2DSUA

Binding of chitin-like polysaccharide to protective signalling factor: crystal structure of the complex formed between signalling protein from sheep (sps-40) with a tetrasaccharide at 2.2 a resolution
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
361
structure length
361
Chain Sequence
YKLICYYTSWSQYREGDGSCFPDAIDPFLCTHVIYSFANISNNEIDTWEWNDVTLYDTLNTLKNRNPKLKTLLSVGGWNFGPERFSAIASKTQSRRTFIKSVPPFLRTHGFDGLDLAWLYPGRRDKRHLTTLVKEMKAEFIREAQAGTEQLLLSAAVSAGKIAIDRGYDIAQISRHLDFISLLTYDFHGAWRQTVGHHSPLFAGNEDASSRFSNADYAVSYMLRLGAPANKLVMGIPTFGRSFTLASSKTDVGAPVSGPGVPGRFTKEKGILAYYEICDFLHGATTHRFRDQQVPYATKGNQWVAYDDQESVKNKARYLKNRQLAGAMVWALDLDDFRGTFCGQNLTFPLTSAVKDVLAEV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Signaling protein
molecule keywords Chitinase-3-like protein 1
publication title Carbohydrate binding properties and carbohydrate induced conformational switch in sheep secretory glycoprotein (SPS-40): crystal structures of four complexes of SPS-40 with chitin-like oligosaccharides
pubmed doi rcsb
total genus 120
structure length 361
sequence length 361
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-07-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 2dsuA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2dsuA01
1W9XA 5KZ6A 4MDPA 4AEEA 1NH6A 1GQKA 3EDDA 4QFUA 3GNRA 5FD0A 1OD8A 3PZMA 3BCDA 1TG7A 2PWHA 3TONA 4MAVA 3WDRA 1EGZA 4W7VA 1M7XA 1K9FA 2DEPA 1UKQA 1JF6A 1E0VA 1NWRA 3DYOA 4C7GA 1XSKA 1B9ZA 3CUFA 3CZLA 5GNZA 1LL7A 5D9MA 2XVKA 4UOJA 3BSHA 3WQ5A 2W67A 3EDEA 3GH7A 4LX4A 2WW5A 5BWFA 2XM1A 4JCMA 1X6NA 1MW2A 2YL6A 2PWDA 2VMFA 1R86A 3EMCA 2BVYA 2JEPA 3OZPA 2TAAA 2EPOA 2DGAA 1JZ8A 1UQZA 1H0GA 1NOFA 1ZBKA 3UCQA 3S6TA 1GVIA 4CD7A 1ESWA 3PZQA 1B3YA 4WLCA 7A3HA 4PYSA 3AICA 4HA4A 3L2LA 1E6RA 4TTGA 1J0ZA 4ACZA 3SCWA 2Z1KA 3J7HA 2WCGA 2WCAA 5EBAA 2OSXA 1QHPA 4X0VA 1Q6CA 1PX4A 5F7UA 2VVNA 3AIUA 1MW0A 1JF5A 3QOMA 4QLLA 1KBBA 4AWEA 5AY7A 4ZXOA 1ZU8A 2RGMA 2J75A 1H41A 3POCA 3W6LA 4MNMA 4HP5A 1UWIA 1W3LA 4JIEA 3WNMA 5IFPA 1QI0A 4W5UA 1JDAA 1G0CA 4HPHA 1EHAA 1W2VA 1JAKA 1W1VA 1VEPA 3AIEA 3CHDA 4LPCA 4NRSA 1KXVA 3EMQA 3LPGA 1GW1A 2A3BA 2CERA 5BRQA 2G3JA 3EDKA 1VFOA 1JG9A 4AISA 4PMRA 5A6JA 1W3KA 4WIWA 2VRKA 3CHFA 2YKKA 3M46A 3VGGA 3WQ6A 1WZKA 3K8KA 3LPOA 2XVGA 5HXMA 2WVTA 2VQUA 4WSJA 3FN9A 2JIWA 3W25A 1SYTA 3PZNA 3WEZA 4TOQA 2PWFA 5LA1A 2XM2A 3OLIA 1JZ6A 3GBDA 3W27A 2WC4A 2ZWYA 3AMLA 2ZXQA 4BCEA 4CU7A 4HPGA 1E4LA 1UD6A 3SUUA 1EOKA 3VINA 4E8CA 2VT0A 4XUYA 4GZIA 4MB5A 1QNQA 3WUEA 3ZJ8A 2CPUA 2EPMX 1DWHM 3W29A 3CGTA 1E4MM 4ML4A 3MSDA 1HJSA 4S3JA 2EPLX 5IHSA 1J12A 1C7TA 1V6VA 2VTFA 1WP6A 1XH0A 1BQCA 1E56A 3RM4A 3KL5A 3LMYA 1V03A 4CU8A 4U3AA 4CN1A 5A95A 3AYRA 2CETA 2J79A 1V6UA 1CXFA 3WD0A 3FXYA 1FP9A 2VCCA 5CPTA 1GNXA 1HL8A 1QNPA 1TFVA 3F5JA 3VKKA 4AIEA 2WZIA 3CIVA 3FHAA 3EDJA 1UH2A 3AXXA 3G6MA 1DWAM 1OD0A 3W81A 1CWYA 3ZR6A 4J7RA 1HP4A 1CZ1A 2NSXA 4H2CA 4WJXA 1HJQA 4AIUA 4XB3A 4KRUA 4HOZA 4JAWA 2ESCA 4J3SA 4CUCA 4HMEA 4B3LA 1UZ1A 1E15A 2ZUTA 2IXVA 1HN1A 3N18A 1UYQA 4OBSA 4HA3A 2WC7A 2J74A 3AS2A 4PMOA 4PSPA 4M81A 2QMKA 3MO4A 2WMFA 4OIFA 3WF3A 1UH4A 2D24A 2YL5A 1E5JA 2W62A 3RJXA 2WVVB 2O92A 4R27A 1NQ6A 5I0DA 4UZSA 3APGA 3WH6A 1OB0A 2J7HA 3WH8A 3AIWA 4BF7A 1DP0A 5BYWA 3OGVA 2OSWA 5CJ5A 2BV9A 4GI6A 2ZUMA 3PN8A 1J0JA 2JF7A 1XRVA 3BAWA 4LGXA 1W9PA 1J18A 2XHYA 4HZ6A 1B1YA 1VEOA 2WLZA 1CLVA 2J25A 2GDUA 5CSUA 1UOKA 1FA2A 4A3HA 2NT1A 2WZEA 4P7LA 3THCA 4AZ5A 1Q6GA 1R7OA 2YDRA 3ZOAA 1KXQA 4UQBA 1EDQA 1BTCA 1HJXA 3BAKA 4UQDA 2GVYA 3GXFA 3WF1A 3VGDA 3WF0A 1JAEA 1ITCA 4D6IA 2EPNA 1PBGA 1RPKA 1GONA 1S46A 2CHOA 1R7AA 7TAAA 2BVTA 5HPOA 1OIMA 2DT0A 2OLHA 3UR7A 3WF4A 1OIFA 3UEQA 2G4FA 4DM1A 1GHSA 4YPJA 3WH9A 3N1AA 3ARSA 5DMYA 2WMGA 1HF6A 3VGHA 4W89A 4PTMA 2E0PA 2DQXA 4YHEA 3T08A 4HOWA 3OG2A 3S2CA 4Q22A 5A6MA 4PMYA 1E6ZA 1HP5A 5CG0A 5FOOA 1KXTA 5LA0A 2W63A 3VGEA 1LLOA 5A8MA 1UWQA 3MANA 1ODZA 3CZEA 3AIRA 3CH9A 5EB8A 3SIMA 3RCNA 2CBUA 4D6GA 1CENA 4E4PA 4CD5A 1B3VA 5CQ1A 1U30A 5CXPA 4AD4A 3CTTA 1VIWA 4PSRA 1JZ5A 2E9MA 1A3HA 2DSVA 2WPGA 4TVUA 3RM8A 4U5IA 3N12A 3HU7A 4ZFMA 5A8NA 1JYVA 1H1NA 1NARA 4UZUA 1JNDA 4GI9A 1WKYA 1JI1A 1B0IA 2XPKA 1JYXA 3VIIA 3FAWA 1IT0A 3IANA 3HJEA 4M29A 3BAXA 2PI6A 1J0HA 5IDIA 3KZSA 1V3IA 3WMSA 3CZJA 1FFQA 3WF2A 1E71M 1LG2A 3VIGA 1BF2A 4CU6A 4MJ4A 5JIPA 2J7CA 4HU0A 5IHRA 4M56A 4U5KA 1WE5A 1CXIA 1TA3B 1MQQA 2BFGA 1BGAA 1UD5A 1OM0A 4WKHA 1UR9A 3AMKA 2G8ZA 1XD0A 5LA2A 2BHYA 1X1NA 3U7VA 4H8HA 3WQVA 5BXTA 1XH1A 4H8UA 2VCAA 4GKLA 4U33A 3VGFA 3AHXA 1D3CA 1TVPA 2NT0A 3OLDA 5CZKA 1W91A 3MU7A 5I23A 2XVLA 2OYMA 1BHGA 1E3XA 5HBFA 2GSJA 3WDHA 4QAWA 1ZB5A 2CEQA 1BFNA 4DUXA 3DYPA 5GPRA 3W4RA 3NDZA 2W91A 4OJYA 1UA3A 1P6WA 2JF6A 5IFTA 4QLKA 4FF5A 3VDCA 2AAAA 4OBRA 4AMCA 3ARUA 3N04A 3L4VA 1UA7A 1VFFA 1QW9A 1I1XA 1HVQA 3BLPX 5A6SA 5AYBA 1OGBA 1V3MA 1E6QM 3T2OA 1V02E 2J47A 4XZWA 2WMIB 1HJVA 4M24A 2DT1A 3CZGA 1VJZA 5A6KA 1R87A 3L4YA 1E4NA 1GORA 1W32A 1WDSA 1GQLA 2BY1A 3VIKA 4UFMA 3CUGA 4MJ2A 5CGMA 4PUDA 1PIGA 4PTWA 2UY3A 4FK9A 5I5RA 2XJ7A 2WHMA 3FAXA 1ISWA 1X6LA 4Z2KA 3VNYA 2DPEA 4F9DA 4MTVA 2YLAA 1MW1A 4MB4A 3B9DA 1JD7A 2Y24A 2X2YA 5A8QA 1AQ0A 1BYCA 2V3EA 1KBKA 3WQ8A 1R85A 4J3XA 1WDPA 3VUPA 3O6AA 4W84A 3UG3A 5IXEA 4P8VA 1SR0A 2D3LA 1E43A 3VD4A 1W1PA 2D0GA 2W5FA 2D1ZA 4CCCA 2WC3A 2X09A 2W61A 1EXPA 3IAPA 1EO7A 2EPKX 1W3HA 1KWKA 5E0FA 1EHNA 2O9RA 4RL3A 1QNRA 1FFRA 2Y4SA 3WNOA 3VM7A 2DSZA 3AI0A 4JZ5A 2GDVA 1UKOA 4PTXA 1E1FA 4CVUA 1KR0A 1UD2A 2J8FA 4TX6A 3VD5A 4EAMA 1US3A 2FGZA 1EDTA 3BMWA 4U31A 5ABFA 1GCYA 5HNNA 3NYDA 3ZMRA 4BQ4A 1GQIA 1K9TA 1WZAA 3CUIA 1NWTA 4CVWA 5E6ZA 3ARZA 4J3TA 5DEZA 3N13A 3PZUA 2V3DA 1SFSA 2D0FA 3ZJKA 2OYLA 1L0PA 1D2KA 3PZGA 2G41A 4YHGA 3CMGA 3BXWA 4P7NA 1GJUA 1ITXA 4H8VA 4AD3A 3UESA 1E4IA 2OWWA 1QPKA 1UWUA 4B16A 4OOUA 3MMUA 2GJXB 3SCTA 5KEZA 2DDXA 3AIVA 4TX8A 3K8MA 4TXEA 3VIOA 1C8XA 3MKKA 3CUJA 1FH7A 2D0HA 1E73M 1CGVA 3RILA 3U57A 4AZBA 1M01A 3GDBA 4JFTA 1EQPA 4HZ7A 4GPNA 4R5EA 1C3FA 3MV11 2J8GA 4TUFA 4H7VA 4J3VA 3KWXA 4JKMA 4BQ2A 5C71A 1US2A 1LF1A 1ODUA 1ISXA 1EA9C 1UD4A 3OZOA 4W87A 3GXDA 4KGLA 2D2OA 1VB9A 3DC0A 3OBAA 4W85A 5C8BB 3VDAA 1JNEA 1UWRA 2Z1SA 1KWGA 4DWSA 1FH8A 2VC9A 1WZMA 3WBEA 2DT2A 1E9LA 2WKLA 4GINA 1CGTA 2QPUA 2X0YA 3WUBA 3UERA 1GJWA 5BXSA 4M1RA 3WFLA 2WYSA 3D5HA 3WQWA 9CGTA 3PZTA 2WNWA 3W38A 3K8LA 3WD2A 4GZEA 4QCFA 2ZX6A 4AD1A 3AHTA 3F5KA 3RPMA 1BPLB 4XV0A 3ZT5A 4CD4A 4HU8A 2CESA 2ZIDA 1UKTA 1LWJA 3GXMA 3WNKA 1CGWA 1B3WA 2AMGA 4D6CA 2FHFA 1OGSA 4D1IA 3AYSA 2CNCA 1CXKA 4PMVA 1HXJA 2ZOXA 5AC4A 4F66A 3W53A 5AC5A 4UFLA 4ZE4A 2FH8A 5E9AA 3RIKA 2VJXA 4W86A 2CKSA 4BA0A 5D9NA 4RE4A 2WMHA 4GXPA 1B90A 2ZICA 3I3EA 5FIPA 5BCAA 4B3KA 5BXPA 3VX1A 4HMDA 2VVSA 3O2LA 8CGTA 3ZO9A 4A3YA 2A3HA 1ZS2A 2OWXA 5DO8A 2E9BA 3AFBA 3WFZA 1V02A 3MMDA 5A94A 8A3HA 1YHTA 2F8QA 3SUTA 3A47A 3AXIA 2QLYA 3BCFA 5BROA 2BY0A 4Z2LA 2YL9A 1B31A 3MUIA 3OGRA 4V27A 2E8YA 3L4XA 3TA9A 3L4UA 1QBBA 4M82A 1DWFM 3GXIA 2JEQA 4D6JA 4AY1A 1NP2A 3QOKA 1M53A 4H04A 1NM9A 3N15A 3DHUA 2DSUA 1GUVA 2BY2A 3THDA 1CYGA 1V0MA 1UR2A 2XYLA 3AMDA 2VZUA 1HKJA 2DT3A 2YIHA 1TUXA 1HX0A 4AZCB 2J7GA 1XYZA 1IZKA 6A3HA 5AYIA 2UY2A 1PPIA 3SUSA 3WDJA 1KB3A 1EDGA 1MFVA 2ZUVA 5I78A 4U2YA 1UUQA 1QI5A 2EBNA 4GQQA 2PF0A 2UY5A 3IJ8A 2WAGA 2PWGA 3M07A 1H11A 3L4ZA 1U33A 4L4PA 2YOCA 1I1WA 3BAIA 4GZJA 4Z2IA 2WWCA 4PUEA 1G01A 1JYWA 1XCXA 3CZ8A 3M7SA 3UG4A 4PCSA 1E40A 4V28A 1V3LA 4EANA 2X0HA 4D6DA 3U5YA 1C8YA 1JL8A 5M03A 1KQZA 3WD1A 5TD4A 3CPUA 3T0DA 3VIJA 1XSJA 2CBIA 2ZXDA 4YN5A 4E2OA 3VD3A 5HDRA 5A2CA 1XYFA 3FHQA 1V08A 1V3HA 4M8UA 5JH8A 1WCGA 2DSKA 2MANA 3CHEA 2C8NA 3KE0A 4WSKA 2ZUSA 3AJ7A 4EKJA 1OT1A 1BG4A 2FHCA 4JL2A 3WKZA 4HZ8A 1WO2A 1EO5A 1XH2A 2XWDA 4JFUA 1KGXA 3NIYA 1JDCA 1UR4A 2VX6A 1PEZA 2YJQA 4FLOA 1CECA 4JKKA 4IPLA 1E0XA 3W26A 2GK1B 2HVMA 4JHOA 1F4HA 1TCMA 3ZSTA 3WDPP 4UQEA 5E70A 4MADA 2BXZA 2VURA 4F9JA 3L4TA 3ZIZA 2WMKA 2VR4A 5ABEA 1UR0A 3IJ7A 3KL0A 1VENA 3BLKA 1H49A 2XSBA 2J7BA 1QI3A 1AQHA 3ARYA 4MNJA 2GUYA 3JUGA 2QHAA 1C93A 4M80A 1H4PA 1CDGA 1BYAA 2O9TA 3PTKA 2WCSA 2WWDA 1QVBA 3PTMA 4LYPA 2PBGA 2GJRA 3CO4A 3MSGA 3ARRA 4MNKA 2WSPA 2VRJA 4PMXA 1PZ2A 3SCRA 1WAWA 1GOQA 5I6SA 5A8OA 3EDFA 2WMJA 5FCZA 2E9LA 1Q6DA 1AMYA 3WMCA 3WNNA 5A6LA 3K1DA 3PZ9A 3ZR5A 4PBGA 1BVZA 4CD8A 1LQ0A 4IPNB 4DUWA 1UKPA 1J0IA 2A3CA 3MS8A 4P7QA 1J9YA 3KEHA 1Q6FA 3RMEA 2W66A 1E1EA 3U5UA 1J11A 1QNSA 3WY1A 2ZUNA 1H0IA 2YLLA 1G9HA 1BVNP 1LG1A 2QF8A 2WVVA 1V6YA 3N17A 2ZXAA 3VIPA 3AHVA 4X9YA 2V3GA 1JZ3A 3OGSA 2ZE0A 5FKYA 1EOMA 1IZJA 2G3MA 1QBAA 1DHKA 1WDRA 3WUFA 5ABGA 3AOFA 3TTYA 1MVYA 3PZVA 3TP4A 4HTYA 3A4WA 4HOXA 4AEFA 2JFEX 1W9UA 1ECEA 2XGBA 2O9PA 4GO9A 5JUVA 5JBEA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3VIL A;  2JE8 A;  2Q8X A;  2V5C A;  2WHL A;  4N42 A;  2VZV A;  2YA1 A;  1ZJB A;  1CNV A;  1RH9 A;  1UWS A;  1UHV A;  3WN6 A;  2PWE A;  2J4G A;  5M17 A;  2BY3 A;  1Z32 X;  4CKQ A;  1HJW A;  1DED A;  2CIP A;  4WKA A;  4TVD A;  4S3K A;  3SCU A;  3W6M A;  5D9P A;  1AQM A;  2WKG A;  4D6F A;  2VX5 A;  1W9B M;  3K4A A;  2WZH A;  3VX0 A;  3NCO A;  2DH2 A;  1KQY A;  3EBV A;  4CCD A;  5A2B A;  1PJ9 A;  1J10 A;  1CIU A;  1J01 A;  3AXH A;  2DH3 A;  4GQR A;  4DWS B;  1RP8 A;  3IJ9 A;  1HKK A;  5CPS A;  3DEC A;  3UR8 A;  1FOB A;  1KFW A;  2OSY A;  5A69 A;  3ALG A;  1VF8 A;  4WKF A;  1GOI A;  2IUZ A;  4LQ1 A;  1JIB A;  2JIE A;  2ZX9 A;  4UTF A;  4D71 A;  4OOZ A;  1M03 A;  4GO8 A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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