2DVJA

Phosphorylated crk-ii
Total Genus 17
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
17
sequence length
228
structure length
227
Chain Sequence
MAGNFDSEERSSWYWGRLSRQEAVALLQGQRHGVFLVRDSSTSPGDYVLSVSENSRVSHYIINSSGPRPPVPPSPAQPPPGVSPSRLRIGDQEFDSLPALLEFYKIHYLDTTTLIEPVSRSRQGSGVILRQEEAEYVRALFDFNGNDEEDLPFKKGDILRIRDKPEEQWWNAEDSEGKRGMIPVPYVEKYRPASASVSALIGGNQEGSHPQPLGGPEPGPAQPSVNT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Signaling protein
molecule keywords V-crk sarcoma virus CT10 oncogene homolog, isoform a
publication title Structural basis for the transforming activity of human cancer-related signaling adaptor protein CRK.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 17
structure length 227
sequence length 228
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-07-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00017 SH2 SH2 domain
A PF00018 SH3_1 SH3 domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.30.40 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 Domains 2dvjA02
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 2dvjA01
1A1AA 1RLPC 2EGCA 2OZOA 1JYRA 4JE4A 1KC2A 2LNHB 1W70A 1UFFA 1NM7A 5ECAA 2MOXA 3FJ5A 4ROJA 3IN8A 1FBZA 1UG1A 1YN8A 4H34A 3M0PA 1SPSA 1SPKA 2JYQA 1AOTF 2RN8A 2J7IA 1OO3A 1YP5A 2KT8A 1O48A 2MCNA 5IHNA 1U3OA 1A1CA 4EIKA 1K1ZA 1AOJA 1O4IA 3THKA 5DC0B 2JS2A 2H8HA 2K7AA 3VS2A 2CBLA 2FPEA 2SEMA 2EVRA 3BUWB 2Y1MA 2QDLA 1UDLA 3UF4A 3EHQA 1AOUF 1SEMA 5EC7A 2BZ8A 2J05A 4X1VA 3CXLA 1O41A 5IHKA 1LKLA 4RTTA 1A81A 4A63B 4OMPA 2IZVA 1FYNA 2AK5A 3CQTA 1GBRA 4OHLA 4U17A 5GJHA 4EIHA 2BBUA 1NYGA 3TSWA 4F17A 1O45A 2BTTA 2V1RA 1MV3A 2J6OA 3HHMB 4QSYA 4J9HA 2LP5A 5I11A 3IMDA 1CJ1A 2FPDA 5EHRA 1ZUYA 4JJDA 3NPFA 1SKJA 3EG3A 3NMZC 1SRMA 2ROTA 4LUEA 1PNJA 1BHFA 1JXOA 1X0NA 1ZUUA 2OJ2A 2LNWA 1AYBA 2IIMA 2RMXA 2EBPA 5GJWB 2D1XA 2DRKA 1K4US 2HSPA 1UJ0A 1M3BA 3M0SA 1WIEA 2YSXA 1BFIA 4IIOA 1OOTA 1ZFPE 2B3OA 2ETZA 1JWOA 2DLYA 2M0YA 1QKXA 1QLYA 1UHCA 4RTUA 4FL2A 1UTIA 4RTYA 1HCTB 2PLEA 1FBVA 1AVZC 4RTZA 4ZNXA 3U23A 1X6GA 3EG2A 1SHBA 3H41A 1K9AA 1QKWA 1KIKA 4LE9A 3N84A 2DBMA 2ED1A 1CKBA 2B86A 2SRCA 4ESRA 1O4PA 1M27A 1A1EA 4OHIA 2BZXA 2ENMA 2FRWA 4J9BA 4JPBW 2IUGA 2RF0A 1I07A 4OHDA 5I6VA 2EYZA 3BUNB 2DLPA 1SHAA 3MAZA 1O49A 2LMJA 1T3LA 1KA6A 4WCIA 1QWEA 1AZGB 5GJVB 2GTOA 3VROA 2RVFA 1A1BA 4A4CA 5IBMA 2DMOA 1TG0A 1YWPA 1WXUA 2M51A 4OMQA 2HDXA 1D1ZA 2YSQA 1NLPC 1NG2A 2IUIA 3PJPA 4M4ZA 2C9WA 4AFSC 2D8JA 5D0JA 3I5RA 2XP1A 1BHHB 1JYQA 4CC3A 1M3CA 1CWEA 1RUWA 2JXBA 2KR3A 1FYRA 2DYBA 1HCSB 4CC4B 1X43A 5IH2A 1BU1A 1O44A 3VS4A 4QT7A 4Z88A 1BHHA 4J9GA 4RTWA 4FL3A 4JJBA 2RPNA 2DRMA 1OPLA 5IXBA 4Z89A 1AWOA 1O4OA 3PS5A 1M30A 3VRRA 4HCKA 1UUEA 5L23A 3M7FA 2CRHA 3LH5A 1UHFA 1AWWA 2LJ1A 1SSHA 1ABQA 2HEQA 3PSKA 1IS0A 1EFNA 4GWFA 1BG1A 1XOVA 1CSZA 1R1PA 1BBZA 4D8KA 1LUMA 2L6KA 1FHSA 1PHTA 1WX6A 3GXWA 4JJCA 3I9QA 2SHPA 2F2VA 1B07A 2MC1A 2RQWA 1BM2A 1TCEA 3S8NA 2DILA 3VS3A 3JV3A 4J9EA 1PWTA 1MW4A 3PQZA 2H46E 4E68A 2EQIA 1OO4A 2DCRA 2JM8A 2JW4A 4J9IA 1X2KA 5FW9A 2EYVA 3TSZA 3HCKA 2ABLA 4AG2C 2GQIA 1IO6A 1VYVA 2VIFA 2L2PA 4J9CA 4ORZA 4JEGA 1O4NA 5DC9A 2OQ1A 3M0RA 4LNPA 1OV3A 3SEMA 1O4DA 2HBWA 1P13A 3S8LA 1RPYA 2C0OA 1NLOC 2V1QA 2EOBA 3REAB 4U1PA 3EAZA 1I0CA 2BZYA 2DM1A 1UGVA 1JU5C 2KEAA 2AOAA 5HKYA 4K2RA 1UE9A 1GCQA 3S9KA 1YNZA 1X27A 4CC2A 4Z8AA 5AXIA 2FCIA 4F5AA 2J6FA 1RQQC 2EKXA 1E6GA 1GCPA 3UATA 3RNJA 4HXJA 1ZX6A 1KSWA 1PICA 3I35A 2EPDA 4KRTA 2KXDA 2MRJA 2PTKA 2KGTA 3VS0A 1ZLMA 2KNBB 4J9FA 2X3WD 2PLDA 2AUGA 5I22A 3IQLA 1O4FA 1IJRA 4JGHA 1I3ZA 3VRNA 2ECDA 1NEGA 3PVQA 2Y3AB 2CUBA 2LNXA 2K3BA 4JZ3A 2GTJA 2HUWA 2JT4A 2D8HA 2GGRA 2PNBA 1D4WA 4K45A 4NWFA 5IXFA 3UA7A 1M61A 2CT3A 2YT6A 3OB1B 1GFDA 3VRPA 1BB9A 4GL9E 4X6SA 5HCKA 1U06A 3R6NA 2K9GA 3EG0A 3QWYA 1W1FA 3CD3A 5KAZA 2YU7A 2VVKA 3CWGA 5EELA 2CI9A 1O46A 1X6BA 2AZVA 2KRMA 2MK2A 1SHGA 1BKMA 1UECA 2W10A 1MUZA 2XMFA 1G2BA 5EEQA 2LZ6B 2QMSA 1ZBJA 1A07A 2H5KA 3CBLA 1JYUA 2LX7A 1O4AA 1TUDA 3ZNIA 4AFZC 3KFVA 1NZLA 2RMOA 1H9OA 5IHIA 3GQIB 1WXTA 2CUDA 4XZ0A 5GJIA 3O5ZA 4E6RA 1PKSA 1NZVA 1YVHA 4R0KA 2RQRA 3US4A 1ZUKA 2JMAA 4FBNA 2LQNA 2GSBA 2DJQA 3PFVA 2LQWA 4EY0A 2K79B 4RUGA 1LUKA 1YWOA 4OHEA 3PLFB 1E7OA 3EACA 1BF5A 1Y0MA 2A08A 1LUNA 3RBBB 1GBQA 4LUDA 2LCSA 1BKLA 2MQIA 3EHRA 1GHUA 1H3HA 4TZIA 1O4LA 2MIOA 1QWFA 2EO6A 1O4HA 3S8OA 1SRLA 1VA7A 1X2QA 2CT4A 4GLMA 1PRLC 1AD5A 1B3QA 1LCJA 1XA6A 5FWCA 1O4RA 2FO0A 2G6FX 1LUIA 2L3QA 3BUOB 5DC4A 2YUNA 1AB2A 1O42A 2L4KA 2OI3A 1FU5A 2KBTA 3C7IA 2EYYA 3EGUA 2KYBA 1LKKA 2FRYA 2EGEA 2A37A 2CREA 2RNAA 4K11A 3PE0A 1G83A 2HCKA 2DL7A 1M27C 2NWMA 3TVTA 1X6CA 3T04A 2KT1A 4F5BA 3C0CA 2KXCA 4RTXA 2DBKA 2ED0A 2KROA 2DL5A 1JU5A 2P4RA 1BLKA 1ABOA 2K2MA 1Z9ZA 2DL4A 3M0QA 1BFJA 3N7YA 1T0JA 2HMHA 1AYCA 3IN7A 2ESWA 1QADA 2GE9A 1W6XA 2RQTA 3N8MA 1NYFA 4F16A 1PRMC 1NRVA 1F2FA 3VRQA 1O4BA 1UURA 2JTEA 1I1JA 1WLPB 2O9VA 2AZSA 2X3XD 3BUXB 3VGOA 1JO8A 3OVEA 3PVLA 4P9VA 1MV0B 4AFQC 2W0ZA 4D8DA 2EL8A 5EG3B 2HDVA 2D0NA 5AULA 4A4BA 2EYXA 4GBQA 1WA7A 2ROLA 3OV1A 2KRSA 4H1OA 1KJWA 2KE9A 2CS0A 2JM9A 1GFCA 2DNUA 2PNIA 5CDWA 2F2WA 1K0XA 5HKWA 1K0SA 1E6HA 4J9DA 2DLZA 3KFJA 5BO4A 2K7AB 1MILA 1O4QA 2VKNA 2Y1NA 1X69A 1B47A 3M0UA 2CIAA 3VS5A 2O9SA 2A28A 1KA7A 1R1QA 2LCTA 2GNCA 1V1CA 1TUCA 2KYMA 4Y92A 3ULRB 1O47A 2DX0A 3HIZB 3OP0A 2DVJA 3NGPA 3A98A 2DL3A 2VWFA 2CH4W 2J6KA 1JQQA 2PZ1A 1JEGA 3H0FA 1AWJA 2RORA 1RI9A 2RQVA 4RTVA 4OMMA 1T0HA 2DE0X 2I0NA 1O43A 2YUOA 1A09A 4OMOA 4OMNA 1HJDA 2CSQA 3GBQA 3H0HA 1GRIA 3UA6A 2MRKA 2YDLA 1FMKA 1CWDL 2CI8A 2CH4A 1RJAA 2L3PA 2EW3A 1CSYA 2LJ3A 3WA4A 4DEXA 3MXCA 2CDTA 4F14A 1TZEE 2AOBA 1A0NB 2K6DA 2CR4A 1M8MA 1M3AA 3REBB 1ZSGA 3OB2B 3TKZA 1GCQC 1SPRA 2DX1A 2PNAA 3NHNA 1UUSA 2AKKA 1WQUA 1HSQA 2EGAA 4F59A 1OPKA 1O4EA 4E93A 1O4JA 3EG1A 4HVUA 1Z3KA 1S1NA 1O4MA 2FEIA 2KNOA 1WYXA 2GBQA 1D4TA 1WDXA 4AG1C 2NUZA 2F2XA 1H8KA 2KRNA 3IMJA 2EYWA 5EHPA 1GL5A 1O4CA 1K76A 1J3TA 2K79A 3H0IA 2J06A 1OEBA 1WI7A 2A36A 1U5SA 4DGXA 4LN2A 2OAWA 1AWXA 2JS0A 1AYAA 1WFWA 2DF6A 3PSJA 3K2MA 5HKZA 1ARKA 1YVLA 4L1BB 5IBSA 1SHFA 1CSKA 5FWBA 4AFUC 2KK6A 1R1SA 1A08A 1NEBA 2RQUA 2YUQA 1KFZA 3VRYA 4CC7A 2EO3A 4OMLA 2FG0A 2L3SA 2C0IA 3BKBA 2RSYA 1BLJA 2EKHA 1RLQC 1O4GA 4HVVA 1PKTA 2DA9A 3ZL7C 2DL8A 4DEYA 1FU6A 4JZ4A 2HDAA 2ECZA 4OHHA 2LJ0A 3SHWA 1Y57A 1AZEA 3VS6A 2IUHA 4DGPA 2C0TA 2DM0A 4WWQA 2YUPA 1AYDA 3VS1A 5DF6A 1H92A 3VRZA 4NWGA 1O4KA 3GXXA 4HVWA 2E5KA 4XZ1A 1QCFA 2EU0A 2FPFA 2AKLA 1CKAA 3BUMB 1HD3A 4GPLB 2O88A 3VS7A 3UYOA 2L3TA 1VYTA 1Z9QA 1Y1UA 1UJYA 3TL0A 1VYUA 2CSIA 3I5SA 1AEYA 1YCSB 3M0TA 4P9ZA 1SHDA 5J3XA 4FSSA 1WXBA 3QWXX 2JMCA 2O2OA 2O31A 1QG1E 4K44A 1N5ZA 1BMBA 1T3SA 1BK2A 1F1WA 1LCKA 4IIMA 1JXMA 2L0AA 3MXYA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1RLPC 2F5TX 1JYRA 3PMIA 2QTXA 1LPLA 1NM7A 3CCVA 1QVFA 3OYHA 5FLXE 1Q81C 4HKEA 2QGFB 3JCMX 1YI2T 1VQNT 3M55A 3LWIA 3V7CA 4XTUA 1YP5A 5KYUA 1O48A 2MCNA 4RG8A 1KQSP 1O4IA 2JS2A 5HY6A 1M2VB 3CD6A 2FPEA 2EVRA 3BUWB 2QDLA 1YIJQ 2QG9B 3X26B 2EJ9A 5GAN6 3FLGA 3I56A 1AOUF 2BZ8A 2J05A 5DC4A 3PGGA 2LTOA 2XDBA 2IZVA 4U17A 4OHLA 2AK5A 1GBRA 2CP5A 2EQUA 3EGDB 1NYGA 3TSWA 4F17A 1Q82R 1XNIA 2BTTA 2V1RA 3C94A 4DOVA 4J9HA 3M57A 4E7IA 5GMKh 1SKJA 4C5HA 9ATCB 3CCMT 1K9MR 1BHFA 1JXOA 3CPWP 4KH1B 1ZUUA 2OJ2A 4M7AA 2P0KA 2IIMA 3RR6A 4C92B 1MHNA 1WNLA 3MHXA 1R77A 5I2SA 2NUTB 1IB8A 4AT1B 2B3OA 2M02A 5GMKj 1HCTB 5GAOq 3KXTA 4OB1B 4E2FB 1FBVA 1PSEA 4ZNXA 3EG2A 3H41A 1VQ7T 1WHJA 1O4PA 4OHIA 4JPBW 2RF0A 5I6VA 3EAEA 2DLPA 2HZYA 2MWPA 4Q5WA 5J39A 1O49A 1T3LA 1KA6A 2G3RA 1AZGB 2L5QA 3VROA 4J83A 3PIOA 1WXUA 2QEXA 2HDXA 4M78D 4XU1A 3PJPA 4M4ZA 4AFSC 1WZOA 2D8JA 3I5RA 2NLUA 2Y4YA 3VYGA 4CC3A 1M3CA 1CWEA 1RUWA 1NZ9A 4JUVA 3GOXA 2KMTA 1X43A 2WSCE 3K2TA 4FYYB 3BFMA 4C8QC 3NTHA 1XJWB 2EAYA 1M1FA 1WJSA 2DRMA 5IXBA 1O4OA 1LVKA 3G6EQ 4M77E 3VRRA 3FDRA 1VQMQ 3M7FA 4M7DE 2CRHA 5GAMj 2V8IA 3LH5A 1M5Q1 1BI0A 1OI1A 1IS0A 1EFNA 5CKEA 1D1BA 2CGHA 1I4K1 4BY6C 1BBZA 4D8KA 2EWNA 3OSSC 5GMKl 3JCMV 4IURA 1PHTA 1V76A 3GXWA 4PK4A 1BM2A 3CCRQ 1MW4A 3PQZA 4MMKA 1OO4A 2EYVA 1X2KA 4RCBA 3CMAA 3CC2Q 3HCKA 2ABLA 4XTVA 2L2PA 3UT1A 1O4NA 3QPHA 2C0OA 3I56T 2EOBA 4EMKC 3EAZA 3G1JA 1UGVA 4E7ZA 4ZTJA 3L2QA 5D6WA 2VXFA 3WXMB 3RKXA 1TTHB 4CC2A 4Z8AA 5DLOA 1VQ8Q 3MPUB 3SFMA 2EKXA 2K4YA 1GCPA 1D0XA 4PFPA 4HXJA 2DO3A 3BE3A 2RK2A 2X9HA 1VQPA 4PFZA 5LL6S 2MRJA 3N5BB 3JCMJ 4ZN1A 4ZGEB 2PTKA 2KGTA 3VS0A 2X3WD 1O4FA 4QKUA 3A8MB 1IJRA 3CCUA 1I3ZA 3VRNA 1TSFA 3PVQA 3JB9F 2DYIA 2D8HA 1D4WA 4NWFA 1VQKQ 3JCMQ 3TCJA 1GFDA 1BB9A 3GPLA 2K9GA 3LGFA 2K5LA 2O4XB 1G3YA 4KGVB 3CC7A 3CWGA 1O46A 2RI3A 3RKYA 5KCHA 1UECA 2DTOA 1MUZA 1G2BA 2R58A 5EEQA 2QMSA 1JYUA 2CP6A 1O4AA 1TUDA 2WACA 1R8OB 4AFZC 3L2VA 3GQIB 2CUDA 4Y91A 4XZ0A 1Q86U 5BO4A 1NZVA 1ZUKA 2JMAA 5CKFA 2QEXT 1K73R 2YRCA 3QDRB 1MNEA 1LUKA 5DY9A 2BUDA 2KQWA 4BY6B 1KC8U 3EACA 2PUOB 3RBBB 1QQJA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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