The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
21
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sequence length |
92
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structure length |
92
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Chain Sequence |
GSSGSSGMANYYEVLGVQASASPEDIKKAYRKLALRWHPDKNPDNKEEAEKKFKLVSEAYEVLSDSKKRSLYDRAGCDSWRAGGGASGPSSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Chaperone
|
| molecule keywords |
DnaJ homolog subfamily B member 8
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| publication title |
Solution structure of the J domain of DnaJ homolog subfamily B member 8
rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
21
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| structure length |
92
|
| sequence length |
92
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2006-04-24 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00226 | DnaJ | DnaJ domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | DnaJ domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2QWP B; 1FAF A; 2GUZ B; 1BQZ A; 2OCH A; 3UCS C; 2CUG A; 2CTR A; 2L6L A; 2N04 A; 3APQ A; 4J7Z A; 2Y4U A; 2GUZ A; 2LO1 A; 1NZ6 A; 1WJZ A; 1FPO A; 4RWU A; 3APO A; 2N05 A; 4J80 A; 1XBL A; 3UO3 A; 1GH6 A; 2QWQ B; 3AG7 A; 3UO2 A; 2KQX A; 2EJ7 A; 2CTW A; 2QWN B; 2CTP A; 2Y4T A; 2DMX A; 2YUA A; 1BQ0 A; 2CTQ A; 1IUR A; 2DN9 A; 2QSA A; 1N4C A; 2PF4 E; 1HDJ A; 2QWR B; 2YS8 A; 2M6Y A; 2LGW A; 2QWO B; 4IT5 A; 3BVO A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4DR3 B; 1CXZ B; 4X1I A; 4OX9 B; 4CH3 A; 3K58 A; 4PA7 A; 3OGI B; 4B7K A; 3P3P A; 2ZDI A; 4DRX A; 1Y67 A; 3Q4H A; 2CAZ C; 2QSA A; 4UCR A; 4DV6 O; 2W6I G; 1N32 O; 1I5X A; 3H1I H; 3K59 A; 3B8N A; 5F2V O; 3AG2 B; 4GX1 A; 4K8Z A; 1P84 F; 3ZHR A; 1P4R A; 3P32 A; 3SR2 C; 3CSX A; 1YTF D; 4O2B B; 2CTP A; 4WFH A; 2Q6A A; 1FJG B; 3ABM C; 4Q6G A; 4YJ3 A; 5IYZ B; 3MAQ A; 2YXL A; 1LNQ A; 4QNH B; 2ZQM A; 4UCO A; 1AB3 A; 4DR1 B; 1VEW A; 3ZHT A; 1AR1 B; 2ZT9 B; 4J7K A; 2HJD A; 3CE2 A; 2XUM A; 5LXT A; 4FLY A; 3SGI A; 4I7Z B; 3ASO B; 5LOV B; 2XHB A; 1FXK A; 3BAA A; 4P2Z A; 3EVK A; 3RVZ A; 2UU9 B; 3ABK C; 1VAR A; 4JI7 O; 4E4E A; 3CCE V; 2BTO A; 3O9O A; 4BIU A; 4U7O A; 2UXC B; 3ZHQ A; 1G1X B; 2KSD A; 4CZZ A; 5FL7 G; 1OCO B; 2M7W A; 1N33 B; 3ZRS A; 1WA8 A; 5GW7 A; 3CRA A; 3OM3 B; 1OCC B; 3SPG A; 3G6B A; 3B8M A; 1JCH A; 1FXK C; 1P7B A; 3E35 A; 4NTX A; 1B04 A; 5IJ9 B; 1BZK A; 5FPO A; 3L74 H; 4RWU A; 1SC5 B; 4AI8 A; 3UO2 A; 1HWY A; 3ZHV A; 2KQX A; 3JD0 A; 1IBM O; 1I5Y A; 2Z5U A; 2DJV A; 3MHH C; 2Q0O C; 3J80 N; 3RFR A; 1XNR O; 2PUS A; 5CBF A; 2VQF O; 1KUQ A; 1ZL8 A; 5H9C A; 3J81 N; 4N23 A; 5DED A; 3OMA B; 5LP6 B; 3I5D A; 4CH6 A; 3H1J H; 4LFC O; 4DR6 O; 4JI4 B; 1EN5 A; 2W0X A; 3L73 H; 4DW0 A; 4CC5 A; 3UT5 B; 3D8C A; 2PI4 A; 5H6Q A; 5TIS Z; 1M57 B; 4G27 B; 3B09 A; 3LNM B; 4JI2 B; 3GWK C; 4X20 A; 2H94 A; 5IJ0 B; 2WWW A; 4DR2 O; 2PYL A; 3A2F A; 1FYJ A; 2IBZ H; 1YVW A; 1BE3 H; 4MW3 A; 2CTW A; 4OXS A; 1JFF A; 3JAW A; 1DTO A; 3MDS A; 1K34 A; 5CMU A; 2A06 H; 3VQX A; 3AG3 B; 4JAS A; 3OR6 C; 3UM7 A; 4J9Z B; 4J7J A; 4ZOL B; 1L0L H; 5H6R A; 1BSM A; 3W7X A; 1NTK H; 4AQY O; 4J7Z A; 3RYC B; 3HKC A; 3OEH G; 4DO2 A; 4QGP A; 3D3Q A; 1YF2 A; 2OIG A; 4MVS A; 2UUC B; 1KD1 W; 3WG7 C; 5C8Y A; 1TVK A; 4YIP A; 2JGD B; 3OFN G; 4I50 A; 2RDC A; 4ZBM A; 2FML A; 3P3N A; 1KMI Z; 1HNZ B; 5IYB O; 2EIM C; 4B3M O; 1YJW V; 1URF A; 1KP3 A; 3TET A; 1Z5W A; 4X1Y B; 1AP5 A; 2DN9 A; 4LBE C; 4MVR A; 1SES A; 4LF4 B; 2JJ1 G; 1PL4 A; 3JAT B; 4DUZ B; 2XOK G; 4W4K A; 4RQE A; 3W7T A; 2CGO A; 2JS3 A; 1F7Y A; 1M93 A; 1WP7 A; 2KKW A; 2EIJ C; 5H2F Z; 1H8E G; 1BL8 A; 3LDD A; 2FKX A; 1MSW D; 5LYJ A; 1J95 A; 1N8R W; 4MVU A; 1JMK C; 2AHY A; 1ARO P; 4TSF G; 3M7M X; 1TA8 A; 2O57 A; 5LA6 B; 4YY3 B; 3LDC A; 3QVN A; 2YI8 A; 5BMV A; 3WFV A; 2BSK B; 1FXV A; 1YXB A; 2EX3 A; 2HJF C; 4QPK A; 4F6R B; 1OV9 A; 2MW2 B; 4CH5 A; 4OPH A; 4MVQ A; 4DR3 O; 4GUN A; 4I4T B; 3RWR D; 1M5I A; 4OX9 O; 4WCE V; 2YEV B; 3CXH F; 4WBN B; 2CTQ A; 1SQG A; 3STZ C; 2N74 A; 3JD4 A; 3X2Q B; 4B3T B; 2R9I A; 5LMU B; 1OZ0 A; 4PJ0 Z; 3JAK A; 3QO7 A; 2P67 A; 1GMG A; 4X62 B; 4TUY A; 1R3J C; 2IJH A; 4TV9 B; 1JR9 A; 2N05 A; 1D5A A; 4R8C A; 2FYU H; 1M9N A; 4DV2 O; 2ZD9 A; 1JQ0 A; 3OR7 C; 3JD2 A; 3L70 H; 2JVD A; 3L72 H; 5D5P A; 3ZCC A; 3U0Z A; 1N0N A; 3ZIA G; 5KLV H; 3ZMU A; 3ZX6 A; 3ZN0 A; 1O9G A; 4JYA B; 1FJG O; 2KG7 A; 3FKS G; 1W0J G; 3DC5 A; 5KHJ A; 1SQQ H; 4Z1M G; 4DXW A; 3FYE B; 2IJK A; 1B6Q A; 4FJC C; 3CHX A; 4BIZ A; 4BR6 A; 3CWB H; 1JPX A; 4PI2 A; 4MVM A; 1VQ8 V; 4I0X B; 2PF4 E; 1HDJ A; 4D6T H; 5LGN A; 2CH7 A; 1E1Q G; 4OPA A; 2YIC A; 4H33 A; 5KX5 A; 5B1B C; 4O4I A; 4UFZ A; 2UU9 O; 3AG1 C; 4DR7 O; 4FLT A; 1FFX B; 1RPO A; 4OGQ B; 4P30 A; 4GT1 A; 3FB8 C; 3LSS A; 2Q67 A; 4JZ2 A; 4EFE A; 5LL6 Y; 1N33 O; 1YCI A; 4JI3 B; 4GKK B; 3BRC A; 4XDL A; 4NXN B; 3C3S A; 4LCU C; 1Q86 W; 2V4D A; 3KKY A; 1SS3 A; 2QWQ B; 3AG4 C; 4LH6 A; 3B2E E; 2BOB C; 5EK0 A; 5KAF Z; 5BZB A; 4DV4 B; 4U3J B; 3ICX A; 3OMN B; 4RQF A; 3CP1 A; 3J7A U; 2AHZ A; 1NVP D; 2ZNI A; 3E22 B; 1XQ8 A; 1JA8 A; 3QF7 A; 4MTF A; 3OUS A; 3IGA C; 5ITZ A; 4NKG B; 2BOC C; 1EZV H; 4JI6 B; 1RP3 B; 4DV5 B; 2DYR C; 1I7F A; 1BT8 A; 5CA1 A; 4R6Z A; 1R6K A; 4JI1 B; 1VP7 A; 2RN9 A; 5KAI Z; 3CME V; 2Y69 C; 4H44 B; 3IJ4 A; 1PM9 A; 3DXR B; 2HEP A; 5B1A C; 3JAL A; 3LUT B; 1TGO A; 4MVZ A; 4JI4 O; 2DYS C; 4JGS A; 3BAB A; 3TCU A; 4JAA A; 4NR1 A; 2DQ3 A; 3CB2 A; 5EYP A; 3K9S A; 4LFC B; 4H13 B; 4D7T A; 1OCZ B; 2QWN B; 2E5L B; 4KP4 A; 5KUM A; 2DWD C; 3HKD B; 5E1A C; 1XNQ O; 2X0L A; 1THZ A; 1QBZ A; 1WNS A; 1VQP V; 3N2G A; 1MOF A; 4DR2 B; 3CYO A; 4R50 A; 4UCU A; 3BCC H; 3CJH A; 1EBO A; 2DE0 X; 5LMN O; 3ABL C; 2F23 A; 2QM7 A; 3ZMZ A; 4FLV A; 1K7D A; 2Q69 A; 1KYO F; 1KKD A; 1K3E A; 2KB1 A; 1VQN V; 4HNA B; 5J2U A; 1VQM V; 4GX0 A; 4AQY B; 2UUC O; 4UVA A; 3HKB A; 1MZF A; 2ATK C; 2HHH B; 2ADQ B; 4PDR A; 2ILM A; 4TV8 B; 1AIL A; 2XAH A; 4G2K A; 4DK0 A; 2LFS A; 5CA0 B; 1HNZ O; 5CN0 A; 1NS1 A; 5EZY A; 3DC6 A; 1W2B U; 1BS3 A; 3CCL V; 5EC1 C; 4A5U B; 1K5S A; 4O4L B; 1NH2 B; 1HNW B; 3KCY A; 4BWA A; 4LF4 O; 4FLW A; 3WB1 A; 3AEI A; 2EJR A; 3JSL A; 3L75 H; 4AHC A; 1RSO A; 1ZUQ A; 2WA4 A; 1HR0 B; 1MMM A; 2CK3 G; 2RCV A; 3QNE A; 5KHK A; 1XHX A; 1EFR G; 2YI9 A; 1PNL A; 4YY3 O; 2OCC B; 5IYZ A; 2N04 A; 4UCT A; 4EKW A; 1PL0 A; 1V55 B; 5IYC O; 3K5M A; 3AG2 C; 2Q5Z A; 3F5W C; 1V54 B; 3CX5 F; 1FS0 G; 1Q6H A; 5J2T B; 4FMT A; 5EIB D; 2JJ2 G; 1GKF A; 4IL6 Z; 1IBK B; 5A2Q N; 5LOV A; 3PN1 A; 3HB3 B; 4B3T O; 2ZE7 A; 5KA5 A; 5LMU O; 4FFK A; 3UO3 A; 1SZX A; 2ARH A; 3T2M A; 3U11 A; 1E1R G; 1WN7 A; 2LW1 A; 4X62 O; 1K33 A; 2WLH A; 4LF6 B; 3ZED A; 1RM1 C; 3U10 A; 1SQX H; 3IFX A; 1AJN A; 3ZRW B; 1NTM H; 3H9V A; 3ZMS A; 5JH7 B; 1WPX A; 2ZNJ A; 2F1M A; 5LGT A; 2H8P C; 1Y74 B; 3ASO C; 4EB6 B; 4DV2 B; 1NVP B; 2P4K A; 2YIA A; 4Z1V A; 1R3K C; 3KG2 A; 5IJ9 A; 4JYA O; 2HVJ C; 3CC2 V; 3CRQ A; 2ZDI C; 4GX5 A; 4MW8 A; 4YIO A; 2V7Q G; 2X6C A; 3RYI B; 2WLI B; 3ZHU A; 4J41 A; 1OCO C; 3BPZ A; 5CBG A; 3CMA V; 1OCC C; 3JAR B; 4UVC A; 4UB8 Z; 1VMG A; 3CEI A; 3FB7 C; 4PV1 B; 5JCO A; 3B77 A; 4WFA V; 3S3W A; 2Q0A A; 1EM1 A; 5LP6 A; 2XAQ A; 1QR9 A; 1K97 A; 5L3D A; 3T1Y B; 2DQ0 A; 3UT5 A; 1K8A W; 2ZXW B; 1S0V A; 4O2A B; 4TOI A; 4I9W A; 4DR7 B; 4X64 B; 1QLE B; 2F93 B; 1VQL V; 4PA4 A; 5JJE B; 3FAV B; 3GB7 C; 1AP6 A; 4JI3 O; 4GKK O; 5IJ0 A; 4NXN O; 2BTQ A; 2EIK B; 5IYD O; 4JAV A; 1D5N A; 3SJC C; 5LP6 C; 5IE9 A; 1SZT A; 1FD9 A; 4DV4 O; 4DV1 B; 2WA3 A; 3WU2 Z; 4ZOL A; 4LNU B; 1LUW A; 2R9R B; 4DRX B; 1ZTE A; 5K1P A; 2A3Q A; 3RYC A; 2QKS A; 3E8G A; 3ABM B; 4TWK A; 2ITC C; 5KHG A; 3MHS C; 4JI6 O; 1I94 O; 4PA6 A; 4DV5 O; 4LFA B; 3D3I A; 1K4C C; 5LGU A; 4RO2 A; 3SYC A; 5KA6 A; 1N0J A; 2HR3 A; 2JGD A; 4JI1 O; 3TXQ A; 1G4Y B; 3ZMV A; 4DYL A; 1XBL A; 4ABM A; 1JVM A; 3BA8 A; 5EBL C; 5IWA B; 1PPJ H; 3CCU V; 2E75 B; 3CCS V; 4BW5 A; 4JI8 B; 1QHT A; 4X1Y A; 2LFR A; 1XUQ A; 2E5L O; 5L3C A; 1YHQ V; 1NR7 A; 4DK1 A; 2FL4 A; 1N36 O; 2OYQ A; 1GN3 A; 3QO5 A; 2UXD B; 5JQG B; 1XNQ B; 2DW4 A; 2GTA A; 3JSN A; 2Q73 A; 4TQD A; 3K9A A; 3H1K H; 3HR0 A; 3QG5 A; 4FM0 A; 5LA6 A; 1N34 B; 3SYO A; 5LMN B; 1XIL A; 4WFB V; 1XL4 A; 1QVG U; 3JAS B; 1H2K A; 1GM7 A; 2BSK A; 2CUG A; 3H1H H; 2Q68 A; 2ZKO A; 1XDC A; 1JJO A; 3E89 A; 4F6R A; 2ZIM A; 2HHH O; 1WA8 B; 5B3S B; 4J11 A; 1CP9 A; 3CRM A; 4I4T A; 2WLL B; 4KXR A; 2YEV A; 3JCZ A; 4CH4 A; 4WBN A; 2QTS A; 1D2D A; 2YC0 A; 2AXT Z; 4DV0 B; 4UV9 A; 2W6J G; 1ROP A; 1XL6 A; 2F4V B; 1OJH A; 2WSS G; 1JX9 A; 1AJP A; 4C7U A; 2G38 A; 1HNW O; 2A9H A; 4TV9 A; 3F5T A; 4I55 B; 3K5L A; 1NJI W; 3W7S A; 1Y76 B; 1R1B A; 1QR8 A; 2JK5 C; 3RN4 A; 3SPC A; 1YTF B; 1R73 A; 4FLX A; 2NLJ C; 3E86 A; 2ZIO A; 1HR0 O; 4DR4 O; 1SA0 B; 1R6T A; 4P9O A; 2AW9 A; 1Z2G A; 2JDI G; 4YJ2 B; 1DLB A; 1DGS A; 2D2C B; 4UCV A; 1BGY H; 1TUB B; 3K03 A; 3RVY A; 2Z0A A; 1M56 C; 5DN6 G; 1NT2 B; 1S76 D; 2B1I A; 1IBK O; 4U3F H; 1SET A; 1VQK V; 3WG7 B; 2P7T C; 1AR5 A; 1K5Q A; 4JI5 B; 2Q7G A; 1YJN V; 1FFX A; 4FIP C; 4JF3 A; 3BFR A; 4X88 A; 3LDE A; 3LSQ A; 2GUZ B; 4NTY A; 3CCQ V; 4PDV A; 3RYF B; 1O9H A; 2VS0 A; 3AK2 A; 4LF6 O; 2UXX A; 1FPO A; 4EEQ A; 1R3L C; 2BCC H; 1KU9 A; 1KBH A; 2OIE A; 1GTO A; 4FLZ A; 4PI0 A; 2X6B A; 4FFB B; 5BY1 A; 3NXS A; 4U3J A; 2K9P A; 3G6E V; 1ZX3 A; 4U7N A; 2RJZ A; 3DTU B; 2OTJ V; 3E22 A; 3A8T A; 3K5N A; 1M4U A; 1NZ6 A; 1DK1 A; 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2P4V A; 4CC6 A; 5BR8 B; 2VQE B; 2EIL B; 5LHH A; 1A32 A; 2P6J A; 3OUF A; 5GTI Z; 3BEH A; 2UXD O; 2CH7 B; 2YDE A; 1PKX A; 4K35 A; 2GV9 A; 1N36 B; 3AG4 B; 4B3S O; 1MSD A; 4QE7 A; 1N34 O; 2DOS A; 4ZHQ B; 3B4S A; 1PNK A; 4GKJ B; 2UXB O; 1NI8 A; 2AZ0 A; 4W4L A; 5CA3 A; 2JIZ G; 5J2T A; 3I56 V; 4HAM A; 1FFT B; 4B08 A; 3P30 A; 4QE9 A; 1FAF A; 2E76 B; 1J5E O; 4QIW F; 2DYR B; 3CC7 V; 3D36 A; 3O65 A; 5EBM C; 1IXB A; 4DV0 O; 2FTK A; 2Y69 B; 3VBB A; 1QVF U; 4XDK A; 2F4V O; 3W7W A; 3OW2 U; 1H38 A; 2DYS B; 3FYI B; 2WLM A; 1F4M A; 1U97 A; 1KB9 F; 4Z2W A; 1V54 C; 1Y66 A; 1YIJ V; 3HKE B; 5ITZ B; 3ZRW A; 3A0B Z; 5JH7 A; 2XAG A; 1SER A; 5KMG B; 4ZIB A; 1XRE A; 4DV7 B; 4HBN A; 1ENV A; 1X59 A; 1P7G A; 3SYQ A; 4O4H B; 1YJ9 V; 2YIB A; 4BW9 A; 4O2B A; 4DR4 B; 3KZI Z; 4X9Q A; 1V9P A; 3RYI A; 2WLI A; 4DR5 B; 4LFB B; 4JTA B; 1NR1 A; 1H2G A; 3ZHS A; 1E79 G; 1WJZ A; 1NQT A; 2P22 C; 3JAR A; 4LWS B; 5CB4 B; 1UPG A; 1GO3 F; 5L3B A; 4MTX A; 4K0K O; 4ICG A; 1EZJ A; 4JAU A; 4IIJ B; 3ZBH A; 2QWR B; 2XT9 A; 2IM9 A; 2LGW A; 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