2E2NA

Crystal structure of sulfolobus tokodaii hexokinase in the apo form
Total Genus 109
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
109
sequence length
298
structure length
298
Chain Sequence
MMIIVGVDAGGTKTKAVAYDCEGNFIGEGSSGPGNYHNVGLTRAIENIKEAVKIAAKGEADVVGMGVAGLDSKFDWENFTPLASLIAPKVIIQHDGVIALFAETLGEPGVVVIAGTGSVVEGYNGKEFLRVGGRGWLLSDDGSAYWVGRKALRKVLKMMDGLENKTILYNKVLKTINVKDLDELVMWSYTSSCQIDLVASIAKAVDEAANEGDTVAMDILKQGAELLASQAVYLARKIGTNKVYLKGGMFRSNIYHKFFTLYLEKEGIISDLGKRSPEIGAVILAYKEVGCDIKKLIS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords HEXOKINASE
publication title Crystal structures of an ATP-dependent hexokinase with broad substrate specificity from the hyperthermophilic archaeon Sulfolobus tokodaii.
pubmed doi rcsb
source organism Sulfolobus tokodaii
total genus 109
structure length 298
sequence length 298
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.1: Hexokinase.
pdb deposition date 2006-11-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01869 BcrAD_BadFG BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2e2nA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2e2nA01
1K8KA 1S3XA 4M7XA 4WQ5C 3DXMA 1BA0A 1GLLO 2IIRA 4LC9B 1QHAA 2E2OA 5AQYA 3WT0A 1NGDA 4BRLA 2CGLA 4JHDA 2P9UA 4HWIA 3BF1A 1MDUB 2FSKA 3KHYA 5ADXA 3ULEA 5BPLA 4H0OA 5AZJB 1QQNA 2CGJA 1X3MA 4XH5A 3H45C 5KPTA 5B8HA 2Q0RA 1YVNA 1YAGA 5KPRA 1XQSC 4FL9A 3MN6A 2QWPA 4QS7A 4Z94A 3OHRA 5KQDA 5AR0A 5AZJA 2E1YA 3L6QA 2NZTA 3H3NO 5KQ8A 1KAZA 4BR5A 5AQUA 3MK6A 3CETA 3RSEA 3WEEB 1NGAA 4A2BA 3GOIA 1DGKN 5AQIA 3D2EA 3CJ7A 1TYQB 1NGIA 4BC5A 4FSVA 2FF3B 4L3QA 2P9NB 2A42A 1D4XA 2P9IA 1TUYA 1MWMA 1E4GT 1XC3A 3VF6A 1C0FA 5F1XA 5F2RA 1TYQA 2QWOA 4FWLA 1R59O 2E2NA 2V7YA 1BWFO 3D7EO 4BRIA 1NGCA 3HM8A 2QXLA 3LDLA 4J8FA 4I6MB 4PL7A 4ISGA 4BR0A 1OKJA 2ASOA 1T44A 5AQXA 1Q18A 3QDKA 3BUZB 3LL3A 2I7NA 1T6DA 3ENOA 4YDUA 1NWKA 5AQWA 3ENHA 2Q0UA 1ATRA 4FOIA 1C0GA 3VEXA 3A5NC 2Q2RA 3DJCA 4Y0WA 4BRQA 1U2VA 3A5MC 3KVGA 2W40A 2HF3A 2ASPA 3FZLA 2A5XA 3L0QA 3M3ZA 3BEXA 1J6ZA 4PKGA 5FPMA 4BRCA 3VENA 5BN9A 3M6GA 5FPDA 2WUSA 2V51B 5AQOA 2V7ZA 4CI6A 2YI1A 2OANA 2ASMA 4H5WA 4BRNA 2YJFA 3ID8A 3VEVA 1QZ6A 3O1WA 3SLCA 5AZIA 4B1UB 2HF4A 4RCHA 4BRFA 3BF3A 1BOTO 2P9PA 3JS6A 4FPAA 1NGEA 2P9LB 3EZWA 3U9DA 3D2FB 4FPBA 5AQPA 3EKSA 2YCHA 4ISEA 3SMSA 5ADXH 2E20A 2P9SB 4CD3A 2Q97A 3VEOA 4BC3A 4KBOA 1ATNA 2IVNA 3LM9A 3MCPA 1GLFO 3VETA 1S22A 1HJOA 4GY2B 4BROA 2FXUA 5BPMA 3DAWA 3ZX2A 1T6CA 2P9SA 3U4LA 5FPNA 3ZETA 4B1XB 5JLFA 4BR4A 4RTFD 1K8KB 3DXMB 3VEZA 5AQJA 2VWBA 3HBTA 3EL2A 4WQ4C 3WUHA 3CJ9A 4CJ7A 4EIAA 4JHDB 2BTFA 2P9UB 3WQTA 1BDGA 2GTDA 1LCUA 3AAQA 3ULEB 3UKRA 3FFKB 3J8AA 1HX1A 1SAZA 3QFUA 3O4WA 4O5FA 5EVZA 1GLBG 1MWKA 3S41A 5AQSA 3VOVA 4BRAA 3I8BA 4EHTA 4FWNA 2ITMA 3IFRA 3CERA 3B8AX 4IZ9A 4H0VB 2ZWHA 4K42A 1QQOA 2QWRA 3IDHA 2F9WA 3RSEB 3C7NA 4JD2A 1IG8A 4H0YB 4H5NA 1HUXA 3D2EB 4FWQA 1BO5O 2HMPA 3H1VX 1SQKA 2P9IB 4DB3A 4K41A 5AFUA 5AQNA 3ZEUA 4DHYA 3JXUA 3EN9A 1KAXA 3CJ1A 3LDQA 4M7YA 5EY4A 4B1ZA 5BN8A 3FR0A 4MO4A 3P4IA 5BRDA 5LY3A 3ZX3A 3VESA 2ZGZA 3MMVA 1HKCA 3G25A 5KPZA 2GUPA 3L4IA 4JAXA 1BU6O 1NGFA 1H1VA 3W0LA 4BGAA 5BREA 4WYBA 4EFHA 2DPNA 5FPEA 4BVPA 1EQYA 2UYTA 1HLUA 1U2VB 1RFQA 3FZHA 1BUPA 2A40A 3A5LC 1RGIA 2BUPA 1NM1A 4IJAA 5BPNA 1NGJA 1MA9B 3CIPA 3A8YA 2ZF5O 2Q1NA 3LDOA 4AM6A 2AA4A 5BR9A 3A0IX 3LDNA 4AM7A 2FLOA 3CJCA 1XUPO 3O5BA 5AZIB 5CE3A 3VF2A 4H5RA 4CZLA 2QWLA 2P9PB 4FWRA 1IJJA 4EAHD 3FLCO 4BQLA 3UB5A 4BRKA 2FF6A 3H46O 2HOEA 1ESVA 3CJAA 1G99A 4CBUA 5AQVA 1BA1A 3VGKA 3GDQA 1V4TA 3QMLA 2YHWA 4ISFA 5AQKA 1RDWX 3TU5A 3IUCA 2YHYA 4RWTA 5TKYA 4CBWA 1NGGA 3F9MA 4PKHA 5AQLA 2IVPA 2A6AA 3ZETB 3VPZA 1Z05A 3HTVA 1GLJO 4O8KA 3MDQA 2I7PA 4K25A 3AAPA 2CH5A 2FSNA 3VGLA 3GG4A 3KZBA 5I9EB 2PBDA 3R9PA 2NRHA 2QWMA 5AQQA 3H1QA 3WQUA 3EKUA 2E1ZA 4YDUC 1CZAN 5AQTA 3UE5A 3UKRB 1KXPA 3VF4A 2IVOA 3CHWA 5AFUH 4BRGA 1E4FT 4FOEA 4CZHA 4NB4A 2D0OA 4BG9A 1WOQA 1NGHA 1X9JA 4XH4A 4K43A 4BREA 4CZIA 2D4WA 3QFPA 1GLAG 1JCGA 4H0PA 3SMPA 3MN9A 3CI5A 3C7NB 4JD2B 4BC4A 4BC2A 4EHUA 3MN7A 3VERA 2AP1A 4BQZA 1GLCG 3O08A 5LJWA 2V52B 4BR9A 2P9KA 2E2PA 1JCEA 3IMXA 4FWKA 3A5OC 3ZEUB 4F9OA 3CQXA 2J4RA 4CZEA 2YHXA 4B9QA 3UKUA 5E26A 2GEMA 4DCHA 2D1KA 3O6WA 4CZGA 3SK3A 3R8EA 2CH6A 1GLEG 4A62A 2E8AA 3M1FA 4FWOA 3VEYA 1BG3A 3BP8A 2EWSA 2VCPA 3GE1A 4QS8A 5EX5A 4CZFA 4C23A 5JICA 4BRMA 1LOTB 3H6EA 2D0PA 1GLDG 3I33A 4IO8A 2VYPA 4FO0A 5AQRA 1NLVA 5LJVA 1QZ5A 3W3DA 2Q36A 2W41A 3O8MA 4B1YB 4H0TB 3H3OB 4GNIA 3WEEA 5BRFA 1ZC6A 4B1WB 4M63C 3FZMA 4XEIA 2H3GX 5EOYA 1JCFA 3C0BA 4MLEA 2QWNA 2P9NA 1YXQA 2GWKA 2E2QA 2E88A 4H0XB 4B1VA 1NGBA 3R6MA 3VGMA 5BRHA 2YJEA 4FWPA 5JLHA 3GBTA 3GL1A 3QB0A 3DWLA 3U9ZA 4CD1A 3VEWA 5E84A 5AQZA 4I6MA 4IXCA 3SJHA 4BR7A 4H03B 5AQFA 3WXJA 4JN4A 4WQ4A 4XH1A 4H5VA 4HTLA 5AQMA 2GWJA 4WQ5A 1WUAA 2GELA 3O80A 2NLXA 2ZGYA 2A3ZA 4A2AA 3WXIA 5AQGA 3EO3A 4BRHA 4BVOA 4IWVA 2F9TA 4NO7A 1HKBA 3WXKA 4DQ8A 5F0XA 3TPQA 3CJBA 2FSJA 3AARA 1Y64A 1NMDA 4PL8A 3ZX0A 3QICA 3O1BA 4CZJA 3ATVA 1X3NA 3LM2A 3LDPA 3MN5A 1DKGD 4H5TA 1HPMA 2CGKA 3FZKA 1U6ZA 3HZ6A 2QM1A 3DXKB 4MLHA 3FZFA 4A61A 1YUWA 4IJNA 2QW9A 3AY9A 2Q31A 4CZKA 1SZ2A 3WXLA 1KAYA 3DXKA 4QS9A 4FWSA 1V4SA 4BRDA 4CBXA 4BG8A 3QBXA 1ZXOA 3U8XA 2P9LA 4JNEA 1ZBSA 2QWQA 3FGUA 5AQHA 1QQMA 4CZMA 1DEJA 5JMVA 3D2FA 4PKIA 4BR2A 5EXWA 2KHOA 3FE1A 3HI0A 3HSCA 1Z6RA 1HKGA 4MO5A 2P9KB 1P8ZA 2PAVA 3CQYA 4BGBA 5ELZA 1NBWA 3ATUA 3UKUB 1ATSA 4FWMA 2A41A 4BRPA 3QBWA 1TUUA 4E1JA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4BDYA 2X78A 4M7XA 4O55A 2E5LK 1BA0A 1YTAA 3ALYA 1RT2A 4LC9B 4IEIA 1QHAA 4E7KA 2P5GA 5AQYA 3WT0A 3AVIA 4CJRA 2P9UA 1HNXK 3SQ1A 1YHQN 4LY7A 4YORA 5CHIA 5BPLA 2CGJA 1X3MA 3H45C 4BWMA 3P5JA 3VQDA 3IAYA 1XQSC 3MN6A 2QWPA 4Z94A 1S6QA 2RKIA 5KQ8A 1KAZA 4E0DA 3MK6A 3RSEA 3OS1A 3T1AA 3GOIA 5AQIA 3KKSA 3JSMA 3D2EA 1NGIA 1WSFA 1D4XA 4DS5A 3MEGA 1MWMA 5JS2A 3VF6A 1T03A 2IDOA 1C0FA 5F1XA 4CGIA 5F2RA 2QWOA 1R59O 1JLQA 1ZYQA 4O44A 1BWFO 4YY3K 1NGCA 1L5UA 4J8FA 4PL7A 1OKJA 4IOAL 1T44A 3CPWM 1JL2A 1BGXT 4KI6A 4HUFA 3LL3A 5C10A 1T6DA 1B9DA 3OVNA 5AQWA 2YNFA 3OYKA 4CF8A 1JXBA 1J6ZA 4JK8A 2UUAK 4GV9A 4YOXA 3VENA 5BN9A 3M8RA 2VWKA 3M6GA 5FPDA 1U04A 2QI2A 2V51B 2WUSA 1WLJA 2V7ZA 3CMAN 2YI1A 4FJKA 1Q82O 3AVAA 2ASMA 4BRNA 2YJFA 2NRTA 3VEVA 4BDZA 1VAZA 3I8DA 3LDSA 3K2PA 2HF4A 4RCHA 5CY4A 4BRFA 3OYAA 3BF3A 4O5BA 4BE0A 4CK3A 3V9UA 4W5OA 1WN7A 3L2WA 1TKXA 5I3UA 3DLKA 3OYMA 1S1VA 1NKEA 3D0PA 1IG9A 2ZE2A 4FJHA 5KGXA 3AVHA 4A5AA 4ISEA 4OPKA 2E20A 3OBYA 4FJGA 2P9SB 1REVA 4CD3A 1VQKN 1G15A 3MCPA 1HJOA 2FXUA 5BPMA 3NH1A 4Q5VA 3DAWA 1T6CA 3ASMA 3WNHA 3E9OA 3DXMB 1RCHA 4CEEA 3PV8A 1KD1O 5AQJA 1IO2A 4WQ4C 2EHGA 3AAQA 3UKRA 4PY5A 5CZ1A 4AHRA 2GBZA 4LD0A 1GLBG 1MWKA 4DV4K 4BRAA 3I8BA 3CERA 4H0VB 2YKMA 1WAJA 3KIOA 3RVCA 2QWRA 3IDHA 2F9WA 1IG8A 4AHVA 4CJTA 1QSLA 3E66A 2EX3A 1BHLA 1BO5O 4KKOA 2HMPA 4F3TA 3H1VX 4HUGA 4Z4FA 2HVIA 1HQUA 4CHOA 3F5TA 2DFHA 4YOWA 3HPHA 1C0TA 1U45A 1W97L 5EY4A 4B1ZA 3OYDA 3TAQA 4CJSA 1HNVA 1ILYA 1VK0A 4M3WA 1BIUA 1HKCA 3OY9A 4NXMK 3V4IA 3QIOA 3Q7BA 3L2RA 2O8EB 4JAXA 3CM6A 1IBLK 2NNWA 2OA8A 1HYZA 1NGFA 4Z4CA 4C8LA 4DV5K 2DPNA 4KHUA 5FPEA 4FJLA 4BVPA 1EQYA 1U2VB 3U6FA 3SPZA 1RGIA 4FW1A 5AJ3K 1CZ9A 1SL2A 3TAEA 1OVQA 4LSLA 4CK2A 4B8CA 1ZBUA 3A8YA 3OYCA 3CFPA 1RBVA 4OGCA 1EO1A 3CJCA 4R5PA 2ITGA 3O5BA 5AZIB 4CE9A 4GMJB 3N4QA 2P9PB 4ILHA 1CZBA 2KQ2A 3T7ZA 3CMEN 4FJNA 1VQNN 3BZKA 4W5QA 4JI2K 1EX4A 1RT6A 1RBRA 4L8RB 3GDQA 1L3SA 3WNEA 1NJWA 2YNGA 4F3OA 4CBWA 3LP2A 4ZTFA 4PKHA 2A6AA 4FK2A 3CPEA 2FC0A 1GLJO 4O8KA 3MCAB 4K25A 4JK9A 5DM7L 4YOVA 2FSNA 4DV2K 3GG4A 5I9EB 2PBDA 4LF4K 2QWMA 3S3MA 1RT7A 3LPUA 1JLBA 4CHQA 5AQTA 1HR0K 4IOXA 2R7YA 2IVOA 3CHWA 3T1YK 1RDAA 2HBKA 3DI6A 3D45A 4C8NA 4GVEA 1VQ5N 1X9JA 2Q3SA 4K43A 3QNOA 3SMPA 4KHWA 2F8SA 3MN9A 4W5RA 4BC4A 4YOUA 2O8FB 3C6TA 2XY8A 4DQQA 4BWJA 2AP1A 4BQZA 4KTZA 2V52B 1S9GA 3ZT0A 2VGMA 4CEQA 2P1JA 3MEEA 3A5OC 3HK2A 1TVRA 2J4RA 2E6MA 1FXXA 4CJFA 1IKXA 3I55N 4DTMA 1I3AA 2D1KA 3O6WA 3CCLN 4CHZA 3J81O 4C8KA 1BCMA 4A62A 3C65A 2O8CB 1BG3A 3BP8A 2EWSA 3GE1A 3O4QA 4CGFA 4FJ8A 5FRNA 4HCBA 3P39A 1T05A 5A2QO 2JWLA 5FROA 3MXMA 2OPQA 1FJGK 4M3XA 2NRVA 4HCCA 4IO8A 3C6AA 1R0AA 3HM9A 4I9LA 5LJVA 3W3DA 5HP1A 3L3UA 3KK1A 4B1YB 1RT3A 3H3OB 1VSHA 4PUOA 4JI5K 1ZC6A 2FBVA 3NAEA 4XEIA 1J9AA 2KZMA 2H3GX 5KRSA 1JCFA 1D9DA 3QETA 2IS3A 3HT3A 1VQLN 1O1WA 1YJWN 2XY6A 3CD6N 4FZXC 3QNNA 5HL7L 4ICLA 1QQCA 2IAJA 4FWPA 5FDLA 2Z1GA 4I6MA 2Y1IA 3SAHA 3SYZA 2HHQA 5AQFA 3WXJA 3SQ4A 4XH1A 4DSFA 4O0JA 1FW6A 3AVFA 3OJSA 3SV3A 4BVOA 3K0SA 3WXKA 2O8BB 1K6YA 4IO9L 4FM1A 3AARA 1Y64A 4LF6K 3MECA 4CFBA 3O1BA 2B5JA 3LM2A 3MN5A 4B9SA 3FZKA 4CJQA 2QM1A 1YT3A 4CECA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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