The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
18
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sequence length |
85
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structure length |
85
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Chain Sequence |
GSSGSSGDREREQHKREEAIQNFKALLSDMVRSSDVSWSDTRRTLRKDHRWESGSLLEREEKEKLFNEHIEALTKKKRESGPSSG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Transcription
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| molecule keywords |
Transcription elongation regulator 1
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| publication title |
Solution structure of the fourth FF domain of human transcription factor CA150
rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
18
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| structure length |
85
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| sequence length |
85
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2006-04-28 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF01846 | FF | FF domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Arc Repressor Mutant, subunit A | FF domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4FQG A; 2DOF A; 2DOD A; 2KFD A; 2KZG A; 1UZC A; 2B7E A; 2CQN A; 2KIS A; 2JUC A; 2LKS A; 2KIQ A; 2E71 A; 2DOE A; 2K85 A; 2L9V A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4HNV A; 1BBY A; 2FF4 A; 4BU2 A; 2NS0 A; 1WJC A; 2QEX I; 5CVU A; 2E5N A; 1DU6 A; 4OOI A; 4I98 B; 2Q2E B; 5IP6 A; 5D4R A; 1JJ6 C; 1OCZ H; 1B4A A; 4KIG A; 4CH7 A; 4M9X A; 2FE3 A; 2HTJ A; 2VI6 A; 2CMP A; 3R0J A; 3L2Q A; 2WC2 A; 3ULQ B; 2F6C A; 4BHB A; 2B0L A; 4WWC A; 1N77 A; 1V55 H; 4XLP F; 5H2F C; 2W00 A; 2ZXW H; 4RDU A; 4N0B A; 2EIK H; 3TKY A; 1A31 A; 2FXA A; 4R79 A; 4FX4 A; 3F6O A; 5CJ9 A; 2ZJQ F; 1X2N A; 3G2B A; 2VB6 A; 2DA5 A; 5EG0 A; 1BIB A; 5AIQ A; 1AKH A; 4AIH A; 5FKN A; 3OYE A; 1HDP A; 4NC7 A; 1ZYR F; 4BE1 A; 3GTK J; 5JR3 A; 3CCJ I; 4HF1 A; 3Q0W A; 3QRF F; 1R1T A; 2GIZ A; 3OSF A; 4BL0 B; 3S3O A; 2NVQ J; 2NS7 A; 5E18 F; 2FNP A; 3C2B A; 1Z1D A; 4D1Q A; 2OBP A; 5E79 C; 2DA3 A; 3PO2 J; 3QOD A; 1IN8 A; 3AL0 C; 4CCL A; 3HRU A; 3TOA A; 4GYI A; 3RZO J; 3CCV I; 2NNN A; 2CS3 A; 2W1O A; 3ZR8 X; 4ZYG A; 4CCK A; 5J3L A; 3LSK A; 4I0B A; 1USS A; 2F4M B; 5FD6 A; 3BG5 A; 4DNC A; 5KHD A; 2HFH A; 1VTN C; 2UV1 A; 1ETY A; 3CMM A; 1OPC A; 3TGN A; 2CFO A; 3OV8 A; 3K1M A; 3OYL A; 5IYD J; 5FFX A; 1G8X A; 4YEL A; 4HQM A; 3DXJ F; 2XC7 A; 1UHM A; 1FYK A; 1T33 A; 3BR1 A; 3IKV A; 4M3E A; 1YJN I; 4IRG A; 4RS8 A; 2RKH A; 5A2Q Z; 3HOY J; 3OMY A; 2HGC A; 2XRL A; 4MLO A; 5JVG F; 2FMY A; 3M1E A; 3VSK A; 2OCE A; 1I3A A; 2R7Z J; 3C3W A; 1HLV A; 1YRN A; 2LRD A; 1GDT A; 1B8I B; 4V2G A; 4KDP A; 5FLM J; 4CYD A; 4G6D A; 3ZRG A; 4XL9 A; 4X1E A; 1ZEL A; 1UZC A; 4NB5 A; 4ZYA A; 2VQC A; 3VDX A; 2VE8 A; 2KLO A; 4XLC A; 3OSG A; 2BE5 F; 4A5N A; 4D7M A; 3CCU I; 3AG3 H; 4XKV A; 1W4M A; 4QPQ A; 3DBL B; 3MVP A; 5ED4 A; 4ETS A; 3CO6 C; 3KP3 A; 2KKO A; 1LKX A; 4M73 A; 5F04 A; 3E3V A; 4ZZD A; 4Y4R A; 2QA4 I; 3ZCO A; 2ZSH B; 2DQR A; 4BHC A; 5GTI C; 5C3E J; 1SVM A; 1R22 A; 3KET A; 2AS5 F; 3DU6 A; 3OR1 C; 2NNY A; 5DCF A; 2CQ7 A; 4NDL A; 2H8R A; 2FSW A; 4E7S A; 3CMY A; 3K70 C; 5LHH A; 3S15 J; 3OYM A; 1PUF A; 1NHA A; 4BXU A; 1ETQ A; 1HA8 A; 3RKY A; 2X85 A; 3OIP A; 3PIO F; 4JYK A; 2BXZ A; 2LBF A; 2MC3 A; 3EPZ A; 1FBU A; 3GCM A; 2NVT J; 2L7M P; 4A2U A; 2MH2 A; 4D9J A; 1ZTR A; 3LL7 A; 2W7N A; 1NTC A; 1B9M A; 2EQR A; 2CV0 A; 1OKR A; 2Z9O A; 2RVC A; 1KZH A; 2IGN A; 2NXN B; 5EGO B; 4ESB A; 4DYC A; 1U9O A; 2ZO4 A; 3HHG A; 2F5C A; 3WTS C; 3E6C C; 1IO2 A; 1EH6 A; 1IXS B; 3NWT A; 3OL4 A; 4HDV A; 3RCO A; 4L0Z B; 3FK7 A; 4MQV A; 2YS9 A; 2FEZ A; 1IRG A; 4NHJ A; 4ZZL A; 1ODD A; 3WE3 A; 4M6V A; 2BY3 A; 4B8X A; 2RQQ A; 2LP0 A; 2PJR B; 3ZQQ A; 2EPF A; 1D0Y A; 2LK2 A; 1KGS A; 3DWL E; 1CF7 B; 1V5F A; 5CQG A; 4EJU A; 1ERD A; 1FZP B; 4IQJ A; 2CO5 A; 2L54 A; 1SAN A; 2JA6 J; 4AC0 A; 1MDM A; 1VQM I; 2MBF A; 3JTH A; 4IZZ A; 1XGM A; 2DAO A; 3CC4 I; 2X1D A; 3RDI A; 4CUG A; 1P9Q C; 2JSC A; 2R7O A; 4MEX F; 2R5Y B; 4UB8 C; 2KIU A; 2LNB A; 3OIQ A; 1I1S A; 2BHZ A; 3ASN H; 2VON A; 2G0E A; 2QQA A; 3DV8 A; 3JCU C; 3NRV A; 2BOL A; 1OYI A; 1FYM A; 5EJC A; 2R7R A; 1MNE A; 1LQ1 A; 1X1P A; 1VQ8 I; 3WE2 A; 2DFI A; 3BTI A; 1FP2 A; 2F5D A; 2DFE A; 2Y30 A; 1U8R A; 2WY7 Q; 3KP6 A; 3BZ6 A; 2VJI A; 4XN3 A; 1IGN A; 1QHG A; 4KFC A; 1XGO A; 3OS0 A; 4HRI A; 2J5O A; 3TL4 X; 2HEO A; 4ASN A; 3CJN A; 1N75 A; 3KLN A; 4ENN A; 1EH7 A; 1VFC A; 4OMY A; 4ZYH A; 2MA3 A; 4M9S A; 1K78 A; 2Q1Z B; 3ZMS A; 2E2H J; 1ORK A; 4BJ6 C; 4EM0 B; 3O3K A; 2QSH X; 1YJW I; 2QGU A; 2AXL A; 5DCM B; 4S04 A; 3M9A A; 4Y17 A; 4XQF A; 3D5R C; 5GAD J; 2M0C A; 2M7B A; 4IHT A; 3A0H C; 4CDG A; 5FLV A; 2VOD A; 3VB2 A; 4YRV A; 3OYJ A; 3WTZ A; 1UJ8 A; 3EUK L; 3M8E A; 2P81 A; 3KP2 A; 2QBY B; 3K1P A; 3REO A; 1ETK A; 3GLL A; 5DUK A; 1BI0 A; 2A69 F; 3JRB A; 1QPI A; 4LK0 F; 4M71 A; 1Y8R B; 1OR7 A; 3K70 D; 5ICE A; 2ELK A; 3AL0 B; 1VZ0 A; 4EQQ A; 2ZME B; 1RUN A; 1WJ5 A; 2B7E A; 4XRF A; 3EUH C; 5DUI A; 3C7J A; 1K79 A; 2JVH A; 2C6Y A; 1GXP A; 1IRX A; 4CYC B; 3OS2 A; 1BW5 A; 4BEH A; 3HBL A; 1HXD A; 3R61 A; 2HQ5 A; 2HWV A; 4F52 A; 1YHQ I; 5HNH A; 2O8K A; 2HDD A; 4V19 K; 3TMO A; 3BG6 A; 1O7L A; 1UEL B; 3BP8 A; 4P5O A; 5M5Y J; 2K40 A; 4ZTF A; 3I55 I; 2Q0O A; 1B72 A; 5DDG A; 3TQN A; 5K5Q A; 4ZC3 A; 3CLO A; 1MGT A; 1DDN A; 1P4X A; 3HG9 A; 5HNF A; 1VQ5 I; 2N8G A; 3ECH A; 1I5Z A; 1MKM A; 4A3F J; 2I10 A; 4ZJZ A; 4CZC A; 4ESF A; 1SMT A; 4BY1 J; 4XLE A; 4AIK A; 4XSZ F; 2ZJP F; 2HU9 A; 4Y13 A; 3ZMV A; 4FIS A; 4EJV A; 1RKT A; 4C2T A; 3E5U A; 5LFA A; 2E2J J; 3BR0 A; 5LD2 C; 2EIM H; 1IDZ A; 2VUM J; 5EG0 B; 1YW9 A; 1AKH B; 4C2U A; 4A3K J; 2ZSI B; 4KIB A; 4EAT A; 2HOT A; 2W84 A; 4FAS D; 4GXO A; 3CZ6 A; 5BMZ A; 1EA3 A; 1YIJ I; 1XMX A; 3RZD J; 2BGC A; 3K2Z A; 5CVJ A; 4MTE A; 3Q5F A; 4Q47 A; 3O2P E; 2H27 A; 4BJT A; 5BQT A; 4HQE A; 2RDP A; 1QBJ A; 1OR7 C; 4IJA A; 4M3D A; 5JHF A; 4ZYD A; 2G7U A; 4R8H A; 3CC2 I; 1Y6I A; 2E1N A; 1HBX G; 3VPR A; 2DOD A; 2A68 F; 4PFO A; 4KIS A; 4LJZ F; 1V54 H; 1X3Z B; 5JHU A; 1IUY A; 2P7C B; 1S29 A; 2IS2 A; 1I3Q J; 1M1E B; 3GW2 A; 3WG7 H; 5FO5 A; 1QZZ A; 3QP5 A; 2VBX A; 2RNG A; 3KP7 A; 2V4J C; 3OOU A; 3G1M A; 3L1P A; 1D3Y A; 1NG6 A; 1TW2 A; 2A6H F; 2H94 A; 2IAI A; 1ZK8 A; 3CCQ I; 1SFK A; 2KIQ A; 4C3I J; 1FEX A; 2V6C A; 2PEX A; 4BBS J; 2QQB A; 4Y33 A; 1IAW A; 4UVC A; 1J75 A; 2ZBK A; 1SEU A; 2IBD A; 3FXK A; 3MAJ A; 4ZYE A; 4BJ5 C; 2E60 A; 1W0T A; 1REP C; 1EJ9 A; 5E1X A; 2WAE A; 2X48 A; 1YRN B; 2M0M A; 5F08 A; 3FK6 A; 2E1M B; 3ZMT A; 1OQY A; 1HW2 A; 2HDC A; 1VQ4 I; 2M2E A; 3K7A J; 5D4S A; 5DV5 A; 4HA8 A; 1QZY A; 3CCY A; 3P7N A; 4C3H J; 4Y7N J; 1XGS A; 2R3S A; 4J19 A; 2EZH A; 3FIS A; 4UXN A; 4LIU A; 3WU1 B; 4JX5 A; 2LD5 A; 4BNC A; 1BI3 A; 2CV1 A; 3TDZ C; 3A4C A; 1ZH5 A; 4HLX A; 5GAG J; 2XV4 S; 2Z3Y A; 2XIG A; 1JKP C; 4XK4 A; 5D5X B; 3BT9 A; 3GLX A; 5CKT A; 3IH4 A; 3O8H A; 2L9V A; 1TWC J; 3K10 A; 3LA2 A; 4X6A J; 3M8F A; 3JRI A; 1HQC A; 4FE7 A; 2IXS A; 2JZY A; 5L3F A; 3UR3 C; 3HRM A; 1UG0 A; 5FFZ A; 2WAQ A; 3GTQ J; 1ZN2 A; 4MFD A; 4WF2 A; 4XMY A; 3KYL A; 5C4J J; 5HOO A; 1ETX A; 2EFP A; 2VPR A; 4MO7 A; 4V2F A; 3HOS A; 4XOP A; 2XGD A; 3BY6 A; 2BXY A; 2M9H A; 3L00 A; 3H0D A; 1PUF B; 2EZL A; 3IWF A; 4U7B A; 2XAS A; 4PGH A; 3RSN A; 5C4X J; 2DA2 A; 2VT3 A; 2BYV E; 2LBF B; 1RZ4 A; 4KMU X; 1OCP A; 1XDS A; 1J59 A; 2E2I J; 2V1N A; 5E1W A; 1TNT A; 1XMK A; 2L7K A; 4N9I A; 3A02 A; 3SQN A; 2D5V A; 2MC4 A; 4XON A; 3JRF A; 3LAJ A; 3N4M A; 2ZFU A; 4FET A; 2MYS A; 1QGP A; 2F2E A; 2Y69 H; 2VKE A; 3OOP A; 4IOC F; 1JT6 A; 2XAH A; 1OLT A; 2F4I A; 3OIO A; 2V7F A; 3LSH A; 2OQG A; 1BIA A; 3IC7 A; 2BZT A; 5J40 A; 2XPV A; 2DMU A; 3WHB A; 3WGI A; 2L4A A; 4L5I A; 1E2X A; 1E0E A; 3CUQ A; 4BDY A; 4UV8 A; 3G71 I; 3LFK A; 2H6C A; 2WAQ N; 3I53 A; 4EM2 A; 1XB4 A; 2FU4 A; 2VQL A; 3IAM 2; 4P55 A; 4M74 A; 3DFG A; 4XBF A; 2MLK A; 3K4N A; 1ZG1 A; 3AG2 H; 1UG2 A; 3A0B C; 1HOM A; 2JK3 A; 1FT9 A; 9ANT A; 2ISZ A; 1FTT A; 5LEK A; 1ZRC A; 2K4B A; 3HOU J; 2M8G X; 3BZK A; 3CJR B; 2EJR A; 2K7L A; 4IPA A; 2PJP A; 3PNV A; 1WH5 A; 1MDM B; 4DBR A; 2V1X A; 1SD5 A; 2CUJ A; 2KRH A; 4I6Z A; 3E1S A; 3CJQ B; 4YEJ A; 4AVZ A; 4CIC A; 1WJF A; 3WOD F; 4CXF A; 1YIT I; 4CCM A; 3KZI C; 3QYE A; 4RA2 A; 2HI3 A; 2KIF A; 1HKS A; 2IGM A; 1LVK A; 4M3F A; 5KVR A; 1X3W B; 2EFN A; 2EIN H; 3U1D A; 2XGE A; 2R7S A; 4O6J A; 3SZT A; 4U7D A; 1MSE C; 2YU9 J; 4KMF A; 1K4S A; 1N78 A; 1FLI A; 1YS6 A; 1WPK A; 1Z6R A; 1VQK I; 2DN0 A; 1Z7L A; 3LSI A; 3ISP A; 1R71 A; 5IT3 A; 3HPH A; 2ZCW A; 1T98 A; 1MBE A; 3ECO A; 4MTD A; 3U1K A; 4CCJ A; 3FIW A; 5DM6 F; 1SFO J; 2IA2 A; 4PJN A; 3VYT B; 2OTJ I; 2NRA C; 2VT2 A; 2VKD A; 1IXR C; 3P9C A; 5LGT A; 4CO8 A; 1K78 B; 2ZNZ A; 1KYZ A; 1D0Z A; 3ABL H; 3QQA A; 3CLQ A; 4F55 A; 1Z05 A; 4XKW A; 2LTP A; 3I64 A; 3ZQ7 A; 2EWN A; 2FJ1 A; 1U78 A; 2Z16 A; 1O57 A; 3KLO A; 3PUB A; 3FKI J; 5LEJ A; 1YO5 C; 4NNJ A; 3HXL A; 4CSW A; 3ABK H; 1MMN A; 1F36 A; 1AU7 A; 2FBH A; 4EJW A; 4P9F A; 3KIO A; 5M3M J; 3F3X A; 3R4K A; 3TO9 A; 1G6N A; 3DKY A; 1YG2 A; 2QVO A; 4IHV A; 2A07 F; 3IV5 A; 3BJA A; 1A35 A; 1GHC A; 2DXI A; 4A3G J; 2GOX B; 1YI2 I; 2A05 A; 3CUO A; 3H9J A; 2NYX A; 2ESN A; 2OU2 A; 1ZRE A; 4BEH B; 1E17 A; 5LRS A; 3OYB A; 2X4H A; 4HX8 A; 2K4J A; 4KIT B; 3F8F A; 2L01 A; 4BQO A; 3T1B A; 1ZGW A; 4MEY F; 2D45 A; 3BQY A; 1MND A; 4BYY A; 4HX4 A; 1XS9 A; 4ABZ A; 5E8G A; 2DOA A; 4LGW A; 1B72 B; 5TRD A; 4A6D A; 3N97 A; 4J01 A; 3H92 A; 4IKF A; 5FJ8 J; 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3R6S A; 3OYH A; 2G7H A; 3ONQ A; 1QRY A; 5BS6 A; 4QTR A; 3GME A; 1ETV A; 3JRG A; 3DLA A; 5TJJ A; 2RQP A; 2XF7 A; 2WTE A; 3TP3 A; 2LDU A; 4I02 A; 1XC5 A; 3GTJ J; 3D1N I; 3MZH A; 1PP7 U; 4RAF A; 3HRT A; 2ECB A; 2DDB A; 3OYG A; 2GWR A; 1Z21 A; 2GQQ A; 2RV8 A; 3QPT A; 4YFK F; 2Y9Y A; 3HKZ A; 4XN0 A; 3JRH A; 2MGQ A; 4UUS A; 1MBJ A; 3DQV C; 1BJZ A; 1PDN C; 1KON A; 1MNM C; 2MSY A; 1WFX A; 2JVG A; 1V5G A; 4ENJ A; 3EET A; 1TWG J; 1ZKG A; 4DYR A; 2QKL B; 4I99 C; 2DMT A; 3BTL A; 5D8K B; 1IV8 A; 1DP7 P; 3FXJ A; 4MIM A; 2YX4 A; 3RJP A; 3HOV J; 3BPX A; 4HLY A; 4AM3 A; 3DBH B; 4OAZ A; 2PG4 A; 2IS4 A; 4EV0 A; 3CF2 A; 4HEA 2; 2ZJR F; 4L5E A; 1R00 A; 3ABM H; 3D5S C; 1LDJ A; 1IF1 A; 1YE9 A; 2LKP A; 5ERI A; 4BE2 A; 2O6G E; 1DPR A; 1C0W A; 1WZ2 A; 1YLF A; 2LFB A; 3HIF A; 3LSG A; 3KEY A; 4KUM A; 1IG7 A; 4F92 B; 3CCS I; 4F7Z A; 4G7H F; 1R1U A; 4E7K A; 4BXX J; 1Z7U A; 3L9F A; 4M3G A; 2VAS A; 5BPD A; 4CZZ A; 4I7H A; 4TV7 A; 4QPO A; 3QOE A; 1NK3 P; 1U5T A; 5ILV A; 3S1M J; 4NQW A; 3BCB A; 2VLA A; 1IC8 A; 4RBO A; 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