2E2OA

Crystal structure of sulfolobus tokodaii hexokinase in complex with glucose
Total Genus 112
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
112
sequence length
299
structure length
299
Chain Sequence
MMIIVGVDAGGTKTKAVAYDCEGNFIGEGSSGPGNYHNVGLTRAIENIKEAVKIAAKGEADVVGMGVAGLDSKFDWENFTPLASLIAPKVIIQHDGVIALFAETLGEPGVVVIAGTGSVVEGYNGKEFLRVGGRGWLLSDDGSAYWVGRKALRKVLKMMDGLENKTILYNKVLKTINVKDLDELVMWSYTSSCQIDLVASIAKAVDEAANEGDTVAMDILKQGAELLASQAVYLARKIGTNKVYLKGGMFRSNIYHKFFTLYLEKEGIISDLGKRSPEIGAVILAYKEVGCDIKKLISD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords HEXOKINASE
publication title Crystal structures of an ATP-dependent hexokinase with broad substrate specificity from the hyperthermophilic archaeon Sulfolobus tokodaii.
pubmed doi rcsb
source organism Sulfolobus tokodaii
total genus 112
structure length 299
sequence length 299
ec nomenclature ec 2.7.1.1: Hexokinase.
pdb deposition date 2006-11-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01869 BcrAD_BadFG BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2e2oA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2e2oA01
1OKJA 3B8AX 2FF6A 2P9UB 3H1QA 4NO7A 1X9JA 3HZ6A 3O1WA 3GOIA 3KVGA 1ATRA 5BRDA 5KPRA 3O1BA 5AQVA 4BQZA 4XH5A 5AQGA 1GLDG 2V52B 3I33A 5LY3A 3FFKB 3R8EA 2YJEA 5JICA 2GWKA 3FR0A 5FPNA 5EVZA 3UE5A 3O5BA 1ZBSA 1U6ZA 2VWBA 1YAGA 3U4LA 3FZFA 2QXLA 2ASOA 2Q2RA 2CGKA 3MDQA 1NGIA 4H5RA 4CD1A 3W0LA 2ZWHA 4MLEA 3ZEUA 4K25A 5FPEA 5BR9A 1C0GA 2UYTA 3H3NO 2HMPA 3MN5A 5BREA 1WOQA 5AQQA 1D4XA 2I7PA 3BEXA 1RFQA 3ZEUB 1JCEA 1BA1A 4BGBA 2A40A 3RSEB 3ATVA 2FSJA 1NGJA 4YDUA 4A61A 4BG8A 4EHUA 1WUAA 2E2QA 2H3GX 4A62A 4FOIA 3VERA 2DPNA 3R6MA 1XC3A 2FSKA 1U2VB 4JNEA 1S22A 3VEZA 3UKUA 2NRHA 2YHWA 5BRFA 1YVNA 4RCHA 4O8KA 1TUYA 2BTFA 1RDWX 2BUPA 4B1UB 1NGAA 4BRDA 3DXMA 3WXKA 1JCGA 4H0VB 1BDGA 1HLUA 3KZBA 4CJ7A 4K41A 1BO5O 5B8HA 3DAWA 3CJAA 3L4IA 2FXUA 1HPMA 4H5VA 3UKUB 1KAZA 4BGAA 2YHYA 3HSCA 3D2EA 3EL2A 4EAHD 5AFUA 5LJWA 1MA9B 3DXMB 2ITMA 1QZ6A 1HUXA 4EHTA 5F0XA 1MDUB 4M7YA 4CZGA 1ESVA 1T6DA 4A2BA 5AFUH 3BF1A 3LDQA 5F2RA 4BREA 5BPNA 1HKGA 2HF4A 2Q36A 1BA0A 3U9DA 4CZEA 2Q97A 2W41A 5AQNA 3JXUA 4DCHA 2PBDA 2F9TA 5EXWA 3QFUA 3D2FA 4AM6A 5I9EB 3UKRA 3ENOA 3MN7A 1NBWA 1NMDA 1X3NA 2P9KA 4CZJA 3ENHA 3SJHA 3D7EO 4L3QA 2Q0RA 2GELA 3VGMA 4FO0A 4XEIA 1XUPO 2P9LB 2P9IA 3O6WA 4BR9A 4EFHA 5AQLA 2A3ZA 4FWSA 1CZAN 5AQFA 5FPDA 4QS8A 3TU5A 2VYPA 3UKRB 1BWFO 2P9NA 1GLCG 3H46O 2P9KB 4RTFD 4JN4A 2IVPA 3LL3A 4PKGA 2QWNA 4IWVA 2P9IB 5AQZA 3IFRA 3VESA 1HKBA 1E4FT 3QBWA 3A5OC 2E88A 1BU6O 5AQXA 3SMSA 1NGCA 1HX1A 1ATNA 3VGKA 4FOEA 3FGUA 4IZ9A 3CETA 4CBUA 3ZX3A 3HI0A 2QW9A 2WUSA 4BC2A 3VETA 2OANA 3BP8A 4AM7A 1QQOA 1LCUA 4H0PA 3ID8A 2ZGYA 2NLXA 3M6GA 1KAXA 4NB4A 3CJBA 3MN6A 2E2NA 3HTVA 2IIRA 3LDPA 5AQSA 5JMVA 2QM1A 3ULEA 3VEXA 4PKIA 5AZIA 2E2OA 3H3OB 3SK3A 3WEEA 4DHYA 3ZX2A 3JS6A 2ZGZA 3VENA 3I8BA 4IO8A 4F9OA 3H45C 1Z05A 4JHDA 1NWKA 4BQLA 3W3DA 3ULEB 4BVPA 3CIPA 4BRAA 3QBXA 2KHOA 3WEEB 4H0OA 2AA4A 1NGDA 2A5XA 3GG4A 4M7XA 4BR4A 2FSNA 1GLEG 3IUCA 4RWTA 5JLFA 1K8KA 4IJAA 4JHDB 3A5NC 1BUPA 1NGGA 4CD3A 3LM2A 1KXPA 5AQIA 3VEYA 2CGJA 1NGBA 3FZHA 4I6MA 3U8XA 4CZFA 1T44A 5AQMA 4CZMA 4BR0A 5KPZA 1YUWA 3WQTA 3QDKA 4PL7A 2ASPA 1K8KB 3O8MA 4XH1A 4BRMA 3O80A 4FWMA 1DEJA 2Q1NA 3ZETA 4JD2A 4B1ZA 3G25A 4FPAA 3F9MA 4I6MB 4IJNA 5KQ8A 4FWOA 4FWRA 2D4WA 4CI6A 3UB5A 1SQKA 2YJFA 3MMVA 2V7YA 1V4SA 4BRLA 3EN9A 3CI5A 3R9PA 4H5NA 3ZETB 4JD2B 4BRIA 2CH5A 4QS7A 3WXJA 1NGHA 4Z94A 2GUPA 1C0FA 1MWKA 1S3XA 3D2EB 1BG3A 3GBTA 4FWLA 4MLHA 5E84A 2YHXA 3VPZA 3MN9A 2QWPA 2A6AA 2GWJA 3CQYA 5EY4A 4JAXA 3DXKA 4FWKA 2J4RA 2YCHA 4FWPA 2D0PA 2A41A 2ZF5O 1QQNA 2HF3A 4PL8A 3HM8A 5AQWA 2P9SA 1R59O 1QHAA 2QWOA 3D2FB 1DGKN 1GLFO 3DXKB 2E1YA 3U9ZA 2F9WA 3FLCO 3H1VX 2AP1A 3WQUA 3QFPA 3CQXA 1RGIA 3VEWA 4H03B 4ISFA 1GLJO 4GY2B 4BRNA 3CJCA 1MWMA 1SAZA 2ASMA 2P9SB 1GLBG 4CBWA 2P9NB 4B1XB 3AY9A 3ZX0A 2P9UA 3FZLA 5BPLA 3GE1A 3IMXA 3A8YA 4BR5A 3GL1A 4BRHA 5BN8A 3TPQA 3QMLA 3VGLA 3FZKA 4CZIA 4CZKA 1IG8A 3M1FA 4XH4A 4BC4A 2D0OA 3EZWA 3EKSA 4K42A 4MO5A 4QS9A 5AQHA 5BN9A 2Q31A 3A5MC 4ISEA 4CZLA 3LM9A 3WXIA 1IJJA 1ZXOA 4WQ4C 3VOVA 3VF2A 4BRPA 1G99A 5AQTA 3BF3A 5F1XA 4H5WA 3OHRA 4BVOA 3EKUA 1E4GT 1V4TA 2IVNA 4ISGA 1H1VA 2E1ZA 4WQ5C 3WUHA 1ATSA 5AZIB 3ATUA 1KAYA 1J6ZA 4GNIA 4BG9A 4HWIA 1LOTB 4BC5A 5AZJA 3CJ9A 4BC3A 4LC9B 3HBTA 3AARA 2Q0UA 2E2PA 4BRKA 3RSEA 4BRFA 3WT0A 1T6CA 3CHWA 4DB3A 2PAVA 2EWSA 5AQPA 1GLLO 1Y64A 1NGEA 3FZMA 5LJVA 2NZTA 1SZ2A 5AQJA 5AZJB 4H5TA 4BR7A 3M3ZA 3H6EA 1U2VA 3QB0A 4CZHA 4J8FA 3LDNA 2QWRA 4E1JA 3L6QA 4FPBA 5AR0A 3SMPA 1ZC6A 3GDQA 3J8AA 1Q18A 2IVOA 3EO3A 4H0YB 3MK6A 4HTLA 4H0XB 3LDOA 2V51B 2CH6A 3LDLA 1NLVA 5BRHA 5EOYA 2QWLA 2E20A 2I7NA 3FE1A 2YI1A 4DQ8A 2FLOA 4EIAA 1DKGD 2E8AA 1NGFA 5E26A 4B1YB 1BOTO 1GLAG 3DWLA 4KBOA 5ELZA 5AQKA 4H0TB 3L0QA 1QQMA 3AAPA 5AQOA 3VF4A 5KQDA 2P9PA 4FWNA 5TKYA 4C23A 3P4IA 1HJOA 1QZ5A 1XQSC 3IDHA 2GEMA 2FF3B 4WYBA 4A2AA 4IXCA 4MO4A 2HOEA 1TYQA 1YXQA 3DJCA 3QICA 4FSVA 4WQ4A 5FPMA 5ADXA 1JCFA 2CGLA 1NM1A 2P9PB 3VEOA 4CBXA 2A42A 4FL9A 2V7ZA 3S41A 1Z6RA 3C0BA 3O08A 5ADXH 4WQ5A 3CERA 5AQUA 2P9LA 2D1KA 5KPTA 5AQRA 4B1VA 4BRQA 4Y0WA 3SLCA 1TYQB 3CJ1A 3VEVA 3MCPA 4YDUC 3BUZB 3WXLA 2QWQA 4BRGA 3KHYA 1P8ZA 4BRCA 5JLHA 4B1WB 4PKHA 1TUUA 3A5LC 1HKCA 3AAQA 5EX5A 3C7NA 1X3MA 5BPMA 4BR2A 3CJ7A 3VF6A 2VCPA 3A0IX 4B9QA 2GTDA 5CE3A 4FWQA 3O4WA 2W40A 1EQYA 4K43A 5AQYA 4BROA 2QWMA 4M63C 4O5FA 3C7NB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1YJNN 3OJUA 4OPHA 4E0DA 5MLCQ 4NO7A 3ZSVA 3CMAN 3M8PA 1QVGM 3NGYA 1DTQA 3JYTA 5E41A 5A2QO 1GLDG 4CF9A 4LF9K 3DLGA 5JICA 2GWKA 1VQPN 5IT9O 2VWBA 4CJVA 4CECA 4A59A 3KK2A 4CD1A 5GINA 4CJQA 4MLEA 3RRHA 1YTUA 2E5LK 1Q9YA 4KB0A 3TR8A 1C0GA 3LWMA 2UYTA 1YIJN 4CW7B 1WOQA 5AQQA 3OYIA 3OYNA 3K59A 3KK1A 2GBZA 4YOUA 2EHGA 1JCEA 4BGBA 1NK8A 3SV3A 4BE0A 2R7YA 4WFAL 3ATVA 3M8QA 3B6PA 4EHUA 4E19A 1VQMN 4IKFA 1WUAA 2H3GX 4FOIA 1LWFA 2KW4A 3VERA 1WSIA 1XC3A 5JS2A 2HW3A 4B3MK 5HROA 3VEZA 5GAEP 3DOKA 2NRHA 3Q7BA 4IO9L 5BRFA 4O8KA 1HYVA 2BTFA 1NGAA 1JCGA 4H0VB 4DTOA 1C1AA 4CJ7A 4GKKK 4JKFA 4LH5A 5B8HA 3CJAA 1XNQK 4CJWA 1BI4A 1W7AA 5AFUA 1K73O 1MA9B 4MFBA 3NF9A 3KLFA 4F3OA 4FXDA 1QZ6A 1HUXA 3B6OA 4EHTA 1MDUB 4CGGA 5AFUH 3BF1A 3LDQA 5BPNA 2VGNA 4CIGA 1BA0A 3U9DA 1NK0A 4DTPA 3AVNA 3JXUA 5AQNA 2PBDA 4DCHA 4KTQA 5EXWA 4DQQA 1DT9A 4AHCA 3ENOA 3I8DA 4CF0A 4B9VA 1GOBA 3NFAA 1X3NA 3ASMA 1TAQA 1WSGA 4L3QA 4EFHA 2OTLN 2P9IA 2A3ZA 4FWSA 5AQFA 4UY8O 3TU5A 2VYPA 3SQ0A 3O9UA 2FBVA 3QNNA 1SV5A 1XWLA 3CC2N 4DF4A 3KKSA 1BQNA 3LL3A 1ASUA 4IWVA 2P9IB 5AQZA 1TKDA 3MCAB 4DSEA 1JXEA 3VESA 4CHOA 4DV5K 1E4FT 3K5NA 1HR0K 3SMSA 3C94A 1NGCA 3SAFA 2DY4A 2OZMA 1LW2A 1NK7A 3AO5A 1W9HA 4IZ9A 4CBUA 3ZX3A 3DLKA 3O3HA 4X65K 3HXMA 4AHSA 1RT5A 3M6GA 4NB4A 1QSYA 3MN6A 2AJQA 3CMEN 1LV5A 3VEXA 2YNGA 2B5JA 3HL8A 5KRSA 5J2QA 4KHWA 3ZT3A 1TK5A 3I8BA 2VGMA 3PLAA 4ILHA 1Z25A 4BQLA 4BDZA 3AO3A 3QBXA 2KHOA 1HNIA 4DWIA 3PSIA 1ZBHA 3GG4A 1LW0A 3HM9A 2FSNA 4JS4A 4JKEA 4IJAA 4EZ6A 1JL2A 1C0UA 2OTJN 4CE9A 2RKIA 1KXPA 1SS6A 1DTTA 3U8XA 3S3MA 5AQMA 3THWA 1KQSM 3THVA 4I9QA 4OPKA 1BCOA 2ASPA 4Z4HA 4MDAA 2F4VK 1ILYA 2G8KA 4GV3A 4OX9K 3HVTA 4B1ZA 1ZYQA 2O8FA 4GVMA 4FPAA 1Y97A 5KQ8A 5I42A 3THWB 1RT2A 5AJ3K 4CI6A 1RT6A 3OYBA 3ZYYX 1WSEA 1V4SA 2KQ2A 1FK9A 2PFUA 4ICLA 3AVBA 3EN9A 4H5NA 1IV0A 2NRXA 5LMUK 2CH5A 5HLFA 2G8FA 3J81O 3SQ1A 5M1KA 4KI4A 1S3XA 1IBLK 1BG3A 3GBTA 3T7ZA 1JXBA 4DFMA 2XHBA 3VQAA 4M45A 1YT3A 3LALA 4DLGA 3OS0A 2ZF5O 4BWMA 3EY1A 1TGOA 1S1VA 4CEZA 1B9FA 2A1RA 5HP1A 4KHQA 1DGKN 1IBMK 4RW4A 2BE2A 3HPOA 2F9WA 4E7KA 4H03B 4ISFA 1GLJO 4GY2B 4N47A 4C1NI 3CJCA 3CG7A 1S72N 1KC8O 3SUQA 4JRPA 4CBWA 3SNNA 3SYZA 1D8YA 3HK2A 2DFEA 1IKVA 3TTCA 3AY9A 3CFOA 3MXMA 3OYMA 1OH5A 3MXJA 3ZLJA 2FC0A 3GE1A 2X6NA 1ASVA 4BRHA 5BN8A 3H08A 3VQDA 4CZKA 3PIPL 4XH4A 4KB1A 2A1SA 4NLCA 4CHPA 3EKSA 4Z4CA 3ULDA 4ID5A 2OCEA 3O9SA 5GADP 2IC3A 4FJ9A 3RMCA 1ZBIA 2YKMA 2Y1JA 5AQTA 4CFBA 3SAHA 4H5WA 3OHRA 4BVOA 1E4GT 1HNXK 1H1VA 4BE2A 3WUHA 1RDUA 2NRVA 1LWCA 2W42A 3E9OA 3HOSA 4Z4EA 4CGHA 3CJ9A 3V1RA 1S6QA 3U6FA 2E2PA 4BRKA 3RSEA 3P83D 3WT0A 3HOTA 3LANA 1TKZA 2RHKA 1GOCA 4CERA 5AQJA 4RW7A 4O5BA 2WFBA 4BR7A 3M3ZA 1RT3A 3EEQA 1A5WA 1BIZA 5C2FA 2ZJRL 2D0CA 2QWRA 3C6TA 4E1JA 3P31A 4FJ8A 4DR2K 3NAEA 1J9AA 3QO9A 3L6QA 5AR0A 5DMRA 1Q18A 1WNSA 1T03A 3LDOA 2ITGA 1A5VA 3NH2A 3T19A 4CGIA 1E3MA 1DKGD 4B3SK 1NGFA 5EU7A 2VWKA 4B1YB 3DWLA 4KBOA 3T1AA 4FK4A 3F73A 1TL1A 4BWJA 4H0TB 3NF6A 1HJOA 1K6YA 3MX2A 3QETA 4L8RB 2GUIA 3CCRN 3P5JA 3OYEA 3SUOA 2I5JA 1XQSC 3LDSA 3VQ8A 1Q82O 1ZBLA 4JKGB 4A2AA 5GIOA 1CZBA 3CCSN 4B3OA 4M3RA 1TVRA 1DLOA 4CHQA 2V7ZA 3S41A 4DFJA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1OKJ A;  3B8A X;  2FF6 A;  2P9U B;  3H1Q A;  4NO7 A;  1X9J A;  3HZ6 A;  3O1W A;  3GOI A;  3KVG A;  1ATR A;  5BRD A;  5KPR A;  3O1B A;  5AQV A;  4BQZ A;  4XH5 A;  5AQG A;  1GLD G;  2V52 B;  3I33 A;  5LY3 A;  3FFK B;  3R8E A;  2YJE A;  5JIC A;  2GWK A;  3FR0 A;  5FPN A;  5EVZ A;  3UE5 A;  3O5B A;  1ZBS A;  1U6Z A;  2VWB A;  1YAG A;  3U4L A;  3FZF A;  2QXL A;  2ASO A;  2Q2R A;  2CGK A;  3MDQ A;  1NGI A;  4H5R A;  4CD1 A;  3W0L A;  2ZWH A;  4MLE A;  3ZEU A;  4K25 A;  5FPE A;  5BR9 A;  1C0G A;  2UYT A;  3H3N O;  2HMP A;  3MN5 A;  5BRE A;  1WOQ A;  5AQQ A;  1D4X A;  2I7P A;  3BEX A;  1RFQ A;  3ZEU B;  1JCE A;  1BA1 A;  4BGB A;  2A40 A;  3RSE B;  3ATV A;  2FSJ A;  1NGJ A;  4YDU A;  4A61 A;  4BG8 A;  4EHU A;  1WUA A;  2E2Q A;  2H3G X;  4A62 A;  4FOI A;  3VER A;  2DPN A;  3R6M A;  1XC3 A;  2FSK A;  1U2V B;  4JNE A;  1S22 A;  3VEZ A;  3UKU A;  2NRH A;  2YHW A;  5BRF A;  1YVN A;  4RCH A;  4O8K A;  1TUY A;  2BTF A;  1RDW X;  2BUP A;  4B1U B;  1NGA A;  4BRD A;  3DXM A;  3WXK A;  1JCG A;  4H0V B;  1BDG A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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