2DZUA

Structure of mutant tryptophan synthase alpha-subunit (d110n) from a hyperthermophile, pyrococcus furiosus
Total Genus 93
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
93
sequence length
248
structure length
244
Chain Sequence
MFKDGSLIPYLTAGDPDKQSTLNFLLALDEYAGAIELGIPFSDPIADGKTIQESHYRALKNGFKLREAFWIVKEFRRHSSTPIVLMTYYNPIYRAGVRNFLAEAKASGVNGILVVDLPVFHAKEFTEIAREEGIKTVFLAAPNTPDERLKVIDDMTTGFVYLVSLYGTEEIPKTAYDLLRRAKRICRNKVAVGFGVSKREHVVSLLKEGANGVVVGSALVKIIGEKGREATEFLKKKVEELLGI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Tryptophan synthase alpha chain
publication title Structures of mutant tryptophan synthase alpha-subunits from a hyperthermophile, Pyrococcus furiosus
rcsb
source organism Pyrococcus furiosus
total genus 93
structure length 244
sequence length 248
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.2.1.20: Tryptophan synthase.
pdb deposition date 2006-09-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00290 Trp_syntA Tryptophan synthase alpha chain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2dzuA00
3Q37A 4Y96A 1JQVA 3LCHA 1PCWA 3TUUA 4LW7A 3FFSA 1BEUA 3P82A 3C4UA 1S3HA 4IXXA 3L0NA 1P5BA 3EWYA 3GXTA 1HG3A 4YCOA 5LSMA 4OV4A 4IUOA 2GQ8A 1G4EA 1K02A 3BW2A 5D09A 4YL2A 2FDSA 2V2HA 3G1YA 4I7WA 1FBAA 4NJKA 1VYSX 2D73A 2YPIA 3DBPA 4U28A 1WYIA 3SIZA 1GT8A 1QPOA 4TO8A 3UWVA 3BPWA 3C2OA 4HN4A 4N6EA 4CNOA 3B0VC 4O28A 2E1DA 1W5OA 4M19A 1PS9A 3UY8A 1JJKA 4OGZA 3IGSA 2VKZG 4XZ9A 2YYTA 2NX9A 3TNOA 2X2GA 3QZEA 2B7OA 3W7HA 2NXIA 3FKRA 2V82A 4IMGA 4CNNA 3KXQA 1W37A 3B4UA 3CWOX 1H1ZA 3RLVA 2ZZ4A 2JGYA 1X1OA 3BG5A 4HIBA 3GKFA 3MYOA 5F2MA 4LS1A 3DAQA 2PCQA 3ABSA 1TPC1 3LI0A 1TO3A 4NNAA 1C29A 3CPRA 5DCBA 3W2LA 1EUNA 4ALDA 1IIGA 4RR4A 5U7SA 4XQ6A 1YDOA 3OBKA 2J9XA 2IQTA 3W7MA 4DBEA 2V8ZA 3NQ7A 1NSJA 4H6KA 4IPJA 4UTWA 4XBSA 5LNRA 1SQ7A 4WZHA 3NQ6A 1KBJA 3PB2A 1OFEA 3RLUA 3LX9A 2W6RA 4LUJA 2YXGA 1AW5A 1TMHA 3NL2A 4UIOA 1K8YA 5EMUA 1TIMA 2ATSA 1OK4A 3GDMA 2WNQA 4FNTA 3PF3A 4TU1A 4JTFA 1ZAJA 4J9JA 4KFNA 3T4CA 2DZVA 5F2IA 2H8XA 1H7NA 4JTJA 4Z1BA 3W7LA 4A2RA 4BI5A 2NWRA 1WA3A 1YTEA 3GAKA 3W70A 3B0PA 2CLOA 2R94A 1HFBA 4ADUA 3C0JA 1A53A 3HGRA 3UNDA 1H61A 5DELA 4NZFA 5D04C 1A5AA 4O18A 4BI7A 2Q3RA 3TJLA 1ME8A 1EA0A 3UZ5A 1MEWA 3G0XA 2NXHA 1SFJA 4LRSA 3OA3A 4HT3A 4JX4A 3KVKA 5G4WA 1Y0EA 2NX3A 3E96A 5IM51 3NQFA 3TK7A 5EYWA 1DKWA 4LV4A 4NX5A 3CB8A 4LS2A 2GVJA 5F2LA 4K37A 4XKYB 3IRDA 4UTTA 3GXPA 3L0KA 3LM7A 5G1TA 1Q6RA 1JCNA 3QPYA 1KTBA 2O7SA 3LCIA 1GJPA 3GNDA 1XXXA 4IGHA 3KRSA 1FUYA 1VYPX 4FHAA 3C52A 5CPLA 5I3HA 2GPTA 3M44A 2H3BA 5ABTA 2CZ5A 2ZRUA 1NEYA 5IBXA 5AHEA 2WOQA 2YFOA 1EB3A 4M6QA 1YDNA 1OYBA 3VNDA 2DZWA 3M5XA 2Y70A 4A22A 4RLIA 1OABA 3W7DA 1F05A 3G24A 5H2ZA 4UMAA 1X8FA 4EIVA 2QCFA 4JTGA 4PCFA 2V0TA 2TSYA 1B57A 2BTMA 2WPBA 3HBLA 4RZ4A 5AOUA 3W7EA 1KBIA 2GQAA 3QMRA 3TSBA 2DP3A 2JGQA 3TX9A 4AWUA 3PB0A 1M7PA 4RV8A 4MYAA 3NNTA 1SPQA 3TQVA 4JR5A 4UTJA 3F03K 2A85A 4LY8A 4JTSA 3CWNA 4CCDA 4QJ1A 1JULA 5KITA 4GNJA 3EKLA 1ICSA 2Z0IA 3PULA 3O16A 1SSGA 5BOOA 1GPWA 3UXAA 3W7JA 1A50A 2XN1A 4O50A 2CLMA 3CT7A 2FPTA 3W1AA 4NU7A 3DHFA 5AC7A 1G6CA 2C13A 1H60A 1T99A 2V30A 4RK8A 2E77A 4IOTA 4YLWA 3WFAA 3HGOA 1A5SA 2QEZA 5LKYA 2CZDA 3KX6A 2JK2A 1DV7A 3TSMA 3JR2A 5K9XA 1KV5A 2QUUA 2BZNA 3G18A 3NAVA 3NXFA 4DF0A 3G1SA 5HWMA 1RR2A 3QJAA 1KM0A 3PSVA 3TQKA 4BK9A 1H63A 5BRBA 2J9YA 1GVQA 4I7VA 2ZRWA 4IQLA 1YPIA 4JTEA 4N9DA 1XBVA 1KFLA 3TCEA 2ZZ2A 2B7QA 3GDLA 1VCGA 4JYFA 1F2JA 2QCGA 3RK8A 4MYXA 4ZQNA 4CQ9A 1B4EA 1FCQA 3S1XA 4JTTA 3OHIA 3BGGA 4IJBA 3P74A 3QYQA 2ZZ3A 3OVQA 1YTDA 3MP4A 5C2XA 3B06A 4UCGA 2B0MA 4UFMA 2DZXA 2CU0A 4LTSA 4IMFA 4O12A 5KSWA 2V5BA 3IEBA 1QAPA 4IMCA 3NPWA 2P10A 3W1MA 1TCDA 1KFCA 4O57A 3B03A 5AHNA 5LNVA 1GG0A 1PV8A 1QOPA 3L5LA 2CLLA 3BK0A 3IIOA 1W31A 3TAKA 5LNSA 1GG1A 4O8RA 1P1XA 3QW4B 4CCCA 3W1PA 4NJIA 4O10A 3BGJA 5H91A 4O54A 5E93A 3QC3A 4AWSA 3SGZA 2QCDA 4NZJA 5J5RA 2V81A 3S9YA 4MFEA 2ISWA 2YFNA 2ISVA 3E9AA 3W74A 5KMYA 1PHQA 4ZVJA 4Q4KA 2ZRVA 3R5EA 1GQNA 3TAOA 3GXNA 5F4XA 3P5YA 4Y8FA 4ADSA 1TV7A 4HPXA 1FCUA 4FNSA 5MHBA 2Y88A 3BV4A 1MZHA 3TXZA 3WJSA 3MBFA 2NV2A 1SO3A 2B4GA 4WY0A 1FY6A 3BARA 4MZYA 3WK1A 3E49A 2FQIA 2ZZ1A 3FEMA 1EEPA 4XWUA 1OYCA 3W86A 5KINA 3CC1A 1JR1A 4N4PA 3N19B 1WDWA 2ZA3A 3NZRA 4E2DA 3L0GA 2E6DA 3R2GA 4JY8A 1AW2A 3PWAA 3IV3A 4NVTA 5K4ZA 1PCKA 3BW4A 2FPYA 3UWWA 3Q2DA 2QCMA 2X1UA 4LVAA 1PHWA 3O6YX 1VPXA 3PY2A 4LVGA 3FS2A 2ALDA 2RDUA 1TREA 3P61A 5I3GA 3UWQA 3TXVA 3VE9A 1QR7A 3HGJA 3W88A 3ABRA 4H3DA 3PBUA 5D37A 4IX0A 1Q3NA 2NXGA 2ZTKA 3PR2A 1VYRA 2FIQA 1O95A 3MP3A 4EOUA 3HJZA 4EWND 3QQ0A 2XN2A 3NQ8A 3EWWA 2CLEA 1OHLA 5LHFA 3ZS4A 1G4TA 3DH7A 3PBVA 5F1VA 3W7GA 3W22A 1B3OA 3LCWA 4MIMA 5CKSA 2DU2A 1L6WA 1TTQA 1YXYA 2WV8A 1WOBA 5A5WA 1OFBA 1JVNA 3FJ6A 2BLEA 1QCWA 1FX6A 4YWIA 3GK0A 1R30A 4FEZA 5HMSA 3TJXA 4Z0JA 1F6PA 2E5CA 3IVTA 1HO4A 5AN7A 1FXQA 2PRMA 4LV9A 3N9RA 2BX7A 4KFOA 3LHUA 2YDAA 3DXIA 1N55A 3K30A 3CM4A 2NUWA 1OVDA 3W1QA 1H7XA 1Z42A 3DI1A 2V5LA 3CIXA 3THQA 1ZFJA 3BLEA 3KVMA 4JDYA 4MY9A 4JGDA 3WJXA 4NJJA 2C6QA 3TIMA 1I2NA 2EPHA 3LTYA 1GYNA 1L6YA 4JTKA 4QQ3A 1B4KA 5A8GA 3EB2A 3KRZA 1SO4A 2UV8G 2G97A 3BW3A 1KM4A 3B8DA 3GNNA 3W87A 4GXMA 2WSRA 4PTNA 4Q32A 2X1RA 3R89A 4BF9A 1LRNA 3C56A 4N9BA 4L4MA 1R47A 4ADTA 1G4SA 3EXTA 4MLJA 4BWLC 3KHJA 4U4MA 2KZHA 3AO0A 5K3VA 4IMEA 3NQDA 2TYSA 3ELFA 3P62A 4O14A 1YADA 3QQ1A 4IX2A 4WY0F 4Z08A 1ZHAA 3NPUA 3IIVA 1IXOA 1VHCA 1FWNA 5EBUA 4ZQMA 2I1OA 3G0UA 4HNNA 4GUHA 5D2TA 3DU0A 2E6FA 3PG8A 1Z44A 5T26A 2RKXA 3GKAA 2OMAA 3W1RA 5G2WA 3HF3A 2VEKA 2X1SA 1K7EA 2TPSA 2GVGA 1OFRA 1DQWA 4ZMGA 3KOFA 3YPIA 3ANYA 1OF6A 1VS1A 3EKZA 3TV8A 4YCPA 4ML9A 3ABQA 1ZJIA 2GUUA 5K9DA 4M7TA 1FCBA 4JD4A 3GYEA 4POCA 2FPVA 7TIMA 2GJLA 3LTPA 1FDYA 4X2RA 1VGAA 3QRHA 3SJ3A 8TIMA 1EWEA 1TRDA 3NGJA 3O63A 3ZWSA 3GVGA 1OX4B 1WOAA 1QPNA 1XM3A 4QIUA 4NXKA 1K8ZA 1YTKA 4OV9A 1X6UA 1RQBA 4JYDA 3TW7A 3S5OA 3KAOA 1LDCA 2V2DA 5FESA 2OJPA 3L65A 3U8GA 1QNVA 4LVFA 4WOZA 4MY8A 3LCXA 5FF0A 1TPDA 5HNRA 4O19A 1YYAA 1MEHA 1TPB1 4UTIA 1G4PA 1Q6LA 2C18A 3O1NA 2RDWA 1CI1A 1SO5A 3NPVA 3H53A 5BMXA 2CLIA 3GZ3A 5K9CA 2V2CA 1TQJA 3NA8A 2C1HA 3HMJG 3FYPA 4JXCA 4FB7A 1JUEA 2PE4A 1H7OA 5BMWA 3PAJA 2OCZA 3W7QA 3G1AA 3W7OA 1O60A 4E2BA 3I68A 2BWGA 2H8ZA 1LLWA 4DELA 4JX6A 4A29A 3TU9A 5CZTA 3KRUA 4HNVA 2ZBTA 3G3DA 4AHPA 3OG3A 1LLZA 1OF8A 1W3NA 3LRLA 3P84A 5F2GA 3LCLA 3NO5A 1WXJA 1NVMA 4ORIA 1NAL1 2ATMA 4N9CA 3S1WA 3H55A 3NZ1A 2Y7EA 1F73A 4AVFA 4UFHA 3T55A 4M6PA 4R7JA 3NM1A 3DKLA 1C9DA 1AW1A 3O06A 3GR7A 2EKCA 3M16A 4UTMA 2ZDRA 5TBOA 3LRMA 1R2RA 2QCCA 1LORA 2QCDB 5U4NA 2YSWA 1Z41A 3B05A 1LRQA 1UASA 3NVTA 1TJPA 4AF0A 1QOQA 4WOQA 4UTKA 3KVLA 3G1DA 4JIPA 4ZQOA 1A5BA 3VE7A 4JX5A 3F1QA 4C1LA 1YXCA 1FWRA 3TKFA 2JKPA 1CW2A 3DI0A 3QMTA 2Q8ZA 3MWAA 2AQWA 2Y62A 4JTIA 4QM1A 3I7RA 3N34A 1UJPA 3HPXA 2R8WA 3P7YA 4LRTA 2A21A 4WY0B 4R34A 2YCEA 2J9ZA 2WKJA 1KLZA 2X16A 3FIGA 5CPMA 1UBSA 2JKEA 3SECA 2ZRXA 5CPNA 3ATYA 1X1ZA 3OVRA 4RZ5A 2A7NA 4N9EA 3P81A 1Q6QA 1T8XA 2YW3A 4O1BA 4GBUA 2RHGA 2Y6ZA 1KFKA 1KM3A 3GDTA 3QMSA 4K8HA 3P60A 4K39A 2A0NA 1J4EA 1KFEA 2VFHA 2HS6A 1OFDA 3IIXA 3QSTA 2BXVA 4RXGA 2VFIA 1IXNA 5EY5A 1DHPA 3W7CA 1GYLA 3G8EA 3LTSA 3A21A 3VI2A 5D30A 3W6YA 3N9SA 4GRSA 1R46A 3UWZA 4OHQA 2Q3OA 4UFJA 3C8FA 4NNCA 4N6FA 2R91A 3STGA 4P61A 3CQ0A 1DJQA 1UB3A 2X1TA 3I6RA 5AYZA 2EHHA 3HGSA 1M6JA 5D03A 3QPZA 4PODA 2ZZ7A 1GZGA 4YMZA 3UPWA 3C6CA 3KVJA 2ISSA 5G2HA 3NQAA 3TE9A 1KFBA 2YX0A 4HKPA 1VLWA 1DJNA 4NT0A 5C6MA 1KM5A 2Y63A 4AWTA 1T0OA 3E12A 1MSSA 1FCVA 1X7FA 3NQMA 3A23A 1OX4A 4I9AA 3C2FA 3PBYA 3THAA 1JRBA 1F74A 2DZSA 3O6DA 3BG9A 4MVAA 2OT0A 4A3UA 3C3NA 5DN1A 3M7WA 3PC0A 5CSSA 2FB3A 5I3IA 2YYUA 3M41A 1XCFA 3W7IA 2ABBA 3N2XA 5D02A 3NDOA 2I9EA 4TMBA 3NQGA 1O4UA 1VH7A 3INPA 3W1XA 3OEXA 1ME7A 3R13A 4PH6A 3DZ1A 1PE1A 4M7SA 1OG0A 1JCLA 1VCFA 1LBFA 5E0KA 5AYYA 5F4WA 5D32A 3H54A 1J2WA 5HWNA 3HOJA 5E1QA 3E02A 1SZFA 4Y6GA 3VFLA 3QM3A 2AAMA 1XC4A 3EWXA 4JYEA 1QPQA 5KZDA 3GDRA 4UR7A 1U83A 3FJLA 2NZLA 4HSNA 1JUKA 3L66A 3G1XA 3MBDA 3U6WA 1YXDA 4AXKA 3HPZA 5C55A 1N8FA 2CWNA 4NXSA 5HUOA 2E09A 2P0OA 2F84A 2E6AA 1BWKA 1LRTA 2XFWA 1XKYA 4HSOA 1UCWA 3NL5A 1VCVA 4WJEA 1I2RA 3TMQA 2NLIA 3LXAA 5G2IA 2B7NA 2J88A 1MO0A 2YR1A 2HS8A 4CLMA 3LV6A 3PSWA 4W9TA 3TSDA 1W0MA 3L67A 5HJLA 4LVDA 2F7FA 1SW3A 3W73A 1RVGA 4UMBA 4DXVA 1XUZA 3SGUA 4E0CA 5C5YA 2LLEA 2ZA1A 3G1VA 2DJLA 4OU1A 1G67A 5DXYA 3IGXA 1OYAA 3B04A 2PRLA 3T40A 3W7PA 2NV1A 1AG1O 4FIRA 1G69A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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