2E5C | Genus

Total Genus 159

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	159
sequence length	476
structure length	466
Chain Sequence	EFNILLATDSYKVTHYKQYPPNTSKVYSYFECREKKYEETVFYGLQYILNKYLKGKVVTKEKIQEAKDVYKEHFQDDVFNEKGWNYILEKYDGHLPIEIKAVPEGFVIPRGNVLFTVENTDPECYWLTNWIETILVQSWYPITVATNSREQKKILAKYLLETSGNLDGLEYKLHDFGYRGVSSQETAGIGASAHLVNFKGTDTVAGLALIKKYYGTKDPVPGYSVPAAEHSTITAWGKDHEKDAFEHIVTQFSSVPVSVVSDSYDIYNACEKIWGEDLRHLIVSRSTQAPLIIRPDSGNPLDTVLKVLEILGKKFPVTENSKGYKLLPPYLRVIQGDGVDINTLQEIVEGMKQKMWSIENIAFGSGGGLLQKLTRDLLNCSFKCSYVVTNGLGINVFKDPVADPNKRSKKGRLSLHRTPAGNFVTLEEGKGDLEEYGQDLLHTVFKNGKVTKSYSFDEIRKNAQLN

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

molecule tags	Transferase
molecule keywords	Nicotinamide phosphoribosyltransferase
publication title	Structure and reaction mechanism of human nicotinamide phosphoribosyltransferase pubmed doi rcsb
source organism	Homo sapiens
total genus	159
structure length	466
sequence length	476
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 2.4.2.12: Nicotinamide phosphoribosyltransferase.
pdb deposition date	2006-12-20

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF04095	NAPRTase	Nicotinate phosphoribosyltransferase (NAPRTase) family
A	PF18127	DUF5598	Domain of unknown function (DUF5598)

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	2e5cA02

3VKJA 2X1TA 1YXDA 4M7SA 5LZLA 4EF8A 3CWOX 4ML9A 4TO8A 4BI7A 1IXPA 3GAKA 3PB0A 4W9TA 1SO6A 1YXCA 5DCEA 3TXZA 5GVJA 4I9AA 2Z6IA 1WDWA 2PE4A 1W3TA 4JTJA 5DCBA 1O4UA 4FB7A 3I68A 3HQ1A 4CQ9A 3Q94A 1QO5A 2VOMA 3PS7A 1AW5A 3G1VA 2YGYA 3DU0A 4O1DA 1OF8A 3TR2A 1B57A 1L2UA 3S1XA 4FNTA 4ZMGA 3SGZA 4O54A 2G95A 2Y7DA 5CZ0A 2RKXA 5L6UA 1QDSA 1XCFA 3TJLA 5G2HA 1W31A 2ZTKA 4JTHA 3NQ6A 3W87A 3G18A 4FF7A 3LCXA 3C52A 1JCMP 3S1UA 3SJ3A 3B03A 1EX5A 3KVLA 2DZVA 3W7HA 4JTIA 1L9WA 2CLHA 3BG3A 1F05A 3LCLA 3F4NA 3O06A 1O5XA 3C4UA 1Q6QA 4O4VA 4S1FA 4CQ8A 2FPTA 4DO5A 3IVSA 2YYTA 3SFKA 1W37A 3LX9A 3PVFA 3ATZA 3TDFA 4HNVA 1PS9A 3C56A 1VH7A 4JTSA 4J9JA 5K3VA 3PM6A 3JS3A 2YR1A 1TRIA 3W7CA 4RX0A 2V9DA 2Y88A 2E68A 3W2MA 1JCNA 3U2OA 3WJWA 5D02A 2GJLA 1H1YA 1ZENA 3LXAA 3STCA 5C54A 1ZJIA 2WNNA 1MEIA 5DBTA 4IWWA 2YFOA 1FXQA 1YDNA 4ZQRA 3TSDA 1FDJA 1FWSA 3T7VA 2ZFAA 2NX9A 2ZRWA 3QQ0A 1ADOA 3GXPA 4Z08A 1F74A 4UC5A 4MYXA 2V81A 3LHWA 3O1NA 3BPWA 3QW4B 3GDMA 2E1DA 3JR2A 4X22A 1JCLA 3DI0A 5CG7A 4DF0A 3G1HA 3SI9A 4M19A 1H7XA 6TIMA 4XKYA 4YL2A 1JRCA 1C8VA 1KV5A 1GQNA 3W1XA 3BW3A 2V2HA 2VEMA 3DBPA 5EMUA 4JY9A 5CPOA 2JKAA 4PC8A 2CLIA 3UPWA 4O10A 3W7DA 3UWUA 3GIYA 2QDGA 2ZQ0A 2VELA 4MJMA 2Y61A 3M5XA 5DELA 1F7BA 3CHVA 3S5OA 5TQLA 3G3MA 2Q8ZA 3G22A 5EA9A 1MO0A 1VLIA 2ZZ4A 1YTEA 3G1FA 4MY1A 2NV1A 1LOQA 1FCVA 2ZZ5A 1U83A 4P2VA 2DZUA 1GYLA 2CZ5A 3NQ2A 1KLZA 2C13A 3ABOA 3O6DA 1EB3A 4K38A 4MZ8A 4MFEA 3QPYA 3M41A 1W5QA 3TMLA 3U6WA 1GEQA 1VYSX 3HPZA 1I2RA 1OVDA 1VLWA 3MBDA 1BTMA 1VC4A 3QSRA 3FKRA 1TJPA 3TC7A 4UTJA 4LRTA 4WQ6A 4IPIA 3C2EA 2R8WA 5HQEA 5AHMA 2FJKA 3M5ZA 1HG3A 2V8ZA 5K9XA 4POCA 3BGJA 3W07A 2WSRA 2J88A 4LY8A 4O28A 4RZ4A 1W56A 2A7NA 1I2NA 3W7JA 2CLMA 4GUJA 1TREA 1RPXA 1K7EA 5BMWA 3LCFA 3Q2DA 4UTLA 1ALDA 3G0UA 1VCVA 2YDAA 3L65A 3NM3A 4LVAA 3G1XA 5A5WA 2V82A 1NEYA 4GUHA 4JYFA 4BFAA 4FNSA 2E5BA 3NA8A 1KM0A 4N2YA 5KTLA 1TQJA 3N34A 5H2ZA 3RLVA 3GXNA 5HULA 1OHLA 1C29A 1ICPA 2BWGA 3SECA 1HO1A 5F2GA 3C3NA 5E1QA 3PG8A 1XDMA 2C3ZA 2DZSA 1W5PA 2ATSA 4NX5A 4UFLA 5D2YA 3TQ0A 4GBUA 4PTNA 3FOKA 3EWXA 3OHIA 4UFHA 1RQHA 2NUXA 5CZJA 4ZQOA 3NDOA 4JYDA 4JD4A 4UFJA 1LRTA 4RXGA 5IBXC 3VNDA 1FDZA 5D05A 3LHVA 3Q37A 2DZXA 1SW0A 5AHLA 3IIXA 2AGKA 2BX7A 1VHNA 4O11A 4GXMA 1K8ZA 1OFRA 2NXHA 3INPA 3K30A 2C15A 2DZTA 4FEZA 5D2XA 2DJXA 1OFBA 4OV9A 3W7EA 4NZJA 4JTTA 5AHNA 2VFGA 4JYEA 3GLCA 4DXVA 2A6LA 3EWYA 3BW2A 4AHOA 1FDYA 4HIBA 3RK8A 5L9FA 5D2VA 1KFCA 4D2JA 2HMCA 1ZNNA 3UWWA 4PL2A 4FIQA 4O17A 3W2UA 3QMTA 3C61A 2QCEA 2QCMA 1HO4A 3L5MA 3JRKA 4LTSA 4PA8A 1ZAIA 3LHYA 4JX5A 3W2KA 3LBMA 1T8XA 1IXNA 4O4WA 2JBMA 3NL5A 4ONVA 2GQ9A 2P1FA 4IUOA 4JGDA 5D2TA 4R34A 5LKYA 3O6CA 3B0UX 4H3DA 4OGZA 1H1ZA 1UB3A 4WJEA 4IXXA 5LGZA 1GG1A 3QYQA 3NL3A 3UY8A 4RK8A 4XTDA 1O5KA 2Y62A 1F5ZA 2WOQA 1TV7A 4X9SA 3MO7A 3W7RA 1DORA 3TC6A 4ZQMA 4XWUA 4LW7A 1WQ5A 1VR6A 3HJZA 1EIXA 4LVBA 4FNPA 2Y63A 1G7VA 2PRHA 1QOPA 4A21A 3PF3A 1QO2A 3W2JA 4NJKA 4GC4A 1HTIA 4O1BA 3WK0A 3L9CA 1VRDA 3STEA 2LLEA 5G2IA 3LLDA 4CCCA 1OFOA 3WK3A 1LOLA 2IQTA 2J9ZA 3E02A 5D2WA 4Z1CA 5KZEA 3PBYA 1LRQA 1Z44A 1ZCOA 3UWZA 1QFEA 4YWIA 1DJQA 2C1HA 1ICSA 3LI0A 5K2ZA 3LXBA 4LV9A 5FF0A 1G7UA 1KTCA 4OHQA 1BWLA 3HG2A 3LCGA 5CZSA 2ATMA 1GG0A 5K9CA 4L4MA 3S6DA 3B0PA 2TRSA 1QMLA 1DJNA 1TO3A 2FB2A 3W71A 2PCQA 4DPQA 1X1ZA 3WJXA 4MIMA 3BVJA 3HB9A 3W1LA 1P4CA 4LS1A 1VJIA 1QCWA 3CT7A 4I7WA 3M5VA 3ZFHA 3W6YA 4TX9A 5I3HA 1TTIA 3CTLA 5EYWA 3GKFA 4CCDA 4DF2A 2VFIA 3SIZA 4ADUA 3EX3A 3PB2A 4HPXA 1FWWA 1G4EA 3DI1A 3LLFA 3P84A 1IGSA 3M5YA 4QNWA 1NSJA 1RVGA 2OX1A 3EWZA 1KFLA 5DY3A 1ZAHA 1PHWA 2E5CA 4A2RA 3F1QA 4ICNA 1KTBA 3L0GA 1KM5A 3BGGA 3MYPA 2G96A 1WX0A 2X30A 3QF0A 3C0JA 2A1YA 1W54A 2P0OA 4NXKA 3KVKA 2ZA1A 2YPIA 4M5PA 4CQAA 2Y7FA 1ZFJA 1B3OA 3WJSA 4MZYA 1KBIA 4M6PA 2EKCA 1Q6RA 3P61A 1OYCA 1OX4A 4R33A 3BO9A 4UR8A 1RQEA 1ME9A 4EOUA 3TFCA 4A3UA 2F84A 3SZ8A 3UZ5A 1DBTA 4RCXA 2CU0A 1P1XA 2Y7EA 3G3DA 2QJGA 4KFPA 3NGJA 4JIPA 3OVPA 3PBVA 4UTTC 5AB3A 1G6CA 2NV2A 1JUEA 3QMSA 3VI2A 5AC7A 3LTSA 4MYAA 3EX2A 4MZ1A 2QR6A 2WKJA 4LOCA 4DO4A 3PAJA 3H54A 5BRBA 3SR7A 3NQ7A 4LUIA 5D03A 1ICQA 3EWBX 2V0TA 2NWSA 5J5DA 2OMAA 2J6XA 1QOQA 3E96A 3S0CA 4O19A 3UWQA 3LV5A 2C16A 1YYAA 1OX4B 4ADSA 5KSWA 3N19B 1FQ0A 3UWVA 3MP5A 3O6YX 3C2RA 4MJZA 2H3DA 4PODA 2FPVA 4WXYA 1TIMA 4ZQCA 3ABQA 1AW1A 5DLCA 2XFWA 2VFHA 3W2LA 3W23A 2EF9A 4Y90A 2CLFA 4OT7A 1TTQA 1EA0A 4MOZA 4LNYA 4AWSA 5U7SA 3F4WA 6ALDA 1JR1A 3KAOA 1KFJA 1ZAJA 4JTGA 1RQBA 4WY0B 5I3IA 3FLUA 4AEOA 3W7LA 4JX4A 1SZGA 3S8HA 4FX6M 3WFAA 3G24A 2DP3A 1IIGA 3W7QA 5K9DA 4S2CA 5G2WA 1S5VA 4LT9A 4O57A 3N3MA 1JRBA 5DCDA 3P74A 1GYNA 1DV7A 5AHEA 2G5WA 4C1LA 1XDLA 5CPLA 4XBSA 1QNVA 4AMAA 4OBTA 4RV8A 1ME8A 4Y8FA 4U28A 2QCDA 4N4PA 2BLEA 3W1NA 3CQ0A 3VCRA 2CWNA 3RF9A 4H4IA 3IIVA 2TYSA 2JK2A 3GB6A 3DGRA 1LLZA 1NF7A 3BLFA 3PUDA 4C1KA 3CB8A 4MLRA 2DU2A 4K6AA 3LRMA 5HWJA 2V5BA 1OFQA 3BLIA 3NR0A 1SFJA 4Q33A 3DFSA 3S42A 1H61A 1NVMA 3W1MA 2GUUA 5I3FA 1RR2A 3O63A 1LROA 2Y85A 1T99A 2ZZ3A 3W74A 3E9AA 5EPDA 3SSJA 3HMJG 4AHPA 1A5CA 3PWAA 2VC6A 4I7UA 2Z2UA 3R89A 3W7OA 3RMJA 3TCEA 3HO8A 4UMAA 2ABAA 1JCXA 4JTFA 1IIHA 4H6KA 3FJ6A 4WD0A 1FWTA 3NM1A 1D9EA 4KWWA 2NLIA 2C18A 3YPIA 3TU9A 3UD6A 3MHFA 5CZTA 3BARA 5DXXA 3NVTA 4LS2A 1P0NA 1YTDA 4GUFA 5C5YA 2FPYA 4LV4A 4CNPA 3BLEA 5FESA 3T40A 2J9YA 1TV5A 3IV3A 2EAWA 1GVRA 1DHPA 3RU6A 1TPH1 4L4LA 1OG0A 2CLOA 4KWVA 1KV8A 1SSGA 4OQVA 3QQ1A 3ZWSA 2ZRVA 4LWWA 2NUYA 1VPXA 2JKPA 2DJLA 1MZHA 2E6YA 3LB0A 3GR7A 3GYEA 4N02A 4RR4A 3NQCA 3DZ1A 4HNUA 1OYBA 1DL3A 2HSAA 1M7OA 1THFD 3GR8A 3TH6A 3R2GA 2H8XA 3NQ8A 3BG9A 3ATYA 3C2FA 3V75A 4BI6A 1QPNA 1JQVA 3NQMA 4O0ZA 1L6SA 3QPZA 2R91A 4G1KA 3CM4A 1Q6LA 2ZRXA 3FEMA 4GWEA 1S5WA 5IBXA 1SSDA 4ZQPA 4EWND 2TSYA 2H90A 1YTKA 2NX3A 3GXTA 3UQNA 1TRDA 5AOUA 4O14A 3P7YA 4HKPA 4UMBA 2OT1A 1O94A 3DH7A 1GTHA 2VFEA 3HGJA 3GKAA 3LCIA 4AHQA 1PE1A 5BNKA 4UTUA 3DXIA 2Y6ZA 1Z48A 3TW6A 1TSIA 1K03A 1GOXA 1JCYA 3GDRA 3CEUA 1W5MA 4Z0SA 5F4WA 1W3NA 1PCKA 2B7QA 2Y89A 4DO6A 2WO5A 4OV4A 3TE9A 3S5ZA 3ANYA 4JICA 5HR6A 3C6CA 3OA3A 1LLWA 1W1ZA 2C19A 4XKYB 4E0CA 1UJPA 3DFNA 5G1YA 1TPDA 4XZ9A 1FCQA 2AQWA 3FJLA 1J4EA 1WBHA 1I2QA 3GVGA 2GOUA 1TPUA 3HG5A 5F4SA 1KBJA 1EUAA 3M47A 1EEPA 3NZRA 3NAVA 3LHTA 1DKWA 4Y96A 2QCLA 4HN4A 4ZQNA 5T26A 1J2WA 1ML1A 1X7FA 4LS0A 1M7PA 4K39A 4YCOA 3M6YA 2GJNA 2CZFA 1S5TA 2OCZA 4WY0F 1A5SA 3EXRA 3DENA 5FEZA 2OZ0A 3QFEA 2B0MA 1UUMA 4FHAA 5LNVA 3BG5A 5F2LA 3FS2A 2F7FA 3HG4A 4LVGA 1SUXA 2RDUA 1IXQA 1XBYA 4K37A 1K02A 1RZMA 3WJYA 5D04C 5C6MA 1YDVA 1F2JA 3TJXA 3GX9A 3LERA 5C55A 1AL7A 5AHFA 1UBSA 3P5ZA 1LZOA 1YLVA 3LHUA 3RNDA 4N9BA 1H7NA 3HBLA 2NWRA 5DY2A 2W79A 3QC3A 4JX6A 2GQ8A 3W7KA 4IQLA 1TPFA 3LHZA 2Q3RA 4O53A 3GZ3A 1YPFA 2R94A 3IIOA 5FF3A 1KM3A 4I7VA 4UTWC 1FWNA 3B05A 5FF4A 4AB4A 1HUVA 5F2MA 5HWMA 4K36A 2Y7GA 3W1RA 1ME7A 3A21A 1XM3A 2J9XA 1KM2A 5TBOA 5LNWA 2VFDA 3N2MA 3THQA 2WQPA 4O1CA 3M1ZA 1R46A 2ZYFA 1EP3A 4Z1AA 1SFLA 3N14A 2Q8LA 4QM1A 4MKNA 3W72A 1FY6A 5F1UA 1B4KA 2X2GA 1RV8A 4JTUA 4GE8A 4N9EA 3DFOA 3GNDA 4FX8A 2O7SA 4HPJA 5LHEA 2XN0A 4S2BA 4CLMA 2BZNA 1YADA 3IIZA 4FIRA 1LCOA 1JQXA 3OEXA 5G4EA 1OFAA 1NAL1 3L21A 1B4EA 3PBUA 4TU1A 3L5LA 4EF9A 1SO3A 3A9IA 2RDWA 4IMGA 1FCUA 3W86A 1SO4A 3TUUA 1H7WA 4CNNA 1FX6A 3GNNA 5EKYA 4MFDA 4RZ6A 1XBVA 4UIOA 4RJEA 4LC6A 3NXFA 2E5DA 1H51A 5CGQA 3O16A 1D3GA 1QPOA 4QQ3A 3P81A 3OBKA 3UWYA 5D33A 3OVQA 3IVUA 4UTTA 3RLUA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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2E5CA

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