The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
18
|
sequence length |
84
|
structure length |
84
|
Chain Sequence |
GSSGSSGPWQPPADLSGLSIEEVSKSLRFIGLSEDVISFFVTEKIDGNLLVQLTEEILSEDFKLSKLQVKKIMQFINGSGPSSG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Signaling protein
|
| molecule keywords |
hypothetical protein LOC64762
|
| publication title |
Solution structure of the SAM_PNT-domain of the hypothetical protein LOC64762
rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
18
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| structure length |
84
|
| sequence length |
84
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2006-04-14 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | DNA polymerase; domain 1 | Transcription Factor, Ets-1 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1SV4 A; 2EAO A; 2E8N A; 1X66 A; 3TAD C; 4NL9 A; 2Y9U A; 5KNI A; 2DKX A; 2QB0 A; 5J8Y A; 1PK3 A; 1X40 A; 1DXS A; 1B4F A; 1OXJ A; 2EAN A; 2QKQ A; 2QB0 B; 3HIL A; 1WWV A; 1SV0 C; 2L5Y A; 3SEN A; 3SEI A; 2E8O A; 2KIV A; 1V38 A; 2F3N A; 2LMR A; 1V85 A; 1OW5 A; 5L1M A; 3IDW A; 5F3X B; 1COK A; 4IS7 A; 5JU5 A; 3H8M A; 1LKY A; 5J8Y C; 1Z1V A; 2DL0 A; 4PZO A; 3BS7 A; 3BS5 A; 2D3D A; 1KW4 A; 5JTI A; 2K4P A; 2YTU A; 3BQ7 A; 3BS5 B; 1X9X A; 2LPE A; 1SXE A; 2KG5 A; 4RQM A; 3TAD A; 2KE7 A; 3KKA C; 2B6G A; 1PK1 A; 2KMD A; 2GLE A; 4MHV A; 2KSO A; 1WWU A; 2EAM A; 2K60 A; 4NL9 C; 2F8K A; 1SV0 A; 5JRT A; 1SGG A; 1B0X A; 3K1R B; 3TAC B; 2E8P A; 2DKZ A; 1LKY B; 1UQV A; 2E8M A; 4RQN A; 4NJ8 A; 2QB1 A; 2JV3 A; 2FE9 A; 2ES6 A; 2F44 A; 2ESE A; 1JI7 A; 1F0M A; 2D8C A; 1PK1 B; 1RG6 A; 1SXD A; 2KSO B; 2QAR A; 1UCV A; 2EAP A; 2Y9T A; 2QAR B; 4PZN A; 3KKA A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4CF5 A; 2HVI A; 9ICQ A; 5AKI A; 1D9F A; 2W55 A; 3AQF A; 4ZOH C; 4YXM A; 4M9H A; 4ELU A; 5ALM A; 3R9K A; 1QSS A; 1ZQP A; 3IG8 A; 5KG5 A; 5AI4 A; 4TUQ A; 4NLN A; 3PSF A; 5F9N A; 4DL5 A; 5C0Y A; 2RDI A; 1OXJ A; 5AM5 A; 8ICW A; 2IHM A; 2VKQ A; 4DS4 A; 4OD0 A; 3RJE A; 2JEI A; 1Z19 A; 4TQR A; 2XY5 A; 3BJY A; 2BCS A; 3ZDE A; 3GFK B; 1HUO A; 1L7M A; 3WK5 A; 4B9N A; 2KZM A; 5DB7 A; 2HHT A; 4DQS A; 2IMW P; 8ICR A; 4QIW C; 4I2D A; 1N2X A; 4YQW A; 3MFI A; 3IM1 A; 2KFN A; 5AI5 A; 4PZO A; 4EEK A; 4GC7 A; 4ICA A; 2HBK A; 2FPM A; 3NVY A; 3C2L A; 2C2D A; 1DGJ A; 4YMM A; 1T4G A; 4O3S A; 2KE7 A; 5J0Y A; 2J6S A; 5DBC A; 2I1Q A; 4Y2J A; 5KFD A; 5DGB A; 1QQ6 A; 2M0N A; 1KFT A; 3QYP A; 1ZQI A; 4OJ6 A; 2C28 A; 3LYS A; 1U45 A; 2Y1I A; 4F3O A; 4KLU A; 1TVA A; 4PPX A; 1HJP A; 1Q3U A; 2YB4 A; 5HR6 A; 3RB0 A; 1LB2 B; 2WF5 A; 4NLB A; 1DK2 A; 4C80 A; 4ELT A; 1ZQG A; 2KN7 A; 5TZV A; 3DDH A; 5F9L A; 4J9M A; 4BDP A; 4UB1 A; 5AM0 A; 2D8C A; 1S0N A; 1WYG A; 1ZQN A; 5AI6 A; 4KLE A; 1WCL A; 4RQ7 A; 3JPS A; 5AM2 A; 4C7Z A; 1ZQA A; 4LVS A; 3NGD A; 3WK6 A; 3CW2 C; 4LJX A; 4P0Q A; 1JIH A; 2KOB A; 2XIC A; 2YB1 A; 4CNQ A; 9ICF A; 2DKX A; 4JWM A; 5DDY A; 2W7O A; 3IHQ B; 2F76 X; 2DF4 B; 4IC9 A; 1S77 D; 4M9L A; 2NRZ A; 1N48 A; 1F44 A; 4J9O A; 3LVV A; 3M9M B; 2NYV A; 1FFV A; 4MF2 A; 2W7P A; 3AUO A; 1NK6 A; 4IS7 A; 4NM1 A; 3KZI U; 4OO1 J; 3H8M A; 1RPL A; 3ZD9 A; 3RB4 A; 3CRX A; 5AKH A; 1S0O A; 2E1E A; 3BQ2 A; 2A1J B; 1N61 A; 3D6J A; 4YP3 A; 4DL6 A; 1H38 A; 1MQ2 A; 1QSY A; 1X9X A; 2LPE A; 4ED1 A; 2ZIV B; 7ICP A; 5DB9 A; 1D8B A; 1A76 A; 1X2I A; 5J2E A; 2Y0S C; 4UAW A; 1WWU A; 5ALE A; 4ACO A; 2F8K A; 1N62 A; 3QU4 A; 4YN4 A; 1KFD A; 4KX3 A; 3NVZ A; 4RQ2 A; 3TAC B; 5ALS A; 5GTH U; 4PHP A; 3GV8 B; 5KG6 A; 2BDU A; 3C1Z A; 2LKY A; 5HNK A; 5BOL A; 3PX4 A; 3IRU A; 5KFF A; 4ECZ A; 4IR9 A; 4CRX A; 3ZI4 A; 5CEH A; 3UQ0 A; 2BQR A; 7ICS A; 3TKA A; 4UBC A; 3AEV A; 2F8L A; 4RQ1 A; 4EYH B; 3MDA A; 4F4Y A; 8ICQ A; 1RXW A; 4RNM A; 3UXO A; 4F2R A; 3KKA A; 2XGP A; 1S9F A; 4J9L A; 4F4W A; 7ICR A; 5CRX A; 5HMM A; 4QZB A; 4NWI A; 2VAN A; 8ICS A; 4PJ0 U; 2JEJ A; 1UPH A; 4FE3 A; 5BOM A; 4DQP A; 3F53 A; 4PHA A; 3HIL A; 5KFQ A; 2EDU A; 4DOA A; 2C2E A; 3LDA A; 3WKE A; 3RH4 A; 5AKG A; 1NJX A; 1IM4 A; 4MFF A; 1L3S A; 1SKW A; 1NK7 A; 4M9N A; 1K5O A; 1KKX A; 1KSP A; 4K4H A; 5ALH A; 2RDJ A; 5J0R A; 3RTV A; 2ISO A; 4QZ8 A; 1O08 A; 2ZUD A; 2J6U A; 1KW4 A; 1L6N A; 1NK9 A; 4KMO B; 1JRP A; 5B5E U; 9ICN A; 2IOH A; 2ALZ A; 5ALD A; 4YMN A; 8ICX A; 2NO4 A; 3A0B U; 1SV0 A; 1QLN A; 3TFR A; 1U49 A; 2LBO A; 5G5G A; 3V72 A; 3QU9 A; 3O0F A; 4EX7 A; 4LZD A; 5AKZ A; 1A6S A; 3M6K A; 2AGP A; 3QZ8 A; 9ICH A; 3PML A; 4Y2Y A; 1C20 A; 1UA0 A; 8ICI A; 3LVW A; 3N7P D; 1SZP A; 1QH9 A; 1ZQJ A; 5KT7 A; 3T5K A; 1ZQO A; 4JK1 A; 5D49 A; 3ICX A; 4YD2 A; 3RBE A; 2CPR A; 3NRW A; 5KFL A; 3WKD A; 5J2G A; 2QB0 A; 5J8Y A; 4QZE A; 1X40 A; 3MGI A; 5KL8 B; 1JXE A; 1VLB A; 2ZIX B; 1T3N A; 1FO4 A; 1T7P A; 5J2F A; 4DSF A; 4DFJ A; 2JZB B; 4DCC A; 2AXT U; 2E8O A; 4M0A A; 2HHS A; 2OXO A; 5AK6 A; 3ETL A; 4FBU A; 3GIL A; 1COO A; 5KG0 A; 1KEJ A; 4BXO B; 5JU5 A; 1WCN A; 5AK3 A; 1Z3E B; 3ALR A; 3RB6 A; 1Z1V A; 4EBE A; 5DQH A; 2PFQ A; 4J9R A; 3MAB A; 2BPC A; 1M6Y A; 2DPJ A; 1L3T A; 4Y2T A; 5KG3 A; 2BR0 A; 1U48 A; 5ALQ A; 2W8K A; 3TAD A; 3PW5 A; 3KKA C; 2B6G A; 3H40 A; 3PX6 A; 1ZQF A; 3T5J A; 2VA3 A; 2OM6 A; 4QZC A; 1XWL A; 1TK5 A; 4F93 B; 2BDP A; 3PO4 A; 3MGH A; 3RJF A; 4ECQ A; 5ALK A; 2PKE A; 5JRT A; 1ZQ1 C; 1NK0 A; 9ICM A; 5EWE A; 5KFC A; 5EE0 A; 1UQV A; 1NOM A; 1FIQ A; 3C29 A; 7ICM A; 4RNO A; 3PSP A; 3MR6 A; 1TAM A; 9ICB A; 4DFD A; 3F2D A; 4DQR A; 2UVV A; 9ICG A; 8ICJ A; 4DL3 A; 2ODG A; 1MN8 A; 4EZ9 A; 2H5X A; 2QAR A; 5ALN A; 4DF8 A; 4GFJ A; 4ELV A; 2EAO A; 3DV9 A; 2WHE A; 2O6K A; 4RNN A; 1ZQR A; 2KVC A; 7ICT A; 5IIK A; 4GXK A; 2DFL A; 2C22 A; 4F4X A; 2XVT A; 4O3M A; 7ICQ A; 4O3R A; 5ALX A; 1SV0 C; 4UQG A; 3C21 A; 5AKX A; 5ALP A; 3PW0 A; 4BWJ A; 4I2B A; 1TKD A; 2HBM A; 8ICA A; 3F2C A; 2KZ3 A; 4DO9 A; 4ED8 A; 4DFK A; 5IIM A; 3I1Y A; 4I2G A; 3GIJ A; 3BDP A; 1ZQY A; 4C8O A; 5AK4 A; 3T79 A; 5IIL A; 2F1I A; 5DG7 A; 2RLT A; 3WK9 A; 3BS5 B; 1QSL A; 3RAX A; 4US9 A; 5ALY A; 4TUP A; 4M9G A; 4P4P A; 4FZN A; 2PI4 A; 2G09 A; 7ICN A; 2GH1 A; 3Q8S B; 4O5C A; 1S10 A; 8ICU A; 2HSZ A; 4R63 A; 1LV5 A; 2IBK A; 3AU2 A; 1ZET A; 4B6J A; 9ICP A; 1J97 A; 2KKP A; 4G3I A; 3KHL A; 2YMM A; 4C4S A; 2JMG A; 3C1Y A; 3EPI A; 2XY7 A; 2FE9 A; 2F44 A; 1UT8 A; 1RYR A; 2W3S A; 4YCX A; 2DBY A; 3LWL A; 5KFG A; 2ZIX A; 4DSI A; 4NM2 A; 2NV3 A; 5CP2 A; 7ICG A; 4ECR A; 2UVW A; 2W3R A; 1SXD A; 3CP8 A; 5L1I A; 4AYB F; 3H0L B; 2F2A B; 4C0Z A; 4NV0 A; 3TAD C; 1SL1 A; 3C5G A; 3KTQ A; 4EEN A; 1K1Q A; 4O3Q A; 1PK3 A; 5EWG A; 3SD7 A; 2QKQ A; 5ALG A; 3UXP A; 1U47 A; 1MSW D; 5KFM A; 4PL1 A; 2NRW A; 1ZQX A; 1TAU A; 3ISC A; 3OPX A; 3BZC A; 3ISB A; 2A19 A; 2WB1 F; 2HHX A; 2E5S A; 2ZXI A; 1TAQ A; 3PW2 A; 1NKE A; 4GC6 A; 5CHG A; 3PR5 B; 2W54 A; 2K8B B; 4QZI A; 3VC8 A; 3AN1 A; 2XI9 A; 1ZQH A; 4C8N A; 4CE6 A; 2HOI A; 2GO7 A; 3OHA A; 1NI3 A; 3KOO A; 4RQ4 A; 2DWQ A; 1ZRM A; 9ICT A; 4FZL A; 4Z6E A; 3QUC A; 3K75 D; 5AKL A; 4FZM A; 3H8S A; 4PH5 A; 5DQG A; 3V7K A; 4KLD A; 2K8A A; 1ZD2 P; 2K89 A; 4K4G A; 5EOZ A; 2HBL A; 4PGQ A; 3N7S C; 2E8P A; 1LKY B; 3T3F A; 5KFU A; 1YZ6 A; 4DSL A; 1X42 A; 2ISP A; 8ICZ A; 3GQC A; 4F4Z A; 1UA1 A; 2KTQ A; 5KFR A; 3EZ5 A; 2FMQ A; 3MC1 A; 5KFV A; 3WK4 A; 3QUQ A; 3TI0 A; 9ICC A; 5KFK A; 4O5E A; 4G9B A; 5J0X A; 4IR1 A; 2G5H B; 2W03 A; 4O3N A; 5III A; 3HRD D; 2Y9T A; 2EAP A; 2ZG6 A; 3ZD8 A; 3FM9 A; 4WJ3 B; 5AKK A; 4ZH4 A; 3NS1 A; 2PFO A; 3RJH A; 2WAQ F; 2K4H A; 4IL6 U; 2PFN A; 3M9N B; 3G6X A; 4KLI A; 1P7D A; 2YN4 A; 2YMQ A; 1F5S A; 2W04 A; 3QU5 A; 3FC4 A; 3LWM A; 2EAN A; 4RQ8 A; 1NKC A; 1ZQC A; 3JPR A; 3E58 A; 3VCB A; 2L5Y A; 2V4Q A; 2PFP A; 4JV0 A; 2W8L A; 3H4D A; 1IV8 A; 5T14 A; 4UB3 A; 2KIV A; 1X6J A; 2AH5 A; 5J2B A; 4NLZ A; 4FFD A; 4RQ3 A; 1DGS A; 2OYY A; 4J9P A; 3RAQ A; 1U4B A; 2W11 A; 2JH1 A; 1KN5 A; 3UQ2 A; 2FJ6 A; 1YZ7 A; 1VDV A; 2KV2 A; 4NLC A; 2ZIW B; 4RQ5 A; 2WF8 A; 3M9O B; 4F50 A; 4DSK A; 3KFU F; 1SZH A; 3BQ7 A; 4KLS A; 4Q8F A; 1QCK A; 2G5I B; 2JRZ A; 2MUT B; 5HML A; 4F4K A; 2P66 A; 1N5W A; 2DPI A; 5CWR A; 3SV4 A; 1S5L U; 5KG1 A; 4F5P A; 5DBB A; 2I6X A; 8ICB A; 2KD1 A; 4GXJ A; 3ZDB A; 5DBA A; 2ZTD A; 4DSE A; 2HHV A; 5KFH A; 1Q3V A; 1HIW A; 1RQN A; 7ICO A; 2KNJ A; 1RQL A; 2FPK A; 2LYH A; 1CUK A; 4MFC A; 4Y2X A; 2HHW A; 3ISD A; 2P6U A; 3IG5 A; 3N97 B; 5G5H A; 3LK9 A; 4QWC A; 1ZJM A; 5A0L A; 3EUB 2; 1UCV A; 4AYB C; 3PO5 A; 4QZA A; 1A0P A; 2E8N A; 5J2C A; 9ICI A; 5HR7 A; 2EQY A; 5HHH A; 2PMZ C; 4YXJ A; 1N56 A; 9ICO A; 2BGW A; 5CJ7 A; 3OJS A; 3SEN A; 1XS9 D; 8ICN A; 1NJY A; 2W9B B; 2BKE A; 5J0W A; 4EX6 A; 4F72 A; 1CRX A; 4F91 B; 3FAH A; 2P6R A; 1OW5 A; 2OHF A; 3EW9 A; 4R65 A; 2VA2 A; 5ALR A; 1OUQ A; 4OJ5 A; 5ALO A; 1D8L A; 5JUM A; 1L7O A; 1ZXI A; 1O03 A; 1BPY A; 1LKY A; 2R8K A; 2C2R A; 5KFX A; 2FMP A; 4UB5 A; 1B43 A; 5JTI A; 2WTF A; 2K4P A; 2RQ5 A; 1SKR A; 3L5K A; 3AL0 B; 1JMS A; 4RQ0 A; 5KT4 A; 2MAX A; 3HKZ F; 5KL1 B; 4EBD A; 3WU2 U; 4RT2 A; 3PX0 A; 4F2S A; 5AIA A; 4I2I A; 4C8L A; 3SAF A; 2MU2 A; 3V7L A; 2EZY A; 1RYU A; 5DG8 A; 2CRX A; 4ECV A; 3RR8 A; 4RUC A; 2R8I A; 4JUZ A; 4KLO A; 3FDS A; 1ZD5 A; 3RJJ A; 2WF9 A; 1XSL A; 4K4I A; 4GIB A; 2H3Q A; 1SIJ A; 4P2H A; 4CF3 A; 4KLG A; 2W9C B; 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4Z6F A; 4X5V A; 1XSN A; 1JXL A; 2KSO B; 2CXY A; 1Z00 B; 3S6J A; 5GTI U; 2W9B A; 2ZUC A; 1PVP A; 3GDX A; 4DL4 A; 4IQW A; 1BGX T; 4JMU A; 4P4O A; 1XO0 A; 1BVS A; 1JAL A; 3D2N A; 2ZTE A; 4US8 A; 5KG4 A; 5EE1 A; 2IA6 A; 4ECW A; 4JWN A; 2KKV A; 2BCV A; 4CCH A; 9ICW A; 1FEZ A; 4Q8E A; 8ICY A; 4IQU A; 4QZ9 A; 5EWF A; 4P4M A; 1JX4 A; 1N5X A; 2ATL A; 2H3V A; 1NZP A; 2H3F A; 1HEK A; 4F5O A; 2G0A A; 3MGV A; 3AM9 A; 4IRD A; 4QWD A; 5KAF U; 2AQ4 A; 5J2J A; 2Q4T A; 1KL9 A; 5KFP A; 2YTU A; 3RFA A; 2FI1 A; 3UPQ A; 2XO7 A; 5KT5 A; 5J2K A; 3K1Z A; 2KG5 A; 3HPO A; 2IHN A; 3WKA A; 2KJ8 A; 5KFI A; 3ORY A; 2F1H A; 3CYM A; 2KMD A; 4F5Q A; 1ZQV A; 5AM3 A; 2ASD A; 3NTU A; 2EAM A; 4NL9 C; 2Z7J A; 4ECS A; 2OEH A; 1SGG A; 5DB8 A; 2W9A A; 4F71 A; 1JRO A; 2JV3 A; 5ALT A; 3QUT A; 1DRG A; 5DDM A; 1TK8 A; 4FS1 A; 2RP5 A; 4OJO A; 4RPX A; 2HHQ A; 1S97 A; 5J29 A; 3MR2 A; 3HT3 A; 4P0P B; 5KFT A; 1SWV A; 2YX8 A; 4DWI A; 1J2M A; 4BX9 C; 4Q43 A; 3TAN A; 2M9N A; 3G6Y A; 2HMX A; 2I5H A; 4C8M A; 1S76 D; 5DB6 A; 2NRV A; 4QZF A; 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