZHA 5DBJA 4H7UA 1GSNA 2R45A 1L9CA 1NPXA 4LA1A 2RGJA 2BCGG 3KD9A 3GD4A 4BJYA 3AE9A 3IC9A 2JB3A 4YTNA 1CC2A 3NN6X 1E7PA 3V3OA 1D7YA 5HY5A 3KKJA 1YKJA 4H4UA 3H8LA 2YG3A 3GSIA 5BRTA 4EMIA 1FECA 1PN0A 1PBDA 3CNTA 3IF9A 4J34A 2ZZBA 4AT2A 4H4WA 1FEBA 3QSMA 2B9XA 4FK1A 3DK8A 2OLOA 2XLPA 3CPJG 5KXJA 3CGDA 5EB4A 1B37A 2Q6UA 2GQFA 2WP9A 2V3BA 4LU6A 3FMWA 1ZMCA 3CN8A 2BS2A 1EL7A 4J31A 4CCRA 1ZX9A 3FPZA 4UDRA 4IVMB 1IUSA 2BACA 3NTAA 3AE5A 1KNPA 4H4XA 3NT6A 2VRLA 1BGJA 4CRTA 1P2EA 4APNA 2R46A 4H4ZA 5KRQA 1NHSA 1D7LA 3AEBA 2AAQA 5M10A 4U8NA 3LADA 1GXFA 2GR3A 3KA7A 2RABA 1RP0A 3ALLA 5GSNA 1Q1WA 4U2LA 3B6DA 3NTDA 2BC1A 3DJEA 1CL0A 4A5LA 2BS3A 4TM1A 4XWZA 3KU9A 2XVIA 3UKHA 3F8RA 3CIRA 4H4YA 4YTMA 4ZCDA 1CJ4A 1JRZA 3ICTA 4O5QA 1PJ5A 3SFEA 3VRDB 4AOXA 2R0GA 2WU5A 4I59A 3NGCX 5C2TA 4E0VA 3UTFA 2WDQA 2CULA 1N4WA 1GPEA 4J36A 3CGBA 3UKKA 5ER0A 3IHMA 1K4QA 1ZY8A 4IA5A 2V3AA 4Z2RA 4AT0A 1COYA 4EM3A 1UKVG 3Q9TA 3LZXA 5BVAA 1QO8A 4YSXA 1TDNA 3AECA 1M64A 2QA1A 4U8KA 1ONFA 2BK4A 4BK1A 2XVJA 3RP7A 2A87A 2EQ6A 4AP3A 3GRSA 1E1KA 1IUWA 1XDIA 3IHGA 3Q6JA 2YVFA 3VQRA 1LQTA 4C77A 4EMWA 2AQJA 1H81A 1Q1RA 1KF6A 1S2YA 2OAMA 2VVMA 1B8SA 5IQ4A 3AYJA 2WDRA 1BGNA 3DA1A 3QFAA 1N4UA 1TDKA 2FJBA 2WBAA 4K2XA 3VR9A 2Q0LA 2ARDA 1GALA 4K8DA 1E39A 2C76A 3ICRA 3ZYXA 5BUKA 2WOIA 2BYBA 3QJ4A 4USRA 2GH5A 1JRXA 4OPCA 2IIDA 2B9YA 2Q7VA 3P4QA 4D03A 1FL2A 3RP6A 1CBOA 1XHCA 4FX9A 2WPEA 1KSSA 1GERA 2GR2A 4XXGA 3BHFA 3CGCA 1JOAA 1H82A 1F6MA 2X99A 2VQ7A 3QSSA 4WCTA 2V6OA 3NH3X 3LB8A 5HYMA 3UP5A 2WETA 1LJ1A 5LV9A 3ADAB 1OJ9A 1CC4A 1S3EA 2Z5YA 5JCMA 3GWDA 2W0HA 4OPTA 4EQRA 1AOGA 3G5SA 2APGA 4H4RA 1FOHA 2EQ9A 2NVKX 3OZ2A 3P4RA 4UP3A 2YR6A 4YSHA 1PDHA 2X3NA 5IPYA 1NHRA 3AB1A 1MO9A 2FBWA 3REDA 1YQ4A 2WOVA 1V59A 3JSKA 2R9ZA 4DGKA 4B64A 4TM0A 1EL8A 4Y4LA 2WS3A 2FJEA 3NIXA 2YWLA 2WEUA 1B5QA 4X4JA 3ABVA 3LJPA 4NTCA 3SGLA 4H4TA 2ZZCA 4NEWA 3VRBA 4YXDA 4CBQA 1LPFA 3LZWA 3PO7A 4U2TA 1N1PA 2WU2A 3UTGA 1ZKQA 3NYFA 1VG0A 1K0JA 1NENA 3F8DA 2R4JA 2YLZA 3KPFA 4PAAA 3AEEA 4X9MA 5M0ZA 4YSYA 1GREA 1DOEA 2A89A 3NK1X 4C3XA 3UKLA 4NTEA 3AE1A 3NK0X 2WDVA 3AE7A 2FJAA 3AD7B 1D5TA 1EL9A 3AYLA 2WPFA 1DJQA 2QA2A 3UOZA 1JRYA 2Y6QA 2B9WA 1PJ7A 2C65A 4GF7A 2YG6A 4BK3A 1EBDA 2CDUA 2VVLA 3BI4A 3E1TA 3RNMA 3C4AA 5HHFA 4CY8A 5FS6A 4PABA 5KWFA 1ZOVA 3PS9A 4M52A 1D4DA 1PHHA 2VQBA 3CPHG 1L0VA 1DXLA 4TM3A 2XVEA 3UCLA 4FDCB 4HA6A 3K7TA 2YG5A 2WP5A 3P4SA 1D4EA 5JCIA 3UKFA 4RSLA 3S61A 1E1MA 1LTXR 3AYIA 4MJWA 3T37A 1JNZA 2R0CA 2C64A 2QAEA 2C70A 4KX6A 4B63A 5BULA 4U8MA 4U8PA 3AE8A 2VZ2A 2X8CA 1JNRA 4C3YA 1W4XA 2XLTA 4Z26A 3ATQA 2WESA 2WQYA 2C3DA 2GR0A 1MOKA 3F8PA 3FIMB 4A99A 3GDPA 1TDEA 1CJ3A 1GRGA 4YWOA 4B1BA 1DODA 2E1MA 3K7MX 4JN9A 2CFYA 4EM4A 1PBBA 2ZBWA 1PJ6A 1ZMDA 2JBVA 4KPRA 2H89A 2BS4A 4YTPA 1OJTA 1Y0PA 1LVLA 3AE6A 2BCPA 4YKGA 5J60A 1ZK7A 2XYOA 2WP6A 2YAUA 5KOXA 3VR8A 3P9UA 4JNQA 3UKQA 1LV0A 2XFUA 3HZLA 3L8KA 2OLNA 3BI5A 2F5ZA 1GOSA 2PHHA 2Q0KA 2PYXA 1NDAA 3EAOA 4ZCCA 3SFDA 3COXA 3GDNA 4GRTA 4H4QA 4IV9A 1Q9IA 3CPIG 3NHOX 4U8LA 1JEHA 5JCLA 2BK3A 4B65A 4GCMA 2BC0A 3NKSA 4EIPA 1GEUA 1GRBA 2YLRA 3R9UA 3UTHA 3M12A 5JCKA 3DJDA 3UOYA 2GB0A 3CGEA 4RG4A 4U2SA 2GF3A 3GYJA 4BK2A 2C73A 5U25A 2JK6A 2GMHA 1JU2A 1H7XA 4OPLA 4RG3A 5EOWA 4C74A 2GMJA 1LQUA 4OPUA 2YM1A 2QCUA 2JKCA 2R4EA 2E5VA 3QSEA 2GAGB 4IA6A 3GWFA 3OC4A 4JQ9A 4UDQA 4K5RA 1H86A 4OPIA 2WOWA 4GUVA 2AR8A 2RGOA 4JDRA 1PBFA 2YG4A 3AE4A 4AOSA 2GV8A 2YVGA 1DJNA 1PXAA 2YR5A 2DKIA 3SQPA 1Y56B 2C72A 4AP1A 4U8JA 3AD9B 4A7AA 5KVHA 3UKAA 1GRFA 2J3NA 4C5OA 4Z2UA 2C66A 4CNKA 5U1OA 1GRHA 4H4PA 3GYIA 4JNAA 5FS8A 1CJ2A 1Y56A 4CNJA 4A9WA 1KDGA 1H7WA 1GETA 3H8IA 1BF3A 3FBSA 4DSGA 1REOA 2XLUA 1D4CA 1TYPA 1SEZA 4ADWA 5L46A 2I0ZA 3IWAA 4NEVA 1NHQA 4X9NA 1PBEA 4ZN0A 4ECHA 4J57A 1KSUA 1NHPA 2DKHA 2GQWA 3UOVA 1S2QA 2BXRA 2O9ZA 3CNSA 3GRTA 3NRNA 4TM4A 5U63A 4EQWA 2CVJA 3S5WA 2RGHA 1IUVA 3QVRA 4Z25A 2GAHB 4UDPA 3M0OA 3K7QX 3AXBA 4OVIA 1OJDA 1TDFA 2XFPA 4WX1A 5KOWA 3D8XA 1GTEA 1NG3A 3P4PA 1QLBA 3CNDA 3EANA 1YY5A 3PVCA 4CY6A 3DK4A 5IQ1A 1S3BA 4Z2TA 2OA1A 1VRQB 3UTEA 4J56A 3NLCA 3KVEA 2XVHA 2TMDA 2YM2A 3UOXA 3ALMA 4JY3A 1H6VA 5EBKA 2YLWA 2X8GA 1F8WA 4K5SA 4H4VA 4REKA 3DJGX 4B67A 3O0HA 2E4GA 3NG7X 2HQMA 1Z6LA 2C7GA 2C3CA 2B7SA 2GEWA 3EF6A 2GR1A 3ICSA 4O5UA 4U8OA 4B66A 1O5WA 1KNRA 1RSGA 1VQWA 1GNDA 1TYTA 4GDPA 3ATRA 2FJDA 2XFOA 2XDOA 5FMHA 5FS7A 2GVCA 4A6NB 5C3JA 5KVIA 4K22A 3CNJA 1YQZA 4Z44A 2V60A 4EQSA 3RP8A 4A79A 1IJHA 2JB1A 2Z5XA 1K0IA 3GD3A 2EQ7A 4YKFA 1FCDA 1P2HA 1F3PA 4Z24A 2C67A 1N4VA 2B76A 3C96A 4LIIA 1GT8A 2A8XA 3AWIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2R6KA 3QOUA 2FWFA 4OFTA 3ISHA 5GAPD 3QVPA 1ILOA 3GURA 3O6TA 1TRVA 1KEBA 4A6NA 3E9JB 1QQ2A 3DGQA 4ZL7A 3AY8A 3SYIA 3E3EA 3GN3A 4FQUA 1YQ3A 2ZCTA 2HZFA 3V76A 1PRXA 2GVPA 4OFNA 5ECKB 3AE3A 3F3QA 3ZIVA 4EQXA 1PXBA 2KHPA 4KCEA 3H4KA 2IMIA 2KP1A 1Y25A 3QFBA 1TDOA 4EMJA 3BI2A 1JZDA 1XOAA 5G31A 1SKSB 1MTCA 4G9HA 4LMWA 4K7NA 1ZOYA 17GSA 3H79A 3W4JA 2XCGA 2BABA 1ZP0A 3APOA 3L9VA 1PQNA 1Z5YE 2B7RA 5ECIB 1QK8A 1BWCA 2UZZA 3HJMA 1NHYA 5D9VA 2HYXA 1H84A 5IMDA 4YQMA 3M9JA 3WGEA 4EVMA 1TU7A 3II4A 2H30A 2HRKA 3L9SA 3E0UA 5DJMA 2K9FA 2JAEA 3VRAA 4YJGB 1R5AA 2GRTA 1ZGNA 2GS3A 3IAM2 4PQ1A 1XWBA 4ZIJA 5D9XA 4F0BA 1TKDB 1HQOA 5JCUA 2WHDA 3VWXA 1T4ZA 1YDKA 1X9SB 2ZNMA 4Y4MA 3AEGA 3UKPA 4FYUA 4BVXB 3LJRA 2E2GA 3D4TA 1ZCPA 3P8WA 4KH7A 2YR4A 4TLZA 3I43A 1GTHA 2LNTA 2E49A 2ACZA 4P9SA 5J41A 2WZ9A 5CAXA 4J2WA 1VE9A 4IJ3A 1PXCA 1RW1A 4EO3A 1WMJA 3F63A 3IE3A 5DAKA 1K0MA 3UJ1A 1GLQA 4IHUA 1QJDA 3SY4A 3LOVA 1SL1B 1R7HA 5IMVA 4BURA 2GDRA 4TLXA 3ZITA 5FS9A 4V1Ap 4BA7A 2TPRA 2YV9A 3APQA 5TR3A 2YVJA 4GQCA 1RK4A 2QC7A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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