2DZPA

Structure of mutant tryptophan synthase alpha-subunit (d17n) from a hyperthermophile, pyrococcus furiosus
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
248
structure length
244
Chain Sequence
MFKDGSLIPYLTAGDPNKQSTLNFLLALDEYAGAIELGIPFSDPIADGKTIQESHYRALKNGFKLREAFWIVKEFRRHSSTPIVLMTYYNPIYRAGVRNFLAEAKASGVDGILVVDLPVFHAKEFTEIAREEGIKTVFLAAPNTPDERLKVIDDMTTGFVYLVSLYGTEEIPKTAYDLLRRAKRICRNKVAVGFGVSKREHVVSLLKEGANGVVVGSALVKIIGEKGREATEFLKKKVEELLGI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Tryptophan synthase alpha chain
publication title Structures of mutant tryptophan synthase alpha-subunits from a hyperthermophile, Pyrococcus furiosus
rcsb
source organism Pyrococcus furiosus
total genus 86
structure length 244
sequence length 248
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.2.1.20: Tryptophan synthase.
pdb deposition date 2006-09-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00290 Trp_syntA Tryptophan synthase alpha chain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2dzpA00
1UUOA 1ICSA 3B8DA 2B7QA 5DY3A 2CWNA 6TIMA 1LOQA 4HN4A 3FYOA 3TFXA 4XUGA 5EPDA 5I3JA 3S42A 1A5AA 4OV4A 1KTBA 4WXYA 3BLFA 3FLUA 4O1CA 1OFOA 1AMKA 3HMJG 1F05A 1W56A 1B3OA 3HG5A 1GT8A 4LVAA 2CLEA 2J9YA 2GVJA 3LLFA 4AHQA 2EKCA 2E68A 2WSQA 2TPSA 3P74A 5AOUA 5KSWA 4N02A 3W6YA 1TPDA 1YDVA 3TK7A 3LCWA 3O8AA 1QOPA 2HTMA 1XBYA 5G4WA 3IVSA 1ICQA 4GFSA 3IEBA 2VKZG 1H51A 1LBMA 3G24A 4MKNA 5CKSA 5H91A 4FXRA 4GUHA 1F5ZA 1ZFJA 4UMAA 1ML1A 1FXPA 2V2CA 3VE9A 4R7JA 3NL5A 3W83A 4Z08A 4RX0A 5C54A 2V9DA 3HQ1A 1Q6RA 2KZHA 3PUEA 1I4NA 1H5YA 3WK0A 2DZVA 3BG3A 4IUOA 1OYAA 3NQ7A 1O5XA 1M7PA 4QSHA 3PWAA 4QM1A 2FTPA 3C52A 5AHFA 5EY5A 3W07A 3QYQA 2OX1A 3WK2A 1OYCA 4AXKA 3UY8A 5CPOA 4KFOA 5K2ZA 2Y63A 2DZPA 3MBDA 1ZJIA 3A9IA 3LHYA 2QJHA 5T26A 1JCLA 4RKAA 3YPIA 1ZCOA 1YTDA 4OWGA 4MJMA 3W75A 1W0MA 3O6DA 4HT3A 3MWAA 3HGSA 3KOFA 5KINA 1H7RA 1H1YA 1TTIA 2QCNA 1J2WA 1KTNA 3NM1A 3FKRA 1DORA 1B57A 3BLIA 3PBYA 4S1FA 4BI5A 3C61A 1TTQA 5LGXA 4O17A 5CPLA 2W6RA 4AWSA 4KFNA 4CCEA 5DBTA 5BRBA 3HG2A 3S6DA 3LV6A 3C2EA 3RNDA 4FX7A 2VEKA 3OHIA 1SR9A 4RZ6A 4PL2A 1G4EA 2ALDA 3V75A 4DELA 4BK9A 4M6QA 1W31A 3BLEA 2WNZA 1G69A 2D73A 3TSMA 1F76A 2BXVA 1YYAA 1GVOA 1P5BA 3NPVA 1TPUA 1TJPA 1C29A 4W9TA 4JEQA 3W1RA 1A5CA 1SZFA 1QWGA 1KFCA 5FF3A 2YSWA 4FO4A 1RPXA 1NFBA 3KRSA 1NEYA 1TO3A 3CIXA 3LM7A 4UTIA 1HL2A 2NZLA 4EWND 1QPNA 3EKZA 1HTIA 4DQWA 4UCGA 4O1BA 1SZEA 4H4IA 4JTGA 4ZQMA 2Z6IA 4NX5A 1GTEA 3F1QA 4UTJA 5LZLA 2YFOA 4Y6GA 1ME9A 3NQ8A 5AC8A 1Q6QA 4AH7A 3MW7A 3L65A 2RDUA 3W3OA 3W7CA 5EL1A 5I3HA 1P1XA 3HPZA 3W2LA 1C9DA 3IGSA 3NM3A 2XN2A 2ZZ3A 5CZSA 4TX9A 4RXFA 4WZHA 1CI1A 1ZAIA 3W2KA 5HNRA 1TPEA 2Y6ZA 5CGQA 5I3FA 1LBFA 3W73A 3W1PA 2ZZ4A 1K3UA 1P0NA 4NX0A 4WY0B 4ICNA 2C14A 1VGAA 2X1TA 1KFKA 2HS6A 1LOSA 4MYXA 4HNVA 1TTJA 5H2ZA 1WAUA 3Q94A 5D2VA 2EPHA 1H1ZA 1K8XA 2FDSA 2C16A 2NXHA 3HBLA 3EX4A 2PCQA 2YCEA 2V2HA 3DFQA 4CQAA 5C5YA 3WJYA 4YXGA 2RHGA 4CLMA 3L67A 1JULA 3TFCA 1XDLA 2JGQA 3IV3A 2QR6A 3S5ZA 1TPWA 1JCNA 3JS3A 3UNDA 2ZZ7A 1QO5A 4JX6A 3DFPA 4U4MA 3P7YA 4QNEA 1LROA 1W5MA 3JRKA 3CLMA 4LW7A 3EX3A 4O4WA 5AHNA 3S5OA 3UWZA 1WXJA 3VFLA 5F1UA 1PV8A 1F7BA 2DP3A 4IQLA 1VYSX 2BZNA 4ZQPA 1PE1A 2FPTA 2PRHA 3EWBX 3W7HA 3W7NA 2PC4A 1I45A 2A7NA 4JTFA 4KWVA 3LV5A 1FWSA 4DXVA 3LCFA 3OG3A 1QCWA 1TPB1 2VXNA 3TQKA 3T55A 4CCCA 1UUMA 4I9AA 4JYEA 4UC5A 1AW5A 1KTCA 5K4XA 5TBOA 3T40A 1OG0A 1K8YA 1LCOA 1R47A 3LRMA 2FIQA 1GG1A 1JUBA 1T8XA 1VZWA 5KMYA 3O63A 2V5BA 3DI0A 3VI2A 3T78A 4UTKA 2ZA2A 3PS7A 1QPRA 4LS0A 2NX1A 1R30A 3O6YX 3QMRA 1G67A 2CLMA 4RK8A 3OVPA 2J88A 3GK0A 5F2IA 1E51A 4P2VA 3C3NA 2DJLA 3L0KA 2V30A 1LRQA 4E38A 1VQTA 2C6QA 3QH2A 2YW3A 2IQTA 5F2MA 4GWEA 3ATZA 3NEVA 3RU6A 1TPH1 4OV9A 3IVUA 4FIQA 4AF0A 5AN7A 1Y0EA 1DJQA 3UQNA 2PURA 2VFGA 4RR4A 4BI6A 1VPXA 3LRKA 1OX4A 2QCMA 1FWTA 3P5YA 2X30A 1VHCA 4UFLA 3TC6A 5EBUA 1EP1A 1WV2A 4NNCA 4A2SA 3NOEA 3NL6A 2A2IA 3W84A 2E1DA 2Y85A 3STCA 3O05A 2YYTA 3ABQA 5FF2A 3L9CA 1G7VA 4U28A 5K9CA 2NWSA 1KM4A 2VOMA 3GYEA 3IIOA 5LGZA 4P61A 3LI1A 4C1KA 3NGJA 4NVTA 3SY5A 5U7SA 3NQFA 3B4UA 3W72A 4ZQOA 3INPA 4LS1A 1M6JA 2ZYFA 3MHFA 1WDWA 2WOQA 4NNBA 2ZFAA 4XWUA 1KM5A 3W1AA 2Y62A 3PULA 4H6KA 4JIPA 1L6SA 3NQEA 3ELFA 1VR6A 2CLHA 1K7XA 2FJKA 1OF8A 4O4VA 4FNUA 1FCVA 3BW2A 5F1VA 4EF9A 4K39A 1EP3A 3A24A 2QDGA 4D2JA 2ZZ2A 1WBJA 3NQ2A 3VCRA 5FEXA 1VHNA 4K7VA 4NXSA 1QPOA 3NNTA 3TNOA 1YDNA 1GVFA 5L6UA 2VFDA 1EIXA 3CB8A 3OBKA 1FBAA 1LBLA 4J9JA 2ATMA 3DFTA 4EVZA 2C0AA 3BG9A 2TYSA 1ZALA 4IMEA 4IMCA 2E6AA 3M5VA 3C2RA 2EAWA 4QAIA 4FIRA 2R94A 5KZDA 4DF0A 2ZRVA 3W7PA 1LZOA 4IJBA 4ZQRA 1PCKA 3GXPA 5KTLA 1F2JA 2JKEA 3USBA 4NJKA 4Y96A 3GR7A 1W3IA 2B4GA 3SGUA 4UTWC 4LVBA 2A4AA 4UUIA 4LUIA 1JRBA 3QPZA 2ZQ0A 4JX5A 1TV7A 3B03A 3GDLA 3STGA 2NWRA 2QUUA 2YPIA 1TIMA 3EX2A 5DXXA 4N2YA 3UXAA 1Q6OA 5FEWA 2Y7FA 2G95A 5K7JA 4CQ8A 1IIGA 3S9YA 4GUFA 3OVQA 1KW1A 4GUGA 4RZ5A 3EXRA 1LLZA 2ZBTA 3I7QA 3P80A 5HUPA 2V8ZA 2A5HA 4K6AA 5I3KA 3C2VA 3W23A 5TIMA 2NX3A 5K9XA 5C55A 1GTHA 1IXPA 5EMUA 1KM2A 1XDMA 1X6UA 3W7DA 3EX1A 1N55A 3G1DA 5KITA 3C56A 4UR8A 1T96A 1TRIA 3LDVA 1FWNA 2B0MA 1F74A 2J9ZA 3RF9A 4O53A 4R34A 5LNUA 4QNWA 4YL2A 1DVJA 3EKLA 1GPWA 4LV4A 3IIZA 3QM3A 4NUWA 3F4WA 5FI8A 4A2RA 1ZENA 1SSGA 1SQ7A 4LC8A 4X3ZA 5FF0A 4IPIA 4FNPA 4IGHA 2Y7DA 3PSVA 3LCIA 3MI3A 1H61A 3UZ5A 3PBVA 1MEHA 4YLWA 4BWLA 4GBUA 2H8ZA 2QCLA 3ANYA 4JTKA 3TXVA 3GDKA 3DFOA 1WA3A 3GXTA 4M7SA 4M5PA 1P4CA 3M5YA 1DV7A 4FB7A 4LS2A 1SO4A 1EEPA 4K37A 3W7RA 5FF4A 3N34A 4O16A 4K7YA 1DJNA 2ZA3A 3G22A 4MLRA 3PM6A 2RH9A 4JTHA 3NR0A 1I2PA 4O18A 4RCXA 3TE9A 4NQ1A 4RV8A 2O7QA 1F6PA 2YGYA 3TW6A 3N3MA 4O12A 3Q37A 3NZRA 4UFHA 1M5WA 4Z1CA 1GVQA 3FOKA 4RXGA 3S1WA 1NF0A 5FEPA 5BMXA 3EB2A 3UY7A 3WK1A 1PHWA 2VELA 2WSRA 4LNYA 1QMLA 5A8GA 2QCGA 4YMZA 4K36A 2R14A 1KA9F 1PIIA 2XN1A 5FEZA 4KKXA 4L4MA 1QOQA 2PRMA 1A53A 1TQXA 4X9SA 2EGZA 3NPUA 3LXBA 4PH6A 3UWQA 1N7KA 4UTMA 1S5VA 3TMQA 1KM1A 5FF7A 3W1TA 5AB3A 1EX5A 5D32A 1LP6A 2DZSA 4XTDA 4TU1A 2YW4A 4C1LA 4HNUA 3CM4A 4AVFA 3EX6A 3CWOX 1W3TA 3NPWA 3UWUA 2QJGA 1KM3A 1VLWA 3EXTA 2DJXA 1KM0A 3P61A 3QRHA 3EXSA 3HIJA 3MHGA 4IWWA 5EA9A 4XTIA 3KVMA 2TSYA 3A21A 3GDMA 5MHBA 4LC6A 4M6VA 4UR7A 4GE8A 2NV2A 3NYZA 4WY0F 5C2XA 4RLIA 1ME8A 1W37A 2YR1A 3ZR4A 1J5TA 3G3DA 1YDOA 3IIXA 3E02A 4WY0A 1B9BA 3DENA 4ZVJA 4M6PA 2FB2A 1Z42A 3KRUA 1AG1O 1W5PA 1YPIA 5F2GA 4MIMA 4Z1BA 3G8EA 1XFBA 1OFBA 4LWWA 1OJXA 1ONRA 3DH7A 1ZAHA 2HSAA 3SI9A 4O1AA 4XBKA 3DFNA 4S2CA 3G1VA 3LOTA 4JTLA 1X8FA 4WD0A 4IXXA 4UNKA 5G2WA 3A22A 4PFMA 4JDBA 3EWZA 1I2NA 4R33A 2ZZ6A 4MZ1A 3SJ3A 3GR8A 1OYBA 1TSIA 5F2LA 2P1FA 3W1MA 4O19A 4NJGA 1SZGA 1O4UA 2F7FA 2TRSA 3THAA 4XBSA 4DF1A 3LGEA 3B05A 2QCHA 4UTTC 3W74A 5CZJA 1TYGA 3F4NA 4JDYA 3PG8A 4OGZA 1WYIA 3DZ1A 2RKXA 2Q3OA 5CSSA 4A21A 2GQ9A 3ZWTA 3C2OA 5HJLA 1M7OA 3M47A 3W70A 2DZXA 3G3MA 3U2OA 2A85A 3TU9A 3L2IA 4Z1DA 1H7NA 1Z41A 3NZ1A 2HS8A 1W3NA 1WX0A 3MP5A 4ADUA 1HO4A 5IBXA 2E5DA 3HGOA 3S8HA 3L0GA 2BX7A 3DFSA 3BW4A 3IGUA 1G4SA 3I68A 1S5TA 2NX9A 2Y61A 3GNDA 1Z44A 3W7JA 3OVRA 1TV5A 4MUZA 4LT9A 1YXYA 1TPFA 2X16A 2DZUA 2NUWA 4MY8A 4HSOA 1TREA 2ABBA 1PHQA 3PB0A 3W7GA 3GDTA 1QFEA 3LHTA 4E0CA 4QJ1A 5DBUA 2C19A 3TAOA 2FPYA 4HKPA 1W8SA 1KM6A 2E5CA 4O1DA 3BG5A 5DCBA 3IGXA 3M43A 3UXDA 5G2IA 2Y89A 1SO3A 2CU0A 4OQVA 3LCGA 4DBEA 1TRDA 2A7PA 3TV8A 3W7EA 4JX4A 3BGJA 4UFMA 5BNKA 3GIYA 3CEUA 3IIPA 4LOCA 3VE7A 3G1SA 1H7PA 1H7WA 4PODA 1X1OA 2UV8G 1OABA 2CFFA 2JKPA 2VC6A 3PB2A 1Q6LA 3U6WA 1DQWA 3G18A 3FJ6A 4POCA 1KV5A 1D3GA 1XI3A 3B06A 4O0KA 3W86A 3NQVA 3C4UA 3M5ZA 5AC6A 1KV8A 3AJXA 1XBZA 4Z0SA 1UB3A 3O07A 1OHLA 2ISSA 2OT0A 2ZTKA 4DF2A 4O0ZA 3CU2A 5HR6A 3STFA 3W1LA 1OK6A 4NJHA 1ADOA 3LRLA 2NUXA 1PCWA 1VCFA 3LTSA 1AK5A 3NQAA 1I2RA 4FXSA 1DHPA 4Y90A 3Q2DA 4HPXA 2ZDRA 2VEMA 1KFJA 3GKAA 4PA8A 4YWIA 4BI7A 2ABAA 2W0UA 3RFAA 2A21A 1TV8A 1KFLA 1JUKA 1FX6A 2CLFA 4PL1A 4JYDA 2J9XA 5AYXA 2WO5A 2X1UA 1SU5A 3NAVA 2I14A 4TMBA 1R2SA 1THFD 3ZWSA 1S3HA 3HJZA 4GRSA 3BO9A 3P84A 3DHDA 2ZRZA 3W7OA 5LKYA 2LLEA 3TJXA 1N8FA 4O15A 3W2JA 4GJ1A 1H63A 1YTKA 4O54A 1TTPA 2PRLA 3Q58A 3UD6A 5AC7A 1H50A 2XFWA 1KLZA 2H3BA 4DPQA 2YDAA 3W85A 1BWKA 3KVJA 2GOUA 4EF8A 1B4EA 3NL2A 1L6WA 3LTPA 3QEZA 4N9CA 3M5XA 4O8RA 1SSDA 1RV8A 3AO0A 3N9SA 5D04C 5HWNA 2E6YA 3PUDA 1VYPX 3M0ZA 5K3VA 1DL3A 1IF2A 2Z1BA 1H60A 5D03A 3TCEA 3HG3A 3B0PA 3NQ6A 4L4LA 1O5KA 1TB3A 4IOTA 5LSMA 3T44A 1GWJA 3I6RA 1BTMA 3MO7A 4O14A 1QAPA 4ML9A 3W7LA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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