The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
56
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sequence length |
140
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structure length |
140
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Chain Sequence |
LSPADKTNVKAAWGKVGAHAGEYGAEALERMFLSFPTTKTYFPHFDLSHGSAQVKGHGKKVADALTNAVAHVDDMPNALSALSDLHAHKLRVDPVNFKLLSHCLLVTLAAHLPAEFTPAVHASLDKFLASVSTVLTSKYR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen storage/transport
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| molecule keywords |
Hemoglobin alpha subunit
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| publication title |
1.25 a resolution crystal structures of human haemoglobin in the oxy, deoxy and carbonmonoxy forms.
pubmed doi rcsb |
| total genus |
56
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| structure length |
140
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| sequence length |
140
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2006-04-25 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2FRF A; 3OO5 B; 4TWU A; 4SDH A; 1VXB A; 1V4U B; 3WFW A; 6HBW A; 1ITH A; 5D5R A; 3ZJO A; 2HBD A; 1O1O B; 5ILR A; 1HGB B; 1I3E A; 1SPG B; 2LH3 A; 1RSE A; 3P5Q B; 1BZ0 A; 3QZZ A; 1YGF B; 1GDI A; 1BAB A; 2DN1 B; 4PQ6 A; 1NQP A; 3UI0 A; 1YIE B; 5B84 A; 1J40 B; 1S5Y B; 1RQ3 A; 1MOD A; 2H8D A; 5E6E A; 1Y01 B; 1ABS A; 1A01 A; 2VM0 A; 2W72 B; 3OZU A; 1HSY A; 1DO3 A; 2GLN A; 2HHB A; 2MGF A; 1EW6 A; 1A6G A; 3RJ6 A; 5SW7 A; 2OH9 A; 2RAO A; 1B86 B; 4F69 A; 1HDS B; 3UHV A; 3BJ2 A; 2Z8A A; 1O1M B; 2EVK A; 1J52 A; 4F4O A; 3KUN A; 4U8U D; 1LH1 A; 3NL7 B; 1THB A; 4ROL A; 4HRT B; 1LHS A; 1Y8I B; 2MGI A; 1C7C B; 1M9P B; 4LPI A; 2ZT0 A; 1NS9 A; 1MLS A; 1LFZ B; 2HBS A; 1N9H A; 2LH7 A; 3CY5 A; 4ESA B; 2MYD A; 3HXN A; 2BKM A; 3KMF C; 2MGH A; 1O1K A; 2G0Z A; 5E83 B; 3M3B A; 1EBT A; 2VRY A; 2QSP B; 4C44 A; 1QXE B; 3B75 B; 2H35 B; 2FRK X; 1MLM A; 3AT6 B; 1BVD A; 1HCO B; 3GOU A; 1NZ4 A; 4N7O A; 1Y4F A; 2ZLX A; 1JZL A; 2IN4 A; 1GDK A; 3PI8 A; 3ZJL A; 2PEG B; 3A59 A; 1G0B A; 1C7D A; 1GCW B; 1O1L A; 3WI8 A; 3NFE B; 4NK1 A; 1A3O B; 1MLQ A; 1MLL A; 3PIA B; 3QJB A; 1Y5F A; 1O1I B; 106M A; 3K8B A; 1MYI A; 1JEB B; 1FHJ B; 1HHO B; 1HBS B; 2ZFO C; 3IXF A; 2HBF A; 4FWX A; 4HRR A; 2ZT4 A; 3GYS A; 4O1T A; 1BIJ B; 2GL3 A; 4F6F A; 1SI4 B; 2ZS0 C; 5CN6 A; 5JDO D; 1IBE B; 3VRF A; 1R1Y A; 1YH9 B; 3CIU B; 4KN3 A; 3TM3 A; 1J7Y A; 2D2N B; 104M A; 1YEQ A; 1DLW A; 3QM9 A; 1MBD A; 1GCV B; 1HBR B; 1BZR A; 1RVW A; 2VLZ A; 1X9F B; 1CP0 A; 1DXU B; 1GZX B; 1UC3 A; 4YU4 A; 1M6M A; 1J41 A; 3WCW D; 4KJT A; 5CN8 A; 1A3N B; 2LHB A; 1GBV B; 3QM8 A; 2EVP A; 1MLO A; 1K0Y B; 1YEN A; 2G14 A; 1MBI A; 1Y0D B; 1FCS A; 1JP9 A; 1B0B A; 4ODC A; 1PMB A; 3ZJI A; 3NMM B; 1UT0 A; 1RTE A; 1HGC B; 4IRO A; 3FS4 B; 1PBX B; 3A5B A; 1NAZ A; 3UHZ A; 2Z6N B; 2ZLU B; 2NX0 A; 1I3D A; 2ZSO A; 4NK2 A; 1NZ2 A; 1Y0W A; 3WCV A; 1VXD A; 3D17 A; 4L2M A; 3O89 A; 1RQA B; 3WFT A; 2GNW A; 3ZJJ A; 2HBC B; 4XS0 B; 3ECZ A; 2ZST A; 2HZ3 A; 1MKO A; 1NS6 A; 2EB9 A; 4MQG A; 1Y8K B; 3WHM A; 1GBU A; 2E2Y A; 3E4N A; 1IT2 A; 3OO5 A; 2ZSN A; 3WTG B; 1XXT B; 1V4U A; 3MN0 A; 1R1X B; 3QJD B; 3AQ5 A; 2BLJ M; 5EQM A; 1O1O A; 4H0B A; 2ZT1 A; 3BJ3 B; 1HGB A; 1SPG A; 1RQ4 B; 3G53 A; 1HBH B; 1J7W B; 5HY8 B; 3MJP B; 1BZ1 A; 3P5Q A; 1YMB A; 3ZJP A; 4MQH A; 3UBV A; 2RI4 B; 1OR4 A; 2IG3 A; 1CG5 B; 2DN1 A; 1HBI A; 1YVQ B; 1X9F D; 1J40 A; 1S5Y A; 4MQJ B; 1JZM A; 3AT5 B; 2GRH A; 5HLU A; 1MYJ A; 1Y0A B; 2MGD A; 3WR1 B; 2ZWJ A; 5CN5 A; 1B86 A; 3ZJH A; 4AVD A; 2VLX A; 1MDN A; 1A00 B; 1T1N A; 5C6Y A; 1S5X B; 2ZFO B; 3VRE B; 1G09 A; 2W6Y A; 3NL7 A; 3MYN A; 3A5A A; 1Y8I A; 1C7C A; 1M9P A; 4C0N A; 2SPN A; 1LFZ A; 3DHR B; 3LR7 A; 5CNB A; 3A0G B; 1JL7 A; 2YRS B; 1MZ0 A; 4ESA A; 1A9W A; 4N7P B; 5E83 A; 2QSP A; 1QXE A; 2HCO B; 3B75 A; 3AT6 A; 1SHR A; 4MU5 A; 1LJW B; 1XQ5 B; 1JP6 A; 1HCO A; 1W92 A; 1CO8 A; 1YFF A; 1YVT B; 2G12 A; 2PEG A; 1KD2 B; 2H8F B; 1GCW A; 1N9I A; 2ZLW B; 1A3O A; 2OIF A; 3PIA A; 3QM6 A; 2QU0 B; 1O1I A; 5EU2 A; 2HBE B; 1G08 A; 3E5O A; 4HSX A; 4MAX A; 1HBS A; 3D1A B; 3D4X B; 1HGA B; 1V5H A; 2R80 A; 1NPG A; 4DC7 A; 5KER B; 1BIJ A; 2Z6S A; 1SI4 A; 2AUO A; 4UIQ A; 1FSL A; 1LH5 A; 2D5X A; 1IBE A; 3WCU C; 3LQD B; 3CIU A; 5CN9 A; 2V1E A; 3OGB A; 1Y4Q B; 2D2N A; 3ODQ B; 1MYG A; 2OHA A; 3GQG B; 2MGB A; 3QQR A; 1MOB A; 3HF4 B; 1GCV A; 1Y7C A; 1HBR A; 3UHT A; 3WCT A; 4NI0 B; 1YMA A; 1DXU A; 5JDO F; 4NI1 B; 5EE4 C; 2DXM A; 2EKT A; 1A3N A; 2M6Z B; 3HRW B; 1GBV A; 2G10 A; 1BZP A; 1K0Y A; 3GKT A; 4IT8 A; 4BJA A; 1MLU A; 1Y0D A; 2O5B X; 1VRF A; 4MQC B; 2B7H B; 2QSS B; 1HDB A; 2R50 A; 1GLI B; 2ZS0 D; 1HGC A; 4HHB B; 3FS4 A; 1PBX A; 2LH6 A; 2HHD B; 3BJ1 B; 3ARL A; 2Z6N A; 2ZLU A; 5F2A A; 1MOC A; 1CH3 A; 1VXF A; 3E55 A; 2D2M D; 1DTI A; 1UVX A; 2MB5 A; 3LB4 A; 3M3A A; 1Y31 A; 3D1K A; 5CNG A; 3UH3 A; 1RQA A; 2ZS1 D; 2HBC A; 2DHB A; 2ZFB B; 4H2L B; 4ROM B; 1CG8 B; 4U8U B; 1N9X A; 1DXC A; 1Y8K A; 2CMM A; 1MOA A; 2VEB A; 3GQR B; 4VHB A; 4G51 B; 3WTG A; 1XXT A; 1Y4B A; 3LB1 A; 3IA3 B; 1S0H B; 1CMY B; 3ZOM A; 3DR9 A; 1CH9 A; 3BJ3 A; 1LA6 B; 1Y8W A; 3SDH A; 3VRG A; 3DUT B; 103M A; 1RQ4 A; 1J7W A; 5HY8 A; 1LFL B; 2BWH A; 3BA2 A; 1NWI A; 2D6C A; 1KFR A; 1CG5 A; 1Y7Z B; 2XKG A; 1WMU B; 2HZ2 A; 2NRM A; 3KMF A; 1YE0 B; 5C6E B; 3ONZ A; 2HBG A; 3AT5 A; 1Y8H B; 3EOK B; 3ZJN A; 1FDH G; 2MHB B; 1YHU D; 1YEO B; 1Y0A A; 1H97 A; 3MVC A; 2DN3 A; 1ABY B; 2XKI A; 3WR1 A; 2NSR A; 1Y7G B; 3GDJ B; 1YEU B; 2ZLT B; 1JW8 A; 5CNE A; 1TU9 A; 4L7Y B; 4M4B B; 5HAV A; 1YOI A; 3KUO A; 2SPL A; 1QXD A; 5KKK A; 1A00 A; 1A4F B; 5M3S A; 3UGY A; 1QSH A; 2NRL A; 2OHB A; 3GLN A; 2O5M X; 5EYS A; 5HU6 B; 1S5X A; 1HBB B; 1V9Q A; 2ZFO A; 1GVH A; 3QM5 A; 1ABW A; 3MBA A; 1QI8 B; 1ECO A; 4UZV A; 1Y22 B; 3ECX A; 1MTK A; 5F0B A; 4HSW A; 2GRZ A; 3OVU C; 3A0G A; 2YRS A; 4N7P A; 1OUU B; 1A6N A; 2GDM A; 1DO7 A; 1OJ6 A; 4MBN A; 2VYZ A; 3WCW B; 1ECN A; 1CQX A; 1LJW A; 1XQ5 A; 1LFT A; 1X3K A; 1DWR A; 1CIK A; 1YVT A; 1JF4 A; 1XZ2 A; 3UBC A; 2QFN A; 1KD2 A; 2V1F A; 2ZLV B; 3QZX A; 2O5S X; 3K9Z A; 2QU0 A; 4UUR A; 2HBE A; 1H1X A; 4YU3 B; 1Y35 A; 3D1A A; 3D4X A; 1HGA A; 2JHO A; 2C0K A; 107M A; 1MWD A; 4MXL A; 2D5Z B; 5KER A; 1J3Y B; 1MNJ A; 1JDO A; 1XZU A; 2BK9 A; 1CH4 A; 4G1V A; 1NZ3 A; 4B3W A; 1TES A; 1Y4Q A; 2MGL A; 3ODQ A; 3WCP B; 3GQG A; 2FAM A; 1Y09 B; 2Z85 A; 1CPW A; 1QSI A; 4NI0 A; 3LHB A; 1LH2 A; 5HLQ A; 4WCH D; 1F65 A; 1RPS A; 3GQP B; 2HHE B; 3UHK A; 2MGM A; 1BZZ A; 2MYB A; 2W6V B; 4TYX A; 5IKS A; 3QJC B; 3M39 A; 5CHR A; 1VXG A; 4B4Y A; 1MLF A; 4MPM A; 1UVY A; 1Y83 B; 5EUI B; 2MGG A; 2D2M C; 1Y85 A; 4FWY A; 3S65 B; 1M6C A; 2VYW A; 4MQC A; 2B7H A; 2QSS A; 3UHH A; 1GLI A; 4OOD A; 109M A; 3WCU D; 4HHB A; 2ZS1 C; 3G4Y A; 1LTW A; 2HHD A; 3BJ1 A; 3UHG A; 1XZ7 B; 1BUW B; 2ZSP A; 1S56 A; 1IOP A; 1VXA A; 3UHR A; 1A0U A; 1NIH B; 1CP5 A; 3QJE A; 2ZFB A; 1SDL B; 4H2L A; 5EE4 D; 4ROM A; 1CG8 A; 2ZT3 A; 1J3Z B; 4U8U A; 2AA1 B; 1DXV A; 2QLS B; 4MQI B; 3S1I A; 3GQR A; 3O7N A; 3PEL B; 4F68 A; 4G51 A; 2V1G A; 1V4W B; 3LR9 A; 1O1N A; 1S0H A; 1CMY A; 3PI1 A; 1MTJ A; 1LFL A; 1YHU C; 3EDB A; 6HBI A; 1VXC A; 1QPW B; 4FC3 B; 1IRD B; 5E29 A; 1Y7Z A; 3A9M A; 4N8T B; 1YMC A; 1V75 B; 2LH2 A; 1YE0 A; 1A0Z B; 1C40 B; 5C6E A; 1XZV B; 4F6D A; 2EKU A; 1Y8H A; 1LFV B; 2MHB A; 1AZI A; 2DN2 B; 1YEO A; 1XZ5 B; 1DXD A; 1ABY A; 3WFX A; 3OZW A; 3HEN A; 2GNV A; 1YZI B; 1S6A A; 3ZJM A; 1XZ4 B; 1YEU A; 2ZLT A; 3QQQ A; 4L7Y A; 3NG6 B; 4M4B A; 2ZSS A; 1YGF A; 1YE2 B; 3ZHW A; 1NGK A; 1MNH A; 1YHR B; 1BVC A; 1HBB A; 3UHY A; 1YIE A; 2ZSX A; 4F6B A; 2G0X A; 4X0L B; 1QI8 A; 1WVP A; 1YG5 B; 2W72 A; 4MBA A; 4F6J A; 1Y22 A; 1AJG A; 2ZSZ A; 1SWM A; 3GK9 A; 1DM1 A; 3BOM B; 5EOH A; 1OUU A; 1HDS A; 2BLH A; 1DKE B; 1FN3 B; 1O1M A; 3WCW A; 3AQ6 A; 1CH1 A; 1Y2Z B; 1Y4R B; 1EMY A; 3AG0 A; 1URV A; 5D1V A; 1Y4G B; 1HAC B; 3ZOL A; 2WY4 A; 2R4Z A; 1BZ0 B; 4HRT A; 5MBA A; 1BBB B; 1MLH A; 1XCH A; 1A6K A; 2GKM A; 4YU3 A; 2ZS0 B; 4JYQ A; 1OUT B; 3MYM A; 4F6G A; 2QRW A; 3S66 B; 1HJT A; 5JGG B; 1CBL A; 1A01 B; 2H35 A; 2V1H A; 2D5Z A; 1ASH A; 2D2M B; 2HHB B; 4JAC A; 3UHC A; 3TM9 A; 3ORD A; 3NFE A; 5CMV A; 3U3E A; 3D7O B; 3UHI A; 2ZS1 B; 3VHB A; 3WCP A; 4H07 A; 1MNK A; 1J3F A; 1JEB A; 1FHJ A; 1HHO A; 1Y09 A; 4WJG 1; 4F6I A; 2BNL A; 4N7N B; 3LB3 A; 2VLY A; 3PI3 A; 2R4W A; 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3EDA A; 1YE2 A; 2RI4 A; 2MBW A; 1YHR A; 3WCT C; 1GDJ A; 1YVQ A; 1MLK A; 3E5I A; 3DHT B; 1MBA A; 3D17 B; 4MQJ A; 4X0L A; 3G46 A; 105M A; 1YG5 A; 3IC0 B; 3NML A; 1LHT A; 2W6X A; 1DXT B; 1X46 A; 3GKV B; 1DO4 A; 1MKO B; 3AQ9 A; 3SDN A; 3WHM B; 3BOM A; 2BLI A; 111M A; 1DKE A; 1FN3 A; 2VHB A; 1GJN A; 5ILP A; 1F5P A; 1Y2Z A; 3OO4 B; 1Y4R A; 4O4T A; 1K1K B; 3VRE A; 1Y4G A; 1HAC A; 2GTL C; 1Y0T B; 3R0G A; 1YCB A; 2MYC A; 2KSC A; 1HBG A; 1Y0C B; 1BZ1 B; 3IC2 B; 1BBB A; 2V1J A; 4MQH B; 4FH7 A; 4ZVA A; 3DHR A; 3ASE A; 1HDA B; 1XY0 B; 2HZ1 A; 2ZS0 A; 3UH5 A; 1OUT A; 3BCQ B; 4NZI A; 3WCU B; 1FAW B; 3S66 A; 2HCO A; 5JGG A; 1MWB A; 2XYK A; 1YGD B; 1YDZ B; 2D2M A; 1N9F A; 1O1J B; 2OH8 A; 4O2G A; 2H8F A; 3HYU B; 2WTH A; 2GRF A; 2ZLW A; 3D7O A; 2ZS1 A; 1EWA A; 2ZSR A; 2XKH A; 3H57 A; 1T1N B; 3HC9 A; 2ZT2 A; 3PI4 A; 2MYE A; 2NSS A; 3HEP A; 1G09 B; 3AQ7 A; 4KMW A; 5HLX A; 4N7N A; 1C7B B; 1XYE B; 3G4V A; 1MLJ A; 3PI9 B; 5HBI A; 1J7S B; 2AUP A; 3G4R A; 3ED9 A; 3WCV D; 3R5I A; 1VWT B; 1COH B; 3LQD A; 5KDQ B; 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