2DZXA

Structure of mutant tryptophan synthase alpha-subunit (e131-132a) from a hyperthermophile, pyrococcus furiosus
Total Genus 95
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
95
sequence length
248
structure length
244
Chain Sequence
MFKDGSLIPYLTAGDPDKQSTLNFLLALDEYAGAIELGIPFSDPIADGKTIQESHYRALKNGFKLREAFWIVKEFRRHSSTPIVLMTYYNPIYRAGVRNFLAEAKASGVDGILVVDLPVFHAKEFTEIARAAGIKTVFLAAPNTPDERLKVIDDMTTGFVYLVSLYGTEEIPKTAYDLLRRAKRICRNKVAVGFGVSKREHVVSLLKEGANGVVVGSALVKIIGEKGREATEFLKKKVEELLGI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Tryptophan synthase alpha chain
publication title Structures of mutant tryptophan synthase alpha-subunits from a hyperthermophile, Pyrococcus furiosus
rcsb
source organism Pyrococcus furiosus
total genus 95
structure length 244
sequence length 248
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.2.1.20: Tryptophan synthase.
pdb deposition date 2006-09-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00290 Trp_syntA Tryptophan synthase alpha chain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2dzxA00
3QH2A 3W7LA 3C3NA 5D2TA 2OJPA 2HS8A 1H7RA 1SW3A 4X2RA 3VNDA 4M6QA 3W1QA 1G4EA 3IGXA 3DGRA 2GQ9A 3GNDA 4RX0A 4DO4A 3QW4B 4XUGA 5D02A 2UV8G 3W1XA 1VRDA 3O6DA 2A7PA 1QPNA 5KMYA 3G3MA 4N6FA 5D2VA 1GTHA 4ZL1A 3I7QA 3NPUA 4JTHA 3C2OA 2JKAA 2C15A 1LLWA 3Q94A 3SY5A 1NFBA 3TNOA 3HGJA 1W31A 2B4GA 2J6XA 4EOUA 3C61A 4OV9A 2Q8ZA 1P1XA 3M44A 2VENA 3IVUA 2WPBA 2V30A 1OX6A 4WOQA 4UTWA 3KRZA 2YYTA 1LTDA 1OFEA 3R8RA 1ZALA 1QNVA 4JIQA 5EKYA 3W1AA 3OVPA 1F6KA 4LC8A 4Q33A 3TR2A 2WSQA 4UTWC 2I9EA 2RHGA 4Y6GA 2A5HA 1FQ0A 2E5CA 4NJJA 2JGQA 3DU0A 3PG8A 3LTPA 5HR7A 3HG2A 4LVBA 1OF8A 3EWBX 3TH6A 3S5ZA 4O1AA 3TXVA 1YTEA 2VELA 2TMDA 1QPOA 1ICPA 3I7SA 3UQNA 5E93A 3PULA 1QPQA 1DOSA 1G4PA 3T55A 1OG0A 3BW2A 2P0OA 3GAYA 1P0KA 4XTIA 4M7SA 6ALDA 2G95A 3W22A 3W7OA 1MEIA 1V7YA 1LBMA 1JR1A 3EX6A 5F2IA 1H7XA 4JX6A 3W70A 4X9SA 3HG3A 2GOUA 3LI1A 3HIJA 1TTIA 3G0UA 2V2CA 2QF7A 2ZBTA 3GXPA 5G4EA 1FUYA 1KLZA 3ELFA 2P10A 3TJXA 1W5MA 1SUXA 4AMAA 5AHNA 3G1SA 3GXTA 2HS6A 4IPIA 4FHAA 1TRDA 1YPFA 4UCGA 1H7WA 1SU5A 3QW3A 2A85A 1HTIA 1IXNA 3G3DA 2WQPA 4O0ZA 1SO3A 1H1ZA 4GBUA 4LVFA 4JYFA 4MYAA 1I45A 5E1QA 3W6YA 3W72A 2YZRA 1VCVA 1GG1A 1YYAA 2ZYFA 4Y8FA 2QCEA 1OFOA 2ZTKA 5CSSA 2ZTJA 4JTEA 4CQ9A 1SPQA 5AN7A 2QKFA 1TPH1 2VFDA 4GXMA 4DBDA 1HFBA 3WK0A 3G22A 4ADUA 1WAUA 1JJKA 2J24A 3QEZA 3C6CA 1H61A 2VFEA 3OA3A 2A1YA 2FPTA 1VH7A 5I3KA 4HNUA 3UXAA 4Z1DA 1ZENA 4HPXA 3S1XA 4OBTA 1XBXA 4WXYA 3ATYA 4K39A 4HNTA 3N9SA 4NZJA 4MVAA 5C6MA 1JUKA 4WY0A 1UJPA 5DELA 2E5DA 2QCDB 5CPLA 2VEMA 1VJIA 3QSRA 3GYEA 5D2WA 4LRTA 4DO6A 2QCLA 4N9EA 3NQDA 2J88A 3TQKA 2NZLA 1QOPA 1R47A 3UWUA 5T26A 2Z6IA 2A7RA 3OHIA 2VEPA 3NEVA 4FNUA 2C1HA 1EA0A 3HPXA 1SO4A 5KSWA 4QIUA 3DFNA 3B03A 5C54A 4K37A 2DJLA 4NU7A 2J27A 2PE4A 1T96A 4WY0F 2VKZG 3N73A 1W37A 3GX9A 5K3VA 2RKXA 2Z6JA 2QCFA 5KZDA 1OX4A 4L4LA 1EP1A 4O18A 3GAKA 4DPQA 1JQVA 5FI8A 5E0KA 4KKXA 5LHFA 4NZFA 1F74A 4UTTA 1OK6A 3O1NA 1AW2A 3UPBA 3UY8A 4JD4A 5HMSA 3CIXA 4MJZA 3DI0A 1ZAIA 1NSJA 1ZCOA 1TV8A 5GVJA 4UTTC 4MIMA 4MFEA 2TPSA 4PH6A 4G1KA 3EKLA 5U4NA 1IF2A 3FEMA 3GVGA 4NX0A 3FFSA 3O6CA 1JUBA 5DCDA 1SSDA 4JTLA 1U5JA 1SZGA 4AHQA 3LV6A 5D09A 4JYDA 1CI1A 3BPWA 3D0CA 1BKSA 3G1FA 3EXRA 1JQXA 4DF2A 3LXAA 1AK5A 1SZFA 4RKAA 2Z2UA 2DZSA 1DQXA 3TAKA 2W6RA 2E09A 1THFD 5LZLA 2NUXA 3IIXA 4ZQNA 3YPIA 4DXVA 1R2TA 1ZNNA 2DP3A 2NV1A 3M1ZA 3UZJA 4O54A 1GEQA 4UTUA 4HNVA 3EWWA 2A7NA 3STEA 3STGA 3LTYA 2YFNA 4IMGA 4HHPA 4LW7A 4UMAA 3M47A 2V2DA 3MW7A 2YDAA 1KV8A 1I2OA 2C18A 3PM6A 4AWTA 4CNPA 2V9DA 3CT7A 1GVSA 5K7JA 3RK8A 3PS7A 3IEBA 4MZ8A 3HF3A 8TIMA 4MKNA 4WD0A 3TK7A 4DQWA 2PRMA 1YTDA 1S5TA 3UWQA 1FX6A 3W07A 1WV2A 3C4UA 1GYLA 2QEZA 5G1YA 3MO7A 1KA9F 1OFAA 2ZZ5A 3W73A 1P4CA 1ME7A 2QCMA 3N14A 4JYEA 4LT9A 1UB3A 2RDUA 3L5AA 2FPYA 1JCXA 5ABTA 3OVQA 1ML1A 1XBYA 2OMAA 3WJSA 3TA6A 5FF2A 2V81A 4MOZA 4J9JA 3JRKA 1RQEA 2RFGA 3PUDA 3EX2A 3L68A 2OZ0A 3NG3A 1H5YA 1YDVA 2FTPA 3H54A 1HL2A 2H3DA 3MHGA 2GVLA 4N4PA 5KZMA 1TPC1 2BZNA 1FWTA 3LHWA 4MFDA 3DHDA 3LXBA 1F2JA 3NM3A 4TR9A 2OT1A 2B7NA 1H63A 1LYXA 4YCOA 5C2XA 1O4UA 2RH9A 3L5LA 5G4WA 3SJ3A 3W7HA 1ME8A 4MLJA 3EKZA 3FJ6A 3DFTA 1DQWA 2J9XA 3W2KA 2VEIA 1O5KA 2A6NA 4FF7A 4JX5A 1A5CA 3INPA 3JS3A 4KFPA 4QJ1A 4K36A 3T7VA 1LM1A 3W7CA 2BTMA 2Y7EA 2WKJA 2AAMA 1JCLA 3A5VA 3NAVA 4QSHA 3HG4A 4ALDA 2EPHA 3LCLA 1EP3A 4N6EA 1H7NA 1TRIA 3P5YA 4NUWA 1GYNA 3DI1A 1K8XA 2VFHA 3WK1A 1O95A 4YMZA 3FS2A 3WJYA 3EEGA 4UTHA 1PIIA 1OABA 2ATMA 1ZAJA 1ALDA 3PUEA 4GRSA 4BWLA 3GLCA 4GUIA 4LVAA 1ME9A 3P5ZA 5BMWA 2YW3A 3W7IA 2CU0A 1Z44A 4LV4A 4U4MA 1JRCA 2FQIA 1G7VA 1G4TA 3ZWSA 4HKPA 3DFOA 2CFFA 4OU1A 2Y70A 3HGRA 3PBWA 3U2OA 1RPXA 4O50A 1OFRA 3NNTA 2YXGA 3P80A 3QM3A 2B7OA 5G2WA 5MHBA 3TMQA 2WNNA 4GE8A 5F1VA 1XFBA 4DPPA 3NQEA 1JCYA 4ML9A 4QITA 5DXXA 2B7PA 1RQHA 1P0NA 1TYGA 3W7QA 1K8ZA 3DFQA 2X1RA 2Y7DA 3PBYA 3TW7A 3TX9A 3SIZA 1TQXA 3NPXA 1U83A 2TYSA 3GDTA 3M6YA 4D2JA 1GG0A 4O10A 5LNWA 5F1UA 3L0NA 4CQ8A 4A2SA 3W7DA 1YDNA 1KFJA 3LHTA 1WOAA 1PVNA 3PSWA 4NVTA 4Z1BA 3W71A 3LBMA 2H8ZA 4DEFA 1W0MA 4XZ9A 3S8HA 3LDVA 4NJKA 2R94A 1JCJA 4OQVA 4X3ZA 1A5SA 2ZRUA 5TBOA 3MI6A 4IUOA 2D73A 3HPSA 3NQVA 3DZ1A 3N2XA 4NXKA 1QOQA 3IIPA 4JDBA 1GVQA 1HO4A 4K6AA 3W75A 1N8FA 4LWWA 4GUFA 5FF7A 1KM5A 3N2MA 4HN4A 1XL9A 3P62A 4WY0B 2QDGA 3DENA 4LUJA 3WK3A 1MEHA 4NJIA 3N3MA 2QAFA 1QAPA 3P67A 3TC6A 1VLWA 2BSLA 1XUUA 2ATSA 3NR0A 5F2MA 4JTIA 4NQ1A 1OFBA 1G6CA 2DZVA 5HULA 4FX8A 3B8DA 2OT0A 3TW6A 4Y96A 2CLFA 3VCRA 4YL2A 1OK4A 2G97A 2ABBA 2BX7A 1OX4B 5F4SA 2X1SA 2BWGA 2ZFAA 2RDWA 3E02A 4ADSA 1VYRA 1T99A 4TMBA 1H50A 3A24A 4P61A 2C16A 5AC7A 1TO3A 4UNLA 3CQ0A 3A23A 2QCGA 1EWDA 2QUTA 1D3HA 3Q2DA 2Q3OA 3I6RA 1S5WA 3BG5A 3QC3A 3GKFA 1W1ZA 3GZ3A 1FWSA 4AH7A 1MO0A 1DKWA 3EXSA 5D30A 1PE1A 2GVGA 3NXFA 4JTFA 4UFMA 2GJLA 2VXNA 3H53A 1WX0A 2VOMA 2ZRZA 4AEOA 4JXCA 3G24A 1A5BA 1H62A 2QR6A 3TIMA 1XBVA 1PHQA 4JTTA 4TMCA 4FNTA 4K7YA 3W2UA 1KBIA 2AGKA 4OWGA 4WXZA 4UUIA 2F84A 3O16A 4EF8A 4CQAA 1FCUA 4CCCA 3GR7A 4FEZA 4JR5A 1L9WA 1QWGA 1MEWA 1KTCA 4JX4A 3O63A 5FEXA 1QFEA 2GUUA 5AHMA 3LHZA 1TQJA 1VPXA 2WOQA 1T8XA 4N2YA 4S1FA 1SO5A 4WZHA 1VHNA 4BFAA 4WOZA 3WJZA 5H91A 2G5WA 1TB3A 4M7TA 1LROA 1QCWA 3LTSA 3O15A 5KINA 1W5NA 4ORMA 4PC8A 3KVLA 3SGUA 3W87A 4ADTA 1TPFA 2ZZ2A 1IXPA 3M43A 5K2ZA 4EWND 5D05A 1D9EA 1UUMA 2NUWA 4H6KA 4S2BA 4WUIA 4MLRA 3HQ1A 5AYXA 3S42A 4H4IA 4WQ6A 1SZNA 3NPWA 4GC4A 1OFDA 2Y7FA 3MJYA 4IMCA 3W83A 4Q32A 1YPIA 5BRBA 2HMCA 3KOFA 3W7KA 3CM4A 4A22A 1SFLA 3SGZA 5G2HA 3NM1A 5G2IA 4JY9A 3EX1A 3EX3A 1ZAHA 2CLOA 7TIMA 4O19A 5BNKA 1Y0EA 1RZMA 3NQ8A 1IXQA 3PY2A 4UMCA 4OHQA 4BK9A 3CTLA 4RCXA 4UR8A 2NXHA 1WDWA 3LRMA 5FEWA 4A29A 3HOJA 3FYPA 3LB0A 3THQA 1QR7A 1V5XA 4QQ3A 1F05A 2WJZA 3SSJA 2XN2A 3LCWA 1NAL1 1TPB1 3B06A 4Z08A 2VFFA 3LCXA 4K8HA 3TV8A 5EL1A 5AYYA 3E49A 3VE9A 3HGOA 1VYSX 3QMSA 3TSBA 5CPMA 1FWWA 3Q58A 1RVGA 3HJZA 4K38A 3L2IA 4OGZA 5AC8A 1TV5A 4HSOA 5D32A 4AWUA 2QCNA 1YXCA 1YDOA 4FIQA 3S5YA 1OF6A 2YSWA 1QO2A 1Z41A 5LSMA 3QSTA 4FIRA 4L4MA 3MBDA 3W1UA 3UYCA 1I8JA 5I3FA 4FNQA 4A21A 5HINA 5TIMA 3TXZA 3FKRA 1W54A 1FWRA 1J2WA 3MYPA 4BI5A 3TSMA 2PRLA 3WJWA 3VFLA 1O5XA 5LKYA 3BGJA 4RR4A 1FDJA 3TQVA 3L66A 3NQMA 2FLIA 1L6SA 2EF9A 3ZWTA 1H7OA 3N19B 5FEZA 3LHYA 3LLDA 1PHWA 3BG9A 4GUHA 3RU6A 1FXQA 2X30A 1F6PA 4YLWA 2QJIA 3OG3A 4CNOA 3E9AA 1JVNA 4GFSA 1KM0A 1NF7A 2I1OA 1K8YA 4FX7A 3LOTA 1XDMA 4ZMGA 2C14A 5EY5A 1X8FA 1TJRA 4N4QA 3O06A 1N55A 5LNSA 3EWUA 3W7JA 2H90A 4JEQA 5L6UA 3L5MA 5I3IA 4NNCA 4JTUA 1KM1A 1H1YA 5G5IA 5HWNA 2BLEA 2ZA3A 4IJBA 4CCDA 1K03A 2JBMA 1DHPA 3LV5A 4YWIA 3C56A 1TTPA 2ISVA 1XCFA 1TJPA 1R2SA 3NZRA 1FBAA 3TE9A 3ZS4A 1KTBA 1X1ZA 4JNMA 3E0IA 2R14A 4GWEA 3G1YA 1DORA 1Z48A 4AHOA 5FEPA 1EX5A 3WK2A 3P74A 2A21A 1OVDA 4X22A 1DJQA 4WJEA 3S5OA 3UWYA 4RZ5A 4ZZ9A 3W2JA 2QJHA 3LHUA 4IPJA 4O16A 3HO8A 2V2HA 1UCWA 1SO6A 4QAIA 3U6WA 3GNNA 2EKCA 3IIOA 2C3ZA 1XXXA 2ZDRA 5D38A 3LCFA 3G1AA 3O8AA 2Y89A 1WOBA 2XFWA 5AHEA 3NL3A 4MZ1A 1FCVA 4QM1A 3M16A 4O53A 3L0KA 3O6YX 4K8EA 2Q8LA 5IM51 2G96A 3NO5A 1HO1A 3W86A 3TU9A 3NL2A 1FWNA 1BWLA 2OCZA 1O94A 3RLVA 3RLUA 4JTGA 2H8XA 1GJPA 1EPXA 2DZXA 2NUYA 4O1CA 4EIVA 4GUJA 1Q45A 4XWUA 4O28A 1GOXA 3LI0A 4LUIA 3C2FA 5DCBA 1KM6A 2Y62A 4NT0A 1J4EA 1LZOA 2QAPA 5TQLA 2WSRA 1ONRA 2P1FA 1K7FA 3IV3A 4FB7A 1KTNA 3LXCA 3G0XA 4O17A 2R91A 2J9ZA 2FB3A 5LNVA 3PVFA 3I65A 3CC1A 3PC0A 4N02A 3G1DA 2VC6A 2ZCGA 3ANYA 5DCEA 3PB2A 3T4CA 3B4UA 2CLHA 4AF0A 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 4C1L A;  1D3G A;  1KBJ A;  3W1N A;  1RR2 A;  2YPI A;  3BLF A;  4Z0J A;  3OEX A;  2VFI A;  2C13 A;  3R13 A;  3R2G A;  3LRL A;  1B4K A;  4MJM A;  5EBU A;  4RJE A;  3M41 A;  3M7W A;  3V1P A;  2YR1 A;  2C0A A;  1X6U A;  2Y7G A;  3UWW A;  3LCH A;  4UNK A;  5LGX A;  5KZE A;  1SZE A;  1B4E A;  3KVJ A;  1VGA A;  4AAJ A;  3EWX A;  3LX9 A;  3UWV A;  4AWS A;  1E51 A;  4O14 A;  1OFQ A;  1GPW A;  3W88 A;  3W2M A;  4IGH A;  1ZHA A;  3TDF A;  3MYO A;  2CLM A;  3O07 A;  3NPV A;  4GJ1 A;  2CLI A;  3BAR A;  1JRB A;  1J5T A;  2GJN A;  1R2R A;  5CZ0 A;  1GWJ A;  1O60 A;  1PL9 A;  3QRH A;  1H51 A;  3MMT A;  2CLE A;  2JK2 A;  3BO9 A;  4I7U A;  1L6Y A;  5G1T A;  4E0C A;  4S2C A;  1EB3 A;  3G1V A;  4DEL A;  1L2U A;  3C2E A;  1Q3N A;  3W84 A;  1OYC A;  4O1B A;  3CHV A;  1YXY A;  3ATZ A;  1DV7 A;  1JCM P;  5EPD A;  5DY2 A;  3K30 A;  3GKA A;  2CZD A;  1Q6O A;  2LLE A;  3SR7 A;  4NNB A;  1GTE A;  3W1T A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 4S39 A;  3QH2 A;  3WLT A;  4E5T A;  3CQH A;  4Q4O A;  2ZC8 A;  1CGX A;  1OBA A;  2GQ9 A;  3GND A;  4RX0 A;  5HJY A;  3V36 A;  3GG7 A;  4DO4 A;  1T8Q A;  2G37 A;  2UV8 G;  3W1X A;  1VRD A;  1W1T A;  2A7P A;  4MWA A;  4EAM A;  1MMF A;  1REQ B;  4HCH A;  2YZ5 A;  3G3M A;  4N6F A;  2PAJ A;  1DWI M;  1EOM A;  2ZAD A;  2C15 A;  3SY5 A;  1NFB A;  4RPQ A;  4MWA C;  1JDE A;  3K4D A;  3D6N A;  5C2G A;  3C61 A;  2X7V A;  5C7V A;  1VFT A;  4A8N A;  4G8T A;  4GGH A;  2FH8 A;  1OX6 A;  1TIW A;  2H9A A;  4UTW A;  2O9P A;  3KP1 A;  1LTD A;  5CLW A;  1TWZ A;  2PWG A;  2YL5 A;  4LC8 A;  4Q33 A;  4XIM A;  4UTW C;  6TAA A;  3EZ4 A;  4EPD C;  3HQN A;  1V0N A;  3PG8 A;  4LVB A;  1RXO B;  4H00 A;  3V0U A;  4TVU A;  1IT7 A;  1YTE A;  2VEL A;  2TMD A;  1RD6 A;  4Q8O A;  1ICP A;  4DVO A;  2X1I A;  2HK1 A;  3HQP A;  5E93 A;  1F3X A;  1DOS A;  2G3N A;  4M81 A;  4LUT A;  4DHG A;  2F2H A;  1P0K A;  2IQ0 A;  1JAK A;  4TX6 A;  3W22 A;  3W7O A;  1LBM A;  2ZOX A;  4S3C A;  4X9S A;  2GOU A;  5BZA A;  3HIJ A;  3LN3 A;  1ZB5 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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